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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5561 | 2026-06-07 |
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-Targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1483
PMID:41532856
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研究论文 | 循环肿瘤细胞预测靶向DLL3的双特异性抗体Tarlatamab的疗效反应 | 首次利用单细胞RNA测序分析小细胞肺癌活检组织中DLL3表达的异质性,并通过循环肿瘤细胞区分患者为DLL3阳性或DLL3低表达,前瞻性队列中CTC的DLL3表达预测Tarlatamab临床获益具有高灵敏度和特异性 | 样本量较小(20例患者),未提及长期随访数据,耐药机制分析仅限于部分病例 | 评估循环肿瘤细胞上DLL3表达作为小细胞肺癌患者Tarlatamab治疗疗效预测生物标志物的可行性 | 小细胞肺癌患者 | 医学图像分析 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | 20例患者的前瞻性队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5562 | 2026-06-07 |
An integrative multi-cohort transcriptomic study reveals cell cycle- and adhesion-related hub genes as diagnostic biomarkers for pulmonary arterial hypertension
2026-May, Advances in biological regulation
DOI:10.1016/j.jbior.2026.101145
PMID:41576688
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研究论文 | 通过整合多个GEO数据集和实验验证,发现细胞周期和黏附相关关键基因CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1可作为肺动脉高压的诊断生物标志物 | 首次综合多队列转录组分析并结合单细胞测序数据及动物模型验证,鉴定出CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1四个关键基因作为PAH的多基因诊断标志物 | NA | 筛选并验证肺动脉高压相关关键基因作为无创诊断生物标志物 | 肺动脉高压患者血液或组织样本及尼古丁诱导的肺动脉高压小鼠模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 基因表达芯片、单细胞测序、RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE117261, GSE24988, GSE53408, GSE113439, GSE33463, GSE228644)及小鼠模型样本 | NA | 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5563 | 2026-06-07 |
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115676
PMID:41621472
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型证明单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进缺血性卒中后的视网膜损伤 | 首次阐明单核细胞来源的巨噬细胞在缺血性卒中后视网膜损伤中的关键作用及其IL-1β依赖机制 | 主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;可能未涵盖所有潜在的免疫细胞亚型 | 探究缺血性卒中后视网膜损伤的炎症机制 | 利用中脑动脉闭塞模型模拟缺血性卒中的小鼠视网膜 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, Luminex检测 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | 涉及小鼠样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 视网膜bulk RNA测序和单细胞RNA测序使用Illumina平台 |
| 5564 | 2026-06-07 |
Mosaic variants in KRAS and STAT5B associated with a mixed phenotype of 2 acquired errors of immunity
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.018
PMID:41628732
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研究论文 | 该文章报告了一例18岁女性患者携带KRAS和STAT5B体细胞嵌合变异,导致混合性获得性免疫缺陷的病例 | 首次报道两种不同的获得性免疫缺陷(Ras相关自身免疫性白细胞增殖性疾病和非克隆性STAT5B功能获得性疾病)共同导致混合临床表型 | NA | 研究一例携带KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异的独特病例,探讨其与免疫缺陷疾病的关联 | 一名18岁女性患者,患有炎症性肠病、脾肿大、血小板减少、支气管扩张、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 全基因组测序、靶向扩增子测序、短读长单细胞RNA测序、长读长单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 1例患者的纵向血液和组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长和长读长单细胞RNA测序 |
| 5565 | 2026-06-07 |
Multi-omics identifies an epithelial-B cell cross-talk that drives functional B cell diversion in breast cancer lymph node metastasis
2026-May, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112394
PMID:41610965
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研究论文 | 通过多组学分析揭示乳腺癌淋巴结转移中上皮细胞与B细胞间的相互作用,导致B细胞功能分化 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和体内功能模型,系统描绘乳腺癌转移过程中B细胞状态和相互作用 | NA | 阐明乳腺癌淋巴结转移中B细胞的功能异质性和作用机制 | 乳腺癌原发肿瘤和转移淋巴结中的B细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 图像数据 | 配对的原发肿瘤和转移淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 5566 | 2026-06-07 |
Depression-related chronic stress promotes ovarian cancer progression via metabolic dysfunction and IRF1-mediated immune suppression
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106471
PMID:41605304
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研究论文 | 探讨抑郁相关慢性应激如何通过代谢功能障碍和IRF1介导的免疫抑制促进卵巢癌进展 | 首次揭示抑郁相关慢性应激通过下调IRF1表达、重塑免疫-代谢微环境促进卵巢癌进展的机制,并提出抗抑郁药联合化疗作为潜在治疗策略 | 未明确说明 | 研究抑郁与卵巢癌进展的关系及抗抑郁药物的潜在治疗价值 | 卵巢癌患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 卵巢癌患者样本及小鼠慢性应激模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5567 | 2026-06-07 |
scGHSOM: A Hierarchical Framework for Single-Cell Data Clustering and Visualization
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3593632
PMID:40811172
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研究论文 | 开发了一个基于层次生长自组织映射的框架scGHSOM,用于单细胞数据的分层聚类和可视化 | 提出了显著属性识别算法以最小化簇内变异并最大化簇间变异,并引入簇特征图和簇分布图两种新可视化工具 | 仅在三个CyTOF数据集上验证性能,未在更多样化的单细胞RNA测序数据上测试 | 解决高维单细胞数据分析中的层次聚类和可视化挑战 | 单细胞数据集,包括CyTOF和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | CyTOF, 单细胞RNA测序 | 层次生长自组织映射 (GHSOM) | 高维单细胞数据 | 三个CyTOF数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5568 | 2026-06-07 |
Bufei formula attenuates airway mucus hypersecretion in COPD through inhibition of TRIM56-mediated ITGB4 ubiquitination
2026-Apr-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121215
PMID:41580166
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研究论文 | 研究补肺方通过抑制TRIM56介导的ITGB4泛素化减轻COPD气道黏液高分泌的机制 | 首次发现补肺方活性组分BFF-4通过靶向TRIM56并抑制其介导的ITGB4泛素化来减轻COPD气道黏液高分泌,并利用DARTS技术、单细胞测序和分子对接等先进方法阐明其作用机制 | 未提及具体局限性,可能包括实验动物模型与人体差异、BFF-4的临床转化可行性待验证 | 探究补肺方通过TRIM56介导的泛素化缓解COPD气道黏液高分泌的机制 | 香烟烟雾诱导的COPD小鼠及香烟烟雾提取物诱导的气道上皮细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | DARTS技术、免疫共沉淀、质谱、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | COPD小鼠和体外气道上皮细胞(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5569 | 2026-06-07 |
SPP1+ macrophage-driven interactions shape the tumor microenvironment in lymph node metastatic acral melanoma
2026-Apr-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08755-5
PMID:42020397
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SPP1+巨噬细胞驱动淋巴结节转移性肢端黑色素瘤的肿瘤微环境相互作用 | 首次识别出SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴与S100A8黑色素瘤细胞相互作用,并发现S100A8细胞在转移性肿瘤中为优势恶性亚群,以及抗SPP1疗法在体内可诱导巨噬细胞表型转换并减少肿瘤负荷 | 未明确说明研究局限性 | 研究肿瘤微环境在肢端黑色素瘤淋巴结转移进展中的作用 | 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配的相邻正常样本,分为淋巴结转移阳性与阴性组 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 治疗初治的肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5570 | 2026-06-07 |
SpaNiche: spatial niche analysis to explore colocalization patterns and cellular interactions in spatial transcriptomics data
2026-Apr-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04069-z
PMID:42015285
