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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5321 | 2026-04-10 |
C-C Chemokine Receptor 4 Deficiency Protects Against Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2026-Mar-17, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043202
PMID:41294146
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型,揭示了CCR4缺失对腹主动脉瘤形成的保护作用及其免疫调节机制 | 首次阐明CCR4在腹主动脉瘤发病中的具体作用,发现其缺失通过调节T细胞平衡和IFN-γ信号通路发挥保护作用 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;未探讨CCR4拮抗剂的具体治疗效果 | 探究CCR4在腹主动脉瘤发病机制中的作用 | CCR4基因敲除小鼠(Ccr4-/-Apoe-/-背景) | 心血管疾病研究 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析、生化检测 | 基因敲除动物模型 | 单细胞转录组数据、组织图像、流式数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5322 | 2026-04-10 |
Transfer of Damaged Mitochondria from Cancer Cells to Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Tyrosine Kinase Inhibitor Tolerance in EGFR-Mutant Lung Cancer
2026-Mar-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0433
PMID:41329713
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研究论文 | 本研究揭示了EGFR突变型肺癌中,癌细胞通过将受损线粒体转移至癌症相关成纤维细胞,从而促进酪氨酸激酶抑制剂耐受的新机制 | 首次发现RGS5+MYL9+癌症相关成纤维细胞可作为“代谢池”接受肿瘤来源的受损线粒体,并揭示了通过CCL11信号招募、Miro1/RhoA激活形成隧道纳米管的线粒体转移机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和体内实验,临床样本验证及具体分子机制的深入解析有待进一步开展 | 探究EGFR突变型肺腺癌中酪氨酸激酶抑制剂耐受的机制,并寻找克服耐药性的潜在治疗策略 | EGFR突变型肺腺癌的耐药持久性细胞及癌症相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5323 | 2026-04-10 |
Immune regulation and cellular crosstalk drive non-fibrotic lung remodeling in pre-metamorphic frogs exposed to paraquat
2026-Feb-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02546-2
PMID:41709280
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研究论文 | 本研究利用组织学分析、行为学检测和单细胞RNA测序技术,探究了环境相关浓度百草枯暴露对Microhyla fissipes蝌蚪的急性肺部反应,揭示了其非纤维化的、免疫驱动的肺重塑程序 | 首次在蝌蚪模型中揭示了急性百草枯暴露诱导的非纤维化肺重塑,并阐明了其涉及上皮-间质协调改变、氧化应激反应和细胞外基质组织的免疫介导适应机制,以及发育信号通路(如Wnt/β-catenin)的重新激活 | 研究结论仅适用于蝌蚪阶段和短期暴露,需要进一步研究评估长期或变态后的结果 | 研究环境化学应激(百草枯暴露)对脊椎动物早期发育阶段肺部急性损伤反应、恢复力和发育可塑性的影响 | Microhyla fissipes(一种蛙)的蝌蚪 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),组织学分析,行为学检测 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据,行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5324 | 2026-04-10 |
A comprehensive evaluation of long-read de novo transcriptome assembly
2026-Feb-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04001-5
PMID:41709347
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研究论文 | 本文对RATTLE、RNA-Bloom2和isONform等长读长从头转录组组装工具进行了全面评估,并与短读长组装工具Trinity进行了性能比较 | 首次在多种数据集(包括模拟数据、spike-in序列和真实生物样本)上系统评估长读长从头转录组组装工具,并分析组装选择对差异基因/转录本表达检测的下游影响 | 长读长组装方法在准确性和冗余度方面仍存在局限,与参考基因组引导的方法相比仍有差距 | 评估长读长从头转录组组装工具的性能,为无高质量参考基因组情况下的差异表达分析提供策略指导 | 人类和豌豆(Pisum sativum)样本的转录组数据 | 生物信息学 | NA | 长读长测序、转录组组装、差异表达分析 | NA | 测序数据(模拟数据、真实生物样本数据) | 多种数据集,覆盖6-60百万读长的测序深度 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | cDNA测序、直接RNA测序、单细胞测序 | ONT, PacBio | Oxford Nanopore Technologies (ONT) cDNA测序、ONT直接RNA测序、Pacific Biosciences (PacBio) 10×单细胞测序 |
| 5325 | 2026-04-10 |
Upregulation of TNFR2 Precedes TOX Expression by Exhausted T cells and Restricts Antitumor and Antiviral Immunity
2026-Feb-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3455
PMID:41269210
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研究论文 | 本研究揭示了TNFR2上调在T细胞耗竭过程中的关键作用,并探索了其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 首次发现TNFR2上调是T细胞从祖细胞耗竭向终末耗竭转变的上游调控因子,并证明TNFR2拮抗可增强抗肿瘤和抗病毒免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床转化仍需进一步验证 | 探究TNFR2在调节T细胞耗竭和TOX表达中的作用,以及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 人类和小鼠肿瘤浸润CD8+ T细胞,以及TNFR2敲除小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤和慢性病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 人类和小鼠肿瘤浸润CD8+ T细胞样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 5326 | 2026-04-10 |
Dissection of Gαs and Hedgehog Signaling Cross-talk Reveals Therapeutic Opportunities to Target Hedgehog-Dependent Tumors
2026-Feb-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1109
PMID:41460725
|
研究论文 | 本研究通过组织学、批量RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs和Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并提出了针对Hedgehog依赖性肿瘤(如基底细胞癌)的潜在治疗策略 | 发现Gαs通路失活驱动的肿瘤与经典Hedgehog信号激活的肿瘤高度相似,且这些肿瘤独立于SMO和GPR161,为SMO非依赖的致癌Hedgehog信号模型提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类BCC样本,尚未在大型临床试验中验证BAY60-6583的治疗效果 | 探索Gαs和Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并寻找针对Hedgehog依赖性肿瘤的治疗机会 | 小鼠基底细胞癌样肿瘤和人类基底细胞癌样本 | 分子生物学与肿瘤学 | 基底细胞癌 | 组织学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | 未明确指定具体样本数量,涉及小鼠肿瘤模型和人类BCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5327 | 2026-04-10 |
Spatiotemporal interplay between epithelial and mesenchymal cells drives human dentinogenesis
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69545-3
PMID:41690906
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建了人类牙齿从起始到萌出阶段的发育图谱,聚焦于上皮-间充质相互作用 | 揭示了牙上皮通过WNT-NOTCH顺序激活模型调控牙乳头细胞分化,并识别了关键信号分子;首次发现DLX6-AS1牙乳头细胞可响应牙上皮信号,且能从成体牙髓干细胞中分离,成功在体内疾病模型中生成管状牙本质 | 未明确提及研究的具体局限性,如样本规模、技术验证或临床转化挑战 | 探究人类牙齿发育过程中上皮与间充质细胞的时空相互作用机制,为牙本质缺陷修复提供再生医学基础 | 人类牙齿发育过程中的牙上皮细胞和牙乳头细胞,以及成体牙髓干细胞 | 数字病理学 | 牙本质缺陷 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 未明确指定样本数量,但涵盖从起始到萌出阶段的人类牙齿发育过程 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5328 | 2026-04-10 |
Molecular Mechanisms of FLASH Radiotherapy in Alleviating Lung Normal Tissue Injury: Insights from Single-Cell Sequencing
2026-Feb-12, Radiation research
IF:2.5Q2
DOI:10.1667/RADE-25-00125
PMID:41679749
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了FLASH放疗在减轻肺正常组织损伤中的分子机制 | 首次在肺癌小鼠模型中结合单细胞测序全面比较FLASH放疗与传统放疗对正常肺组织和肿瘤的差异分子响应 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;分子机制尚未完全阐明 | 探究FLASH放疗减轻正常组织毒性的分子机制 | 肺癌小鼠模型中的正常肺组织和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达谱 | 肺癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5329 | 2026-04-10 |
PURE-seq integrates FACS and PIP-seq for single-cell genomics of ultra-rare cells
2026-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68146-w
PMID:41565684
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PURE-seq的新方法,该技术整合了FACS和PIP-seq,用于对超稀有细胞进行单细胞基因组学研究 | 开发了PURE-seq技术,通过直接FACS分选细胞到PIP-seq反应中,实现了对超稀有细胞(如稀有度达百万分之一的细胞)的高效捕获和单细胞测序 | NA | 开发一种高灵敏度的方法,用于单细胞测序超稀有细胞,以解决传统单细胞转录组学中稀有细胞群体被稀释的问题 | 循环肿瘤细胞(来自转移性黑色素瘤患者血液)以及年轻、老年和中年小鼠的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞基因组学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学,FACS,PIP-seq | NA | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5330 | 2026-04-10 |
CD19 CAR T-Cell Therapy for Autoimmune Hemolytic Anemia
2026-Jan-15, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2509820
PMID:41534043
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研究论文 | 本研究评估了CD19 CAR T细胞疗法在治疗多难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 | 首次将CD19 CAR T细胞疗法应用于多难治性自身免疫性溶血性贫血,并利用多组学分析揭示了复发特异性B细胞生态位的细胞间相互作用 | 样本量较小(11例患者),中位随访时间仅12.2个月,需要更大规模和更长期的随访研究 | 评估CD19 CAR T细胞疗法在多难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 | 多难治性自身免疫性溶血性贫血患者 | NA | 自身免疫性溶血性贫血 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、配对B细胞受体测序 | NA | 临床数据、多组学数据 | 11例患者(5例来自同情使用项目,6例来自1期研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5331 | 2026-04-10 |
MIF-mediated reprogramming of myeloid lineage within the glioma tumor microenvironment impacts the efficacy of immune stimulatory gene therapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699283
PMID:41648606
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析野生型和突变型IDH1胶质瘤的细胞异质性,重点关注髓系细胞群,揭示了MIF-CD74轴在调节胶质瘤免疫微环境中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和MIF-CD74轴机制研究,在胶质瘤中揭示MIF介导的髓系细胞重编程对免疫刺激基因疗法疗效的影响 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限,且未详细探讨其他免疫细胞亚群的作用 | 探究胶质瘤肿瘤微环境中髓系细胞的异质性及其对免疫疗法疗效的影响 | 野生型和突变型IDH1胶质瘤的髓系细胞群,特别是单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及wtIDH1和mIDH1胶质瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5332 | 2026-04-09 |
Neutrophils have altered response to acute respiratory viral infection in sputum of patients with rheumatoid arthritis
2026-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2026.100665
PMID:41852854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎患者与健康对照者在呼吸道感染前后痰液中的免疫细胞转录组差异 | 首次在类风湿关节炎患者痰液中应用单细胞RNA测序技术,揭示中性粒细胞在感染后30天内持续存在的转录组差异 | 样本量较小(仅5名女性捐赠者),且缺乏长期随访数据 | 探究类风湿关节炎患者肺部免疫细胞在急性呼吸道病毒感染前后的转录组变化 | 类风湿关节炎患者和健康对照者的痰液样本 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名女性捐赠者(2名健康,3名类风湿关节炎),共23,094个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Flex | 10x Flex单细胞RNA测序协议 |
| 5333 | 2026-04-09 |
Shear stress-induced endothelial HEG1 signalling regulates vascular tone and blood pressure
2026-Apr-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf742
PMID:40986512
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞中HEG1蛋白在血流剪切应力感应和血压调节中的关键作用及其分子机制 | 首次发现内皮HEG1通过CUL3介导的PHACTR1降解调控eNOS转录和NO产生,从而影响血管舒张和血压 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且未探讨HEG1信号通路在其他心血管疾病中的潜在作用 | 阐明内皮HEG1在血压调节中的作用及其分子机制 | 内皮细胞、小鼠模型、人类动脉和血浆样本 | 心血管生物学 | 高血压 | 单细胞RNA测序、计算流体动力学分析、蛋白质组学、转录组学、泛素化分析 | 内皮特异性Heg1敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、血流动力学数据 | 多个独立队列的人类动脉和血浆样本,以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5334 | 2026-04-09 |
Img2Gene: Debiased Spatially Resolved Transcriptomics with Biological Context from Pathology Images
2026-Apr-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3681769
PMID:41945845
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研究论文 | 提出一个名为Img2Gene的去偏框架,用于从病理全切片图像中预测基因表达水平,通过整合生物学上下文信息来解决数据稀疏性和模态异质性问题 | 首次将因果分析整合到基因表达预测任务中,以缓解数据稀疏性并实现无偏预测;利用基因集富集分析识别高度相关的通路信息作为生物学上下文;引入跨模态一致性损失来对齐不同模态的数据 | 未明确说明模型在临床样本或更大规模数据集上的泛化能力,也未讨论计算资源需求 | 开发一个能够从病理图像中准确、无偏地预测空间分辨转录组基因表达水平的计算框架 | 空间转录组数据与病理全切片图像的整合分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架(具体架构未明确说明,但涉及因果分析和跨模态对齐) | 图像(病理全切片图像)与基因表达数据 | 四个公共数据集(具体样本数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5335 | 2026-04-09 |
The roles of NF-κB-activated theca cell subtypes in subclinical premature ovarian insufficiency
2026-Apr-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag032
PMID:41818683
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序,探索了早发性卵巢功能不全患者卵泡微环境中细胞和分子的改变,特别是炎症通路的作用 | 首次在早发性卵巢功能不全患者中,通过单细胞测序鉴定出NF-κB激活的卵泡膜/基质细胞亚型,并揭示了其可能通过影响颗粒细胞分化参与疾病早期发病机制 | 样本量有限(单细胞测序每组仅n=1),初步发现需要更大样本量的研究进一步验证 | 探究早发性卵巢功能不全的早期发病机制,特别是卵泡微环境中炎症通路的角色 | 早发性卵巢功能不全患者的卵泡微环境细胞(颗粒细胞、卵泡膜/基质细胞等) | 单细胞组学 | 卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单细胞测序:每组1例(共2例);批量RNA测序:每组4例(共8例) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5336 | 2026-04-09 |
Single-cell transcriptomics reveals cytotrophoblast subtypes and senescence in recurrent spontaneous abortion
2026-Apr-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag030
PMID:41849438
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了复发性自然流产中细胞滋养层细胞的亚型特征及细胞衰老现象 | 首次在复发性自然流产中鉴定出三种细胞滋养层细胞亚型,并发现CTB2和CTB3亚型存在显著的细胞衰老特征 | 研究样本量有限,且未深入探讨细胞衰老的具体分子机制 | 探究复发性自然流产的发病机制,特别是滋养层细胞的功能异常 | 对照和复发性自然流产患者的绒毛组织 | 数字病理学 | 复发性自然流产 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确具体样本数量,但包括对照和RSA两组绒毛组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5337 | 2026-04-09 |
NRF2/SLC7A11 axis-mediated metabolic reprogramming drives Benzo[a]pyrene-induced malignant transformation: Evidence from lung organoid and 16HBE cell models
2026-Apr-03, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究利用肺类器官和BaP诱导的恶性转化细胞模型,揭示了NRF2/SLC7A11轴介导的氨基酸代谢重编程在苯并[a]芘诱导的细胞恶性转化中的关键作用 | 首次在肺类器官和细胞模型中系统阐明了NRF2通过直接结合SLC7A11启动子调控氨基酸代谢,从而驱动BaP诱导的恶性转化的分子机制 | 研究主要基于体外模型(类器官和细胞系),缺乏体内动物模型的验证,且临床相关性有待进一步探索 | 阐明苯并[a]芘诱导肺癌发生的分子机制 | 肺类器官和BaP诱导的恶性转化人支气管上皮细胞(16HBE-T) | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5338 | 2026-04-09 |
scGraphDap: Integrating Functional State Pseudo-Labels and Graph Structure Learning for Robust Cell Type Annotation in Tumor Microenvironments
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3607687
PMID:40928910
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGraphDap的图神经网络框架,通过整合功能状态伪标签和图结构学习,以改善肿瘤微环境中的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 利用通路活性评分作为伪标签优化细胞-细胞图,以捕捉超越几何相似性的功能邻近性,并引入图域适应模块对齐不同患者间的细胞嵌入,增强跨个体泛化能力 | NA | 改善肿瘤微环境中基于非空间单细胞RNA测序数据的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 肿瘤微环境中的细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 来自15名患者的38,667个细胞,涵盖三种癌症 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5339 | 2026-04-09 |
AutoGRN: An Automated Graph Neural Network Framework for Gene Regulatory Network Inference
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3609408
PMID:40956752
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研究论文 | 本文提出了AutoGRN,一个用于基因调控网络推断的自动化图神经网络框架,通过遗传搜索算法优化GNN架构以适应单细胞RNA测序数据的特性 | AutoGRN通过将影响GRN推断性能的多种组件纳入搜索空间,并利用信息熵约束的遗传搜索算法,自动适应不同单细胞RNA测序数据集的特征,从而优化GNN架构,解决了固定架构难以泛化的问题 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个自动化框架以提高基因调控网络推断的准确性和泛化能力 | 基因调控网络(GRN) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图神经网络(GNN) | 基因表达数据 | 多个公共数据集(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5340 | 2026-04-09 |
scProca: A Cross-Attention-Enhanced Deep Generative Model for Single-Cell Transcriptomics and Proteomics Integration and Imputation
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3615771
PMID:41021958
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scProca的深度生成模型,用于整合和插补单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | scProca通过交叉注意力机制整合细胞间关系,以处理异质性输入数据,并在高蛋白质稀疏性下保持鲁棒性,实现了最先进的整合和插补性能 | NA | 旨在通过整合单细胞转录组学和蛋白质组学数据,更深入地理解复杂疾病的分子机制和细胞状态 | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | 复杂疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学和蛋白质组学共分析 | 深度生成模型(基于交叉注意力机制) | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学和蛋白质组学共分析 | NA | NA |