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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4661 | 2026-05-02 |
Integrative Machine Learning and Experimental Validation Identify MYBL2 as a Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Hepatocellular Carcinoma
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075284
PMID:42065054
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research paper | 通过整合机器学习和实验验证,确定MYBL2作为肝细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点 | 系统验证了MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,利用多种机器学习及实验技术,并揭示了miR-29a对MYBL2的调控机制 | 研究主要基于公开数据集和有限体外实验,临床应用验证不足 | 验证MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,阐明其功能及上游调控机制 | 肝细胞癌样本、细胞系及小鼠模型 | machine learning | liver cancer | RNA-seq, single-cell transcriptomics, iTRAQ proteomics, CRISPR knockout | LASSO | transcriptomic data, proteomic data, clinical data | TCGA和GEO队列样本 | Illumina | RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA和GEO平台的RNA-seq数据 |
| 4662 | 2026-05-02 |
Identify MTDH as a Key Gene of Radio-Resistance in Colorectal Cancer Based on Multi-Omics and Experimental Validation
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075314
PMID:42065055
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research paper | 基于多组学和实验验证,确定MTDH为结直肠癌放疗抵抗的关键基因 | 结合14种机器学习算法和SHAP可解释性分析,从多组学数据中识别MTDH与放疗抵抗的关联,并通过单细胞RNA测序和临床样本验证其在恶性二倍体单细胞亚群中的上调表达 | 未提及具体局限性 | 探究MTDH在结直肠癌放疗抵抗中的精确作用机制 | MTDH基因及其在结直肠癌放疗抵抗中的作用 | machine learning | colorectal cancer | RNA-seq, single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data, single-cell transcriptomic data | 82名直肠癌患者的组织样本 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4663 | 2026-05-02 |
Navigating the Labyrinth of Hepatocellular Carcinoma: Leveraging AI/ML for Precision Oncology
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074185
PMID:42065059
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综述 | 系统评估人工智能与机器学习在肝细胞癌精准肿瘤学中整合多组学数据、识别生物标志物和优化治疗决策的作用 | 创新性提出了AI驱动框架在解码肿瘤微环境相互作用和空间异质性中的转化潜力,特别是结合空间转录组学、数字病理学和单细胞技术的综合策略 | 文中未明确讨论具体局限,但综述性质可能受限于当前AI模型的可解释性、数据标准化及临床验证不足 | 评估AI/ML作为整合工具在肝细胞癌管理中转化高维多组学数据为临床可操作见解的能力 | 肝细胞癌的分子靶点、组合治疗策略、多组学数据(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学) | 机器学习 | 肝癌 | NA | NA | 文本、图像(数字病理学)、空间转录组学数据、单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 数字病理学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4664 | 2026-05-02 |
CDKN1A/p21 Influences the Survival and Expansion of Breast Cancer Stem Cells after Oxidative Damage
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074965
PMID:42065068
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研究论文 | 本研究探讨了CDKN1A/p21在氧化损伤后乳腺癌干细胞存活与扩增中的作用 | 首次揭示CDKN1A/p21通过直接结合CD44、SPP1和TMSB10启动子调控其表达,影响乳腺癌干细胞存活,为克服治疗耐药和转移提供了新靶点 | 研究主要基于体外三维模型,缺乏体内验证,且未深入探讨p21调控的具体信号通路机制 | 探索CDKN1A/p21在乳腺癌干细胞存活和扩增中的功能及其分子机制 | 乳腺癌干细胞(BCSCs) | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学,染色质免疫沉淀定量PCR | NA | 图像,文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于基因表达谱分析 |
| 4665 | 2026-05-02 |
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third-trimester pregnancy
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70096
PMID:42065097
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研究论文 | 利用多组学技术研究妊娠晚期CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组变化 | 首次通过高维多组学方法(包括流式细胞术和单细胞RNA测序结合CITE-seq)系统分析了妊娠晚期外周血和蜕膜中CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组,揭示了IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 | 研究仅针对足月妊娠(>37周),未涵盖早孕期或中孕期;样本量较小;未对非妊娠对照组进行纵向追踪 | 理解妊娠期CD4+ T细胞的表面蛋白表达和转录组变化,为胎盘发育和妊娠并发症的免疫调节提供机制见解 | 足月妊娠(>37周)女性的外周血和蜕膜中的CD4+ T细胞以及非妊娠女性的外周血CD4+ T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 妊高症、胎儿生长受限、死产 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CITE-seq | NA | 蛋白质表达数据、转录组数据 | 足月妊娠女性与非妊娠女性(具体数量未明确提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、CITE-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序结合CITE-seq抗体(>130种条形码抗体) |
| 4666 | 2026-05-01 |
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218465
PMID:41912135
|
研究论文 | 通过分析80,000多个RNA-seq样本的HOX基因表达,发现HOX代码能够跨癌种区分谱系受限和谱系可塑性状态,并揭示RUNX1T1-HDAC轴作为可治疗靶点 | 首次建立基于HOX代码的跨癌种谱系可塑性分类框架,发现RUNX1T1作为跨谱系可塑性调节因子,并验证HDAC3抑制可作为治疗策略 | 未明确提及,但可能包括机制验证主要基于前列腺癌模型,以及临床验证样本范围的潜在限制 | 探索HOX代码作为跨癌种谱系可塑性生物标志物的可行性,并鉴定潜在治疗靶点 | 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病的谱系可塑性亚型及相关细胞模型 | 机器学习 | 前列腺癌、肺癌、急性髓系白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&RUN, 共免疫沉淀, 脂质纳米颗粒 | 人工智能结构建模 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 染色质图谱数据 | 超过80,000个RNA-seq样本,涵盖23种癌症类型的114个亚型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4667 | 2026-05-01 |
AMPK-p38 axis converts human pluripotent stem cells to naive state
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115569
PMID:42058906
|
研究论文 | 本研究发现AMPK-p38轴可单独诱导人类多能干细胞(hPSCs)从始发态向原始态转化,并揭示了中间状态细胞的特征 | 首次发现AMPK/p38通路单因子即可驱动始发态hPSC向原始态转变,无需多种外源因子;通过scRNA-seq与RNA速率分析揭示了始发态与原始态之间的中间细胞状态 | 未提及具体局限性,可能需要进一步验证AMPK-p38通路的长期稳定性和安全性 | 探索将人类多能干细胞从始发态高效转化为原始态的新机制与简化方法 | 人类多能干细胞(hPSCs)在始发态与原始态之间的转化过程及中间状态细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,研究基于细胞系实验及单细胞分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序,结合RNA速率分析和Totem轨迹映射分析中间状态 |
| 4668 | 2026-05-01 |
Single-Cell Profiling Reveals Divergent Mechanisms of Fibrosis in Localized Scleroderma and Systemic Sclerosis
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70039
PMID:41451447
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化的不同机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较两种纤维化疾病的机制差异,发现局限性硬皮病中三级淋巴结构驱动的局部免疫激活,而系统性硬化症中CREB3L1高表达成纤维细胞的系统性活化 | 样本量较小(每组仅3例患者),且未进行大规模队列验证 | 阐明局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化差异的分子机制 | 皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病患者、3例系统性硬化症患者)及小鼠模型 | 数字病理学 | 纤维化疾病(局限性硬皮病、系统性硬化症) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9例皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病、3例系统性硬化症) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 4669 | 2026-05-01 |
Transcriptomics analyses reveal microgravity triggers estrogen synthesis amidst degeneration and aging in human ovarian granulosa cells
2026-May, Life sciences in space research
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.lssr.2025.12.002
PMID:42056751
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研究论文 | 通过转录组学分析揭示微重力诱发人卵巢颗粒细胞退化和衰老过程中的雌激素合成 | 首次系统表征微重力对人卵巢颗粒细胞的多方面影响,包括细胞骨架、线粒体功能和雌激素合成相关过程的破坏,并鉴定抗衰老化合物如雷帕霉素作为潜在干预措施 | 由于测序数据稀缺,机制研究和干预开发受到限制,且研究仅在体外进行 | 探究微重力对人卵巢颗粒细胞的影响及其对生殖内分泌健康的潜在机制 | 人卵巢颗粒细胞 | 转录组学 | 生殖内分泌疾病 | 转录组学分析、单细胞转录组学解卷积分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4670 | 2026-05-01 |
Methylene blue restores NAD+/NADH homeostasis to attenuate Achilles tendinopathy via activating AIF/Mitochondrial respiratory chain complex I
2026-May, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2026.101085
PMID:42058931
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research paper | 本研究探讨亚甲蓝通过恢复NAD+/NADH稳态缓解跟腱病的机制,并发现其通过激活AIF/线粒体呼吸链复合体I发挥作用 | 首次揭示亚甲蓝靶向NAD代谢通过AIF驱动的线粒体修复机制促进线粒体复合体I生物合成,为老药新用提供转化医学范例 | 未提及具体研究局限性 | 研究NAD代谢失调在跟腱病中的作用,评估亚甲蓝恢复NAD稳态和缓解跟腱病的疗效 | 人类跟腱组织、大鼠实验性跟腱病模型、大鼠原代跟腱细胞 | machine learning | geriatric disease | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类跟腱组织和大鼠跟腱样本,具体数量未提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4671 | 2026-05-01 |
Clec3b⁺ fibroblasts are the primary effectors of portal fibrosis following activation via a KLF4/periostin axis
2026-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72394-9
PMID:42056126
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪,鉴定Clec3b⁺成纤维细胞为门脉纤维化的主要效应细胞,并揭示KLF4/Periostin轴调控其活化 | 首次明确Clec3b⁺成纤维细胞是胆道损伤后门脉纤维化的主要效应细胞,并发现KLF4/Periostin信号轴是调控其活化的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类疾病,且未涉及其他慢性肝病中的门脉纤维化机制 | 探究胆道疾病中门脉纤维化的细胞和分子机制,特别是寻找关键效应细胞和调控通路 | 小鼠模型中的门脉成纤维细胞,特别是Clec3b⁺成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本,具体数量文中未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于小鼠门脉成纤维细胞分析 |
| 4672 | 2026-05-01 |
Spatial transcriptomic mapping of canine osteosarcoma reveals immune microenvironment features linked to survival
2026-Apr-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10152-9
PMID:42056464
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研究论文 | 利用空间转录组技术绘制犬骨肉瘤的免疫微环境图谱,揭示与生存相关的特征 | 首次使用10x Genomics Visium平台对犬骨肉瘤进行空间转录组分析,结合单细胞数据解卷积,识别与生存相关的免疫细胞空间共定位模式 | 样本量较小(11只犬的14个肿瘤样本),未提及技术重复或批次效应校正 | 探究犬骨肉瘤肿瘤内异质性和肿瘤微环境的空间特征,识别与生存相关的免疫微环境特征 | 11只犬的14个骨肉瘤肿瘤样本(包括原发、转移和复发肿瘤),按生存结果分层 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 11只犬的14个肿瘤样本,共18,834个组织斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium平台用于新鲜冷冻犬骨肉瘤组织切片的空间基因表达分析 |
| 4673 | 2026-05-01 |
Targeting GPR34 in damage-associated macrophages enhances anti-tumor immunity and the efficacy of Surufatinib in pancreatic cancer
2026-Apr-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02641-4
PMID:42045172
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别出高表达GPR34的损伤相关巨噬细胞亚群,并证明靶向GPR34可增强胰腺癌抗肿瘤免疫和索凡替尼疗效 | 首次在胰腺癌中发现GPR34+损伤相关巨噬细胞亚群,揭示其通过释放LysoPS促进CXCL16分泌和胞葬作用导致CD8 T细胞耗竭的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,尚需进一步的临床试验验证 | 探究靶向GPR34在胰腺癌免疫治疗中的潜在价值 | 胰腺导管腺癌患者标本、Gpr34小鼠模型及体外共培养体系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受索凡替尼联合化疗的患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4674 | 2026-05-01 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Apr-22, Free radical biology & medicine
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综述 | 探讨中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中旁观者组织损伤的作用机制 | 整合了氧化还原蛋白质组学、空间转录组学、活体成像和单细胞分析等最新技术,揭示了中性粒细胞氧化损伤并非不可规避的炎症副产物,而是动态、情境依赖且具有治疗靶向潜力的过程 | 未明确指出具体的实验数据或临床验证,属于文献综述,缺乏原创实验证据 | 综述中性粒细胞氧化自由基生物学在胃肠道黏膜中的知识,评估减轻旁观者损伤同时保留宿主防御的治疗策略 | 中性粒细胞及其在炎症性肠病中产生的活性氧和活性氮物种 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 氧化还原蛋白质组学, 空间转录组学, 活体成像, 单细胞分析 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序系统 |
| 4675 | 2026-05-01 |
Metabolic reprogramming and signalling networks in microglial activation: Implications for neurodegeneration
2026-Apr-22, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103138
PMID:42031319
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评论 | 综述小胶质细胞激活中的代谢重编程和信号网络,及其在神经退行性疾病中的作用 | 提出将小胶质细胞激活视为代谢-炎症整合网络,并强调炎症消退失败而非持续激活是慢性神经炎症的关键 | 代谢抑制剂的临床不可行性,需转向TREM2免疫调节剂和消退激动剂 | 整合单细胞转录组学、空间蛋白质组学和代谢组学,提供小胶质细胞激活的综合视角 | 小胶质细胞,特别是疾病相关小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4676 | 2026-05-01 |
Deciphering IFN signaling in gastric cancer: A single-cell and bulk transcriptomic integration reveals CXCR4 as a key immunomodulator and prognostic determinant
2026-Apr-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102778
PMID:42019279
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学整合,解析胃癌中干扰素信号通路,发现CXCR4作为关键免疫调节因子和预后决定因子 | 首次在单细胞分辨率下深入解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号网络,并识别出CXCR4作为与干扰素信号紧密相关的关键免疫调节因子和预后生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和体外细胞实验,缺乏体内验证和临床队列的进一步证实 | 解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号通路的作用,识别可干预的靶点以优化免疫治疗策略 | 胃癌患者的肿瘤组织样本及AGS胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术、CCK-8、Transwell、划痕实验 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌患者样本数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4677 | 2026-05-01 |
Single-Cell sequencing investigation of endoplasmic reticulum stress-related genes in gastric cancer prognostic models and identification of NOX5 as a novel therapeutic target
2026-Apr-20, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102780
PMID:42013548
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研究论文 | 利用单细胞测序研究内质网应激相关基因在胃癌预后模型中的作用,并鉴定NOX5为新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析构建基于内质网应激的胃癌预后模型,并发现NOX5作为新潜在治疗靶点 | NA | 开发基于单细胞分析的内质网应激相关预后标志物,并鉴定潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和MKN-45 | 机器学习,自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4678 | 2026-05-01 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
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研究论文 | 提出一种名为Locat的框架,通过联合评估单细胞转录组数据中基因表达的富集和缺失,识别高度特异性的局部化标记基因 | 传统方法仅关注基因在候选群体内的富集,Locat同时检测表达在群体外是否显著缺失,并整合两者形成统一的局部化评分 | NA | 开发一种新的统计框架,以识别单细胞转录组数据中具有高度空间特异性的标记基因 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4679 | 2026-05-01 |
Spatial Transcriptomics and Dual Dye Mapping Identify Wnt-Driven BBB Protection in Endothelial EphA4-Deficiency
2026-Apr-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9261231/v1
PMID:41994141
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研究论文 | 通过空间转录组学和双染料标记技术,揭示EphA4缺失内皮细胞中Wnt信号驱动的血脑屏障保护机制 | 首次结合双染料标记系统与空间转录组学,解析创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的时空动态及EphA4/Wnt信号通路的作用 | 未明确说明局限性 | 研究创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的分子和空间特征,以及EphA4/Wnt信号在保护血脑屏障中的作用 | 内皮细胞特异性EphA4基因敲除小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学, 双染料标记, 免疫组化 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠样本,具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4680 | 2026-05-01 |
Defining the RNA Modification Landscape of Multiple Myeloma Reveals METTL3-Dependent m6A Regulation of NEAT1
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716518
PMID:41993494
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研究论文 | 通过整合质谱、Nanopore直接RNA测序和甲基化RNA免疫沉淀测序,定义了多发性骨髓瘤的RNA修饰景观,并揭示了METTL3依赖的m6A修饰对NEAT1的调控作用 | 首次系统描绘多发性骨髓瘤中RNA修饰的全景图谱,发现了超过15000个m6A位点,并鉴定了m6A修饰的长链非编码RNA NEAT1在疾病中的关键调控作用 | 未明确提及研究的局限点 | 解析多发性骨髓瘤中的RNA修饰图谱及m6A修饰的长链非编码RNA在疾病中的作用机制 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 质谱, Nanopore直接RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞样本 | Oxford Nanopore Technologies | Nanopore直接RNA测序, 单细胞RNA测序 | Nanopore测序平台 | Nanopore直接RNA测序用于鉴定RNA修饰类型和m6A位点 |