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研究论文 | 提出SpaNiche空间生态位分析框架,用于探索空间转录组数据中的共定位模式和细胞间相互作用 | 利用图正则化联合非负矩阵分解整合细胞丰度和配体-受体表达信息,并通过共识聚类定义“生态型”,增强多样本空间转录组数据分析的实用性 | 未明确说明 | 开发计算框架以揭示空间转录组中的细胞共定位模式和推断潜在配体-受体相互作用 | 结直肠癌、前列腺癌和早期阿尔茨海默病的脑皮层组织 | 数字病理学 | 结直肠癌, 前列腺癌, 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5571 | 2026-06-07 |
Deciphering the role of circulating inflammatory proteins in myocarditis: Novel strategies for targeted therapy
2026-Apr-15, International journal of cardiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.ijcard.2026.134198
PMID:41605333
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research paper | 使用孟德尔随机化和单细胞RNA测序解析循环炎症蛋白在心肌炎中的作用,为靶向治疗提供新策略 | 首次整合孟德尔随机化与单细胞转录组分析,鉴定了LIF作为心肌炎的因果性炎症蛋白和潜在治疗靶点 | 研究依赖公开数据集,可能受样本异质性和统计效力限制;LIF在心肌炎中的具体机制仍需实验验证 | 探究循环炎症蛋白与心肌炎的因果关系,并评估其作为治疗靶点的转化潜力 | 91种循环炎症蛋白与心肌炎之间的因果关系 | machine learning | cardiovascular disease | GWAS, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA(基于公开GWAS汇总统计数据和GEO数据集,具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5572 | 2026-06-07 |
Macrophage membrane-biomimetic DNA nanocages deliver taurine to reprogram trained immunity for periodontitis therapy
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114664
PMID:41605382
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研究论文 | 本研究开发了一种巨噬细胞膜仿生DNA纳米笼递送牛磺酸的方法,通过重编程训练免疫来治疗牙周炎 | 首次利用巨噬细胞膜仿生DNA纳米笼精准靶向单核细胞,通过递送牛磺酸纠正牙周炎中失调的训练免疫状态,同时恢复牙周膜细胞的成骨分化和线粒体功能 | 未提及具体限制,但可能包括纳米笼的体内稳定性、长期安全性及临床转化挑战 | 开发一种基于DNA纳米笼的靶向递送系统,用于重编程训练免疫以治疗慢性牙周炎 | 牙周炎患者的外周血单核细胞、M2极化和训练免疫抑制巨噬细胞、牙周膜细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5573 | 2026-06-07 |
Strategies for resolving cellular phylogenies from sequential lineage tracing data
2026-Apr, Theoretical population biology
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.tpb.2026.01.001
PMID:41554460
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研究论文 | 本文通过模拟和分析顺序编辑的谱系示踪数据,研究在高概率下实现精确系统发育重建的条件 | 首次建模顺序编辑记录系统,并利用模拟和理论分析明确简化距离重建方法可准确解析细胞系统发育的参数范围 | 研究基于模拟和理论,实际实验条件可能与模型假设存在偏差 | 理解顺序编辑记录系统的信息内容并指导实验设计 | 顺序编辑记录系统及细胞系统发育重建方法 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 谱系示踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5574 | 2026-06-07 |
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Mar-31, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218252
PMID:41565051
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研究论文 | 利用化疗前后的胰腺癌类器官揭示化疗耐药性机制,并发现AG化疗可激活KRAS/MAPK信号通路,为后续靶向治疗提供依据 | 首次建立配对的患者来源胰腺癌类器官模型(化疗前后),揭示AG化疗诱导的KRAS/MAPK信号激活可作为治疗新靶点 | NA | 探究胰腺导管腺癌化疗耐药性的机制及潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌患者的类器官及其异种移植模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、类器官表型数据 | AG治疗患者30例,未治疗患者60例;验证队列29例类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5575 | 2026-06-07 |
Hist2Cell: Deciphering fine-grained cellular architectures from histology images
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101137
PMID:41592568
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研究论文 | Hist2Cell是一个视觉图变换器框架,能从组织学图像直接精确解析细粒度细胞类型 | 首次实现从组织学图像直接预测细粒度转录细胞类型,无需重新训练即可泛化至TCGA大型队列 | 未提及具体局限性 | 开发一种成本效益高的方法,从组织学图像预测空间转录组学的细胞表型 | 人类肺癌和乳腺癌数据集 | 计算机视觉 | 肺癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 视觉图变换器 | 图像 | 人类肺癌和乳腺癌数据集,以及TCGA大型队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5576 | 2026-06-07 |
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-Mar-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag020
PMID:41592225
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研究论文 | 识别RPS14作为与衰老相关的生物标志物,用于评估育龄男性精子发生功能障碍中睾丸衰老相关基因的早发改变 | 首次发现RPS14在年轻精子发生功能障碍患者睾丸中显著上调,并证明其作为衰老相关生物标志物在预测精子获取手术成功率和与睾丸免疫微环境(特别是肥大细胞)关联中的潜在价值 | 研究样本量有限,且机制分析主要依赖生物信息学推断,缺乏直接的实验验证 | 探索睾丸衰老相关基因在年轻男性精子发生功能障碍中的早发表型标志物及其功能 | 老年小鼠、老年男性、育龄期正常精子生成患者及精子发生功能障碍患者的睾丸组织 | 机器学习 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集、三个批量微阵列数据集及多组睾丸组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 5577 | 2026-06-07 |
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-03-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153347
PMID:41610714
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综述 | 文章综述了利用单细胞测序技术发现的克罗恩病相关的新型免疫细胞亚群及其在疾病发生发展中的作用 | 系统总结了克罗恩病中多种罕见免疫细胞亚群(如INFLARE细胞、LND细胞、Tc1/17细胞等)的特征及其潜在治疗靶点价值 | 未提供具体的实验数据或验证结果,主要依赖于已发表文献的总结 | 探讨克罗恩病中免疫细胞亚群的多样性及其在发病机制中的作用,为未来治疗干预提供潜在靶点 | 克罗恩病相关的免疫细胞亚群 | 自然语言处理 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5578 | 2026-06-07 |
Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents
2026-Mar-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.11.018
PMID:41619726
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研究论文 | Runx1转录因子通过调控小胶质细胞转录组,影响阿片类药物镇痛效果和戒断反应,并在人类和小鼠中验证 | 首次发现Runx1在小胶质细胞中调节阿片类药物反应,并通过单细胞RNA测序和ChIP-seq揭示其作用机制,结合人类遗传关联分析证实临床相关性 | 未明确Runx1在其他细胞类型或人类脑区的具体作用,且临床样本量有限,机制验证主要依赖小鼠模型 | 探究Runx1转录因子在阿片类药物镇痛和戒断反应中的调控作用及其个体差异的遗传基础 | 小鼠小胶质细胞(Runx1敲除模型)及人类外周血样本(与阿片类药物反应相关的遗传变异) | 机器学习和数字病理学 | 阿片类药物耐受和戒断综合征 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、遗传关联分析 | NA | 基因表达数据、染色质结合位点数据、遗传变异数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)及人类队列(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 5579 | 2026-06-07 |
KCMF1 regulates HRI ubiquitination to inhibit the integrated stress response in ovarian cancer
2026-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117634
PMID:41391693
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研究论文 | 研究KCMF1在卵巢癌中通过调控HRI泛素化抑制整合应激反应的作用机制 | 首次揭示KCMF1通过调控HRI泛素化抑制卵巢癌中整合应激反应,并鉴定植物苷D为新型KCMF1抑制剂 | NA | 探究钾离子通道调节因子1在卵巢癌中的生物学功能和机制 | 卵巢癌上皮细胞、细胞系和异种移植小鼠模型 | 分子生物学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、定量实时反转录聚合酶链反应、免疫组化、蛋白质印迹分析、Ni-NTA pull-down实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 卵巢癌组织样本、细胞系样本及小鼠模型样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5580 | 2026-06-07 |
Remodeling of non-coding RNA regulatory networks: Decoding the pathological mechanisms and new therapeutic paradigms of cardiovascular diseases
2026-03, Physics of life reviews
IF:13.7Q1
DOI:10.1016/j.plrev.2025.12.007
PMID:41447890
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综述 | 系统总结非编码RNA在心血管疾病中的表达谱、多层次调控机制及诊疗应用,并提出跨尺度分析框架 | 提出跨尺度分析框架整合网络拓扑、时空梯度和能量约束等原理,并强调单细胞多组学、空间转录组学等技术在ncRNA靶向治疗中的创新应用 | ncRNA疗法实际应用受限于递送效率低、功能冗余及微环境依赖性等挑战 | 解析非编码RNA在心血管疾病中的病理机制并探索新的治疗范式 | 微RNA、长链非编码RNA、环状RNA、小核仁RNA等非编码RNA在多种心血管疾病中的表达和功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |