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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-02-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Biomarkers for NK Cell Dysfunction in Endometriosis-Associated Immune Dysregulation
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9028037
PMID:41640571
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了子宫内膜异位症中NK细胞功能障碍的生物标志物,并提出了GNLY、PRF1和ENTPD1作为潜在的分子诊断标志物 | 整合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,结合机器学习方法识别出三个关键基因,并发现ENTPD1在免疫调节和基质细胞迁移中的双重功能 | 样本量较小(仅3名患者和3个正常样本),且验证队列的AUC值在外部验证中有所下降 | 探究子宫内膜异位症中NK细胞功能障碍的生物标志物及其在免疫失调中的作用机制 | 子宫内膜异位症患者的病变组织和正常子宫内膜样本 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, 伤口愈合实验, Transwell实验 | LASSO, SVM-RFE | RNA测序数据, 基因表达数据 | 3名子宫内膜异位症患者的病变组织, 3个正常子宫内膜样本, 以及来自GEO的三个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 502 | 2026-02-06 |
VST-DAVis: an R Shiny application and web-browser for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag007
PMID:41640624
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研究论文 | 本文介绍了一个名为VST-DAVis的交互式R Shiny应用程序和网络浏览器,专为分析10x Genomics Visium HD平台生成的空间转录组学数据而设计 | 开发了一个用户友好的交互式工具,使无编程背景的研究者也能通过图形界面进行端到端的空间转录组学分析,并整合了多种流行的R分析包 | NA | 为空间转录组学数据分析提供一个直观、易用的分析平台 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Genomics Visium HD平台 |
| 503 | 2026-02-06 |
Engineering scalable vascularized kidney organoids for in vivo glomerular filtration with human endothelial integration
2026, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00063-5
PMID:41640674
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研究论文 | 本文开发了一种可扩展的血管化肾脏类器官生产方法,用于体内肾小球滤过功能研究 | 通过动态培养环境和三角翼搅拌生物反应器,将血管化肾脏类器官的生产效率提高了50倍以上,并实现了人类内皮细胞整合的肾小球滤过功能 | NA | 开发可扩展的血管化肾脏类器官生产系统,用于肾脏疾病模型和再生医学应用 | 人类多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 组织工程与再生医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2026-02-06 |
Single-cell RNA sequencing revealed cell heterogeneity in sagittal suture mesenchyme
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1725375
PMID:41640972
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研究论文 | 本研究通过整合10x Genomics和Smart-seq3单细胞转录组测序技术,首次识别了矢状缝间充质中的增殖性祖细胞群,揭示了其在颅骨快速发育中的关键作用 | 首次在发育中的颅缝生态位中识别出具有瞬时扩增细胞特征的增殖性祖细胞群,并阐明了SuSCs和TACs中的关键调控基因和信号网络 | NA | 探索颅缝间充质中细胞异质性及其在颅骨发育和稳态维持中的作用机制 | 矢状缝间充质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷检测, 原位杂交, 谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Smart-seq3 | 10x Genomics单细胞转录组测序与Smart-seq3技术整合 |
| 505 | 2026-02-06 |
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0009
PMID:41641368
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白TIMELESS通过招募CNOT3加速转铁蛋白mRNA降解,从而抑制铁死亡并促进肺腺癌生长,并重塑肿瘤微环境以抵抗抗PD-1免疫治疗的分子机制 | 首次发现TIMELESS通过招募CNOT3复合物降解转铁蛋白mRNA来调控铁死亡,并阐明了其在肺腺癌生长和抗PD-1免疫治疗抵抗中的双重作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限;TIMELESS/TF轴在其他癌症类型中的普适性未探讨 | 阐明高表达的RNA结合蛋白TIMELESS在肺腺癌进展中的分子网络和机制作用 | 肺腺癌细胞、小鼠原位肺癌模型、临床组织微阵列样本 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | PAR-CLIP测序, RNA测序, 免疫沉淀-质谱, GST pull-down, 免疫荧光-荧光原位杂交, RNA免疫沉淀, poly(A)尾分析, RNA稳定性检测, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质互作数据, 组织图像数据 | 来自TCGA-LUAD、GEO和单细胞RNA测序数据集的多个数据集,以及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2026-02-06 |
Research Progress of Interstitial Lung Disease Based on Single-Cell Sequencing Technology
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/8863968
PMID:41641446
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综述 | 本文总结了基于单细胞测序技术在间质性肺病(ILD)研究中的最新进展,重点聚焦于特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD | 利用单细胞测序技术为揭示ILD的复杂发病机制提供了新视角,克服了传统研究方法的局限 | NA | 总结单细胞测序在ILD研究中的应用进展并展望未来研究方向 | 间质性肺病(ILD),包括特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 507 | 2026-02-05 |
An AI-assisted designed supramolecularly engineered nanoplatform reverses pigmentation by triggering an ineffective compensatory melanin production program
2026-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.01.027
PMID:41625493
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研究论文 | 本研究利用AI辅助计算筛选和超分子工程策略,构建了一种用于治疗皮肤色素沉着过度的双组装纳米系统,并揭示了其通过触发无效的代偿性黑色素生成程序来逆转色素沉着的机制 | 采用AI辅助计算模型筛选分子伴侣,结合分层超分子工程策略构建稳定的混合纳米平台,并首次通过单细胞转录组学揭示了药物通过加速黑素体降解引发无效转录激活的“功能抑制”新机制 | 未明确说明动物模型的具体类型和数量,临床前研究阶段尚未涉及人体试验 | 开发用于治疗皮肤色素沉着过度的新型纳米药物递送系统,并阐明其作用机制 | 黑色素细胞、皮肤免疫微环境 | 机器学习 | 皮肤色素沉着过度 | 单细胞转录组学、AI辅助计算筛选 | AI辅助计算筛选模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-02-05 |
Apolipoprotein E knockout attenuates vascular graft fibrosis by reducing profibrotic macrophage formation through low-density lipoprotein receptor related protein 1
2026-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.01.029
PMID:41625498
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研究论文 | 本研究揭示了载脂蛋白E(APOE)通过低密度脂蛋白受体相关蛋白1(LRP1)促进促纤维化巨噬细胞形成,进而通过分泌胰岛素样生长因子-1(IGF-1)介导血管移植物纤维化的机制 | 首次发现APOE在血管移植物纤维化中的关键作用,并阐明其通过LRP1调控促纤维化巨噬细胞形成及IGF-1分泌的新机制 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体血管移植物中进行验证;AAV介导的APOE敲低治疗的长期安全性和有效性需进一步评估 | 探究血管移植物纤维化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠主动脉移植物模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 509 | 2026-02-05 |
Repeated proliferative events ameliorate age-associated accumulation of DNA damage in HSPCs
2026-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503337
PMID:41611449
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研究论文 | 本研究探讨了增加造血干细胞和祖细胞(HSPCs)增殖率对造血衰老的影响,发现重复放血可清除DNA损伤而不影响HSPCs功能 | 首次证明通过重复放血(模拟临床献血)诱导HSPCs增殖,可在体内激活DNA损伤反应并减少年龄相关的双链断裂积累 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自scRNA-Seq分析,需进一步临床验证;未明确DNA损伤清除的具体分子机制 | 探究增殖事件对造血干细胞年龄相关DNA损伤积累的影响 | 小鼠和人类的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2026-02-05 |
Single-cell RNA-seq data of wild type and fli1b mutant zebrafish embryos
2026-Apr, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2026.112459
PMID:41624301
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研究论文 | 本文提供了野生型和fli1b突变斑马鱼胚胎在受精后24小时的单细胞RNA测序数据,用于研究血管和造血发育的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术比较野生型和fli1b突变斑马鱼胚胎的转录组,识别出34个不同的细胞簇,为血管和造血发育研究提供了新的数据资源 | 研究仅基于24小时时间点的胚胎样本,未涵盖其他发育阶段;样本量相对较小(约40个胚胎),可能影响统计效力 | 研究fli1b转录因子在斑马鱼血管和造血发育中的作用,并提供单细胞转录组数据以支持相关分子机制分析 | 野生型和母体合子fli1b突变斑马鱼胚胎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 约40个母体合子fli1b突变胚胎和野生型同胞胚胎 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium平台用于单细胞RNA测序 |
| 511 | 2026-02-05 |
Spatial transcriptomics: challenges and future directions in musculoskeletal diseases
2026-Mar-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001140
PMID:41263435
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综述 | 本文综述了空间转录组学在肌肉骨骼疾病研究中的最新进展、挑战及未来方向 | 探讨空间转录组学如何革新肌肉骨骼疾病研究,通过原位基因表达分析揭示组织内细胞的空间转录组异质性 | 空间转录组学在肌肉骨骼组织应用中面临广泛推广的挑战,具体限制未详细说明 | 旨在总结空间转录组学在揭示肌肉骨骼疾病分子机制中的作用,并讨论其应用挑战与未来改进机会 | 肌肉骨骼系统及其相关疾病 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 512 | 2026-02-05 |
Multi-omics mapping identifies CYBA-mediated mitochondrial dysfunction driving macrophage polarization and ferroptosis via Nrf2 pathway in atherosclerosis
2026-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0303714
PMID:41624806
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CYBA通过抑制Nrf2通路介导的抗氧化反应,导致线粒体功能障碍,从而驱动巨噬细胞向促炎表型极化和铁死亡,促进动脉粥样硬化斑块形成 | 首次将CYBA鉴定为连接线粒体功能障碍与巨噬细胞表型改变及铁死亡的关键氧化应激调节因子,并阐明了其通过抑制Nrf2通路发挥作用的分子机制 | 研究主要基于细胞模型(THP-1巨噬细胞)和ApoE小鼠模型,尚未在人体组织或临床样本中得到验证 | 探究CYBA在动脉粥样硬化中如何通过调控线粒体功能影响巨噬细胞表型极化和铁死亡 | THP-1巨噬细胞、ApoE基因敲除小鼠、动脉粥样硬化斑块 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 多组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、免疫荧光 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 细胞模型(THP-1巨噬细胞)和动物模型(ApoE小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-02-05 |
Identification of factors conferring resistance to trastuzumab deruxtecan in advanced gastric cancer: a translational study from the single-arm, phase II, DESTINY-Gastric06 trial
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf038
PMID:41625230
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了晚期胃癌中曲妥珠单抗德鲁替康(T-DXd)的原发性和获得性耐药机制 | 首次在单细胞水平上系统揭示了T-DXd在胃癌中的耐药机制,并识别了MUC3A和胱抑素C等关键生物标志物 | 研究样本来源于单臂II期临床试验,样本量可能有限,且为观察性研究,需要进一步功能验证 | 阐明胃癌对T-DXd的原发性和获得性耐药机制 | 胃癌肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,免疫组化,功能实验 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),CellChat细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 来自DESTINY-Gastric06试验的胃癌肿瘤组织样本(包括初治基线样本及耐药样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 514 | 2026-02-05 |
IRF7 orchestrates maladaptive smooth muscle cell phenotype switching in atherosclerosis
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf039
PMID:41625231
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研究论文 | 本研究揭示了干扰素调节因子7(IRF7)是调控动脉粥样硬化中平滑肌细胞向促炎性巨噬细胞样状态转分化的关键转录调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析和基因调控网络推断,将IRF7确定为驱动平滑肌细胞向特定致病性巨噬细胞样亚群(macrophage 4)转分化的主调控因子,并利用体内实验验证了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据的计算分析,在人体中的直接功能验证和具体分子通路细节仍需进一步探索 | 探究动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞表型转换的分子驱动机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞及其转分化产生的巨噬细胞样细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,轨迹分析,基因调控网络推断,计算机扰动建模,体内基因敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 谱系示踪小鼠的主动脉斑块组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2026-02-05 |
Targeting Piezo1 can improve endometrial fibrosis by inhibiting ferroptosis in endothelial cells
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114540
PMID:41623492
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠宫腔粘连模型,首次揭示基质硬度通过激活Piezo1诱导子宫内膜内皮细胞铁死亡,进而导致子宫内膜纤维化,并证实靶向Piezo1可改善纤维化 | 首次在宫腔粘连中发现子宫内膜内皮细胞显著减少并伴随Piezo1表达上调,首次阐明基质硬度-Piezo1-铁死亡轴在子宫内膜纤维化中的机制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体组织中验证;GsMTx4的治疗效果需进一步临床转化研究 | 探究宫腔粘连中子宫内膜纤维化的分子机制并寻找治疗靶点 | 小鼠宫腔粘连模型中的子宫内膜组织,特别是内皮细胞 | 单细胞组学 | 妇科疾病(宫腔粘连) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠宫腔粘连模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2026-02-05 |
PRDX6 as a Ferroptosis-Related Hub Gene in the Entorhinal Cortex of Alzheimer's Disease: A Multidimensional Bioinformatics and Experimental Validation Study
2026-Feb-04, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02482-4
PMID:41634496
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研究论文 | 本研究通过多维生物信息学分析和实验验证,识别了PRDX6作为阿尔茨海默病内嗅皮层中与铁死亡相关的枢纽基因,并评估了其诊断和治疗潜力 | 首次将PRDX6确立为连接铁死亡、免疫细胞动态和AD神经病理学的关键介导因子,为AD诊断和治疗提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型,需要进一步在体内模型和临床样本中进行验证 | 识别并验证阿尔茨海默病内嗅皮层中与铁死亡相关的枢纽基因,探索其诊断和治疗潜力 | 阿尔茨海默病患者的内嗅皮层组织、Aβ诱导的U251星形胶质细胞模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、Western blot、机器学习 | LASSO、随机森林 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个GEO数据集(GSE138852、GSE5281、GSE48350、GSE118553) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 517 | 2026-02-05 |
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag019
PMID:41634919
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研究论文 | 本研究结合功能ADCC实验与单细胞转录组学,揭示了COVID-19患者自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性的分子决定因素 | 首次通过单细胞转录组学揭示ADCC反应差异的转录程序,发现干扰素刺激基因和NKG2D的关键作用,并提出了抗体介导ADCC能力与干扰素激活水平负相关的调控检查点机制 | 研究样本仅来自COVID-19参与者,未验证其他病毒感染模型;单细胞转录组学为观察性研究,需要后续功能实验验证机制 | 阐明自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性的内在分子机制及其在抗病毒免疫中的作用 | COVID-19患者的自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | COVID-19参与者的外周自然杀伤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 518 | 2026-02-05 |
Exacerbated salmonellosis in poly(ADP-ribose) polymerase 14-deficient mice
2026-Feb-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02971-25
PMID:41468544
|
研究论文 | 本研究探讨了PARP14在小鼠沙门氏菌感染模型中的作用,发现PARP14缺失会加剧肠道炎症并影响Th17反应和上皮细胞转录组 | 首次揭示了PARP14在沙门氏菌感染中的多细胞类型调节作用,特别是在上皮细胞中的功能及其对黏膜炎症的调控 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且分子机制细节仍需进一步探索 | 探究PARP14在沙门氏菌感染过程中的功能及其对黏膜炎症的调节机制 | 小鼠模型中的沙门氏菌感染,重点关注肠道组织(小肠、盲肠、大肠)的免疫细胞和上皮细胞 | 分子生物学与免疫学 | 沙门氏菌感染 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, TaqMan qPCR, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 使用Parp14缺陷小鼠进行感染实验,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-02-05 |
Landscape of microRNA and target expression variation and covariation in single mouse embryonic stem cells
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279914.124
PMID:41526192
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研究论文 | 本研究通过遗传扰动和多组学方法,系统探讨了小鼠胚胎干细胞中microRNA的替代功能及其对靶基因表达变异和共变的影响 | 首次在单细胞水平上提供了microRNA动力学的全局视图,揭示了microRNA形成四个不同的共表达组,并发现某些microRNA如miR-182具有相反功能 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞,未在其他细胞类型或生物体中验证,且依赖于遗传删除特定microRNA的方法 | 系统研究microRNA在小鼠胚胎干细胞中的替代功能,包括对靶基因表达变异和共变的影响 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs)中的microRNA及其靶基因 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq、转录抑制 | NA | RNA序列数据 | 单细胞水平的小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 520 | 2026-02-05 |
scSHEFT enables multiomics label transfer from scRNA-seq to scATAC-seq through dual alignment
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280410.125
PMID:41558828
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研究论文 | 本文提出了一种新的标签转移工具scSHEFT,用于从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据转移多组学标签 | scSHEFT通过同时考虑基因表达计数数据、峰值计数数据和基因活性分数作为输入,并采用双重对齐策略来桥接异质特征之间的差距 | NA | 开发一种能够从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据有效转移多组学标签的工具 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达计数数据, 峰值计数数据, 基因活性分数 | 七个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |