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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-09-21 |
Deep Learning Enabled 3D Multi-Omic Analysis Reveals Molecular Signatures of Heterogeneous Response to Chemotherapy in Pancreatic Cancer
2026-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.03.709150
PMID:41867770
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研究论文 | 该研究开发了一种基于深度学习的3D多组学分析流程，用于识别胰腺癌化疗敏感与持续存在的肿瘤细胞群体，并揭示肿瘤内异质性及耐药分子特征 | 开发了一种新型3D临床样本分析流程，利用深度学习基于形态学特征对化疗敏感和持续存在的肿瘤细胞群体进行分类，实现肿瘤内异质性的后续分子表征，并整合空间蛋白质组学和空间转录组学进行多组学验证 | 摘要中未明确提及研究局限性，但样本队列规模及临床验证的广泛性可能需要进一步确认 | 识别胰腺癌系统性治疗耐药的潜在机制，发现耐药机制并设计新的治疗组合以克服耐药 | 接受新辅助化疗的人胰腺癌临床样本 | 数字病理学, 机器学习 | 胰腺癌 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | 深度学习 | 图像, 文本 | 多个胰腺癌队列的临床样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 422 | 2026-09-21 |
Immune reconstruction after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation: rules, mechanisms, and applications
2026-Mar-05, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-06922-4
PMID:41784824
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综述 | 本文综述了异基因造血干细胞移植后免疫重建的主要特征、影响因素、机制及监测方法 | 结合单细胞测序等最新技术进展，系统总结了不同条件下免疫重建的具体模式和机制 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且对现有监测方法的局限性未做深入探讨 | 探讨促进免疫恢复的策略，理解免疫重建的基本原理和影响因素 | 异基因造血干细胞移植受者 | 免疫学 | 血液疾病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2026-09-21 |
Pyroptosis Modulates Multiple Immune Cell Populations in Targeted Therapy-Treated Melanoma
2026-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0444
PMID:41296494
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了GSDME介导的细胞焦亡在BRAF抑制剂联合MEK抑制剂治疗黑色素瘤中对肿瘤内多种免疫细胞群体的调控作用 | 首次利用同源基因敲除（Gsdme KO）肿瘤模型结合单细胞RNA测序，系统阐明了GSDME在BRAFi+MEKi治疗黑色素瘤中对T细胞、NK细胞和调节性T细胞浸润及功能的调控作用，并发现焦亡缺陷型GSDME突变体（T6E）无法恢复抑制性Treg的表型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究GSDME介导的细胞焦亡如何影响BRAFi+MEKi治疗的黑色素瘤中的肿瘤免疫微环境 | BRAFi+MEKi治疗的黑色素瘤小鼠肿瘤模型及肿瘤内浸润的免疫细胞 | 单细胞组学, 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2026-09-21 |
Topological Data Analysis for Unsupervised Feature Selection in Large Scale Spatial Omics Data Sets
2026-Mar-04, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-026-01618-2
PMID:41779089
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研究论文 | 应用持续同调进行无监督特征选择，用于大规模空间组学数据的空间可变基因识别 | 利用持续同调对基因表达的空间结构进行连续量化，而非基于p值的方法，并展示了该方法可自然扩展到其他空间组学模态 | 未明确说明方法在大规模数据集上的计算效率和可扩展性 | 开发一种基于拓扑数据分析的无监督特征选择方法，用于空间组学数据的空间结构量化与空间可变基因识别 | 空间转录组学数据中的基因表达空间结构 | 空间组学分析 | 肾病、心肌梗死 | 空间转录组学、空间代谢组学 | 持续同调 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 425 | 2026-09-21 |
Regulation of spikelet number during wheat spike development
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698073
PMID:41835394
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综述 | 本文综述了调控小麦穗发育过程中小穗数目的基因网络，探讨了影响每穗小穗数的发育机制、关键基因及育种应用前景 | 综合了近期空间转录组学、单细胞分析和多组学在小麦穗发育研究中的应用，加速了新基因的发现并提升了工程化改良小麦穗产量的能力 | 将促进小穗数增加的突变整合到商业小麦品种中面临育性和粒重的权衡问题，需要进一步的研究和育种努力 | 阐明调控小麦每穗小穗数（SNS）的基因网络，为高产小麦育种提供理论基础 | 小麦穗发育过程中的小穗发育及每穗小穗数调控机制 | 机器学习 | NA | 空间转录组学，单细胞分析，多组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序，多组学 | NA | NA |
| 426 | 2026-09-21 |
Restoration of Keratinocyte Homeostasis Drives Resolution of Skin Inflammation
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.708224
PMID:41867805
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研究论文 | 该研究通过调节小鼠炎症性皮肤病的表皮脂质代谢，发现恢复角质细胞稳态可驱动皮肤炎症消退，并揭示了表皮转录网络重组在炎症消退中的核心作用 | 首次证明表皮状态是炎症持续的决定因素，而非仅仅是炎症的被动靶标；识别了一个保守的上皮调节三元组，其协同调控可控制疾病严重程度；通过跨物种分析证明消退相关基因网络在人类银屑病中反向调控 | 研究基于小鼠模型，需进一步验证在人类中的直接适用性；单细胞RNA测序主要揭示相关性，具体分子机制仍需深入解析；样本量未明确说明 | 探究表皮状态是否主动调控组织稳态的恢复，以及角质细胞稳态恢复如何驱动皮肤炎症消退 | 小鼠炎症性皮肤病模型及人类银屑病和特应性皮炎样本 | 机器学习, 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 蛋白质组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 427 | 2026-09-21 |
Organization and evolution of sex-biased gene expression in Drosophila adult sexual circuits
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.28.708756
PMID:41846957
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学，以果蝇性别决定基因为分子标记，在细胞分辨率下分析了成年果蝇性行为神经环路的转录组景观及其进化 | 首次在细胞分辨率下系统性揭示果蝇成年性行为神经环路中性别偏向基因表达的组织模式和进化规律，发现性别偏向表达高度细胞类型特异且物种特异，物种间表达分化主要在两性间耦合，性别特异变化受多效性基因表达约束 | 研究仅基于果蝇模型，结论是否适用于其他物种尚不清楚；单细胞转录组可能遗漏低表达基因；未进行功能验证实验 | 探究果蝇性行为神经环路如何在共享发育蓝图的基础上进化以满足性别特异的适应需求 | 果蝇成年性行为神经环路中的细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 428 | 2026-09-21 |
Functional Type I and Type II interferon crosstalk restricts progenitor exhausted CD8 T cells through spatial exclusion and checkpoint enforcement
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.01.708869
PMID:41847035
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研究论文 | 该研究揭示了I型干扰素和IFNγ通过空间排布与检查点控制协同限制慢性感染中前体耗竭CD8 T细胞的机制 | 发现了空间编码的干扰素回路，IFN-I通过隔离Tpex于PDL1富集的B细胞龛并抑制IFNγ，IFNγ则维持髓系细胞PDL1表达形成反馈，联合阻断可促进Tpex扩增 | 研究基于慢性LCMV感染小鼠模型，结论在人类慢性感染中的适用性尚需验证 | 探究I型干扰素和IFNγ如何协同调控慢性感染中CD8 T细胞命运 | 慢性LCMV感染小鼠模型中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 慢性病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2026-09-21 |
The Histone Methyltransferase KMT2D Is a Critical Mediator of Lineage Plasticity and Therapeutic Response in Castration-Resistant Prostate Cancer
2026-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2053
PMID:41379538
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶KMT2D在去势抵抗性前列腺癌中通过调控染色质可及性维持AR依赖型和AR低表达干细胞样亚型的谱系可塑性，并影响治疗响应 | 首次发现KMT2D不仅调控AR依赖型CRPC中AR和FOXA1转录因子的染色质招募，还维持AR低表达的干细胞样亚型身份并通过AP-1转录因子（如FOSL1）控制其活性，揭示了KMT2D在混合谱系细胞状态中的双重调控作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明控制去势抵抗性前列腺癌不同细胞状态维持的表观遗传机制，为开发有效的联合治疗策略提供依据 | 去势抵抗性前列腺癌细胞系、患者来源类器官及患者样本 | 表观遗传学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学、染色质检测 | NA | 转录组数据、染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2026-09-21 |
Percentage of CD56+ monocytes at neutrophil engraftment is associated with the incidence of acute graft-versus-host disease
2026-Mar-02, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-06897-2
PMID:41770386
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，发现中性粒细胞植入时CD56+单核细胞的比例与急性移植物抗宿主病的发生率相关 | 首次发现CD56+单核细胞在中性粒细胞植入时的短暂增加与急性GVHD发生率降低相关，并鉴定出以NCAM为特征的单核细胞亚群 | 样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证CD56+单核细胞作为预测生物标志物的临床实用性 | 探讨CD56+单核细胞在异基因造血干细胞移植后急性GVHD中的预测价值 | 接受异基因造血干细胞移植的患者的外周血样本 | 数字病理学 | 急性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序, 多色流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2026-09-21 |
Multi-omics analysis identifies SMPD1 as a key contributor in sphingolipid pathway for Type 2 diabetes pathogenesis
2026-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01727-7
PMID:41428198
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研究论文 | 该研究通过整合基因组、转录组和代谢组的多组学数据，结合孟德尔随机化和小鼠体内实验，鉴定出SMPD1是2型糖尿病鞘脂代谢通路中的关键致病因子 | 首次通过多组学整合分析结合孟德尔随机化和小鼠体内功能验证，系统地证明SMPD1在2型糖尿病和代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的致病作用 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 鉴定和表征参与2型糖尿病发病机制的鞘脂代谢通路关键组分 | 2型糖尿病患者的多组学数据、瘦型小鼠和ob/ob小鼠 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 全基因组关联研究、孟德尔随机化、转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 432 | 2026-09-21 |
Senescent Mesenchymal Stromal Cells Differentially Alter Adipogenesis in Adipose Tissue, Skeletal Muscle, and Bone Marrow
2026-Mar, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.70119
PMID:41437892
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和体外实验，探究间充质基质细胞衰老如何以组织特异性方式差异调控脂肪组织、骨骼肌和骨髓中的脂肪生成 | 首次系统比较了骨骼肌、脂肪组织和骨髓三种来源间充质基质细胞的转录组特征，并揭示了衰老间充质基质细胞通过旁分泌效应对不同组织脂肪生成的双向调控作用（促进骨髓脂肪生成、抑制骨骼肌和脂肪组织脂肪生成） | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，缺乏体内验证实验，未完全阐明旁分泌因子调控脂肪生成的具体分子机制 | 探究间充质基质细胞衰老如何调控不同组织中的脂肪生成，以及其在衰老相关脂肪再分布中的作用机制 | 小鼠骨骼肌来源间充质基质细胞（FAPs）、脂肪组织来源间充质基质细胞（APCs）和骨髓来源间充质基质细胞（BMSCs） | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三种组织来源的原代间充质基质细胞（小鼠骨骼肌FAPs、脂肪组织APCs和骨髓BMSCs） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-09-21 |
Spatial transcriptomics in bone research: navigating hype and hurdles
2026-Mar, Pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.pathol.2025.10.003
PMID:41475999
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综述 | 本文综述了空间转录组学（ST）在骨研究中的应用现状，包括当前ST平台的优缺点、骨样本处理的挑战、生物信息学分析要点，以及ST在肌肉骨骼组织和动物模型中的应用，并展望了未来发展方向 | 系统性地梳理了空间转录组学在骨研究领域中面临的独特挑战（如骨组织脱钙和处理问题），并整合了ST平台比较、骨样本处理流程、生物信息学分析及跨组织应用的综合视角 | 作为综述文章，未提供原始实验数据；骨组织脱钙和处理对ST应用造成的困难尚未完全解决；ST平台本身存在固有局限性、工作流程瓶颈和分析复杂性 | 综述空间转录组学在骨研究中的应用现状，探讨其 hype 与 hurdles，为未来研究方向提供指导 | 骨组织及肌肉骨骼组织、相关动物模型 | 空间转录组学 | 骨疾病 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 434 | 2026-09-21 |
IRF7 orchestrates maladaptive smooth muscle cell phenotype switching in atherosclerosis
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf039
PMID:41625231
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研究论文 | 该研究通过重新分析谱系追踪小鼠的单细胞RNA测序数据，揭示了IRF7作为主转录调控因子驱动平滑肌细胞向促炎巨噬细胞样状态转分化，从而促进动脉粥样硬化斑块不稳定的机制 | 首次鉴定IRF7为调控平滑肌细胞向促炎巨噬细胞样细胞转分化的主转录调控因子，并阐明其通过中间'干细胞-内皮-单核细胞'状态进行转分化的轨迹，同时通过AAV-SM22α-shIRF7载体在体内验证了靶向IRF7可稳定动脉粥样硬化斑块 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析动脉粥样硬化形成过程中平滑肌细胞异质性的分子驱动机制，特别是调控平滑肌细胞向促炎巨噬细胞样细胞转分化的关键转录因子 | 谱系追踪小鼠的平滑肌细胞、ApoE-/-高脂饮食小鼠的主动脉斑块、人类动脉粥样硬化斑块样本 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因调控网络推断, 计算机模拟扰动建模 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2026-09-21 |
Single-Cell Multimodal Profiling Highlights Persistent Aortic Smooth Muscle Cell Changes in Diabetic Mice Despite Glycemic Control
2026-Mar, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.324012
PMID:41641545
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研究论文 | 该研究利用单细胞多组学和空间转录组技术，分析2型糖尿病小鼠在血糖控制后主动脉平滑肌细胞的转录组和表观遗传变化 | 结合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学，揭示糖尿病小鼠中平滑肌细胞表型转换相关的基因表达和染色质可及性变化，并发现这些变化在血糖控制后仍持续存在 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；未深入探讨高血糖记忆的具体分子机制 | 探究血糖正常化对2型糖尿病小鼠主动脉平滑肌细胞表型转换相关转录组和表观基因组变化的影响 | 2型糖尿病db/db小鼠和对照组db/+小鼠的主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 2型糖尿病db/db小鼠（接受DAPA或载体治疗）和非糖尿病db/+小鼠（接受载体治疗），每组若干只，具体数量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台，10x Xenium空间转录组学平台 |
| 436 | 2026-09-21 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals upregulation of glycolysis pathway genes before overt tauopathy in the PS19 mouse model
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01652-z
PMID:41688738
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研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术对PS19 tau转基因小鼠模型在不同疾病阶段的海马和皮层区域进行时空转录组分析，揭示了tau病理出现前糖酵解通路基因的上调 | 首次在tau蛋白缠结病理可检测之前，发现CA3区域Pgk1等糖酵解通路基因在2月龄时已上调，并与缠结严重程度相关，揭示了易感脑区的早期代谢紊乱 | 研究仅基于PS19小鼠模型，结果是否适用于人类AD患者仍需进一步验证；空间转录组的分辨率和覆盖范围可能限制了对稀有细胞类型和低表达基因的检测 | 探究tau蛋白病变驱动的区域易感性与转录组变化之间的关系，特别是代谢紊乱在tau病理早期阶段的作用 | PS19 tau P301S转基因小鼠模型的海马和皮层脑区 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 437 | 2026-09-21 |
3D "Emboli" Culture Models Epithelial Breast Cancer Cell Oxidative Mitochondrial Metabolism with Relevance for Lung Metastasis
2026-03-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0587
PMID:41706033
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研究论文 | 该研究比较了乳腺癌细胞在乳腺球培养模型和"栓塞"培养模型中的差异，发现栓塞培养模型富集上皮特征，细胞偏好线粒体氧化代谢，并与肺转移相关 | 首次系统比较栓塞培养模型与乳腺球培养模型在乳腺癌细胞代谢、超微结构和转移能力方面的差异，揭示栓塞培养模型可作为研究基底上皮型乳腺癌肺转移和OXPHOS相关信号通路的适宜体外模型 | 研究仅涉及三种乳腺癌细胞系，样本量有限，栓塞培养模型的体内微环境模拟仍不完全，需进一步验证其临床相关性 | 比较乳腺癌细胞在乳腺球培养和栓塞培养两种三维培养模型中的生物学特性，评估栓塞培养模型作为研究乳腺癌肺转移和氧化磷酸化代谢的体外模型的适用性 | 乳腺癌细胞系SUM149、IBC-3和MDA-MB-468 | 数字病理学 | 肺癌 | 蛋白质组学，单细胞转录组学，代谢通量分析，电子显微镜 | NA | 图像，文本 | 三种乳腺癌细胞系（SUM149、IBC-3、MDA-MB-468） | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，代谢通量分析 | NA | NA |
| 438 | 2026-09-21 |
Distribution and Levels of Insulin-like Growth Factor 2 Receptor Across Mouse Brain Cell Types
2026-Mar, Receptors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/receptors5010001
PMID:41725679
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研究论文 | 本研究通过双重和多重免疫荧光染色结合单细胞RNA测序数据库，系统比较了成年雄性C57BL/6J小鼠不同脑区和细胞类型中IGF-2R蛋白的分布与水平 | 首次对小鼠全脑多种细胞类型和亚细胞结构中IGF-2R蛋白水平进行系统性比较评估，并将蛋白分布与公开单细胞RNA测序数据库中的Igf2r mRNA表达进行对比验证 | 研究仅基于成年雄性C57BL/6J小鼠，未涵盖雌性、不同年龄阶段或其他品系，且主要依赖免疫荧光半定量分析，缺乏功能性实验验证 | 阐明IGF-2R在不同脑细胞类型和亚细胞区域的分布与表达水平，为其脑功能和治疗靶向研究提供基础 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的多个脑区及不同脑细胞类型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 免疫荧光染色，单细胞RNA测序 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2026-09-21 |
Decoding the Mechanisms of Hepatocellular Carcinoma Cancer Stem Cells and Identifying Potential Therapeutic Strategies Based on Single-cell Omics
2026 Mar-Apr, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20577
PMID:41771574
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据系统解析肝细胞癌癌症干细胞的细胞与空间异质性，并构建预后模型及预测潜在治疗化合物 | 首次基于单细胞组学系统构建肝细胞癌癌症干细胞图谱，揭示其在肿瘤-基质界面的空间富集特征，并整合GEO生存数据构建12基因预后模型，同时通过Connectivity Map预测靶向癌症干细胞的候选化合物 | 数据来源于公共数据库HCCDB v2.0而非自测数据，预后模型仅在GEO数据集（GSE76427、GSE14520）中验证，候选化合物的癌症干细胞抑制活性仅通过计算预测，缺乏实验验证 | 系统表征肝细胞癌相关癌症干细胞，识别预后生物标志物及潜在治疗策略 | 肝细胞癌癌症干细胞及肝细胞癌患者样本 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 拷贝数变异分析, 基因调控网络分析, 通路富集分析, 拟时序轨迹推断, 细胞通讯分析 | Harmony, UMAP, Louvain聚类, SCENIC, GSVA, Monocle, CytoTRACE2, CellChat | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 440 | 2026-09-21 |
Female iPSC X-chromosome inactivation (XCI) erosion and its transcriptomic effects during CRISPR gene editing and neural differentiation
2026-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708613
PMID:41890091
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研究论文 | 该研究利用批量RNA测序和单细胞RNA测序，探究了CRISPR基因编辑和神经分化过程中女性iPSC的X染色体失活侵蚀现象及其对转录组分析的影响 | 首次系统性地揭示了CRISPR编辑和神经分化对女性iPSC中XCI侵蚀的影响，发现XCI侵蚀在CRISPR编辑的iPSC中具有变异性但在神经元中基本保持，并证明了XCI侵蚀对差异表达基因分析的混杂效应 | 研究主要基于有限数量的供体细胞系，XCI侵蚀的分子机制尚未完全阐明，且未涉及其他类型的神经细胞或脑区 | 研究CRISPR基因编辑和神经分化对女性iPSC中X染色体失活侵蚀的影响，以及其对转录组差异表达基因分析的混杂效应 | 女性iPSC细胞系及其分化而来的神经元 | 机器学习 | 神经系统疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPR基因编辑 | NA | 转录组数据 | 来自4个供体细胞系的数百个CRISPR编辑的女性iPSC细胞系（针对66个基因），以及42个编辑基因子集的iPSC衍生神经元的单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |