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当前共找到 148 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-15 |
Renal tubular-derived retinoic acid drives renal fibrosis via a RAI14-TRIOBP-YAP mechanotransduction axis
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112246
PMID:41242366
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研究论文 | 本文揭示了肾小管来源的视黄酸通过RAI14-TRIOBP-YAP机械转导轴驱动肾纤维化的机制 | 首次发现视黄酸作为旁分泌信号连接肾小管损伤与成纤维细胞激活，并阐明RAI14-TRIOBP-YAP轴在纤维化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类临床相关性需进一步验证 | 探究视黄酸在肾纤维化中的功能转换机制及治疗靶点 | 肾小管上皮细胞和间质成纤维细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-12-15 |
Integrative genomic and transcriptomic profiling identifies HSPA5 as a central player in hepatocellular carcinoma pathogenesis
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学和转录组学分析，识别出HSPA5作为肝细胞癌发病机制中的关键因子 | 采用多组学方法（包括外显子测序、单细胞RNA-seq和空间转录组学）系统性地筛选并验证了HSPA5在肝细胞癌中的核心作用 | 未明确提及研究的样本量限制或验证队列的规模，可能影响结果的普适性 | 探索肝细胞癌的新生物标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC）患者样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 外显子测序、GO分析、PPI网络分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学、Venn分析、生存分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-12-15 |
scREPA: Predicting single-cell perturbation responses with cycle-consistent representation alignment
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scREPA的新框架，用于预测单细胞扰动响应，通过将基于变分自编码器的内部表征与预训练的单细胞基础模型的高质量外部表征进行对齐来实现 | 提出了scREPA框架，首次将生成扩散模型中的表征对齐思想应用于单细胞扰动预测，并引入了循环一致表征对齐机制，通过双重一致性约束提升表征质量 | 未明确说明模型在跨物种或跨组织类型泛化能力的具体评估，也未讨论计算复杂度或运行时间 | 开发一种能够从稀疏、嘈杂、高维且数据量有限的单细胞RNA测序数据中准确预测细胞扰动响应的计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 生成扩散模型 | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-12-15 |
DiffuScope: A diffusion-regularized autoencoder for spatial transcriptomic clustering
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究提出了一种名为DiffuScope的基于图卷积变分自编码器的空间转录组学聚类框架，旨在解决数据异质性带来的挑战并提升聚类准确性和跨数据集泛化能力 | 提出了结合自监督学习、重构损失和扩散一致性损失的双重损失函数设计，以增强特征学习并改善聚类性能 | NA | 开发一种能够适应空间转录组学数据生物和技术异质性的通用聚类算法 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胃癌 | 空间转录组学 | 图卷积变分自编码器 (GC-VAE) | 空间表达数据 | 12个公开数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2025-12-15 |
Fibroblast Dysregulation in Multiple Idiopathic External Cervical Resorption: Laboratory Investigation From a Rare Case of 13 Affected Teeth
2026-Jan, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70037
PMID:40988149
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序、单细胞RNA测序和体外实验，探讨了多发性特发性颈部外吸收的发病机制，发现GNAS错义突变和成纤维细胞异常活动在疾病进展中的关键作用 | 首次结合全外显子测序、单细胞RNA测序和体外实验，系统研究MIECR的分子机制，并发现PI3K/Akt信号通路抑制可减少成纤维细胞侵袭和破骨细胞生成 | 研究基于单一罕见病例，样本量有限，结果可能需要更大规模研究验证 | 探讨多发性特发性颈部外吸收的病因和发病机制 | 一名患有13颗牙齿颈部外吸收的药剂师患者的病变组织和健康牙龈组织 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 组织病理学分析, 体外实验 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 组织图像 | 1名患者的病变组织和健康牙龈组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-12-15 |
Molecular, metabolic, and histological subtypes of pancreatic ductal adenocarcinoma and its tumor microenvironment: Insights into tumor heterogeneity and clinical implications
2026-Jan, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108946
PMID:41183744
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌（PDAC）在分子、代谢和组织学层面的分型方法，及其与肿瘤微环境的相互作用，旨在为精准诊断和个性化治疗提供见解 | 整合了单细胞/空间转录组学、代谢组学和深度学习病理分析等多维度技术，系统阐述了PDAC的异质性、可塑性及亚型特异性特征，重塑了PDAC的分类体系 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要基于现有研究进行整合分析 | 阐明PDAC的肿瘤异质性，整合多组学数据以推动亚型指导的精准治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 转录组数据, 代谢组数据, 组织病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-12-14 |
Fibroblast diversity within human gut-associated lymphoid tissues
2026-Mar-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250471
PMID:41379085
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，绘制了人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性图谱 | 首次识别CD24作为区分GALT成纤维细胞的标记物，并揭示了不同GALT亚型中成纤维细胞的功能差异 | 研究主要基于观察性数据，功能验证实验相对有限 | 探索人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性和功能 | 人类肠道相关淋巴组织（包括Peyer斑块、黏膜孤立淋巴滤泡和黏膜下孤立淋巴滤泡）中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，共聚焦激光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-12-14 |
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-Feb, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70115
PMID:41388751
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核RNA测序技术，识别了小鼠视网膜发育过程中独特的髓系细胞群体，并验证了它们在神经纤维层和血管生成前沿的解剖位置 | 首次在视网膜中识别并验证了发育特异性髓系细胞群体，包括Spp1和Hmox1标记的两种小胶质细胞亚群，揭示了NRF2转录因子在调控这些状态转换中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类或其他物种中的普适性尚需验证，且功能机制探究有限 | 探究小胶质细胞在视网膜发育过程中的具体作用和分子特征 | 发育中的小鼠视网膜髓系细胞群体，特别是小胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个发育时间点的小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-12-14 |
PD-1+/CXCR6+CD8+T lymphocytes promote MASLD malignant progression through inflammatory and immune dysregulation
2026-Jan-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115847
PMID:41253047
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研究论文 | 本研究探讨了PD-1+/CXCR6+ CD8+ T淋巴细胞通过炎症和免疫失调促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病恶性进展的机制 | 揭示了在MASLD向HCC进展过程中，CD8 T细胞亚群（特别是PD-1+和CXCR6+亚群）的动态变化及其通过促进炎症和免疫失调驱动恶性转化的新机制 | 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析，具体的分子机制和因果关系的深入验证有待进一步研究 | 阐明CD8 T细胞在MASLD向HCC恶性进展中的作用机制 | MASLD模型小鼠、MASLD/HCC患者的临床样本 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 流式细胞数据、单细胞测序数据、临床生化数据 | 动物模型（HFD和HFD/HCC组小鼠）及MASLD/HCC患者临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-12-13 |
Multi-Omics discovery and clinical validation of IGFBP2, B2M, and CST3 as a serum biomarker panel for diabetic kidney disease progression
2026-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149858
PMID:41167578
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与血清蛋白质组学数据，发现并验证了IGFBP2、B2M和CST3作为糖尿病肾病进展的血清生物标志物组合 | 首次通过整合单细胞转录组与血清蛋白质组学数据，系统性地识别并验证了一个用于糖尿病肾病进展诊断的非侵入性三标志物组合，并探索了其作为治疗靶点的潜力 | 临床样本量相对有限（n=139），且主要基于观察性数据，需要更大规模的前瞻性队列研究进一步验证其临床效用 | 开发一种用于糖尿病肾病进展诊断和监测的新型非侵入性生物标志物组合 | 糖尿病肾病患者、健康对照者、小鼠模型以及相关的肾脏组织和血清样本 | 生物信息学与多组学整合分析 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、血清蛋白质组学、bulk RNA-seq、分子对接 | LASSO回归模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、bulk RNA-seq数据、临床血清样本数据 | 30人（肾脏组织scRNA-seq：18名健康，12名DKD）；139人（临床血清验证）；16只小鼠（STZ诱导模型）；外加独立bulk RNA-seq队列（Nephrectomy和Nephroseq） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 31 | 2025-12-13 |
Recent insights in the development and functions of insect hemocytes
2026-Feb, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101434
PMID:40962030
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综述 | 本文综述了昆虫血细胞发育和功能的最新研究进展，重点探讨了血细胞分化、增殖及免疫响应中的转录因子和信号通路 | 整合了单细胞RNA测序技术揭示血细胞群体过渡状态基因表达变化，并扩展了对固着血细胞功能的理解 | NA | 总结昆虫血细胞在细胞免疫中的发育机制和功能调控 | 果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的血细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-12-13 |
Recent advances and applications of single-cell sequencing in insects
2026-Feb, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101455
PMID:41173389
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在昆虫科学中的最新进展与应用，强调了该技术如何推动昆虫生物学从描述性研究转向功能性和机制性研究 | 整合了单细胞多组学技术和空间转录组学的最新进展，结合深度学习方法，为昆虫生物学提供了前所未有的分子动态和细胞多样性视角 | NA | 回顾单细胞基因组学在昆虫科学中的进展，探讨其在昆虫生理、发育、免疫和进化研究中的应用前景 | 昆虫 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，单细胞多组学，空间转录组学 | 深度学习算法 | 转录组、表观基因组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2025-12-13 |
Pharmacovigilance-Based Identification and Mechanistic Exploration of Periodontitis-Related Drugs
2026-Jan, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70040
PMID:40957584
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研究论文 | 本研究利用药物警戒数据、孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别与牙周炎相关的药物并探索其潜在分子机制 | 首次结合大规模真实世界药物警戒数据、孟德尔随机化因果推断和单细胞RNA测序技术，系统性地探索药物与牙周炎风险的关联及其细胞类型特异性分子机制 | 研究主要基于观察性数据和遗传学关联，需要进一步的实验研究来确认因果关系 | 识别与牙周炎风险相关的药物并探索其潜在的分子机制 | 牙周炎患者、药物不良反应报告数据、遗传学数据和单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 药物警戒数据挖掘、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 逻辑回归、信号检测算法、通路富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 药物不良反应报告、遗传学数据、单细胞转录组数据 | 来自FAERS数据库的药物不良反应报告、UKB-PPP和deCODE队列的遗传学数据、牙周炎患者牙龈组织和外周血的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-12-13 |
Ubiquitylation-oxaliplatin-related prognosis signature reveals the landscapes of immune responses, cell communication, and therapeutic sensitivity for colorectal cancer
2026-Jan-01, Anti-cancer drugs
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/CAD.0000000000001778
PMID:41191789
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研究论文 | 本研究构建了一个泛素化-奥沙利铂耐药相关风险评分模型，用于预测结直肠癌患者的免疫反应、细胞通讯和治疗敏感性 | 首次整合泛素化修饰与奥沙利铂耐药性，通过单细胞RNA测序识别耐药细胞群体，并发现USP7在结直肠癌增殖、侵袭和耐药中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据，缺乏体内实验验证，且样本来源可能限制模型的普适性 | 揭示泛素化在结直肠癌奥沙利铂耐药中的作用，并开发预测模型以指导治疗策略 | 结直肠癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，药物敏感性预测 | 风险评分模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-12-13 |
Hypoxia-induced regional heterogeneity in proliferative vitreoretinopathy: implications for targeted therapies
2026-Jan, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6494
PMID:41215615
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和免疫荧光染色揭示了增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）在视网膜不同位置具有不同的细胞病理学特征，并发现缺氧诱导的区域异质性是其病理机制，为靶向治疗提供了新策略 | 首次利用单细胞测序技术结合免疫荧光染色，系统揭示了PVR在视网膜不同区域（视网膜前和视网膜下）的细胞组成差异，并明确了缺氧作为统一驱动因素但下游通路选择不同，提出了基于解剖位置的靶向治疗新思路 | 研究主要基于手术切除的PVR膜样本和小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的全貌；样本量相对有限，且未详细探讨长期治疗效果 | 探究增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）的病理机制，特别是区域异质性，以开发更有效的靶向治疗方法 | 手术切除的PVR膜样本以及dispase诱导视网膜损伤的小鼠模型 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞测序数据，图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及手术切除的PVR膜样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-12-13 |
Spatial Transcriptomic Assessments of Gene Expression Profiles in Human Peri-Implant Lesions
2026-Jan, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70008
PMID:41077421
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学、RNA测序和免疫组织化学分析人类牙种植体周围炎病变的基因表达谱 | 首次在人类牙种植体周围炎病变中应用空间转录组学技术，结合RNA测序和免疫组织化学，揭示基因簇与特定组织区域的关联及生物通路失调 | 样本量较小（空间转录组学n=4，RNA测序n=20，免疫组织化学n=38），且仅针对严重牙种植体周围炎病例，可能限制结果的普遍性 | 分析有或无牙种植体周围炎的牙种植体部位人类组织样本的基因表达谱 | 从患有严重牙种植体周围炎的患者及无牙种植体周围炎迹象的相邻参考种植体获取的软组织活检样本 | 数字病理学 | 牙种植体周围炎 | 空间转录组学，RNA测序，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，RNA测序数据，免疫组织化学图像 | 空间转录组学样本4个，RNA测序样本20个，免疫组织化学样本38个 | NA | 空间转录组学，RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-12-12 |
scRNA-sequencing Reveals Bu-Shen-Yi-Qi formula (BSYQF) ameliorates airway remodeling via regulating imbalanced M1/M2 macrophage subtypes in chronic asthmatic mice
2026-Feb-28, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120883
PMID:41237867
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了补肾益气方通过调节慢性哮喘小鼠体内失衡的M1/M2巨噬细胞亚型来改善气道重塑的机制 | 首次在单细胞分辨率上揭示了补肾益气方通过靶向调节M1和M2巨噬细胞亚型来恢复其失衡比例，从而改善慢性哮喘气道重塑的具体分子机制 | 研究基于小鼠模型，其结论在人体中的适用性有待进一步验证；样本量相对有限（8个样本） | 探究补肾益气方治疗慢性哮喘的潜在分子机制 | 慢性哮喘小鼠模型 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光分析, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 图像数据 | 8个样本，超过60,000个小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-12-12 |
Multi-omics analysis of ketogenic diet-mediated neural repair in spinal cord injury: Targeting of lysosomal autophagy through CTSB/LAMP2 regulation
2026-Feb, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110152
PMID:41115614
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研究论文 | 本研究采用多组学方法探究生酮饮食通过调控CTSB/LAMP2轴促进脊髓损伤后神经修复的机制 | 首次整合4D蛋白质组学、转录组学和单细胞RNA测序，揭示生酮饮食通过靶向溶酶体自噬通路CTSB/LAMP2实现神经保护的双重机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人体中进行验证 | 探究生酮饮食在脊髓损伤后神经修复中的作用机制 | C5半挫伤小鼠模型和β-羟基丁酸处理的BV2小胶质细胞 | 多组学分析 | 脊髓损伤 | 4D蛋白质组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量的小鼠模型和BV2细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-12-12 |
Leveraging mutual information in Variational Autoencoders for improved dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing data: The scInfoMaxVAE approach
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种名为scInfoMaxVAE的变分自编码器方法，通过最大化互信息和采用零膨胀计数似然，旨在改进单细胞RNA测序数据的降维和细胞类型分类 | 提出了一种结合互信息最大化与零膨胀计数似然的变分自编码器，专门针对scRNA-seq数据的稀疏性和技术噪声进行优化 | 模型对超参数敏感，且存在一定的运行间方差，建议未来进行自动调优和更大规模的验证 | 改进单细胞RNA测序数据的降维表示和细胞类型分类的鲁棒性与准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | 12个公共scRNA-seq数据集，涵盖多种组织和平台 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-12-12 |
Multiomics data reveal microglia's promotion for choroidal neovascularization in endothelial cells
2026-Jan, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110701
PMID:41130334
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了小胶质细胞通过上调CSRP2并激活VEGF和TGF-β信号通路，促进脉络膜内皮细胞血管生成，从而驱动脉络膜新生血管(CNV)的病理进程 | 首次通过整合组织、血液样本的单细胞RNA测序分析，并结合体外实验验证，明确了CSRP2作为关键生物标志物在小胶质细胞-内皮细胞互作中的核心调控作用 | 研究主要依赖于GEO数据库的公共数据，样本来源可能有限；体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的微环境 | 阐明脉络膜新生血管(CNV)进展中视网膜和RPE/脉络膜复合体内的特定细胞类型及其分子机制，并探索下游效应物CSRP2的表达变化 | 年龄相关性黄斑变性(AMD)引起的CNV患者及健康对照者的视网膜组织、RPE/脉络膜复合体和血液样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 免疫浸润分析, 基因集富集分析, 体外共培养实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的湿性AMD患者和健康对照者的组织与血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |