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当前共找到 7432 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-07-13 |
Ambiguity-Aware Multi-Stage Cell-Type Annotation for Spatial Transcriptomics
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.733596
PMID:42395369
|
研究论文 | 提出一种感知模糊、多阶段的空间转录组细胞类型注释框架，通过混合空间特征聚类和受限语言模型推理来提升注释可靠性 | 首次在空间转录组注释中显式处理生物学模糊性，通过局部重聚类保留未解析混合群而非强制标注 | 依赖特定空间平台数据参数设置，未在多种空间转录组平台验证泛化性 | 解决空间转录组细胞类型注释中的异质性表达和模糊标签分配问题 | 胆管癌组织中的空间转录组数据 | 数字病理学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 语言模型 | 空间转录组数据 | 10x Genomics Xenium平台采集的胆管癌空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Genomics Xenium空间转录组平台 |
| 422 | 2026-07-13 |
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals Microenvironment-Dependent Immune Signatures in a Lyme Arthritis model
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.25.734510
PMID:42395505
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示莱姆关节炎小鼠模型中关节组织的微环境依赖性免疫特征 | 首次在莱姆关节炎模型中应用空间转录组学技术，绘制关节组织炎症高峰期和消退期的空间基因表达图谱，发现不同关节区域的成纤维细胞和滑膜细胞呈现差异性的免疫表型 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；抗生素治疗后仅观察了一个时间点（感染后4周），可能未完全捕捉炎症消退的完整动态过程 | 探索莱姆关节炎感染后关节组织的空间基因表达环境及其在病理发生中的作用 | 感染伯氏疏螺旋体的C3H小鼠的踝关节组织 | 空间转录组学 | 莱姆关节炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 感染后2周（炎症高峰期）和感染后4周（抗生素治疗后炎症消退期）的C3H小鼠踝关节样本，以及媒介物处理的对照组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 423 | 2026-07-13 |
NanoCellAnnotator: Formalizing Expert Cell Type Annotation with Large Language Models
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.728965
PMID:42395456
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研究论文 | 提出一种名为NanoCellAnnotator的生物约束框架，利用大型语言模型在空间转录组学中进行自动细胞类型注释 | 将空间结构发现、确定性生物学证据构建与轻量级语言模型推理解耦，并引入置信度估计和受限标签选择机制以避免产生生物学上不支持的预测和幻觉细胞类型 | 依赖PanglaoDB和CellMarker等数据库构建允许标签空间，可能无法覆盖所有细胞类型；轻量语言模型性能可能不及大型云端模型 | 开发一种生物约束且具有置信度感知的自动细胞类型注释方法，应用于空间转录组学数据 | 空间转录组学数据中的细胞簇及其标记基因 | 数字病理学 | 肝内胆管癌、乳腺癌 | 空间转录组学 | 大型语言模型（LLM） | 空间转录组学数据 | 肝内胆管癌数据集和独立乳腺癌空间转录组学数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学平台 |
| 424 | 2026-07-13 |
Type I Interferon-Driven Monocyte Dysregulation and MAS-associated CD8+ T cells During Macrophage Activation Syndrome
2026-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.23.727321
PMID:42244634
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research paper | 使用bulk和单细胞RNA测序研究儿童巨噬细胞活化综合征中单核细胞和CD8+ T细胞的转录变化 | 首次发现I型干扰素而非IFNγ驱动MAS单核细胞反应，并识别出一种与MAS相关的独特CD8+ T细胞群体 | 样本来自儿童，可能不适用于成人患者；未涉及功能验证实验 | 阐明巨噬细胞活化综合征中单核细胞的转录改变及其在病理机制中的作用 | 巨噬细胞活化综合征儿童患者的单核细胞 | machine learning, digital pathology | 巨噬细胞活化综合征, 系统性红斑狼疮, 新冠肺炎 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | cell-cell communication algorithms | RNA sequencing data | MAS儿童与健康对照 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2026-07-13 |
Single-cell profiling reveals CCL5Hi GZMAHi effector memory CD8 T cell association to oligoarticular JIA
2026-Jun-03, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keag211
PMID:42046256
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示CCL5Hi GZMAHi效应记忆CD8 T细胞与少关节型幼年特发性关节炎（oligo JIA）的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了oligo JIA患者滑液中活化的效应记忆CD8+ T细胞（CD8+TEM）的克隆扩增和细胞毒性特征，并发现这些细胞表达CCL5、GZMA和GNLY，且与葡萄膜炎相关的MAIT细胞克隆扩增和转录重编程 | 发现队列样本量较小，仅包含3例初治新发oligo JIA患者、4例葡萄膜炎发作患者和4例健康对照；验证队列样本量有限 | 表征oligo JIA及其关节外表现（葡萄膜炎）的免疫病理机制，鉴定致病细胞群和调控机制 | 少关节型幼年特发性关节炎（oligo JIA）患者及其葡萄膜炎并发症 | 单细胞基因组学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序，单细胞TCR测序，质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 单细胞转录组和TCR测序数据，质谱流式细胞术数据 | 发现队列：14个样本（3例oligo JIA患者的PBMC和配对SF，4例葡萄膜炎患者的PBMC，4例健康对照的PBMC）；验证队列：13例oligo JIA患者、8例葡萄膜炎患者和6例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞TCR测序，质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 426 | 2026-07-13 |
Defective HNF1A hinders GLI3 processing favoring duodenal versus pancreatic fate, thus leading to intestinal elongation in vivo
2026-06-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353153.125
PMID:41887801
|
研究论文 | 揭示HNF1A缺陷通过阻碍GLI3加工促使后肠向十二指肠而非胰腺命运分化，导致体内肠道伸长 | 首次阐明HNF1A与Hedgehog信号之间的自调节环路，解释其在后肠细胞命运决定中的作用 | 主要基于体外分化模型和转基因小鼠，缺乏人类疾病直接验证 | 探索Hedgehog信号控制后肠细胞谱系分离的分子机制 | 人类诱导多能干细胞分化模型和小鼠转基因模型 | 分子生物学、发育生物学 | 糖尿病、胰腺发育相关疾病 | 批量转录组学、单细胞转录组学、显微镜、生理学、遗传细胞追踪 | NA | 转录组数据、图像数据 | 人类诱导多能干细胞和转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2026-07-13 |
A Dynamic Change of Microglial States Occurs During the Transition From Photoreceptor Degeneration to Regeneration in Zebrafish pde6c Mutants
2026-06, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70158
PMID:41995141
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了斑马鱼pde6c突变体中视网膜小胶质细胞从感光细胞退行到再生过程中的动态状态变化 | 首次描绘了斑马鱼视网膜小胶质细胞在慢性感光细胞退行和Müller胶质细胞介导的神经元再生过程中的转录组异质性和动态变化，并发现了退行反应簇表达神经保护和组织修复基因 | 未提及研究的方法学局限性或适用范围限制；可能仅限于斑马鱼模型，未在人类或其他哺乳动物中进行验证 | 理解小胶质细胞功能状态在神经元退行和再生过程中的调控机制 | 斑马鱼pde6c突变体视网膜中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型同胞和pde6c突变体的视网膜样本，分别于5 dpf（感光细胞退行起始）和4 wpf（Müller胶质细胞介导的再生阶段）采集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 428 | 2026-07-13 |
Alleviation of diabetic cardiomyopathy via preventing VCAM1-positive cells from senescence by engineered nanovesicles
2026-May-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04555-3
PMID:42144613
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出VCAM1阳性细胞为糖尿病心肌病中一种新的前衰老细胞群体，并开发了工程化纳米囊泡精准靶向该细胞，从而缓解心肌损伤 | 首次鉴定VCAM1作为前衰老细胞标志物，并利用膜脂质工程改造纳米囊泡以实现对STING信号通路的精准靶向干预 | 未提及人类样本验证及长期安全性评估，且动物模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探索通过靶向前衰老内皮细胞来缓解糖尿病心肌病的新治疗策略 | 糖尿病小鼠心脏中的VCAM1阳性前衰老内皮细胞 | 机器学习 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光分析、脂质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2026-07-13 |
Integrated bulk RNA-seq and scRNA-seq identification of a novel "PET-SPI1-MYL9" transcriptional axis in lung adenocarcinoma driven by polyethylene terephthalate exposure
2026-Mar-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1-2630
PMID:41969450
|
研究论文 | 整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，识别聚乙烯 terephthalate暴露驱动肺腺癌的新型PET-SPI1-MYL9转录轴 | 首次提出PET暴露通过结合SPI1转录因子的DNA结合域，抑制MYL9表达，形成非基因毒性致癌机制的新型转录轴 | 计算证据虽然稳健，但仍需进一步湿实验验证结合和转录抑制机制 | 探索空气传播微塑料PET在肺腺癌中的潜在致癌分子机制 | PET暴露相关的肺腺癌样本和分子靶标（MYL9、SPI1） | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | 分类回归树, 朴素贝叶斯, 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据 | 三个独立肺腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2026-07-13 |
Identification of papillary thyroid carcinoma-associated epithelial cell subpopulations and diagnostic biomarkers: integrating machine learning with single-cell analysis
2026-Mar-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-aw-2244
PMID:41969483
|
研究论文 | 通过整合机器学习与单细胞分析，识别甲状腺乳头状癌相关上皮细胞亚群及诊断生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序结合多种机器学习算法（随机森林、XGBoost、Boruta和SVM-RFE）筛选出XPR1、SH3RF1和TLE1三个关键基因，构建高辨别力的诊断模型（AUC>0.90） | 未提及 | 揭示甲状腺乳头状癌的分子机制并识别用于早期诊断和个体化治疗的潜在生物标志物 | 甲状腺乳头状癌组织的上皮细胞亚群 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR | 随机森林、XGBoost、Boruta特征选择算法、支持向量机递归特征消除 | 单细胞基因表达数据 | 甲状腺乳头状癌细胞系（BCPAP）和正常甲状腺上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2026-07-13 |
ZNF460 inhibits HMGCL and promotes PI3K pathway in colon cancer
2026-Mar-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-aw-2410
PMID:41969486
|
研究论文 | 本文研究ZNF460在结肠癌中的表达模式、预后价值及其通过抑制HMGCL激活PI3K通路促进癌症进展的分子机制 | 首次揭示ZNF460通过抑制HMGCL表达激活PI3K通路促进结肠癌进展，并结合单细胞测序分析细胞间通讯 | NA | 阐明ZNF460在结直肠癌中的表达、预后价值和生物学功能及其分子机制 | 结直肠癌组织和细胞 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、临床数据、单细胞数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2026-07-13 |
Tumor-intrinsic redox programming drives an SPP1-CD44 axis of immune suppression in uveal melanoma
2026-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104011
PMID:41534302
|
研究论文 | 通过对葡萄膜黑色素瘤原发标本进行单细胞RNA测序，揭示肿瘤内在氧化还原程序驱动SPP1-CD44免疫抑制轴 | 首次识别出氧化还原优化的黑色素瘤亚群，揭示ROS-SPP1-CD44代谢-免疫调节新轴，将肿瘤氧化还原稳态与免疫逃逸直接关联 | 未提及样本量及验证队列，可能受限于原发肿瘤标本的代表性 | 揭示葡萄膜黑色素瘤中肿瘤内在代谢程序驱动免疫逃逸的机制 | 葡萄膜黑色素瘤原发标本中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 葡萄膜黑色素瘤原发标本（具体数量未在摘要中给出） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-07-13 |
Macrophage AMPK activated by oxidative stress drives profibrotic crosstalk with tubular cells to accelerate renal fibrosis after ischemic and reperfusion injury
2026-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.104002
PMID:41621245
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研究论文 | 本研究揭示了氧化应激激活巨噬细胞AMPK，通过与肾小管细胞的促纤维化相互作用加速肾缺血再灌注损伤后纤维化的机制 | 首次发现巨噬细胞AMPK作为氧化还原传感器，在氧化应激下通过TWEAK-Fn14信号通路启动巨噬细胞与肾小管上皮细胞的促纤维化串扰，为AKI向CKD转变提供新机制 | 未提及具体局限性 | 探究氧化应激在缺血再灌注损伤诱导的急性肾损伤向慢性肾脏病转变过程中调控炎症和纤维化的具体机制 | 小鼠肾缺血再灌注损伤模型及巨噬细胞AMPKα1条件性敲除小鼠 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（Lyz2-Cre;Prkaa1-fl/fl小鼠及对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 434 | 2026-07-13 |
Unveiling a novel function of Aconitase-2: attenuating lung ischemia-reperfusion injury via inhibition of pulmonary endothelial apoptosis
2026-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104016
PMID:41637882
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研究论文 | 揭示乌头酸酶2通过抑制肺内皮细胞凋亡减轻肺缺血再灌注损伤的新功能 | 首次发现乌头酸酶2在肺缺血再灌注损伤中的保护作用，并阐明其通过增强线粒体三羧酸循环和下游代谢产物4-辛基衣康酸抑制细胞凋亡的机制 | 研究仅限于小鼠模型和体外细胞实验，临床样本量较小，需要进一步验证在人体中的治疗潜力 | 探索乌头酸酶2在肺缺血再灌注损伤中的作用及其分子机制 | 肺血管内皮细胞中的乌头酸酶2功能 | 数字病理学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 65名健康捐赠者和48名肺缺血再灌注损伤患者 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2026-07-13 |
Cell Subtypes and Gene Dysfunction in Ovarian Endometriosis Before and After GnRHa Treatment Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2026-02, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-026-02056-0
PMID:41688861
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析卵巢子宫内膜异位症患者在GnRHa治疗前后的细胞亚型和基因功能变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示GnRHa治疗前后异位和原位子宫内膜的细胞异质性，并鉴定出ECM1高表达亚群是纤维化过程中的关键细胞群 | 样本量较小，仅涉及三名患者；未提供更多患者临床特征和治疗反应细节 | 探索子宫内膜异位症纤维化的病理特征，了解异位和原位子宫内膜的细胞异质性及GnRHa治疗前后的变化 | 卵巢子宫内膜异位症患者的原位子宫内膜和异位病灶 | 单细胞测序 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名患者的6份样本（原位子宫内膜和异位病灶），约73,531个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2026-07-13 |
Identification of a Potential Biomarker PDGFRA for Endometriosis Based on Comprehensive Analysis of Multiple Omics Data
2026-02, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-02049-5
PMID:41721175
|
研究论文 | 基于多组学数据综合分析，识别PDGFRA作为子宫内膜异位症的潜在生物标志物 | 整合了bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组数据，结合WGCNA和机器学习方法识别PDGFRA作为核心基因 | 未提及明显局限性 | 寻找子宫内膜异位症的潜在生物标志物和治疗靶点 | 子宫内膜异位症组织样本及基质细胞 | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学 | WGCNA、机器学习 | 基因表达数据 | 利用GEO数据库中的公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 437 | 2026-07-13 |
SCSEQ: A web tool for analyzing single-cell RNA-seq data
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag029
PMID:42084898
|
研究论文 | 开发了一个基于网络交互式生物信息学分析平台SCSEQ，用于分析单细胞RNA-seq数据 | 提供了一个无需编程技能即可使用的综合性单细胞数据分析平台，涵盖从预处理到下游分析的完整流程，并支持多种输入格式和动态交互 | 未明确说明限制，但可能依赖于平台在线服务的稳定性和计算资源 | 解决单细胞RNA测序数据处理的挑战，为研究人员提供便捷的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2026-07-13 |
4D single-cell spatial transcriptomics reveals dynamic morphogenetic gradients and regenerative domains in planarians
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag064
PMID:42172041
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学构建包含超过350万细胞、涵盖8个再生时间点的四维图谱，揭示涡虫再生的形态发生梯度和再生区域 | 首次生成覆盖涡虫全身再生的四维单细胞空间转录组图谱，识别出由Mediator 8调控的前再生区这一全新的损伤诱导空间域 | 未提及具体局限性 | 研究涡虫全身再生过程中基因表达与细胞反应的时空动态规律 | 涡虫（planarians） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过350万个细胞，来自8个不同再生时间点的完整涡虫样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 439 | 2026-07-13 |
Integrative single-cell transcriptomics and proteomics reveal an immunometabolic framework for MSC-exosome-mediated remodeling of expanded NK cells
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag049
PMID:42008150
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析，揭示间充质干细胞外泌体对扩增NK细胞功能重塑的免疫代谢调控机制 | 首次将单细胞转录组学与蛋白质组学结合，系统解析MSC-Exos对NK细胞代谢与免疫功能的多维度调控，并提出基于FcγR/CD16信号的外泌体作用假说 | 因果关系验证尚不充分，需进一步机制研究确认 | 评估MSC-Exos对人NK细胞体外扩增过程中功能状态的影响及其分子机制 | 人自然杀伤细胞（NK细胞）及间充质干细胞来源的外泌体 | 单细胞组学 | 肿瘤免疫、衰老免疫监视 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 体外扩增的人NK细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 440 | 2026-07-13 |
Inhibiting Nampt signaling promotes M2 macrophage polarization to enhance bone regeneration in periodontitis
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1768560
PMID:41969528
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研究论文 | 研究通过抑制Nampt信号促进M2型巨噬细胞极化，增强牙周炎骨再生 | 首次揭示NAMPT信号在牙周炎巨噬细胞极化中的作用，并证实局部注射FK866通过诱导M2极化促进骨再生 | NA | 阐明NAMPT信号在巨噬细胞极化中的功能及其对牙周骨再生的影响 | 牙周炎组织中的巨噬细胞、小鼠RAW264.7巨噬细胞、MC3T3-E1成骨细胞、结扎诱导的大鼠牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、共培养、显微CT、组织学染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 牙周炎组织样本、小鼠细胞系、大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |