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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5521 | 2026-03-29 |
Colorectal microenvironment determines the prognosis of colorectal cancer
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01599-7
PMID:41495419
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研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌患者的肿瘤和非肿瘤组织,评估了区分支持癌细胞生长的微环境与健康微环境的可行性,并发现微环境特征可作为预后生物标志物 | 首次利用bulk RNA测序数据将结直肠癌患者分为肿瘤支持性微环境和健康微环境组,并结合单细胞RNA测序揭示了微环境中特定细胞类型间的相互作用 | 样本量相对有限(273对样本),且研究主要基于回顾性分析,需要进一步前瞻性验证 | 评估结直肠微环境对癌症预后的影响,并探索其作为预后生物标志物的潜力 | 结直肠癌患者及其配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 273对配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | NA | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5522 | 2026-03-29 |
Microglial CX3CR1 deficiency regulates the selective vulnerability of cone photoreceptors via STAT3/CCL-ACKR1 signaling in the mouse retina
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01618-7
PMID:41535549
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路导致小鼠视网膜中视锥光感受器选择性易损性的分子机制 | 首次发现CX3CR1缺陷通过STAT3介导小胶质细胞神经毒性,并鉴定出CCL-ACKR1信号通路在视锥细胞选择性丢失中的关键作用 | 研究局限于小鼠模型,人类视网膜中的机制仍需验证 | 探究神经退行性疾病中神经元选择性易损性的分子机制 | 小鼠视网膜中的小胶质细胞、星形胶质细胞和视锥光感受器 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5523 | 2026-03-29 |
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2026, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2566387
PMID:41176166
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其潜力 | 提出了将单细胞组学技术与类器官、器官芯片等先进人体衍生系统相结合,以在生理相关背景下进行机制研究的新框架 | 讨论了该领域面临的技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 | 推进以人为中心的营养研究,揭示饮食化合物对人类健康的影响机制 | 饮食化合物与人体细胞的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞蛋白质组学,单细胞代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5524 | 2026-03-29 |
Resveratrol Alleviates Intervertebral Disc Degeneration by Targeting NCOA4-Mediated Ferritinophagy Through Dual Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects
2026, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S575321
PMID:41873334
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验模型,揭示了NCOA4介导的铁蛋白自噬在椎间盘退变中的关键作用,并发现白藜芦醇通过靶向NCOA4发挥双重抗氧化和抗炎效应来缓解退变 | 首次将铁蛋白自噬确立为椎间盘退变的新型病理机制,并阐明NCOA4作为协调铁死亡与自噬交互作用的关键节点,同时验证了天然化合物白藜芦醇通过多靶点调控炎症和铁稳态通路治疗椎间盘退变的潜力 | 研究主要基于大鼠模型和细胞实验,临床转化仍需进一步验证;铁蛋白自噬的具体调控网络及其与其他细胞死亡方式的相互作用尚未完全阐明 | 探究铁蛋白自噬在椎间盘退变中的作用机制,并评估白藜芦醇的治疗效果 | 椎间盘退变患者样本、大鼠椎间盘退变模型、髓核细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 椎间盘退变 | 生物信息学分析、单细胞测序、转录组分析、实验模型验证 | NA | 临床转录组数据、单细胞测序数据、实验数据 | 未明确具体样本数量,涉及临床样本、大鼠模型和细胞研究 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5525 | 2026-03-29 |
Cell Differentiation of DPSCs Infected With Different Periodontal Pathogens
2026-Jan, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70045
PMID:40739838
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了两种牙周病原体(牙龈卟啉单胞菌和牙周二氧化碳嗜纤维菌)对人牙髓干细胞亚群分化的不同影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示了不同牙周病原体对牙髓干细胞亚群分化的特异性调控作用,并识别出对特定病原体有独特反应的细胞亚群 | 研究样本来源于健康供体,未考虑临床患者个体差异;体外感染模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究牙周病原体感染对牙髓干细胞分化的影响机制 | 人牙髓干细胞 | 单细胞组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体来源的牙髓干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5526 | 2026-03-28 |
