单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 7641 篇文献,本页显示第 3981 - 4000 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3981 2026-05-17
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-Apr-09, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 利用人诱导多能干细胞快速共分化平台,生成具有生物学响应性的结肠样肠道组织补片 开发了一种新型早期人诱导多能干细胞共分化平台,能在8天内生成多种肠道细胞谱系(上皮、间质和内皮),该方法无血清、动物产品使用大幅减少,且能形成结肠样肠道组织补片 仍处于早期阶段 开发一种可移植的肠道黏膜组织移植物,用于促进肠道损伤愈合 人诱导多能干细胞 数字病理学 肠道疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA RNA测序数据 多个hiPSC细胞系,并在独立中心重复 NA 单细胞RNA-seq, 大量RNA-seq NA NA
3982 2026-05-17
A zero-inflated hierarchical generalized transformation model to address non-normality in spatially-informed cell-type deconvolution
2026-Apr-09, Biometrics IF:1.4Q2
研究论文 提出一种零膨胀分层广义变换模型,用于解决空间转录组学中细胞类型解卷积的非正态性问题,并在口腔鳞状细胞癌数据上验证其优越性能 首次将零膨胀分层广义变换模型应用于条件自回归解卷积框架,解决口腔鳞状细胞癌空间转录组数据的高度零膨胀问题,提高细胞类型解卷积的准确性并量化不确定性 未提及具体局限性 改进空间转录组学中细胞类型解卷积方法,处理数据非正态性和高度零膨胀问题 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的细胞类型解卷积 机器学习 口腔癌 空间转录组学 零膨胀分层广义变换模型、条件自回归模型 空间转录组数据 口腔鳞状细胞癌样本(具体数量未提及) NA 空间转录组学 NA NA
3983 2026-05-17
Benchmarking tools for deciphering cellular crosstalk in spatially-resolved transcriptomics
2026-Apr-08, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 该论文对九种计算细胞间相互作用推断方法在空间转录组学数据上进行了系统评估 首次针对空间转录组学应用场景对细胞间相互作用推断工具进行全面基准测试,涵盖多个平台和真实数据集 工具性能在不同空间分辨率、组织背景和平台间存在显著差异;应用于真实空间转录组学数据时面临关键挑战 评估空间转录组学中用于解析细胞间通讯的计算工具的性能和适用性 九种计算细胞间相互作用推断方法 空间转录组学 不适用 空间转录组学 不适用 空间转录组数据 九组来自三项独立研究的真实空间转录组学数据集 10x Genomics, BGI 空间转录组学 10x Visium, MGI Stereo-seq, 10x Xenium Visium平台、Stereo-seq平台、Xenium平台
3984 2026-04-04
Global scientific growth and thematic development of spatial transcriptomics in oncology research
2026-Apr-03, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3985 2026-05-17
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过对比早期与晚期抗逆转录病毒治疗后的SIV感染恒河猴,结合免疫PET/CT引导采样和空间转录组学,定义了组织病毒微环境(VME)在病毒持久性和反弹中的作用 首次利用免疫PET/CT引导的空间转录组学揭示病毒微环境(VME)的结构和功能特征,并发现其与肿瘤微环境的相似性,为HIV治愈策略提供新视角 未提及具体局限性 探究SIV在抗逆转录病毒治疗下的病毒持久性机制及其对病毒反弹的影响 早期与晚期启动抗逆转录病毒治疗的SIV感染恒河猴组织样本 数字病理学 艾滋病 空间转录组学、免疫PET/CT NA 影像数据, 空间转录组数据 SIV感染的恒河猴(早期治疗组与晚期治疗组) NA 空间转录组学 NA NA
3986 2026-05-17
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 消耗纤维蛋白原抑制胰腺导管腺癌原发性肿瘤生长和转移 首次使用临床上正在测试的反义寡核苷酸或含小干扰RNA的脂质纳米颗粒来消耗纤维蛋白原,并揭示了纤维蛋白原在胰腺癌早期(而非晚期)转移步骤中的差异作用以及通过空间转录组学鉴定了基质成分的变化 纤维蛋白原敲低在脾内注射模型中不影响肝定植,提示该研究主要针对早期转移而非晚期转移步骤,且机制研究依赖于体内模型和蛋白组学、空间转录组学方法 探究消耗纤维蛋白原对胰腺导管腺癌肿瘤生长和转移的影响及其潜在机制 胰腺导管腺癌患者异种移植模型小鼠 机器学习 胰腺癌 反义寡核苷酸、脂质纳米颗粒、蛋白组学、空间转录组学 NA 空间转录组学数据 3个患者来源的异种移植模型 NA 空间转录组学 NA NA
3987 2026-05-17
RNF128 aggravates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression via stabilization of SCD1
2026-Mar-30, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示了RNF128通过稳定SCD1加重代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 首次发现E3泛素连接酶RNF128通过催化SCD1的K63连接泛素化并阻断其自噬溶酶体降解,促进脂质积累,并验证了靶向RNF128的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类MASLD的异质性和复杂性可能限制其直接临床转化 阐明RNF128在MASLD进展中的功能及其分子机制,并评估其治疗靶点潜力 人类MASLD肝脏组织、饮食诱导的MASLD小鼠模型、肝细胞特异性RNF128敲除和过表达模型 分子生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 泛素组学分析 NA RNA序列数据, 蛋白质组学数据, 泛素组学数据 未明确说明具体样本量,涉及人类肝脏样本和小鼠模型 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3988 2026-05-17
KIF11 prevents retinal endothelial ferroptosis in familial exudative vitreoretinopathy by inhibiting phosphorylation-driven PRDX1 phase separation
2026-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析,发现KIF11是家族性渗出性玻璃体视网膜病变中视网膜内皮细胞的关键下游效应因子,并通过抑制磷酸化驱动的PRDX1相分离来阻止铁死亡 首次揭示β-catenin/KIF11/PRDX1轴依赖的铁死亡机制在家族性渗出性玻璃体视网膜病变中的作用,并强调铁死亡靶向和抗氧化策略作为潜在疗法 未提及 探究家族性渗出性玻璃体视网膜病变的发病机制,特别是下游致病机制 视网膜内皮细胞和小鼠模型 数字病理学 家族性渗出性玻璃体视网膜病变 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠组织样本(具体数量未提及) Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq 使用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析视网膜内皮细胞
3989 2026-05-17
Asymmetric histone inheritance regulates olfactory stem cell fates during regeneration
2026-Mar-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文揭示了小鼠嗅觉上皮再生过程中水平基底细胞(HBCs)的不对称组蛋白遗传模式及其对干细胞命运和功能恢复的影响 首次在哺乳动物成体干细胞中证明组蛋白H4、H3和H3.3的不对称遗传,并揭示其通过p63转录因子调控细胞命运和神经组织再生的机制 未明确说明限制 探究嗅觉干细胞在再生过程中的组蛋白不对称遗传及其生物学意义 小鼠嗅觉上皮中的水平基底细胞(HBCs)及其子代细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠嗅觉上皮组织和培养的HBC子代细胞对 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3990 2026-05-17
Ganglioside-Mediated Neural-Acinar Crosstalk Facilitates Pancreatic Carcinogenesis via Metaplastic Niche Remodeling
2026-Mar-16, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究揭示了神经-腺泡细胞间通过神经节苷脂介导的相互作用在胰腺癌发生中的作用机制 首次阐明神经节苷脂GM3在腺泡-导管化生与神经重塑双向串扰中的关键作用,发现β-1,4-半乳糖基转移酶5在胰腺癌早期病变中的过表达及其作为治疗靶点的潜力 未提供具体局限性信息 系统研究胰腺导管腺癌发生过程中腺泡-导管化生与神经重塑之间的相互作用机制 小鼠ADM模型、胰腺上皮内瘤变病变、PDAC病变、小鼠及人类细胞系和组织标本 数字病理学 胰腺癌 质谱脂质组学分析、单细胞RNA测序、基因过表达/敲低、免疫组化、免疫印迹 NA 转录组数据、脂质组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3991 2026-05-17
Integrated multi-omics analysis reveals that MARCKS reprograms the immunosuppressive microenvironment to drive hepatocellular carcinoma progression
2026-Mar-11, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
科研论文 通过多组学综合分析揭示MARCKS在肝细胞癌中重编程免疫抑制微环境以驱动肿瘤进展的机制 首次整合批量转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统阐明MARCKS在肝细胞癌免疫微环境中的调控作用及其通过JAK/STAT3信号通路促进M2型巨噬细胞极化的新机制 主要依靠临床样本和细胞系实验,缺乏大规模前瞻性队列验证,MARCKS作为治疗靶点的体内药效学验证尚不充分 阐明MARCKS在肝细胞癌免疫抑制微环境中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者肿瘤组织样本和肝癌细胞系 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多免疫荧光 NA 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 多组肝细胞癌临床样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
3992 2026-05-17
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2026-Feb-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 通过人体血浆样培养基中的稳定同位素示踪揭示胶质母细胞瘤微环境的代谢与免疫调节 在体外使用人体血浆样培养基(HPLM)结合稳定同位素示踪技术,模拟生理营养条件和完整肿瘤微环境,揭示传统培养条件下被抑制的代谢和免疫程序 未提及具体局限性,但可能包括体外模型与体内真实环境的差异 研究胶质瘤代谢在完整肿瘤微环境下的特点及其与免疫微环境的相互作用 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体及胶质瘤干细胞样细胞系 机器学习 胶质母细胞瘤 稳定同位素示踪, 空间转录组学 NA 文本, 图像 人胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞系(具体数量未提供) NA 空间转录组学 NA NA
3993 2026-05-17
Progenitor CD8+ T cells and hyper-Treg crosstalk: a driver of immune checkpoint inhibitor resistance in esophageal squamous cell carcinoma
2026-01-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究食管鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂耐药机制,揭示祖细胞CD8+ T细胞与超强Treg之间的相互作用 首次发现抗原递呈恶性上皮细胞与T细胞之间的交互作用在食管鳞癌免疫检查点抑制剂耐药中的关键作用,以及超强Treg通过CLEC2C-KLRB1轴调节CD8 T细胞活化的新机制 基于公开数据库的scRNA-seq数据,样本量有限(24例),且缺乏功能性验证实验 阐明食管鳞状细胞癌中肿瘤抗原呈递和肿瘤微环境内细胞间相互作用如何驱动免疫检查点抑制剂耐药 接受化疗和免疫检查点抑制剂治疗的食管鳞状细胞癌患者 机器学习 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 24例食管鳞癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3994 2026-05-17
Patient-derived liver organoids recapitulate liver epithelial heterogeneity and enable precision modeling of alcohol-related liver disease
2026-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究开发了一种从酒精性肝病患者肝脏穿刺活检样本中衍生的类器官模型,该模型能够重现肝上皮异质性,并用于酒精性肝病的精准建模 首次从酒精性肝病患者的穿刺活检样本中生成类器官,并证明其能捕捉肝上皮细胞的异质性和疾病阶段特异性特征,从而为个性化疾病建模和药物测试提供新的平台 未提及具体局限性 开发一种能够捕捉肝上皮异质性和患者特异性特征的人类模型,以推进酒精性肝病的精准建模和个性化治疗 酒精性肝病患者的穿刺活检样本及其衍生的类器官 数字病理学 酒精性肝病 单细胞RNA测序、免疫荧光 类器官模型 图像、文本 早期阶段患者28例,晚期阶段患者34例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3995 2026-05-17
Integrative bioinformatic analysis prioritizes TIMP1 and FN1 as angiogenesis-related candidate genes in diabetic foot ulcers
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合生物信息学分析,优先识别TIMP1和FN1作为糖尿病足溃疡中血管生成相关的候选基因 首次将批量转录组数据、机器学习基因优先级排序和单细胞RNA测序相结合,系统表征糖尿病足溃疡中血管生成损伤相关的分子特征 FN1 mRNA表达下降趋势未达到统计学显著性,且结论基于生物信息学探索性分析,需进一步实验验证 探索糖尿病足溃疡中与血管生成损伤和修复受损相关的分子特征 糖尿病足溃疡的转录组数据及单细胞表达模式 机器学习, 数字病理学 糖尿病足溃疡 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习 LASSO逻辑回归模型 转录组数据, 单细胞转录组数据 使用GSE199939和GSE134431数据集(含发现队列和复制队列) NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3996 2026-05-17
UBE2S emerges as a key driver in an NK cell-based prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序与多队列转录组验证,构建基于NK细胞和UBE2S的肾透明细胞癌预后模型 首次通过单细胞RNA测序揭示NK细胞亚群在ccRCC肿瘤微环境中的关键作用,并发现UBE2S作为驱动基因参与肿瘤进展;基于CoxBoost算法构建的12基因预后模型在多独立数据集中验证了高预测准确性 未提供明显的局限性信息 探索肾透明细胞癌的免疫微环境异质性,建立稳健的预后分子标志物和治疗靶点 肾透明细胞癌患者肿瘤及癌旁组织 机器学习, 数字病理学 肾细胞癌, 肾透明细胞癌 单细胞RNA测序, 转录组测序, CoxBoost, 体外敲低实验 CoxBoost, 加权基因共表达网络分析 单细胞转录组数据, 转录组数据 多队列转录组验证,具体样本数未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3997 2026-05-16
Targeting HIF-1α promotes ferroptosis and boosts antitumor immunity in MSS colorectal cancer
2026-Jun, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 靶向HIF-1α促进铁死亡并增强微卫星稳定结直肠癌的抗肿瘤免疫 揭示了HIF-1α在RSL3耐药MSS结直肠癌细胞中的关键作用,以及联合靶向HIF-1α和铁死亡诱导剂可增强抗PD1治疗效果的新策略 主要为体内小鼠模型和体外细胞实验,未来需在更接近人类肿瘤的模型或临床试验中验证 探索靶向HIF-1α促进铁死亡并增强MSS结直肠癌免疫治疗的可行性 MSS结直肠癌细胞系(包括RSL3耐药株)、小鼠CT26同源移植模型 机器学习 结直肠癌 单细胞测序,染色质免疫沉淀(ChIP) NA 基因表达数据 细胞系及小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台
3998 2026-05-16
Dual targeting of NCF1 and NLRP3 by roburic acid orchestrates redox homeostasis and inhibits macrophage death in septic lung injury
2026-Jun, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞测序分析发现罗布酸通过双重靶向NCF1和NLRP3调节氧化还原稳态并抑制巨噬细胞死亡,缓解脓毒症肺损伤 发现NLRP3和NCF1是罗布酸的直接细胞内靶点,通过双重靶向同时抑制炎症小体组装和铁死亡,提供综合治疗策略 摘要未明确说明研究局限性 探索脓毒症相关急性肺损伤的治疗靶点并评估罗布酸的作用机制 脓毒症肺损伤模型中的巨噬细胞 数字病理学 脓毒症肺损伤 单细胞测序 NA 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3999 2026-05-16
Quercetin improves retinal glycolysis to slow myopia progression through orchestrating the AKT/FOXO/HK2 axis
2026-Jun, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨槲皮素通过调节AKT/FOXO/HK2轴改善视网膜糖酵解,从而延缓近视进展的机制 首次从多组学角度揭示AKT/FOXO/HK2通路抑制糖酵解促进近视进展,并发现槲皮素通过恢复糖酵解减缓氧化损伤和神经元凋亡 仅使用豚鼠模型,未在人类样本中验证;槲皮素的具体作用剂量和长期效果未详细讨论 探索视网膜糖酵解变化导致的氧化损伤如何促进近视,并评估槲皮素缓解该过程的潜力 近视豚鼠视网膜 数字病理学 近视 单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、代谢组学、线粒体压力测定、糖酵解速率测定 NA 蛋白质组学数据、磷酸化蛋白质组学数据、代谢组学数据、单细胞转录组数据 近视豚鼠视网膜样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序分析视网膜组织
4000 2026-05-16
Endothelial MerTK impairment promotes cardiac dysfunction in the condition of high fat diet
2026-Jun, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 该研究探讨了内皮细胞MerTK损伤在促进高脂饮食诱导的心脏功能障碍中的新作用及其分子机制 首次揭示了内皮细胞MerTK受体在心脏功能障碍中的新角色,特别是在高脂饮食条件下,通过多组学分析阐明了其调控线粒体功能障碍、凋亡、坏死、吞噬体形成和细胞吞入等信号通路 未明确说明 研究内皮细胞MerTK在高脂饮食条件下调节心脏功能障碍的新作用 内皮细胞特异性MerTK缺陷小鼠及人扩张型心肌病和肥厚型心肌病患者的心脏标本 数字病理学, 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 蛋白质组学, 免疫染色 NA 图像, 文本, 测序数据 小鼠(MerTKflox/floxTie2Cre和MerTKflox/flox)注射AAV8-PCSK9后高脂饮食2个月,以及人扩张型心肌病和肥厚型心肌病患者标本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序和单核RNA测序
回到顶部