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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-09-21 |
NR4A1 limits CD8⁺ T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.12.699051
PMID:41648508
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研究论文 | 该研究通过基因敲除小鼠、过继转移模型以及猕猴和人类数据集验证，发现核受体NR4A1是结核病中CD8⁺ T细胞免疫的关键抑制因子，并揭示NR4A1-NKG7轴可作为新的宿主导向治疗靶点 | 首次鉴定NR4A1作为结核病中CD8⁺ T细胞免疫的负调控因子，揭示了NR4A1-NKG7轴作为宿主导向治疗的新靶点，并结合小鼠模型、猕猴及人类数据集进行多物种验证 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究NR4A1在结核病CD8⁺ T细胞免疫调控中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 结核分枝杆菌感染的小鼠模型、猕猴及人类数据集中的CD8⁺ T细胞 | 免疫学 | 结核病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ChIP-qPCR, 空间分析 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 562 | 2026-09-21 |
A technical comparison of spatial transcriptomics platforms across six cancer types
2026-Jan-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03937-y
PMID:41526977
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研究论文 | 该研究系统比较了五种商业空间转录组平台在六种癌症类型的FFPE肿瘤样本中的表现，评估了转录本和UMI检测、基因-组织学一致性、细胞类型恢复及空间多组学整合等多个维度 | 首次在相同FFPE肿瘤样本上同时使用基于测序和基于成像的平台进行直接技术比较；首次对Xenium Multi-Tissue（377基因）和Xenium Prime（5,000基因）进行同样本比较；整合Visium靶向蛋白数据与匹配RNA图谱，揭示广泛的RNA-蛋白解耦和空间异质性 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 系统基准测试五种商业空间转录组平台在FFPE临床肿瘤样本中的技术性能，为空间转录组社区提供协调数据集和技术参考 | 六种癌症类型的匹配FFPE人类肿瘤切片 | 空间转录组学 | 肺癌、前列腺癌、乳腺癌、结直肠癌、胰腺癌、黑色素瘤 | 空间转录组学、靶向蛋白检测、空间多组学 | NA | 图像、文本 | 六种癌症类型的匹配FFPE人类肿瘤切片 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学、空间多组学 | Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium, CosMx | Visium v1使用10x Chromium单细胞3'试剂盒；Visium v2/CytAssist使用10x Chromium单细胞3'试剂盒和CytAssist仪器；Visium HD使用10x Chromium单细胞3'试剂盒；Xenium使用Xenium Multi-Tissue（377基因）和Xenium Prime（5,000基因）面板；CosMx使用CosMx空间分子成像仪；Visium v2靶向蛋白面板包含30种蛋白质 |
| 563 | 2026-09-21 |
Using Spatial Transcriptomics to Identify a Diagnostic Molecular Signature Associated with Reversible Dental Pulpitis
2026-Jan-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7955718/v1
PMID:41646399
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研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术分析牙髓组织的转录组图谱，识别与可逆性牙髓炎相关的诊断分子特征，并提出超越传统可逆/不可逆分类的炎症亚型分类框架 | 首次将空间转录组学（Visium-CytAssist-V2）应用于牙髓炎研究，在空间背景下解析牙髓组织的转录组特征；发现临床诊断为不可逆牙髓炎的样本与可逆性牙髓炎共享分子特征（相似的免疫-成纤维细胞比例及TLR4和神经炎症通路激活）；提出免疫-成纤维细胞相互作用而非单纯巨噬细胞变化是影响牙髓炎进展的关键因素；鉴定出PTN和CXCL14上调及ENG、SELE、COL4A1、CXCL1、CXCL13下调可能指示残余愈合潜力 | 样本量较小，仅分析了四例牙髓组织；未提及验证队列或更大规模的独立验证；空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析单细胞水平的分子异质性 | 研究牙髓炎的转录组图谱，识别炎症亚型，并改进超越传统可逆/不可逆框架的分类方法，以优化病例选择和维持牙齿活力 | 四例牙髓组织，包括健康牙髓（HL）、可逆性牙髓炎（RP）和不可逆牙髓炎（IP），特别关注邻近龋损的冠部区域 | 空间转录组学 | 牙髓炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 4例牙髓组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium CytAssist V2 |
| 564 | 2026-09-21 |
Aging-related Transcriptomic Changes with Spatial Resolution in the Human Prefrontal Cortex
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.12.698703
PMID:41648412
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研究论文 | 本研究对37名成年个体的死后前额叶皮层进行全转录组空间转录组测序，绘制皮层分层并揭示各层衰老机制 | 这是目前规模最大、最全面的前额叶皮层全生命周期空间转录组分析之一，首次在空间分辨率下揭示衰老驱动的转录组变化在皮层各层之间的差异 | 样本为死后组织，无法动态追踪衰老过程；样本量相对有限，且可能受死后间隔及个体差异影响 | 探究人类前额叶皮层衰老驱动的转录组变化是否在不同皮层之间具有差异 | 37名覆盖成年全生命周期的个体死后前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | 衰老 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 37名个体的死后前额叶皮层组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 565 | 2026-09-21 |
Spatial transcriptomics reveals organizational properties of mouse spinal cord and alterations in neuropathic pain
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.10.698734
PMID:41648549
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研究论文 | 该研究通过对成年小鼠脊髓进行空间分辨的单细胞转录组分析，揭示了脊髓中神经元亚型的空间和层状分布特征及其在神经病理性疼痛模型中的变化 | 首次构建了成年小鼠脊髓的空间分辨单细胞转录组图谱，揭示了神经元亚型的空间分布、轴向水平和性别特异性差异，以及背角神经元亚型的细胞间通讯模式，并识别了神经病理性疼痛模型中转录组和细胞间通讯改变的神经元亚型 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类脊髓仍需进一步验证；空间转录组技术的分辨率可能限制了对某些细胞类型的精确分析 | 旨在揭示脊髓的组织逻辑，包括神经元亚型的空间分布、细胞间通讯模式，以及神经病理性疼痛中的改变 | 成年小鼠脊髓 | 空间转录组学 | 神经病理性疼痛 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2026-09-21 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2026-Jan-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68257-4
PMID:41519914
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析小鼠肾上腺类固醇生成谱系的转录组，发现转录因子HHEX是维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导脂质耗竭的关键调控因子 | 首次将HHEX鉴定为肾上腺糖皮质激素产生细胞中富集度最高的转录因子；揭示HHEX是雄激素受体（AR）的靶基因，通过抑制青春期女性转录程序塑造肾上腺的性别二态性；发现HHEX通过保护脂滴免受雄激素诱导的脂噬来维持zF胆固醇酯含量；揭示HHEX维持最内侧肾上腺皮质细胞亚群身份并通过调控Abcb1b（P-糖蛋白/MDR1）表达影响类固醇外排和外源物水平 | 研究主要基于小鼠遗传模型，尚未在人类肾上腺中验证HHEX的功能；对HHEX调控下游靶基因的具体分子机制探讨有限；性别差异的机制研究主要集中于雄性小鼠的糖皮质激素缺乏表型 | 解析肾上腺类固醇生成谱系的转录组，鉴定调控肾上腺糖皮质激素产生和出生后肾上腺成熟的关键转录因子及其分子机制 | 小鼠肾上腺皮质（特别是束状带zF）的类固醇生成细胞谱系，包括雄性和雌性小鼠 | 单细胞转录组学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Sf1-Cre; Rosa报告小鼠模型、Hhex基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 567 | 2026-09-21 |
Unstressed cells are alike, but stressed cells differ: Environmental and single-cell heterogeneity in yeast stress responses
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.12.642837
PMID:41542409
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研究论文 | 该研究利用高通量单细胞RNA测序技术，对约13,000个暴露于多种压力条件下的酵母细胞进行转录组分析，重新定义了细胞应激反应的识别标准，揭示了未受压力细胞相似而受压力细胞存在异质性的现象 | 首次将转座子元件注释与编码基因联合分析，在单细胞水平上重新定义了应激反应的概念，从最强的平均信号转向最能预测单个细胞是否经历应激的特征；发现了应激抑制程序（以核糖体相关基因为主）具有跨数据集稳定预测能力，而应激诱导程序高度条件特异性；揭示了应激细胞可分为追求经典应激程序和转向转座子转录的互斥亚群 | 研究仅基于酵母模型，结论是否适用于高等生物尚需验证；单细胞RNA测序可能存在技术噪音和dropout问题；转座子元件的注释和定量可能不够完整；未能直接证明不同应激响应亚群与生存结局之间的因果关系 | 重新定义细胞应激反应的识别标准，从单细胞水平理解应激反应的异质性，区分平均信号与单细胞水平信号之间的差异 | 酵母细胞（约13,000个暴露于多种压力条件的单细胞） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 约13,000个酵母单细胞，涵盖超过6,600个表达特征 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高通量单细胞RNA测序平台 |
| 568 | 2026-09-21 |
Single-cell RNA analysis reveals unexpected hemocyte plasticity and immune cell specialization in a Drosophila overgrowth model
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698745
PMID:41542540
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇过度生长模型中的血细胞转录组多样性、谱系动态及免疫细胞特化特征 | 首次在果蝇过度生长模型中应用单细胞RNA测序解析近5万个血细胞，鉴定了17个转录上不同的血细胞簇，包括13个此前未识别的浆细胞亚型；发现了一个以Jonah家族丝氨酸蛋白酶高表达为标志的基质重塑浆细胞群体；通过拟时间分析揭示了浆细胞的可塑性和两种新的终末分化效应状态 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究先天免疫细胞如何适应慢性凋亡信号，解析果蝇肿瘤样过度生长条件下血细胞的转录多样性和谱系动态 | 携带不死性过度生长眼盘的果蝇幼虫的循环血细胞和组织驻留血细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 近50,000个循环和组织驻留血细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2026-09-21 |
A Transcriptional Atlas of Endothelial Cell Zonation Along the Pulmonary Vascular Tree
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.17.654540
PMID:41542612
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序数据构建了肺血管树中内皮细胞沿血管连续体的转录组图谱，并开发了分析框架来划定转录组梯度并分配血管大小评分 | 开发了一个分析框架，利用扩散伪时间在所有肺内皮细胞中划定转录组梯度，并分配血管大小评分，从而将单个内皮细胞分类到血管连续体上；揭示了毛细血管内的动静脉极性，并成功应用于多个已发表的小鼠和人类数据集 | 研究基于P3小鼠肺，可能不完全代表其他发育阶段或人类情况；框架的普适性需要进一步验证 | 旨在全面绘制肺血管树中内皮细胞的转录组图谱，并开发分析框架以从scRNA-seq数据中进行空间推断和获得机制见解 | P3小鼠肺内皮细胞，以及多个已发表的小鼠和人类数据集 | 单细胞转录组学 | 肺血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 扩散伪时间 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-09-21 |
Spatial Imbalance of Innate-like T-Cell Niches Underlies Clinical Trajectories in Psoriasis
2026-Jan-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020715
PMID:41596369
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研究论文 | 该研究通过空间转录组学和CITE-seq技术，揭示了银屑病炎症中γδT细胞和MAIT细胞龛的空间分布失衡及其与临床严重程度的关系 | 首次在银屑病中系统描绘了γδT和MAIT细胞龛的空间组织格局，发现两种先天性T细胞亚群在皮肤不同层次中的分布呈现明显分化，且其动态变化与临床严重程度呈相反关联模式 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明银屑病炎症中先天性T细胞（iLTCs）的空间组织及组织相关程序，探索其与临床轨迹的关联 | 银屑病患者的皮肤组织和外周血样本 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学、CITE-seq | NA | 空间转录组数据、单细胞多组学数据、文本 | 多个独立队列的银屑病患者样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学、CITE-seq | NA | NA |
| 571 | 2026-09-21 |
GLP-1 Targeting Agents Impair Chemoimmunotherapy Effectiveness in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8380296/v1
PMID:41542041
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研究论文 | 本文检测了GLP-1R在多种人类肿瘤中的表达，并重点分析三阴性乳腺癌中GLP-1暴露对肿瘤细胞和免疫细胞的影响及其对化疗免疫治疗疗效的削弱作用。 | 首次系统检测GLP-1R在多种人类肿瘤中的表达，并结合空间转录组学揭示GLP-1暴露重塑三阴性乳腺癌肿瘤微环境、促进恶性细胞间充质转化并破坏巨噬细胞炎症反应，同时提供临床证据表明GLP-1药物降低新辅助化疗的病理完全缓解率。 | 摘要未明确说明样本量及研究设计的局限性，缺乏对GLP-1R在其他肿瘤类型中作用的深入分析。 | 评估GLP-1R在人类肿瘤中的表达与活性，并探究GLP-1靶向药物对三阴性乳腺癌化疗免疫治疗效果的影响。 | 多种人类肿瘤类型，重点关注三阴性乳腺癌患者及肿瘤细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2026-09-21 |
Stack: In-Context Learning of Single-Cell Biology
2026-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698608
PMID:41542582
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研究论文 | 本文提出了Stack，一个基于1.49亿个统一预处理的人类单细胞训练的基础模型，利用表格注意力机制生成基于上下文的细胞表征，实现单细胞生物学的上下文学习 | 提出了首个基于表格注意力机制的单细胞基础模型，使细胞本身在推理时作为引导示例，实现无需数据特异性微调的上下文学习能力，并构建了首个跨越28种组织、40个细胞类别和201种扰动的人类全生物体扰动细胞图谱 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一个能够利用上下文信息生成细胞表征的基础模型，实现单细胞生物学的通用上下文学习，并预测条件对目标细胞群体的影响 | 人类单细胞转录组数据，涵盖多种物种、疾病和生物条件下的细胞表型 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 基础模型（Foundation Model），表格注意力机制（Tabular Attention） | 表格数据（单细胞基因表达数据） | 1.49亿个统一预处理的人类单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 573 | 2026-09-21 |
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2026-01-08, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf543
PMID:41132132
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研究论文 | 通过对722例肌肉活检进行批量RNA测序，结合空间转录组学和免疫组化，揭示肉芽肿性肌炎的转录组特征及其与疾病活动性的关联 | 首次系统性地定义了肉芽肿性肌炎的转录组图谱，发现了由1293个上调基因和256个下调基因组成的特异性基因签名，并构建了准确率高达98.6%的支持向量机诊断模型，同时鉴定出CHIT1为与疾病严重程度最显著相关的上调基因 | 摘要未明确提及研究的局限性 | 通过定义肉芽肿性肌炎的特异性转录组图谱来阐明其病理生理机制 | 肉芽肿性肌炎患者的肌肉活检样本 | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化 | 支持向量机 | 图像, 文本 | 722例肌肉活检样本，包括38例来自肉芽肿性肌炎患者，其余为其他肌病患者和健康对照 | NA | 单细胞空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2026-09-21 |
Fishing with Two Lines: A Hybrid Approach to Spatial Transcriptomic Discovery
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698201
PMID:41542551
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研究论文 | 本文开发了一种“双化学”方法，将10X Genomics Xenium V1定制面板（高灵敏度，最多480个基因）与Prime 5K面板（广覆盖，5001个基因）结合在同一组织切片上，以解决空间转录组学中基因数量与灵敏度之间的权衡问题 | 创新性地提出了“双化学”方法，在同一组织切片上共杂交Prime和V1探针，并顺序运行V1和Prime解码化学，实现了高灵敏度分析和广泛基因覆盖的统一，同时通过同一细胞中两种化学信息的整合保留了更多细胞并获取额外信息 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决空间转录组学中基因检测数量与单基因灵敏度之间的权衡问题，实现高灵敏度分析和基因发现的同时进行 | 人类肺组织微阵列 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 人类肺组织微阵列（具体样本数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics Xenium V1, Prime 5K | 10X Genomics Xenium V1定制面板（最多480个基因）和Prime 5K面板（5001个基因），在同一组织切片上共杂交并顺序解码 |
| 575 | 2026-09-21 |
Single-cell multi-omics reveals DUSP9 as a key regulator of cancer stemness and a potential therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2026-01-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07630-9
PMID:41508037
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研究论文 | 该研究整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，揭示DUSP9通过ERK–FOXO3轴调控肝细胞癌肿瘤干细胞干性，并发现候选化合物AKOS000434153可抑制HCC细胞恶性表型 | 首次通过单细胞多组学整合分析将DUSP9鉴定为肝细胞癌肿瘤干细胞干性的关键调控因子，揭示其通过ERK–FOXO3轴增强干性的机制，并发现DUSP9⁺细胞定位于富集CAF的免疫抑制微环境，同时筛选出靶向该通路的候选化合物AKOS000434153 | 研究主要基于体外功能实验验证，缺乏体内动物模型验证DUSP9的调控关系及其作为治疗靶点的有效性，仍需进一步开展体内实验确认 | 识别与肝细胞癌肿瘤干细胞干性相关的分子调控因子，阐明其调控机制，并探索其作为治疗靶点和生物标志物的潜力 | 肝细胞癌（HCC）肿瘤组织及细胞，包括肿瘤干细胞（CSCs）和DUSP9⁺恶性亚群细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 576 | 2026-09-21 |
The dorsal aortic compartment is a developmental source of brown adipose tissue in mice
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68147-9
PMID:41501080
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研究论文 | 该研究揭示了小鼠棕色脂肪组织的一种非体节来源，即胚胎期背主动脉区域的多能间充质祖细胞 | 发现背主动脉区域存在表达Osr1的多能间充质祖细胞，这些细胞可形成部分棕色脂肪组织，挑战了棕色脂肪组织仅来源于体节中胚层的传统观点 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；未明确这些祖细胞在成体中的具体作用及调控机制 | 探究棕色脂肪组织的发育起源，特别是非体节来源的祖细胞 | 小鼠胚胎期背主动脉区域的间充质祖细胞及棕色脂肪组织 | 发育生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞测序，遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2026-09-21 |
Proteotranscriptomic Dissection of Breast Cancer T Cell States Identifies CD103+ Tfh-derived Cytotoxic Cells Linked to Immunotherapy Response
2026-Jan-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8394722/v1
PMID:41542042
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序和多重蛋白表位分析，解析了乳腺癌肿瘤微环境中CD4 T滤泡辅助样细胞的异质性，发现CD103+ Tfh衍生细胞具有细胞毒性并与免疫治疗响应相关 | 首次在乳腺癌中鉴定出三种不同的CD4 Tfh样细胞状态，发现CD103+ Tfh样细胞具有组织驻留、耗竭和细胞毒性特征，并揭示了其通过CCL趋化因子和CSF1与CXCL10+巨噬细胞相互作用，且CD103+ Tfh与IGFL2 Tfh的比值及CD103+亚群的克隆扩增对抗PD-1治疗响应的预测价值优于耗竭CD8 T细胞 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解析乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞状态的复杂性，特别是CD4 T细胞亚群，并探索其与免疫治疗响应的关系 | 乳腺癌样本中的免疫细胞，特别是CD4 T滤泡辅助样细胞 | digital pathology | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，多重蛋白表位分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白表位数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, 多重蛋白表位分析 | NA | NA |
| 578 | 2026-09-21 |
The 2026 Nucleic Acids Research database issue and the online molecular biology database collection
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1427
PMID:41431842
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综述 | 介绍2026年《核酸研究》数据库专刊的内容，包括182篇论文，涵盖新数据库和更新数据库，并总结了在线分子生物学数据库集合的年度更新情况 | 首次报道了NapRNAdb（非帽化RNA数据库）和GlycoRNAdb等新数据库，并推出了JoGo（人类单倍型层级命名与情境化数据库）和So3D（真正的三维空间转录组学数据库）两项突破性成果 | 作为数据库专刊的介绍性文章，未涉及具体技术方法的深入探讨，也未提供各数据库的详细性能评估 | 汇总和介绍2026年生物学及相关领域的最新数据库资源，更新在线分子生物学数据库集合 | 生物信息学数据库，包括核酸数据库、蛋白质结构数据库、结构域与家族数据库、酶数据库、蛋白质组数据库、人类单倍型数据库、空间转录组学数据库、基因命名数据库和基因本体数据库等 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 文本 | 共审查了899个条目，新增96个资源，移除319个失效URL，数据库总数达到2173个 | NA | NA | NA | NA |
| 579 | 2026-09-21 |
Divergent role of CD8 T cells with distinct metabolic phenotypes during curative radio-immunotherapy in hot versus cold tumors
2026-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684274
PMID:41279819
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研究论文 | 本研究开发了一种放射免疫治疗方案，可治愈小鼠的热肿瘤和冷肿瘤，并探索了CD8 T细胞在热结肠癌与冷黑色素瘤中发挥的不同作用 | 引入表达mCherry的CD8 T细胞免疫健全小鼠模型进行细胞追踪，结合单细胞功能、代谢和基因表达的时间变化分析，揭示了冷肿瘤中CD8 T细胞虽被激活但无法驱动肿瘤治愈，可能与静态氧化代谢、耗竭表型及肿瘤MHC-I表达下调有关 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中验证；冷肿瘤中CD8 T细胞无法驱动治愈的具体机制仍需进一步深入探究 | 探索CD8 T细胞在热肿瘤与冷肿瘤放射免疫治疗中的不同作用及其潜在机制 | 小鼠热结肠癌模型和冷黑色素瘤模型中的CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、黑色素瘤 | 流式细胞术、多光子成像、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 580 | 2026-09-21 |
Type I interferon drives dysfunction of a distinct CD8+ HLA-DRB1+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.02.26343348
PMID:41607660
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研究论文 | 本研究全面表征了系统性红斑狼疮（SLE）患者中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群的特征，揭示I型干扰素驱动该亚群功能失调的机制 | 首次全面表征SLE中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群，揭示其兼具细胞毒性激活、增殖潜能、耗竭和衰老的矛盾特征，并证明I型干扰素通过促进耗竭和脱颗粒障碍驱动这种矛盾状态 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 全面表征系统性红斑狼疮中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞的特征及其在I型干扰素信号下的功能变化 | SLE患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞，以及狼疮肾炎肾脏浸润CD8+ T细胞数据集 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞TCR测序 | NA | NA |