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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-09-21 |
Microglia Display Heterogeneous Initial Responses to Disseminated Tumor Cells
2026-03-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3425
PMID:41369553
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研究论文 | 本研究结合体内命运图谱成像、单细胞RNA测序和全息光转换技术(opto-omics),追踪播散性肿瘤细胞定植过程中肿瘤命运及小胶质细胞的早期异质性反应 | 首次在同一个动物体内随时间追踪肿瘤命运和早期小胶质细胞反应,揭示了小胶质细胞对脑转移的早期异质性反应及可靶向的可塑性,发现通过抑制TGFβ信号或敲除肿瘤细胞表面抗原CD24和CD47可改变小胶质细胞表型 | 摘要中未提及具体局限性 | 理解发育中的肿瘤微环境中异质性小胶质细胞亚群如何被调控,为早期阶段消除转移性肿瘤的治疗策略铺平道路 | 播散性肿瘤细胞定植过程中的小胶质细胞及肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序、体内命运图谱成像、全息光转换技术(opto-omics) | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2026-09-21 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
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研究论文 | 本文提出了一种全无监督方法ITEC,通过迭代跟踪与纠错,高保真地重建了斑马鱼胚胎中1850万个细胞的完整谱系和命运图谱 | ITEC是首个能够自动、高保真地重建胚胎中每个细胞谱系的全无监督方法,并在TB级数据上验证了超过99.7%的准确率 | 摘要中未明确提及研究限制 | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图谱,并探索细胞尺度和单胚胎水平的发育动态 | 斑马鱼、小鼠等跨物种胚胎数据集 | 计算生物学、发育生物学 | NA | 单细胞谱系追踪、空间转录组学 | 迭代跟踪与纠错算法 | 图像、文本 | 总计1850万个细胞,来自斑马鱼、小鼠等四个跨物种数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2026-09-21 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
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研究论文 | 提出UniST统一生成式AI框架,从稀疏连续切片中计算重建密集连续的三维空间转录组景观 | 首个统一生成式AI框架,集成核点卷积与交叉注意力点云上采样、光流插值连续切片重建、图自编码器与隐式神经表示基因表达填补三个模块,在不改变实验技术的前提下实现三维空间转录组计算重建 | 仅在小鼠胚胎和两种人类癌症组织中验证,未在其他物种或更多组织类型中广泛验证;依赖现有稀疏连续切片数据,重建精度受原始数据质量影响 | 从稀疏序列切片中计算重建密集连续的三维空间转录组景观,弥补现有二维切片采集导致的三维组织信息不完整问题 | 小鼠胚胎数据集和两种人类癌症三维组织 | 数字病理学 | 肺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 生成式AI, 核点卷积, 交叉注意力, 光流插值, 图自编码器, 隐式神经表示 | 空间转录组数据, 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 404 | 2026-09-21 |
Melanocyte loss dominates the vitiligo transcriptome: a rank-based meta-analysis
2026-Mar-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.07.26345817
PMID:41728299
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研究论文 | 本研究对六项独立转录组研究进行基于秩的荟萃分析,识别白癜风皮损的共识特征,发现黑素细胞丢失是主要转录组特征 | 采用基于秩的荟萃分析方法整合微阵列、bulk和单细胞RNA-seq多种平台数据,发现白癜风中黑素细胞丢失信号稳健且一致,并识别了高黑素细胞特异性的候选标志物CYB561A3和QPCT | 免疫反应激活在不同研究间存在异质性,可能受采样方法和疾病特征影响,需要进一步研究;可能受纳入研究数量和分析方法限制 | 识别白癜风皮损皮肤的共识转录组特征,揭示其分子机制 | 白癜风患者皮损皮肤样本及健康对照样本 | 转录组学 | 白癜风 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 115个样本,来自6项独立研究 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 405 | 2026-09-21 |
Predicting targeted- and immunotherapeutic response outcomes in melanoma with single-cell Raman spectroscopy and AI
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654612
PMID:41889902
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研究论文 | 该研究结合单细胞拉曼光谱与机器学习,对黑色素瘤细胞系和患者样本进行无创性细胞表型分析和治疗耐药性预测 | 首次将单细胞拉曼光谱与机器学习相结合,实现非破坏性的单细胞水平治疗反应预测,并开发了适用于患者样本的两阶段评估流程 | 样本量有限(9例患者样本),需要在更大规模的多中心队列中进一步验证方法的普适性和临床适用性 | 开发一种基于单细胞拉曼光谱和机器学习的非破坏性方法,用于快速预测黑色素瘤患者对靶向治疗和免疫治疗的耐药性反应 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系,以及9例已知耐药谱的黑色素瘤患者来源样本 | 数字病理学, 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 拉曼光谱 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系,9例黑色素瘤患者来源样本,33种临床相关患者-药物组合 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2026-09-21 |
Vps35 p. D620N causes Lrrk2 kinase hyperactivity, chronic microglial activation and inflammation
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710482
PMID:41846978
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Vps35 p.D620N敲入小鼠小胶质细胞的转录组和功能变化,揭示了该突变导致慢性促炎性小胶质细胞表型及其对帕金森病发病机制的贡献 | 首次在Vps35 p.D620N敲入小鼠中系统研究小胶质细胞的转录组和功能变化,揭示了逆转录体功能障碍与LRRK2激酶过度活跃如何交叉影响小胶质细胞生物学,从而促进帕金森病发病 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证;单细胞RNA测序仅分析了六个月龄小鼠的小胶质细胞,未涵盖疾病不同阶段;未深入探讨Vps35 p.D620N如何具体导致LRRK2激酶过度活跃的分子机制 | 探究Vps35 p.D620N突变对小胶质细胞转录组和免疫功能的影响,以及其在帕金森病发病机制中的作用 | Vps35 p.D620N敲入小鼠(VKI)的小胶质细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 6只六个月龄VKI小鼠的小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2026-09-21 |
CXCR6+ T Cells Drive Immune Checkpoint Inhibitor Myocarditis
2026-Mar-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 该研究发现CXCR6+ T细胞驱动免疫检查点抑制剂相关心肌炎,并通过小鼠模型和患者数据验证了CXCR6作为治疗靶点的潜力 | 首次发现CXCR6是活化心脏T细胞的关键标志物,并证明CXCR6+ T细胞对ICI心肌炎发病是必需的,同时提出CXCR6作为治疗靶点 | 主要基于小鼠模型和药物警戒数据库分析,需要进一步临床验证 | 探究抗LAG-3/PD-1联合治疗相关心肌炎的驱动T细胞群和信号通路 | VigiBase数据库中的患者数据、Lag3-/-Pdcd1-/-小鼠模型、临床前模型和患者数据 | 免疫学、心血管疾病 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学、心电图 | NA | 文本、图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 408 | 2026-09-21 |
Phenotypically similar but functionally distinct NK cell populations within the human maternal-fetal interface
2026-Mar-10, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlag001
PMID:41808348
|
研究论文 | 研究比较了足月妊娠母胎界面中蜕膜-胎盘界面(DPI)和蜕膜中的自然杀伤(NK)细胞,发现两者表型相似但功能不同 | 发现在解剖学相邻的两种组织中存在功能不同的组织驻留NK细胞群,且这种功能差异不能通过细胞表面表型或转录组预测 | 仅分析了足月妊娠样本,未涉及早孕期或病理妊娠,且未明确导致功能差异的具体机制 | 探究足月妊娠母胎界面的NK细胞是否具有效应功能,以及其功能与表型、转录组的关系 | 足月妊娠母胎界面(蜕膜-胎盘界面和蜕膜)中的NK细胞 | 单细胞组学、免疫学 | 正常妊娠 | 高参数流式细胞术、单细胞测序 | NA | 流式细胞数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 409 | 2026-09-21 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 该研究构建了基于铁死亡相关基因的机器学习预测模型,揭示了IFN-γ通过IRF1上调AGPAT3驱动脂质重塑,从而增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性并提升免疫治疗疗效 | 首次揭示IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过重塑多不饱和醚磷脂代谢增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性,并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习模型用于预测免疫检查点抑制剂响应 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的治疗潜力及其分子机制 | 肿瘤细胞、免疫检查点抑制剂治疗的肿瘤患者 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、脂质组学、转录组学、ChIP-seq、CUT&Tag | 机器学习预测模型 | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-09-21 |
Ribosomal modifications are associated with mesenchymal fate selection in the neural crest lineage
2026-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70375-6
PMID:41803115
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研究论文 | 该研究利用Smart-seq2单细胞转录组学揭示核糖体RNA修饰和核糖体组装因子与神经嵴细胞间充质命运决定相关,并涉及神经母细胞瘤进展 | 首次发现间充质命运承诺与rRNA修饰及核糖体组装因子表达相关,而非结构性核糖体蛋白;鉴定EMG1和NHP2介导的18S rRNA关键修饰m¹acp³ψ及其成熟需要TSR3;将核糖体异质性与正常发育和肿瘤进展联系起来 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究核糖体修饰和核糖体组装在神经嵴谱系命运决定中的作用及其对神经母细胞瘤进展的影响 | 神经嵴细胞、颅神经嵴细胞、神经母细胞瘤细胞系及患者数据 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | Smart-seq2单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | Illumina | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞转录组测序平台 |
| 411 | 2026-09-21 |
ChatSpatial: Schema-Enforced Agentic Orchestration for Reproducible and Cross-Platform Spatial Transcriptomics
2026-Mar-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.26.708361
PMID:41890081
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研究论文 | 本文提出了ChatSpatial,一个基于LLM和模式约束的智能体编排平台,用于可重复且跨平台的空间转录组学分析 | LLM从预验证的工具模式中选择而非生成自由形式代码,领域知识嵌入模式描述中用于上下文感知参数推断;基于MCP协议统一了Python和R生态系统中15个分析类别的60多种方法;实现了工作流级别的近乎确定性的可重复性 | 摘要中未明确提及 | 解决空间转录组数据分析中跨Python和R生态系统计算方法的复杂性问题,实现可重复的跨平台分析工作流 | 空间转录组数据,以及两个已发表研究(卵巢癌亚克隆异质性和口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境组织) | 空间转录组学 | 卵巢癌, 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | LLM | 空间转录组数据 | 两个已发表研究的数据集(卵巢癌和口腔鳞状细胞癌) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 412 | 2026-09-21 |
Spatially defined danger zone shapes gastric cancer progression through CCDC80+ fibroblast-induced CD8+ T cell dysfunction
2026-03-07, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02287-1
PMID:41793512
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研究论文 | 该研究通过空间转录组学、单细胞分析和机器学习,揭示了胃癌中一个由CCDC80+成纤维细胞驱动的“危险区”空间结构,该结构通过CXCL12-CXCR4轴招募CD8+ T细胞并诱导其功能障碍,促进免疫抑制和肿瘤进展 | 首次定义并表征了胃癌中一个独特的基质-免疫-血管核心区域(危险区),揭示了CCDC80+成纤维细胞通过CXCL12-CXCR4信号轴招募并导致CD8+ T细胞耗竭和凋亡的新机制,并开发了基于XGBoost和LightGBM的预后预测模型 | 摘要未明确提及研究的局限性 | 探究胃癌肿瘤微环境中空间异质性对疾病进展和免疫抑制的影响,并寻找新的生物标志物、预后工具和治疗靶点 | 侵袭性小鼠肿瘤模型和人类胃癌样本 | 数字病理学, 机器学习 | 胃癌 | 空间转录组学, 单细胞分析, 免疫组织化学, 细胞共培养 | XGBoost, LightGBM | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2026-09-21 |
SR2P: an efficient stacking method to predict protein abundance from gene expression in spatial transcriptomics data
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.709692
PMID:41846960
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研究论文 | 该文章提出了SR2P,一个基于堆叠的机器学习框架,用于从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度 | SR2P整合了11个互补的预测模型,在多个空间多组学基准测试中持续优于现有方法,能够从仅有RNA的空间数据中推断蛋白质丰度 | 技术和成本限制仍然是空间多组学分析的门槛,缺乏多组学空间数据限制了免疫细胞及其信号通路的识别 | 从空间转录组学数据中的RNA表达预测空间蛋白质丰度,扩展当前空间平台在肿瘤免疫学研究中的分析能力 | 空间转录组学数据,头颈部鳞状细胞癌患者样本 | 空间转录组学,机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学,空间多组学 | 堆叠集成学习 | RNA表达数据,图像 | NA | NA | 空间转录组学,空间多组学 | NA | NA |
| 414 | 2026-09-21 |
ENS lineage potential is not intrinsically regionalized but is modulated by PTPRZ1 signaling
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.05.709942
PMID:41846962
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研究论文 | 该研究通过多重单细胞RNA测序和功能扰动实验,揭示了肠道神经系统(ENS)在小肠发育过程中缺乏内在的区域化特征,而是遵循以神经元和胶质细胞分化为主的时间成熟轨迹,并受微环境信号(特别是PTN/MDK-PTPRZ1信号)调控。 | 首次系统性地证明ENS谱系潜能并非内在区域化,而是通过间充质来源的A-P模式化微环境信号(尤其是PTN/MDK-PTPRZ1通路)进行后天精细调控,并利用人多能干细胞衍生的ENS培养体系验证了PTPRZ1信号在人类ENS发育中的功能相关性。 | 研究主要基于小鼠模型(E13.5-E18.5),人类ENS发育的验证仅通过体外干细胞衍生培养体系进行,缺乏体内人类发育数据的直接支持;此外,对于其他信号通路在ENS区域化调控中的协同作用尚未全面解析。 | 探究肠道神经系统(ENS)在小肠发育过程中是否存在与上皮和间充质相似的前后轴(A-P)区域化转录程序,并鉴定调控ENS成熟的外部微环境信号。 | 小鼠胚胎期(E13.5-E18.5)小肠中的肠道神经系统细胞、肠上皮细胞和间充质细胞,以及人多能干细胞衍生的ENS培养体系。 | 单细胞组学、发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重单细胞RNA测序、配体-受体分析、功能扰动实验 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 小鼠胚胎期E13.5至E18.5多个时间点的小肠组织样本,以及人多能干细胞衍生的ENS培养样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 415 | 2026-09-21 |
Dynamic transcriptomic remodeling in grafted human neural progenitor cells uncovers mechanisms for vision preservation in a rat model of retinitis pigmentosa
2026-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69776-4
PMID:41792118
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学追踪了移植到视网膜色素变性大鼠模型视网膜下的人神经祖细胞(hNPCs)及宿主视网膜细胞的时序基因表达变化 | 首次在视网膜色素变性大鼠模型中系统揭示移植hNPCs的动态转录组重塑过程,发现其主要分化为星形胶质细胞表型并通过神经营养因子分泌(尤其是MANF)、代谢调节、抑制凋亡、氧化应激和炎症以及细胞外基质重塑等机制保护光感受器,同时通过CellChat分析揭示了细胞间信号通讯随时间逐渐减弱的规律 | 研究仅基于大鼠模型,尚需在更接近人类的模型或临床样本中验证;未明确hNPCs长期存活和功能维持的具体调控机制;样本量信息未在摘要中说明 | 探究移植hNPCs的长期命运及其与宿主视网膜细胞的相互作用机制,以阐明其在视网膜色素变性中保护视力的分子基础 | 移植到视网膜色素变性大鼠模型视网膜下的人神经祖细胞(hNPCs)及宿主视网膜细胞 | 单细胞转录组学、数字病理学、再生医学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-09-21 |
Spatial transcriptomics reveals mechanism of autoimmunity driven by internalized autoantibodies
2026-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.14.26346329
PMID:41757163
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研究论文 | 该研究通过空间转录组学等技术揭示自身抗体被细胞内化后驱动自身免疫的机制,并在多种自身免疫病中得到验证 | 首次将自身抗体内化确立为多种自身免疫病共享的致病机制,发现抗体分泌细胞可将免疫球蛋白RNA转移至邻近受累细胞,并证明患者IgG足以诱导相应转录组程序 | 摘要中未明确说明样本量有限、机制验证主要依赖体外电转模型、空间转录组分辨率与覆盖度可能受限等具体局限 | 阐明自身抗体内化的机制及其在不同疾病、细胞类型和受累组织中的普遍性 | 抗Mi2皮肌炎、抗PM/Scl硬化性肌炎患者的肌肉活检样本,以及抗U1RNP混合性结缔组织病、抗Ku重叠综合征、抗Scl70系统性硬化症患者的不同组织 | 空间转录组学 | 自身免疫病 | bulk RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 电转 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 荧光图像 | 来自多个独立队列的抗Mi2皮肌炎和抗PM/Scl硬化性肌炎患者肌肉活检样本,以及多种其他自身免疫病患者的组织样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 417 | 2026-09-21 |
Selective B-cell subset depletion underlies increased infection risk in patients with MM treated with anti-BCMA vs anti-GPRC5D bsAbs
2026-Mar-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029572
PMID:41405507
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了抗BCMA双特异性抗体相比抗GPRC5D双特异性抗体在多发性骨髓瘤患者中导致更高感染风险的机制,即抗BCMA抗体同时耗竭浆细胞和B细胞谱系(从小前B细胞阶段开始),而抗GPRC5D抗体仅靶向浆细胞 | 首次发现BCMA在成熟B细胞和小前B细胞中表达,而GPRC5D仅表达于恶性及正常浆细胞;通过单细胞RNA测序和流式细胞术证明抗BCMA双特异性抗体同时耗竭B细胞和浆细胞,而抗GPRC5D双特异性抗体仅选择性靶向浆细胞;利用MIcγ1小鼠模型作为阴性对照验证了BCMA表达模式 | 样本量相对较小(单细胞RNA测序11例患者和8例健康供者,流式细胞术62例和31例患者,单细胞RNA测序8例患者);未明确说明随访时间;未详细阐述不同双特异性抗体对感染风险影响的具体临床终点 | 探究抗BCMA与抗GPRC5D双特异性抗体治疗多发性骨髓瘤时导致不同感染率和严重程度的机制 | 接受抗BCMA或抗GPRC5D双特异性抗体治疗的多发性骨髓瘤患者及健康供者 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、下一代流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 单细胞RNA测序:11例多发性骨髓瘤患者和8例健康供者,以及8例患者用于验证;流式细胞术:62例复发多发性骨髓瘤患者和31例患者用于验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-09-21 |
Histological, ultrastructural, and single-cell profiling reveal immune-mediated remodeling in gallbladder inflammation
2026-Mar-05, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-026-04057-6
PMID:41781757
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研究论文 | 本研究通过组织学、免疫组化、透射电镜、细胞因子表达分析及单细胞RNA测序,揭示急性和慢性胆囊炎症中不同的免疫-基质重塑程序 | 首次结合组织学、超微结构和单细胞转录组学系统比较急性胆囊炎与慢性胆石症的免疫-基质细胞程序,发现两者并非时间性转变而是截然不同的免疫-基质构型 | 样本量有限(41例),仅对免疫富集悬液进行单细胞RNA测序,未涵盖全部细胞类型,且未进行功能性验证实验 | 定义急性和慢性胆囊炎症状态的细胞和结构程序,并将上皮、免疫和基质改变联系起来 | 41例患者的组织和血液样本,包括12例急性胆囊炎和29例慢性胆石症患者 | 单细胞转录组学 | 胆囊炎 | 单细胞RNA测序、免疫组化、透射电子显微镜、靶向细胞因子表达分析 | NA | 图像、文本 | 41例患者(12例急性胆囊炎、29例慢性胆石症)的组织和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对免疫富集悬液进行单细胞RNA测序 |
| 419 | 2026-09-21 |
Prospective study of patients with immune checkpoint inhibitor-induced hepatitis; characterization of liver injury, outcome of therapy, and management of steroid-unresponsive and steroid-dependent hepatitis
2026-Mar-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013861
PMID:41786454
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研究论文 | 一项前瞻性研究,纳入34例免疫检查点抑制剂相关肝炎患者,通过肝活检、多重免疫组化和外周血单细胞RNA测序,分析肝损伤特征、激素治疗反应及激素无应答/依赖型肝炎的管理 | 前瞻性设计并结合肝活检多重免疫组化与外周血单细胞RNA测序,系统刻画免疫相关肝炎的免疫特征,并区分激素无应答与激素依赖表型 | 样本量较小(34例),单中心前瞻性研究,单细胞RNA测序仅用于部分患者比较,结论需更大规模研究验证 | 明确免疫检查点抑制剂诱导肝炎的肝损伤特征、激素治疗反应及激素无应答和激素依赖型肝炎的治疗管理策略 | 接受免疫检查点抑制剂治疗并发生3-4级免疫相关肝炎的患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 34例免疫相关肝炎患者的肝活检组织和外周血样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 420 | 2026-09-21 |
Mesoscale molecular architecture of the human striatum across cell types and lifespan
2026-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.709715
PMID:41846979
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研究论文 | 该研究利用Slide-tags单核空间转录组技术,对人类纹状体进行百万级细胞的空间分子图谱绘制,揭示了纹状体的中尺度分子分区结构及其随年龄的变化 | 首次使用Slide-tags可扩展单核空间转录组技术对人类纹状体进行大规模空间映射,发现了由分子定义的中尺度六分区结构,并揭示了背侧与腹侧区域在神经元-星形胶质细胞信号传导上的空间协调差异以及空间分区特征随年龄衰减的现象 | 研究基于死后脑组织样本,可能受死后间隔和样本质量影响;空间分区身份的推断依赖于单核RNA-seq队列的归因,可能存在批次效应;样本主要覆盖前部纹状体,未涵盖纹状体全部区域 | 揭示人类纹状体的中尺度分子结构,将细胞类型身份与功能特化及衰老易感性联系起来 | 人类纹状体组织,包括19例死后供体的前部纹状体及131例供体的单核RNA-seq数据 | 空间转录组学 | NA | 单核空间转录组学, 单核RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 19例死后供体的前部纹状体共110万个细胞用于空间转录组分析,131例供体用于单核RNA-seq分析 | NA | 单核空间转录组学, 单核RNA-seq | Slide-tags | Slide-tags可扩展单核空间转录组技术 |