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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-03-20 |
Neutrophils have altered response to acute respiratory viral infection in sputum of patients with rheumatoid arthritis
2026-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2026.100665
PMID:41852854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎患者与健康对照者在呼吸道感染前后痰液中的免疫细胞转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示类风湿关节炎患者中性粒细胞在急性呼吸道病毒感染后存在持续的转录组改变,特别是与NETosis和炎症反应相关的基因模块 | 样本量较小(仅5名女性捐赠者),缺乏男性样本,且仅观察了感染后30天的短期变化 | 探究类风湿关节炎患者肺部免疫细胞在呼吸道感染前后的转录组特征差异 | 类风湿关节炎患者和健康对照者的痰液样本 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名女性捐赠者(2名健康,3名类风湿关节炎),共23,094个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Flex | 10x Flex单细胞RNA测序方案 |
| 542 | 2026-03-20 |
Refinement of histologic subtypes and identification of biomarkers linked to unfavorable prognosis in cholangiocarcinoma: The ENSCCA registries' framework for digital twin advancement
2026-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001425
PMID:40513068
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研究论文 | 本研究通过建立欧洲胆管癌组织学注册库,分析胆管癌的组织学亚型和生物标志物,以识别与不良预后相关的亚型 | 首次利用多中心数字化注册库结合组织学、空间转录组学和影像学技术,识别出PAS HIGH LBD iCCA这一具有特定分子特征和不良预后的胆管癌亚型 | 样本量相对有限(293例患者),且空间转录组学分析仅覆盖18例病例,可能影响结果的普遍性 | 研究胆管癌的组织学异质性及其临床相关性,识别与预后相关的生物标志物 | 胆管癌患者 | 数字病理学 | 胆管癌 | 免疫组织化学染色、空间转录组学分析、计算机断层扫描影像学和放射组学技术 | Cox回归分析 | 组织学图像、免疫组化数据、CT扫描图像、空间转录组学数据 | 293例胆管癌患者,其中112例进行了CT扫描分析,18例进行了空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 543 | 2026-03-20 |
MIF-mediated crosstalk between THRSP + hepatocytes and CD74 + lipid-associated macrophages in hepatic periportal zone drives MASH
2026-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001429
PMID:40590856
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研究论文 | 本研究揭示了THRSP+肝细胞与CD74+脂质相关巨噬细胞在肝脏门静脉区通过MIF介导的串扰驱动MASH进展的机制 | 首次在空间转录组学层面揭示了肝脏门静脉区THRSP+肝细胞与CD74+脂质相关巨噬细胞通过MIF介导的相互作用在MASH进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,且THRSP抑制剂C6的临床转化潜力需进一步评估 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展的空间分区机制及细胞间相互作用 | MASH小鼠模型及MASH患者肝脏组织 | 空间转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) | 空间转录组学,CellPhoneDB分析,基因过表达/敲除实验 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | MASH小鼠及患者肝脏组织(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 544 | 2026-03-20 |
Intratumour ploidy heterogeneity and clonal evolution in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.11.015
PMID:41297676
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研究论文 | 本研究开发了一种新型高通量原位定量数字病理学方法,用于评估肝细胞癌(HCC)的核倍性,并揭示了其与预后和克隆演化的关系 | 开发了一种基于全玻片成像的定量数字病理学新方法,用于原位评估肿瘤核倍性,并结合空间转录组学揭示了超倍体HCC从肿瘤内超倍体灶克隆演化的直接证据 | 研究样本量相对有限(111例),且主要基于回顾性分析,需要前瞻性研究进一步验证其临床适用性 | 评估肝细胞癌(HCC)中核倍性异质性的预后价值,并探究超倍体克隆在肿瘤内的克隆演化机制 | 111例人类肝细胞癌(HCC)样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全外显子组测序(WES)、bulk RNA测序、3' mRNA测序、空间转录组学、定量数字病理学 | NA | 图像、基因组数据、转录组数据 | 111例人类HCC样本 | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, whole-exome sequencing | NA | NA |
| 545 | 2026-03-20 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophage-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-Apr-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00235.2025
PMID:41481288
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠肺泡巨噬细胞在单次臭氧暴露模型中浓度依赖性的转录组学变化和功能调控 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了肺泡巨噬细胞对不同浓度臭氧暴露的转录组响应,并识别出五个不同的亚群及其功能特征 | 研究仅基于成年雄性C57BL/6J小鼠模型,且暴露后观察时间点固定(22-24小时),未涵盖长期效应或性别差异 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制,特别是不同暴露浓度下的转录组变化和功能状态 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组实验小鼠(过滤空气暴露组、1 ppm臭氧暴露组、1.5 ppm臭氧暴露组),每组具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 546 | 2026-03-20 |
Pathological mechanisms and treatment strategies for immune checkpoint inhibitor-associated myocarditis: insights from single-cell sequencing
2026-Apr, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01156-3
PMID:41520297
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在免疫检查点抑制剂相关心肌炎(ICI-M)研究中的应用进展,并探讨了基于机制见解的靶向治疗策略 | 强调了单细胞测序技术相较于传统批量测序在解析复杂组织(如心肌炎)中特定细胞群组成变化和基因表达特征方面的变革性优势,为阐明ICI-M的发病机制提供了关键见解 | 本文是一篇综述,未报告原始实验数据或新模型,其讨论基于现有文献,可能受限于已发表研究的覆盖范围和深度 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的病理机制,并探讨基于机制见解的精准干预策略 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 547 | 2026-03-20 |
Cardiac lymphatics: functional plasticity in development, disease, and precision-targeted therapies
2026-Apr, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01159-0
PMID:41571961
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综述 | 本文综述了心脏淋巴系统在发育、疾病中的功能可塑性及其精准靶向治疗的最新进展 | 利用单细胞转录组学揭示了心脏淋巴内皮细胞的功能亚群,并提出了性别特异性分子调控和精准靶向纳米治疗等新兴策略 | 自主神经与淋巴系统整合以及谱系特异性表观遗传记忆等关键问题尚未解决 | 探讨心脏淋巴系统在维持心肌稳态、疾病病理生理学中的作用及其治疗转化潜力 | 心脏淋巴系统、淋巴内皮细胞及其在心肌梗死、高血压和钙化性主动脉瓣疾病等心血管疾病中的角色 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2026-03-20 |
Transcriptome Comparison Between the Cultured and In Vivo Chick Primordial Germ Cells by SMART-Seq-Based Single-Cell RNA Sequencing
2026-Apr, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.70049
PMID:41775620
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研究论文 | 本研究通过基于SMART-seq的单细胞RNA测序,比较了体内和体外培养的鸡原始生殖细胞的转录组差异 | 首次揭示了PGC培养导致基因调控网络从MYC依赖转变为MYCN依赖,并发现了一个具有生殖系偏向的未分化细胞新群体 | 研究主要基于转录组数据,缺乏功能验证实验 | 在分子水平上理解鸡原始生殖细胞培养效应及其发育过程 | 鸡的原始生殖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SMART-seq |
| 549 | 2026-03-20 |
L1TD1 promotes colorectal mucinous adenocarcinoma progression by enhancing ABCC3 mRNA stability
2026-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03716-w
PMID:41776049
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研究论文 | 本研究揭示了L1TD1通过增强ABCC3 mRNA稳定性促进结直肠黏液腺癌进展的机制 | 首次发现L1TD1作为RNA结合蛋白通过结合ABCC3 mRNA的3'-UTR区域增强其稳定性,从而激活MAPK信号通路促进黏液产生和肿瘤进展 | 未明确L1TD1-ABCC3轴在其他癌症类型中的普适性,且临床样本量可能有限 | 探究结直肠黏液腺癌中黏液产生的调控机制及肿瘤进展的分子基础 | 结直肠黏液腺癌组织、癌细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2026-03-20 |
Species-specific roles of SP1 in bovine and human embryonic genome activation and early embryonic development
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2526998123
PMID:41849396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牛胚胎中主要胚胎基因组激活的异步启动,并探讨了转录因子SP1在牛和人类胚胎中调控胚胎基因组激活和早期发育的保守及物种特异性作用 | 首次在牛胚胎中揭示主要胚胎基因组激活在8细胞阶段的异步启动,并通过多组学分析阐明了SP1在调控胚胎基因组激活中的保守和物种特异性机制 | 研究主要基于体外胚胎模型,可能无法完全反映体内胚胎发育的复杂性,且样本量相对有限 | 探究牛和人类胚胎中胚胎基因组激活的分子特征及转录因子SP1的调控作用 | 牛和人类早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 551 | 2026-03-20 |
Red panda intestinal organoids for the functional analysis of Lactobacillus salivarius
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114844
PMID:41852748
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研究论文 | 本研究建立了红熊猫肠道类器官培养系统,用于分析唾液乳杆菌P103的益生功能 | 首次成功建立红熊猫肠道类器官,并利用单细胞RNA测序验证其组织特异性细胞类型和功能,为濒危物种研究提供了可传代、冻存和复苏的模型系统 | 未在摘要中明确提及具体限制,可能包括类器官与体内环境的差异或样本规模有限 | 研究红熊猫肠道类器官的建立及其在宿主-微生物相互作用机制分析中的应用,减少野生动物研究对动物模型的依赖 | 红熊猫肠道类器官及唾液乳杆菌P103 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 552 | 2026-03-20 |
The ATF5-GPER1 axis drives female protection in hepatocellular carcinoma through dual tumor-suppressive and immune-modulatory mechanisms
2026-Mar-19, Bioscience trends
IF:5.7Q1
DOI:10.5582/bst.2026.01026
PMID:41850858
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习,揭示了ATF5-GPER1轴通过抑制肿瘤增殖、诱导凋亡以及重塑免疫微环境,驱动肝细胞癌女性保护性现象的分子机制 | 首次整合bulk转录组学、单细胞RNA测序与机器学习,系统性地识别并验证了ATF5作为女性保护性基因,并阐明其通过激活GPER1形成雌激素响应模块,在肿瘤细胞和免疫细胞中发挥双重抑制作用的机制 | 研究主要基于回顾性队列和公共数据集,需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证;体外细胞实验(HepG2)的发现需要在更复杂的体内模型中进一步确认 | 探究肝细胞癌性别二态性(女性生存优势)的分子机制,并识别相关的生物标志物 | 肝细胞癌患者(包括男性和女性)的肿瘤组织、肿瘤细胞系(HepG2)以及相关的转录组和单细胞数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习(LASSO, SVM, 随机森林), 组织芯片验证 | LASSO, SVM, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床生存数据, 组织芯片图像数据 | bulk转录组数据来自3个公共数据集(GSE39791, TCGA-LIHC, GSE14520);单细胞RNA测序数据来自5个数据集,共58名患者的238,982个细胞;组织芯片验证包含167个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 553 | 2026-03-20 |
Targeting the ferritinophagy axis: multi-target regulation of TFRC/FTH1/NCOA4 by artesunate ameliorates salivary gland dysfunction in Sjögren's Disease
2026-Mar-19, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-026-01354-8
PMID:41851758
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研究论文 | 本研究探讨了青蒿琥酯通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而改善干燥综合征小鼠唾液腺功能障碍的机制 | 首次揭示了青蒿琥酯通过双重靶向铁蛋白自噬轴(TFRC/FTH1/NCOA4)并增强抗氧化防御来改善干燥综合征唾液腺功能障碍的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人类患者中进行验证,且具体分子结合机制需进一步实验确认 | 探究青蒿琥酯是否通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而缓解干燥综合征的唾液腺功能障碍 | 非肥胖糖尿病小鼠(干燥综合征模型)和IFN-γ诱导的人唾液腺细胞系A253 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, Western印迹, 免疫荧光, 流式细胞术, 功能测定 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 554 | 2026-03-20 |
Single-cell atlas of B cell heterogeneity in lacrimal IgG4-related disorders: Unraveling the transition from inflammatory exhaustion to clonal malignancy
2026-Mar-19, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70498
PMID:41853890
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了泪腺IgG4相关疾病中B细胞的异质性,揭示了从炎症性耗竭向克隆性恶性肿瘤转变的关键差异 | 首次在单细胞水平上比较了IgG4-ROD和IgG4阳性MALT淋巴瘤中B细胞的分化轨迹和分子特征,识别了记忆B细胞分化状态作为恶性转化的关键节点 | 样本量较小(仅6例患者),且仅分析了泪腺组织,可能无法完全代表疾病的全貌 | 探究泪腺IgG4相关疾病中B细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 4例IgG4-ROD患者和2例IgG4阳性MALT淋巴瘤患者的泪腺组织 | 数字病理学 | 眼部疾病(IgG4相关疾病) | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 6例患者(4例IgG4-ROD,2例MALT淋巴瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 555 | 2026-03-20 |
Uncovering the therapeutic mechanism of Baicalein in diabetic retinopathy through ferroptosis regulation
2026-Mar-18, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2026.2646309
PMID:41848783
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研究论文 | 本研究通过网络药理学和单细胞转录组学方法,探讨了黄芩素通过调控铁死亡治疗糖尿病视网膜病变的潜在机制 | 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序数据,系统揭示了黄芩素通过靶向铁死亡通路治疗糖尿病视网膜病变的多靶点作用机制,并利用分子对接与动力学模拟验证了关键靶点的结合稳定性 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟,缺乏体内实验验证;单细胞数据样本来源有限,临床转化潜力需进一步评估 | 探究黄芩素治疗糖尿病视网膜病变的作用机制,重点关注其对铁死亡通路的调控作用 | 糖尿病视网膜病变相关的差异表达基因、铁死亡相关基因、黄芩素作用靶点及视网膜单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质结构数据 | 基于公共数据库GSE102485和GSE178121的基因表达数据集,未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 556 | 2026-03-20 |
Rudolf Buchheim Award 2026: Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation
2026-Mar-18, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05170-7
PMID:41848856
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统解析了碳基纳米材料诱导肺部炎症的起始细胞回路,并构建了毒理学图谱 | 首次在单细胞分辨率下,将碳基纳米材料的物理化学特性与细胞特异性炎症起始、应激反应及免疫细胞招募联系起来,为基于作用模式的危害评估提供了概念框架 | 研究基于小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;且仅关注了早期炎症起始事件,长期效应未涉及 | 推进对碳基纳米材料引发呼吸道炎症机制的理解,支持更安全的纳米材料理性设计及特异性体外检测方法的开发 | 暴露于碳基纳米材料(炭黑样碳纳米颗粒、柔性双壁碳纳米管、针状多壁碳纳米管)的小鼠肺部细胞 | 毒理学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 557 | 2026-03-20 |
The Application of Single-cell RNA Sequencing Technology in the Research of Sino-Nasal Diseases
2026-Mar-18, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-026-09145-7
PMID:41849011
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 558 | 2026-03-20 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Cytotrophoblast Subtypes and Senescence in Recurrent Spontaneous Abortion
2026-Mar-18, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag030
PMID:41849438
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了复发性自然流产(RSA)绒毛组织中细胞滋养层细胞的亚型特征及细胞衰老现象 | 首次在RSA绒毛组织中鉴定出三种细胞滋养层细胞亚型(CTB1、CTB2、CTB3),并发现CTB2和CTB3亚型存在显著的细胞衰老特征 | 研究样本量未明确说明,且未涉及其他可能影响胎盘发育的细胞类型或分子机制 | 探究复发性自然流产(RSA)的发病机制,特别是滋养层细胞的功能异常 | 对照组和RSA患者的绒毛组织 | 单细胞转录组学 | 复发性自然流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 559 | 2026-03-20 |
RENAL-CHIP: Rejection Evaluation via Non-Invasive Analysis of Circulating Podocytes With Herringbone-Chip Isolation Platform
2026-Mar-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520426
PMID:41849694
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RENAL-CHIP的非侵入性方法,通过磁性可逆鲱鱼骨微流控芯片从外周血中分离供体来源的循环足细胞,用于评估肾移植排斥反应 | 首次将供体来源的循环足细胞作为急性排斥反应的血液生物标志物,并开发了一种高效的微流控芯片进行非侵入性检测 | 样本量相对较小(65名参与者),且仅针对肾移植排斥反应,未涉及其他疾病或移植类型 | 开发一种非侵入性、精确的肾移植排斥反应诊断方法 | 肾移植受者,特别是那些经历急性排斥反应的个体 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序,荧光原位杂交 | NA | 血液样本,单细胞RNA-seq数据 | 65名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 560 | 2026-03-20 |
Spi-1 proto-oncogene regulates mRNA hypertranscription and malignant progression in head and neck cancer
2026-Mar-18, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02669-6
PMID:41851070
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子SPI1通过驱动mRNA超转录促进头颈鳞状细胞癌恶性进展的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌中明确了mRNA特异性超转录的作用,并鉴定出SPI1是其关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,需要更多临床样本验证 | 探究mRNA超转录在头颈鳞状细胞癌恶性进展中的作用及其分子驱动机制 | 头颈鳞状细胞癌细胞系、异种移植模型及单细胞转录组数据 | 癌症生物学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学、ChIP-seq、RNA-seq、功能获得/缺失实验 | NA | 转录组数据、基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |