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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5241 | 2026-04-13 |
Demystifying Plasmodium development within the Anopheles mosquito
2026-Apr-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102751
PMID:41966627
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综述 | 本文总结了显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选等新技术如何革新了对疟原虫在按蚊体内发育阶段的研究 | 整合了最新的显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选技术,以揭示疟原虫在蚊媒中发育的复杂过程 | NA | 提高对疟原虫在按蚊体内发育阶段的理解,以支持新型疟疾传播控制工具的研发 | 疟原虫在按蚊体内的生命周期阶段 | 自然语言处理 | 疟疾 | 显微镜、单细胞RNA测序、遗传筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5242 | 2026-04-13 |
Comprehensive multi-omics analyses reveal small intestinal genetic mechanisms regulating milk protein trait in yak
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2026-28364
PMID:41966396
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研究论文 | 本研究通过构建首个牦牛小肠单细胞转录组图谱,并结合多组学分析,揭示了小肠功能特化及其相关基因调控牦牛乳高蛋白含量的遗传机制 | 首次构建了牦牛小肠的单细胞转录组图谱,并开发了一个整合基因组学和scRNA-seq数据的多策略GWAS框架来鉴定与乳蛋白含量相关的候选基因 | NA | 探究牦牛乳高蛋白含量的生物学基础,特别是小肠的调控机制 | 牦牛、犏牛和奶牛的生乳营养成分、氨基酸组成,以及牦牛小肠细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | 转录组数据,基因组数据 | 从小肠组织中共获得27,026个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5243 | 2026-04-13 |
Spatial metabolomics and transcriptomics reveal the metabolic-immune niche associated with renal fibrosis in hyperuricemia
2026-Apr-06, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究通过整合空间代谢组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了高尿酸血症肾病中与肾纤维化相关的代谢-免疫微环境 | 首次构建了高分辨率多组学图谱,阐明了代谢重塑与细胞间通讯的空间协调关系,并提出了缺氧依赖性成纤维细胞-巨噬细胞串扰的新机制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体样本中得到验证,且机制假设需要进一步实验证实 | 探究高尿酸血症肾病中代谢微环境与免疫-间质细胞相互作用的时空关系 | 高尿酸血症小鼠模型的肾脏组织 | 空间多组学 | 高尿酸血症肾病 | 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化分析 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 高尿酸血症小鼠模型肾脏组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5244 | 2026-04-13 |
PCSK9 promotes prostate cancer via facilitating intratumoral cholesterol accumulation and enhancing immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Apr-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.020
PMID:41951051
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研究论文 | 本研究揭示了PCSK9通过促进前列腺癌肿瘤内胆固醇积累和塑造免疫抑制微环境来驱动前列腺癌进展的新机制 | 首次阐明了PCSK9在前列腺癌中的促癌作用机制,发现了新的免疫抑制因子(Sig15IM、ABI3、CORO1A、CD53等)在塑造免疫抑制微环境中的关键作用,并证实了抗PCSK9抗体(evolocumab)的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,临床样本验证相对有限;免疫抑制因子在人类前列腺癌中的确切功能需要进一步验证 | 探究PCSK9在前列腺癌进展中的功能及其潜在分子机制 | 前列腺癌干细胞、原发性及转移性前列腺癌组织、基因工程小鼠模型(Pten-/-、TRAMP)、异种移植瘤模型、LNCaP细胞系 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个独立前列腺癌人群(包括转移性和去势抵抗性前列腺癌)、8种其他癌症类型的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5245 | 2026-04-13 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies an EMT-Associated Prognostic Signature for Papillary Thyroid Cancer
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71766
PMID:41957879
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习分析,识别了与上皮-间质转化相关的八个预后基因,并构建了用于甲状腺乳头状癌预后评估的风险模型 | 首次将单细胞RNA测序与101种机器学习算法组合相结合,系统识别甲状腺乳头状癌中与上皮-间质转化相关的预后基因,并构建了综合性的预后风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内实验和更大规模的前瞻性临床队列验证 | 探究甲状腺乳头状癌中上皮-间质转化的分子机制,并开发预后评估的生物标志物 | 甲状腺乳头状癌患者组织样本和正常甲状腺组织 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型和多种机器学习算法组合 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量,涉及内部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5246 | 2026-04-13 |
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014008
PMID:41838767
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研究论文 | 本文系统性地比较了半监督与无监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景下的性能 | 首次在真实条件下系统性地基准测试半监督单细胞RNA-seq整合方法,并考虑了多种不完美标签场景 | 研究仅基于六个数据集,且半监督方法在标签质量不确定时优势有限 | 评估半监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景中的性能和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | scANVI, ssSTACAS | 单细胞RNA-seq数据 | 六个多样化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5247 | 2026-04-13 |
BrainConnect: processing brain connectivity and spatial transcriptomics data for integrative analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag120
PMID:41808453
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研究论文 | 开发了一个名为BrainConnect的软件,用于处理小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据,以进行整合分析并预测连接强度 | 首次提出一个方法,将不同类型的大脑连接数据与空间转录组学数据在一致的大脑区域格式下处理,利用LSTM网络从空间转录组学预测连接强度,并识别潜在的重要基因 | 方法目前仅应用于小鼠大脑数据,未在其他物种或更广泛的数据集上验证 | 整合大脑连接数据和空间转录组学数据,以预测和理解大脑连接性及其分子基础 | 小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | LSTM | 空间转录组学数据和大脑连接数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5248 | 2026-04-13 |
Utilising Machine Learning and Single-Cell Analysis to Uncover SKCM Metastasis-Related Genes
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70061
PMID:41961982
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习,揭示了皮肤黑色素瘤转移相关的核心基因及其调控机制 | 创新性地构建了结合粒子群优化算法和支持向量机的二元分类模型(PSO-SVM),用于准确预测肿瘤转移,并整合单细胞与转录组数据进行多维度分析 | 未明确说明样本的具体数量及来源,模型在其他癌症中的泛化能力有待进一步验证 | 阐明皮肤黑色素瘤(SKCM)转移的核心分子机制,寻找早期诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 | 转移性皮肤黑色素瘤与原发性肿瘤细胞 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | PSO-SVM(粒子群优化-支持向量机) | 单细胞RNA测序数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5249 | 2026-04-12 |
Oxidative stress in neurodegeneration: from a simple insult to a dynamic regulator
2026-Dec-31, Redox report : communications in free radical research
IF:5.2Q1
DOI:10.1080/13510002.2026.2654906
PMID:41964111
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综述 | 本文综述了氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,将其重新定义为一种复杂的动态调控系统,并探讨了其分子机制及先进的抗氧化干预技术策略 | 将氧化应激重新定义为神经退行性疾病中一个复杂的动态调控系统,而非单一事件,并整合了亚细胞器靶向、纳米载体递送以及单细胞/空间组学等先进技术策略,为开发靶向和个性化治疗提供了新视角 | 本文是一篇综述,主要基于现有文献进行分析和整合,未报告新的原始实验数据或临床研究结果 | 评估氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,探索其动态调控特征、信号通路、分子机制以及先进的抗氧化干预技术策略 | 神经退行性疾病中的氧化应激过程及其调控 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞氧化还原组学,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 5250 | 2026-04-12 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNF-α promotes glioblastoma proliferation and migration via CP-mediated KLF10 upregulation
2026-Apr-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01859-3
PMID:41963569
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5251 | 2026-04-12 |
Super-enhancer-driven recruitment of C/EBPβ by SULT1B1 is implicated in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression
2026-Apr-10, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02121-0
PMID:41964026
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研究论文 | 本研究揭示了超级增强子驱动的H3K27ac/C/EBPβ/SULT1B1调控轴在代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)进展中的关键作用 | 首次在MASLD中鉴定出SULT1B1作为核心超级增强子相关基因,并阐明C/EBPβ通过H3K27ac修饰促进其转录的分子机制,同时通过单细胞分析将该调控轴定位于肝细胞 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类样本验证相对有限,且JQ1介导的超级增强子抑制在体内的长期疗效和安全性尚未评估 | 阐明超级增强子在MASLD发病机制中的调控作用 | 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 | 表观遗传学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | ChIP-Seq, RNA-Seq, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 组蛋白修饰分析 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据, 表观基因组学数据 | 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 5252 | 2026-04-12 |
Evaluating genetic ancestry inference from single-cell transcriptomic datasets
2026-Apr-09, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2026.100564
PMID:41508611
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研究论文 | 本文提出一个评估从单细胞转录组数据推断遗传祖先方法的框架,并应用于人类细胞图谱数据集 | 首次系统评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性,并揭示现有数据集中祖先代表性的不平衡问题 | 评估主要基于模拟数据和现有数据集,未涵盖所有可能的祖先群体和测序技术 | 评估和改进单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法,以促进遗传多样性研究和减少分析偏差 | 单细胞转录组测序数据中的遗传多态性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | ADMIXTURE等群体遗传学工具 | 测序reads中的遗传变异数据 | 来自10个人类细胞图谱数据集的401名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5253 | 2026-04-12 |
CIPHER-seq enables intracellular multimodal profiling of cytokine responses in single immune cells
2026-Apr-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44946-y
PMID:41951681
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CIPHER-seq的新方法,用于在单个免疫细胞中同时量化细胞内蛋白质和转录组,以解决单细胞RNA测序在预测蛋白质丰度方面的不足 | 开发了CIPHER-seq技术,首次实现了在单细胞水平上同时分析细胞内蛋白质和转录组,提供了五层分析能力,并在免疫细胞回收方面与商业协议相匹配,同时显著减少了线粒体应激信号 | NA | 开发一种能够同时量化细胞内蛋白质和转录组的技术,以改善单细胞RNA测序在预测蛋白质丰度方面的局限性 | 刺激后的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞内蛋白质分析 | NA | RNA序列数据,蛋白质丰度数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 5254 | 2026-04-12 |
Structure-preserving multivariate hypothesis testing for mass spectrometry imaging and single-cell data
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag137
PMID:41863333
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研究论文 | 本文介绍了一种名为block-SAM的结构保持多变量假设检验方法,用于处理质谱成像和单细胞RNA测序数据,以减少假阳性发现 | 提出block-SAM方法,考虑像素或细胞的嵌套样本结构,避免传统方法因忽略此结构而导致的样本量膨胀和假阳性增加问题 | 未明确讨论方法在极端数据分布或小样本情况下的性能,且主要针对特定数据类型(MSI和scRNA-seq) | 开发一种统计方法,以更准确地识别质谱成像和单细胞RNA测序数据中的差异特征,同时保留空间或细胞分辨率 | 质谱成像数据和单细胞RNA测序数据,包括肾脏、肺、卵巢肿瘤的DESI-MSI数据以及转移性肾细胞癌的scRNA-seq数据 | 生物信息学 | 肾癌、肺癌、卵巢癌 | 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | block-SAM(一种多变量假设检验方法) | 图像数据(质谱成像)、基因表达数据(单细胞RNA测序) | 未明确指定具体样本数量,但涉及多个肿瘤数据集和患者比较 | NA | 质谱成像(DESI-MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 5255 | 2026-04-12 |
AutoGERN: single-cell RNA-seq gene regulatory network inference via explicit link modeling and adaptive architectures
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag143
PMID:41871930
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研究论文 | 本文提出了AutoGERN,一种专为单细胞RNA测序数据设计的图神经网络框架,用于推断基因调控网络 | AutoGERN通过显式建模调控信息在消息传递空间中的表达,学习链接嵌入,并采用自适应架构搜索以适应不同数据集分布 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个能够从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络的图神经网络框架 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5256 | 2026-04-12 |
UBTF-HSP90A-MIF stress circuit drives lenvatinib resistance and immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.002
PMID:41946392
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞癌中UBTF/HSP90A/MIF调控环路介导乐伐替尼耐药和免疫排斥的分子机制 | 首次阐明UBTF/HSP90A/MIF应激环路在肝细胞癌乐伐替尼耐药和免疫微环境重塑中的核心作用,并验证MIF作为预测生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于临床前模型,临床验证队列样本量有限,需进一步大规模临床试验验证 | 阐明肝细胞癌中乐伐替尼-PD-1联合治疗的适应性耐药和免疫排斥机制 | 肝细胞癌细胞系、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及临床患者队列 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、启动子下拉实验、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测、邻近连接分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据、临床数据 | 配对乐伐替尼敏感和耐药HCC模型、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及独立临床队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5257 | 2026-04-12 |
Hh and EGFR-Ras signaling promote distinct steps of tumor progression in the Drosophila follicle epithelium
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70844-y
PMID:41876551
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与遗传学、成像分析,探究EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在果蝇滤泡干细胞谱系稳态中的作用 | 首次揭示Hedgehog信号同时维持未分化状态并通过激活Zfh1诱导分化,EGFR-Ras过激活通过Pointed和E2f1引起细胞周期缺陷,双通路共激活导致肿瘤样生长 | 研究基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性需进一步验证 | 探究EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在组织稳态和肿瘤发生中的作用机制 | 果蝇滤泡上皮干细胞谱系 | 发育生物学与肿瘤生物学 | 肿瘤发生 | 单细胞RNA-seq, 遗传学分析, 成像分析 | 果蝇遗传模型 | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5258 | 2026-04-12 |
Exploring single-cell and multi-omics technologies and their role in unraveling tumor heterogeneity of hepatocellular carcinoma
2026-Mar, Journal of liver cancer
DOI:10.17998/jlc.2025.11.29
PMID:41402037
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综述 | 本文综述了单细胞和多组学技术在揭示肝细胞癌肿瘤异质性方面的变革性作用 | 强调了单细胞和空间组学技术如何通过高分辨率分析肿瘤生态系统,重塑了HCC研究,并推动了生物标志物、治疗靶点和患者分层策略的发现 | 高成本、技术要求高以及在资源有限的环境中可及性差,是其广泛应用的主要障碍 | 探讨单细胞及多组学技术在解析肝细胞癌肿瘤异质性中的作用 | 肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、表观基因组学、多组学、空间转录组学 | NA | 单细胞测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5259 | 2026-04-12 |
Fibulin-7 in progenitor cells promotes adipose tissue fibrosis and disrupts metabolic homeostasis in obesity
2026-Mar-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf084
PMID:41128612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq技术,发现脂肪生成干细胞和祖细胞(ASPCs)中Fibulin-7(FBLN7)的表达上调会促进脂肪组织纤维化,并揭示了其通过稳定TSP1蛋白激活TGF-β信号通路的分子机制 | 首次在单细胞水平上识别出与细胞外基质功能密切相关的ASPCs亚群,并发现FBLN7是该亚群中在肥胖状态下显著上调的关键因子;阐明了FBLN7通过结合TSP1增强其稳定性,进而激活TGF-β信号通路促进纤维化的新机制;开发了能够显著缓解饮食诱导脂肪组织纤维化的抗FBLN7中和抗体 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的相关性分析仍需进一步验证;FBLN7在ASPCs中的特异性调控机制及其在其他组织纤维化中的作用尚未完全阐明;中和抗体的长期疗效和潜在副作用需要更多临床前研究 | 探究脂肪组织纤维化的细胞起源和分子机制,寻找改善肥胖相关代谢紊乱的潜在治疗靶点 | 小鼠脂肪生成干细胞和祖细胞(ASPCs)、肥胖小鼠模型、人类肥胖个体的内脏脂肪组织 | 单细胞组学 | 肥胖及相关代谢疾病 | 单细胞RNA-seq | 基因敲除小鼠模型、过表达模型 | 单细胞转录组数据、临床代谢表型数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及肥胖小鼠模型和人类肥胖个体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5260 | 2026-04-12 |
Single-cell transcriptomics reveals hair growth retardation mediated by aberrant connective tissue sheath contraction in male androgenetic alopecia
2026-Feb-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70153-4
PMID:41748637
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研究论文 | 本研究结合空间和单细胞转录组学,揭示了男性雄激素性脱发中毛囊微型化的细胞动态机制,并发现结缔组织鞘的异常收缩是关键驱动因素 | 首次通过单细胞和空间转录组学构建男性雄激素性脱发毛囊的单细胞图谱,揭示结缔组织鞘机械性收缩通过激活PIEZO1通道导致毛囊祖细胞凋亡和增殖抑制,从而驱动毛囊微型化,并证明ML-7药物干预可改善毛囊生长 | 研究主要基于男性雄激素性脱发模型,可能不适用于女性或其他类型脱发;体外器官培养和人源化小鼠模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明男性雄激素性脱发的发病机制,特别是毛囊微型化的细胞和分子驱动因素 | 男性雄激素性脱发患者的毛囊组织,包括毛囊干细胞、祖细胞和结缔组织鞘细胞 | 数字病理学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及男性雄激素性脱发患者来源的毛囊组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |