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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5981 2026-03-10
Single-Cell Sequencing and Transcriptomic Sequencing Exploration of the Mechanisms Governing Lactylation in Mitochondrial Diseases
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和转录组分析探索了乳酸化修饰在线粒体疾病中的作用机制 首次结合单细胞测序与转录组分析探索乳酸化在线粒体疾病中的角色,并利用机器学习识别出三个核心基因EIF3D、SOD1和RPS26 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于qRT-PCR和Western blotting,样本来源和数量可能有限 探索乳酸化修饰与线粒体疾病之间的关联,以揭示其分子病理机制和潜在治疗策略 线粒体疾病患者的骨骼肌样本及相关的免疫细胞 生物信息学 线粒体疾病 单细胞RNA测序, 转录组分析, qRT-PCR, Western blotting 机器学习算法 RNA测序数据, 基因表达数据 线粒体疾病患者的骨骼肌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
5982 2026-03-10
A supramolecular peptide reprograms PD-L1+ tumor-associated macrophages to enhance antitumor immunity in lung adenocarcinoma
2026-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 本研究开发了一种超分子肽纳米平台MH-PDBP,用于重编程肺腺癌中的PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞,以增强抗肿瘤免疫 通过金亲和自组装构建了超分子肽纳米平台,并利用甘露糖化人血清白蛋白涂层实现选择性靶向肿瘤相关巨噬细胞,促进PD-L1的溶酶体降解并重编程巨噬细胞向M1表型转化 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性 旨在克服肺腺癌中免疫抑制性肿瘤免疫微环境,增强免疫检查点抑制剂的疗效 肺腺癌患者样本、小鼠模型及肿瘤相关巨噬细胞 数字病理 肺癌 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA 图像、测序数据 来自免疫检查点抑制剂治疗的肺腺癌患者的多重免疫组织化学样本及公共单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5983 2026-03-10
OralDB: A Transcriptomic Resource for Mechanistic Exploration in Oral Diseases
2026-Mar-08, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本文介绍了OralDB,一个专为口腔疾病设计的首个全面、标准化、交互式的多模态转录组资源平台 首次创建了专门针对口腔疾病的综合性、标准化、交互式多模态转录组资源,整合了多种组学数据和疾病类型,解决了数据碎片化和批次效应问题 平台主要基于现有公共数据集,可能受限于数据质量和覆盖范围,且未提及对新数据集的持续更新机制 开发一个标准化资源平台,以促进口腔疾病的分子机制探索和转化应用研究 口腔疾病,包括口腔癌、牙周炎和口腔黏膜疾病等 数字病理学 口腔癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST)、RNA-seq、微阵列 NA 转录组数据 2027个组织样本,覆盖73个高质量数据集和20种口腔疾病 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, 微阵列 NA NA
5984 2026-03-10
KAFSTExp: Kernel Adaptive Filtering With Nyström Approximation for Predicting Spatial Gene Expression From Histology Images
2026-Mar, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为KAFSTExp的框架,利用病理学基础模型UNI提取组织学图像特征,并引入带Nyström近似的核最小均方算法来预测空间基因表达 首次将核自适应滤波与Nyström近似结合应用于从组织学图像预测空间基因表达,显著提高了预测精度并降低了计算成本 模型在有限的空间转录组数据集上的泛化能力可能受数据量限制,且依赖于特定病理学基础模型的特征提取 开发一种从低成本组织学图像预测空间基因表达的高效计算方法 空间转录组数据和组织病理学图像 数字病理学 肿瘤 核自适应滤波,Nyström近似 核最小均方算法,UNI基础模型 图像,基因表达数据 多个空间转录组数据集(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
5985 2026-03-10
Endothelial-to-mesenchymal transition primes vascular endothelial cells toward an osteochondrogenic fate
2026-Mar, Vascular pharmacology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了内皮-间充质转化(EndMT)如何促使血管内皮细胞向成骨和成软骨命运转化,从而在动脉粥样硬化中促进血管功能障碍和钙化 首次在体外和体内定义了EndMT衍生细胞的寡能性状态,并揭示了其向成骨和成软骨命运的转化,将内皮功能障碍与血管钙化联系起来 研究主要基于HUVECs和鼠类模型,可能无法完全反映人类动脉粥样硬化的复杂性 探究EndMT在动脉粥样硬化中的作用,特别是EndMT衍生细胞的分化潜力和功能特性 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和动脉粥样硬化模型小鼠中的内皮谱系追踪细胞 细胞生物学 动脉粥样硬化 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 未明确样本数量,但涉及HUVECs和鼠类模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5986 2026-03-10
Targeting IL27RA Enhances Immunotherapy in Triple-Negative Breast Cancer by Modulating Tumor Cells and the Tumor Microenvironment
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,发现IL27RA在三阴性乳腺癌恶性上皮细胞中的上调与免疫检查点阻断治疗抵抗相关,并揭示了其通过PI3K/AKT通路抑制MHC-I表达、损害CD8⁺ T细胞功能的机制 首次在单细胞水平上揭示了IL27RA在三阴性乳腺癌免疫治疗抵抗中的关键作用,并发现其通过非经典的PI3K/AKT通路而非传统的IL-27/STAT轴调控MHC-I表达 研究样本量有限,主要基于非病理完全缓解患者的配对样本;机制研究主要在动物模型中进行,需要进一步临床验证 探究三阴性乳腺癌免疫检查点阻断治疗抵抗的分子机制,并寻找新的治疗靶点 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本、小鼠原位肿瘤模型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 非病理完全缓解患者的配对治疗前后肿瘤样本,以及3名病理完全缓解患者的独立队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5987 2026-03-10
CGRP Enhances the Regeneration of Bone Defects by Regulating Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Through Promoting ANGPTL4 Secretion by Bone Blood Vessels
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了降钙素基因相关肽(CGRP)通过促进骨血管分泌ANGPTL4来调节骨髓间充质干细胞,从而增强骨缺损再生的机制 首次阐明CGRP通过FAK-AKT-VEGF通路促进血管生成,并通过诱导骨血管内皮细胞分泌ANGPTL4驱动骨髓间充质干细胞成骨分化的双重作用机制,为骨再生提供了新的治疗策略 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床转化效果仍需进一步验证;单细胞RNA测序数据的分析深度和样本量可能有限 探究CGRP在骨缺损修复中通过血管介导的成骨作用机制 人类临床数据、小鼠骨缺损模型、人微血管内皮细胞系-1、骨髓间充质干细胞 单细胞组学 骨缺损/骨损伤 单细胞RNA测序,批量转录组测序,实验分析 NA 转录组数据,实验数据 未明确说明具体样本数量,涉及人类临床数据、小鼠模型和细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
5988 2026-03-10
Targeting the CMKLR1-Mediated Signaling Rebalances Immunometabolism State in Middle-Age Testicular Macrophages
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CMKLR1介导的睾丸巨噬细胞免疫代谢重编程在中年男性生殖功能衰退中的作用,并验证了靶向CMKLR1的治疗潜力 首次在人和小鼠睾丸中发现保守的CD206MHCII巨噬细胞亚群,并阐明其通过CMKLR1信号通路在中年期向糖酵解和促炎状态代谢重编程的机制,同时开发了新型CMKLR1拮抗剂肽P12C5 研究主要聚焦于中年阶段,对更年轻或更年老阶段的免疫代谢变化覆盖不足;新型拮抗剂肽的长期安全性和临床转化潜力需进一步验证 探究脂肪介导的信号如何与局部睾丸免疫相互作用,以及如何通过调节免疫代谢状态改善年龄相关的男性性腺功能减退 人和小鼠的睾丸组织,特别是其中的巨噬细胞亚群 单细胞组学 男性性腺功能减退 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 涉及人类和小鼠的睾丸样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5989 2026-03-10
The protective up-regulation of metallothionein-2A in intervertebral disc degeneration inhibits nucleus pulposus cell ferroptosis through activation of the PI3K/AKT/mTOR pathway
2026-Feb-25, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了金属硫蛋白-2A(MT2A)在椎间盘退变中通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡,从而发挥保护作用 首次发现MT2A在椎间盘退变中保护性上调,并阐明其通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡的具体分子机制 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在人体中进行验证;铁死亡在椎间盘退变中的具体作用机制仍需进一步探索 阐明MT2A如何抑制椎间盘退变的进展 椎间盘退变、髓核细胞 分子生物学与细胞生物学 椎间盘退变 单细胞测序分析、细胞培养、动物模型 NA 测序数据、细胞表型数据、动物影像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
5990 2026-03-10
Advances in spatial omics for the analysis of prostate cancer
2026-Feb-21, Analytical and bioanalytical chemistry IF:3.8Q1
综述 本文综述了空间组学技术在分析前列腺癌中的应用进展 整合了高维分子分析与保留的组织结构,揭示了前列腺癌进展中的关键特征,如基质重塑、免疫逃逸、脂质代谢重编程和治疗耐药性生态位 NA 探讨空间组学技术在前列腺癌研究中的最新进展、整合应用及临床转化挑战 前列腺癌 数字病理学 前列腺癌 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 NA 空间分子数据 NA NA 单细胞空间组学 NA NA
5991 2026-03-10
A Multimodal Single-Cell Epigenomic and 3D Genome Atlas of the Human Basal Ganglia
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文构建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,揭示了细胞类型和区域特异性的表观遗传差异 首次创建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,整合了DNA甲基化、3D染色质构象、空间转录组学等多组学数据 NA 构建人类基底节的综合表观基因组图谱,以解析其细胞类型特异性的表观遗传调控机制 人类基底节的主要亚区和细胞类型 表观基因组学 神经精神疾病 多组学测序(snm3C-seq)、MERFISH空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 197,003个细胞核(来自八个基底节亚区),整合后总计261,331个细胞 NA 单细胞多组学测序、空间转录组学 NA NA
5992 2026-03-10
Genome-wide single-cell perturbation screens with VIPerturb-seq
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为VIPerturb-seq的新平台,旨在通过基于探针的检测工作流程,促进全基因组范围的Perturb-seq实验,以应对成本和高通量挑战 VIPerturb-seq平台引入了分裂探针策略,用于在固定细胞中检测全基因组CRISPR文库,支持在单细胞分析前对重要扰动进行表型富集,并与组合索引工作流程兼容,将Perturb-seq通量提高50倍 NA 开发一个平台,以促进常规的全基因组Perturb-seq实验,解决现有方法在成本和通量方面的限制 全基因组CRISPRi文库(GuEST-List)以及相关的单细胞扰动筛选 单细胞测序技术 NA CRISPR-based screening, single-cell sequencing, probe-based detection, combinatorial indexing NA 单细胞测序数据 NA NA Perturb-seq, single-cell RNA-seq VIPerturb-seq 基于探针的检测工作流程,支持全基因组CRISPR文库检测和表型富集
5993 2026-03-10
Parameter-free representations outperform single-cell foundation models on downstream benchmarks
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文比较了基于参数化表示的单细胞基础模型与简单线性方法在下游任务中的性能 研究发现,无需复杂深度学习表示,通过简单、可解释的线性方法即可在多个基准测试中达到或接近最先进性能,甚至在涉及新细胞类型和生物体的分布外任务中超越基础模型 未明确提及具体局限性,但暗示需要更严格的基准测试来评估模型 评估单细胞RNA测序数据表示方法的性能,特别是比较基础模型与简单线性方法在下游任务中的表现 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Transformer, 线性方法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5994 2026-02-06
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq finds gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with cytoskeleton protein in epithelial-mesenchymal transition in ovarian cancer
2026-Feb-04, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
5995 2026-03-10
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2026, Molecular and cellular biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴,促进巨噬细胞M1极化与成纤维细胞功能,从而加速肛瘘愈合的分子机制 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴调控巨噬细胞-成纤维细胞互作促进肛瘘愈合的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其结论在人体中的适用性及临床转化效果仍需进一步验证 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子机制 肛瘘愈合过程、巨噬细胞、成纤维细胞 生物信息学与分子生物学 肛瘘 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外细胞实验数据、体内动物模型数据 使用了公开数据集GSE28914和GSE203244,并建立了小鼠肛瘘模型进行体内验证 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
5996 2026-03-10
Cochlear neural functional competence: an integrative transcriptomic module analysis of excitability, plasticity and microenvironmental support programs
2026, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合分析多个耳蜗转录组数据集,构建了一个用于评估螺旋神经元功能状态的综合评分框架(CNFC) 提出了一个整合神经元兴奋性、可塑性、营养/代谢支持和损伤/炎症等转录程序的模块化分析框架,并开发了可量化的CNFC评分,超越了传统的神经元存活率预测 MSC治疗的功能性后果尚未明确建立,部分结论仍需进一步机制验证 开发一个从转录组数据中总结耳蜗神经元功能状态的透明、可生成假设的分析框架,以补充传统的存活率指标 螺旋神经元、毛细胞及耳蜗组织 转录组学 听力损失 RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 模块化基因评分框架 转录组数据 多个公开数据集(涵盖发育期、成年期及损伤/退化期样本) NA RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 NA NA
5997 2026-03-09
Single-cell RNA sequencing analysis of bone cancer pain model induced by Lewis lung cancer cells in male mice
2026-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了雄性小鼠中由Lewis肺癌细胞诱导的骨癌疼痛模型的脊髓细胞组成和分子特征 首次在骨癌疼痛模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地揭示了脊髓中多种细胞类型的比例变化和分子通路改变 研究仅针对雄性小鼠,未考虑性别差异;模型基于特定肺癌细胞系,可能无法完全代表其他癌症类型引起的骨痛 探究骨癌疼痛的分子机制,为开发新的治疗方法提供依据 雄性小鼠的L2-L4脊髓组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5998 2026-03-09
3D culture reveals dual role of ICAM-1 in mediating tissue-specific human MSC spheroid formation & enhanced immunomodulation
2026-Jul, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本研究探讨了三维培养系统如何影响人骨髓和胎盘来源间充质干细胞的免疫调节能力,并揭示了ICAM-1在介导球体形成和增强免疫调节中的双重作用 首次通过三维培养系统比较不同来源MSCs的免疫调节差异,并识别ICAM-1在球体形成和免疫调节中的关键双重功能 研究主要基于体外实验,体内验证有限,且仅聚焦于两种MSC来源,可能未涵盖其他组织来源的MSCs 探究三维培养对MSCs免疫调节能力的影响及其机制,以优化干细胞治疗策略 人骨髓来源间充质干细胞和胎盘来源间充质干细胞 细胞生物学 NA qPCR、流式细胞术、单细胞RNA测序、生物信息学分析 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 两种来源的MSCs(骨髓和胎盘) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5999 2026-03-09
R-loop-driven molecular subtypes reveal prognostic and immunogenomic features in uterine corpus endometrial carcinoma
2026-Jun, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了R-loop活性在子宫体子宫内膜癌中的预后意义,并识别出CSDE1作为关键预测基因,其通过SPP1通路与免疫细胞相互作用,影响肿瘤进展和免疫抑制 首次将R-loop活性与UCEC的分子亚型、预后及免疫基因组特征关联,并发现CSDE1在成纤维细胞中的特异性表达及其通过SPP1通路介导的免疫抑制机制 研究主要基于公共数据库数据,缺乏大规模独立队列验证;功能实验仅限于CSDE1,其他R-loop基因的作用未深入探讨 阐明R-loop在子宫体子宫内膜癌中的预后价值和生物学机制,探索CSDE1作为潜在治疗靶点 子宫体子宫内膜癌患者样本及相关转录组、临床、突变和空间数据 生物信息学 子宫内膜癌 转录组分析、单细胞转录组学、空间转录组学、拷贝数变异分析、体细胞突变比较 预后模型 转录组数据、临床数据、突变数据、空间数据 来自TCGA及公共数据库的UCEC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
6000 2026-03-09
Electrocorticographic, astrocytic and transcriptomic signatures in the triple transgenic mouse model of Alzheimer's disease submitted to stearoyl-CoA desaturase inhibition
2026-May-15, Neuropharmacology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了在阿尔茨海默病三转基因小鼠模型中,抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶对睡眠、脑电图活动、星形胶质细胞功能、脂质代谢和转录组的影响 首次结合脑电图记录、星形胶质细胞标记、脂滴分析和空间转录组学,全面评估SCD抑制对AD模型小鼠多维度病理特征的挽救作用 研究仅使用雌性小鼠,未涵盖性别差异;SCD抑制未能恢复AD小鼠的睡眠时间改变 探究SCD抑制是否能恢复AD模型小鼠的睡眠障碍,并评估其对脑脂质代谢、星形胶质细胞功能和转录组的影响 野生型和三转基因阿尔茨海默病雌性小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 脑电图记录、免疫组织化学、空间转录组学 三转基因小鼠模型 生理信号、图像、转录组数据 野生型和3xTg-AD雌性小鼠,接受SCD抑制剂或对照处理 NA NA NA NA
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