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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-03-23 |
T cell development from expanded hematopoietic progenitors reveals initiation control by Lmo2 and Flt3L priming
2026-Mar-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adw7765
PMID:41824555
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研究论文 | 本研究通过建立血清无扩增系统,探索了小鼠T细胞发育的最早阶段,揭示了Lmo2和Flt3L在T细胞程序启动中的调控作用 | 利用血清无扩增系统研究T细胞发育早期事件,结合单细胞RNA测序验证,并发现Lmo2作为祖细胞和白血病相关因子显著抑制T细胞程序启动 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;体外扩增系统的分化速度较慢,可能影响对正常发育时间的准确评估 | 探究T细胞发育的最早阶段及其调控机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞样细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序,CRISPR敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2026-03-23 |
Single-cell RNA sequencing provides insights into the potential cellular origins and microenvironment of Extramammary Paget's disease
2026-Mar-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110698
PMID:41831584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探索了乳房外佩吉特病的潜在细胞起源和肿瘤微环境 | 首次在单细胞水平上描绘了EMPD的全面细胞图谱,并识别出表达NY-BR-1的基底角质形成细胞群,该细胞群显示出向佩吉特样表型的转录轨迹,同时揭示了成纤维细胞在细胞间通讯中的核心作用 | 样本量相对有限,且研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证 | 探索EMPD的潜在细胞起源并描绘其肿瘤微环境的细胞组成 | EMPD患者的肿瘤组织细胞 | 单细胞组学 | 乳房外佩吉特病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从患者中收集了50,180个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 423 | 2026-03-23 |
Endothelial SMAD1-MCAM axis facilitates sunitinib resistance and progression of clear cell renal cell carcinoma via LAMB1-ITGB1 signaling
2026-Mar-10, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101388
PMID:41864072
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了透明细胞肾细胞癌中SMAD1-MCAM-LAMB1-ITGB1-RhoA轴驱动的肿瘤-基质相互作用机制及其在舒尼替尼耐药和疾病进展中的作用 | 首次识别出MCAM内皮细胞亚群,阐明了其通过LAMB1-ITGB1-RhoA信号轴促进EMT和细胞外基质重塑的机制,并开发了基于MCAM+内皮细胞的风险评分模型 | 研究主要基于转录组学数据,具体的信号通路调控细节和体内功能验证可能需要进一步实验支持 | 探究透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境特征、耐药机制和疾病进展的分子基础 | 透明细胞肾细胞癌患者样本中的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞(特别是内皮细胞) | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 集成机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 临床数据 | 大型ccRCC队列(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 424 | 2026-03-23 |
A novel ZIC1-BMP4 axis identified in photoaged dermal fibroblasts regulates melanogenesis
2026-Mar-10, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2026.03.003
PMID:41864822
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据与实验验证,揭示了光老化皮肤中成纤维细胞通过ZIC1-BMP4轴调控黑色素生成的新机制 | 首次在光老化皮肤中鉴定出成纤维细胞特异性转录因子ZIC1与BMP4之间的调控轴,并阐明其通过影响黑色素生成关键因子MITF来参与色素沉着过程 | 研究主要基于转录组数据分析和初步实验验证,ZIC1-BMP4轴在体内光老化相关色素沉着中的具体功能机制仍需进一步深入探究 | 识别光老化相关色素沉着的关键调控因子 | 人皮肤组织(光暴露与光保护部位)、成纤维细胞、黑色素细胞 | 数字病理学 | 皮肤光老化与色素性疾病(如黄褐斑) | RNA-seq、单细胞RNA-seq、免疫组织化学、免疫荧光、ChIP-PCR、离体皮肤培养 | NA | 转录组数据、单细胞数据、图像数据 | 利用GTEx数据集中的批量RNA-seq数据及公共单细胞RNA-seq数据进行验证,涉及超过19,000个基因 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2026-03-23 |
Chenodeoxycholic acid redirects the bile acid synthetic pathway to limit pro-inflammatory neutrophil infiltration and alleviate colitis
2026-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.004
PMID:41792997
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研究论文 | 本研究探讨了鹅去氧胆酸通过重编程胆汁酸合成途径,减少促炎性中性粒细胞浸润,从而缓解结肠炎的机制 | 揭示了结肠炎通过增强经典胆汁酸合成途径并抑制替代途径来影响肝脏胆汁酸合成,首次证明CDCA通过激活肠道上皮维生素D受体抑制CXCL2表达,为IBD治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析,人类临床试验尚未进行,且CDCA的具体给药方案和长期安全性需进一步评估 | 探究胆汁酸合成途径在炎症性肠病发病机制中的作用,并评估CDCA作为治疗候选药物的潜力 | 炎症性肠病患者样本、小鼠结肠炎模型、肠道上皮细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、过继转移实验、体外实验、转基因小鼠模型 | NA | 基因表达数据、临床样本数据 | 公共数据集、内部患者样本、动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 426 | 2026-03-23 |
Alk-Fam150b (augmentor α) expression in the paraventricular nucleus of the mouse hypothalamus at molecular resolution, and its sensitivity to acute stress
2026-Mar, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70159
PMID:41856795
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重原位杂交技术,揭示了小鼠下丘脑室旁核中Fam150b和Alk的表达模式及其对急性应激的敏感性 | 首次在分子分辨率水平上证实了Fam150b和Alk在小鼠下丘脑室旁核中的表达,并发现Fam150b在炎症相关应激下表达上调且受糖皮质激素反馈调节 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;机制研究尚不完整,信号通路的具体作用有待进一步阐明 | 探究Fam150b-Alk信号通路在下丘脑室旁核中的表达及其对急性应激的响应,以理解应激诱导摄食和体重变化的潜在机制 | 成年小鼠的下丘脑室旁核组织及其中包含促肾上腺皮质激素释放激素的神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序,多重原位杂交 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用成年小鼠的下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2026-03-23 |
CEMUSA: a graph-based integrative metric for evaluating clusters in spatial transcriptomics
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag056
PMID:41663910
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研究论文 | 本文提出了一种名为CEMUSA的基于图的新型评估指标,用于评估空间转录组学中的聚类结果 | CEMUSA首次将标签一致性、空间组织和错误严重性三个因素整合到一个统一的评估框架中,克服了现有指标只关注单一因素的局限性 | NA | 开发一个有效的评估指标来评估空间转录组学中聚类方法的性能 | 空间转录组学数据中的聚类结果 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基于图的指标 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 428 | 2026-03-23 |
Macrophages in human atherosclerotic plaques in the era of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-17, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf089
PMID:41702598
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术如何重新定义人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的生物学特性,超越了传统的M1/M2极化模型 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多模态组学数据,揭示了人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞亚群的多样性、空间分布和代谢功能,并建立了其与微环境信号、血管位置和疾病阶段的动态联系 | NA | 总结单细胞和空间转录组学时代对人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞生物学的新认识,并探讨其对疾病机制模型和靶向治疗的启示 | 人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多模态组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 429 | 2026-03-23 |
Caldesmon-1-mediated actin dynamics is essential for osteogenic differentiation of aortic valve interstitial cells
2026-Feb-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39938-x
PMID:41703153
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研究论文 | 本研究首次揭示了钙调蛋白-1(CALD1)在钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)发病机制中的作用,通过单细胞RNA测序和功能实验证明CALD1通过调节肌动蛋白动力学影响瓣膜间质细胞的成骨分化和钙化 | 首次发现CALD1在CAVD中的关键作用,并阐明其通过调节肌动蛋白聚合调控瓣膜间质细胞形态、增殖和成骨分化的分子机制 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且CALD1在CAVD中的具体信号通路尚未完全阐明 | 探究CALD1在主动脉瓣钙化疾病发病机制中的作用 | 主动脉瓣间质细胞(VICs) | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,组织学分析 | NA | RNA测序数据,组织图像 | 基于公共单细胞RNA测序数据集和体外培养的VICs | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2026-03-23 |
Innate lymphoid cell heterogeneity and etiology-specific reprogramming in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01282-8
PMID:41673425
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和质谱流式细胞术,分析了50名不同病因(乙肝病毒和非病毒性)肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织中固有淋巴细胞的异质性及其与病因相关的重编程 | 揭示了肝细胞癌中固有淋巴细胞(ILCs)的异质性,首次根据病因(HBV vs 非病毒性)系统描述了ILC亚群(特别是ILC1、ILC2、ILC3)的表型和功能差异,并发现了ILC1在非病毒性HCC中具有细胞毒性表型而在HBV-HCC中呈现耗竭迹象 | 单细胞队列样本量有限,需要在更大数据集中进行验证 | 探究肝细胞癌中固有淋巴细胞的异质性及其在不同病因下的重编程,以理解它们在肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 50名肝细胞癌患者的肿瘤组织和癌旁非肿瘤肝组织 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, CyTOF | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、蛋白质表达数据 | 50名肝细胞癌患者(包括乙肝病毒性和非病毒性病因) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 431 | 2026-03-23 |
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68802-9
PMID:41667466
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研究论文 | 本研究结合报告基因追踪和单细胞转录组学,揭示了海葵中两种成年神经发生的细胞谱系和转录程序 | 首次在海葵中识别出成年神经发生轨迹,发现两种不同的神经发生机制,包括多能祖细胞直接分化和刺细胞逐步成熟 | 研究主要聚焦于海葵这一特定物种,结果在更广泛的刺胞动物门中的普适性有待进一步验证 | 探究刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录调控机制 | 海葵Nematostella vectensis的成年神经发生过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 432 | 2026-03-23 |
Innate antiviral and immune functions associated with the HIV reservoir decay after anti-PD-1 therapy
2026-Feb, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04139-y
PMID:41680482
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了抗PD-1疗法在HIV感染者中减少病毒库的免疫机制 | 首次在HIV感染者中通过纵向多组学分析,揭示了抗PD-1疗法诱导的先天抗病毒和免疫功能与病毒库衰减的关联 | 样本量较小(30名参与者),且主要为男性,可能限制结果的普适性 | 探究抗PD-1疗法减少HIV病毒库的个体差异和潜在机制 | 30名患有癌症的HIV感染者 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | 转录组数据,临床数据 | 30名参与者(29名男性,1名女性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals disease associated changes in brain endothelial cells in the 5XFAD mouse
2026-Jan-30, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00766-w
PMID:41618410
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2026-01-23 |
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12283-5
PMID:41566221
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2026-03-23 |
Soluble guanylate cyclase deficiency drives retinal ganglion cell neurodegeneration with age in female mice through disrupted oxidative metabolism
2026-Jan-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34243-5
PMID:41513693
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研究论文 | 本研究探讨了可溶性鸟苷酸环化酶(sGC)缺失如何通过破坏氧化代谢导致雌性小鼠视网膜神经节细胞随年龄增长而退化 | 揭示了cGMP信号在维持视网膜代谢完整性和RGC功能中的潜在性别特异性作用,并首次将sGC-cGMP信号通路与雌性年龄相关视网膜神经退行性变联系起来 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类样本,且机制细节仍需进一步验证 | 探究sGC在年龄和性别依赖性视网膜神经节细胞功能中的作用 | 缺乏sGCα1亚基的雌性和雄性小鼠的视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blotting, 线粒体超微结构分析, 视力测量, 视网膜氧化代谢体内测量 | NA | RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 图像数据, 生理测量数据 | 雌性和雄性sGCα1缺失小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2026-03-23 |
Losartan Alleviates Chemical Burn-Induced Limbal Stem Cell Deficiency: Repurposing a Venerable Anti-Hypertension Drug
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.35
PMID:41537756
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研究论文 | 本研究通过氮芥诱导的角膜损伤模型,探索了抗高血压药物氯沙坦在缓解角膜缘干细胞缺乏症中的作用 | 首次发现氯沙坦能够通过减少单核细胞/巨噬细胞浸润,显著减轻角膜缘干细胞缺乏症的炎症和新生血管形成,为该药物的新治疗用途提供了证据 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且长期疗效和安全性需进一步评估 | 评估氯沙坦在治疗角膜缘干细胞缺乏症中的潜在疗效 | 氮芥诱导角膜损伤的小鼠模型 | 数字病理学 | 角膜缘干细胞缺乏症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics平台 | 未指定具体产品细节 |
| 437 | 2026-03-23 |
PAX6 Deficiency Compromises the Ability of Limbal Epithelial Stem Cells to Properly Differentiate Into Mature Corneal Epithelial Cells
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.56
PMID:41590604
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了PAX6缺陷小鼠角膜/缘组织的转录组变化,揭示了PAX6缺乏如何影响缘上皮干细胞向成熟角膜上皮细胞的分化能力 | 首次在单细胞分辨率下,通过scRNA-seq技术系统性地描绘了PAX6缺陷小鼠角膜/缘组织的转录组变化,并识别出功能失调的干细胞/早期瞬时放大细胞群 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类疾病;样本量未明确说明,可能影响统计效力 | 探究PAX6突变引起的无虹膜相关角膜病变(AAK)的分子机制,特别是缘干细胞缺陷的分子异常 | 野生型和PAX6杂合(Pax6 het)小鼠的角膜/缘组织 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫染色 | NA | 转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2026-03-23 |
Quantitative profiling of lifespan-dependent cell-cell communication potential reveals dynamic ligand-receptor network shifts across mouse tissues
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345045
PMID:41860844
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研究论文 | 本研究通过整合多种推断方法,对小鼠四个器官(肝、肺、心、肾)在关键生命阶段(出生后发育、成年、衰老)的单细胞RNA测序数据进行分析,揭示了寿命依赖的细胞间通讯动态变化模式 | 开发了一个两阶段比较框架并引入了收缩与扩展(SE)评分,以量化推断的配体-受体相互作用集在不同生物状态间的定向变化,支持跨不同状态(如发育、衰老、疾病)的细胞间通讯定量比较 | 研究基于转录组推断的通讯潜力,仍需进一步的蛋白质水平实验验证;分析仅限于小鼠的四个器官,可能无法完全代表其他组织或物种的情况 | 揭示寿命依赖的细胞间通讯动态变化模式,并开发一个通用框架以定量比较不同生物状态下的推断通讯 | 小鼠的肝脏、肺、心脏和肾脏组织 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LIANA(配体-受体分析框架),整合了多种推断方法 | 单细胞转录组数据 | 涉及四个小鼠器官在多个生命阶段的数据,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 439 | 2026-03-21 |
Chronic inflammation-responsive hydrogel restores myeloid-T cell crosstalk to reinvigorate antitumor immunity against metastatic colorectal cancer
2026-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.03.012
PMID:41858728
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研究论文 | 本文开发了一种慢性炎症响应性水凝胶(TRANS),通过调节骨髓细胞与T细胞间的相互作用,恢复抗肿瘤免疫,以治疗转移性结直肠癌 | 创新点在于设计了一种炎症条件触发的水凝胶,能同时抑制促肿瘤炎症并增强免疫监视,通过释放药物和激动剂优化骨髓细胞与T细胞的交互 | NA | 研究旨在通过重新平衡炎症-免疫动态,开发一种新型免疫疗法以对抗转移性结直肠癌 | 研究针对转移性结直肠癌模型,关注肿瘤微环境中的慢性炎症、骨髓细胞(如肿瘤相关巨噬细胞、cDC1)和T细胞 | 生物医学工程 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2026-03-21 |
Single-cell RNA sequencing and large-panel NGS analysis reveal transcriptional heterogeneity and genomic characteristics of double primary lung cancer and thyroid cancer
2026-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101889
PMID:41859004
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |