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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4941 2026-06-17
[Impact of bone metastasis on the prognosis of lung adenocarcinoma patients treated with third-generation EGFR-TKI and the underlying mechanisms]
2026-Jun-16, Zhonghua yi xue za zhi
研究论文 评估骨转移对接受第三代EGFR-TKI一线治疗的肺腺癌患者预后的影响,并探索其潜在机制 通过单细胞RNA测序揭示骨转移灶中肿瘤细胞免疫调节基因上调及免疫细胞功能失调,构建免疫调节评分以预测预后 回顾性研究设计,单中心数据,样本量有限,需进一步验证 分析骨转移对肺腺癌患者接受第三代EGFR-TKI治疗效果的影响及耐药机制 370例EGFR突变晚期肺腺癌患者,含骨转移组161例、无骨转移组209例 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归 LASSO-Cox回归模型 临床数据, 单细胞转录组数据 370例患者(其中2例原发肺肿瘤和2例骨转移灶用于scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序 NA NA
4942 2026-06-17
Well-ST-seq: Cost-Effective and Near-Cellular Spatial Transcriptomics Using Deterministic Barcoded Bead Arrays
2026-Jun-16, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 提出Well-ST-seq平台,通过确定性条形码微珠阵列实现接近单细胞分辨率的空间转录组学,兼具低成本和高效率 利用微孔组装水凝胶微珠载体与组合微流控索引生成预定义空间条形码阵列,简化工作流程并大幅降低试剂成本(每平方毫米0.05-0.54美元),实现30-10微米点间距的快速制备 可能受限于微珠阵列的尺寸一致性和空间分辨率进一步优化,以及在大规模组织样本中的验证需求 开发经济高效、接近单细胞分辨率的空间转录组学方法,提升基础研究和临床应用中组织解剖图谱的精细度 小鼠海马体和发育中的小鼠胚胎脑连续切片 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 小鼠海马体组织样本和多个发育中小鼠胚胎脑连续切片 NA 空间转录组学 Well-ST-seq平台 微孔组装水凝胶微珠载体与组合微流控索引系统
4943 2026-06-17
The Association Between Alzheimer's Disease-Related Biomarkers And Parkinson's Disease Based On Single-Cell Sequencing Analysis Combined With Mendelian Randomization
2026-Jun-16, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 基于单细胞测序分析和孟德尔随机化研究探讨阿尔茨海默病相关生物标志物与帕金森病的关联 结合双向孟德尔随机化与单细胞核RNA测序,从遗传和细胞层面初步探索阿尔茨海默病相关生物标志物(如tau、Aβ42)与帕金森病及其进展的因果关系 多重暴露的工具变量数量有限,单细胞核RNA测序队列样本量小,且缺乏蛋白水平验证 探索阿尔茨海默病相关生物标志物与帕金森病之间的因果关系 帕金森病患者和阿尔茨海默病患者的脑脊液生物标志物(p-tau、总tau、Aβ42)以及死后中脑组织的单细胞核RNA测序数据 机器学习 帕金森病, 阿尔茨海默病 单细胞核RNA测序, GWAS NA 基因表达数据, 遗传汇总统计 双向孟德尔随机化基于GWAS汇总统计,样本量未明确;单细胞核RNA测序队列样本较小,数量未说明 NA 单细胞核RNA测序 NA 死后中脑组织的单细胞核RNA测序分析
4944 2026-06-17
Ovarian localization drives IL-7R-dependent CD8 coreceptor expression in peripheral double-negative T cells
2026-Jun-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 研究发现卵巢微环境可诱导外周双阴性T细胞获得CD8共受体表达,且此过程依赖于IL-7R信号通路 首次直接证明卵巢组织能主动改变浸润淋巴细胞的表型,揭示IL-7R信号是卵巢局部诱导CD8共受体的必要条件 未明确卵巢内具体细胞亚群如何通过IL-7信号调控CD8表达,且仅在小鼠模型中验证 探究卵巢组织是否主动指导浸润淋巴细胞表型改变 小鼠外周双阴性T细胞(DNTs)及卵巢组织 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型,具体样本量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 卵巢组织单细胞RNA-seq
4945 2026-06-17
Runx1-Snx9 axis drives the pathological secretion of mitochondrial-derived vesicles to activate cGAS-STING signaling in acute pancreatitis
2026-Jun-16, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究揭示了在急性胰腺炎中,Runx1-Snx9转录轴驱动胰腺腺泡细胞产生并分泌致病性线粒体衍生囊泡,进而激活cGAS-STING信号通路,引发全身性炎症反应 首次阐明Runx1-Snx9转录轴是急性胰腺炎中胰腺腺泡细胞异常生成和分泌细胞外线粒体衍生囊泡的核心上游机制 基于小鼠模型,需要进一步在人体组织中验证;机制细节如MDVs分选和分泌的具体分子过程尚需深入解析 研究急性胰腺炎中胰腺腺泡细胞释放线粒体DNA的上游调控机制 胰腺腺泡细胞、巨噬细胞、急性胰腺炎小鼠模型 分子生物学 急性胰腺炎 单细胞RNA测序、CUT&Tag、荧光素酶报告基因检测 NA 基因表达数据、染色质结合数据 小鼠模型及相关细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序分析的10x Chromium平台
4946 2026-06-17
Canopy1/Cnpy1 is required for proper V2R processing and transport; its loss impairs the function and circuit organization of basal/V2R vomeronasal sensory neurons
2026-Jun-16, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究发现Canopy1/Cnpy1对V2R神经元的加工和运输至关重要,其缺失会损害犁鼻器基底/V2R感觉神经元的功能和回路组织 首次揭示Canopy1 (Cnpy1)在V2R犁鼻感觉神经元中的特异性高表达及其对内质网功能维持的关键作用 尚未明确Cnpy1缺失导致V2R神经元丢失的具体分子机制,且仅基于小鼠模型 探讨Canopy1在犁鼻器V2R感觉神经元发育和功能中的作用及其对行为的影响 小鼠犁鼻器(VNO)及其V2R感觉神经元 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 野生型和Cnpy1敲除小鼠的犁鼻组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4947 2026-06-17
Investigating Immune Microenvironment of Inflammatory Bowel Disease and the Mitochondrial Metabolism-Related Molecular Mechanisms: Combining a Multiomics Approach and Experimental Validation
2026-Jun-15, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 结合多组学方法和实验验证,研究炎症性肠病的免疫微环境及线粒体代谢相关分子机制,鉴定关键基因MRPL35和MRPS6作为潜在诊断标志物和治疗靶点 首次将线粒体代谢相关基因与炎症性肠病的免疫微环境结合,通过多组学整合分析策略(转录组、单细胞测序、ceRNA网络和分子对接)识别出MRPL35和MRPS6两个关键基因,并揭示其在单核吞噬细胞中的高表达及与其他细胞的通讯机制 仍缺乏多中心、大规模临床队列的外部验证;关键基因的功能机制未完全阐明;动物模型或体外实验验证尚不充分 探究炎症性肠病中与线粒体代谢相关的分子机制及免疫微环境变化,并鉴定新的诊断标志物和治疗靶点 炎症性肠病(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎)患者的组织样本和单细胞数据 机器学习 炎症性肠病 转录组测序、单细胞RNA测序、反向转录定量聚合酶链反应、分子对接 随机森林、支持向量机、LASSO回归、XGBoost 基因表达数据(转录组、单细胞转录组)和临床样本 多个公开数据集(GSE3365, GSE75214, GSE134809)及临床验证样本,具体数量未明确提及 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
4948 2026-06-17
RSTG: Robust Generation of High Quality Spatial Transcriptomics Data using Beta Divergence Based AutoEncoder
2026-Jun-15, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出一种基于Beta散度自编码器的鲁棒空间转录组数据生成方法RSTG,以解决现有生成模型在噪声环境下性能下降的问题 将Beta-ELBO损失函数融入自编码器框架,通过变分推断近似数据内在分布,实现对离群点的鲁棒性生成,并在多种技术(MERFISH、MERSCOPE、Visium)和多种扰动(白噪声、批次效应、缺失值)下保持高质量 未在文章提供的信息中明确提及局限性 开发一种鲁棒的空间转录组数据生成方法,以提高在噪声环境下的生成质量和稳定性 空间转录组数据(包括脑组织、肝脏样本) 机器学习 NA MERFISH, MERSCOPE, Visium 自编码器 基因表达数据 多个数据集,包括脑和肝脏样本 10x Genomics 空间转录组学 Visium 10x Visium, MERFISH, MERSCOPE
4949 2026-06-17
Common Principles Underlie Mitochondrial DNA Heteroplasmy Dynamics in the Germline and Soma
2026-Jun-15, Annual review of genomics and human genetics IF:7.7Q1
综述 综述了线粒体DNA异质性在生殖系和体细胞系统中动态变化的基本原理 提出异质性动态变化遵循共通的量化原理,从描述性观察转向预测性机制模型,并整合单细胞测序、mtDNA成像、基因编辑等多种新技术进行分子水平解析 未明确说明具体局限性,但可能涉及异质性动态机制的复杂性及实验模型的不完整性 揭示线粒体DNA异质性在细胞、组织和生物体中随时间变化的共同机制和量化规律 生殖系和体细胞中的线粒体DNA异质性动态 机器学习 线粒体疾病, 衰老相关疾病 单细胞测序, mtDNA成像, 遗传筛选, mtDNA编辑技术 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4950 2026-06-17
Endothelial-derived TWEAK drives granulosa cell apoptosis in PCOS via the Fn14-oxidative stress axis
2026-Jun-15, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究揭示了内皮细胞来源的TWEAK通过Fn14-氧化应激轴驱动多囊卵巢综合征中颗粒细胞凋亡的新机制 首次在PCOS中发现并验证内皮细胞与颗粒细胞间通过TWEAK-Fn14配体-受体对的细胞间通讯异常,并阐明其通过氧化应激促进颗粒细胞凋亡的作用机制 体外实验仅部分验证了机制,缺乏体内遗传学或药理学干预的验证数据 探索PCOS中卵巢内皮细胞与颗粒细胞间的异常通讯及其在颗粒细胞凋亡中的作用机制 PCOS患者和小鼠模型中的卵巢内皮细胞与颗粒细胞 数字病理学 多囊卵巢综合征 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附测定, 免疫荧光 NA 基因表达数据, 图像 小鼠模型:DHEA诱导的PCOS小鼠;人类数据:公共数据集GSE268919 NA 单细胞RNA测序 NA 小鼠单细胞RNA-seq数据集GSE268919
4951 2026-06-17
Spatial Transcriptomics Identifies Cytotoxic and Fibrotic Immune-Stromal Niches in Morphea and Eosinophilic Fasciitis
2026-Jun-15, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4952 2026-06-17
A myeloid immunosuppressive phenotype defines primary refractoriness to atezolizumab Plus bevacizumab in hepatocellular caarcinoma
2026-Jun-15, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 该文章分析了肝细胞癌患者对阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗的原发性难治性,并鉴定了其免疫抑制性肿瘤微环境特征 首次在肝细胞癌中应用SITC标准定义原发性难治性,并系统揭示了由IFN-γ通路抑制、髓系极化异常和空间免疫结构改变组成的免疫分子特征 未说明具体限制,但可推断样本量和队列异质性可能存在限制 阐明肝细胞癌患者对阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗原发性难治性的生物学机制 肝细胞癌患者 机器学习 肝癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 条件推断树 图像, 文本, RNA表达数据 1296例真实世界患者和645例临床试验参与者(其中20例用于scRNA-seq,16例用于IMC) NA 单细胞RNA测序 NA NA
4953 2026-06-17
Spatial and network principles behind neural generation of locomotion
2026-Jun-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出脊髓空间组织主导网络驱动的运动节律与模式的神经生成原理 通过不对称“墨西哥帽”连接模型(局部兴奋与远程抑制耦合纵向偏斜)和细胞类型横断面分域特性,首次揭示细胞类型-网络连接-功能行为的空间组织通用原则 NA 阐明运动神经生成的神经原理,特别是细胞类型、网络与功能之间的关系 小鼠脊髓中的神经元细胞类型及运动回路 机器学习 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 表达数据, 空间分布数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
4954 2026-06-17
An invariant VLR-like receptor refines the T-like cell framework in lamprey
2026-Jun-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学在七鳃鳗中发现一种恒定VLR样受体,细化了T样细胞框架 首次发现并表征了一种种系编码、不进行重组的恒定VLR样受体,揭示了其与VLRC共表达且协调多样化VLR的新模式 未明确阐述研究局限性 研究七鳃鳗中VLR多样性的细胞组织方式以及单个淋巴细胞整合多种VLR的机制 七鳃鳗(雷氏七鳃鳗)的淋巴细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞基因表达数据 来自多组织的淋巴细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4955 2026-06-17
Bisphenol A exacerbates diabetic foot ulcers through disruption of immune microenvironment and repair processes: a multi-omics analysis of environmental exposure mechanisms
2026-Jun-15, Drug and chemical toxicology IF:2.1Q3
研究论文 通过多组学分析揭示双酚A通过破坏免疫微环境和修复过程加重糖尿病足溃疡的分子机制 首次系统分析环境污染物双酚A与糖尿病足溃疡的因果关系及其分子机制,并筛选出潜在拮抗剂药物 仅基于公共数据库的转录组数据,缺乏体外或体内实验验证 探索双酚A在糖尿病足溃疡中的分子机制并筛选拮抗剂 双酚A作用靶点和糖尿病足溃疡差异表达基因(来自GEO数据库) 生物信息学 糖尿病足溃疡 NA NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 NA NA NA NA NA
4956 2026-06-17
Phylogenetic tree inference from single-cell RNA sequencing data with SCITE-RNA
2026-Jun-15, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种用于单细胞RNA测序数据的系统发育树推断方法SCITE-RNA 引入最大似然随机扫描贪婪搜索算法,在细胞谱系树和突变树表示之间交替优化以逃逸局部最优 标题和摘要中未提供 开发适用于单细胞RNA测序数据的系统发育树推断方法 单细胞RNA测序数据中的单核苷酸变异 机器学习 NA RNA-seq 最大似然随机扫描贪婪搜索 单细胞RNA测序数据 模拟数据、癌症单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4957 2026-06-17
YAP/TAZ Drive Oral Leukoplakia Progression and Confer Ferroptosis Vulnerability
2026-Jun-15, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究发现YAP/TAZ过度激活驱动口腔白斑进展,并揭示其介导的铁死亡脆弱性,为治疗提供新策略 首次通过单细胞RNA测序鉴定出口腔白斑特异性细胞群体,揭示YAP/TAZ激活的双重作用:维持恶性特性同时赋予铁死亡脆弱性,并提出利用临床可用药物组合诱导铁死亡来间接靶向YAP/TAZ 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限或机制验证需进一步临床转化研究 阐明YAP/TAZ在口腔白斑进展和恶性转化中的机制,并探索铁死亡诱导治疗的可能性 口腔白斑患者样本及转基因小鼠模型中的口腔白斑恶性细胞 机器学习 口腔白斑 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 口腔白斑患者样本(具体数量未提及)及转基因小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
4958 2026-06-17
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2026-Jun-12, Development (Cambridge, England)
研究论文 该研究利用高通量测序技术定义了小鼠前肢起始的发育和转录程序,鉴定出四个不同阶段,并发现一组受TBX5调控的候选早期转录靶基因 首次通过RNA-seq、scRNA-seq、ChIP-seq和Ribo-ITP等多种测序方法系统表征前肢起始的时序性转录程序,并鉴定出区别于其他细胞类型的前肢特征基因集,其中包含参与神经投射和细胞粘附的基因 未明确说明局限,但可能包括仅在小鼠胚胎中研究,以及未在功能上验证候选基因的调控机制 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制,特别是TBX5依赖性转录调控 小鼠胚胎中体壁侧板中胚层(体壁LPM)的前肢起始过程 数字病理学 不适用 RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP 不适用 转录组数据 小鼠胚胎,具体样本量未在摘要中说明 不适用 不适用 不适用 不适用
4959 2026-06-17
Aberrant STAT signaling and T cell dysregulation define a targetable pediatric sepsis endotype
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术,在前瞻性队列中识别出儿科脓毒症的一种异常STAT信号和T细胞失调的内型 首次定义了由IL-6和IFN-γ驱动的儿科脓毒症T细胞功能障碍内型,并揭示JAK/STAT轴作为免疫调节治疗的潜在靶点 信息未明确提供 阐明儿科脓毒症中免疫异质性的机制并寻找可靶向治疗的内型 88名危重病患儿的免疫细胞和血浆样本 数字病理学 儿科脓毒症 血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序、磷酸流式细胞术 无监督聚类(对血浆细胞因子进行聚类) 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 88名危重病患儿 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4960 2026-06-17
Single-cell spatial transcriptomics of formalin-fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 利用成像型单细胞空间转录组学对福尔马林固定石蜡包埋活检组织进行分析,揭示了与结肠炎相关的细胞网络 首次将成像型单细胞空间转录组学应用于临床福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本,并识别出与维多珠单抗治疗反应相关的两种不同抗性原型 未提供 探究溃疡性结肠炎病理机制并识别治疗反应生物标志物 溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检组织 数字病理学 溃疡性结肠炎 成像型单细胞空间转录组学 未提供 图像 包括溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本 10x Genomics 单细胞空间转录组学 10x Xenium 自定义Xenium基因面板
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