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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-09-21 |
Therapeutic strategy for cervical gastric-type adenocarcinoma by targeting CLU to relieve CLU-associated stress and sensitize chemotherapy
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbag003
PMID:41878236
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，揭示了宫颈胃型腺癌（GAS）中CLU相关热应激的关键细胞亚群及其促进免疫逃逸的机制，并基于肿瘤类器官验证了靶向CLU联合顺铂的治疗策略 | 首次构建了GAS来源的肿瘤类器官，揭示了CLU相关热应激在GAS恶性微环境和免疫逃逸中的关键作用，建立了四基因预后标志物（CLU、PDGFB、TIGIT、C3），并提出了靶向CLU联合化疗的新治疗策略 | 单细胞RNA测序样本量较小（仅3例GAS和2例UEA），验证队列样本量有限，需要更大规模的多中心研究进一步验证 | 探索宫颈胃型腺癌的致癌机制和有效治疗靶点 | 宫颈胃型腺癌（GAS）患者和宫颈腺癌（ADC）患者 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、免疫组化染色、多色免疫组化染色 | 肿瘤类器官模型 | 图像、文本 | 172例患者（19例NHPVA和153例HPVA ADC）用于临床病理分析，3例GAS和2例UEA用于单细胞测序，25例GAS和25例UEA用于免疫组化验证，2例GAS用于多色免疫组化验证，GAS来源的肿瘤类器官用于药物实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5'（包含V(D)J富集） |
| 442 | 2026-09-21 |
Mapping kinase-dependent tumor immune adaptation with multiplexed single-cell CRISPR screens
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698516
PMID:41542636
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研究论文 | 该研究通过结合多重单细胞CRISPR筛选与胶质母细胞瘤（GBM）-T细胞共培养体系，系统解析了激酶依赖的肿瘤免疫适应机制，并利用深度生成模型分析扰动效应，揭示了免疫逃逸的关键模块及潜在激酶靶点 | 开发了整合CRISPRi/a、抗原特异性T细胞共培养与多重单细胞转录组学的高通量筛选框架，并利用深度生成模型解析CRISPR筛选数据，实现了对肿瘤免疫适应连续转录轨迹的精细剖析 | 摘要中未明确提及样本量及技术平台细节，且研究局限于GBM的体外模型，体内验证及临床转化潜力尚待进一步评估 | 绘制肿瘤内在激酶调控T细胞免疫压力的图谱，系统解析免疫逃逸与生存机制 | 胶质母细胞瘤（GBM）细胞与NY-ESO-1抗原特异性同种异体T细胞的共培养体系 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR干扰/激活（CRISPRi/a）筛选、单细胞转录组测序、化学筛选 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据、CRISPR筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选 | NA | NA |
| 443 | 2026-09-21 |
Souporcell3: robust demultiplexing for high-donor single-cell RNA-seq datasets
2026-02-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag117
PMID:41808435
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研究论文 | 本文提出Souporcell3，一种用于高供体单细胞RNA-seq数据解复用（demultiplexing）的增强方法，可处理多达64个供体 | 使用10× merge进行初始化，K-Harmonic Means进行稳健聚类，并通过迭代优化重新初始化低质量簇并锁定高质量簇，完全消除了错误合并的簇，在不同双细胞率下保持高调整兰德指数（ARI） | 摘要中未明确提及限制 | 解决高供体数量下单细胞RNA-seq数据解复用的准确性和可扩展性问题 | 混合的单细胞RNA-seq数据，来自多个供体（最多64个） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | K-Harmonic Means聚类 | 文本（基因表达数据） | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 444 | 2026-09-21 |
A Multi-Omics and machine learning platelet-related prognostic signature in multiple myeloma
2026-Feb-28, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-06867-8
PMID:41762247
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研究论文 | 该研究结合血小板活化的临床评估与多发性骨髓瘤细胞系共培养实验，并通过批量及单细胞转录组数据的多组学分析，构建了一个13基因的血小板相关预后模型，用于多发性骨髓瘤的风险分层。 | 首次系统性地将血小板功能与多发性骨髓瘤进展相关联，利用单细胞RNA测序发现异常的红系-巨核细胞成分及功能失调的血小板活性，并通过116种算法的综合生物信息学筛选，确定了前向逐步Cox回归与Ridge回归联合模型作为最优模型，建立了13基因血小板相关预后标志。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 评估血小板在多发性骨髓瘤中的功能，验证血小板相关基因（PRGs）在多发性骨髓瘤患者中的预后价值，为多发性骨髓瘤的诊疗开发提供新思路。 | 多发性骨髓瘤患者及多发性骨髓瘤细胞系（RPMI8226、MM.1S）。 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 前向逐步Cox回归，Ridge回归 | 基因表达数据，临床数据 | 多个公共数据集（GSE124310、GSE6477、TCGA-MM数据、GSE4581、GSE24080、GSE136337）中的多发性骨髓瘤样本，具体样本量未在摘要中明确说明。 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2026-09-21 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
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研究论文 | 该研究通过对颈动脉内膜剥脱术患者的纤维性动脉粥样硬化斑块进行组织学、蛋白质组、转录组、单细胞转录组和DNA甲基化分析，揭示了女性和男性纤维斑块在分子和细胞机制上的差异 | 首次系统性地揭示了女性和男性终末期纤维性动脉粥样硬化斑块在临床和分子特征上的差异，发现女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的ECM重塑、TGF-β反应和内皮-间质转化为特征，而男性斑块则与巨噬细胞介导的炎症相关，并通过实验验证了TGF-β诱导的内皮-间质转化和ECM重塑可被SMAD3抑制部分逆转 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究组织学确定的纤维性斑块在男性和女性之间的分子驱动机制是否存在差异，并从分子角度理解斑块侵蚀的机制，为动脉粥样硬化治疗提供靶点 | 来自Athero-Express生物库的颈动脉内膜剥脱术患者的终末期动脉粥样硬化斑块，包括1889个斑块（1309个男性和580个女性） | 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, DNA methylation sequencing, spatial transcriptomics | NA | image, text | 1889个动脉粥样硬化斑块（1309个男性和580个女性），其中纤维性斑块患者对比动脉粥样斑块患者（n=494） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, DNA methylation sequencing, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 446 | 2026-09-21 |
Circulating tumor cells in myeloma are a compound biomarker for bone marrow high-risk genomic alterations and tumor load
2026-Feb-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030083
PMID:41411148
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学和全基因组测序分析新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本，揭示循环肿瘤细胞是骨髓高危基因组改变和肿瘤负荷的复合生物标志物 | 首次在单克隆水平上证明CTC与配对骨髓细胞转录组相似，无独特循环群体；发现高CTC水平患者骨髓瘤细胞增殖增加且原发性遗传事件不平衡；建立了预测遗传改变和肿瘤负荷对CTC水平影响的模型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究CTC相关病理生物学是否由特定CTC亚群驱动，以及异质性基因组事件对CTC水平的影响 | 新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本，以及Multiple Myeloma Research Foundation CoMMpass数据集 | digital pathology | 多发性骨髓瘤 | single-cell transcriptomics, whole-genome sequencing, whole-exome sequencing, bulk RNA sequencing | NA | 图像, 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 447 | 2026-09-21 |
A non-canonical role of Myc in programming basal cells as sentinels of upper airway immunity during influenza infection
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696065
PMID:41509430
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研究论文 | 该研究利用小鼠模型、成像和单细胞转录组学，揭示了甲型流感病毒感染上呼吸道后，基底细胞通过MYC依赖的CXCL10-CXCR3轴协调黏膜修复并招募CD8 NKT样效应细胞的机制 | 首次发现Myc在KRT5基底祖细胞中发挥非经典作用，即程序化基底细胞作为上气道免疫哨兵，通过MYC依赖的CXCL10-CXCR3轴协调急性修复并招募细胞毒性效应细胞；同时发现了一种此前未被识别的上皮内CD8 NKT样效应细胞群体 | 研究基于小鼠模型，其结论在人类上呼吸道感染中的适用性仍需进一步验证；对上气道区域特异性损伤与修复机制的下游信号通路解析可能尚不全面 | 解析甲型流感病毒感染引起上呼吸道（喉气管区域）损伤与修复的区域特异性机制，特别是基底细胞在黏膜恢复和免疫招募中的作用 | 甲型流感病毒感染的小鼠上呼吸道（声门下和气管假复层上皮） | 单细胞转录组学 | 流感病毒感染 | 单细胞转录组测序、成像、小鼠模型 | NA | 图像、文本（转录组数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2026-09-21 |
MANTIS: Analytics toolkit for spatial metabolomics with matching spatial transcriptomics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.20.700581
PMID:41648596
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研究论文 | 提出MANTIS，一个用于联合分析空间代谢组学和空间转录组学数据的统计框架，能够发现代谢物空间模式和基因-代谢物关系 | 首次将空间代谢组学、空间转录组学、细胞类型信息和空间域统一在单一框架中，强调空间统计、假设检验和混杂因素校正；采用保留自相关的置换策略评估统计显著性；引入空间互相关和空间偏相关统计量量化基因-代谢物关联 | 未明确说明 | 开发计算工具以分析配准的空间代谢组学和空间转录组学数据，揭示代谢物空间模式和基因-代谢物关系 | 空间代谢组学和空间转录组学数据 | 空间组学分析 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | 空间代谢组学数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2026-09-21 |
Specific depletion of TIGIThigh CD226- clonally expanded intratumoral Tregs defines safe and effective TIGIT targeting
2026-Feb-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013636
PMID:41735000
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研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了TIGIThigh CD226-克隆扩增的瘤内调节性T细胞是限制TIGIT阻断疗效的主要障碍，并证明具有增强ADCC活性的抗TIGIT抗体可特异性清除该Treg亚群，从而显著提升抗肿瘤疗效 | 首次鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的瘤内Tregs是限制TIGIT阻断疗效的关键障碍，并提出通过αTIGIT-IgG1-ADCC特异性清除该Treg亚群来解除对干性CD4+ T细胞的抑制，进而促进Th1分化并增强CD8+ T细胞功能 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索提高抗TIGIT免疫治疗抗肿瘤活性的新策略，克服当前TIGIT阻断临床疗效不足的问题 | 人源化TIGIT敲入小鼠（Tigith/h、Tigith/m）MC38肿瘤模型、非小细胞肺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞及临床样本 | 肿瘤免疫学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、bulk RNA-seq、流式细胞术、生物膜干涉技术 | NA | 基因表达数据、TCR序列数据、流式细胞数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2026-09-21 |
Singe cell RNA sequencing data processing using cloud-based serverless computing
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.26.650787
PMID:41756869
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研究论文 | 本文提出了一种利用无服务器云计算加速单细胞RNA测序数据处理的通用方法 | 使用可快速部署的云无服务器函数构建按需“超级计算机”作为自动配置的计算单元，以优化scRNA-seq工作流 | 未明确说明 | 利用无服务器云计算加速计算密集型的单细胞RNA测序工作流 | 外周血单核细胞（PBMC）数据集以及NIH MorPhiC项目生成的人类scRNA-seq数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 两个公开PBMC数据集，以及一个450 GB的人类scRNA-seq数据集（涵盖86个细胞系） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-09-21 |
Reconstructing multi-scale tissue spatial architecture from single-cell RNA-seq with REMAP
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.21.707167
PMID:41756915
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研究论文 | 该文章提出了REMAP，一个深度学习框架，整合基因表达与邻域级基因-基因协方差，利用一个或多个空间转录组参考数据重建单细胞RNA-seq数据的多尺度空间组织结构 | 利用邻域级基因-基因协方差整合基因表达信息，实现从scRNA-seq数据重建多尺度空间组织结构，可同时利用一个或多个ST参考数据，在2D和3D多种组织及七种人类癌症类型中均优于现有方法 | 依赖空间转录组参考数据，ST数据的成本和基因覆盖度限制可能影响重建效果 | 从单细胞RNA-seq数据重建多尺度组织空间结构，将经济高效的单细胞数据集转化为空间可解释的组织图谱 | 2D和3D小鼠大脑、人类胎儿皮层、七种人类癌症类型、人类多发性硬化症图谱 | 机器学习 | 多发性硬化症, 癌症 | scRNA-seq, 空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 452 | 2026-09-21 |
Mechanisms of HIV Latency in Hematopoietic Progenitors: GFI1 as a Key Regulator
2026-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.19.706859
PMID:41756862
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研究论文 | 该研究利用双报告HIV病毒和单细胞RNA测序，揭示了GFI1作为HIV在造血干细胞和祖细胞中潜伏的关键调控因子 | 首次发现GFI1通过结合LTR中引物结合位点附近的保守序列抑制HIV基因表达，并拮抗Tat和NF-κB介导的激活 | 未明确GFI1在不同HSPC亚群中的特异性作用，且缺乏体内验证实验 | 探究HIV在造血干细胞和祖细胞中潜伏的分子机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）中潜伏感染的HIV病毒 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2026-09-21 |
Distinct and cooperative roles of host and tumor Osteopontin in colorectal cancer liver metastasis
2026-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.19.706899
PMID:41756888
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研究论文 | 该研究通过2×2基因敲除小鼠模型和空间转录组学，揭示了宿主来源和肿瘤来源的骨桥蛋白（OPN）在结直肠癌肝转移中各自独立且协同的作用 | 首次利用2×2基因敲除小鼠模型系统区分并阐明了宿主和肿瘤两个区室来源OPN在结直肠癌肝转移中的不同空间功能，揭示了宿主OPN驱动单核细胞向巨噬细胞分化而肿瘤OPN诱导M2样巨噬细胞极化的机制差异，并发现宿主OPN缺失可激活干扰素驱动的抗肿瘤微环境 | 研究主要基于小鼠模型，宿主和肿瘤OPN在人类结直肠癌肝转移中的具体贡献仍需进一步验证，OPN阻断免疫治疗的临床转化效果尚需临床试验评估 | 阐明宿主来源和肿瘤来源的骨桥蛋白在结直肠癌肝转移中的区室特异性功能及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌肝转移小鼠模型（2×2基因敲除小鼠）、同源移植模型和患者来源异种移植（PDX）小鼠模型 | 空间转录组学, 肿瘤免疫学 | 结直肠癌, 肝癌 | 空间转录组学, 基因敲除小鼠模型, 免疫治疗 | 2×2基因敲除小鼠模型, 同源移植小鼠模型, 患者来源异种移植（PDX）小鼠模型 | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 454 | 2026-09-21 |
TAZ (Wwtr1) deficiency leads to ER stress and mitochondrial dysfunction in a mouse model of Fuchs' endothelial corneal dystrophy
2026-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.17.706456
PMID:41756894
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学、透射电子显微镜和免疫荧光染色，揭示TAZ基因敲除小鼠角膜内皮细胞中内质网应激、线粒体功能障碍及年龄相关差异 | 首次在TAZ敲除FECD小鼠模型中结合单细胞转录组学与超微结构分析，揭示机械转导障碍与细胞器应激之间的机制联系，并发现年轻与老年小鼠角膜内皮细胞的年龄相关差异反应 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类FECD样本中验证；样本量有限；仅分析了2个月和11个月两个时间点 | 阐明TAZ缺陷导致FECD发病的机制，建立TAZ敲除小鼠作为非手术治疗策略的转化平台 | TAZ敲除小鼠（年轻2个月和老年11个月）的角膜内皮细胞 | 数字病理学 | Fuchs内皮性角膜营养不良 | 单细胞转录组学，透射电子显微镜，免疫荧光染色 | NA | 图像，文本 | 年轻（2个月）和老年（11个月）TAZ敲除小鼠的角膜内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 455 | 2026-09-21 |
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.700850
PMID:41756925
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研究论文 | 本研究通过体外和体内模型，探讨了维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 | 首次通过单细胞RNA测序证明维生素D缺乏比雄激素缺乏更严重地阻碍小鼠前列腺类器官的管腔细胞分化，并发现长期维持于1,25-二羟基维生素D的人前列腺癌细胞MDA-PCa-2b丧失异种移植能力 | 研究主要基于小鼠模型和单一人类细胞系，样本量有限，未在人类临床样本中验证维生素D缺乏与前列腺癌侵袭性的直接关联 | 探究生物学相关水平的维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 | 小鼠前列腺类器官、小鼠前列腺管腔细胞、MDA-PCa-2b人前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据、表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2026-09-21 |
Distinct cochlear cell types associated with genetic susceptibility to sensory and metabolic hearing loss in older adults from the CLSA
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.17.706270
PMID:41757007
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研究论文 | 本研究整合人类全基因组关联研究数据与小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据，利用单细胞疾病相关性评分工具，揭示了与老年人年龄相关性听力损失感觉型和代谢型相关的不同耳蜗细胞类型 | 首次将人类ARHL的GWAS数据与小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据整合，利用单细胞疾病相关性评分工具，识别出感觉型和代谢型ARHL各自关联的特定耳蜗细胞类型，并通过年龄分层分析揭示了不同生命阶段细胞异质性的变化 | 研究基于小鼠耳蜗单细胞数据与人类GWAS数据的跨物种整合，可能存在物种差异；样本仅来自CLSA队列的老年人，年龄分层分析基于小鼠模型，结果外推需谨慎 | 探究年龄相关性听力损失感觉型和代谢型遗传基础所对应的耳蜗细胞类型，并评估年龄相关转录变化对这些模式的影响 | 加拿大CLSA队列中的老年人（人类GWAS数据）以及年轻和年老小鼠的耳蜗单细胞 | 机器学习 | 老年性听力损失 | GWAS, 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, GWAS | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 457 | 2026-09-21 |
Regulatory network architecture constrains inflammatory responses in tissue-resident alveolar macrophages
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706134
PMID:41757068
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研究论文 | 整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和深度学习染色质可及性建模，推断组织驻留与招募性肺泡巨噬细胞在炎症应激下的基因调控网络架构 | 首次结合单细胞多组学和深度学习染色质可及性建模，揭示PU.1和CEBP/β介导的稳定调控网络架构使组织驻留肺泡巨噬细胞的炎症反应受到约束 | 摘要中未明确说明样本量及具体验证实验，推断的调控网络架构仍需进一步功能验证 | 探究协调组织驻留巨噬细胞身份与炎症反应调控的高阶调控相互作用，理解组织驻留肺泡巨噬细胞的功能可塑性及其在宿主防御中的作用 | 组织驻留肺泡巨噬细胞与招募的单核细胞来源肺泡巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | 深度学习 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 458 | 2026-09-21 |
Deciphering epileptogenic and activity-dependent gene programs in the human brain
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.18.706645
PMID:41757101
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研究论文 | 该研究通过单核和空间转录组学技术，分析了耐药性癫痫患者大脑皮层组织在致痫、非致痫和急性刺激条件下的基因表达程序 | 首次在人类大脑中系统解析了致痫和活动依赖的基因程序，揭示了谷氨酸能神经元的细胞类型特异性反应以及髓系细胞驱动的炎症重塑 | 研究样本来源于耐药性癫痫患者，可能无法完全代表正常大脑活动依赖的基因程序，且样本量有限 | 解析人类大脑中致痫性和活动依赖的基因表达程序，理解耐药性癫痫的分子机制 | 耐药性癫痫患者的致痫、非致痫和术中刺激的非致痫皮层组织 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 耐药性癫痫 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 26种细胞类型，来自耐药性癫痫患者的皮层组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 459 | 2026-09-21 |
Parameter-free representations outperform single-cell foundation models on downstream benchmarks
2026-Feb-18, ArXiv
PMID:41757283
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研究论文 | 该文通过简单可解释的线性方法在多个下游基准任务上取得最优或接近最优性能，挑战单细胞基础模型的必要性 | 首次系统性地证明无需计算密集的深度学习表示，仅靠仔细的归一化和线性方法即可在单细胞下游任务中达到或超越基础模型的表现，并在分布外任务上表现更优 | 未明确提出自身方法的局限性，但暗示单细胞基础模型可能被过度评估 | 探究是否可以在不依赖计算密集型深度学习表示的情况下，在单细胞下游任务上取得与基础模型相当的性能 | 单细胞RNA测序数据及其下游任务（细胞类型分类、疾病状态预测、跨物种学习） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2026-09-21 |
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525673123
PMID:41665992
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研究论文 | 该研究结合组织病理学分析、空间转录组学和单核RNA测序，构建了人类小脑Bergmann胶质细胞（BG）的发育图谱，揭示了BG的时空发育动态 | 首次结合详细组织病理学、空间转录组学和单核RNA测序构建人类小脑BG发育图谱；发现BG在11孕周后出现，挑战了此前认为BG在妊娠晚期才出现的观点；揭示了人类特有的三层组织结构（包括dissecans层）；鉴定了两个时空和转录上不同的BG群体，提示BG的多阶段个体发育 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明人类小脑中Bergmann胶质细胞的发育时间线和分子特征，构建人类小脑BG的发育图谱 | 人类小脑中的Bergmann胶质细胞（BG），以及小鼠、雪貂和狨猴的小脑作为比较对象 | 空间转录组学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 图像，文本 | 人类小脑样本跨越11孕周至妊娠晚期多个发育阶段 | 10x Genomics | 空间转录组学，单核RNA-seq | 10x Visium，10x Chromium | NA |