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当前共找到 9459 篇文献,本页显示第 4701 - 4720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4701 2026-06-23
Transcriptional programming of early-forming memory B cells arises independently of cognate CD4+ T-cell interactions
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 通过MHCII敲除小鼠模型,研究早期记忆B细胞在缺乏CD4+ T细胞相互作用下的转录编程机制 首次揭示早期记忆B细胞的转录编程独立于CD4+ T细胞相互作用,证明其在无T细胞辅助下仍可形成多样化群体 未分析T细胞非依赖记忆B细胞在长期免疫记忆维持中的功能差异 探究CD4+ T细胞相互作用对T细胞非依赖记忆B细胞分子编程和多样性的影响 流感病毒感染后形成的记忆B细胞 免疫学 流感感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 转录组分析 NA 基因表达数据 MHCII敲除小鼠与野生型小鼠的B细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
4702 2026-06-23
Mapping the Cell-Cell Interactions in Cardiovascular Diseases: A Single-Cell Atlas Perspective
2026-Apr-14, Korean circulation journal IF:3.0Q2
综述 基于单细胞图谱视角,综述心血管疾病中细胞间相互作用的改变及其发病机制 通过单细胞和空间转录组学技术系统构建人类心脏和血管细胞图谱,推断配体-受体分析介导的细胞间通讯,揭示疾病特异性信号通路改变 未提及具体局限性 总结心血管疾病中细胞间相互作用的主要变化,阐明失调信号网络在心肌病、心肌梗死和心力衰竭中的作用 心血管细胞(心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞和免疫细胞) 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
4703 2026-06-23
A Protocol for Harvesting Single-cell Suspension from Mouse Corneas
2026-Apr-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 建立了一种从小鼠角膜中制备高质量单细胞悬液的稳健方案 提出了一种独特的通过胶原酶A和胰蛋白酶顺序消化从小鼠角膜组织制备单细胞悬液的方法,确保了高细胞数量和优良活性 未提及局限性 解决角膜组织因结构致密而难以制备高质量单细胞悬液的问题 小鼠角膜 数字病理学 NA scRNA-seq, 胶原酶A消化, 胰蛋白酶消化 NA 单细胞悬液 多只小鼠角膜 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4704 2026-06-23
Mapping Infant Immunity with Minimal Input: Integrative Single-cell and Multiomic Profiling
2026-Apr-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 针对新生儿血量极少的限制,开发了优化方案,通过整合流式细胞术、蛋白质组学和单细胞RNA测序,从微量血液中获取高维度免疫数据,揭示早期生命免疫的独特轨迹 提出了利用极少量新生儿血液进行高维免疫分析的综合方案,实现了纵向采样和多组学整合,弥补了新生儿免疫研究中的关键空白 研究中提到的极低出生体重和极早早产儿的血液样本量限制仍然是挑战,且方案在更大人群中的验证可能受限于样本可获得性 建立从微量新生儿血液中进行高分辨率免疫分析的方法,揭示早期生命免疫系统的动态变化 新生儿血液中的循环免疫细胞 NA NA 流式细胞术、蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 转录组和蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4705 2026-06-23
Fibroblast-Driven Fibroblast Growth Factor and Fibronectin 1 Signaling Orchestrates Extracellular Matrix Remodeling for Ovine Mammary Lactation Decline
2026-Apr, Comprehensive Physiology IF:4.2Q1
研究论文 本研究整合了绵羊泌乳高峰和晚期单细胞RNA测序数据,揭示了成纤维细胞驱动的FGF和FN1信号通路在细胞外基质重塑和泌乳衰退中的作用 首次在绵羊乳腺中通过单细胞转录组学揭示成纤维细胞作为基质调控枢纽,通过FGF和FN1信号通路协调ECM重塑,并发现与人类保守的转录程序 未涉及功能验证实验,跨物种比较仅限于转录水平,缺乏对信号通路的直接干扰验证 阐明绵羊泌乳衰退过程中乳腺细胞外基质重塑的细胞和分子机制 泌乳高峰和晚期绵羊乳腺组织中的多种细胞类型,包括成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞 数字病理学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 未指定具体样本数量,但涉及泌乳高峰和晚期两个阶段的绵羊乳腺样本 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
4706 2026-06-23
Limited protection against early-life lung murine cytomegalovirus infection results from deficiency of cytotoxic CD8 T cells
2026-Apr, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 该研究通过小鼠巨细胞病毒呼吸道感染模型和过继性T细胞转移,揭示了早期生命阶段CD8 T细胞毒性缺陷导致抗病毒保护不足的机制 首次通过单细胞RNA测序分析早期生命阶段MCMV特异性CD8 T细胞的分化,发现新生儿期αβ T细胞普遍缺陷导致效应T细胞功能不全 研究基于小鼠模型,结果向人类CMV感染的转化需进一步验证 阐明早期生命阶段抗巨细胞病毒T细胞免疫的差异机制 新生和成年小鼠的呼吸道巨细胞病毒感染模型 数字病理学 巨细胞病毒感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本量 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
4707 2026-06-23
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出scGPD框架,利用单细胞RNA-seq数据设计用于靶向空间转录组学的基因组合 采用基因-基因相关性感知的门控机制,可从数据中提取信息特征并消除基因冗余,优于现有方法 未提及具体限制 开发用于空间转录组学的紧凑且非冗余基因组合设计方法 多样单细胞数据集和空间转录组数据 机器学习 NA RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学 深度学习 基因表达数据 多个单细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
4708 2026-06-23
Spatial-ZEDNet : a unified spatial transcriptomics framework for detecting differential gene activation and expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出Spatial-ZEDNet框架,统一检测空间转录组学中差异基因表达与激活 通过层级高斯随机场模型同时检测空间差异表达基因和差异激活基因,明确建模零膨胀问题,且无需空间坐标匹配即可对齐不同条件下的生物信号 模拟和实际应用中虽表现优异,但可能对复杂组织微环境的泛化性有限,且计算成本可能较高 开发一种统计严谨的方法,用于整合空间转录组学数据以检测暴露诱导的组织重塑中的差异基因调控 结肠炎和疟原虫感染数据集中的免疫基因表达与激活模式 数字病理学 结肠炎、疟疾 空间转录组学 高斯随机场 空间转录组数据 结肠炎和疟原虫感染数据集 NA 空间转录组学 NA NA
4709 2026-06-23
Causal modeling reveals cell-cell communication dynamics in the tumor microenvironment during anti-PD-1 therapy in breast cancer patients
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出因果推断框架scIVCCC,利用单细胞数据分析抗PD-1治疗前后乳腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯的动态变化 首次将治疗作为工具变量进行因果推断,识别出真正的细胞间通讯网络,区分混杂关联,揭示T细胞与肿瘤相关巨噬细胞的双重角色 未提及具体局限性 揭示免疫检查点阻断治疗如何通过细胞间通讯重塑肿瘤微环境,并确定潜在联合治疗靶点 31名乳腺癌患者治疗前后的单细胞RNA测序数据 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 因果模型 基因表达数据 31名乳腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4710 2026-06-23
GALA: a unified landmark-free framework for coarse-to-fine spatial alignment across resolutions and modalities in spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出GALA框架,一种无需标记点的统一方法,用于空间转录组学中不同分辨率和模态的粗到细空间对齐 引入遗传算法引导的大变形对齐框架,通过单一优化耦合全局仿射变换和局部微分同胚变形,实现无需标记点的多模态对齐 未提及具体局限性 解决空间转录组学对齐中因技术变异、几何畸变和平台差异导致的挑战,提供高效准确的对齐方法 空间转录组学数据 计算生物学 NA 空间转录组学 遗传算法、全局仿射变换、局部微分同胚变形 空间转录组学数据、组织学图像 多种人类和小鼠数据集 NA 空间转录组学 NA NA
4711 2026-06-23
[Shared mechanisms of obesity and male infertility and prediction of natural therapeutics based on machine learning and single-cell sequencing]
2026-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
研究论文 利用生物信息学和机器学习方法,结合单细胞测序数据,揭示肥胖与男性不育的共病机制,并预测具有治疗潜力的天然化合物及中药 首次整合多组学数据、三种机器学习算法(随机森林、LASSO回归、支持向量机)及单细胞测序,系统揭示肥胖与男性不育在免疫炎症调控和细胞分化功能障碍方面的共病机制,并基于CMap数据库和TCMSP平台构建“靶点-天然化合物-草药”网络,为精准中医药干预提供新思路 研究基于公共数据库分析,缺乏独立外部验证和体内外实验验证;预测的天然化合物和中药需进一步临床验证 探索肥胖与男性不育的共病分子机制,并预测天然化合物和中药的潜在治疗价值 肥胖患者脂肪组织和男性不育患者睾丸组织的单细胞测序数据,以及GEO数据库中的相关批量转录组数据 机器学习 男性不育 单细胞测序 随机森林, LASSO回归, 支持向量机 基因表达数据, 单细胞转录组数据 GEO数据库的批量转录组数据集及单细胞测序数据集,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4712 2026-06-23
TIM-4+ skeletal muscle Resident Tissue Macrophages Ferroptosis mediated Rhabdomyolysis in Exertional Heatstroke
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 揭示了TIM-4+骨骼肌驻留巨噬细胞铁死亡介导劳力性中暑相关横纹肌溶解的免疫代谢机制 首次发现TIM-4+骨骼肌驻留巨噬细胞通过HMOX1依赖的铁死亡途径驱动劳力性中暑时的横纹肌溶解,并阐明JunD-Olfr2-NLRP3-IL-1β信号轴的核心作用 未充分验证结果在人类中的可重复性,且对铁死亡与NLRP3炎症小体交互作用的机制细节尚未完全阐明 阐明骨骼肌驻留巨噬细胞在劳力性中暑相关横纹肌溶解中的功能机制 小鼠模型中的TIM-4+骨骼肌驻留巨噬细胞 数字病理学 骨骼肌疾病 单细胞RNA测序、基因敲除、药理学调控、染色质分析 NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
4713 2026-06-23
Macrophage NEDD4L restrains liver fibrosis by preventing scar-associated macrophage expansion via ubiquitination of phospho-SMAD3
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
research paper 本研究揭示了巨噬细胞中的E3泛素连接酶NEDD4L通过泛素化磷酸化SMAD3抑制疤痕相关巨噬细胞扩增,从而缓解肝纤维化的机制 首次发现NEDD4L在巨噬细胞中通过泛素化降解p-SMAD3限制TGF-β1/SMAD3信号通路,进而抑制促纤维化SAM的扩增,为肝纤维化治疗提供了新的潜在靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本相关性分析尚不够深入,需要更多临床验证 探究巨噬细胞中NEDD4L在肝纤维化发展中的作用及其分子机制 肝纤维化小鼠模型及人类肝纤维化患者肝脏样本 machine learning liver fibrosis 单细胞RNA测序、转录组分析、泛素化实验 NA 基因表达数据 人类和小鼠纤维化肝脏样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
4714 2026-06-23
DHCR24 Deficiency Drives Age-Related Meibomian Gland Dysfunction by Regulating Lipid Metabolic Imbalance and Cytosolic mtDNA-Induced cGAS-STING Activation
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 通过多组学筛选发现DHCR24缺失通过脂质代谢失衡和胞质mtDNA激活cGAS-STING通路驱动年龄相关性睑板腺功能障碍 首次揭示DHCR24作为双重靶点调控因子,同时维持胆固醇代谢稳态并抑制mtDNA驱动的cGAS-STING炎症通路,为年龄相关性睑板腺功能障碍提供潜在治疗靶点 主要基于小鼠模型和体外细胞实验,缺乏人体组织验证;AAV介导的DHCR24恢复治疗的安全性和长期效果尚未评估 阐明年龄相关性睑板腺功能障碍的关键分子驱动机制 老年小鼠睑板腺及睑板腺细胞(meibocytes) 数字病理学 老年性疾病 单细胞测序、多组学分析 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、影像数据 老年小鼠睑板腺组织样本,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4715 2026-06-23
Oligodendrocyte-secreted ERBB3 Mediates the Competitive Uptake of Copper Ions by Tumor Cells to Promote Brain Metastasis in Lung Cancer
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 揭示少突胶质细胞分泌的ERBB3通过竞争性结合肿瘤细胞上的SLC31A1促进铜离子摄取,从而驱动肺癌脑转移的机制 首次发现少突胶质细胞通过分泌ERBB3作为铜伴侣蛋白,竞争性结合SLC31A1促进铜离子向肿瘤细胞转移,揭示了脑转移微环境中胶质细胞与肿瘤细胞的铜信号交互新机制 目前尚未明确ERBB3介导的铜转运是否在其他肿瘤脑转移中具有普遍性,以及该机制在临床转化中的潜在副作用 阐明少突胶质细胞在肺癌脑转移中的功能作用及分子机制 肺癌脑转移临床标本和动物模型中的少突胶质细胞及肿瘤细胞 分子生物学 肺癌 单细胞RNA测序、功能基因组学、机制研究 NA 基因表达数据 临床标本和动物模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
4716 2026-06-23
RUNX2 enhances vascular remodeling to promote endothelial proliferation in acute liver injury
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探究了RUNX2在急性肝损伤后通过血管重塑促进内皮细胞增殖的作用机制,揭示了其在肝内皮细胞再生中的关键角色 首次发现RUNX2在内皮祖细胞中显著富集,并通过调控Lrp1、Gadd45b等靶基因促进肝内皮细胞再生,揭示了急性肝损伤后血管重塑的新分子机制 未明确说明限制因素 明确急性肝损伤后内皮祖细胞的再生能力及RUNX2在其中的作用机制 小鼠肝内皮细胞和慢性肝病患者的内皮细胞 机器学习 肝病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用TAA诱导急性肝损伤的小鼠模型及Runx2杂合子小鼠,以及慢性肝病患者的内皮细胞样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
4717 2026-06-23
A SUMOylation/immune-related gene signature predicts the prognosis and immunotherapy efficacy of patients with triple-negative breast cancer
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 构建一个结合SUMOylation和免疫相关基因的预后模型,用于预测三阴性乳腺癌患者的预后和免疫治疗效果 首次将SUMOylation修饰与免疫相关基因结合,通过多种机器学习方法构建风险预后模型,并利用单细胞测序进行分析 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏大规模独立外部验证队列;模型基因的功能机制有待进一步实验验证 开发一个基于SUMOylation和免疫相关基因表达的生存预测模型,以指导三阴性乳腺癌患者的个性化治疗策略 三阴性乳腺癌患者 机器学习 三阴性乳腺癌 RNA-seq, 单细胞测序, qRT-PCR, 免疫组化 LASSO, SVM-RFE, 随机森林 基因表达数据 来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌患者样本 NA RNA-seq NA NA
4718 2026-06-23
Multiomics Biomarkers for Differential Diagnosis of Pleural Effusion: Integration of Proteomic Markers and Single-Cell Transcriptomics
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 整合蛋白质组标志物与单细胞转录组学分析,建立胸腔积液鉴别诊断的多组学生物标志物模型,并揭示疾病特异性免疫机制及突变驱动的治疗机会 首次将蛋白质组生物标志物、单细胞转录组学与基因组突变谱整合,构建顺序多标志物算法,实现胸腔积液高准确度鉴别诊断,并发现EGFR突变与免疫抑制微环境的关联 单中心研究设计、样本量相对有限(564例),且未对诊断模型进行外部验证 评估整合蛋白质组标志物、单细胞转录组学与基因组突变谱对胸腔积液鉴别诊断的准确性及机制解析能力 胸腔积液患者(包括炎性、结核性及恶性胸腔积液) 计算生物学 胸腔积液 单细胞RNA测序、靶向下一代测序(NGS)、蛋白质标志物检测 顺序多标志物算法 基因表达数据、突变数据、蛋白质标志物浓度数据 564例胸腔积液患者(炎性95例,结核性299例,恶性170例) Illumina 单细胞RNA测序、靶向测序 Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序和靶向下一代测序(涵盖15个癌症相关基因)
4719 2026-06-23
Single-cell extracellular vesicle-program scoring maps immunometabolic rewiring and immune crosstalk of mesenchymal stromal cells in intervertebral disc degeneration, prioritizing AP2S1 and CSTB
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,研究间充质干细胞来源的细胞外囊泡相关转录程序在椎间盘退变中的免疫代谢重编程和免疫串扰作用,并优先考虑AP2S1和CSTB 首次在单细胞分辨率下描绘间充质干细胞胞外囊泡相关程序,并将其置于免疫通信和免疫代谢框架中,通过共识LASSO/SVM-RFE工作流程优先考虑候选调控因子 未提及 了解间充质干细胞胞外囊泡相关转录程序在椎间盘退变中的免疫代谢重编程和免疫串扰作用 椎间盘退变患者的髓核样本中的间充质干细胞 机器学习 椎间盘退变 单细胞RNA测序,RT-qPCR LASSO,SVM-RFE 基因表达数据 8个椎间盘退变样本和3个对照髓核样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4720 2026-06-23
Machine learning integration of bulk and single-cell RNA-Seq data reveals COPS2 as a central immune regulator in deep vein thrombosis
2026, American journal of translational research IF:1.7Q4
研究论文 通过机器学习和多组学整合分析,揭示COPS2是深静脉血栓中的关键免疫调节因子 首次利用蛋白质组全孟德尔随机化、免疫细胞介导分析、批量与单细胞转录组学及机器学习相结合的多组学策略,系统性鉴定COPS2在深静脉血栓中的免疫-内皮交互调控作用,并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、功能验证仅在内皮细胞中进行、动物模型与人类的差异等 识别深静脉血栓中失调的免疫-内皮交互的上游分子调控因子 深静脉血栓(DVT)患者及动物模型中的血浆蛋白、免疫细胞(效应记忆CD8 T细胞)和内皮细胞 机器学习 深静脉血栓 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 机器学习模型 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 多个独立队列 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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