单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7593 篇文献，本页显示第 5401 - 5420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5401 | 2026-04-04 |
Bayesian Hyperspherical Graph Mixture-of-Experts Deciphers Cell-Cell Interaction in Spatial Transcriptomics
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3660060
PMID:41628049
|
研究论文 | 本文提出了一种名为B-HGME的无监督贝叶斯框架，用于从空间转录组数据中联合推断空间域和细胞-细胞相互作用网络 | 提出了首个结合超球面嵌入和贝叶斯混合专家模型的框架，用于无监督地推断具有方向性和长程性的细胞-细胞相互作用，并提供了原则性的不确定性量化 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一种计算框架，以无监督和可解释的方式从空间转录组数据中准确推断细胞-细胞相互作用和空间域 | 空间转录组数据中的细胞及其相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯超球面图混合专家模型 | 空间转录组数据 | 来自六个主要空间转录组平台的多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5402 | 2026-04-04 |
scDBic: a novel deep learning-based biclustering algorithm for analyzing scRNA-seq data
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag095
PMID:41746287
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scDBic的新型深度学习双聚类算法，专门用于分析单细胞RNA测序数据，以改善细胞聚类性能并识别关键基因 | scDBic结合了深度自编码器进行细胞聚类、基因聚类以及使用反向策略识别关键基因簇，解决了传统聚类算法在捕获局部一致性和双聚类算法在细胞丢失、高维数据适应性及迭代选择方面的不足 | NA | 开发一种针对单细胞RNA测序数据的深度学习双聚类算法，以更有效地发现细胞群并识别其关键基因 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5403 | 2026-04-04 |
TGF-β regulated Tim-3 sustains macrophage phagocytic function and confers protection in Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2026-Feb-27, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07287-3
PMID:41761269
|
研究论文 | 本研究揭示了在疟疾感染中，TGF-β调控的Tim-3通过维持巨噬细胞的吞噬功能发挥保护作用 | 首次揭示了TGF-β-Tim-3轴在疟疾感染中调控巨噬细胞功能的新机制，并证明Tim-3在巨噬细胞上的保护性作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中得到验证 | 探究Tim-3在疟疾感染期间调控巨噬细胞功能的作用及其上游调控机制 | 约氏疟原虫NSM感染的小鼠模型、脾脏巨噬细胞、体外共培养系统 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5404 | 2026-04-04 |
Tumor-infiltrating lymphocytes demonstrate potent anti-tumor efficacy and synergize with PD-1 blockade in bladder cancer
2026-Feb-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07924-6
PMID:41749249
|
研究论文 | 本研究评估了从膀胱癌患者中分离并扩增的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的抗肿瘤功效，并探索了其与PD-1抑制剂Nivolumab联用的协同效应 | 首次在膀胱癌中系统评估TIL的扩增、表型特征及其与PD-1阻断的协同抗肿瘤作用，并利用患者来源类器官（PDO）作为功能评估平台 | 研究样本量有限（48例），且体内验证仅使用了细胞系来源的异种移植模型，缺乏患者来源的异种移植模型验证 | 评估TIL在膀胱癌中的抗肿瘤潜力及其与免疫检查点抑制剂联用的协同疗效 | 膀胱癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞、膀胱癌细胞系、患者来源的膀胱癌类器官 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、流式细胞术、细胞活力检测、细胞因子释放测定、细胞凋亡检测 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、流式细胞术数据、体外功能测定数据 | 48例膀胱癌患者样本（其中33例成功扩增TIL） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5405 | 2026-04-04 |
Single-cell hdWGCNA and experimental validation identify an innovative T-cell-associated prognostic model and immune microenvironment in lung adenocarcinoma with lymph node metastasis
2026-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15649-4
PMID:41742055
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析，构建了一个基于T细胞相关基因（CD69、GOLGA8A、IL16）的预后模型，用于评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后 | 首次结合单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）构建T细胞相关预后模型，并整合临床变量提升模型可解释性 | 研究依赖于公共数据库数据，样本量可能有限，且实验验证主要在细胞系中进行，需进一步临床验证 | 建立基于T细胞的预后模型，评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后并优化治疗策略 | 淋巴结转移性肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、差异表达分析、Cox/LASSO回归、qRT-PCR、免疫组化、多重免疫荧光 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5406 | 2026-04-04 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195917
PMID:41433107
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后的再神经支配模型，揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了多种不同的施万细胞亚型，包括一个在去神经-再神经循环中起关键作用的终末施万细胞亚型，并确定了SPP1信号通路是调节神经肌肉接头动态、促进施万细胞增殖和肌肉再神经支配的关键调控因子 | 未在摘要中明确说明 | 阐明肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留施万细胞 | 单细胞组学 | 神经肌肉疾病、神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5407 | 2026-04-04 |
Aging-induced decrease in progenitor B cells enhances the osteoclastogenesis of bone marrow macrophages via ROS-activated Fos/CCL3 signaling pathway
2026-Feb-10, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-026-00561-z
PMID:41668199
|
研究论文 | 本研究揭示了衰老过程中骨髓微环境中ROS水平升高导致祖B细胞减少，进而通过激活Fos/CCL3信号通路促进破骨细胞生成，从而引发老年性骨质疏松的机制 | 首次通过单细胞RNA测序等多组学整合策略，阐明了骨髓微环境中ROS诱导的祖B细胞减少通过Fos/CCL3-CCR1轴促进破骨细胞生成的新机制 | 研究主要基于SAMP6小鼠模型，人体内的验证尚需进一步研究；体外细胞实验使用了BaF3和RAW 264.7细胞系，可能与体内原代细胞存在差异 | 探究免疫细胞改变在老年性骨质疏松中的机制作用 | SAMP6衰老加速小鼠、SAMR1对照小鼠、BaF3细胞系、RAW 264.7细胞系 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、转录组测序、流式细胞术、微CT、分子生物学、组织学技术、多色免疫荧光、多重细胞因子分析 | NA | 基因表达数据、图像数据、细胞计数数据 | SAMP6与SAMR1小鼠模型，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5408 | 2026-04-04 |
Short-Chain Fatty Acid Supplementation After Traumatic Brain Injury Attenuates Neurologic Injury Via the Gut-Brain-Microglia Axis
2026-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002706
PMID:40961414
|
研究论文 | 本研究探讨了补充短链脂肪酸（SCFAs）对创伤性脑损伤（TBI）后神经损伤的改善作用及其通过肠道-大脑-小胶质细胞轴的潜在机制 | 首次系统性地研究了TBI后补充SCFAs（乙酸盐、丁酸盐和丙酸盐）对神经损伤的改善作用，并揭示了其通过调节肠道微生物组、保护白质连接性、改变小胶质细胞转录谱以及诱导神经保护性热休克蛋白表达等多重机制发挥作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6小鼠模型，样本量相对有限（n=52），且未探讨SCFAs补充的最佳剂量、时间窗口或长期效果，也未在人类或更复杂的动物模型中进行验证 | 探究创伤性脑损伤（TBI）后补充短链脂肪酸（SCFAs）是否能够减轻神经损伤并阐明其作用机制 | 14周龄雄性C57BL/6小鼠 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 16s rRNA基因扩增子测序，单细胞RNA测序（scRNAseq），3D对比增强磁共振成像 | NA | 微生物组测序数据，神经影像数据，行为学数据，单细胞转录组数据 | 52只14周龄雄性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5409 | 2026-04-04 |
Genetic Association Between Polymyositis/Dermatomyositis and Epilepsy: Insights From Mendelian Randomization and Bioinformatic Analyses
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71148
PMID:41466027
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和生物信息学分析，探讨了多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的遗传关联及免疫介导机制 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学，揭示了多发性肌炎与癫痫之间的因果关联及免疫细胞浸润模式 | 研究主要基于公开数据库数据，缺乏大规模临床队列验证，且皮肌炎与癫痫的关联未得到证实 | 探索多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的潜在因果联系及免疫介导机制 | 多发性肌炎、皮肌炎和癫痫患者相关的基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 多发性肌炎/皮肌炎和癫痫 | GWAS, 孟德尔随机化, 转录组分析, 单细胞转录组学, PCR | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 基于公开GWAS数据库的汇总数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5410 | 2026-04-04 |
The Role of Sphingolipid Metabolism and Neuron Death in Ischemic Stroke: A New Perspective from Bioinformatics
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71172
PMID:41474773
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探讨了鞘脂代谢与神经元死亡在缺血性脑卒中中的作用 | 结合bulk和单细胞转录组学数据，首次系统分析了鞘脂代谢通路在缺血性脑卒中中的变化，并鉴定了与神经元死亡相关的关键基因App | 研究主要基于生物信息学分析，体内验证仅限于MCAO大鼠模型，缺乏临床样本的直接验证 | 探索鞘脂代谢与神经元死亡在缺血性脑卒中发病机制中的关系 | 缺血性脑卒中患者和小鼠模型的转录组数据，以及MCAO大鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 转录组数据 | 人类外周血bulk数据(GSE16561)和MCAO小鼠外周血scRNA-seq数据(GSE225948)，以及MCAO大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5411 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia
2026-Dec, Platelets
IF:2.5Q2
DOI:10.1080/09537104.2026.2651849
PMID:41918402
|
研究论文 | 本研究结合网络药理学与单细胞转录组学，系统解析了四种血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的关键靶点及免疫微环境特征 | 首次整合网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析，系统鉴定出TPO-RAs在ITP中的五个关键靶点基因，并揭示了骨髓微环境中异常的细胞间通讯和巨核细胞成熟动力学紊乱 | 研究主要基于计算生物学和体外数据验证，缺乏体内实验的直接功能验证；样本量可能有限，且ITP患者的异质性可能影响结果的普适性 | 阐明血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的作用分子机制，并探索其治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者的骨髓单细胞转录组数据、四种TPO-RAs药物（罗米司亭、艾曲泊帕、阿伐曲泊帕、海曲泊帕）的靶点 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序、网络药理学、高维加权基因共表达网络分析、分子对接、伪时间轨迹分析、计算机基因敲低 | hdWGCNA、分子对接模型、伪时间分析模型 | 单细胞转录组数据 | ITP患者和健康对照的骨髓单细胞RNA测序数据（具体样本数未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5412 | 2026-04-02 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-May, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
|
研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本的单细胞转录组数据，构建了一个基于癌症干细胞样细胞特征的12基因签名，用于预测患者生存和治疗反应 | 首次在患者样本中识别出具有癌症干细胞样特征的罕见细胞群，并基于此构建了CARS评分系统，揭示了其与索拉非尼耐药性和免疫检查点抑制剂敏感性的关联 | 研究基于单细胞转录组数据，样本量有限，需要更大规模的临床验证来确认CARS的预测价值 | 开发一个基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因签名，以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌患者样本中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | 基因签名评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5413 | 2026-04-02 |
Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis
2026-Apr, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2532039
PMID:40684330
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化方法，整合大规模表达数量性状位点数据和脑静脉血栓形成全基因组关联研究，系统识别并验证了与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 首次通过整合外周血和脑组织表达数量性状位点数据，结合孟德尔随机化框架，识别出IL18、BMPR2和COMT等基因作为脑静脉血栓形成的新型潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究结果基于遗传推断，需要进一步的机制和临床验证 | 系统识别和验证与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 脑静脉血栓形成患者 | 生物信息学 | 脑静脉血栓形成 | 孟德尔随机化、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接 | 两样本孟德尔随机化框架 | 遗传数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5414 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2026-Apr, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术，识别了具有内皮和间质双重表型的细胞簇，并明确了TGF-β/Snail通路在驱动内皮-间质转化中的核心作用 | 需要在临床前模型中进行进一步验证 | 阐明TGF-β信号通路在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 烟雾病 | 空间转录组学，免疫组织化学，免疫荧光，苏木精-伊红染色 | 伪时间轨迹分析，细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据，图像数据 | 11例烟雾病标本用于空间转录组学，总计51例烟雾病和11例对照血管标本用于组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 5415 | 2026-04-02 |
KGLAR: Deconvoluting Spatial Transcriptomics Data with Single-cell Transcriptomes through Knowledge-guided NMF and Least Angle Regression
2026-Apr-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00815-w
PMID:41920506
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5416 | 2026-04-02 |
Sparser2Sparse: Single-shot Sparser-to-Sparse Learning for Spatial Transcriptomics Imputation with Natural Image Co-learning
2026-Mar-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3679252
PMID:41915529
|
研究论文 | 提出了一种名为S2S-ST的新型单次稀疏到稀疏学习框架，用于空间转录组学数据插补，并利用自然图像进行协同训练 | 1) 提出稀疏到稀疏的自监督学习策略，利用ST数据内在空间模式从更稀疏子集预测部分观测稀疏区域；2) 引入与自然图像的跨域协同学习以增强特征表示；3) 设计级联数据一致性插补网络(CDCIN)，在迭代优化预测的同时保持采样基因数据的保真度 | NA | 解决高分辨率空间转录组学数据成本高、稀缺性的挑战，实现从稀疏输入进行准确数据插补 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 级联数据一致性插补网络(CDCIN) | 空间转录组学数据，自然图像 | 多种组织类型（包括乳腺癌、肝脏和淋巴组织） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5417 | 2026-04-02 |
Tobacco exposure and peripheral artery disease: A multi-omics investigation integrating epidemiology, genetics, toxicology, and single-cell transcriptomics
2026-Mar-30, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120083
PMID:41916120
|
研究论文 | 本研究通过整合流行病学、遗传学、毒理学和单细胞转录组学方法，探讨烟草暴露与血清可替宁水平对周围动脉疾病的影响及其炎症通路机制 | 首次将流行病学分析、网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接动力学和单细胞转录组学整合，系统揭示可替宁通过IL6/STAT3信号通路介导烟草暴露与周围动脉疾病关联的新机制 | 分子对接和动力学分析仅提示可替宁与IL6/STAT3可能存在瞬时相互作用，需进一步实验验证；单细胞数据未明确说明样本来源和数量 | 阐明烟草暴露通过血清可替宁介导的炎症通路导致周围动脉疾病的分子机制 | 烟草暴露人群、周围动脉疾病患者、血管相关免疫细胞和基质细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接与动力学、网络毒理学 | NA | 流行病学数据、遗传数据、分子模拟数据、单细胞转录组数据 | 基于NHANES数据库的流行病学队列（具体样本数未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5418 | 2026-04-02 |
Pre-existing cell states predict resistance to multiple treatments
2026-Mar-30, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101191
PMID:41916275
|
研究论文 | 本研究通过多治疗、高通量克隆追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了癌症细胞在治疗前的预存状态如何预测其对多种治疗产生耐药性 | 首次在平行多治疗条件下追踪稀有克隆的耐药性发展过程，并识别出与多治疗耐药相关的细胞状态，特别是发现治疗前CD44高表达可作为多治疗耐药的预测指标 | 研究主要基于体外实验模型，尚未在临床样本中得到充分验证 | 探究癌症细胞预存状态对多种治疗耐药性的预测机制 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | DNA条形码技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5419 | 2026-04-02 |
Perturb-seq uncovers pathological obstacles to direct cardiac reprogramming in vivo
2026-Mar-30, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.006
PMID:41916284
|
研究论文 | 本研究利用Perturb-seq平台系统识别了体内心脏重编程的障碍，发现calreticulin (Calr)是主要抑制剂，其敲除可显著提高诱导心肌细胞效率并改善心肌梗死后的心脏功能 | 开发了适用于复杂病理环境的Perturb-seq平台，首次系统比较并排名了140个潜在体内心脏重编程障碍，揭示了Calr作为关键抑制剂的新机制 | 研究主要基于shRNA筛选和单细胞RNA-seq数据，体内实验验证可能受模型特异性限制，未全面探讨其他潜在障碍的长期影响 | 识别并克服体内直接心脏重编程的病理障碍，以提高心肌细胞诱导效率，促进心脏再生 | 成纤维细胞向心肌细胞的直接转分化过程，特别是在心肌梗死后的病理微环境中 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | Perturb-seq, 单细胞RNA-seq, shRNA筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及140个潜在障碍的筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制化Perturb-seq平台，适用于复杂病理环境 |
| 5420 | 2026-04-02 |
Spatiotemporal multiomics reveal a default CD4 fate and a stem-like CD8 T cell subset in the thymus
2026-Mar-25, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.053
PMID:41895464
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质分析、染色质可及性和空间转录组学技术，构建了小鼠胸腺T细胞发育的多模态图谱，揭示了αβ和γδ谱系的早期分叉、CD4谱系的默认程序以及一个干细胞样CD8 T细胞亚群 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术，高分辨率地解析了胸腺T细胞发育的时空动态，明确了αβ和γδ谱系在DN1阶段的早期分叉，并发现CD4谱系是转录默认程序，而CD8谱系需要Runx3激活和I类MHC信号 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；空间转录组学分辨率有限，可能无法完全捕捉细胞间相互作用的细节 | 构建胸腺T细胞发育的全面多模态图谱，以阐明早期谱系决定、中间状态和空间检查点的分子机制 | 小鼠胸腺中的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、CITE-seq、scATAC-seq、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |