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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3981 | 2026-07-09 |
ATP-binding cassette subfamily A member 5 suppresses pancreatic ductal adenocarcinoma progression and chemoresistance by promoting β-catenin ubiquitin-dependent degradation
2026-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101381
PMID:41734476
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research paper | 本研究首次证明ATP结合盒亚家族A成员5(ABCA5)在胰腺导管腺癌中作为肿瘤抑制因子,通过促进β-连环蛋白泛素依赖性降解抑制肿瘤进展和化疗耐药 | 首次确定ABCA5在胰腺导管腺癌中的抑癌作用,并阐明其通过结合β-TrCP的WD40重复结构域诱导β-连环蛋白泛素依赖性降解,从而抑制WNT通路的新型分子机制 | 未提及具体局限性 | 探讨ABCA5在胰腺导管腺癌中的作用及分子机制,以及其作为治疗靶点的潜力 | 80例临床胰腺导管腺癌样本及患者来源类器官 | machine learning | 胰腺导管腺癌 | NA | NA | 转录组数据 | 80例临床胰腺导管腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3982 | 2026-07-09 |
Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153484
PMID:41734714
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的免疫景观,揭示桥本甲状腺炎的细胞机制 | 构建了NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的单细胞转录组图谱,首次揭示甲状腺细胞可塑性和调节性T细胞功能障碍可能是疾病进展的驱动因素 | 未明确提及局限性 | 阐明桥本甲状腺炎中每种甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用 | NOD.H-2h4小鼠甲状腺组织 | 单细胞转录组学 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 38,461个细胞,来自三个疾病阶段(4、8和16周)的甲状腺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 3983 | 2026-07-09 |
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01068-4
PMID:41731121
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现衰老过程中树突状细胞迁移缺陷,并通过口服酵母纳米颗粒增强其功能以改善疫苗效力 | 揭示了衰老中树突状细胞迁移缺陷是免疫衰退的关键机制,并开发了口服酵母纳米颗粒的非侵入性策略来增强树突状细胞功能 | 未明确提及 | 探究树突状细胞在衰老相关疫苗效力下降中的作用及改善策略 | 年轻与老年小鼠的淋巴结、树突状细胞及肠道免疫系统 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻与老年小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3984 | 2026-07-09 |
Distinct spatial patterning and transcriptomic landscapes of human neural organoids by localized delivery of morphogens
2026-Mar-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.01.008
PMID:41734763
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研究论文 | 本研究开发了一种基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可在无Matrigel条件下产生稳定的空间形态发生素梯度,用于人神经类器官的模式化 | 首次报道一种无Matrigel、基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可稳定建立陡峭的外源空间形态发生素梯度,实现人神经类器官的稳健区域化 | 当前技术难以在神经类器官中生成稳定、界限明确的梯度以实现稳健区域化 | 研究人类大脑区域化过程中单个形态发生素的作用,并建立模拟空间-时间形态发生素动态的类器官模型 | 人神经类器官 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人神经类器官(具体样本量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3985 | 2026-07-09 |
BiGCN Learns B Cell Functional States by Integrating Single-Cell Transcriptomes and BCR Repertoires
2026-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202501919
PMID:41725270
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研究论文 | 提出BiGCN方法,通过整合单细胞转录组和BCR库数据,学习B细胞功能状态 | 首次在单细胞分辨率下显式整合转录组和BCR数据,利用图卷积网络框架统一嵌入,高保真表征B细胞状态和克隆关系 | NA | 开发能够整合单细胞转录组和BCR库数据的方法,以揭示B细胞的功能多样性 | B细胞 | 机器学习 | 感染性疾病, 自身免疫病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | 图卷积网络 | 转录组数据, BCR序列数据 | 涵盖感染性疾病、自身免疫病和泛癌图谱的多组配对单细胞RNA测序和单细胞BCR测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 3986 | 2026-07-09 |
Single-cell transcriptomics reveals phenotypic and functional alterations of erythroid progenitor cells in tuberculosis patients
2026-Mar, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2026.102746
PMID:41734583
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示结核病患者红细胞祖细胞的表型和功能变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了结核病不同阶段(潜伏感染、活动性、播散性)及肺组织中红细胞祖细胞的异质性,发现了疾病特异性亚群及其代谢重编程,并建立了基于EPC标志基因的潜伏结核预测模型 | NA | 探究结核病对红细胞祖细胞动态变化的影响及其与免疫细胞的双向调控机制 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核患者的外周血单个核细胞,以及结核肺组织和邻近未受累区域 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核队列的外周血样本以及结核肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3987 | 2026-07-09 |
Integrating scRNA-seq and snRNA-seq with spatial transcriptomics to unlock the xylem puzzle
2026-Feb-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04007-z
PMID:41724975
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学技术,重建杨树茎发育木质部的完整分化轨迹,揭示次生细胞壁形成和程序性细胞死亡的转录调控机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单核RNA测序数据,克服了传统单细胞RNA测序无法捕获具有次生细胞壁的晚期木质部细胞的局限性,成功构建木质部发育的完整图谱 | 未明确提及局限性 | 通过整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学,解决木质部发育研究中晚期细胞类型难以捕获的问题 | 杨树茎发育木质部细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 激光捕获显微切割转录组, 支持向量机分类 | 支持向量机 | 转录组数据 | 不适用(论文未明确提及样本数量) | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 3988 | 2026-07-09 |
WWP2 underlies ROS-induced granulosa cell apoptosis by promoting ubiquitination of BAK in polycystic ovary syndrome
2026-Feb-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08500-y
PMID:41730845
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研究论文 | 本研究整合公共单细胞RNA-seq数据与临床颗粒细胞样本验证,揭示了WWP2通过促进BAK泛素化调控氧化应激诱导的颗粒细胞凋亡在多囊卵巢综合征中的作用机制 | 首次报道E3泛素连接酶WWP2在PCOS中的功能,阐明氧化应激通过削弱WWP2与BAK相互作用并下调WWP2表达,抑制BAK Lys113位点泛素化从而促进颗粒细胞凋亡的分子机制 | NA | 阐明活性氧如何通过WWP2介导的BAK泛素化调控PCOS中颗粒细胞凋亡的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者颗粒细胞、KGN细胞系、PCOS小鼠模型 | 分子生物学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序、泛素化分析 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本测序数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集及临床PCOS患者颗粒细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3989 | 2026-07-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
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研究论文 | 构建家蚕翅芽时空单细胞图谱,揭示20E驱动的发育重编程机制 | 首次构建家蚕翅芽跨10个时间点的时空单细胞图谱,鉴定Wm细胞作为中心祖细胞并建立五阶段基因转变模型 | 研究主要基于家蚕模型,其结论在其它昆虫中的普适性需进一步验证 | 解析昆虫翅芽发育的时空逻辑及激素驱动的细胞命运转变 | 家蚕翅芽 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 10个时间点的家蚕翅芽样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序及空间转录组平台 |
| 3990 | 2026-07-09 |
Decoding hepatocellular carcinoma prognosis: a machine learning-derived methylation signature integrating transcriptomic and tumor microenvironment insights
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003942
PMID:41731861
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研究论文 | 整合转录组、甲基组和临床数据,通过机器学习算法开发并验证了肝细胞癌预后相关的10基因甲基化特征 | 首次系统结合数百种机器学习算法,从甲基化与转录组差异表达基因中构建多维度预后特征,并整合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示肿瘤微环境调控机制 | 未提及明确的局限性 | 开发基于甲基化与转录组整合的肝细胞癌预后生物标志物及风险分层模型 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及癌旁组织样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA测序, 甲基化测序, 定量PCR, 蛋白质印迹法 | 机器学习算法(数百种算法组合) | 转录组数据, 甲基化数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 10对肝细胞癌肿瘤与癌旁组织(用于验证) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3991 | 2026-07-09 |
Screening Biomarkers for Nerve Injury Using Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Machine Learning
2026-Feb, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71279
PMID:41733593
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研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析和机器学习筛选神经损伤生物标志物 | 结合多转录组数据集和机器学习方法识别并验证了神经损伤的新型生物标志物Atf3、Bin2、Fcgr2b和Ucn,并阐明了它们在神经免疫串扰中的双重作用 | 该研究主要基于公开数据集,缺乏体内实验验证,且样本量可能有限 | 识别和验证神经损伤的关键调控基因及其功能机制 | 神经损伤和假手术样本的RNA-seq和单细胞转录组数据 | 机器学 | 神经损伤 | RNA-seq | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)和三种机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的神经损伤和假手术样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3992 | 2026-07-09 |
Microglia heterogeneity and therapeutic strategies in Parkinson's disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739341
PMID:41727462
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综述 | 系统描述小胶质细胞在帕金森病中的生物学特性、功能异质性及靶向治疗策略 | 结合单细胞转录组学技术揭示小胶质细胞在帕金森病中的功能、空间、遗传和性别相关差异,并总结新兴靶向小胶质细胞的干预治疗策略 | 未详细讨论临床转化中的具体障碍及不同治疗策略的成本效益比较 | 阐明小胶质细胞异质性在帕金森病神经退行性变中的作用机制并指导精准治疗 | 小胶质细胞及帕金森病患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3993 | 2026-07-09 |
Unique chicken B cell development: species-specific mechanisms and contradictory requirements of B cell receptor for post-hatched B cell development
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755331
PMID:41727463
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综述 | 文章记录了鸡B细胞在三个发育阶段(前法氏囊期至法氏囊后阶段)的发育过程,并与人类B细胞发育进行比较 | 揭示了鸡B细胞发育的物种特异性机制,包括法氏囊作为主要B细胞受体依赖性发育器官的同时支持非依赖性早期定殖,以及通过激活诱导胞苷脱氨酶介导的基因转换而非V(D)J重组实现抗体多样化 | 未明确提及具体研究限制 | 探讨鸡B细胞发育的独特机制及其与哺乳动物发育的差异 | 鸡B细胞发育过程 | 基因组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 3994 | 2026-07-09 |
Blinatumomab-driven T-cell activation in αβ and γδ T-cell subsets: insights from in vitro assays
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739493
PMID:41727470
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research paper | 该研究通过体外实验系统比较了博纳吐单抗驱动的αβ和γδ T细胞亚群活化效应,揭示了两种T细胞亚群对BLN反应的特异性差异 | 首次在健康供体来源的αβ和γδ T细胞中系统比较BLN驱动的效应功能,并发现唑来膦酸扩增的Vγ9Vδ2 γδ T细胞系在高肿瘤负荷下需要更高BLN浓度,同时γδ T细胞表现出更稳定的效应记忆表型 | 实验仅基于健康供体来源的T细胞,未涉及患者样本;单细胞转录组分析仅使用一个供体,样本量有限 | 阐明博纳吐单抗对αβ和γδ T细胞亚群免疫学机制的差异影响 | 健康成人供体的αβ和γδ T细胞 | machine learning | 急性淋巴细胞白血病 | NA | NA | 流式细胞术数据、单细胞转录组数据 | 健康供体(具体数量未明确);单细胞转录组分析使用1个供体 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 探索性靶向单细胞转录组分析(一个供体) |
| 3995 | 2026-07-09 |
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1765095
PMID:41727482
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研究论文 | 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序鉴定与胃癌转移相关的细胞外基质重塑免疫特征和核心蛋白,验证RPS29在转移机制中的作用 | 整合蛋白质组学与单细胞转录组学,首次系统解析细胞外基质重塑在胃癌转移中的分子机制,并鉴定RPS29作为新的转移相关核心蛋白 | 未明确提及局限性,可能包括样本量有限、功能验证仅限体外实验等 | 探索细胞外基质重塑在胃癌转移中的分子机制,鉴定预测标志物和治疗靶点 | 胃癌患者样本、胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及样本具体数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3996 | 2026-07-08 |
Identification of novel diagnostic biomarkers and host-directed drug screening for Mycobacterium avium infection: A multi-omics and artificial intelligence study
2026-Sep, SLAS discovery : advancing life sciences R & D
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.slasd.2026.100317
PMID:42276326
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研究论文 | 结合多组学和人工智能识别鸟分枝杆菌感染的新型诊断标志物并进行宿主导向药物筛选 | 首次通过单细胞RNA测序与机器学习整合分析,揭示鸟分枝杆菌感染中髓系细胞重编程的MIF-APP轴机制,并基于113种机器学习算法筛选出高精度诊断模型及潜在免疫调节剂Wogonin | 依赖外周血样本,未验证组织或不同亚群中的免疫特征;临床验证样本量和动物模型数据有限 | 解析鸟分枝杆菌感染中的宿主免疫重塑机制,特别是髓系异质性,并识别精准诊断标志物与治疗靶点 | 鸟分枝杆菌感染患者的外周血样本 | 机器学习 | 鸟分枝杆菌感染 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | Stepglm+GBM | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3997 | 2026-07-08 |
Polystyrene microplastics drive chondrotoxicity in osteoarthritis through inducing ER stress and apoptosis via NFKB1 activation
2026-Sep, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116166
PMID:42162659
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研究论文 | 本研究结合网络毒理学和转录组学分析,发现聚苯乙烯微塑料通过激活NFKB1诱导内质网应激和细胞凋亡,从而加剧骨关节炎的软骨毒性 | 首次揭示聚苯乙烯微塑料通过NFKB1驱动内质网应激和凋亡通路促进骨关节炎进展的分子机制,并利用机器学习鉴定了六个潜在的早期诊断生物标志物 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序,缺乏体内动物模型验证,且NFKB1的上下游调控网络尚未完全阐明 | 阐明聚苯乙烯微塑料在骨关节炎发病机制中的作用及其分子通路 | 聚苯乙烯微塑料对软骨细胞的影响及骨关节炎相关分子机制 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、分子对接、动态模拟 | 机器学习模型、分子对接模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本量,涉及网络毒理学分析和体外软骨细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3998 | 2026-07-08 |
Integrated Multiomics Reveals Key Drivers and Immune Cell Phenotypes of Infrapopliteal Atherosclerosis and Calcification
2026-Sep, Annals of vascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.avsg.2026.05.073
PMID:42176975
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研究论文 | 整合多组学揭示膝下动脉粥样硬化和钙化的关键驱动因子及免疫细胞表型 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化等多组学方法,鉴定出HLA-B是膝下动脉粥样硬化的关键致病基因,并识别出因果相关的免疫细胞表型 | 未提及具体局限性 | 识别驱动膝下动脉粥样硬化和钙化的关键基因和免疫细胞表型,开发靶向治疗策略 | 膝下动脉粥样硬化和钙化患者样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ST, SMR, MR | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3999 | 2026-07-08 |
Separable Decomposition for Ragged Tensors
2026-Aug, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3679727
PMID:41945837
|
研究论文 | 提出一种基于CP分解的几何感知可分离分解框架,用于直接分解多维不规则张量数据(即 ragged tensor) | 首次引入二元加权张量模型描述ragged tensor的有效域,利用CP因子行与有效元素间的关联将全局目标解耦为独立、良态的子问题,并设计基于近邻交替最小化的闭式稳定更新算法,理论收敛有保障 | 未明确说明,需进一步阅读全文 | 发展能够处理多维不规则索引模式(ragged tensor)的张量分解方法 | 多光谱、高光谱图像以及空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 张量分解 | CANDECOMP/PARAFAC (CP) 分解 | 图像、空间转录组数据 | 多个挑战性数据集(具体数量未详述) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4000 | 2026-07-08 |
Fusobacterium nucleatum-Derived Outer Membrane Vesicles Disrupt Epithelial Barrier in Oral Lichen Planus via JNK/c-JUN Mediated Claudin-4 Downregulation
2026-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109526
PMID:42048970
|
研究论文 | 本研究揭示具核梭杆菌外膜囊泡通过JNK/c-JUN通路下调Claudin-4破坏口腔扁平苔藓上皮屏障 | 首次发现具核梭杆菌外膜囊泡通过激活JNK/c-JUN信号通路下调Claudin-4,揭示微生物驱动口腔扁平苔藓上皮屏障破坏的新机制 | 未开展体内动物模型验证实验,且主要基于体外细胞系研究,临床相关性需进一步验证 | 探究具核梭杆菌外膜囊泡在口腔扁平苔藓上皮屏障功能障碍中的作用机制 | 口腔扁平苔藓患者组织样本及HaCaT角质形成细胞 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, RNA测序, qPCR, Western blot | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 口腔扁平苔藓病变组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |