单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 481 - 500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-02-06
Mapping clinical CAR-T cells: insights from scRNA-seq
2026-Jan-15, Trends in molecular medicine IF:12.8Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术分析临床CAR-T细胞的研究,重点关注T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性及细胞因子等特征 首次系统性地总结了已发表的利用scRNA-seq分析临床CAR-T细胞的研究,并整合了其在T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性及细胞因子等多个维度的发现 作为一篇综述文章,其局限性在于未提供新的实验数据,且依赖于现有已发表研究的质量和覆盖范围 总结和评估单细胞RNA测序在临床CAR-T细胞研究中的应用、发现及未来方向 临床CAR-T细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
482 2026-02-06
Impaired Mitophagy-Induced Apoptosis of Gingival Fibroblasts Exacerbates Diabetic Periodontitis Via THBS-1/CD36-Dependent Macrophage Activation
2026-Jan-14, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究揭示了糖尿病牙周炎中牙龈成纤维细胞线粒体自噬受损导致凋亡,并通过THBS-1/CD36轴激活巨噬细胞,加剧炎症和组织破坏的机制 首次通过单细胞测序分析发现糖尿病牙龈组织中牙龈成纤维细胞的凋亡激活与线粒体失调密切相关,并阐明了THBS-1/CD36依赖的巨噬细胞激活新通路 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且THBS-1/CD36轴在其他细胞类型中的作用未充分探索 探究高血糖如何通过线粒体功能障碍和细胞间通讯加剧糖尿病牙周炎的炎症反应 糖尿病牙周炎患者的牙龈组织、牙龈成纤维细胞和巨噬细胞 NA 糖尿病牙周炎 单细胞测序、分子建模、基因沉默 NA 单细胞测序数据、分子相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
483 2026-02-06
Unveiling a novel function of Aconitase-2: attenuating lung ischemia-reperfusion injury via inhibition of pulmonary endothelial apoptosis
2026-Jan-12, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本文揭示了Aconitase-2(ACO2)通过抑制肺内皮细胞凋亡来减轻肺缺血再灌注损伤的新功能 发现了ACO2在肺缺血再灌注损伤中的新功能,即通过增强线粒体功能来抑制内皮细胞凋亡,并验证了其下游代谢物4-OI的缓解作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床样本量相对有限,需要进一步在更大规模人群中验证 探究ACO2在肺缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗潜力 小鼠肺缺血再灌注模型、原代肺血管内皮细胞、健康供体和LIRI患者临床队列 NA 肺缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA RNA测序数据、临床数据 小鼠模型、原代肺血管内皮细胞、65名健康供体和48名LIRI患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
484 2026-02-06
Molecular characterization of directly reprogrammed neurons from human fibroblasts using single cell RNA sequencing
2026-Jan-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了通过PTBP1敲降从人皮肤成纤维细胞直接重编程为神经元的分子特征和细胞异质性 首次在人类细胞中应用单细胞RNA测序技术系统解析直接神经元重编程过程中的细胞异质性和分子转变轨迹,并开发了适用于单样本数据的统计稳健性分析框架 研究仅基于单个时间点(第14天)的样本进行分析,未涵盖重编程全过程的动态变化 探究人类成纤维细胞直接重编程为神经元的分子机制和细胞状态转变 经过PTBP1敲降处理的人皮肤成纤维细胞及其重编程产生的神经元 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 第14天处理后的单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
485 2026-02-06
Boron neutron capture therapy preserves immune cells and induces robust anti-tumour immunity in preclinical mouse model
2026-Jan-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究比较了硼中子俘获疗法与X射线照射对免疫细胞的影响,揭示了BNCT通过诱导免疫原性肿瘤细胞死亡和重塑肿瘤微环境来增强抗肿瘤免疫的机制 首次在临床前模型中系统比较BNCT与传统X射线放疗对免疫系统的差异影响,并利用单细胞RNA测序技术解析BNCT重塑肿瘤微环境的机制 研究仅基于小鼠肿瘤模型,尚未在人体中进行验证;BNCT的长期免疫效应仍需进一步探索 探究硼中子俘获疗法的免疫学机制及其与传统放疗的差异 小鼠肿瘤模型中的免疫细胞和肿瘤微环境 肿瘤免疫学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
486 2026-02-06
Spatial information matters: are traditional imputation methods effective for spatial transcriptomics data?
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文系统评估了七种先进的插补方法在五种新兴空间转录组学平台上的表现,并提出了一种结合空间信息的新方法SpaMean-Impute以更有效地处理丢失值 首次系统评估了现有先进插补方法在新型空间转录组学技术数据上的表现,并提出了一种专门针对空间转录组学数据、结合空间信息的新插补方法SpaMean-Impute,该方法在多项评估指标上优于现有方法且计算效率更高 研究主要基于23个数据集进行评估,可能未覆盖所有类型的空间转录组学数据;新方法SpaMean-Impute虽然表现优异,但其在不同生物学场景中的普适性仍需进一步验证 评估现有插补方法在空间转录组学数据上的有效性,并开发一种专门针对此类数据的新插补方法 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 NA 空间转录组学数据 23个数据集 NA 空间转录组学 NA 五种新兴空间转录组学平台
487 2026-02-06
PathCLAST: pathway-augmented contrastive learning with attention for interpretable spatial transcriptomics
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出PathCLAST框架,通过整合基因表达、病理图像和通路图进行双模态对比学习,实现可解释的空间转录组学分析 首次结合通路结构和空间匹配的病理学图像,通过双模态对比学习实现准确且生物学可解释的空间域识别 未在摘要中明确提及 开发可解释的空间转录组学方法,以理解肿瘤进化和微环境相互作用 空间转录组学数据,包括基因表达、病理图像和通路图 数字病理学 肿瘤 空间转录组学 对比学习,注意力机制 基因表达数据,病理图像,通路图 多个公共数据集,具体样本数量未在摘要中提及 NA 空间转录组学 NA NA
488 2026-02-06
sc-eQTL unveil immunogenetic architecture of polycystic ovary syndrome
2026-Jan-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合GWAS数据和多种免疫细胞的单细胞表达数量性状位点分析,揭示了多囊卵巢综合征在细胞水平的遗传和免疫机制 首次在单细胞分辨率下系统解析PCOS的免疫遗传结构,识别出被批量eQTL分析掩盖的T细胞亚群和NK细胞特异性因果基因 研究主要基于已有数据集的二次分析,缺乏实验验证;样本来源和种群特异性可能影响结果普适性 阐明多囊卵巢综合征的遗传基础和免疫细胞特异性机制 多囊卵巢综合征患者相关的遗传变异和免疫细胞 计算生物学 多囊卵巢综合征 全基因组关联研究,单细胞表达数量性状位点分析,单细胞RNA测序 统计遗传学模型,共定位分析 基因组数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
489 2026-02-06
Novel insights into meningioma brain invasion with spatial transcriptomic profiling
2026-Jan-04, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探究脑膜瘤脑侵袭的分子特征,重点关注肿瘤细胞和免疫细胞在脑-瘤边界的基因表达变化 首次应用空间转录组学分析脑膜瘤脑侵袭的分子机制,揭示了KRT18、CSF1R等关键基因在侵袭过程中的空间特异性表达模式 样本量较小(16例肿瘤),需要更大规模研究验证发现;空间转录组学分辨率有限,无法达到单细胞水平 探究脑膜瘤脑侵袭的分子机制及其与预后的关系 脑膜瘤患者肿瘤组织(包括侵袭性和非侵袭性病例) 数字病理学 脑膜瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 16例脑膜瘤肿瘤(8例侵袭性,8例非侵袭性) NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiling NanoString GeoMx数字空间分析平台,使用1800基因panel
490 2026-01-04
Exploring molecular mechanisms of radioactive iodine therapy in thyroid cancer using single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-03, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
491 2026-02-06
Integrated experimental and computational workflows for single-cell transcriptomics in plants
2026-Jan-03, Plant methods IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过系统性地基准测试玉米中的批量与单细胞转录组工作流程,建立了一个优化的集成框架,以解决植物单细胞转录组学中的组织制备、核分离和转录组质量挑战 开发了改进的批量RNA-seq协议作为单细胞数据集的参考,比较了原生质体、新鲜核和冷冻核三种输入类型在组织中的转录组谱可比性,并利用批量RNA-seq提供额外生物背景以验证单细胞分析结果 所有实验数据均来自玉米,可能限制了在其他植物物种中的直接适用性 优化植物单细胞转录组学的实验和计算工作流程,以解决细胞异质性解析中的挑战 玉米组织中的细胞类型,包括原生质体、新鲜核和冷冻核 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
492 2026-02-06
Comprehensive profiling of lactylation-associated genes in pulmonary hypertension through bulk and single-cell RNA sequencing integration
2026-Jan-03, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,全面分析了肺动脉高压中乳酰化相关基因,并鉴定出LCP1作为核心诊断标志物 首次在肺动脉高压中整合bulk和单细胞RNA测序数据来系统研究乳酰化相关基因,并揭示了免疫细胞中的乳酰化水平变化 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏更深入的体内功能验证 探究乳酰化在肺动脉高压发生发展中的作用及其分子机制 肺动脉高压患者和对照组的bulk RNA-seq及单细胞RNA-seq数据,以及缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞 生物信息学 肺动脉高压 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR, western blot NA RNA测序数据, 基因表达数据 来自多个数据集(GSE113439, GSE186996, GSE210248)的肺动脉高压患者和对照组样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
493 2026-02-06
SLPI⁺ AT2-Like Cells Orchestrate Lung Adenocarcinoma Invasion via Wnt Pathway Activation and Stromal Crosstalk in a Spatially Defined Margin Niche
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了肺腺癌侵袭前沿中一种表达SLPI的AT2样细胞亚群及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用机制 首次在肺腺癌侵袭边缘鉴定出表达SLPI的AT2样细胞亚群,并阐明了其通过Wnt通路激活和与基质细胞(如MRC1+巨噬细胞和肌成纤维细胞)的空间协同作用驱动肿瘤侵袭的机制 研究主要基于转录组学数据,功能验证和体内实验可能有限,且样本来源和数量未在摘要中明确说明 探究肺腺癌侵袭过程中的关键细胞类型、空间分布及其功能相互作用 肺腺癌肿瘤组织,重点关注侵袭边缘的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞 数字病理学 肺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
494 2026-02-06
TMEM131-Mediated Soluble TRAIL Triggered Type II Alveolar Epithelial Cell Senescence in Radiation-Induced Lung Injury
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了TMEM131介导的可溶性TRAIL通过抑制线粒体自噬导致II型肺泡上皮细胞衰老,在辐射诱导的肺损伤发病机制中起关键作用 首次发现TMEM131介导TRAIL从内质网向高尔基体的运输过程,并阐明可溶性TRAIL通过死亡受体5激活mTOR通路抑制线粒体自噬的新机制 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限;TMEM131介导的运输机制在人体中的普适性需进一步验证 阐明辐射诱导肺损伤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 辐射诱导肺损伤小鼠模型、II型肺泡上皮细胞、临床患者血浆样本 单细胞组学 肺损伤 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 免疫沉淀质谱 基因敲除小鼠模型 (Trail;Sftpc-Cre) 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 免疫荧光图像 未明确样本数量,包含小鼠模型和临床患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
495 2026-02-06
Retinoic Acid Reprograms Mast Cells Toward a Proinflammatory State to Enhance Antitumor Immunity
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了肥大细胞在肿瘤微环境中的异质性,并发现视黄酸信号可驱动肥大细胞向促炎表型极化,从而增强抗肿瘤免疫 首次系统性地描绘了十种癌症类型中肥大细胞的转录和空间异质性图谱,并鉴定出一个具有抗原呈递特征和免疫激活潜能的促炎性肥大细胞亚群,揭示了视黄酸-RARα-CIITA信号轴在肥大细胞重编程中的关键作用 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制细节仍需进一步实验确认;临床相关性分析为观察性结果,需前瞻性研究验证 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的分子特征、功能多样性及其对抗肿瘤免疫的调控机制 十种人类癌症类型中的肥大细胞 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 十种癌症类型的样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
496 2026-02-06
High-Dimensional Profiling of Circulating Dendritic Cells and Monocytes in Atopic Dermatitis Patients by Mass Cytometry
2026-Jan, Allergy, asthma & immunology research
研究论文 本研究通过质谱流式细胞术分析了特应性皮炎患者外周血中树突状细胞和单核细胞的高维特征,揭示了cDC1频率降低和DC3特征增强的现象 首次利用质谱流式细胞术系统比较特应性皮炎患者与健康对照的循环树突状细胞和单核细胞亚群,并结合公共单细胞RNA测序数据和皮肤免疫荧光染色进行验证 样本量相对有限(48例患者和48例对照),且为横断面研究,无法确定因果关系 探究特应性皮炎中髓系细胞(特别是树突状细胞和单核细胞)在疾病发病机制中的作用 特应性皮炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞,以及公共单细胞RNA测序数据和皮肤组织样本 免疫学 特应性皮炎 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA 细胞计数数据,基因表达数据,图像数据 48例特应性皮炎患者和48例健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
497 2026-02-06
Targeting SH3GL1 for prognosis and immune response in breast cancer
2026-Jan, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究识别了铜死亡相关基因SH3GL1作为乳腺癌进展和免疫调控的关键调节因子 首次将SH3GL1与乳腺癌的铜死亡过程、免疫微环境及免疫治疗反应联系起来,揭示了其在预后和免疫调节中的双重作用 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏大规模临床队列验证和体内机制研究 探索SH3GL1在乳腺癌中的预后价值和免疫调控功能 乳腺癌肿瘤组织和细胞 生物信息学 乳腺癌 基因表达谱分析、meta分析、单细胞RNA测序、功能实验 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
498 2026-02-06
Advances in the diagnosis and treatment of oligoasthenozoospermia based on epigenetic regulation
2026 Jan-Dec, Therapeutic advances in urology IF:2.6Q2
综述 本文综述了基于表观遗传调控的少弱精子症诊断与治疗进展 整合基因组学、转录组学和单细胞研究,阐明DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA在少弱精子症中的作用,并评估单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序及整合多组学方法在解析细胞类型和阶段特异性调控中的应用 NA 提高对男性生殖细胞发育的理解,并改善生殖健康 少弱精子症患者及其表观遗传调控机制 生殖医学 男性不育症 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 整合多组学 NA 基因组, 转录组, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 NA NA
499 2026-02-06
Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for the treatment of chronic active Epstein-Barr virus infection
2026 Jan-Dec, Cell transplantation IF:3.2Q2
综述 本文综述了异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)治疗慢性活动性EB病毒感染(CAEBV)的现状、理论基础、临床挑战及未来研究方向 整合了最新的单细胞测序和嵌合体研究证据,明确了EBV感染的造血干细胞是CAEBV的“种子”细胞,并基于此系统论证了allo-HSCT作为唯一可能根治性策略的理论依据,同时前瞻性地提出了“移植前病毒载量降低-移植后复发预防”的综合策略新思路 本文是一篇综述,未报告原始临床研究数据,其结论和建议主要基于对现有文献的总结和分析 探讨异基因造血干细胞移植作为慢性活动性EB病毒感染潜在根治性治疗策略的有效性、挑战及未来优化方向 慢性活动性EB病毒感染(CAEBV)患者 NA 慢性活动性EB病毒感染 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
500 2026-02-06
Single cell RNA sequencing analysis and molecular biology experiments identify NAFLD-related fibroblasts and highlights seven hub genes in NAFLD
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结合分子生物学实验,识别了与非酒精性脂肪肝病相关的成纤维细胞亚群,并鉴定了七个关键基因 利用单细胞RNA测序数据识别NAFLD特异性成纤维细胞亚群,并结合多种机器学习方法筛选出七个与NAFLD发病机制相关的关键基因 研究基于公开数据集GSE182365,样本量可能有限,且湿实验验证主要在模型中进行,需进一步临床验证 探索NAFLD进展的潜在机制,识别与疾病相关的成纤维细胞亚群和关键基因 健康与NAFLD患者的肝脏样本 数字病理学 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序,机器学习算法,湿实验验证 高维加权基因共表达网络分析,七种机器学习方法 单细胞RNA测序数据 来自GSE182365数据集的健康与NAFLD患者肝脏样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部