Integrated bioinformatics analysis reveals cross-talking hub genes and therapeutic agents between sepsis and acute myocardial infarction
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2645276
PMID:41863100
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析,识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因,并探讨了其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 首次系统性地识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的交叉核心基因(JAK2、MYD88、TIMP1),并验证了槲皮素作为潜在靶向治疗药物的结合亲和力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏临床前或临床试验数据来证实治疗效果的体内有效性 | 识别脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因,并探索其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 脓毒症和急性心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症和急性心肌梗死 | RNA测序、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接模拟、qPCR验证 | MCC/Degree算法 | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 5527 | 2026-03-28 |
Cell-type-specific genetic associations in Lewy body dementia identified using single-cell eQTL-based Mendelian randomization
2026-Jun, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2026.106205
PMID:41855783
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研究论文 | 本研究利用单细胞eQTL进行孟德尔随机化分析,识别了路易体痴呆中细胞类型特异的遗传关联 | 首次将单细胞转录组范围的孟德尔随机化与脑细胞类型特异性eQTL结合,揭示了ANKRD65在兴奋性神经元中表达与路易体痴呆风险的关联 | 研究主要基于遗传推断,需要进一步实验验证功能机制;样本分层可能影响统计效力 | 探索遗传变异通过细胞类型特异性机制影响路易体痴呆易感性的关联 | 路易体痴呆患者及对照人群的脑组织样本 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序,孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析 | 逆方差加权模型 | 遗传与转录组数据 | 基于APOE ε4携带状态分层的独立路易体痴呆队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5528 | 2026-03-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Apr-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0424
PMID:41563441
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议,以增强胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议并采用胰岛素转录本靶向耗竭策略,提高了长读长测序在单细胞水平上的转录本检测效率和准确性 | 技术挑战包括读长不足和较高错误率,可能影响某些低丰度转录本的识别 | 优化单细胞长读长测序协议,以改善胰腺胰岛中异构体的检测和基因表达分析 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型,特别是胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5529 | 2026-03-28 |
Identifying prognosis-associated spatial patterns by integrating bulk RNA-seq and spatial transcriptomic data
2026-Mar-26, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3677899
PMID:41886327
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研究论文 | 本研究提出了一种名为stSurvTrans的深度迁移学习框架,用于识别与预后相关的空间模式,通过整合bulk RNA-seq和空间转录组数据 | 利用条件变分自编码器(CVAE)整合bulk RNA-seq和空间转录组数据,并采用Weibull模块将临床生存信息从bulk样本迁移到空间数据中 | NA | 将空间特征与生存信息关联起来,以识别与预后相关的空间模式 | 肝细胞癌(HCC)的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | 条件变分自编码器(CVAE), Weibull模块 | bulk RNA-seq数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5530 | 2026-03-28 |
Enhancing Proteasome Activity in T Cells Alleviates Exhaustion and Improves Antitumor Immunity
2026-Mar-26, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1246
PMID:41886620
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研究论文 | 本研究通过增强T细胞中的蛋白酶体活性,延缓了T细胞耗竭,改善了其功能,并转化为更强的抗肿瘤免疫和肿瘤控制 | 首次提出并验证了蛋白酶体活性是T细胞耗竭的关键调节因素,并证明通过药理学和遗传学方法增强蛋白酶体活性可以改善T细胞功能和抗肿瘤免疫 | 研究主要在体外模型和单细胞转录组学分析中进行,体内验证和临床转化效果需要进一步研究 | 探究T细胞耗竭的机制并寻找改善抗肿瘤免疫的新策略 | 耗竭T细胞 (TEX) 和非耗竭T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 涵盖16种肿瘤类型的单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5531 | 2026-03-28 |
Microbiota-Driven microglia reprogramming reverses depressive-like behaviors through Peripheral-to-Central immune crosstalk
2026-Mar-26, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03545-z
PMID:41888425
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研究论文 | 本研究通过肠道微生物干预逆转慢性不可预测轻度应激诱导的抑郁样行为,揭示了微生物群驱动的微胶质细胞重编程通过外周-中枢免疫轴调控抑郁表型 | 首次构建了中枢与外周免疫细胞单细胞图谱,发现稳态微胶质细胞2亚型通过激活轨迹调控微胶质状态,并鉴定Klf2作为单核细胞和HM2微胶质亚型的主调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证;微生物干预的具体机制尚未完全阐明 | 探究肠道微生物干预如何通过免疫轴调控改善抑郁样行为 | 小鼠脑组织、颅骨和外周血单核细胞中的微胶质细胞及非微胶质免疫细胞 | 神经免疫学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、染色质开放性测序、CD45免疫细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据 | 未明确样本数量,使用慢性不可预测轻度应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5532 | 2026-03-28 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveals senescence-associated changes in MIA-induced ASD male mouse brain
2026-Mar-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117191
PMID:41886454
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单核RNA测序分析,揭示了母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍小鼠大脑中衰老相关的变化机制 | 首次结合空间转录组和单核RNA测序技术,系统性地识别了MIA诱导的ASD大脑中衰老相关基因通路和细胞类型特异性调控机制 | 研究仅基于雄性小鼠模型,未涵盖雌性个体;机制验证主要在动物模型中进行,人类临床转化需进一步探索 | 探索母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍的神经生物学特征和调控机制 | MIA诱导的ASD雄性小鼠大脑组织 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 空间转录组测序, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5533 | 2026-03-28 |
p53: defender of lineage fidelity and foe of plasticity in cancer and regeneration
2026-Mar-25, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2026.02.004
PMID:41887985
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综述 | 本文综述了p53在肿瘤抑制和组织修复中,通过调控细胞状态变化来维持谱系保真度和抑制可塑性的新功能 | 揭示了p53在可塑的过渡细胞状态中,通过驱动肺泡1型细胞分化来抑制肺癌和促进肺损伤修复,并扩展了其在其他组织损伤修复中的作用 | p53肿瘤抑制功能的分子程序仍未完全阐明,且研究主要基于基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序 | 探讨p53在肿瘤抑制和组织修复中的分子机制与功能 | p53蛋白、肺腺癌、肺损伤修复、损伤诱导的肠道再生干细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5534 | 2026-03-28 |
A single-cell transcriptional reference for the functional and developmental diversity of neonatal innate lymphoid cells
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117000
PMID:41706587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合发育和功能分析,深入解析了脐带血中循环先天淋巴细胞的复杂性和多样性 | 首次在免疫学上未成熟的脐带血中,通过单细胞转录组学详细描绘了循环先天淋巴细胞的亚群多样性,并利用人工胸腺器官模型揭示了cILC1s的发育潜力仅限于NK细胞 | 研究主要基于脐带血样本,可能无法完全代表成人或其他组织中的先天淋巴细胞状态 | 旨在建立新生儿先天淋巴细胞的功能和发育多样性的单细胞转录参考图谱 | 脐带血中的循环先天淋巴细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但基于脐带血 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5535 | 2026-03-28 |
Single-cell transcriptional and epigenomic landscape of human blood immune cells across the lifespan
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117072
PMID:41818242
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,绘制了从胎儿中期到成年晚期人类外周血单个核细胞的转录组和表观基因组图谱,揭示了免疫细胞组成随年龄的动态变化 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类整个生命周期中外周血免疫细胞的转录和表观遗传景观,并识别了多个年龄相关的免疫细胞亚群和特征 | 研究仅基于健康供体的外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫细胞或疾病状态,样本量可能有限 | 探究人类生命周期中免疫细胞组成的动态变化及其与年龄相关的特征 | 健康供体的外周血单个核细胞,涵盖从胎儿中期到成年晚期的不同年龄阶段 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 来自健康供体的外周血单个核细胞样本,覆盖多个年龄阶段 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 5536 | 2026-03-28 |
Spatiotemporal molecular profiling of macrophage-fibroblast crosstalk defines checkpoints orchestrating onset and resolution of inflammation
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117091
PMID:41832953
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了炎症性关节炎中巨噬细胞与成纤维细胞在炎症起始和消退阶段的时空分子互作网络 | 首次结合单细胞RNA测序与单细胞ATAC测序技术,系统描绘了滑膜巨噬细胞与成纤维细胞亚群在炎症不同阶段的异质性信号回路,揭示了巨噬细胞亚群在促炎与消退过程中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分;未深入探究其他免疫细胞类型在炎症回路中的作用 | 阐明炎症性疾病中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的分子机制与时空动态 | 炎症性关节炎模型中的滑膜巨噬细胞与滑膜成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 生物信息学建模 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确(基于炎症不同阶段的滑膜组织样本) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 5537 | 2026-03-28 |
Dendritic Cells Remodel Eccrine Sweat Gland Niche Metabolism Via Oxidative Phosphorylation During Aging
2026-Mar-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.011
PMID:41887396
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能实验,揭示了树突状细胞通过氧化磷酸化调控汗腺代谢的免疫-上皮回路,并阐明其在衰老过程中的失调机制 | 首次发现树突状细胞作为汗腺代谢稳态的守护者,通过NAMPT-INSR信号轴促进氧化磷酸化,并揭示衰老过程中MIF-CD74-CYBB信号通路导致细胞功能障碍的可逆机制 | 研究主要基于小鼠爪部和人类手掌皮肤样本,可能无法完全代表其他皮肤区域或物种的衰老过程 | 探究衰老过程中汗腺功能下降的细胞和分子机制,特别是与年龄相关的微环境重塑 | 小鼠爪部汗腺和人类手掌皮肤中的汗腺细胞及树突状细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学, scRNA-seq, 免疫染色, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及老年小鼠爪部和人类手掌皮肤 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5538 | 2026-03-28 |
Protocol to evaluate mouse brain spatial cell type-resolved transcriptomic discoveries using 10× Visium spatial transcriptomics and FLEX scRNA-seq
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104277
PMID:41456279
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合10× Genomics Visium空间转录组学和FLEX单细胞RNA测序技术,用于研究小鼠脑组织中空间区域基因表达和细胞间信号变化的实验方案 | 整合了空间转录组学和单细胞RNA测序技术,提供了一种系统性的实验方案来解析小鼠脑组织在疾病状态下的空间分子特征 | NA | 研究疾病组织中空间区域基因表达和细胞间信号的变化机制 | 小鼠脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium, 10x FLEX | 10× Genomics Visium空间转录组学和10× Genomics FLEX单细胞RNA测序 |
| 5539 | 2026-03-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
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研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组学分析协议,旨在分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组学分析协议,能够同时分析宿主和病原体的转录模式,并建立病理适应特征以预测感染结果 | 协议的具体应用效果和局限性未在摘要中详细说明,需参考原始文献 | 建立感染组织中宿主和病原体转录模式的分析方法 | 感染组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5540 | 2026-03-28 |
Protocol for the generation of a human-derived nasal epithelial model and induction of tissue-resident memory-like T cells in a co-culture system
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104401
PMID:41758640
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研究论文 | 本文介绍了一种生成人源性鼻上皮模型并在共培养系统中诱导组织驻留记忆样T细胞的实验方案 | 开发了一种体外模型系统,用于研究人源性组织驻留记忆T细胞(TRMs),通过共培养诱导TRM样T细胞 | NA | 研究人源性组织驻留记忆T细胞(TRMs)的诱导和分析方法 | 人源性鼻上皮模型和自体免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子释放分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |