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当前共找到 5215 篇文献，本页显示第 4841 - 4860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4841 | 2026-01-15 |
A Transcriptional Map of Human Tonsil Architecture: Beyond the Sum of (Single Cell) Parts
2026-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70121
PMID:41518352
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研究论文 | 本文利用成像空间转录组学数据，绘制了人类扁桃体的转录图谱，并比较了其与单细胞RNA测序在细胞组成分析中的优势 | 开发了一个多尺度分析流程，专注于空间数据的组织、相互作用和功能特性，揭示了扁桃体的空间结构和免疫过程 | 数据仍存在分析挑战和标准化不足的问题 | 研究免疫反应在原生组织环境中的空间转录组学应用，并展示其在细胞组成分析中的优势 | 人类扁桃体组织 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据，单细胞RNA测序数据 | 约200万个细胞 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4842 | 2026-01-15 |
Co-targeting MRPS7-23 synergistically enhances cisplatin efficacy to suppress nasopharyngeal carcinoma growth and metastasis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115523
PMID:41522354
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了MRPS7和MRPS23通过稳定β-catenin驱动鼻咽癌顺铂耐药的新机制，并发现靶向其上游调控因子USP10可协同增强顺铂疗效 | 首次鉴定出线粒体核糖体蛋白MRPS7和MRPS23是鼻咽癌顺铂耐药的关键驱动因子，并阐明了其通过抑制β-catenin泛素化促进癌症干细胞特性和上皮-间质转化的分子机制，同时发现了USP10作为上游调控因子的新作用 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化效果仍需进一步验证；耐药机制可能涉及其他未被发现的通路 | 阐明鼻咽癌顺铂耐药的分子机制，并寻找逆转耐药的治疗策略 | 鼻咽癌细胞系、动物模型以及相关的分子通路 | 癌症生物学 | 鼻咽癌 | 整合多组学分析、单细胞RNA测序、质谱分析、功能研究 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4843 | 2026-01-15 |
Dual Phosphorylation of STAT1 at Y701/S727 by TNFα Drives AIM2-Mediated PANoptosis of Renal Tubular Epithelial Cells and Fibrotic Progression in Renal Allografts
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.123441
PMID:41522348
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研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过双重磷酸化STAT1激活AIM2，驱动肾小管上皮细胞发生PANoptosis，进而促进肾移植间质纤维化的分子机制 | 首次阐明了TNF-α/STAT1/AIM2轴在触发PANoptosis及其下游EMT-纤维化级联反应中的作用，为慢性移植肾功能障碍提供了新的治疗靶点 | NA | 探究慢性移植肾功能障碍中肾移植间质纤维化的分子机制 | 肾移植组织、肾小管上皮细胞 | 数字病理 | 慢性移植肾功能障碍 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4844 | 2026-01-15 |
Acute anti-Aβ antibody exposure induces microglial changes and significantly alters chemokine signaling
2026 Jan-Mar, Alzheimer's & dementia (New York, N. Y.)
DOI:10.1002/trc2.70201
PMID:41522370
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了抗淀粉样蛋白β抗体（3D6）急性暴露对大脑免疫反应的影响，特别是小胶质细胞的变化和趋化因子信号通路的改变 | 首次在急性时间点（3天）通过单细胞测序揭示抗Aβ抗体如何快速改变小胶质细胞亚型和趋化因子信号，特别是CCL通路靶向稳态小胶质细胞而非疾病相关亚型的新发现 | 研究仅基于短期（3天）观察，未评估长期效应；颅内注射模型可能无法完全模拟临床免疫治疗的实际给药方式 | 阐明抗淀粉样蛋白β抗体治疗阿尔茨海默病时大脑的即时免疫反应机制 | 小鼠大脑皮层组织中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及3D6抗体注射组和IgG对照组的小鼠大脑皮层 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4845 | 2026-01-15 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Deubiquitination Genes as Prognostic Markers in Hepatocellular Carcinoma
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/4893924
PMID:41523581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了去泛素化基因在肝细胞癌中的预后标志物作用 | 首次在单细胞水平整合分析HCC肿瘤样本，结合TCGA和ICGC大样本队列，构建了基于去泛素化酶基因的预后风险模型 | 需要进一步的实验验证来确认研究结果 | 探究去泛素化在肝细胞癌进展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌肿瘤样本、TCGA和ICGC数据库中的RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | LASSO-Cox机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据、bulk RNA测序数据 | 13个初治HCC肿瘤样本的单细胞数据，374个TCGA样本和243个ICGC样本的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4846 | 2026-01-15 |
Itaconate-Related Gene Signatures as Prognostic Markers in Colon Cancer: Insights From Transcriptomic and Spatial Analysis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7928082
PMID:41523911
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研究论文 | 本研究首次综合运用批量转录组学、单细胞转录组学和空间转录组学数据，全面分析了衣康酸及其相关通路基因在结肠癌中的表达、生物学作用和预后价值，并构建了一个优于现有模型的预后预测模型 | 首次在结肠癌中系统分析衣康酸相关基因的预后价值，并整合了单细胞和空间转录组学数据来阐明这些基因在肿瘤微环境中的细胞特异性表达和空间分布特征 | 研究主要基于TCGA和GEO的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 | 开发用于结肠癌患者精确预后评估和分层治疗的新型生物标志物和预测模型 | 结肠癌患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | 批量转录组测序，单细胞RNA测序，空间转录组学，组织微阵列 | 弹性网络回归模型 | 转录组数据，空间表达数据，单细胞数据 | 训练集：TCGA数据库中的448例结肠癌患者；验证集：GEO数据库中的7个预后模型，共1473例 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，批量RNA-seq | NA | NA |
| 4847 | 2026-01-14 |
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf215
PMID:41503158
|
研究论文 | 本文对商业单细胞RNA测序技术进行了全面评估，比较了多种平台的性能指标和实际应用因素 | 首次在单细胞TCR恢复可用检测中比较了T细胞特异性性能，并综合评估了细胞回收率、灵敏度对稀有细胞亚型解析能力的影响 | 研究主要基于PBMC样本，可能不适用于其他组织类型；未涵盖所有商业平台 | 评估商业单细胞RNA测序技术的实际应用性能和选择标准 | 来自不同供者的标准化PBMC样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个供者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, TCR分析 | NA | 评估了七种全转录组mRNA检测试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒 |
| 4848 | 2026-01-14 |
Opportunities for RNA sequencing in physiology: from big data to understanding homeostasis and heterogeneity
2026-Feb-01, Function (Oxford, England)
DOI:10.1152/function.019.2025
PMID:41401424
|
综述 | 本文探讨了RNA测序在生理学中的应用潜力，强调其从大数据到理解稳态和异质性的作用 | 强调非编码RNA（如lncRNA）在生理学中的重要性，并讨论单细胞和空间转录组学的最新进展 | 未提及具体实验或数据验证，主要基于现有文献综述 | 评估RNA测序技术在生理学研究中的机遇和挑战 | RNA分子，包括编码和非编码RNA，以及其在细胞、组织和器官生理学中的应用 | 自然语言处理 | NA | RNA测序，单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 超过一百万RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4849 | 2026-01-14 |
Detection of pleiotropic genetic factors and critical brain cell types linking insomnia with psychiatric disorders
2026-Jan-13, Sleep
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/sleep/zsaf317
PMID:41065713
|
研究论文 | 本研究通过分析失眠症与12种精神疾病的遗传关联，揭示了它们之间共享的遗传结构和神经生物学机制 | 首次系统地识别了失眠症与多种精神疾病共享的70个基因组位点，并确定了GABA能突触信号通路和特定皮质神经元亚型在共病机制中的核心作用 | 研究主要基于欧洲血统人群的GWAS数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；功能验证和因果推断需要进一步实验研究 | 探究失眠症与精神疾病之间的遗传重叠、生物学通路和脑细胞类型关联 | 失眠症和12种精神疾病（包括ADHD、厌食症、焦虑症、自闭症谱系障碍、双相情感障碍、重度抑郁症和精神分裂症）的基因组数据 | 遗传学与神经科学 | 精神疾病与睡眠障碍 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序 | bivariate MiXeR、conjFDR、ASSET、MAGMA、SEISMIC | 基因组关联数据、单细胞转录组数据 | 失眠症样本量314,149；精神疾病样本量12,783至449,855不等 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4850 | 2026-01-14 |
GraphSTAR: Proximal Operator-Based Graph Neural Network Enhanced by Dynamic Graph Aggregation for Spatial Transcriptomics
2026-Jan-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3644379
PMID:41525646
|
研究论文 | 本文提出了一种名为GraphSTAR的新方法，用于整合空间转录组学中的空间坐标和基因表达数据，以改进空间域识别和细胞类型注释任务 | GraphSTAR通过将空间和基因表达数据编码为无向图，并利用动态图聚合结合近端算子，有效建模局部邻域关系和长程功能关联，克服了现有方法在探索长程关系方面的不足 | NA | 解决空间转录组学中原始空间坐标与高维基因表达谱在原生特征空间中的整合挑战，以更好地解析基因的空间表达模式 | 空间转录组学数据，包括空间坐标和基因表达谱 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络（GNN） | 空间坐标和基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4851 | 2026-01-14 |
Mapping somatosensory afferent circuitry to bone identifies neurotrophic signals required for fracture healing
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr9608
PMID:41505527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的关键作用 | 首次系统性地绘制了骨骼感觉传入神经元的单细胞转录组图谱，并识别出FGF9作为骨折修复的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证尚需进一步研究 | 探究骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的调控机制 | 小鼠骨骼的背根神经节神经元 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及骨折前后的小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4852 | 2026-01-14 |
A subcellular spatial atlas illuminates the microenvironmental remodeling of perineural invasion in distal cholangiocarcinoma
2026-Jan-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01773-4
PMID:41508044
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研究论文 | 本研究利用Xenium亚细胞分辨率空间转录组学平台，构建了远端胆管癌神经周围侵袭的亚细胞空间图谱，揭示了驱动神经侵袭的协调性上皮、基质和免疫重塑 | 首次在亚细胞分辨率下解析了远端胆管癌神经周围侵袭的空间结构和分子驱动因素，鉴定了LAMB3-DAG1轴作为肿瘤细胞与施万细胞相互作用的潜在介质 | 研究基于手术切除的肿瘤组织样本，样本量有限，且为横断面研究，未能动态追踪神经侵袭过程 | 阐明远端胆管癌神经周围侵袭的空间结构和分子机制 | 远端胆管癌患者的肿瘤组织 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 根据PNI状态分层的远端胆管癌患者切除肿瘤组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium亚细胞分辨率空间转录组学平台 |
| 4853 | 2026-01-14 |
Drug and single-cell gene expression integration identifies sensitive and resistant glioblastoma cell populations
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67783-5
PMID:41501023
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研究论文 | 本研究开发了scFOCAL平台，通过整合单细胞基因表达数据与药物数据库，识别胶质母细胞瘤中对靶向疗法敏感和耐药的细胞亚群，并预测协同治疗组合 | 开发了scFOCAL（单细胞组学连接与分析框架），首次将单细胞RNA测序数据与LINCS L1000药物数据库的转录反应特征进行整合，量化细胞对药物的敏感性和耐药性景观，并预测药物组合协同作用 | 研究主要基于转录组数据，未全面评估表观遗传、蛋白质组等其他层面的异质性；临床前验证虽涵盖体外、离体和体内模型，但尚未进行临床试验 | 开发一个预测平台，以解决胶质母细胞瘤肿瘤内异质性和可塑性对治疗开发的阻碍，识别对不同治疗敏感或耐药的细胞状态，并发现新的协同治疗组合 | 新诊断和复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4854 | 2026-01-14 |
Mapping isoforms and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data with SPLISOSM
2026-Jan-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02965-6
PMID:41491254
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SPLISOSM的方法，用于从空间转录组学数据中检测异构体分辨率模式，并应用于小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤的分析 | SPLISOSM方法首次使用非参数核的多变量测试来处理点水平和异构体水平的依赖性，从而在稀疏数据上实现高统计功效，揭示了空间转录多样性的新调控关系 | 方法可能依赖于数据质量和覆盖度，且分析主要聚焦于大脑组织，在其他组织中的适用性未验证 | 研究旨在理解转录多样性（包括剪接和替代3'端使用）的空间协调机制及其在正常和肿瘤条件下的作用 | 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤组织 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | SPLISOSM（空间异构体统计建模） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4855 | 2026-01-14 |
Radial-glia-to-astrocyte trans-differentiation and astrocyte transcriptional convergence are coordinated by CEH-43/DLX in C. elegans
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.682973
PMID:41279325
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研究论文 | 本研究通过线虫模型揭示了CEH-43/DLX转录因子在调控放射状胶质细胞向星形胶质细胞转分化和转录收敛过程中的关键作用 | 首次在C. elegans中解析了不依赖细胞分裂的放射状胶质细胞向星形胶质细胞转分化的两阶段分子程序，并发现CEH-43/DLX转录因子的保守调控机制 | 研究基于线虫模型，在哺乳动物系统中的直接适用性需进一步验证 | 揭示放射状胶质细胞向星形胶质细胞转分化过程中的分子调控机制 | 线虫CEPsh星形胶质细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4856 | 2026-01-14 |
STAHD: a scalable and accurate method to detect spatial domains in high-resolution spatial transcriptomics data
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf619
PMID:41212773
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研究论文 | 本文提出了一种名为STAHD的可扩展且高效的方法，用于检测高分辨率空间转录组学数据中的空间域 | 结合图注意力自编码器与多层次k路图分割，将大型图分解为紧凑子图并生成低维嵌入，从而提升计算效率和聚类精度 | NA | 开发一种可扩展且精确的解决方案，以应对大规模、高分辨率空间转录组学数据在空间域检测中的效率与准确性挑战 | 人类和小鼠的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4857 | 2026-01-14 |
Spider: a flexible and unified framework for simulating spatial transcriptomics data
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf562
PMID:41237053
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研究论文 | 本文提出了一个名为Spider的灵活统一框架，用于模拟空间转录组学数据，以解决现有基准数据集在多样性和准确性方面的不足 | Spider框架无需真实ST数据作为参考，通过细胞类型比例和相邻细胞间转移矩阵来表征空间模式，能生成更真实、多样的模拟数据，并提供交互功能以定制空间域 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个用于模拟空间转录组学数据的框架，以促进ST分析工具的基准测试 | 空间转录组学数据模拟 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学模拟 | NA | 基因表达谱和细胞位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4858 | 2026-01-14 |
Disruption of Pre-Bötzinger Complex neuropeptidergic tonality controls fear and metabolic response
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.697304
PMID:41509333
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研究论文 | 本文识别了preBötzinger复合体作为协调应激与代谢适应的关键中枢，揭示了PACAP信号在此回路中的调控作用 | 首次将脑干呼吸节律生成器preBötzinger复合体定义为整合应激、呼吸和代谢的神经肽能脑干-外周回路的关键枢纽 | NA | 探索连接应激反应与外围代谢调节的中枢神经回路 | preBötzinger复合体神经元、棕色脂肪组织和肝脏 | 神经科学 | NA | 病毒追踪、全脑c-Fos映射、空间转录组学 | NA | 神经解剖学数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4859 | 2026-01-14 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies a Nucleotide Metabolism-Related Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in LUAD
2026-Jan-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18010160
PMID:41514669
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，构建了一个核苷酸代谢相关特征（NMRS），用于预测肺腺癌（LUAD）的预后和免疫治疗反应 | 首次在单细胞水平上系统描绘了肺腺癌中核苷酸代谢的异质性，并构建了一个跨队列稳健的预后和免疫治疗反应预测特征（NMRS），同时通过实验验证了关键基因ENO1的功能 | 研究主要基于公开的回顾性数据集，需要前瞻性临床队列进一步验证NMRS的预测效能；体外实验仅初步验证了ENO1的功能，缺乏体内模型和机制深入探索 | 探究肺腺癌中核苷酸代谢的细胞异质性及其对肿瘤进展、免疫微环境和治疗反应的影响，并开发相关的预后和预测标志物 | 肺腺癌（LUAD）患者肿瘤组织中的细胞，特别是恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），机器学习算法组合 | 多种机器学习算法组合（共101种组合），inferCNV，Monocle2，CellChat | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 来自独立LUAD患者的公开scRNA-seq数据集，TCGA-LUAD队列和多个GEO队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4860 | 2026-01-14 |
CausalGenDiff: Generative causal diffusion bridges scRNA-seq and spatial transcriptomics
2026-Jan, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2025.104966
PMID:41354118
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研究论文 | 提出了一种名为CausalGenDiff的生成因果扩散模型，用于有效整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 首次将扩散和自回归过程相结合以利用基因间的因果依赖关系，并将原本用于图像生成的因果注意力变换器扩展应用于高维基因表达数据，无需依赖预定义关系即可捕捉基因调控机制 | 未明确说明模型的计算复杂度或对计算资源的需求，也未讨论模型在更广泛组织类型或疾病状态下的泛化能力 | 提高单细胞RNA测序和空间转录组学数据整合的性能，以更好地理解空间背景下的基因表达 | 基因表达数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 扩散模型，自回归模型，因果注意力变换器，VAE | 基因表达数据 | 10个组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |