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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5541 | 2026-03-28 |
Transcriptional landscape of CD4+ T cells in Systemic Sclerosis
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697349
PMID:41889800
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术深入表征了系统性硬化症患者中CD4+ T细胞的亚群,揭示了疾病相关的转录组特征和细胞状态变化 | 采用新颖的单细胞RNA测序方法,首次全面描绘了系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录景观,并结合TCR库分析,提供了前所未有的疾病细胞和分子机制见解 | 样本量相对较小(8名患者和8名健康对照),可能限制结果的普适性;研究主要关注CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录组特征和亚群变化,以揭示疾病的细胞和分子基础 | 系统性硬化症患者和健康对照者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 超过80,000个CD4+ T细胞,来自8名系统性硬化症患者和8名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5542 | 2026-03-28 |
Patches: A Representation Learning Framework for Decoding Shared and Condition-Specific Transcriptional Programs in Wound Healing
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630186
PMID:41889850
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研究论文 | 本文提出了一个名为Patches的表示学习框架,用于解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 开发了条件子空间学习方法,能够同时解析共享和条件特异性转录模式,特别适用于具有缺失数据、不匹配细胞群或复杂属性组合的实验设计 | 未明确说明框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 皮肤损伤模型中的单细胞转录组数据 | 计算生物学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 条件子空间学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5543 | 2026-03-28 |
Single-cell-based identification of drug synergy with immunotherapy via tumor microenvironment remodeling
2026-Mar-18, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014132
PMID:41850739
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和L1000平台筛选,建立了一个评估肿瘤微环境重塑的框架,并识别出增强免疫疗法疗效的药物组合 | 开发了一个基于单细胞RNA测序的免疫调节药物资源库和MP评分算法,首次系统性地量化肿瘤微环境对治疗干预的响应,并发现痛风药物别嘌醇能显著增强抗PD-1疗法的效果 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证;样本量相对有限,可能影响结果的普适性 | 识别在复杂肿瘤微环境中有效的治疗药物,特别是通过重塑肿瘤微环境来增强免疫疗法疗效的药物协同作用 | 肿瘤微环境中的细胞类型,包括髓源性抑制细胞等免疫细胞,以及739种免疫调节化合物 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,L1000平台筛选 | MP评分算法 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及多种癌症的小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5544 | 2026-03-28 |
Cell-type-specific transposon demethylation and TAD remodeling in aging mouse brain
2026-Mar-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.015
PMID:41819104
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研究论文 | 本研究通过生成小鼠大脑衰老的单细胞表观基因组图谱,揭示了细胞类型特异的转座子去甲基化和染色质构象变化 | 整合了单细胞甲基组、染色质构象、转录组和染色质可及性数据,构建了跨模态细胞分类,并开发了基于深度学习模型预测衰老相关基因表达变化 | 使用2月龄小鼠作为基线,可能无法完全反映更早或更晚生命阶段的衰老过程 | 探究大脑衰老的表观遗传机制,特别是转座子甲基化和染色质构象变化 | 小鼠大脑多个区域的细胞 | 表观遗传学 | 神经退行性疾病 | 单细胞甲基组测序、染色质构象分析、空间转录组学 | 深度学习模型 | 甲基组数据、染色质构象数据、转录组数据、染色质可及性数据 | 132,551个单细胞甲基组和72,666个联合染色质构象-甲基组细胞核,以及895,296个细胞的空间转录组数据 | NA | 单细胞甲基组测序、染色质构象分析、空间转录组学 | NA | NA |
| 5545 | 2026-03-28 |
Vascular STING activation facilitates NK cell anti-tumor immunity in small cell lung cancer
2026-Mar-05, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.02.008
PMID:41791380
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研究论文 | 本文研究了小细胞肺癌(SCLC)中血管STING激活如何促进NK细胞的抗肿瘤免疫,揭示了微血管作为限制NK细胞外渗/招募的主要检查点 | 开发了动态单细胞RNA测序技术(DynaMITE-seq)并结合空间转录组学,首次揭示了SCLC中微血管对NK细胞浸润的调控作用,并提出通过激活血管STING信号来克服免疫屏障的新策略 | 研究主要基于实验模型和患者样本分析,尚未进行大规模临床试验验证,且具体机制细节需进一步探索 | 探索小细胞肺癌中NK细胞抗肿瘤免疫的调控机制,并寻找克服免疫屏障的治疗策略 | 小细胞肺癌(SCLC)细胞、NK细胞、微血管系统及患者组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA-seq数据、空间转录组数据 | 患者组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5546 | 2026-03-28 |
Targeted Ferroptosis Improves RPE Phagocytosis via MERTK/NFE2L2/HMOX1 Axis to Alleviate Retinitis Pigmentosa
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.42
PMID:41848364
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研究论文 | 本研究通过整合RCS大鼠体内模型和人类原代RPE细胞体外模型,利用单细胞RNA测序揭示了铁死亡在MERTK缺陷型视网膜色素变性中的关键致病作用,并验证了靶向铁死亡可改善RPE吞噬功能 | 首次在视网膜色素变性模型中系统揭示了铁死亡通过MERTK/NFE2L2/HMOX1轴驱动RPE功能障碍的分子机制,并证明铁死亡抑制剂Fer-1的治疗潜力 | 研究主要基于RCS大鼠模型和体外细胞模型,尚未在更广泛的RP亚型或临床患者中进行验证 | 探究视网膜色素变性中RPE细胞的致病性改变,并寻找潜在的治疗策略 | 皇家外科学院大鼠、人类原代视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | RCS大鼠与RDY大鼠的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5547 | 2026-03-28 |
Identifying Clones in Myelodysplastic Syndromes by Using Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.70189
PMID:41886772
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5548 | 2026-03-28 |
A Single-Cell Perspective on Remapping Human Adult Neurogenesis and Its Clinical Implications
2026-02-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16020331
PMID:41750399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在成人海马神经发生研究中的应用,及其对神经系统疾病机制和治疗策略的启示 | 整合了单细胞RNA测序技术提供的细胞和分子层面见解,为神经系统疾病的靶向治疗开发提供了新视角 | NA | 探讨成人海马神经发生的细胞和分子景观,以及神经系统疾病的病理机制及其治疗意义 | 成人海马神经发生、神经系统疾病(如癌症、心血管疾病和神经系统疾病) | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5549 | 2026-03-28 |
Lactate-Driven Reprogramming of Monocyte Bridges Bone Loss in Inflammatory Comorbidities
2026-02-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16020308
PMID:41750376
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸驱动的单核细胞重编程在牙周炎和类风湿关节炎等炎症共病中连接免疫激活与骨吸收加剧的分子机制 | 首次将乳酸代谢与炎症共病(牙周炎和类风湿关节炎)的骨丢失联系起来,并鉴定出SAT1、TET2和HIF1A作为核心乳酸相关基因和潜在生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,需要在更大规模的人类队列中进行验证 | 揭示炎症共病中骨破坏的分子驱动机制 | 牙周炎和类风湿关节炎作为炎症疾病共病的临床相关模型 | 生物信息学 | 牙周炎, 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据 | PD和RA队列的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5550 | 2026-03-28 |
Neonatal Hyperoxia Induces Metabolic Reprogramming in Senescent Alveolar Macrophages, Leading to Persistent Lung Injury
2026-Feb-10, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL48370
PMID:41761973
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,揭示了新生小鼠高氧暴露诱导衰老肺泡巨噬细胞的代谢重编程,并证明靶向代谢或清除衰老细胞可减轻持续性肺损伤 | 首次在新生小鼠高氧模型中,利用单细胞RNA测序技术系统描绘了衰老肺泡巨噬细胞的异质性、代谢重编程特征及其在持续性肺损伤中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类早产儿支气管肺发育不良中的直接适用性仍需进一步验证 | 探究新生儿高氧暴露诱导的衰老肺泡巨噬细胞的分子与功能特征,及其在持续性肺损伤发生发展中的作用 | 新生小鼠的肺组织,特别是高氧暴露后分离的衰老肺细胞(以巨噬细胞为主) | 数字病理学 | 肺损伤/支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 数据集GSE207866中的样本,包括高氧暴露后第7天(SD7)、年龄匹配的空气暴露对照(AirD7)及未富集衰老细胞的高氧暴露组(O2D7)小鼠肺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5551 | 2026-03-28 |
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Jan-15, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02948-0
PMID:41540123
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DBiTplus的新型整合多模态空间组学方法,可在同一组织切片上结合测序型空间转录组学与多重蛋白成像技术 | 开发了DBiTplus整合工作流程,首次实现同一组织切片上测序型空间转录组与多重蛋白成像的同步分析,并采用RNase H介导的cDNA回收技术以保留组织架构 | 方法在极具挑战性的临床样本(如FFPE组织)中的全面性能仍需进一步验证 | 开发一种整合成像与测序的空间组学映射技术,以在单细胞分辨率下探索细胞异质性和功能 | 冷冻小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的人体淋巴结及淋巴瘤组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间条形码技术、RNase H介导的cDNA回收、多重蛋白成像、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、蛋白成像数据 | 多种样本类型,包括小鼠胚胎和人类淋巴组织 | NA | 空间转录组学, 多重蛋白成像 | DBiTplus | DBiTplus整合工作流程,支持测序型空间转录组学与成像型蛋白分析在同一组织切片上进行 |
| 5552 | 2026-03-27 |
LLOT: application of Laplacian Linear Optimal Transport in spatial transcriptome reconstruction
2026-Jan-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujag046
PMID:41885893
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研究论文 | 本文提出了一种名为LLOT的可解释方法,用于整合单细胞和空间转录组学数据,以在全基因组和单细胞分辨率下重建缺失的空间信息 | LLOT通过迭代校正平台效应并利用拉普拉斯最优传输,将空间转录组学数据中的每个点分解为空间平滑的单细胞概率混合,提供了一种可解释且通用的框架 | NA | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,以重建组织中的空间基因表达和推断细胞位置 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium和Visium HD) | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学技术(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium、Visium HD) | 拉普拉斯线性最优传输(LLOT) | 基因表达数据(包括单细胞和空间数据) | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Visium HD | 10x Visium和Visium HD用于空间转录组学测量 |
| 5553 | 2026-03-27 |
Screening and molecular functional analysis of telomere-related genes in abdominal aortic aneurysms based on bioinformatics
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1716161
PMID:41884632
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法筛选并分析了腹主动脉瘤中端粒相关基因的分子特征,以识别潜在的治疗靶点 | 结合WGCNA、LASSO、SVM算法及单细胞RNA-seq数据,系统鉴定出KLF15和ZBTB16作为腹主动脉瘤的关键生物标志物,并验证了其在免疫炎症调控中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 | 探究腹主动脉瘤中端粒相关分子的特征,为开发治疗药物提供潜在靶点 | 腹主动脉瘤患者与正常对照的RNA表达数据及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, Western blot, ELISA, 流式细胞术, Trans-well实验 | WGCNA, LASSO, SVM | 基因表达数据, 单细胞数据 | 基于公共数据集GSE57691和GSE237230,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5554 | 2026-03-27 |
Cochlear macrophage CD74 enhances the apoptosis of senescent cochlear hair cells by down-regulating MIF
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1751126
PMID:41884819
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠耳蜗单细胞测序数据,揭示了巨噬细胞CD74通过下调MIF促进衰老耳蜗毛细胞凋亡的新机制 | 首次发现衰老耳蜗中巨噬细胞CD74表达上调,并通过与MIF相互作用降低局部MIF水平,从而削弱MIF对衰老听觉细胞的保护作用,促进其凋亡 | 研究主要基于HEI-OC1细胞模型和小鼠数据,尚未在人体组织中得到验证,且具体信号通路机制有待进一步阐明 | 探究年龄相关性听力损失的细胞分子机制,特别是巨噬细胞在耳蜗衰老过程中的作用 | C57BL/6J小鼠的耳蜗组织、HEI-OC1听觉细胞系、BV2小胶质细胞系 | 单细胞生物学 | 年龄相关性听力损失 | 单细胞RNA测序 | 细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据、细胞实验数据 | 不同年龄段的C57BL/6J小鼠耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5555 | 2026-03-25 |
Transient ER stress cell-autonomously promotes beta cell cycling in mice
2026-May, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06649-3
PMID:41537777
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠模型发现,短暂的内质网应激可自主促进小鼠β细胞增殖 | 揭示了转基因过表达、内质网应激、葡萄糖与β细胞周期激活之间的新联系 | 研究主要基于小鼠模型,人体β细胞的响应可能不同 | 探究内分泌胰腺实验性低血管化恢复是否能触发小鼠β细胞增殖 | 转基因小鼠的胰腺β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 定量RT-PCR, 免疫染色 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5556 | 2026-03-25 |
FOXE1 promotes the progression of pulp inflammation by activating PANoptosis in dental pulp cells
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115204
PMID:41869565
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研究论文 | 本研究揭示了FOXE1通过激活牙髓细胞中的PANoptosis来促进牙髓炎症进展的机制 | 首次在牙髓炎症中鉴定出PANoptotic牙髓细胞簇,并发现FOXE1是调控该过程的关键转录因子 | 未明确FOXE1调控PANoptosis的具体下游信号通路 | 探究PANoptosis在牙髓炎中的作用及调控机制 | 牙髓细胞、临床牙髓炎样本、小鼠实验性牙髓炎模型 | 单细胞组学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类临床牙髓炎样本、原代培养牙髓细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5557 | 2026-03-25 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2026-Apr, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了学习后压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子特征和细胞类型特异性变化 | 首次在单细胞分辨率下解析了空间记忆巩固过程中压后皮层的转录组特征,并揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中学习诱导的神经元激活减少 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化的普适性有待验证;化学遗传学干预的时间窗口和特异性可能存在局限 | 探究压后皮层在空间记忆巩固过程中的转录组学变化及其在阿尔茨海默病中的异常 | 小鼠压后皮层神经元,特别是兴奋性神经元亚型 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病及相关痴呆 | 空间转录组学,化学遗传学,深度学习计算工具 | 深度学习模型 | 空间转录组数据,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及正常成年小鼠和ADRD模型小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学平台,用于解析细胞类型和兴奋性神经元层特异性的基因表达变化 |
| 5558 | 2026-03-25 |
Exosomal miR-26a-5p From Urine-Derived Stem Cells Mitigates Renal Fibrosis via Targeting NRAS
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504385RR
PMID:41874363
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研究论文 | 本研究揭示了尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS基因,抑制MAPK信号通路和机械微环境激活,从而缓解肾纤维化的分子机制 | 首次发现尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS并抑制下游MAPK信号通路及机械信号分子(如PTK2、SRC等),从而减轻肾纤维化 | NA | 探究尿液来源干细胞外泌体中的miRNA是否能抑制肾纤维化及其分子机制 | 肾纤维化过程、尿液来源干细胞、外泌体、miR-26a-5p、NRAS基因 | 分子生物学 | 慢性肾病 | miRNA高通量测序、整合转录组分析、单细胞测序分析、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5559 | 2026-03-25 |
CCR8 Expression on Regulatory T Cells Reveals Trajectories of Tissue Adaptation and Protects Against Myocardial Infarction-Induced Tissue Damage
2026-Mar-24, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后心脏内调节性T细胞的组织适应轨迹,并发现CCL1-CCR8轴对于Treg的募集和功能至关重要,从而保护心肌免受损伤 | 首次描绘了Treg从纵隔淋巴结到心脏的分化轨迹,并确立了CCL1-CCR8轴作为Treg募集和发挥心脏保护功能的关键通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证仍需进一步扩大样本量以确认临床普适性 | 探究心肌梗死后心脏特异性调节性T细胞的发育轨迹、募集机制及其在心脏修复中的作用 | 小鼠心肌梗死模型、调节性T细胞、CCR8和CCL1基因修饰小鼠、以及心肌梗死患者的血液和心脏组织 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多种基因修饰小鼠模型及人类心肌梗死患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5560 | 2026-03-25 |
In Situ Needle-Free Injection of Multiretention Micelles for Melanoma Therapy with Multiomics Insights into Tumor Targeting and Immune Modulation
2026-Mar-24, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01481
PMID:41808385
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研究论文 | 本文报道了一种用于黑色素瘤治疗的无针原位注射多滞留纳米胶束平台,并通过多组学分析揭示了其靶向肿瘤和调节免疫的双重作用机制 | 开发了一种结合热触发局部沉积、pH响应释放和叶酸受体靶向的多滞留纳米胶束,并首次采用无针注射方式递送,同时利用单细胞测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学技术深入解析了其直接抑制肿瘤和重塑免疫微环境的双重作用机制 | NA | 开发一种新型的黑色素瘤治疗策略,旨在提高紫杉醇的局部暴露、减少全身毒性并增强抗肿瘤效果 | 黑色素瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |