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当前共找到 9459 篇文献,本页显示第 5381 - 5400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5381 2026-06-10
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2026-Feb-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序分析肝癌中肿瘤细胞与微环境的共依赖性关系 提出深度学习策略将肿瘤细胞状态与其周围环境架构进行空间映射,并发现不同的肿瘤细胞状态可形成独特的“村庄”结构,每个村庄由特定的微环境支持 未提及具体局限性 理解肿瘤如何建立其独特的空间景观以及驱动肿瘤适应性的因素 来自50个肿瘤标本的超过200万个细胞,以及740名肝癌患者的单细胞、空间和批量转录组数据 数字病理学 肝癌 空间单细胞成像、单细胞RNA测序 深度学习 图像、转录组数据 50个肿瘤标本、740名肝癌患者 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
5382 2026-06-10
Utilizing bulk and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers linked to angiogenesis and integrated stress response in chondrosarcoma
2026-Feb-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用批量与单细胞RNA测序识别与软骨肉瘤血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物 首次通过综合批量与单细胞RNA测序分析,确定HSPA8、LMNA和SERPINH1作为软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物,并揭示其调控网络及细胞互作机制 样本量有限且主要依赖公开数据库,部分分析结果尚未在独立队列中验证,分子机制验证仍停留在表达水平 鉴定软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物,并阐明其分子机制 软骨肉瘤患者样本 机器学习 软骨肉瘤 RNA-seq NA 基因表达数据 来源于GEO数据库的多个数据集(GSE30835、GSE22855、GSE184118) NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
5383 2026-06-10
Milk fat globule-EGF factor 8 enhances the proliferation and migration of thyroid carcinoma cells through epithelial-mesenchymal transition and PI3K/AKT signaling pathway
2026-Feb-21, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 发现MFG-E8通过EMT和PI3K/AKT信号通路促进甲状腺癌细胞增殖和迁移 首次揭示MFG-E8在甲状腺癌中的表达和功能,特别是其与侵袭性亚型的关系及潜在临床应用价值 未提及具体局限性,需进一步验证临床转化价值 研究MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及作用机制 甲状腺癌细胞系及乳头状甲状腺癌组织样本 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、转录组测序、质谱分析、免疫组化、Western blotting、RT-PCR NA 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 包含甲状腺癌组织和细胞系样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA 未提供具体平台配置细节
5384 2026-06-10
Spatial multiomics reveals irreversible electroporation-induced immuno-metabolic characteristics of the inflammatory margin in liver cancer
2026-Feb-20, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 结合空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序和CyTOF技术,揭示不可逆电穿孔(IRE)诱导的肝癌炎症边缘中的免疫代谢特征 首次通过多组学方法精确定位IRE诱导的炎症边缘,并发现Ly6CPD-L1+脂质相关巨噬细胞(LAMs)的显著浸润及其免疫抑制表型与脂质代谢重编程的关联 研究仅在雄性C57BL/6小鼠原位肝癌模型中进行,尚未在人类样本中验证 阐明IRE消融后肝癌炎症边缘的免疫和代谢变化,为联合治疗提供潜在代谢靶点 雄性C57BL/6小鼠的原位肝癌模型 数字病理学 肝癌 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, CyTOF NA 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, CyTOF数据 未指定具体样本数量 NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, CyTOF NA NA
5385 2026-06-10
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序,发现肿瘤内微小单胞菌通过分泌p-甲酚诱导调节性T细胞分化,从而促进食管鳞状细胞癌的进展 首次揭示了肿瘤内微生物(微小单胞菌)与食管鳞状细胞癌免疫微环境之间的直接机制联系,阐明了其通过代谢物p-甲酚诱导Treg分化的具体途径 未提及研究的具体局限性 探究肿瘤内微生物群在食管鳞状细胞癌发生与发展中的组成和功能影响 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤与配对正常组织,以及调节性T细胞 机器学习 食管癌 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 测序数据 119对肿瘤-正常组织样本,45个单细胞RNA测序样本 Illumina 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
5386 2026-06-10
Calibrating tissue level PDE models of ligand dynamics using single cell and spatial transcriptomics data
2026-Feb-19, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据校准组织水平的配体动力学偏微分方程模型 提出了一个计算流程,将有限体积求解器、生物信息学预处理、近似贝叶斯计算和基于梯度的优化相结合,利用单细胞和空间转录组数据校准组织尺度上的反应扩散模型参数 该方法依赖于高质量的空间转录组和单细胞数据,公开数据集的可用性和质量可能限制其广泛应用;此外,校准过程计算成本较高 开发一种灵活且严谨的方法,利用现代转录组学数据校准组织层次的机械模型参数 转化生长因子β的亚型,这是组织修复和纤维化的关键调节因子 机器学习, 数字病理学 纤维化 单细胞RNA测序, 空间转录组学 反应扩散偏微分方程, 近似贝叶斯计算, 梯度优化 基因表达数据, 空间转录组数据 两个公开的人类皮肤数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
5387 2026-06-10
Poly-l-lactic acid electrospun membrane with specific morphology promotes bone regeneration through macrophage reprogramming
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 通过巨噬细胞重编程促进骨再生的特定形态聚左旋乳酸电纺膜研究 首次揭示不同形貌(取向与随机)和尺寸(纳米与微米)的聚左旋乳酸电纺膜通过调控巨噬细胞亚型转化促进骨再生的分子机制,特别是发现取向600nm组具有最佳骨修复效果 仅在大鼠颅骨缺损模型中验证,缺乏临床人体样本研究;单细胞RNA测序分析主要聚焦免疫微环境,其他细胞类型的作用未充分探讨 探究聚左旋乳酸电纺膜的物理形貌对骨免疫微环境的影响及其促进骨再生的分子机制 大鼠颅骨缺损模型中的骨组织及巨噬细胞与骨髓间充质干细胞共培养体系 数字病理学, 机器学习 骨缺损 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大鼠骨组织样本(各组数量未明确提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5388 2026-06-10
In situ electrospinning at the operating table to immobilise mesenchymal stem cells on the bony wall for the regeneration of osteoporotic bone defects
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 利用手持静电纺丝装置在手术中将间充质干细胞直接固定于骨缺损部位,促进骨质疏松性骨缺损再生 提出一种新型干细胞递送策略,通过手持静电纺丝装置在体内骨缺损部位原位固定间充质干细胞,解决了现有方法依赖支架等载体、细胞难以直接粘附于复杂骨壁表面的问题 未提及具体限制,可能与样本量较小或动物模型局限性有关 开发一种改进的间充质干细胞递送策略,以增强骨质疏松性骨缺损的骨修复 骨质疏松大鼠的颅骨缺损模型及间充质干细胞 机器学学 骨质疏松性骨缺损 单细胞测序、组织mRNA测序、流式细胞术 NA 测序数据 骨质疏松大鼠(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
5389 2026-06-10
From modality-specific to compositional foundation models for cell biology
2026-Feb-18, Cell systems IF:9.0Q1
评论 探讨了组合式AI作为模块化设计方法,用于构建多模态基础模型,统一生物模态(如染色质可及性、蛋白质丰度、空间转录组学、显微镜成像和文本注释)成为细胞行为的统一表示 提出了组合式AI作为模块化设计方法构建多模态基础模型,并介绍了基于Transformer的注意力策略来实现这些模型 面临数据可用性有限和模态表示之间的结构差异等挑战 利用多模态AI解码细胞系统的复杂性,并展望代理虚拟细胞模型的发展 细胞生物学中的多模态数据 数字病理学 不适用 NGS Transformer 图像、文本 不适用 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
5390 2026-06-10
Metformin inhibits proliferation of residing fibroadipogenic progenitor cells from failing human hearts
2026-Feb-03, ESC heart failure IF:3.2Q2
研究论文 二甲双胍抑制衰竭人类心脏中驻留的纤维脂肪祖细胞增殖 首次在HFrEF患者体内研究了心肌二甲双胍分布,并通过单细胞RNA测序识别出心脏纤维脂肪祖细胞(FAPs) 样本量较小(7例患者和4例对照),可能影响结果的普遍性 探究二甲双胍在射血分数降低的心力衰竭(HFrEF)中的心肌分布及其对心脏纤维生成祖细胞的作用 7名HFrEF患者和4个对照人类心脏组织的纤维脂肪祖细胞 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 正电子发射断层扫描, 荧光激活细胞分选 NA 图像, 文本 7名HFrEF患者进行PET成像, 4个HFrEF和4个对照心脏用于单细胞RNA测序 Illumina 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
5391 2026-06-10
Heat shock response-driven signature and DNAJB11 in HCC: A multifaceted role in prognosis, immune microenvironment, ferroptosis and therapeutic sensitivity
2026-Feb, Journal of thermal biology IF:2.9Q1
研究论文 基于热休克反应相关基因构建肝细胞癌预后风险模型,并揭示其在免疫微环境、铁死亡和治疗敏感性中的多重作用 首次基于热休克反应相关基因对肝细胞癌进行分子分型,并构建预后风险模型,整合铁死亡机制分析,为个体化治疗提供新工具 未提及验证队列或外部数据集验证,且机制研究限于体外实验,缺乏体内模型验证 探索热休克反应在肝细胞癌预后、免疫微环境、铁死亡及治疗敏感性中的作用,并开发预后预测模型 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及细胞系 机器学习 肝细胞癌 RNA测序,免疫组织化学,单细胞RNA测序,空间转录组学 机器学习模型,风险评分模型 基因表达数据,免疫组织化学图像,单细胞转录组数据,空间转录组数据 基于公开数据集,样本量未具体说明 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
5392 2026-06-10
Identifying cell-type-specific marker genes of dental epithelial cells using single-cell RNA sequence: A review
2026-Feb, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
综述 系统整合单细胞RNA测序数据与实验验证,构建牙上皮细胞类型特异性标记基因分子图谱 首次整合scRNA-seq、组织学验证、表型数据库和CAGE-seq数据,对成釉细胞和非成釉细胞谱系进行全面的分子标记鉴定 主要基于小鼠模型数据进行整合分析,缺乏人类牙发育数据的直接验证 建立牙上皮细胞类型的更新分子图谱,为解释牙釉质表型和指导未来牙发育研究提供综合基础 牙上皮细胞,包括内釉上皮、外釉上皮、星网层、中间层等细胞类型 数字病理学 牙发育相关疾病 单细胞RNA测序, CAGE测序 NA 基因表达数据 整合多个已发表的scRNA-seq牙发育研究数据集,以及小鼠牙组织免疫染色/原位杂交实验验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5393 2026-06-10
Microbiota-dependent transcriptional priming of lung innate immune cells in a mouse model of LPS-induced sepsis-associated lung injury
2026-Feb, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
研究论文 研究无特定病原体和传统饲养小鼠在正常和脂多糖诱导脓毒症条件下肺免疫细胞的单细胞转录组,揭示共生微生物对肺先天免疫细胞转录成熟和功能的影响 首次通过单细胞RNA测序揭示共生微生物对肺先天免疫细胞(中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞)转录状态和成熟轨迹的启动作用,发现微生物信号缺失导致中性粒细胞成熟受阻及炎症反应减弱 仅基于小鼠模型和LPS诱导的脓毒症条件,结果可能不完全适用于人类或其他感染模型;未能详细阐明微生物信号的具体分子机制 探究共生微生物如何通过转录启动影响肺先天免疫细胞的成熟和炎症响应能力 无特定病原体(GF)和传统饲养(CV)小鼠的肺先天免疫细胞(中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞) 单细胞转录组学 脓毒症相关肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 GF和CV小鼠在正常和LPS诱导脓毒症条件下的肺免疫细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA 使用标准单细胞RNA测序流程进行细胞类型注释和通路分析
5394 2026-06-10
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN,整合改进的对抗自编码器与图卷积网络,以鲁棒分析不同分辨率和通量的空间转录组数据 创新性地将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成在统一框架中,通过混合编码器(多注意力机制与残差连接)捕获精细局部表达模式同时保留关键全局信息,实现去噪与稳定潜在表征学习 未在文中明确提及局限性 开发一种无监督方法用于空间转录组学分析,以应对数据噪声和复杂性挑战 空间转录组学数据集 机器学习 NA 空间转录组学 对抗自编码器(AAE),图卷积网络(GCN) 基因表达数据 多个空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
5395 2026-06-10
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals ISG15 as a Key Regulator of Macrophage-Mediated Inflammation Driving Primary Sjögren's Syndrome Progression
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示ISG15作为巨噬细胞介导的炎症驱动原发性干燥综合征进展的关键调控因子 整合批量RNA-seq与单细胞RNA-seq数据,结合三种机器学习算法筛选免疫代谢生物标志物,并首次实验验证ISG15在pSS中通过NF-κB通路调控炎症的功能 未提及明确的局限性 识别原发性干燥综合征的诊断生物标志物并表征单核-巨噬细胞分化轨迹 原发性干燥综合征患者的唾液腺细胞和THP-1巨噬细胞 机器学习 干燥综合征 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 伪时间分析, 机器学习 LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林, Monocle3, CellChat 基因表达数据 42,157个唾液腺细胞 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
5396 2026-06-10
Single-Cell Sequencing Combined with RNA Sequencing Reveals the Role of Natural Killer Cells in Prognosis and Immunotherapy Response in Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 结合单细胞测序和RNA测序揭示自然杀伤细胞在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫疗法反应中的作用 首次通过整合单细胞测序和转录组测序数据,鉴定高活性NK细胞相关基因并构建预后风险模型,为宫颈鳞状细胞癌的免疫治疗提供新靶点 未说明明确的局限性(需根据全文推断,但摘要未提及) 探究高活性NK细胞相关基因在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗中的潜在价值 宫颈鳞状细胞癌患者的转录组和单细胞测序数据 机器学习 宫颈鳞状细胞癌 RNA-seq, 单细胞测序 Cox回归, LASSO回归, WGCNA 基因表达数据 NA(摘要未明确样本数量) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
5397 2026-06-10
Integrated single-cell and transcriptomic profiling identifies machine-learning-based pyroptosis biomarkers in IBD
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和转录组数据,利用机器学习方法识别炎症性肠病中与细胞焦亡相关的生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法(LASSO、GBM、SVM、Boruta、随机森林)筛选出六种具有诊断潜力的细胞焦亡关键基因,并鉴定出巨噬细胞、上皮细胞和中性粒细胞是焦亡最活跃的细胞类型 未提及样本间异质性验证和纵向队列数据支持;单细胞分析仅限于肠道黏膜样本,可能无法完全代表全身性焦亡动态 探索炎症性肠病中细胞焦亡的关键细胞类型和调控基因,并筛选非侵入性诊断生物标志物 炎症性肠病患者的肠道黏膜样本和外周血转录组数据 生物信息学 炎症性肠病 单细胞RNA测序、RNA-seq LASSO, GBM, SVM, Boruta, Random Forest 基因表达数据 未明确提及样本数量(依据单细胞和bulk转录组数据集) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5398 2026-06-10
UNC93B1 promotes pancreatic cancer progression through modulation of cGAS-STING signaling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析,发现UNC93B1通过调控cGAS-STING信号通路促进胰腺癌进展,并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次结合单细胞转录组、空间转录组、GWAS和机器学习框架系统鉴定UNC93B1在胰腺癌中的关键作用,并阐明其通过抑制cGAS-STING通路促进免疫抑制微环境和转移的机制 依赖公开数据集中有限的样本量,体外功能验证仅采用部分细胞系,体内模型为皮下移植瘤,未涉及原位模型或患者来源异种移植模型(PDX) 揭示胰腺导管腺癌(PDAC)的分子驱动因素,阐明UNC93B1在肿瘤微环境中的功能及其机制,为精准治疗策略提供依据 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织、PDAC细胞系及异种移植瘤模型 数字病理学, 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 基因组关联研究(GWAS), 基因敲低, 蛋白质印迹, 流式细胞术 Seurat, Harmony, scPagwas, hdWGCNA, LASSO回归, 随机森林, 支持向量机, GSVA, Monocle2, CellChat 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据、GWAS数据、蛋白质表达数据 单细胞RNA测序:22个PDAC样本(GSE154778, GSE212966);批量转录组队列:GSE28735、GSE62452;TCGA-PAAD项目:172例生存数据;GWAS数据:196,187例;体外验证:4个PDAC细胞系;体内模型:皮下异种移植瘤 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
5399 2026-06-10
Single-cell and spatial transcriptomics reveal transplant-associated T cells and myeloid cells in human liver transplantation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肝移植中的移植相关T细胞和髓系细胞 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学,高分辨率揭示肝移植排斥反应中免疫细胞的动态变化及空间分布 样本量有限,未提供具体样本数量;机制验证缺乏体内功能实验支持 探究肝移植排斥反应中肝内免疫细胞的动态变化及相互作用 人类肝移植术后不同阶段的移植物组织 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
5400 2026-06-10
Molecular interplay of ASNS and the PI3K-AKT-mTOR pathway in CMV and HIV co-infections: Therapeutic implications
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究揭示了天冬酰胺合成酶(ASNS)在巨细胞病毒(CMV)和HIV共感染中的关键代谢信号枢纽作用及其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,为共感染治疗提供了新靶点 首次发现ASNS作为CMV/HIV共感染中的代谢信号枢纽,并验证其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,通过分子对接发现西多福韦以高亲和力结合ASNS 研究主要基于生物信息学分析和计算模拟,缺乏体外或体内实验验证,结论尚需进一步实验确认 探究CMV/HIV共感染中ASNS与PI3K-AKT-mTOR通路的分子相互作用及其治疗意义 CMV/HIV共感染患者,转录组数据及单细胞RNA测序数据 计算机视觉 感染性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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