单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 7432 篇文献,本页显示第 461 - 480 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
461 2026-07-12
Alk-Fam150b (augmentor α) expression in the paraventricular nucleus of the mouse hypothalamus at molecular resolution, and its sensitivity to acute stress
2026-Mar, Journal of neuroendocrinology IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和多重原位杂交,在小鼠下丘脑室旁核中解析了Alk-Fam150b(augmentor α)的分子表达,并揭示了其对应激的敏感性 首次在分子水平上证明Fam150b和Alk在小鼠下丘脑室旁核中共同表达,包括促肾上腺皮质激素释放激素神经元,并发现CRH神经元以互斥方式表达Fam150b或Scgn,以及应激诱导的Fam150b表达上调受糖皮质激素反馈调控 未明确Fam150b和Alk在室旁核中的功能作用,以及augmentor α-ALK信号在摄食和体重控制应激诱导变化中的具体机制 研究Alk-Fam150b(augmentor α)在小鼠下丘脑室旁核中的表达及其对应激的敏感性 成年小鼠下丘脑室旁核中的神经元,特别是促肾上腺皮质激素释放激素神经元 分子生物学 应激相关疾病 单细胞RNA测序, 多重原位杂交 NA 基因表达数据, 空间表达数据 小鼠样品(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
462 2026-07-12
The PKA/MBD2 Axis Transcriptionally Represses INPP5A to Modulate PI3K/Akt Signaling and Accelerate Pituitary Tumorigenesis
2026-Mar, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
research paper 本文研究了INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的抑癌作用及其与PI3K/Akt信号通路和表观遗传调控因子MBD2的相互作用机制 首次揭示PKA/MBD2轴通过转录抑制INPP5A进而调控PI3K/Akt信号通路促进垂体肿瘤发生的分子机制 NA 探究INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及其分子机制 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)样本及细胞系 machine learning pituitary neuroendocrine tumors(垂体神经内分泌肿瘤) single-cell sequencing(单细胞测序),免疫荧光染色 NA gene expression data(基因表达数据) 62例PitNETs患者样本 NA single-cell RNA-seq(单细胞RNA测序) NA NA
463 2026-07-12
Prior-guided factorization for reliable imputation of scRNA-seq data
2026-Mar, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种基于先验知识引导的因子分解方法用于单细胞RNA测序数据的可靠填补 提出scZN框架,将数据观测建模为RNA两态转录过程与dropout的联合作用,利用非负矩阵分解、先验知识约束和多重正则化,实现可解释的缺失值填补和表达重建 论文未明确提及局限性 解决scRNA-seq数据中dropout噪声与生物真实零表达的区分问题,提升数据填补的准确性和可解释性 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 基因表达矩阵 多个真实数据集,包括胚胎干细胞、小鼠齿状回和海马体数据,以及阿尔茨海默病数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
464 2026-07-12
A single-cell immune atlas of primary and secondary lymphoid organs in pigs
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序构建猪初级和次级淋巴器官的免疫细胞图谱 首次创建涵盖猪多种淋巴组织(骨髓、胸腺、淋巴结和脾脏)的单细胞免疫图谱,识别出新的胸腺细胞群体,并揭示猪与人之间保守的先天淋巴样细胞亚群 未明确提及局限性,但可能包括样本量有限或仅覆盖关键淋巴器官 利用单细胞RNA测序构建猪淋巴器官免疫细胞图谱,以促进农业和生物医学研究 猪的初级淋巴器官(骨髓、胸腺)和次级淋巴器官(淋巴结、脾脏)中的免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 多个猪淋巴组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
465 2026-07-12
Integrated spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing reveal Lars2-mediated spatiotemporal dynamics of myocardial remodeling in a mouse model of transverse aortic constriction
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示小鼠主动脉缩窄模型中Lars2介导的心肌重塑时空动态变化 首次利用空间转录组学与单细胞RNA测序的整合分析,高分辨率解析压力超负荷诱导心肌肥厚过程中细胞组成和基因表达的时空动态变化,并鉴定Lars2为疾病进展相关基因 NA 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序,全面表征压力超负荷诱导心肌重塑的细胞与空间动态变化 小鼠心脏组织,取自主动脉缩窄模型的不同疾病阶段(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据(空间转录组和单细胞RNA测序数据) 不同疾病阶段的小鼠心脏组织样本(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
466 2026-07-12
Quantitative profiling of lifespan-dependent cell-cell communication potential reveals dynamic ligand-receptor network shifts across mouse tissues
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序数据推断小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏)中跨生命周期的细胞间通信动态变化,并开发了一种量化框架来捕捉配体-受体相互作用的变化 开发了Shrink and Expand (SE) 评分来量化两个生物学状态之间推断的配体-受体相互作用集的定向变化,并构建了跨器官和生命周期的配体-受体对变化数据集 该研究基于转录组推断而非蛋白质水平验证,可能存在假阳性或假阴性结果,且未涵盖所有潜在细胞类型 研究细胞间通信随年龄变化的动态模式,并开发可量化的比较方法 小鼠的肝脏、肺、心脏和肾脏组织 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏),涵盖产后发育、成年和衰老三个阶段 NA 单细胞RNA测序 NA NA
467 2026-07-10
Integrated multi-omics analysis identifies prognostic risk genes and constructs a predictive signature in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Dec-31, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
研究论文 通过整合多组学分析识别弥漫性大B细胞淋巴瘤的预后风险基因并构建预测模型 首次结合eQTL-MR分析、单细胞RNA测序和免疫浸润分析,系统鉴定出15个与DLBCL发病和预后相关的风险基因并构建预测模型 未说明具体局限性 探索弥漫性大B细胞淋巴瘤的潜在致病基因并构建预后预测模型 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者 计算机视觉 淋巴瘤 eQTL-MR分析, 单细胞RNA测序, GO/KEGG富集分析, 免疫浸润分析, 药物敏感性分析 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
468 2026-07-10
POU2F2 as a dual oncogenic and immunomodulatory driver in kidney renal clear cell carcinoma
2026-Dec, Cell adhesion & migration IF:3.3Q3
研究论文 探讨POU2F2在肾透明细胞癌中的致癌和免疫调节作用 首次揭示POU2F2在肾透明细胞癌中兼具致癌和免疫调节双重功能,特别是通过影响巨噬细胞极化来调控肿瘤微环境 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本量未提及 研究转录因子POU2F2在肾透明细胞癌发生发展及肿瘤微环境免疫调节中的作用 肾透明细胞癌细胞系及肿瘤样本 自然语言处理 肾透明细胞癌 单细胞转录组学、空间转录组学、共培养实验 NA 图像 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
469 2026-07-10
Mitochondria-related pathogenic genes in acute and chronic kidney disease: a Mendelian randomization study
2026-Dec, Renal failure IF:3.0Q1
研究论文 利用基于汇总数据的孟德尔随机化方法探究线粒体相关基因与急性肾损伤和慢性肾病的潜在关联 首次通过SMR方法结合多组学数据(DNA甲基化、基因表达、蛋白表达)系统评估线粒体相关基因与AKI和CKD的因果关系 未明确说明,可能包括样本来源局限(主要为美国退伍军人)和效应量较小(如CKD保护基因OR 0.95) 利用SMR方法识别与急性肾损伤(AKI)和慢性肾病(CKD)相关的线粒体致病基因 线粒体相关基因(来自MitoCarta3.0数据库)及其多组学定量性状位点(mQTL、eQTL、pQTL) 机器学习 肾脏疾病(急性肾损伤、慢性肾病) NA NA 基因表达、甲基化、蛋白表达数据 美国百万退伍军人项目(发现数据集)和英国生物样本库(验证数据集)的汇总统计数据 NA NA NA NA
470 2026-07-10
Immune regulatory mechanisms and potential microbiota-associated targets in Kawasaki disease: an integrative multi-omics and network pharmacology study
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
研究论文 该研究采用整合多组学策略,系统调查川崎病中肠道微生物群-代谢物相互作用,并识别关键分子靶点 首次整合多组学分析、网络药理学和孟德尔随机化,揭示肠道微生物群-代谢物-SELP轴作为川崎病潜在治疗靶点 研究仍处于初步阶段,未明确提及具体限制信息 探索川崎病中肠道微生物群在免疫调节和炎症反应中的作用机制,并确定潜在干预靶点 川崎病患者的肠道微生物群、代谢物及免疫细胞相互作用 机器学习 川崎病 多组学分析、网络药理学、孟德尔随机化、单细胞转录组学、分子对接 机器学习模型 基因表达数据、微生物组数据、代谢组数据 未在标题和摘要中说明 NA NA NA NA
471 2026-07-10
Integrative genomic characterization of the FADS1-2-3 mood disorder risk locus: implications for the role of polyunsaturated fatty acids
2026-Nov-01, Journal of affective disorders IF:4.9Q1
研究论文 对FADS1-2-3情绪障碍风险位点进行整合基因组特征分析,探讨多不饱和脂肪酸在其中的作用 通过整合遗传共定位分析、跨群体变异注释及单细胞RNA-seq数据,优先将FADS1而非FADS2或FADS3确定为最可能的效应基因,并发现TMEM258和MYRF作为替代效应基因涉及N-糖基化和轴突髓鞘化等新型机制 未来需要采用正交方法进一步验证该位点中潜在的水平多效性来源 解析FADS1-2-3基因簇与情绪障碍(双相情感障碍和重度抑郁症)之间的遗传风险关联及潜在效应基因 FADS1-2-3情绪障碍风险位点及相关遗传变异 自然语言处理 情绪障碍(双相情感障碍、重度抑郁症) 全基因组关联研究、cis-eQTL分析、单细胞RNA-seq NA 基因型数据、表达数量性状位点数据 最大样本量达400万人的GWAS摘要统计数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
472 2026-07-10
Vesicular QSOX1-MMP2 from inflammatory cancer-associated fibroblasts degrades the extracellular matrix to drive colorectal cancer pulmonary dissemination
2026-Sep-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡携带QSOX1-MMP2复合物降解细胞外基质,驱动结直肠癌肺转移 首次发现炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡中QSOX1选择性富集,并能与MMP2结合促进其分泌和活性,从而重塑转移微环境 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证有限,且QSOX1抑制剂Ebselen的安全性需进一步评估 阐明结直肠癌肺转移中基质细胞介导的转移定植机制,并探索靶向QSOX1的治疗策略 结直肠癌肺转移小鼠模型中的炎性癌相关成纤维细胞及其分泌的细胞外囊泡 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 NA 基因表达数据, 蛋白质组数据 结直肠癌肺转移小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
473 2026-07-10
A multiperspective evaluation framework of spatial transcriptomics clustering methods
2026-Sep, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 提出一个多视角评估框架,用于系统评价空间转录组聚类方法 整合了前沿和传统的标签依赖与标签无关指标,提供统一灵活的评价策略,能够同时评估转录组和空间信息的整合效果 依赖合成数据集和现有数据集,可能无法涵盖所有实际应用场景,标签无关指标仍难以完全反映空间聚类方法的全部特征 开发统一框架以克服现有评估方法的局限性,实现空间转录组聚类方法的全方位、可重复评估 十一种深度学习空间域识别方法,在合成数据集和七种空间转录组技术所生成的十三个数据集上的表现 机器学习 NA 空间转录组学 深度学习 空间转录组数据 两个合成数据集和十三个来自七种空间转录组技术的数据集 NA 空间转录组学 NA NA
474 2026-07-10
The rituximab paradox in rheumatoid arthritis: Re-evaluating B-cell depletion depth and the synovial microenvironment
2026-Aug, Autoimmunity reviews IF:9.2Q1
research paper 重新评估类风湿关节炎中B细胞耗竭深度与滑膜微环境,解释利妥昔单抗临床悖论 提出类风湿关节炎治疗无需完全系统性B细胞清除,通过单细胞转录组学与纵向数据整合揭示“不完全耗竭”在维持组织免疫安全边际中的作用 NA 解释利妥昔单抗在类风湿关节炎中临床疗效与B细胞耗竭深度不一致的悖论,并提出未来治疗范式 类风湿关节炎患者及滑膜组织中的致病性B细胞-成纤维细胞相互作用 machine learning, digital pathology 类风湿关节炎 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据、纵向临床数据 来自REDO试验的纵向数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
475 2026-07-10
In vivo engineering tumor cells to a universal "all-in-one" cancer vaccine with full antigen spectrum
2026-Jul-10, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 开发了一种通用型“一体化”癌细胞衍生疫苗UniCVac,通过体内编程肿瘤细胞为抗原呈递细胞,实现全面抗原谱覆盖和T细胞直接激活 首次通过共递送CIITA、NLRC5、CD80和IL-2将肿瘤细胞编程为专业抗原呈递细胞,实现同时提供HLA-I和HLA-II抗原呈递、共刺激和T细胞增殖信号,并且不依赖传统抗原呈递细胞直接激活CD4和CD8 T细胞 研究中仅使用了小鼠模型,尚需在人类临床样本和临床试验中验证其有效性和安全性 开发一种通用型癌症疫苗,克服现有疫苗抗原覆盖有限、抗原呈递不足和免疫抑制微环境等挑战 肿瘤细胞、T细胞、小鼠肿瘤模型 机器学习 癌症(肿瘤) 单细胞转录组分析 NA 基因表达数据 小鼠模型中的预防性和治疗性肿瘤模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 通过单细胞转录组分析验证免疫细胞亚型相似性
476 2026-07-10
VCAM-1-targeting peptide assemblies protect vascular endothelium and prolong cardiac xenograft survival
2026-Jul-10, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞RNA测序,识别出VCAM-1内皮细胞亚群是心脏异种移植急性排斥的主要靶点,并开发了靶向VCAM-1的纳米颗粒,显著延长了异种移植物的存活时间 首次在猪到灵长类异种移植模型中通过单细胞RNA测序鉴定VCAM-1内皮细胞亚群为急性排斥关键亚型,并开发了整合VCAM-1靶向肽、自组装纳米纤维涂层和免疫抑制药物递送的多功能纳米颗粒 未在文中明确指出局限性,但可能包括研究仅基于猪到灵长类模型、样本量有限、长期效果和安全性需进一步验证 保护血管内皮细胞并延长心脏异种移植物的存活时间 猪到灵长类异种移植模型中的心脏内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量,但涉及猪到灵长类异种移植模型 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
477 2026-07-10
FLT3-ITD scaffolds PKCι-STAT1 to drive noncanonical S727 phosphorylation and CD276-driven CD8+ T-cell exhaustion in AML
2026-Jul-09, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究揭示FLT3-ITD通过支架PKCι-STAT1复合物驱动非经典S727磷酸化,上调CD276表达,导致AML中CD8+ T细胞耗竭 首次发现FLT3-ITD作为一种突变特异性支架蛋白,组装PKCι-STAT1三元复合物,介导STAT1 S727磷酸化而非经典Y701位点,驱动CD276转录,阐明其激酶非依赖性免疫抑制机制 研究主要基于体外和异种移植模型,临床样本验证规模有限(104例),且未深入探索其他可能的免疫调节机制 阐明FLT3-ITD在急性髓系白血病中激酶非依赖性免疫抑制机制 FLT3-ITD突变的急性髓系白血病患者样本、CD8+ T细胞 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、免疫共沉淀、染色质免疫沉淀、电泳迁移率变动分析、报告基因实验、多重免疫组化 NA 基因表达数据、流式细胞术数据 104例原发性患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
478 2026-07-10
T cell transfer into immunodeficient mice uncovers a paralytic phenotype beyond colitis
2026-Jul-09, Experimental animals IF:2.2Q1
研究论文 将CD45RB T细胞过继转移至免疫缺陷小鼠后,意外发现部分小鼠出现类似实验性自身免疫性脑脊髓炎的麻痹表型,而非仅结肠炎 首次报道T细胞过继转移模型中出现麻痹表型,揭示ex-Th17细胞在结肠炎和中枢神经系统自身免疫中的共同作用,并建立此模型为研究组织特异性自身免疫病理的平台 未明确列出,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异、机制研究的深度有限 探究T细胞过继转移诱导的结肠炎模型中意外出现的麻痹表型及其与中枢神经系统自身免疫的关联 免疫缺陷小鼠(如Rag-/-小鼠)以及克罗恩病和多发性硬化症患者的结肠和脑脊液样本 免疫学 炎症性肠病、多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞RNA-seq) 涉及小鼠实验及克罗恩病患者结肠样本、多发性硬化症患者脑脊液样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
479 2026-07-10
Integrative bulk and single-cell analyses implicate ASL in MIF-associated myeloid programs in glioblastoma
2026-Jul-09, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 通过整合性批量与单细胞分析,揭示ASL在胶质母细胞瘤中与MIF相关髓系免疫程序的关系 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据,系统鉴定ASL作为精氨酸代谢相关预后基因,并明确其在胶质母细胞瘤高危分子亚型(如IDH野生型和1p/19q非共缺失)中的作用,特别关联肿瘤微环境中的髓系免疫程序 研究主要基于公共数据库(TCGA、CGGA、GEO)和少量单细胞样本(5个),可能限制结果的普适性;ASL的具体功能机制和因果关系需进一步实验验证 阐明胶质母细胞瘤中精氨酸代谢相关基因的预后价值及其细胞特异性作用,尤其关注髓系细胞的免疫调节功能 胶质母细胞瘤患者的批量转录组数据(TCGA、CGGA、GEO)和单细胞RNA测序数据(5个样本) 数字病理学 脑癌 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 TCGA胶质母细胞瘤批量数据(样本数未明确);5个胶质母细胞瘤样本用于单细胞RNA测序,获得38,263个高质量细胞 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
480 2026-07-10
PAPSS2-mediated BMPR1A sulfation in stromal cells regulating endometrial decidualization via autophagy
2026-Jul-09, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 该论文研究了PAPSS2介导的BMPR1A硫酸化通过自噬调控子宫内膜间质细胞蜕膜化的机制 首次揭示了PAPSS2-BMPR1A硫酸化轴通过调控BMP2/SMAD信号和自噬稳态来微调蜕膜化这一先前未被识别的机制 需要更大样本量的进一步研究以确认体内相关性 阐明PAPSS2介导的硫酸化在复发性植入失败患者蜕膜化缺陷中的作用及机制 复发性植入失败患者和生育能力正常对照者的分泌中期子宫内膜组织,以及永生化人子宫内膜间质细胞和原代人子宫内膜间质细胞 数字病理学 不孕症 RNA-seq NA 转录组数据 复发性植入失败患者和生育能力正常对照者的子宫内膜组织样本(具体数量未详述) NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部