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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4141 | 2026-02-12 |
Comprehensive bioinformatic analysis and experimental validation identify MT1M and MT1X as key metallothioneins in BC pathogenesis
2026-Jan-31, Journal of trace elements in medicine and biology : organ of the Society for Minerals and Trace Elements (GMS)
IF:3.6Q2
DOI:10.1016/j.jtemb.2026.127832
PMID:41666661
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,识别了MT1M和MT1X作为乳腺癌发病机制中的关键金属硫蛋白 | 首次通过整合多组学数据和机器学习方法,系统性地鉴定了金属硫蛋白相关基因在乳腺癌中的核心作用,并实验验证了MT1M和MT1X的肿瘤抑制功能 | 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 | 探索金属硫蛋白相关基因在乳腺癌发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, PCR, 蛋白质印迹, CCK-8, 迁移和侵袭实验 | LASSO回归, 随机森林, 逻辑回归 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 整合了两个乳腺癌数据集(GSE42568和GSE29044),涉及62个金属硫蛋白相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4142 | 2026-02-12 |
EVA1A responds to endoplasmic reticulum stress to regulate renal fibrosis by promoting TGF-β signaling pathway
2026-Jan-25, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.01.064
PMID:41592679
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研究论文 | 本研究揭示了EVA1A作为内质网应激的传感器,通过稳定和促进TGFBR2从内质网分泌至质膜,从而激活TGF-β信号通路,调控肾纤维化的机制 | 首次阐明了EVA1A在肾纤维化中的作用,并揭示了其通过内质网应激-CHOP轴上调,并与BIP相互作用以稳定和促进TGFBR2分泌,从而激活TGF-β信号通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未在人体中进行直接验证;EVA1A与BIP/TGFBR2相互作用的具体结构细节仍需进一步探索 | 阐明EVA1A在TGF-β信号通路调控和肾纤维化中的作用及其分子机制 | 慢性肾病患者的肾组织、UUO和UIRI诱导的纤维化肾病小鼠模型、培养的肾上皮细胞 | NA | 慢性肾病 | 单细胞RNA-seq、免疫组织化学染色、Western blot、免疫共沉淀、双分子荧光互补 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、图像数据 | 慢性肾病患者样本、UUO和UIRI处理的小鼠模型、培养的肾上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4143 | 2026-02-12 |
CCT5 as a candidate biomarker in bladder cancer: functional validation and mechanistic clues
2026, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/EBFE5165
PMID:41657783
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研究论文 | 本研究探讨了CCT5在膀胱癌中的功能作用及其与Hippo/YAP信号通路的关联,揭示了CCT5作为致癌因子和潜在生物标志物的价值 | 首次在膀胱癌中系统验证CCT5的致癌功能,并发现其通过调控Hippo/YAP信号通路发挥作用,结合单细胞和空间转录组学分析揭示了其在恶性上皮亚群中的富集模式 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,且Hippo/YAP通路的具体调控机制尚未完全阐明 | 探究CCT5在膀胱癌中的生物学功能、预后价值及其分子机制 | 膀胱癌组织样本、细胞系及小鼠异种移植模型 | 生物信息学与癌症生物学 | 膀胱癌 | RNA-seq、单细胞转录组学、空间转录组学、Western blotting | NA | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据、蛋白质印迹数据 | 基于TCGA和GEO公共数据库的膀胱癌样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4144 | 2026-02-12 |
Identification of CTHRC1 as a novel candidate for neurodevelopmental disorders
2026, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2026.1737003
PMID:41658012
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学、单细胞RNA测序和系统遗传学分析,鉴定出CTHRC1作为与认知功能和神经退行性疾病相关的新候选基因 | 首次将CTHRC1鉴定为神经发育障碍的新候选基因,并通过多组学分析揭示了其在阿尔茨海默病中的上调表达以及与核心AD通路的网络连接 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,人类样本验证有限,且CTHRC1的具体作用机制仍需进一步探索 | 鉴定与认知功能和神经退行性疾病相关的新基因,并探索其潜在治疗价值 | 阿尔茨海默病患者、5xFAD小鼠模型、BXD小鼠品系、SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、系统遗传学分析、eQTL作图、网络分析 | NA | 蛋白质组数据、RNA测序数据、遗传学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4145 | 2026-02-10 |
Editorial: Unraveling immune metabolism: single-cell & spatial transcriptomics illuminate disease dynamics
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1779505
PMID:41658520
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4146 | 2026-02-12 |
Integration of single-cell sequencing, transcriptome sequencing, and machine learning for constructing and validating histone acetylation-related prognostic risk models in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1624883
PMID:41659855
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研究论文 | 本研究整合单细胞测序、转录组测序和机器学习,构建并验证了肝细胞癌中组蛋白乙酰化相关的预后风险模型 | 首次整合单细胞测序、转录组测序和101种机器学习组合算法,构建了基于组蛋白乙酰化相关基因的肝细胞癌风险预测模型,并识别出NEU1作为关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 | 构建肝细胞癌的组蛋白乙酰化相关预后风险模型,并探索其诊断、预后和治疗价值 | 肝细胞癌(LIHC)患者数据、组蛋白乙酰化相关基因、NEU1基因功能 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、RNA-seq、qRT-PCR、Western Blot、分子对接 | 机器学习组合算法(101种) | 单细胞测序数据、转录组测序数据、临床样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4147 | 2026-02-12 |
Multilayered regulation of BDNF DNA methylation in PTSD: a review from molecular mechanisms to trans generational inheritance
2026, Frontiers in psychiatry
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fpsyt.2026.1734160
PMID:41660208
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综述 | 本文综述了BDNF DNA甲基化在创伤后应激障碍(PTSD)中的多层调控作用,从分子机制到跨代遗传 | 聚焦于BDNF DNA甲基化作为创伤暴露与PTSD发病之间的关键分子桥梁,并总结了其在诊断生物标志物和靶向干预方面的应用潜力,以及单细胞测序和表观遗传编辑等新兴技术驱动的前沿研究方向 | 遵循结构化但非系统性的检索策略,且搜索截止日期为2025年12月,可能未包含此后发表的最新研究 | 深入理解PTSD的发病机制,并促进临床转化研究 | BDNF DNA甲基化与PTSD之间的关联 | 自然语言处理 | NA | DNA甲基化分析 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4148 | 2026-02-12 |
Epithelial Cell-Specific Prognostic Signature (FTH1, RIT1, WASL, NDRG2, KIFC3) Stratifies Cervical Cancer Patients and Correlates With Immune Infiltration
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4109928
PMID:41660555
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研究论文 | 本研究构建了一个基于上皮细胞特异性基因(FTH1、RIT1、WASL、NDRG2、KIFC3)的风险模型,用于预测宫颈癌患者的预后并分析其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别宫颈癌上皮细胞亚群特异性基因模块,并从中构建了一个具有预后价值的五基因特征,该特征与免疫浸润和化疗药物敏感性相关 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要在前瞻性临床队列中进行进一步验证;体外实验仅针对FTH1基因进行了功能验证 | 开发一个上皮细胞特异性风险模型以改善宫颈癌的临床预后评估,并揭示肿瘤免疫微环境的改变 | 宫颈癌患者及其肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox回归模型,LASSO回归 | 单细胞转录组数据,批量RNA-seq数据 | 来自GSE208653数据集的40,457个细胞,以及TCGA-CESC和GSE52903队列的患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4149 | 2026-02-11 |
Inflammation-induced Neuronal Damage in CNS Tuberculosis: Molecular Mechanism and Therapeutic Targets
2026-Mar-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150169
PMID:41558621
|
综述 | 本文综述了中枢神经系统结核病中神经炎症诱导神经元损伤的分子机制及潜在治疗靶点 | 提出了以胶质细胞驱动的炎症和线粒体功能障碍为核心的统一框架,为疾病发病机制提供了关键见解 | NA | 探讨中枢神经系统结核病中神经免疫机制及宿主导向治疗策略 | 中枢神经系统结核病(CNS-TB)相关的神经炎症和神经元损伤 | NA | 结核病 | 单细胞转录组学、免疫代谢分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4150 | 2026-02-11 |
Single-cell analysis reveals the diversity of human fetal membrane and adjacent placental cells with preterm premature rupture of membranes
2026-Feb-09, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf143
PMID:41319021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早产胎膜早破(PPROM)中人类胎膜及邻近胎盘细胞的多样性 | 识别了先前未知的滋养层细胞亚型FABP7+Tb,并发现MMP11在EVT-1中的上调表达可能作为PPROM诊断的生物标志物 | 样本来源仅限于脐带周围约两厘米的组织,可能无法完全代表整个胎膜及胎盘区域的细胞多样性 | 探究PPROM的细胞组成和遗传变化,以揭示其分子机制和早期预测靶点 | 来自足月分娩、早产无胎膜早破及PPROM女性的胎膜及邻近胎盘组织 | 数字病理学 | 产科疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 来自三组女性(FTIL、PPWROM、PPROM)的胎膜及邻近胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4151 | 2026-02-11 |
Spatial transcriptomics identifies IL-32 as a lipid droplet-associated cytokine linked to tubular injury in human diabetic kidney disease
2026-Feb-07, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02192-y
PMID:41653322
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术,在人类糖尿病肾病中鉴定出脂滴相关细胞因子IL-32,并揭示其与肾小管损伤及疾病进展的联系 | 首次利用单细胞空间转录组学在糖尿病肾病肾活检组织中鉴定出IL-32作为一种脂滴相关细胞因子,并发现其在损伤肾小管中特异性高表达,建立了脂质代谢失调与炎症信号之间的分子联系 | 样本量相对较小(14例患者),且主要关注肾小管区域,未全面评估其他肾细胞类型的作用 | 探究糖尿病肾病中脂质积累与炎症信号之间的分子联系及其在肾小管损伤中的作用 | 糖尿病肾病患者的肾活检组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学,单细胞空间转录组学,数字空间分析,RNA scope,免疫荧光显微镜,尼罗红光谱分析 | NA | 空间转录组数据,图像数据 | 14例不同病理分期的糖尿病肾病患者肾活检样本 | NA | 空间转录组学,单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 4152 | 2026-02-11 |
Exploring the Therapeutic Potential and Underlying Mechanism of Callerya speciosa in Ankylosing Spondylitis: Network Pharmacology, Molecular Docking, and Single-Cell Sequencing
2026-Feb-04, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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研究论文 | 本研究整合网络药理学、孟德尔随机化分析和单细胞测序,探讨了美丽崖豆藤治疗强直性脊柱炎的活性成分、核心靶点及作用机制 | 首次将单细胞测序与网络药理学、孟德尔随机化分析相结合,系统揭示美丽崖豆藤治疗强直性脊柱炎的多成分、多靶点、多通路协同作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析和分子对接,缺乏体内外实验验证 | 阐明美丽崖豆藤治疗强直性脊柱炎的活性成分及分子机制 | 美丽崖豆藤的活性化合物、强直性脊柱炎相关基因及差异表达基因 | 生物信息学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序, 网络药理学, 孟德尔随机化分析, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 化合物结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4153 | 2026-02-11 |
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2026-Feb-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.2.2
PMID:41626873
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研究论文 | 本研究探讨了脂氧素B4(LXB4)如何调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞活化,并发现Müller胶质细胞是视网膜中LXB4的重要来源,为青光眼治疗提供了新靶点 | 首次揭示Müller胶质细胞作为视网膜中LXB4的内源性来源,并证明LXB4通过下调IL-6和STAT3抑制TRPV4诱导的胶质增生,为靶向TRPV4-脂氧素通路治疗青光眼提供了新策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,尚未在人类临床样本中验证,且具体信号转导机制需进一步阐明 | 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞活化,以及Müller胶质细胞是否参与脂氧素通路 | 小鼠Müller胶质细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 转录组学、流式细胞术、免疫染色、qPCR、Western blotting、脂质组学、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、脂质组学数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型及体外培养的Müller胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4154 | 2026-02-11 |
BRD4 Induces Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via the Wnt/β-catenin Pathway
2026-Feb, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11043-0
PMID:39903433
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研究论文 | 本研究探讨了BRD4在食管鳞状细胞癌(ESCC)进展中的作用及其通过Wnt/β-catenin信号通路的分子机制 | 首次全面探索BRD4在ESCC中的功能,并利用单细胞转录组测序分析肿瘤微环境对BRD4过表达的影响 | 未明确BRD4在ESCC中的具体上游调控机制,且体内实验验证可能不足 | 阐明BRD4在ESCC进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 食管鳞状细胞癌细胞 | 癌症生物学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4155 | 2026-02-11 |
Integrated analysis identifies conserved transcription factors TCF12, E2F1, and TEAD4 with diagnostic and therapeutic value in osteoarthritis subchondral bone
2026-Feb, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01704-0
PMID:41296172
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研究论文 | 本研究通过整合分析识别了骨关节炎软骨下骨中保守的转录因子TCF12、E2F1和TEAD4,并探讨了其诊断和治疗价值 | 首次在人类和动物模型中系统识别并验证了骨关节炎软骨下骨中保守的转录因子TCF12、E2F1和TEAD4,揭示了它们在骨重塑中的关键调控作用及其作为新型诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,尚未进行深入的机制研究和临床试验 | 识别驱动骨关节炎进展的软骨下骨关键分子靶点和转录因子,并评估其诊断和治疗潜力 | 人类骨关节炎患者、大鼠骨关节炎模型和小鼠DMM模型的软骨下骨组织 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 | 人类OA患者和大鼠OA模型的RNA-seq数据,以及人类OA和小鼠DMM模型的实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4156 | 2026-02-11 |
Tumor microenvironment-driven drug resistance in urologic cancers: mechanisms and therapeutic targets
2026-Feb, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01710-2
PMID:41296173
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综述 | 本文综述了泌尿系统肿瘤微环境如何驱动对多种疗法的耐药性,并探讨了潜在的干预策略 | 系统性地总结了肿瘤微环境中不同组分(如CAFs、ECM、免疫抑制细胞、缺氧)在泌尿系统癌症中驱动耐药的具体机制,并整合了单细胞测序、空间转录组学等新兴技术带来的新机遇 | NA | 阐明肿瘤微环境在泌尿系统癌症治疗耐药中的作用机制,并探索克服耐药的治疗靶点 | 肾细胞癌、膀胱癌、前列腺癌等泌尿系统癌症及其肿瘤微环境 | 肿瘤生物学 | 肾细胞癌、膀胱癌、前列腺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4157 | 2026-02-11 |
LETIM Robustly Predicts Immune Checkpoint Blockade Efficacy for Liver Cancer Patients Using Multiple Immune-Related Genesets
2026-Feb, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70232
PMID:41510834
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,建立了用于评估免疫细胞状态的基因集,并基于此开发了能够预测肝癌患者免疫检查点阻断疗效的模型LETIM | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,建立了同时具有组内稳定性和组间变异性的免疫相关基因集,并构建了超越现有模型的跨队列通用预测模型LETIM | 未在文中明确说明,但可能包括样本来源的局限性、模型在更广泛人群中的验证需求等 | 开发能够准确预测肝癌患者免疫检查点阻断治疗反应的模型 | 肝癌患者 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | ExtraTrees | 基因表达数据 | 多个大型肝癌测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4158 | 2026-02-11 |
USAG-1 and Regenerative Dentistry, Therapeutic Implications and Future Directions: Review of the Literature
2026-Feb, Clinical and experimental dental research
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/cre2.70301
PMID:41632902
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综述 | 本文综述了子宫致敏相关基因1(USAG-1)在牙齿再生中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 强调了USAG-1抑制通过激活BMP介导的形态发生促进牙齿再生,并探讨了工程化单克隆抗体在临床前模型中的疗效 | 安全性、特异性、递送机制以及伦理问题仍是实现临床应用的主要挑战 | 评估USAG-1在牙齿组织修复和再生中的治疗潜力及未来方向 | USAG-1基因及其在BMP和Wnt信号通路中的作用,涉及肾脏、牙龈和牙齿组织 | 再生牙科 | 先天性牙齿缺失 | 单细胞RNA测序,RNA-seq分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4159 | 2026-02-11 |
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69159
PMID:41662190
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研究论文 | 本文介绍了一种针对钙化动脉样本进行数字空间谱分析(Digital Spatial Profiling)的优化工作流程,旨在解决血管组织空间转录组学分析中的技术障碍 | 开发了一种针对钙化动脉的逐步工作流程,能够在脱钙等苛刻处理后同时保持组织形态和RNA完整性,并详细描述了组织微阵列(TMA)构建和ROI选择策略 | 该协议主要针对人类胫动脉晚期病变样本进行优化,可能不直接适用于所有类型的血管组织或疾病阶段 | 为血管生物学研究提供可靠的空间转录组学数据生成方法,以研究健康和病变血管中特定层次的转录活动 | 人类胫动脉(特别是伴有晚期病变的钙化动脉样本) | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,组织微阵列(TMA)构建,组织学染色 | NA | 空间转录组数据,组织图像 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) |
| 4160 | 2026-02-11 |
Decoding the Role of H19 in Cholestatic Liver Injury Using snRNA-seq, Spatial Transcriptomics, and Machine Learning-Based Disease Prediction
2026-Jan-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8339668/v1
PMID:41646424
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序、空间转录组学和机器学习模型,揭示了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 | 首次结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习方法,系统解析了H19在细胞类型特异性和空间分辨率上对胆汁淤积性肝损伤的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仅使用公开数据集,需要进一步实验验证 | 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)进展中的细胞类型特异性和空间调控机制 | 野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠的肝组织,以及人类数据集GSE243981 | 数字病理学 | 肝病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 逻辑回归, XGBoost, 神经网络, 随机森林 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠肝组织 | NanoString | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NanoString GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学平台 |