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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4521 | 2026-05-05 |
Identification of a migrasome-related lncRNA signature and its prognostic and immunological role in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1763443
PMID:42079608
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研究论文 | 建立了一个与迁移体相关的长链非编码RNA签名,用于预测膀胱癌患者的预后和免疫特征 | 首次识别并构建了基于迁移体相关lncRNA的预后签名,并整合单细胞RNA测序分析揭示其在膀胱癌微环境中的细胞异质性和细胞间通讯模式 | 未提及具体局限性 | 识别与膀胱癌预后相关的迁移体相关lncRNA,并评估其与免疫微环境和药物敏感性的关系 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4522 | 2026-05-05 |
Innate immune profiling reveals a specific reduction of CD57+CD62L+CD161+ NK cells in CMV-positive males with hypertension
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1749702
PMID:42079601
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研究论文 | 利用质谱流式和单细胞RNA测序揭示高血压男性患者中CMV阳性状态下CD57+CD62L+CD161+ NK细胞特异性减少及其亚群重塑机制 | 首次发现高血压导致CD57+CD62L+CD161+ NK细胞整体减少及致病性亚群重塑,即KLRC2high适应性亚群特异性丧失,而FCER1Ghigh细胞毒性亚群相对保留并成为优势群体 | 样本量较小(仅男性),机制验证依赖IL-15信号通路关联分析,缺乏直接因果实验 | 探究高血压中先天免疫细胞(特别是NK细胞)的失调机制及致病作用 | 高血压和血压正常男性的外周血单个核细胞(PBMC)中的NK细胞 | 机器学习和生物信息学 | 高血压 | 质谱流式(CyTOF)、全谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 质谱流式数据、流式细胞术数据、单细胞转录组数据 | 初始队列10例高血压和10例血压正常男性;验证队列10例高血压和6例血压正常男性 | Fluidigm | 质谱流式, 单细胞RNA测序 | CyTOF, 10x Chromium | CyTOF用于先天免疫谱分析;10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 4523 | 2026-05-05 |
Single-cell landscape of melanoma reveals ETV5-driven C3 ID4+ tumor subpopulation with extracellular vesicle-associated immunosuppressive and pro-metastatic potential
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1795778
PMID:42079653
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组分析,在黑色素瘤中鉴定出ETV5驱动的C3 ID4+肿瘤亚群,该亚群具有细胞外囊泡相关的免疫抑制和促转移潜力 | 首次通过单细胞转录组整合分析揭示ETV5作为关键转录调控因子驱动C3 ID4+肿瘤亚群,并阐明其通过TGF-β相关细胞间通讯和细胞外囊泡信号促进黑色素瘤进展和免疫逃逸的机制 | 缺乏大规模临床样本验证及功能实验的体内模型支持,且ETV5下游具体调控网络和细胞外囊泡的详细机制尚未完全解析 | 探究黑色素瘤中未分化的肿瘤亚群及其在恶性进展和免疫逃逸中的作用 | 10例I/III期黑色素瘤标本的肿瘤微环境和肿瘤异质性 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE, CellChat, SCENIC, CRISPR/Cas9 | 单细胞转录组数据 | 10例I/III期黑色素瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4524 | 2026-05-05 |
scRNA sequencing revealed HIV-associated inflammation-mediated lung epithelial dysregulation and fibroblast remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1789140
PMID:42079650
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HIV感染导致肺部上皮失调和成纤维细胞重塑的机制 | 首次在单细胞水平上系统描绘HIV感染对肺上皮、免疫和基质细胞群的转录重组影响,发现肺泡上皮细胞向间质表型转变及成纤维细胞促炎应激反应增强 | 未探讨这些通路在HIV相关肺部病理中的治疗相关性,且样本量可能有限 | 表征HIV感染在肺部的细胞和分子景观,评估上皮重塑和HIV驱动的肺细胞组成及转录程序变化 | 来自HIV感染者和未感染个体的肺组织,包括吸烟者和非吸烟者 | 单细胞转录组学 | HIV相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类 | 单细胞转录组数据 | 总共54,230个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4525 | 2026-05-05 |
Tumor reactivity assessment using clonal expression reveals tumor reactive CD8+ T cell heterogeneity across solid tumors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1815974
PMID:42079667
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研究论文 | 利用克隆表达评估肿瘤反应性,揭示实体瘤中肿瘤反应性CD8+ T细胞的异质性 | 提出一种无需数据集预处理的克隆型水平CD8+ TRT分类器TRACE,克服了单数据集、供体或适应症训练的局限性,并可在新测试数据集上直接应用 | 未在论文中明确提及局限性 | 构建并验证一种基于单细胞RNA测序的肿瘤反应性T细胞预测算法,以评估不同实体瘤中TRT的频率 | 肿瘤浸润淋巴细胞和血液T细胞克隆型 | 机器学习 | 肺癌,结直肠癌,胰腺癌,黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自多个肿瘤图谱的数百名患者样本(涵盖肺癌、结直肠癌和胰腺癌) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4526 | 2026-05-05 |
Application of multi-omics in systemic autoimmune rheumatic diseases: a bibliometric and visualization analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1759610
PMID:42079670
|
综述 | 利用文献计量学和可视化分析,系统回顾2005至2025年间多组学技术在系统性自身免疫性风湿病中的应用现状、发展趋势及主题演变 | 首次通过文献计量学方法,系统描绘了多组学在SARD研究中从体液分子表征向单细胞免疫细胞层面高分辨率分析的转化路径及国际合作模式 | 仅依赖Web of Science核心合集数据库,可能存在文献覆盖不全;操作化定义仅纳入至少两个组学层面的研究,可能排除了单一组学但有重要贡献的工作 | 系统综述多组学技术在系统性自身免疫性风湿病研究中的应用现状与发展趋势,指导未来研究方向 | 2005至2025年间Web of Science核心合集中关于多组学在SARD应用的英文文献 | 自然语言处理 | 风湿性自身免疫疾病 | NA | NA | 文本 | 2576篇文献(2072篇研究论文和504篇综述) | NA | NA | NA | NA |
| 4527 | 2026-05-05 |
Integrated analysis identifies a palmitoylation-associated prognostic model (ACSM5/SKA3) for lung adenocarcinoma across multiple cohorts
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21160
PMID:42079738
|
研究论文 | 通过整合分析确定了肺腺癌中一个棕榈酰化相关预后模型(ACSM5/SKA3),并在多个队列中验证其预后价值 | 首次构建了基于棕榈酰化相关基因的ACSM5/SKA3双基因预后模型,该模型能够分层患者预后并反映代谢、增殖和免疫微环境状态,为肺腺癌风险分层和治疗设计提供棕榈酰化相关基础 | 模型区分性能中等(TCGA中1年、3年、5年AUC分别为0.717、0.733、0.697),可能需进一步优化 | 探究棕榈酰化相关基因在肺腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的关系 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据(RNA-seq), 单细胞RNA测序数据(scRNA-seq) | TCGA-LUAD队列及三个GEO外部验证队列,包含单细胞RNA测序数据集和配对的LUAD及相邻组织 | NA | NA | NA | NA |
| 4528 | 2026-05-05 |
An optimization framework for hierarchical clustering
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag107
PMID:42079811
|
研究论文 | 提出一种基于平均链接的层次聚类优化框架,通过集成多视图相似性度量提升聚类质量 | 首次将局部与全局视角结合,通过多视图数据生成与集成学习优化层次聚类,克服贪心算法的结构性次优问题 | 未明确提及计算复杂度及大规模数据集上的扩展性 | 改进层次聚类的结构最优性 | 合成数据集、经典基准数据集及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 平均链接层次聚类、集成学习 | 数值数据 | 多种合成及经典数据集,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4529 | 2026-05-04 |
Molecular PET imaging of tumor-associated macrophages in precision oncology
2026-Jul-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218526
PMID:42019605
|
综述 | 系统评述了用于肿瘤相关巨噬细胞定量成像的正电子发射断层扫描策略的演变,重点介绍了高亲和力分子探针的范式转变及其临床潜力 | 强调从间接代谢成像向高亲和力分子探针的范式转变,特别突出了纳米抗体和肽类示踪剂在肿瘤穿透性和快速清除方面优于全长抗体的优势 | 跨物种标志物不一致等转化障碍限制了临床应用 | 评估分子PET成像在肿瘤相关巨噬细胞量化中的进展及其在精准肿瘤学中的潜在应用 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 计算机视觉 | 肿瘤 | PET | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4530 | 2026-05-04 |
GLT8D2-mediated PD-L1 N-glycosylation promotes tumor immune evasion in ovarian cancer peritoneal metastasis
2026-Jul-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218478
PMID:41936856
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研究论文 | 本研究探讨糖基转移酶GLT8D2通过PD-L1 N-糖基化促进卵巢癌腹膜转移和肿瘤免疫逃逸的作用机制 | 首次发现GLT8D2通过催化PD-L1在Asn192位点的N-糖基化修饰来增强PD-L1稳定性,从而促进卵巢癌腹膜转移和免疫逃逸,并揭示了HIF-1α作为其直接转录激活因子 | 尚需进一步验证GLT8D2在其他癌症类型中的功能和临床转化潜力 | 阐明GLT8D2在卵巢癌腹膜转移中调控免疫逃逸的分子机制 | 卵巢癌腹膜转移组织和肿瘤细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床样本和单细胞数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 4531 | 2026-05-04 |
DECTIN-2 regulates macrophage M1 polarization via the SYK/ROS/JNK axis to influence the progress of apical periodontitis
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116694
PMID:42019388
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研究论文 | 本研究揭示DECTIN-2通过SYK/ROS/JNK信号轴调控巨噬细胞M1极化,从而影响根尖周炎的进展 | 首次阐明DECTIN-2在根尖周炎中通过SYK/ROS/JNK轴调控巨噬细胞M1极化的分子机制 | 未提及具体局限性 | 探究DECTIN-2在巨噬细胞极化和根尖周炎中的功能及潜在机制 | 人类根尖周炎病变组织、Dectin-2敲除小鼠模型及体外培养的巨噬细胞 | 机器学习 | 根尖周炎 | 单细胞测序、转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、转录组测序数据 | 人类根尖周炎病变组织样本及Dectin-2敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | NA |
| 4532 | 2026-05-04 |
From cells to niches: Rewiring cardiovascular disease through spatial immunity
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116731
PMID:42044575
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综述 | 提出从细胞中心转向微环境中心的心血管疾病空间免疫学新框架 | 提出从细胞中心模型转向微环境中心模型,将组织视为结构化免疫生态系统,并整合空间转录组学等多模态技术 | 目前从空间相关性推断因果关系的能力有限 | 整合空间免疫学进展,推动心血管疾病免疫机制的概念转变 | 心血管疾病中的免疫细胞、基质细胞及其空间微环境 | 计算生物学、免疫学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、多重成像、单细胞多组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞多组学 | NA | NA |
| 4533 | 2026-05-04 |
Targeted inhibition of microglial C5aR1 by PMX205 mitigates post-ischemic stroke neuroinflammation and promotes functional recovery
2026-Jun-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能实验,发现PMX205靶向抑制小胶质细胞C5aR1可减轻缺血性脑卒中后神经炎症并促进功能恢复 | 首次利用单细胞RNA测序识别缺血性脑卒中后小胶质细胞中C5aR1的关键调控作用,并通过PMX205靶向抑制验证其治疗潜力 | NA | 识别缺血性脑卒中小胶质细胞中的关键调节因子,并将其转化为临床治疗靶点 | 小胶质细胞C5aR1在缺血性脑卒中的表达及功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,定量免疫印迹,分子对接,ELISA,TTC染色,TUNEL/Nissl染色 | NA | 基因表达数据,图像 | 公共单细胞RNA测序数据集,两种小鼠模型(永久性局灶性缺血和短暂缺血再灌注损伤) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4534 | 2026-05-04 |
Exploring the toxicological impact of perfluorooctanoic acid and perfluorooctane sulfonate on glioblastoma through network toxicology, machine learning, and multi-dimensional bioinformatics analysis
2026-Jun-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 结合网络毒理学、机器学习和多维生物信息学分析,探究全氟辛酸(PFOA)和全氟辛烷磺酸(PFOS)对胶质母细胞瘤(GBM)的毒性影响及其分子机制 | 首次联合网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、孟德尔随机化和分子动力学模拟等多维度方法,系统揭示PFOA/PFOS暴露与GBM之间的潜在毒性靶点和机制,并提出了新的不良结局通路框架 | 研究主要基于计算分析和公共数据库,缺乏体外或体内实验验证,且MR分析中ODC1与GBM风险的关联需要进一步在更大样本中确认 | 探索PFOA和PFOS对胶质母细胞瘤的潜在毒性靶点和分子机制 | PFOA和PFOS两种化学物质、GBM相关基因表达数据、免疫细胞浸润数据、单细胞RNA测序数据 | 计算生物学、机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、孟德尔随机化、分子动力学模拟 | 机器学习模型(具体类型未明确) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子对接数据、分子动力学模拟数据 | 3个外部独立数据集用于验证,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4535 | 2026-05-04 |
Multi-omic and functional analyses identified an endoplasmic reticulum stress-driven TIMD4⁺ IL1β⁺ macrophage subpopulation contributes to osteoarthritis progression
2026-Jun, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156442
PMID:41875622
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研究论文 | 通过多组学与功能分析鉴定了一种内质网应激驱动的TIMD4⁺ IL1β⁺巨噬细胞亚群,该亚群促进骨关节炎进展 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间多组学技术,在滑膜和髌下脂肪垫中发现了特定的TIMD4⁺ IL1β⁺巨噬细胞亚群,并揭示内质网应激驱动其激活,促进骨关节炎进展 | 尚未在更大样本量或不同物种中验证该亚群的普遍性,且体内干预实验仅使用小鼠模型 | 探索滑膜和髌下脂肪垫在骨关节炎进展中的作用及细胞机制 | 人类滑膜和髌下脂肪垫组织,以及骨关节炎小鼠模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间多组学测序 | NA | 测序数据, 图像 | 人类滑膜和髌下脂肪垫样本,骨关节炎小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4536 | 2026-05-04 |
Intelligence-responsive wettability switch coating on magnesium implants for treating osteoporotic fracture
2026-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72683-3
PMID:42069674
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研究论文 | 开发一种智能响应性可湿性开关涂层,用于镁基植入体治疗骨质疏松性骨折 | 首次在镁合金植入体上构建活性氧响应性水凝胶涂层,实现按需清除活性氧并减缓降解,结合单细胞转录组学揭示分子机制 | 未提及 | 开发一种多功能涂层以改善镁合金植入体在氧化应激微环境下的性能,促进骨质疏松性骨折愈合 | 骨质疏松性骨折大鼠模型及骨髓间充质基质细胞与骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习 | 骨质疏松性骨折 | 单细胞转录组测序 | 未提及 | 单细胞转录组数据 | 骨质疏松大鼠模型(具体数量未提及) | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 4537 | 2026-05-04 |
Transformative Applications and Innovations in Next-Generation Sequencing Data Analysis
2026-May-02, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-026-01064-9
PMID:42068517
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综述 | 综述了二代测序数据分析中的变革性应用和创新 | 探讨了单细胞测序、长读长技术和多组学整合等先进方法如何扩展NGS应用范围,并展望了人工智能和机器学习与NGS数据管线的整合前景 | 数据量大需要强大计算基础设施、测序错误率影响变异检测和临床可靠性、隐私和数据共享等伦理问题、资源有限环境下的公平获取问题 | 综合分析二代测序在基因组学、转录组学和表观基因组学分析中的创新应用及挑战 | NGS数据及其在癌症基因组学、传染病研究、罕见病诊断和精准医学中的应用 | 机器学习 | 癌症, 传染病, 罕见病 | NGS, 单细胞测序, 长读长测序, 多组学整合 | NA | 基因组序列 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 4538 | 2026-05-04 |
Acarbose modulates microglial Pkm2 acetylation to reshape immunometabolism and preserve retinal neurons after ischemia-reperfusion
2026-May-02, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03838-8
PMID:42069589
|
研究论文 | 阿卡波糖通过调节小胶质细胞Pkm2乙酰化来重塑免疫代谢并在缺血再灌注后保护视网膜神经元 | 首次发现阿卡波糖通过Sirt1-Pkm2-NAD轴发挥视网膜保护作用,揭示了其调控小胶质细胞代谢重编程和线粒体功能的分子机制 | 未明确提及具体局限性,但研究主要基于小鼠模型,临床转化仍需验证 | 探究阿卡波糖对缺血再灌注后视网膜神经元的保护机制及其免疫代谢调控作用 | 小鼠视网膜、视网膜神经节细胞、小胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组分析、生物化学分析 | CNN | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 小鼠模型和特定基因敲除小鼠(Pkm2Cx3cr1-Cre小鼠) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 4539 | 2026-05-04 |
Generation and single-cell characterization of functional megakaryocytes derived from umbilical cord blood
2026-May-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05047-9
PMID:42069610
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研究论文 | 从脐带血中生成功能性巨核细胞并进行单细胞表征 | 通过单细胞RNA测序揭示了脐带血来源巨核细胞的转录组特征,并鉴定出九个转录不同的亚群(MK1-MK9),其中仅MK9与免疫相关 | 未提及具体局限性 | 为更高效地体外生产功能性巨核细胞提供理论基础 | 脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脐带血样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4540 | 2026-05-04 |
PD-1 Blockade-Induced DKK1 Expression by CD8+ T Cells Promotes Blood-Brain Barrier Permeabilization
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1222
PMID:41525686
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示抗PD-1治疗通过诱导CD8+ T细胞表达DKK1促进血脑屏障通透性,从而影响脑转移瘤治疗效果 | 首次发现抗PD-1治疗可特异性地破坏血脑屏障完整性,并阐明DKK1/β-catenin/TCF及FOXM1通路介导的机制 | 未明确提及研究局限性 | 探究抗PD-1治疗脑转移瘤效果异质性的宿主驱动因素 | 脑转移微环境中的免疫细胞及内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌脑转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 临床肺癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |