单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 581 - 600 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-02-03
Copy-number amplification drives IFI30 overexpression and coordinated immune activation, identifying a novel diagnostic and therapeutic target in gastric adenocarcinoma
2026-Feb-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了IFI30在胃腺癌中的拷贝数扩增驱动的过表达及其在免疫激活中的关键作用,并评估了其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次系统性地阐明了IFI30在胃癌中的生物学意义,发现拷贝数扩增而非点突变是其主要驱动机制,并建立了IFI30与肿瘤免疫微环境及免疫检查点阻断反应预测的关联 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证和临床队列的长期随访数据 全面表征IFI30在胃癌中的失调机制及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 胃腺癌(STAD)组织、正常胃黏膜组织及胃癌细胞系 生物信息学 胃癌 转录组学、基因组学(全外显子体细胞突变、拷贝数变异)、单细胞RNA测序、免疫分析、转录因子预测、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、基因集富集分析(GSEA)、磷酸化蛋白质组学相关性映射 NA 多组学数据(包括转录组、基因组、单细胞RNA-seq、空间转录组数据) TCGA-STAD、GEO数据库中的多个验证队列及六个胃癌细胞系 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
582 2026-02-03
Impairment of hippocampal gamma oscillations, mitochondria and neurovascular function in CADASIL
2026-Feb-02, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过CADASIL小鼠模型、人脑组织样本和原代血管平滑肌细胞,揭示了CADASIL中小血管病变如何导致海马神经元功能障碍、线粒体异常和神经血管单元损伤 首次在CADASIL模型中系统揭示海马伽马振荡受损、线粒体呼吸复合物减少及神经血管单元结构功能异常的多层次病理机制 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,人类样本数量有限,且未涉及长期病程动态观察 阐明CADASIL中小血管病变导致认知障碍的细胞分子机制,特别关注海马区的易感性 人源化CADASIL小鼠模型、尸检人脑组织切片、原代人脑血管平滑肌细胞 神经科学 脑血管疾病 离体电生理学、免疫组化、Western blotting、Seahorse能量代谢分析、qPCR、单细胞RNA测序 NA 电生理信号、图像、蛋白质印迹、基因表达数据、单细胞转录组数据 包含四种不同NOTCH3基因变异的人脑组织样本及对应细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
583 2026-02-03
Epithelial-Associated CD207+ DCs Link Allergen Sensing and IL-25-Driven Th2 Inflammation in Asthma
2026-Feb-02, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究揭示了CD207+树突状细胞作为上皮相关抗原呈递细胞,在过敏性哮喘中连接IL-25信号和Th2极化的作用 首次将CD207+树突状细胞鉴定为连接上皮源性IL-25信号与Th2免疫反应的关键桥梁,并提出了IL-25-CD207轴作为T2高表型哮喘的潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且未深入探讨其他上皮源性细胞因子或DC亚型的作用 阐明IL-25在哮喘中驱动Th2炎症的下游机制,特别是CD207+树突状细胞在其中的作用 健康人肺单细胞RNA-seq数据、HDM诱导的哮喘小鼠模型、哮喘患者气道样本(U-BIOPRED队列) 免疫学 哮喘 单细胞RNA-seq、流式细胞术、DC-T细胞共培养、Transwell共培养 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、临床样本数据 健康人肺单细胞RNA-seq数据、Cd207-/-小鼠模型、U-BIOPRED队列哮喘患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
584 2026-02-03
Spatial Location of SPP1+TAMs and Mutually Exclusive Subsets Based on Single-Cell and Transcriptome Data
2026-Feb, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究基于单细胞和空间转录组数据,阐明了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺腺癌中的空间定位及其互斥亚群 首次结合单细胞转录组、空间转录组和免疫组化数据,系统揭示了SPP1+TAMs与MARCO+M2巨噬细胞在肺腺癌不同阶段(原位癌与浸润癌)的互斥分布模式及其空间定位特征 研究主要基于公共数据库和局部样本,缺乏大规模前瞻性临床队列验证,且机制研究深度有限 阐明SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺腺癌中的空间定位、互斥亚群及其在肿瘤进展中的作用,为精准治疗提供依据 肺腺癌组织、肿瘤相关巨噬细胞(特别是SPP1+和MARCO+亚群) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学, 生物信息学分析 UMAP降维与聚类分析 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像数据 基于TCGA、GTEx、GEO、HPA等多个公共数据库及局部肺腺癌样本,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
585 2026-02-03
Cancer-associated fibroblasts: Recent advances and therapeutic implications
2026-Feb, Current opinion in cell biology IF:6.0Q1
综述 本文综述了肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的最新研究进展及其治疗意义 整合了单细胞测序和空间转录组学等新技术揭示的CAFs功能异质性、空间组织、时间动态和免疫调节功能,并讨论了靶向CAFs亚群的新兴治疗策略 作为一篇综述文章,主要总结现有研究,未提出新的原始实验数据或模型 总结CAFs在肿瘤微环境中的生物学特性、异质性及其在癌症治疗中的意义 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其在肿瘤微环境中的作用 肿瘤生物学 癌症 单细胞测序,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
586 2026-02-03
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-Feb, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和单核RNA测序技术,识别了小鼠视网膜发育过程中独特的髓系细胞群体,并验证了它们在神经纤维层和血管生成前沿的定位与功能 首次在视网膜中识别并验证了发育特异性微胶质细胞群体,特别是Spp1和Hmox1标记的群体,揭示了NRF2转录因子在调控微胶质细胞状态转换中的作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚未验证,且功能机制仍需进一步实验探究 探究微胶质细胞在小鼠视网膜发育过程中的分子特征、空间定位及其功能影响 发育中的小鼠视网膜髓系细胞群体,特别是微胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA RNA序列数据, 组织学图像 多个发育时间点的小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
587 2026-02-03
CD44 upregulation in chronic liver disease marks the transition to hepatocellular carcinoma and portends poor prognosis
2026-Feb, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了CD44在慢性肝病向肝细胞癌转化过程中的表达变化及其作为早期生物标志物和治疗靶点的潜力 首次系统性地在慢性肝病模型中展示了CD44及其亚型v6和v10的渐进性上调,并利用单细胞转录组数据揭示了其在肿瘤和免疫细胞中的表达与免疫抑制微环境的关联 研究主要基于转录组数据分析,缺乏直接的体内功能验证实验来确认CD44在肝细胞癌发生中的因果作用 探索CD44作为慢性肝病向肝细胞癌转化早期生物标志物的临床价值 小鼠慢性肝损伤模型和人类肝细胞癌样本 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
588 2026-02-03
Transgelin defines pro-tumorigenic cancer-associated fibroblasts in pancreatic cancer
2026-Feb, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示了胰腺癌中肌成纤维样癌症相关成纤维细胞的异质性,并识别出Transgelin作为肿瘤进展的关键驱动因子 首次结合scATAC-seq和scRNA-seq在胰腺癌模型中系统表征myCAF的异质性,并验证Tagln在肿瘤生长中的功能作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨Tagln作用的具体分子机制 探究胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的功能 KPC转基因小鼠的胰腺组织及TCGA人类PDAC样本 单细胞组学 胰腺癌 scATAC-seq, scRNA-seq NA 单细胞染色质可及性数据、单细胞转录组数据 KPC小鼠胰腺组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
589 2026-02-03
A single-nucleus RNA sequencing reveals the differential fate mechanism underlying flavonoid biosynthesis of middle and inner tepals in Chimonanthus praecox
2026-Feb, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序揭示了蜡梅中内层与中层花被片中黄酮类生物合成的差异命运机制 首次构建了蜡梅花被片的单细胞转录组图谱,揭示了细胞发育调控在决定花被片颜色命运中的关键作用 研究仅基于单核RNA测序数据,未进行功能验证实验 探究蜡梅花被片颜色形成的分子机制 蜡梅(Chimonanthus praecox)的内层与中层花被片 植物生物学 NA 单核RNA测序(snRNA-seq)、WGCNA分析 NA 单细胞转录组数据 从内层和中层花被片分别分离了13,073和12,625个单细胞核 NA 单核RNA测序 NA NA
590 2026-02-03
Comprehensive tumour-immune profiling reveals TREM2+ tumour-associated macrophages facilitating lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组数据,揭示了头颈鳞状细胞癌中TREM2+肿瘤相关巨噬细胞通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭,从而驱动淋巴结转移的机制 首次在头颈鳞状细胞癌中鉴定出与淋巴结转移密切相关的TREM2+肿瘤相关巨噬细胞亚群,并阐明了其通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭的具体分子机制 研究主要基于单细胞转录组和体外实验,缺乏体内动物模型验证;临床队列样本量可能有限,需进一步扩大验证 探究头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的肿瘤免疫微环境特征及关键驱动机制 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤样本及单细胞转录组数据 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,微阵列分析,多重免疫组化染色,体外共培养实验 机器学习算法 单细胞转录组数据,微阵列数据,临床病理数据 212个头颈鳞状细胞癌样本,共688,866个单细胞转录组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
591 2026-02-03
Narrowband Ultraviolet B Induces Peripheral Regulatory T Cells to Exert Antigen-Specific Immune Suppression
2026-Feb, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究探讨窄谱紫外线B(UVB)通过诱导抗原特异性调节性T细胞(Tregs)来发挥免疫抑制作用的机制 揭示了UVB在临床和动物模型中诱导抗原特异性Tregs的机制,并整合了CyTOF、bulk RNA-seq和scRNA-seq技术进行多维度分析 样本量较小(19名银屑病患者),且机制研究主要基于小鼠模型,需进一步验证人类特异性 探究UVB诱导抗原特异性免疫抑制的分子和细胞机制 银屑病患者的外周血单核细胞(PBMCs)和OVA诱导的小鼠皮肤炎症及同种异体皮肤移植模型 免疫学 银屑病 飞行时间质谱流式细胞术(CyTOF)、bulk RNA-seq、scRNA-seq NA 单细胞数据、转录组数据 19名银屑病患者和多个小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
592 2026-02-03
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-01, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究探讨了GITR在胰腺导管腺癌中的免疫调节作用,通过体内实验和人类样本分析,揭示了GITR激活如何改善肿瘤微环境并抑制肿瘤进展 首次在PDAC中系统评估GITR的表达模式及其在化疗后的上调,结合空间转录组学定位GITR+淋巴细胞与肿瘤细胞的邻近关系,并关联长期生存患者的高GITR表达 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,缺乏大规模临床试验验证,且GITR激活的具体分子机制尚未完全阐明 探索GITR作为免疫治疗靶点在胰腺导管腺癌中的作用,以克服当前免疫疗法的局限性 Pan02小鼠PDAC模型和人类PDAC手术切除样本(包括初治和接受新辅助化疗的患者) 数字病理学 胰腺癌 scRNA-seq, 空间转录组学, 免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 人类PDAC手术样本(具体数量未明确)和Pan02小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
593 2026-02-03
Single-cell sequencing-guided design of synergistic chemo-immunotherapy nanodrugs for cGAS-STING activation in prostate cancer therapy
2026-Feb-01, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析,设计了一种协同化疗-免疫治疗的纳米药物,用于激活前列腺癌中的cGAS-STING通路,以逆转肿瘤的免疫抑制微环境 通过单细胞测序识别VSIG4作为前列腺肿瘤驻留巨噬细胞命运的关键调节因子,并基于此设计了一种新型金属-多酚网络纳米药物(Mn/Shik@CpG NDs),该药物能在肿瘤微环境中释放组分,协同激活先天和适应性免疫,将“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤 研究主要基于临床前体内模型,尚未在人体中进行验证;纳米药物的长期安全性和具体临床转化路径仍需进一步探索 开发一种能逆转前列腺癌免疫抑制微环境、激活cGAS-STING通路并增强免疫治疗效果的纳米药物 前列腺癌肿瘤免疫微环境(TIME),特别是肿瘤驻留巨噬细胞和cGAS-STING信号通路 数字病理学 前列腺癌 单细胞测序,转录组分析 NA 单细胞测序数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
594 2026-02-03
Multi-omics analysis reveals that ginsenoside Rb1 improves prognostic outcomes in sepsis by modulating mitochondrial metabolism MTHFD2 targets
2026-Feb-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析发现人参皂苷Rb1通过调控线粒体代谢靶点MTHFD2改善脓毒症预后 首次结合公共数据库分析、单细胞测序、分子对接和动物实验,系统揭示了MTHFD2作为脓毒症关键靶点及人参皂苷Rb1的治疗潜力 动物实验为初步验证,需进一步临床研究确认;分子机制细节有待深入探索 探索脓毒症预后改善的潜在治疗靶点和药物 脓毒症患者样本数据、CLP诱导的脓毒症大鼠 生物信息学与计算生物学 脓毒症 多组学分析、单细胞测序、分子对接、动物实验 风险预测模型 基因表达数据、单细胞测序数据 公共数据库中的脓毒症与正常样本、CLP诱导的脓毒症大鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
595 2026-02-03
The Role of CCR1 as a decisive factor for immune response activation versus suppression phenotypes in gastric cancer
2026-Jan-31, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了趋化因子受体1(CCR1)在胃癌免疫微环境中的作用,发现其通过激活巨噬细胞中的NF-κB和MAPK通路促进T细胞募集,从而抑制肿瘤进展 首次在胃癌中系统阐明CCR1通过巨噬细胞调控T细胞浸润的分子机制,并利用单细胞和空间转录组学技术精确定位CCR1的表达细胞类型 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证仍需扩大;CCR1作为治疗靶点的临床转化潜力需进一步评估 探究CCR1在胃癌免疫微环境中对肿瘤进展的促进或抑制作用 胃癌患者样本、CCR1基因敲除小鼠模型、巨噬细胞 肿瘤免疫学 胃癌 转录组分析、单细胞转录组学、空间转录组学、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光 NA 转录组数据、临床数据、图像数据 未明确样本数量,包含患者分层样本和小鼠模型 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
596 2026-02-03
Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 1 expression defines CD8+ T cell exhaustion in acute myeloid leukemia
2026-Jan-31, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,结合机器学习方法,揭示了LILRB1是驱动急性髓系白血病中CD8+ T细胞耗竭和细胞毒性功能障碍的关键免疫检查点,并构建了一个九基因预后特征 首次将LILRB1鉴定为AML中CD8+ T细胞耗竭的核心免疫抑制枢纽,并通过整合多组学数据与机器学习构建了稳定的预后模型,同时揭示了NK细胞在其中的作用 样本量相对较小(20名AML患者和20名健康供者),且研究主要基于转录组数据,功能验证有待进一步深入 阐明急性髓系白血病中细胞毒性受损的机制,并寻找关键的免疫治疗靶点 急性髓系白血病患者的免疫细胞(特别是CD8+ T细胞和NK细胞) 机器学习 急性髓系白血病 scRNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, 多色流式细胞术 Ridge Regression, 以及其他多种机器学习算法(共18种模型) 单细胞RNA测序数据、批量转录组数据、流式细胞术数据、RT-qPCR数据 20名AML患者和20名健康供者的样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
597 2026-02-03
Single-Cell Network Analysis Reveals Cell-Type-Specific Pathology Following Retinal Detachment
2026-Jan-30, The American journal of pathology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和单细胞图形高斯模型分析视网膜脱离后细胞类型特异性基因模块,揭示了视网膜脱离后的病理变化 开发并应用单细胞图形高斯模型算法进行基因共表达网络分析,识别视网膜脱离后细胞类型特异性基因模块 关于T细胞浸润的发现仅为初步证据,需要进一步验证 阐明视网膜脱离后视网膜细胞类型特异性病理变化 视网膜脱离患者的视网膜组织 数字病理学 视网膜脱离 单细胞RNA测序 单细胞图形高斯模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
598 2026-02-03
Tuft cells in the gut limit cognitive disorders by regulating gut homeostasis
2026-Jan-30, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了肠道簇细胞在认知障碍中的作用,通过小鼠模型揭示了簇细胞缺失导致肠道通透性增加、免疫失衡和认知功能障碍,并发现琥珀酸能恢复阿尔茨海默病小鼠的认知功能和肠道稳态 首次揭示了肠道簇细胞通过调节肠道稳态在认知障碍中的关键作用,并发现β-淀粉样蛋白抑制簇细胞分化,琥珀酸作为簇细胞激活剂能改善认知功能 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证,且样本量相对有限 探究肠道簇细胞在认知障碍中的作用机制 雄性簇细胞缺失小鼠(Pou2f3-/-)、野生型同窝小鼠、阿尔茨海默病模型小鼠、结肠类器官 神经科学 阿尔茨海默病 16S rRNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序、荧光成像、类器官培养 小鼠模型 基因表达数据、微生物组数据、免疫细胞数据、行为数据 未明确指定具体数量,但涉及多种基因型小鼠和实验组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
599 2026-02-03
Single-cell transcriptomics identifies altered neutrophil dynamics and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco-flavored e-cigarette-exposed mouse lungs
2026-Jan-29, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了不同口味电子烟暴露对小鼠肺部免疫细胞的差异化影响,特别是烟草口味电子烟导致的中性粒细胞动态改变和T细胞毒性增强 首次利用单细胞转录组学技术系统比较了不同口味电子烟暴露对肺部免疫景观的影响,并发现了口味依赖性的免疫细胞功能失调模式 研究仅基于急性暴露模型,未评估长期暴露效应;样本量相对有限;机制性研究不足 探究不同口味电子烟暴露对肺部免疫反应的细胞特异性影响 小鼠肺部免疫细胞 单细胞转录组学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 71,725个肺细胞(来自对照组和暴露组小鼠) NA 单细胞RNA-seq NA NA
600 2026-02-03
Deep neural network-based biostatistical analysis for disease marker screening
2026-Jan-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于深度神经网络的新型生物标志物筛选框架,并与传统统计方法进行比较,在乳腺癌数据集上验证了其优越性 结合注意力机制与SHAP值分析,增强了模型的可解释性,并设计了可扩展的综合模型用于多组学数据整合 未明确提及具体局限性 开发一种用于疾病标志物筛选的深度神经网络框架,提高筛选准确性和可解释性 乳腺癌数据集 机器学习 乳腺癌 单细胞测序 深度神经网络(DNN) 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部