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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4441 | 2026-06-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals the neuronal transcriptional differentiation program associated with ferroptosis-related heterogeneity in human hepatoblastoma
2026-08, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示人类肝母细胞瘤中铁死亡相关异质性的神经元转录分化程序 | 首次在单细胞水平上揭示肝母细胞瘤中神经元分化与铁死亡程序的关联,并发现ACSL4与铁死亡抑制因子共调节,TGFB2与谷氨酸受体及转录因子共表达 | 未提及具体局限性 | 研究肝母细胞瘤中铁死亡转录程序在肿瘤异质性中的作用,特别是与神经元分化的关系 | 人类肝母细胞瘤肿瘤样本、正常肝脏样本及患者来源异种移植模型 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立队列(GSE131329和GSE104766)的批量转录组数据,及一个单细胞RNA测序数据(GSE180665) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4442 | 2026-06-26 |
scDCL: A multi-view single-cell RNA sequencing clustering method based on dual contrastive learning
2026-08, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出基于双对比学习的多视图单细胞RNA测序聚类方法scDCL,用于更好地解析细胞异质性 | 首次将ZINB掩码自编码器、图神经网络和双对比学习协同集成,同时捕获细胞内在特征和全局结构特征,并通过双对比损失优化聚类效果 | 未提及具体数据集大小和计算资源需求,可能对大型数据集存在扩展性挑战 | 开发一种新的单细胞RNA测序聚类方法,解决数据高稀疏性、强非线性和极端维度带来的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | ZINB掩码自编码器(ZINB-MAE)、图神经网络(GNN)、双对比学习 | 基因表达数据(单细胞RNA测序) | 未在标题和摘要中明确给出 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4443 | 2026-06-26 |
Adipose tissue microvasculature is linked to insulin resistance and lipidome alterations in treated HIV
2026-Aug-01, AIDS (London, England)
DOI:10.1097/QAD.0000000000004491
PMID:41873969
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研究论文 | 研究了接受现代抗逆转录病毒治疗的HIV感染者的皮下脂肪组织微血管系统与胰岛素抵抗和脂质组改变之间的关联 | 首次在HIV感染者中揭示脂肪组织微血管重塑(毛细血管内皮减少及关键脂质转运受体表达下降)与胰岛素抵抗相关的脂质组特征的联系 | 样本量相对较小(n=127,其中单细胞RNA测序n=59),且为横断面观察性研究,无法确定因果关系 | 探究HIV感染者中皮下脂肪组织细胞组成如何影响循环脂质谱 | 长期接受抗逆转录病毒治疗且病毒学抑制的HIV感染者 | 机器学习和生物信息学 | HIV相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序、未靶向血浆脂质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据和脂质组学数据 | 127名参与者(其中59名进行了单细胞RNA测序) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 4444 | 2026-06-26 |
4-Nonylphenol mediated tumor progression and immune modulation through CDK2: Computational and experimental validation
2026-Aug, Journal of environmental sciences (China)
DOI:10.1016/j.jes.2025.10.046
PMID:42336586
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研究论文 | 通过整合网络毒理学、机器学习、分子对接模拟、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统研究了内分泌干扰物4-壬基酚的致癌机制 | 首次建立计算-实验联合框架,综合多种组学技术阐明4-壬基酚通过CDK2等靶点促进肿瘤进展及免疫抑制微环境的机制 | 研究主要基于计算模拟和体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型和临床样本的进一步确认 | 阐明4-壬基酚的致癌分子机制及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 4-壬基酚及其相关致癌靶点,包括TNF、CDK2、PRKCA、ERBB2、CASP8、MAPK3等核心基因 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 网络毒理学, 分子对接模拟, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 两种乳腺癌细胞系用于体外验证实验 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4445 | 2026-06-26 |
A Cross-Species Single-Cell Transcriptomic Atlas of Subcutaneous Adipose Tissue Reveals Conserved and Divergent Cellular Programs
2026-Aug, Animal genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1002/age.70152
PMID:42337981
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研究论文 | 构建牛、猪和人类皮下脂肪组织的跨物种单细胞转录组图谱,揭示保守和物种特异的细胞程序 | 首次跨物种系统比较皮下脂肪组织的单细胞转录组,识别了保守的细胞类型和物种特异的细胞类群及差异表达基因 | NA | 揭示不同哺乳动物(牛、猪、人)皮下脂肪组织在细胞组成和转录特征上的保守性与分歧 | 牛、猪和人的皮下脂肪组织 | 机器学习和转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 牛、猪和人的样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4446 | 2026-06-26 |
Spatiotemporal heterogeneity in non-small cell lung cancer: A paradigm shift from characterization to dynamic management (Review)
2026-Aug, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2026.15697
PMID:42344719
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综述 | 探讨非小细胞肺癌时空异质性及其在临床管理策略中从静态分类向动态监测与干预的范式转变 | 提出基于单细胞测序、空间转录组学和液体活检等技术的新型动态管理框架,整合多组学数据和智能算法,旨在将非小细胞肺癌转变为可控制的慢性病 | 技术层面(如数据整合与算法优化)、生物学层面(如异质性机制理解不充分)和临床转化层面(如策略验证与实施困难)存在持续挑战 | 分析非小细胞肺癌时空异质性对治疗失败和耐药的影响,并讨论从静态分类向动态监测和干预的临床管理范式转变 | 非小细胞肺癌的时空异质性及其临床管理策略 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、液体活检 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 4447 | 2026-06-26 |
Spatial transcriptomics uncovers unique tumor microenvironments in folliculotropic versus classic mycosis fungoides
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.013
PMID:41338334
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿之间独特的肿瘤微环境差异 | 首次通过空间转录组学比较滤泡性蕈样肉芽肿(FMF)与经典型蕈样肉芽肿(MF)在肿瘤微环境中的差异,发现FMF中肿瘤CD4 T细胞具有高炎症表型、更好的细胞饥饿适应能力和增强的抗原呈递 | 样本量有限,且仅分析了毛囊周围和真皮区域,未涉及其他潜在相关微环境区域 | 揭示滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿肿瘤微环境的差异及其临床侵袭性机制 | 蕈样肉芽肿患者皮肤组织样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 患者样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4448 | 2026-06-26 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mTOR-driven cellular fate of spindle cells and immune evasion in classic Kaposi's sarcoma
2026-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04063-0
PMID:41525037
|
研究论文 | 单细胞和空间转录组学揭示了mTOR驱动经典卡波西肉瘤中梭形细胞的命运和免疫逃逸 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤患者中的治疗潜力及其分子机制 | 样本量小,仅2名患者,且未设立对照组 | 评估mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤治疗中的潜力并揭示其分子机制 | 经典卡波西肉瘤患者肿瘤组织中的梭形细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 卡波西肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据 | 2名经典卡波西肉瘤患者的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4449 | 2026-06-26 |
Single-Cell CRISPR: An Efficient Strategy for Decoding Plant Cis-Regulatory Complexity
2026-Jul, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70647
PMID:41854240
|
综述 | 总结单细胞CRISPR系统在解码植物顺式调控复杂性中的策略与进展 | 强调单细胞CRISPR系统在细胞类型特异性水平上解码顺式调控元件功能的新方法 | 植物研究中应用这些方法仍面临挑战 | 探讨单细胞CRISPR系统在植物顺式调控元件功能基因组分析中的应用潜力 | 植物顺式调控元件及基因表达调控机制 | 机器学习 | NA | 单细胞CRISPR | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4450 | 2026-06-26 |
Piecing together the alveolar-capillary unit: arterial-venous capillary polarization
2026-Jul-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00101.2026
PMID:42227649
|
综述 | 综述肺泡-毛细血管单元中动脉-静脉极化的研究进展 | 强调肺毛细血管内皮细胞中CAP1群体的异质性和修复亚群,揭示动脉-静脉极化及基因表达梯度 | 未提及具体局限性 | 总结肺毛细血管内皮细胞异质性,特别是动脉-静脉极化和修复性祖细胞 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、表观基因组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4451 | 2026-06-26 |
Identification of PSMA4 as a Therapeutic Target for Atherosclerosis: A Comprehensive Multiomics Mendelian Randomization Analysis
2026-Jul, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70039
PMID:42032825
|
研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化整合分析,识别PSMA4作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次利用多组学孟德尔随机化框架,整合GWAS、eQTL、mQTL和sQTL数据,系统鉴定并验证PSMA4作为动脉粥样硬化的遗传因果治疗靶点,并通过单细胞RNA测序揭示其在斑块免疫细胞中的高表达 | 研究基于欧洲人群数据,种族多样性有限;MR和共定位分析虽支持因果关系,但无法完全排除残余混杂;药物预测仍需体外和体内实验验证 | 鉴定新的、受遗传支持的动脉粥样硬化治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者与对照人群的血液、组织样本及动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | GWAS, eQTL, mQTL, sQTL, scRNA-seq | NA | 基因表达、甲基化、剪接变异、单细胞转录组 | 三个独立队列的cis-eQTL数据及外部AS数据集,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 4452 | 2026-06-26 |
Ythdf2 loss in microglia aggravates ischemic retinopathy by increasing microglia activation and microvascular anomalies
2026-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.024
PMID:41627954
|
研究论文 | 揭示小胶质细胞中Ythdf2缺失通过增加小胶质细胞活化和微血管异常加剧缺血性视网膜病变的机制 | 首次探索m6A阅读蛋白Ythdf2在视网膜小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的调控机制 | 未明确提及限制性 | 研究Ythdf2在小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的参与,并揭示其调控机制 | 小胶质细胞Ythdf2及视网膜微血管 | 机器学习 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 4453 | 2026-06-26 |
Mouse, Pig, and Human Atherosclerotic Lesions Have Common and Distinct Mesenchymal Cell Populations
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323640
PMID:42165148
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序整合分析小鼠、猪和人类的动脉粥样硬化病变,发现共有和特有的间充质细胞群体 | 首次跨物种整合分析小鼠、猪和人类动脉粥样硬化斑块中的间充质细胞异质性,揭示了保守的间充质细胞连续体及多种物种特异性亚群(如DLX5和RERGL标记的平滑肌细胞亚群仅存在于人类颈动脉和冠状动脉斑块) | 未明确提及但隐含限制包括:不同物种间细胞状态的功能验证不足;仅分析了特定血管床和病变阶段,可能无法完全覆盖疾病全貌 | 比较小鼠和猪实验性动脉粥样硬化病变中复杂的间充质细胞群体与人类临床斑块的异同 | 来自人类颈动脉和冠状动脉、猪主动脉和冠状动脉、以及小鼠头臂动脉的动脉粥样硬化病变样本 | 数字病理学、单细胞组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了人类、猪和小鼠多个动脉样本的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4454 | 2026-06-26 |
Epigenetic Regulation of the Epstein-Barr Virus Latent-Lytic Switch
2026-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.71031
PMID:42345494
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综述 | 综述爱泼斯坦-巴尔病毒潜伏-裂解转换的表观遗传调控机制 | 整合全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学和整合多组学分析的最新进展,揭示表观遗传抑制、转录控制、代谢适应和免疫微环境信号如何协同调控潜伏-裂解转换的分子逻辑 | 未提及具体限制 | 总结EBV潜伏-裂解转换的表观遗传调控新发现及其对治疗方法的启示 | 爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)的潜伏-裂解转换过程 | 机器学习 | EBV相关恶性肿瘤 | 全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学、整合多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多组学 | NA | NA |
| 4455 | 2026-06-26 |
Epigenetic-Genetic Crosstalk at the Cancer-Diabetes Interface: Convergent Molecular Pathways, Multi-Omics Biomarkers, and Dual Therapeutic Targets
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202602229R
PMID:42313898
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综述 | 该综述系统探讨了癌症与糖尿病之间的表观遗传-遗传互作,揭示了常见的分子通路、多组学生物标志物及双重治疗靶点 | 从表观遗传与遗传互作的新视角,整合多组学技术(如单细胞测序和人工智能),深入分析癌症与糖尿病的共同分子机制,并提出双重治疗靶点的概念 | 未提及具体局限性,但综述性质意味着可能缺乏原始实验数据验证 | 揭示癌症与糖尿病共有的分子通路和生物标志物,为两者共同治疗策略提供理论基础 | 癌症与糖尿病的分子通路、表观遗传修饰(DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA失调)及相关风险因素(肥胖、慢性炎症、氧化应激) | 机器学习, 数字病理学 | 癌症, 糖尿病 | 多组学技术, 单细胞测序 | na | 多组学数据 | na | na | 单细胞RNA测序 | na | na |
| 4456 | 2026-06-26 |
Integrating Machine Learning and Single-Cell Analysis to Reveal the Diagnostic and Therapeutic Value of Regulated Cell Death Mechanisms in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504703R
PMID:42338358
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研究论文 | 结合机器学习和单细胞分析,揭示调控细胞死亡机制在肝细胞癌中的诊断和治疗价值 | 构建了一个基于调控细胞死亡相关基因的预后模型RCDI,并通过单细胞RNA测序验证其与肿瘤微环境异质性和免疫检查点分子的关联 | NA | 开发有效的预后模型,以准确预测肝细胞癌患者预后并指导靶向治疗决策 | 肝细胞癌患者的多队列转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多队列数据(TCGA, GSE14520, ICGC)和单细胞数据(GSE149614) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4457 | 2026-06-26 |
Macrophage-Mediated Mechanisms of Vascular Remodeling in Arteriovenous Malformations
2026-Jun-25, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323163
PMID:42345097
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动静脉畸形中通过介导血管重塑的机制,并探讨了其潜在的研究方向 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了动静脉畸形组织中巨噬细胞的异质性及其对内皮细胞信号通路的直接调控作用,为理解巨噬细胞在动静脉畸形病理生理学中的作用提供了新的视角 | 目前对巨噬细胞如何具体参与动静脉畸形起始和进展的机制理解仍不充分,现有证据主要基于临床样本和动物模型,尚缺乏完整的机制解析 | 阐明巨噬细胞在动静脉畸形血管重塑中的介导机制,并指出未来研究方向 | 动静脉畸形病理组织中的巨噬细胞及其与内皮细胞的相互作用 | 机器学习 | 动静脉畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床动静脉畸形样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4458 | 2026-06-26 |
A cell atlas of the developing human outflow tract of the heart and its adult aortic valve derivatives
2026-Jun-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107748
PMID:42345287
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研究论文 | 对心脏流出道(OFT)发育过程及其成年主动脉瓣衍生物进行单细胞和空间转录组分析 | 首次在胚胎和胎儿两个时间点以及成年主动脉瓣中提供OFT的全面转录组数据,并利用空间转录组学确定细胞群分布,发现胚胎特征在成人细胞中持续存在,可用于追溯大时间尺度细胞间的关系 | 文中未明确提及研究的局限性 | 定义人类心脏流出道发育及其成年衍生物的细胞和分子特征,以理解先天性心脏缺陷并推动再生医学发展 | 人类心脏流出道(胚胎期和胎儿期)及其成年主动脉瓣衍生物 | 数字病理学 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 单细胞调控网络推断模型(如SCENIC) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 人类胚胎期、胎儿期心脏流出道组织样本及成年主动脉瓣样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 4459 | 2026-06-26 |
Plant Phosphatidylinositol Signalling Network in Cotton Resistance to Verticillium Wilt
2026-Jun-25, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70701
PMID:42347818
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综述 | 本文综述了磷脂酰肌醇信号网络在棉花抗黄萎病中的作用机制 | 系统揭示了棉花中保守的磷脂酰肌醇信号通路如何形成调控网络赋予抗病性,并强调了棉花特有的调控节点如GhPIP5K9a和GhPLDδ酶的作用 | 未提及具体局限性,但可能因主要基于模式植物拟南芥的比较研究,棉花中特定调控节点的功能验证尚不充分 | 阐明磷脂酰肌醇信号通路在棉花抗黄萎病中的调控网络 | 棉花以及模式植物拟南芥 | 机器学习 | 棉花黄萎病 | 磷酸化蛋白质组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4460 | 2026-06-26 |
Single-cell RNA sequencing: a powerful tool to study heterogeneity in papillary and anaplastic thyroid carcinoma
2026-Jun-24, European thyroid journal
IF:3.5Q2
DOI:10.1530/ETJ-25-0141
PMID:42340813
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综述 | 综述单细胞RNA测序技术在研究甲状腺乳头状癌和未分化癌异质性中的应用 | 阐述了单细胞RNA测序如何深入揭示甲状腺癌肿瘤内和肿瘤间的细胞异质性,包括癌细胞表型异质性及肿瘤微环境中基质和免疫细胞的变化 | 未明确提及局限性 | 探讨单细胞RNA测序技术在研究甲状腺癌异质性方面的见解 | 甲状腺乳头状癌和未分化癌 | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |