单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9459 篇文献,本页显示第 4181 - 4200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4181 2026-07-03
Anti-CCL2-conjugated platelets attenuate early allograft and ischemia-reperfusion injury by inhibiting monocyte infiltration
2026-Jul-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过转录组测序和单细胞测序技术发现趋化因子CCL2是早期同种异体移植功能障碍的关键分子,并开发了一种基于血小板的药物递送系统(PLT-aCCL2)以抑制单核细胞浸润、减轻炎症损伤和急性排斥反应 首次报道血小板可将抗CCL2抗体定向递送至肝脏移植物,打破CCL2-CCR2+单核细胞信号通路驱动的免疫-炎症级联反应,并证明PLT-aCCL2能通过减少髓系细胞与T细胞相互作用来缓解急性细胞排斥反应 研究主要基于临床队列和动物模型,未在大型临床随机对照试验中验证治疗效果;血小板制剂的长期安全性和稳定性有待进一步评估 阐明肝脏移植后早期炎症损伤和排斥反应的关键驱动机制,并开发靶向干预策略 接受肝脏移植的患者及原位肝移植小鼠模型 数字病理学 肝脏疾病 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 基因表达数据 临床队列和原位肝移植小鼠模型 Illumina bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq Illumina NovaSeq bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq测序平台
4182 2026-07-03
Anserine restores antibacterial immunity in cirrhosis via a protective CCL5-mediated hepatocyte-CD44+pDC crosstalk
2026-Jul-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 小鼠肝脏单细胞RNA测序发现肝硬化中一种保护性CCL5介导的肝细胞-CD44+浆细胞样树突状细胞串扰被破坏,鹅肌肽通过恢复该轴增强抗菌免疫 首次揭示鹅肌肽-CCL5-pDC-巨噬细胞代谢-免疫轴在肝硬化中受损,并证明鹅肌肽补充可恢复该轴以降低感染风险 研究主要在动物模型中进行,人类数据虽来自多中心队列但样本量有限,且机制验证依赖于多种体外和体内实验,尚未直接评估鹅肌肽在人类中的治疗效果 探究肝硬化患者易感细菌感染的免疫缺陷机制,特别是肝脏内细胞串扰的失调 对照和肝硬化小鼠(有无细菌感染)、肝硬化患者(来自全国多中心前瞻性队列CATCH-LIFE) 数字病理学 肝脏疾病, 肝硬化 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 靶向代谢组学, 质谱, 外体共培养, 体内过继转移, 抗体阻断, 转基因小鼠模型, 人类批量转录组学和单细胞转录组学数据集 NA 基因表达数据, 代谢组学数据, 临床队列数据 对照和肝硬化小鼠多个, 人类多中心前瞻性队列(CATCH-LIFE) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
4183 2026-07-03
4-1BBL on monocyte lineage cells rather than on classical dendritic cells drives CD8+ T cell accumulation in the respiratory tract and protects from severe respiratory influenza infection
2026-Jul-01, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了在急性流感感染期间,单核细胞谱系细胞而非经典树突状细胞上的4-1BBL驱动CD8+ T细胞在呼吸道的积累,并保护机体免受严重呼吸道流感感染 首次明确区分单核细胞谱系细胞和经典树突状细胞在提供4-1BBL方面的不同作用,发现炎性单核细胞独特地提供4-1BBL以增加CD8 T细胞在肺部的积累,这种分工对于抵御严重流感感染至关重要 研究主要在鼠模型中进行,结果向人类的转化需要进一步验证;未阐明4-1BBL表达调控的分子机制 阐明提供4-1BBL的抗原呈递细胞类型及其在流感感染中驱动CD8 T细胞积累和保护作用中的分工 小鼠的单核细胞谱系细胞、经典树突状细胞、CD8效应T细胞和组织驻留记忆T细胞 免疫学 流感病毒感染 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 混合骨髓嵌合体, Cre重组酶敲除 NA 基因表达数据, 流式细胞术数据 小鼠模型,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4184 2026-07-03
Single-cell architecture of purinergic signaling in human cord blood hematopoietic stem and progenitor cells
2026-Jul-01, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 应用单细胞RNA测序揭示人脐带血造血干和祖细胞中嘌呤能信号传导的转录组结构 首次在人造血干和祖细胞亚群中描绘嘌呤能信号网络的层级组织,发现原始HSPC具有受限的嘌呤能受体库并耦合胞内核苷酸回收机制,而谱系偏向簇则富集与炎症激活和迁移相关的受体和核苷外酶 该研究仅基于转录组分析,未在蛋白或功能水平验证嘌呤能受体和酶的表达与活性,且样本来源限于脐带血,可能不反映成体骨髓中HSPC的特征 阐明嘌呤能信号在人造血干和祖细胞不同亚群中的转录组织及其在早期造血调控中的作用 人脐带血来源的CD133⁺Lin⁻CD45⁺和CD34⁺Lin⁻CD45⁺富集HSPC细胞 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人脐带血样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
4185 2026-07-03
Microglial tunneling nanotubes: an intercellular transfer facilitating mitochondrial dysfunction and neuroinflammation in experimental cerebral malaria
2026-Jul-01, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 探究微胶质细胞隧道纳米管在实验性脑疟中介导线粒体功能障碍和神经炎症的细胞间传递机制 首次揭示隧道纳米管在脑疟中介导微胶质细胞间线粒体和疟色素转移,并阐明其放大神经炎症的分子机制 主要基于体外和动物模型,缺乏临床样本验证;隧道纳米管抑制剂的长期效果和安全性未评估 阐明隧道纳米管在实验性脑疟微胶质细胞激活和神经炎症中的具体作用机制 实验性恶性疟疾模型小鼠的微胶质细胞 数字病理学 疟疾 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 实验性恶性疟疾模型小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
4186 2026-07-03
An AI-Driven Multi-Omics Framework Identifies CASP8 as a Clinically Actionable Pyroptosis Biomarker in Bladder Cancer
2026 Jul-Aug, BioFactors (Oxford, England)
研究论文 本研究开发了一个AI驱动的多组学框架,整合单细胞RNA测序、多队列转录组学和机器学习,鉴定出CASP8作为膀胱癌中临床可操作的焦亡生物标志物 创新性地将人工智能与多组学数据整合,从单细胞分辨率下分析染色体非整倍性和拷贝数变异,构建共识焦亡评分系统并通过机器学习筛选关键生物标志物,最终发现CASP8与基因组不稳定性及焦亡失调的临床关联 未在文中明确提及局限性 开发一种AI驱动的多组学发现框架,以克服将复杂基因组不稳定性与可解释生物学过程相关联的困难,加速膀胱癌生物标志物的临床转化 膀胱癌恶性细胞群体及其微环境中的焦亡活性与CASP8表达 机器学习 膀胱癌 单细胞RNA测序、多队列转录组学、机器学习基因组推断 机器学习模型(未具体说明类型) 单细胞RNA测序数据、转录组学数据、基因组变异数据 多个队列的样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
4187 2026-07-03
A pan-cancer single-cell atlas uncovers the role of sex hormones and chromosomes in sex-divergent reprogramming of the tumor microenvironment
2026-Jul-01, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4188 2026-07-03
Unveiling tumor heterogeneity by single cell RNA-sequencing: From basic considerations to clinical applications
2026-Jun-28, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序在解析肿瘤异质性方面的技术基础、平台演变及临床应用,并强调了其在肺癌研究中的具体进展 系统梳理了scRNA-seq从基础考量到临床应用的完整路径,并结合机器学习方法加速生物标志物发现和个体化治疗预测 成本高、可扩展性有限,且在常规临床应用前需严格验证 探讨scRNA-seq在解析肿瘤异质性并推动精准医学中的潜力 肺癌中的肿瘤细胞、免疫微环境及治疗耐药机制 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 深度学习分类器、图模型 单细胞转录组数据 约380项已完成或正在进行的研究(来自ClinicalTrials.gov) NA 单细胞RNA-seq NA 从手动显微操作到高通量系统
4189 2026-07-03
Integrative transcriptomic and CRISPR dependency analysis identifies hepatoblastoma-specific essential genes and actionable vulnerabilities
2026-Jun-24, Cancer genetics IF:1.4Q4
研究论文 整合转录组学和CRISPR依赖性分析,识别肝母细胞瘤特异性必需基因和可利用的药物靶点 首次结合转录组分析、CRISPR依赖性图谱、机器学习及药物基因组学注释,系统识别肝母细胞瘤特异性必需基因和预测性分子标志物 未提及潜在限制 识别肝母细胞瘤特异性必需基因和可利用的药物脆弱性 肝母细胞瘤肿瘤样本与正常肝组织 机器学习 肝母细胞瘤 CRISPR-Cas9, RNA-seq 弹性网络回归, 深度学习分类器 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, CRISPR依赖性数据 训练队列和外部队列,具体样本数量未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4190 2026-07-03
PD-1 H (VISTA) drives immunosuppressive reprogramming of glioma-associated myeloid cells to promote glioma progression
2026-Jun-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究揭示了PD-1 H(VISTA)作为髓系限制性免疫检查点,驱动胶质瘤相关髓系细胞的免疫抑制重编程,促进胶质瘤进展 首次系统研究了PD-1 H在胶质瘤相关髓系细胞中的功能角色,发现其通过AKT/NF-κB通路驱动髓系细胞免疫抑制重编程,并验证了靶向PD-1 H的免疫治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析,PD-1 H阻断在人体中的治疗效果和潜在副作用仍需进一步验证 探究PD-1 H在胶质瘤相关髓系细胞中的功能及其对胶质瘤进展的影响 人胶质瘤组织、胶质瘤相关髓系细胞(包括小胶质细胞和浸润巨噬细胞)、CD8+ T细胞 机器学习 胶质瘤 NA NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 人类胶质瘤临床队列样本、原位胶质瘤小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4191 2026-07-03
Inferring cell-specific gene regulatory networks based on causal graph embedding
2026-Jun-15, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 提出一种基于因果图嵌入的监督计算框架CSGRN,从单细胞RNA测序数据中推断细胞特异性基因调控网络 将图嵌入与条件细胞特异性网络相结合,整合因果调控结构及局部与全局表征,提升调控网络推断的准确性和鲁棒性 未提及局限性 开发能从单细胞RNA测序数据中推断细胞特异性基因调控网络的监督计算方法 单个细胞的基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图嵌入模型 基因表达数据 三个数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4192 2026-07-03
scParadise: tunable, highly accurate multi-level cell type annotation, unknown cell type identification, and modality imputation
2026-Jun-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出scParadise工具套件,用于单细胞RNA测序数据的多水平细胞类型注释、未知细胞类型识别和跨组织模态数据填补 scParadise整合三个独立工具(scAdam、scEve、scNoah),实现高精度的多水平细胞注释、未知细胞类型检测及跨组织蛋白质表达填补,并在人类内脏脂肪组织中鉴定出三种新的自然杀伤T细胞亚群 基于标题和摘要未提及明显的局限性 解决单细胞RNA测序数据稀疏性和异质性带来的细胞类型注释、多组学状态解释及可重复结论的挑战 Tabula Muris Senis图谱以及人类内脏脂肪组织样本 机器学习 肥胖相关慢性炎症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包含Tabula Muris Senis图谱数据及人类内脏脂肪组织样本(具体样本量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
4193 2026-07-03
An artificial intelligence optimized hepatic differentiation unveils NR5A2 and AP-1 transcriptional regulation in hepatic maturation
2026-Jun, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 利用机器学习人工智能工具优化肝细胞分化方案,发现NR5A2和AP-1在肝细胞成熟中的转录调控机制 开发基于机器学习的人工智能工具,利用肝祖细胞明场图像优化肝分化方案,无需免疫染色或谱系追踪,结合转录组和表观基因组分析揭示NR5A2和AP-1的关键调控作用 未明确说明 提高肝分化成功率并解析肝细胞成熟的基因调控机制 人多能干细胞衍生的肝祖细胞和肝细胞样细胞 机器学习 肝脏疾病 单细胞RNA测序、转录组分析、表观基因组分析 机器学习模型 明场图像 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4194 2026-07-03
Exploring mechanisms of scar-free skin wound healing in adult zebrafish in comparison to mouse
2026-Jun, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学比较成年斑马鱼与小鼠皮肤伤口愈合机制,揭示斑马鱼无疤痕愈合的分子基础 首次利用HCR-based空间转录组学分析斑马鱼皮肤伤口愈合过程中细胞动态,发现斑马鱼成纤维细胞缺乏胶原表达但表达促纤维化基因,且TGFβ信号诱导plod2表达但不影响肉芽组织消退 斑马鱼基因组缺乏retln基因,但仍存在plod2表达和胶原交联,提示存在其他未明确的促进暂时性纤维化消退的途径 探究成年斑马鱼无疤痕皮肤伤口愈合的细胞和分子机制,并与小鼠进行比较 成年斑马鱼和小鼠的皮肤伤口愈合过程 数字病理学 皮肤损伤 单细胞RNA测序、HCR-based空间转录组学 NA 基因表达数据 斑马鱼和小鼠的皮肤伤口样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和HCR-based空间转录组学
4195 2026-07-03
Hypoxic niche drives lineage imbalance and early tumorigenesis in EGFR-mutant lung cancer
2026-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 该研究揭示了缺氧微环境通过核糖体碰撞信号驱动EGFR突变肺癌早期肿瘤发生和谱系失衡的机制 首次发现中心型EGFR突变肺腺癌的早期恶性进展与缺氧微环境相关,并阐明ZAKα-MAPK-c-Fos轴介导的核糖体碰撞信号在肺泡谱系失衡中的作用 研究主要基于小鼠模型和类器官,人类患者数据有限,且未深入探讨不同缺氧程度对肿瘤进展的剂量效应 明确EGFR突变肺腺癌早期侵袭性进展的空间临床决定因素,并建立基于谱系的机制框架 EGFR突变肺腺癌细胞、小鼠模型、3D类器官、临床样本 数字病理学 肺癌 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学分析 NA 基因表达数据、组织图像 277例临床样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
4196 2026-07-03
ZNF469 drives TGF-β1/SMAD3-mediated extracellular matrix regulation in pulmonary fibrosis
2026-May-28, Biomolecules & biomedicine
研究论文 通过整合功能与转录组方法,研究ZNF469在肺纤维化中通过TGF-β1/SMAD3轴驱动细胞外基质调控的机制 首次揭示ZNF469作为TGF-β1/SMAD3轴的下游转录因子在肺成纤维细胞激活及细胞外基质沉积中的关键作用,并利用CUT&RUN技术证明其直接调控胶原基因启动子 未在体内模型中验证ZNF469的促纤维化功能,且未阐明ZNF469与SMAD3相互作用的分子细节 揭示ZNF469在肺纤维化中调控成纤维细胞激活和细胞外基质沉积的转录机制 人类肺成纤维细胞及来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本 NA 肺纤维化 RNA-seq, CUT&RUN, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA 转录组数据, 基因表达数据 来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
4197 2026-07-03
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-05-15, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 利用Scissor算法鉴定与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,对结直肠癌亚型进行分类并评估免疫微环境 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据,鉴定出与结直肠癌不良预后显著相关的成纤维细胞亚群,并揭示其促转移通路激活及免疫激活但功能耗竭的特征 未提及具体局限性,可能包括算法依赖的数据整合质量及验证样本的有限性 识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,用于亚型分类和免疫微环境评估 结直肠癌成纤维细胞亚群及肿瘤微环境中的免疫细胞 机器学习 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Scissor算法 基因表达数据 从TCGA和GEO数据库整合的批量RNA-seq及单细胞RNA-seq数据 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
4198 2026-07-03
Single-cell profiling identifies a pro-tumoral VCAN positive macrophage subset and defines a prognostic signature in glioblastoma
2026-May-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定胶质母细胞瘤中促肿瘤的VCAN阳性巨噬细胞亚群并构建预后特征 首次鉴定出GBM微环境中VCAN⁺巨噬细胞亚群,揭示其终末分化状态、TNF-α驱动的独特极化表型及SPP1信号介导的促肿瘤免疫抑制机制,并基于其相关基因构建有效预后模型 样本量较小,需更大队列和功能性验证以明确该亚群的治疗潜力和空间分布模式 解析胶质母细胞瘤微环境中巨噬细胞的异质性,鉴定关键亚群并建立预后模型 胶质母细胞瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学学习 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 机器学习模型 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4199 2026-07-03
Combining single cell and bulk transcriptomics with Mendelian randomization identifies gut microbiota related prognostic genes and mechanisms in thyroid cancer
2026-May-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 结合单细胞与批量转录组学及孟德尔随机化方法,鉴定甲状腺癌中与肠道菌群相关的预后基因及机制 首次通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和孟德尔随机化分析,系统鉴定与肠道菌群相关的甲状腺癌预后基因,并揭示成纤维细胞在甲状腺癌进展中的关键作用 未明确提及局限性 鉴定与甲状腺癌及肠道菌群相关的预后基因,并探索其分子机制 甲状腺癌患者 机器学学习 甲状腺癌 RNA-seq 机器学习模型(如用于构建预后模型) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4200 2026-07-03
Integrating machine learning and single-cell sequencing to reveal the role of kinase-related genes in subtype classification and prognostic significance of lung squamous cell carcinoma
2026-May-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合机器学习和单细胞测序,揭示激酶相关基因在肺鳞癌亚型分类和预后中的作用 首次大规模系统探索激酶相关基因在肺鳞癌生存预后和微环境重塑中的调控功能,并构建包含四个关键激酶基因的预测模型 模型在训练和外部验证队列中1年、3年和5年的AUC值均在0.60左右,预测性能中等,可能存在进一步改进空间 研究激酶相关基因对肺鳞癌发展的影响,构建预后预测模型,为个性化治疗提供理论支持 肺鳞癌患者 机器学习和数字病理学 肺癌 RNA-seq,单细胞RNA测序 LASSO-Cox回归模型 转录组数据 TCGA-LUSC队列和两个GEO外部数据集(GSE157010和GSE73403),以及单细胞RNA测序数据(GSE127465和GSE162498) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部