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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-09-21 |
Binary-SPA: A Reference-Free Method for Cell Annotation in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712369
PMID:41889971
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研究论文 | 本文提出了一种名为Binary-SPA的无参考计算方法，用于高分辨率空间转录组学数据中的细胞类型注释，通过两阶段策略实现高覆盖率和高准确性的细胞注释 | 提出了一种无需外部参考数据的细胞注释框架，采用两阶段策略：第一阶段利用预定义标记集进行二分类以识别高置信度细胞，第二阶段将这些高置信度细胞作为内部参考进行基于锚点的标签转移，从而在100%注释覆盖率下达到与需要匹配scRNA-seq参考数据的标签转移方法相当的准确性 | 摘要中未明确提及该方法的局限性 | 解决高分辨率空间转录组学中细胞类型注释依赖外部参考数据或标记基因方法准确性不足和覆盖范围有限的问题 | 高分辨率空间转录组学数据，包括多种组织类型和平台的数据，以及骨髓活检等挑战性样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 542 | 2026-09-21 |
PalmaClust: A graph-fusion framework leveraging the Palma ratio for robust ultra-rare cell type detection in scRNA-seq data
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712161
PMID:41890078
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研究论文 | 本文提出PalmaClust，一种利用帕尔马比率构建融合KNN图的聚类框架，用于从scRNA-seq数据中灵敏检测超稀有细胞类型 | 首次将社会学中的帕尔马比率引入单细胞分析，用于识别由极端稀疏性驱动的标记基因，并构建多图融合聚类框架，结合局部精炼策略重新优先考虑帕尔马比率排名基因 | 未明确说明方法在大规模数据集上的可扩展性、参数选择的敏感性以及在不同组织类型中的泛化能力 | 开发一种可扩展、统计基础扎实的方法，灵敏检测稀有细胞群体，同时提供校准的置信度和可解释的分子特征 | 单细胞RNA测序数据中的稀有和超稀有细胞类型，包括瞬时祖细胞、治疗抵抗性肿瘤亚克隆和抗原特异性淋巴细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | KNN图融合聚类 | 文本 | 多个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2026-09-21 |
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf317
PMID:41384851
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研究论文 | 该研究利用多模态单细胞测序和体外刺激实验，定义了来自肺、小肠、脾、骨髓和淋巴结的人巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性特征 | 首次系统性地在单细胞水平上比较了多个黏膜和淋巴器官中的人巨噬细胞的组织适应性转录和蛋白质特征，并揭示了染色质可及性差异及转录因子利用差异可能是维持组织特异性特征的机制 | 样本来源于器官捐献者，样本量有限，可能无法完全代表不同个体间的异质性；体外刺激实验可能无法完全模拟体内复杂的组织微环境 | 定义人巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性分子特征，并探索其维持机制 | 从肺、小肠、脾、骨髓和淋巴结中分离的人巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | NA | 多模态单细胞测序、单核ATAC测序、体外刺激实验 | NA | 单细胞转录组、单核ATAC、蛋白质分泌数据 | 来自多个器官捐献者的肺、小肠、脾、骨髓和淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学 | NA | NA |
| 544 | 2026-09-21 |
Immune checkpoints in a genetically engineered mouse model of spontaneous autoimmune uveitis
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf334
PMID:41847848
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，分析了自发性自身免疫性葡萄膜炎基因工程小鼠模型中针对视网膜自身抗原IRBP P2表位的CD4+ T细胞的免疫检查点机制 | 揭示了在眼引流淋巴结中Treg细胞作为检查点限制视网膜炎症发展的关键作用，并发现可能存在额外的外周免疫耐受机制 | 未在摘要中明确说明 | 研究自发性自身免疫性葡萄膜炎中免疫检查点的作用机制 | AireGW/+Lyn-/- C57BL/6基因工程小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 545 | 2026-09-21 |
Single-cell analysis of recruited ILC2 cell fate during transition from circulation to establishment of tissue residency
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf352
PMID:41847845
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术，追踪了在巴西日圆线虫感染过程中循环ILC2细胞向肺部组织驻留转变的细胞命运 | 首次结合报告小鼠、scRNA-seq和CITE-seq技术追踪循环ILC2细胞在感染过程中向肺部组织驻留的动态转变过程，发现转变主要发生在细胞从血管进入肺实质时，且转化的ILC2细胞保留肠道来源的独特基因表达并与增强的功能相关 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类中验证；可能未完全捕捉组织驻留过程的全部微环境因素 | 探究循环ILC2细胞在向肺部组织驻留转变过程中的细胞命运及其与肺驻留ILC2细胞的关系 | 小鼠循环ILC2细胞和肺驻留ILC2细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | scRNA-seq, CITE-seq | NA | 单细胞转录组和表位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 546 | 2026-09-21 |
Müller glia-mediated regeneration restores neuronal diversity and retinal circuit organization in the adult zebrafish
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.15.711785
PMID:41889825
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研究论文 | 该研究结合诱导谱系追踪、单细胞RNA测序和形态学分析，揭示成年斑马鱼Müller胶质细胞介导的视网膜再生能够恢复神经元多样性及视网膜回路组织 | 结合诱导谱系追踪、单细胞RNA测序和形态学分析，系统定义成年斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞来源神经元的分子和结构特征；发现损伤情境影响再生神经元的相对比例，但Müller胶质细胞来源祖细胞保留广泛的神经发生潜力 | 仅使用光损伤和NMDA损伤两种模型，未评估其他损伤类型；再生神经元与内源性对应细胞仍存在差异，主要反映持续成熟过程；未在功能层面验证再生视网膜回路的视觉恢复 | 探究成年斑马鱼Müller胶质细胞介导的视网膜再生在多大程度上恢复丢失神经元身份、多样性及结构特征 | 成年斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞及其再生的视网膜神经元 | 数字病理学, 机器学习 | 视网膜损伤 | 单细胞RNA测序, 诱导谱系追踪, 形态学分析 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 547 | 2026-09-21 |
Preferential formation of NUP98-KDM5A condensates at specific H3K4me3-rich loci drives leukemogenic gene expression
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712262
PMID:41889846
|
研究论文 | 本文以NUP98-KDM5A为模型，通过整合细胞成像、体外重构和基因组分析，揭示了NUP98-KDM5A融合蛋白在H3K4me3富集位点优先形成凝聚体，从而驱动白血病相关基因表达的机制 | 首次揭示了NUP98-KDM5A凝聚体的形成受H3K4me3结合促进，提出了基于局部H3K4me3密度的定量靶向机制，解释了为何在基因组广泛存在H3K4me3的情况下凝聚体仍能选择性富集于白血病相关HOX基因簇 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 解析染色质结合如何影响NUP98-KDM5A凝聚体的形成及其基因靶向机制，理解染色质相关凝聚体如何解读表观遗传景观 | NUP98-KDM5A融合蛋白、H3K4me3修饰位点、白血病细胞及患者单细胞测序数据 | 机器学习, 数字病理学 | 白血病 | 细胞成像, 体外重构, 基因组分析, 单细胞测序 | NA | 图像, 基因组数据, 文本 | 患者单细胞测序数据（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 548 | 2026-09-21 |
Microglia Display Heterogeneous Initial Responses to Disseminated Tumor Cells
2026-03-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3425
PMID:41369553
|
研究论文 | 本研究结合体内命运图谱成像、单细胞RNA测序和全息光转换技术（opto-omics），追踪播散性肿瘤细胞定植过程中肿瘤命运及小胶质细胞的早期异质性反应 | 首次在同一个动物体内随时间追踪肿瘤命运和早期小胶质细胞反应，揭示了小胶质细胞对脑转移的早期异质性反应及可靶向的可塑性，发现通过抑制TGFβ信号或敲除肿瘤细胞表面抗原CD24和CD47可改变小胶质细胞表型 | 摘要中未提及具体局限性 | 理解发育中的肿瘤微环境中异质性小胶质细胞亚群如何被调控，为早期阶段消除转移性肿瘤的治疗策略铺平道路 | 播散性肿瘤细胞定植过程中的小胶质细胞及肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序、体内命运图谱成像、全息光转换技术（opto-omics） | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 549 | 2026-09-21 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
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研究论文 | 本文提出了一种全无监督方法ITEC，通过迭代跟踪与纠错，高保真地重建了斑马鱼胚胎中1850万个细胞的完整谱系和命运图谱 | ITEC是首个能够自动、高保真地重建胚胎中每个细胞谱系的全无监督方法，并在TB级数据上验证了超过99.7%的准确率 | 摘要中未明确提及研究限制 | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图谱，并探索细胞尺度和单胚胎水平的发育动态 | 斑马鱼、小鼠等跨物种胚胎数据集 | 计算生物学、发育生物学 | NA | 单细胞谱系追踪、空间转录组学 | 迭代跟踪与纠错算法 | 图像、文本 | 总计1850万个细胞，来自斑马鱼、小鼠等四个跨物种数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 550 | 2026-09-21 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
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研究论文 | 提出UniST统一生成式AI框架，从稀疏连续切片中计算重建密集连续的三维空间转录组景观 | 首个统一生成式AI框架，集成核点卷积与交叉注意力点云上采样、光流插值连续切片重建、图自编码器与隐式神经表示基因表达填补三个模块，在不改变实验技术的前提下实现三维空间转录组计算重建 | 仅在小鼠胚胎和两种人类癌症组织中验证，未在其他物种或更多组织类型中广泛验证；依赖现有稀疏连续切片数据，重建精度受原始数据质量影响 | 从稀疏序列切片中计算重建密集连续的三维空间转录组景观，弥补现有二维切片采集导致的三维组织信息不完整问题 | 小鼠胚胎数据集和两种人类癌症三维组织 | 数字病理学 | 肺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 生成式AI, 核点卷积, 交叉注意力, 光流插值, 图自编码器, 隐式神经表示 | 空间转录组数据, 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 551 | 2026-09-21 |
Melanocyte loss dominates the vitiligo transcriptome: a rank-based meta-analysis
2026-Mar-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.07.26345817
PMID:41728299
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研究论文 | 本研究对六项独立转录组研究进行基于秩的荟萃分析，识别白癜风皮损的共识特征，发现黑素细胞丢失是主要转录组特征 | 采用基于秩的荟萃分析方法整合微阵列、bulk和单细胞RNA-seq多种平台数据，发现白癜风中黑素细胞丢失信号稳健且一致，并识别了高黑素细胞特异性的候选标志物CYB561A3和QPCT | 免疫反应激活在不同研究间存在异质性，可能受采样方法和疾病特征影响，需要进一步研究；可能受纳入研究数量和分析方法限制 | 识别白癜风皮损皮肤的共识转录组特征，揭示其分子机制 | 白癜风患者皮损皮肤样本及健康对照样本 | 转录组学 | 白癜风 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 115个样本，来自6项独立研究 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 552 | 2026-09-21 |
Predicting targeted- and immunotherapeutic response outcomes in melanoma with single-cell Raman spectroscopy and AI
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654612
PMID:41889902
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研究论文 | 该研究结合单细胞拉曼光谱与机器学习，对黑色素瘤细胞系和患者样本进行无创性细胞表型分析和治疗耐药性预测 | 首次将单细胞拉曼光谱与机器学习相结合，实现非破坏性的单细胞水平治疗反应预测，并开发了适用于患者样本的两阶段评估流程 | 样本量有限（9例患者样本），需要在更大规模的多中心队列中进一步验证方法的普适性和临床适用性 | 开发一种基于单细胞拉曼光谱和机器学习的非破坏性方法，用于快速预测黑色素瘤患者对靶向治疗和免疫治疗的耐药性反应 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，以及9例已知耐药谱的黑色素瘤患者来源样本 | 数字病理学, 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 拉曼光谱 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，9例黑色素瘤患者来源样本，33种临床相关患者-药物组合 | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2026-09-21 |
Vps35 p. D620N causes Lrrk2 kinase hyperactivity, chronic microglial activation and inflammation
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710482
PMID:41846978
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Vps35 p.D620N敲入小鼠小胶质细胞的转录组和功能变化，揭示了该突变导致慢性促炎性小胶质细胞表型及其对帕金森病发病机制的贡献 | 首次在Vps35 p.D620N敲入小鼠中系统研究小胶质细胞的转录组和功能变化，揭示了逆转录体功能障碍与LRRK2激酶过度活跃如何交叉影响小胶质细胞生物学，从而促进帕金森病发病 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证；单细胞RNA测序仅分析了六个月龄小鼠的小胶质细胞，未涵盖疾病不同阶段；未深入探讨Vps35 p.D620N如何具体导致LRRK2激酶过度活跃的分子机制 | 探究Vps35 p.D620N突变对小胶质细胞转录组和免疫功能的影响，以及其在帕金森病发病机制中的作用 | Vps35 p.D620N敲入小鼠（VKI）的小胶质细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 6只六个月龄VKI小鼠的小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 554 | 2026-09-21 |
CXCR6+ T Cells Drive Immune Checkpoint Inhibitor Myocarditis
2026-Mar-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 该研究发现CXCR6+ T细胞驱动免疫检查点抑制剂相关心肌炎，并通过小鼠模型和患者数据验证了CXCR6作为治疗靶点的潜力 | 首次发现CXCR6是活化心脏T细胞的关键标志物，并证明CXCR6+ T细胞对ICI心肌炎发病是必需的，同时提出CXCR6作为治疗靶点 | 主要基于小鼠模型和药物警戒数据库分析，需要进一步临床验证 | 探究抗LAG-3/PD-1联合治疗相关心肌炎的驱动T细胞群和信号通路 | VigiBase数据库中的患者数据、Lag3-/-Pdcd1-/-小鼠模型、临床前模型和患者数据 | 免疫学、心血管疾病 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学、心电图 | NA | 文本、图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2026-09-21 |
Phenotypically similar but functionally distinct NK cell populations within the human maternal-fetal interface
2026-Mar-10, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlag001
PMID:41808348
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研究论文 | 研究比较了足月妊娠母胎界面中蜕膜-胎盘界面（DPI）和蜕膜中的自然杀伤（NK）细胞，发现两者表型相似但功能不同 | 发现在解剖学相邻的两种组织中存在功能不同的组织驻留NK细胞群，且这种功能差异不能通过细胞表面表型或转录组预测 | 仅分析了足月妊娠样本，未涉及早孕期或病理妊娠，且未明确导致功能差异的具体机制 | 探究足月妊娠母胎界面的NK细胞是否具有效应功能，以及其功能与表型、转录组的关系 | 足月妊娠母胎界面（蜕膜-胎盘界面和蜕膜）中的NK细胞 | 单细胞组学、免疫学 | 正常妊娠 | 高参数流式细胞术、单细胞测序 | NA | 流式细胞数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 556 | 2026-09-21 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 该研究构建了基于铁死亡相关基因的机器学习预测模型，揭示了IFN-γ通过IRF1上调AGPAT3驱动脂质重塑，从而增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性并提升免疫治疗疗效 | 首次揭示IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过重塑多不饱和醚磷脂代谢增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性，并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习模型用于预测免疫检查点抑制剂响应 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的治疗潜力及其分子机制 | 肿瘤细胞、免疫检查点抑制剂治疗的肿瘤患者 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、脂质组学、转录组学、ChIP-seq、CUT&Tag | 机器学习预测模型 | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2026-09-21 |
Ribosomal modifications are associated with mesenchymal fate selection in the neural crest lineage
2026-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70375-6
PMID:41803115
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研究论文 | 该研究利用Smart-seq2单细胞转录组学揭示核糖体RNA修饰和核糖体组装因子与神经嵴细胞间充质命运决定相关，并涉及神经母细胞瘤进展 | 首次发现间充质命运承诺与rRNA修饰及核糖体组装因子表达相关，而非结构性核糖体蛋白；鉴定EMG1和NHP2介导的18S rRNA关键修饰m¹acp³ψ及其成熟需要TSR3；将核糖体异质性与正常发育和肿瘤进展联系起来 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究核糖体修饰和核糖体组装在神经嵴谱系命运决定中的作用及其对神经母细胞瘤进展的影响 | 神经嵴细胞、颅神经嵴细胞、神经母细胞瘤细胞系及患者数据 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | Smart-seq2单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | Illumina | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞转录组测序平台 |
| 558 | 2026-09-21 |
ChatSpatial: Schema-Enforced Agentic Orchestration for Reproducible and Cross-Platform Spatial Transcriptomics
2026-Mar-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.26.708361
PMID:41890081
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研究论文 | 本文提出了ChatSpatial，一个基于LLM和模式约束的智能体编排平台，用于可重复且跨平台的空间转录组学分析 | LLM从预验证的工具模式中选择而非生成自由形式代码，领域知识嵌入模式描述中用于上下文感知参数推断；基于MCP协议统一了Python和R生态系统中15个分析类别的60多种方法；实现了工作流级别的近乎确定性的可重复性 | 摘要中未明确提及 | 解决空间转录组数据分析中跨Python和R生态系统计算方法的复杂性问题，实现可重复的跨平台分析工作流 | 空间转录组数据，以及两个已发表研究（卵巢癌亚克隆异质性和口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境组织） | 空间转录组学 | 卵巢癌, 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | LLM | 空间转录组数据 | 两个已发表研究的数据集（卵巢癌和口腔鳞状细胞癌） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 559 | 2026-09-21 |
Spatially defined danger zone shapes gastric cancer progression through CCDC80+ fibroblast-induced CD8+ T cell dysfunction
2026-03-07, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02287-1
PMID:41793512
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研究论文 | 该研究通过空间转录组学、单细胞分析和机器学习，揭示了胃癌中一个由CCDC80+成纤维细胞驱动的“危险区”空间结构，该结构通过CXCL12-CXCR4轴招募CD8+ T细胞并诱导其功能障碍，促进免疫抑制和肿瘤进展 | 首次定义并表征了胃癌中一个独特的基质-免疫-血管核心区域（危险区），揭示了CCDC80+成纤维细胞通过CXCL12-CXCR4信号轴招募并导致CD8+ T细胞耗竭和凋亡的新机制，并开发了基于XGBoost和LightGBM的预后预测模型 | 摘要未明确提及研究的局限性 | 探究胃癌肿瘤微环境中空间异质性对疾病进展和免疫抑制的影响，并寻找新的生物标志物、预后工具和治疗靶点 | 侵袭性小鼠肿瘤模型和人类胃癌样本 | 数字病理学, 机器学习 | 胃癌 | 空间转录组学, 单细胞分析, 免疫组织化学, 细胞共培养 | XGBoost, LightGBM | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2026-09-21 |
SR2P: an efficient stacking method to predict protein abundance from gene expression in spatial transcriptomics data
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.709692
PMID:41846960
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研究论文 | 该文章提出了SR2P，一个基于堆叠的机器学习框架，用于从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度 | SR2P整合了11个互补的预测模型，在多个空间多组学基准测试中持续优于现有方法，能够从仅有RNA的空间数据中推断蛋白质丰度 | 技术和成本限制仍然是空间多组学分析的门槛，缺乏多组学空间数据限制了免疫细胞及其信号通路的识别 | 从空间转录组学数据中的RNA表达预测空间蛋白质丰度，扩展当前空间平台在肿瘤免疫学研究中的分析能力 | 空间转录组学数据，头颈部鳞状细胞癌患者样本 | 空间转录组学，机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学，空间多组学 | 堆叠集成学习 | RNA表达数据，图像 | NA | NA | 空间转录组学，空间多组学 | NA | NA |