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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4961 | 2026-04-24 |
Integrated profiling of RUNX3 in intratumoral NK cells activity through bulk and single-cell transcriptomic analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1787302
PMID:42023209
|
研究论文 | 通过整体和单细胞转录组分析,探究RUNX3在肿瘤内NK细胞活性中的综合作用 | 首次揭示RUNX3在肿瘤微环境中对NK细胞功能的调控作用,并利用单细胞RNA测序分析其表达与分化的关系 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内模型验证,且样本量有限 | 阐明RUNX3在NK细胞介导的抗肿瘤免疫中的生物学作用 | RUNX3基因、NK细胞、肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌, 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用TCGA数据库的泛癌样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 整体RNA测序 | NA | NA |
| 4962 | 2026-04-24 |
Single cell transcriptomics reveals dendritic cell subsets in bovine afferent lymph and immune cell-resolved responses to BCG vaccination
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1764014
PMID:42023217
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示牛传入淋巴树突状细胞亚群及其对BCG疫苗接种的免疫细胞响应 | 首次在牛模型中通过单细胞转录组学系统解析传入淋巴树突状细胞(ALDC)的亚群(cDC1和cDC2)及其对BCG疫苗接种的差异化响应,揭示了亚群特异性基因功能 | 样本量较小(3头牛),且仅关注皮肤引流淋巴结的ALDCs,未涉及其他组织或长期免疫应答 | 探究BCG疫苗接种后牛树突状细胞亚群的转录组变化及其在抗结核免疫中的作用 | 牛传入淋巴树突状细胞(ALDCs)及其他免疫细胞(单核细胞、T细胞、B细胞、NK细胞) | 单细胞转录组学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3头牛,共20,761个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 4963 | 2026-04-24 |
Integrating bulk, single-cell, and spatial transcriptomics to identify a novel pyroptosis-related gene signature for predicting prognosis and tumor immune landscape in triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743222
PMID:42023218
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研究论文 | 通过整合批量、单细胞和空间转录组学数据,构建一种新的焦亡相关基因特征,用于预测三阴性乳腺癌的预后和肿瘤免疫景观 | 首次结合多组学数据(批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学)全面识别三阴性乳腺癌中的焦亡相关基因,并构建预后特征,揭示了这些基因在肿瘤免疫微环境中的细胞和空间异质性 | 未提及 | 开发一种可靠的焦亡相关基因预后特征,用于预测三阴性乳腺癌的预后和免疫景观 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化 | LASSO算法 | 转录组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 48个临床三阴性乳腺癌样本 | Illumina | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | TCGA和GEO数据库中的转录组数据,单细胞RNA测序和空间转录组学平台未明确指定 |
| 4964 | 2026-04-24 |
Acylation modification mediated post-translational modifications learning signature reveals ZDHHC18 promotes progression of lung adenocarcinoma by attenuating immunocyte activation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802631
PMID:42023227
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研究论文 | 该研究构建了酰化修饰(AM)学习签名AM.score,并发现ZDHHC18通过减弱免疫细胞激活促进肺腺癌进展 | 首次整合12种酰化修饰类型,利用多组学共识聚类和机器学习建立跨癌种免疫治疗预测评分系统,并验证ZDHHC18作为关键分子靶点的作用 | 具体机制尚未完全阐明,且需更多独立队列验证AM.score的临床适用性 | 探索酰化修饰相关的新型治疗途径,为肺腺癌精准治疗提供预测生物标志物 | 肺腺癌患者及免疫治疗队列,包括1720名患者和8个验证队列 | 机器学习 | 肺腺癌 | 多组学共识聚类、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学 | AM.score学习签名(基于机器学习算法) | 转录组数据、多组学数据、免疫治疗响应数据 | 1720名肺腺癌患者(主队列)及8个独立队列 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 4965 | 2026-04-24 |
Interferon regulatory factors: the next prospective targets for tissue ischemia-reperfusion injury?
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1782849
PMID:42023232
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综述 | 系统阐述干扰素调节因子(IRFs)在多系统和器官组织缺血再灌注损伤中的调控机制与研究进展,并提出了“动态调控网络”和“器官-IRF轴”两个创新理论框架 | 首次提出“动态调控网络”和“器官-IRF轴”两个理论框架,揭示了IRFs功能异质性的分子基础,并前瞻性地提出整合单细胞测序、类器官模型和人工智能预测的未来研究方向 | IRFs的潜在调控机制仍需进一步研究和阐明,且存在转化瓶颈的挑战 | 系统阐述IRFs及其相关通路在组织缺血再灌注损伤中的调控机制和研究进展,从病理生理学和分子生物学角度提供理论基础 | 干扰素调节因子(IRFs)家族及其在心血管系统、中枢神经系统、肾脏、肝脏和肠道等器官中的生物学功能 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4966 | 2026-04-24 |
Integrative analysis of transcriptomics, single-cell RNA sequencing, and GraphBAN identifies de novo lipogenesis-associated genes and their potential roles in diabetic retinopathy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1803639
PMID:42023244
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研究论文 | 整合转录组学、单细胞RNA测序和GraphBAN模型,识别了与新生脂肪生成相关的基因及其在糖尿病视网膜病变中的潜在作用 | 首次结合GraphBAN模型预测基因与化合物相互作用,并在单细胞水平上解析了DC2和经典单核细胞在DR相关通路中的转录活性 | 该研究为探索性研究,初步发现需进一步验证,且样本量可能有限 | 识别与新生脂肪生成和糖尿病视网膜病变相关的特征基因,并探索其在疾病发病机制中的作用 | 糖尿病视网膜病变患者和对照组的血液样本及公开数据库中的转录组和单细胞数据 | 计算机视觉 | 糖尿病视网膜病变 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | GraphBAN | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 糖尿病视网膜病变患者与对照组血液样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 4967 | 2026-04-23 |
Spatiotemporally programming the immune-osteogenic cascade with a dual-immunomodulatory scaffold for functional bone regeneration
2026-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.04.002
PMID:42016199
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研究论文 | 本文提出了一种双免疫调节骨支架(DIBS),通过顺序调节巨噬细胞和间充质干细胞的免疫功能,以修复临界尺寸骨缺损 | 创新点在于开发了一种双免疫调节支架,不仅调控巨噬细胞表型转换,还激活归巢间充质干细胞的免疫调节功能,通过CCL2/CCR2信号轴促进血管生成和成骨分化 | NA | 研究目的是通过免疫-成骨级联调控,实现功能性骨再生 | 研究对象为临界尺寸骨缺损的修复过程,涉及巨噬细胞和间充质干细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4968 | 2026-04-23 |
Ion channel/Stat6-driven nano-immune programming of tissue-resident macrophages by amide-functionalized nanocellulose
2026-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.03.038
PMID:42004621
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,探讨了酰胺功能化纳米纤维素对组织驻留巨噬细胞的免疫重编程机制 | 揭示了酰胺功能化纳米纤维素通过激活电压门控离子通道和Stat6信号通路,促进M2巨噬细胞极化,而不引发适应性免疫反应 | 研究仅基于14天亚急性窗口和28天脾细胞分析,长期效应和具体分子机制需进一步验证 | 阐明纳米纤维素表面化学介导的免疫重编程机制 | 原始纤维素纳米晶体和酰胺功能化纤维素纳米晶体 | 纳米生物材料 | NA | scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, 药理学抑制, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4969 | 2026-04-23 |
ELK1/NOL3/GRP78 axis regulates proliferation and stemness in TP53-mutant colon cancer by enhancing adaptive endoplasmic reticulum stress
2026-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168227
PMID:41864308
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研究论文 | 本文研究了ELK1/NOL3/GRP78轴在TP53突变结肠癌中通过增强适应性内质网应激来调控增殖和干细胞特性的机制 | 揭示了TP53突变肿瘤干细胞中内质网应激与线粒体代谢途径的同步激活,并首次将ELK1/NOL3/GRP78轴鉴定为驱动适应性内质网应激和干细胞特性的上游调控因子 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限,且未探讨该轴在其他癌症类型中的普适性 | 探究TP53突变结肠癌中适应性内质网应激的上游调控机制及其对肿瘤进展的影响 | TP53突变与野生型结肠癌细胞系(SW480、HT-29、HCT116)及TCGA-COAD和GEO队列的临床数据 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、DESeq2、LASSO回归、CCK-8、集落形成、微球形成、异种移植、双荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、Western blot | NA | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、临床数据 | TCGA-COAD和GEO队列的结肠癌样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4970 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the characteristics of porcine viral diseases, development, and immune repertoires: Current status and challenges
2026-Jun, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2026.105929
PMID:41865947
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综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在猪研究中的应用进展,涵盖疾病机制、发育生物学和免疫学特征三个方面 | 首次系统性地将scRNA-seq技术在猪研究中的三大应用方向(疾病解码、发育探索、免疫分析)进行整合综述,并分析了该技术在当前猪研究中的独特挑战与未来前景 | 猪参考基因组注释不完整、样本获取与处理困难、数据分析复杂度高 | 为scRNA-seq在猪传染病防控、遗传育种和生物医学模型开发中发挥更大作用提供研究思路 | 猪(作为农业经济动物和人类疾病模型) | 数字病理学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4971 | 2026-04-23 |
A comprehensive multi-omics and functional study of evolutionary adaptive responses to smoke
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115547
PMID:42016314
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研究论文 | 本研究通过多组学和功能分析,全面探讨了吸烟引起的进化适应性反应,识别了吸烟特征及其在气道中的空间分布,并揭示了关键调控基因 | 结合单细胞和空间转录组学数据映射吸烟特征,识别人类特异性烟雾反应基因,表明进化适应,并通过甲基化和ChIP-seq分析确定主调控因子 | 研究可能受限于样本队列的多样性和规模,且进化适应性的机制需要进一步验证 | 研究吸烟引起的进化适应性反应及其在慢性肺病发展中的作用 | 当前吸烟者和非吸烟者的肺组织,包括人类和非人类灵长类动物 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组学、单细胞RNA-seq、空间转录组学、甲基化分析、ChIP-seq | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间数据、甲基化数据、ChIP-seq数据 | 多个队列的当前吸烟者和非吸烟者样本,包括人类和非人类灵长类动物 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4972 | 2026-04-23 |
Keratin 15 Regulates Cell Proliferation in Outer Enamel Epithelium
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251368346
PMID:41103018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠牙胚中角蛋白15在牙釉质外上皮细胞中的特异性表达及其在调控细胞增殖和牙发育中的作用 | 首次将角蛋白15鉴定为牙釉质外上皮的特异性标记基因,并揭示了其通过抑制p38 MAPK通路调控牙上皮细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系,尚未在人类样本中验证,且对Krt15调控的具体下游靶点仍需进一步探索 | 阐明牙釉质外上皮在牙发育中的功能角色及其分子调控机制 | 小鼠牙胚(出生后第7天切牙和胚胎第14天第一磨牙)及牙上皮细胞系CLDE | 单细胞转录组学 | 牙发育异常 | 单细胞RNA测序,体外器官培养,基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 小鼠牙胚样本(P7切牙和E14 P1磨牙)及CLDE细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4973 | 2026-04-23 |
Development and validation of a cuproptosis-related gene signature for predicting prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2026-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04132-4
PMID:41296174
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于铜死亡相关基因的预后模型,用于预测胃癌患者的生存和治疗反应 | 首次在胃癌中基于铜死亡相关基因构建预后模型,并关联化疗和免疫治疗敏感性 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 构建基于铜死亡相关基因的预后模型,评估其在胃癌预后预测和治疗反应评估中的临床效用 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR | LASSO回归 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4974 | 2026-04-23 |
Identification of Apically Localized Endogenous Dental Pulp Stem Cells
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378094
PMID:41108143
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和谱系追踪技术,在小鼠磨牙根尖处鉴定出内源性Axin2+牙髓干细胞,并揭示了其在牙髓和牙本质再生中的作用机制 | 首次在小鼠磨牙根尖处鉴定出内源性Axin2+牙髓干细胞,并利用单细胞转录组学和谱系追踪技术详细描述了其在牙髓组织形成和损伤修复中的动态过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类牙髓干细胞在根尖的定位和功能可能有所不同,且长期追踪时间(至少9个月)可能限制了临床转化的直接应用 | 探究牙髓干细胞在牙髓和牙本质再生中的在体作用机制,为再生牙髓治疗提供新见解 | 小鼠磨牙的牙髓组织和根尖乳头 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4975 | 2026-04-23 |
Biological multi-omics approaches to next-generation biomarkers in immune-related disorders and malignancies: An overview
2026-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04128-0
PMID:41324821
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综述 | 本文概述了癌症和自身免疫性疾病中下一代生物标志物的研究进展,重点关注多组学整合和人工智能驱动的方法 | 强调多组学数据与人工智能/机器学习相结合,以揭示动态分子特征,并利用单细胞和空间分析来解析细胞异质性和组织背景 | 挑战包括检测标准化、患者间变异性和监管障碍 | 综述下一代生物标志物在癌症和自身免疫性疾病中的应用,以推动精准诊断和个性化治疗 | 癌症和自身免疫性疾病 | 自然语言处理 | 肺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4976 | 2026-04-23 |
The cardiac conduction system: development, function and therapeutic targets
2026-May, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-025-01227-x
PMID:41478886
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综述 | 本文综述了心脏传导系统的发育、功能及其作为治疗靶点的最新研究进展 | 整合单细胞基因组学、转录组学及空间转录组学技术,深入揭示心脏传导系统的细胞微环境与功能调控机制 | NA | 探讨心脏传导系统的生物学基础及其在疾病治疗中的应用潜力 | 心脏传导系统及其相关疾病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4977 | 2026-02-14 |
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.02.003
PMID:41679567
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4978 | 2026-04-23 |
CTPS1 modulates mitophagy to propel diffuse large B-cell lymphoma via reshaping CEPT1-mediated phospholipid metabolism
2026-May, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104132
PMID:41865720
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研究论文 | 本研究探讨了CTPS1通过调节CEPT1介导的磷脂代谢和线粒体自噬,促进弥漫大B细胞淋巴瘤进展的机制 | 首次揭示了CTPS1在DLBCL中通过上调CEPT1表达,重塑磷脂代谢并驱动BNIP3介导的线粒体自噬,促进肿瘤进展的新机制 | 未明确CTPS1抑制剂R80在临床治疗中的具体效果及潜在副作用 | 探索CTPS1在弥漫大B细胞淋巴瘤中的作用及其治疗潜力 | 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞及患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4979 | 2026-04-23 |
Decoding Spatiotemporal Microenvironmental Changes in Oral Carcinogenesis
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378087
PMID:41123100
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研究论文 | 本研究通过多组学时空分析,揭示了口腔黏膜癌变过程中微环境的动态重塑,重点关注了IGFBP2+口腔上皮祖细胞与调节性B细胞之间的相互作用及其在肿瘤发生中的作用 | 首次整合多组学时空数据解析口腔癌变全过程,发现了IGFBP2+口腔上皮祖细胞与调节性B细胞通过TGF-β信号通路的空间互作关系,并揭示了癌前阶段与癌症阶段调控机制的差异性 | 未明确说明样本的具体数量与类型,也未详细描述所使用的具体技术平台和产品型号 | 解析口腔黏膜癌变过程中微环境的动态变化,以预防疾病进展 | 口腔黏膜癌变过程(包括上皮增生、异型增生和癌变阶段)中的微环境细胞 | 数字病理学 | 口腔癌 | 多组学时空分析,空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4980 | 2026-04-23 |
Integrated multi-omics analysis identifies TBC1D10C as an NK- and T cell-associated diagnostic biomarker in childhood obesity
2026-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04818-8
PMID:42004165
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,鉴定出TBC1D10C作为儿童肥胖中与NK细胞和T细胞相关的诊断生物标志物 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和qPCR验证数据,系统揭示了儿童肥胖中NK细胞和T细胞的转录组改变,并鉴定出TBC1D10C这一新的诊断生物标志物 | 样本量相对有限(qPCR验证队列仅29名儿童),且主要基于转录组数据,功能机制有待进一步实验验证 | 探究儿童肥胖中NK细胞和T细胞的转录组改变,并评估其作为非侵入性诊断生物标志物的潜力 | 儿童肥胖患者的免疫细胞(特别是NK细胞和T细胞) | 生物信息学 | 儿童肥胖 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, WGCNA, 机器学习 | 集成机器学习工作流(包含110种模型配置) | 转录组数据 | 多个公共数据集(GSE205668, GSE87493, GSE159960)及独立验证队列(29名儿童) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |