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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3861 | 2026-07-13 |
Unveiling a novel function of Aconitase-2: attenuating lung ischemia-reperfusion injury via inhibition of pulmonary endothelial apoptosis
2026-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104016
PMID:41637882
|
研究论文 | 揭示乌头酸酶2通过抑制肺内皮细胞凋亡减轻肺缺血再灌注损伤的新功能 | 首次发现乌头酸酶2在肺缺血再灌注损伤中的保护作用,并阐明其通过增强线粒体三羧酸循环和下游代谢产物4-辛基衣康酸抑制细胞凋亡的机制 | 研究仅限于小鼠模型和体外细胞实验,临床样本量较小,需要进一步验证在人体中的治疗潜力 | 探索乌头酸酶2在肺缺血再灌注损伤中的作用及其分子机制 | 肺血管内皮细胞中的乌头酸酶2功能 | 数字病理学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 65名健康捐赠者和48名肺缺血再灌注损伤患者 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 3862 | 2026-07-13 |
Cell Subtypes and Gene Dysfunction in Ovarian Endometriosis Before and After GnRHa Treatment Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2026-02, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-026-02056-0
PMID:41688861
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析卵巢子宫内膜异位症患者在GnRHa治疗前后的细胞亚型和基因功能变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示GnRHa治疗前后异位和原位子宫内膜的细胞异质性,并鉴定出ECM1高表达亚群是纤维化过程中的关键细胞群 | 样本量较小,仅涉及三名患者;未提供更多患者临床特征和治疗反应细节 | 探索子宫内膜异位症纤维化的病理特征,了解异位和原位子宫内膜的细胞异质性及GnRHa治疗前后的变化 | 卵巢子宫内膜异位症患者的原位子宫内膜和异位病灶 | 单细胞测序 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名患者的6份样本(原位子宫内膜和异位病灶),约73,531个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3863 | 2026-07-13 |
Identification of a Potential Biomarker PDGFRA for Endometriosis Based on Comprehensive Analysis of Multiple Omics Data
2026-02, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-02049-5
PMID:41721175
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研究论文 | 基于多组学数据综合分析,识别PDGFRA作为子宫内膜异位症的潜在生物标志物 | 整合了bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组数据,结合WGCNA和机器学习方法识别PDGFRA作为核心基因 | 未提及明显局限性 | 寻找子宫内膜异位症的潜在生物标志物和治疗靶点 | 子宫内膜异位症组织样本及基质细胞 | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学 | WGCNA、机器学习 | 基因表达数据 | 利用GEO数据库中的公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3864 | 2026-07-13 |
SCSEQ: A web tool for analyzing single-cell RNA-seq data
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag029
PMID:42084898
|
研究论文 | 开发了一个基于网络交互式生物信息学分析平台SCSEQ,用于分析单细胞RNA-seq数据 | 提供了一个无需编程技能即可使用的综合性单细胞数据分析平台,涵盖从预处理到下游分析的完整流程,并支持多种输入格式和动态交互 | 未明确说明限制,但可能依赖于平台在线服务的稳定性和计算资源 | 解决单细胞RNA测序数据处理的挑战,为研究人员提供便捷的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3865 | 2026-07-13 |
4D single-cell spatial transcriptomics reveals dynamic morphogenetic gradients and regenerative domains in planarians
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag064
PMID:42172041
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学构建包含超过350万细胞、涵盖8个再生时间点的四维图谱,揭示涡虫再生的形态发生梯度和再生区域 | 首次生成覆盖涡虫全身再生的四维单细胞空间转录组图谱,识别出由Mediator 8调控的前再生区这一全新的损伤诱导空间域 | 未提及具体局限性 | 研究涡虫全身再生过程中基因表达与细胞反应的时空动态规律 | 涡虫(planarians) | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过350万个细胞,来自8个不同再生时间点的完整涡虫样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3866 | 2026-07-13 |
Integrative single-cell transcriptomics and proteomics reveal an immunometabolic framework for MSC-exosome-mediated remodeling of expanded NK cells
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag049
PMID:42008150
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析,揭示间充质干细胞外泌体对扩增NK细胞功能重塑的免疫代谢调控机制 | 首次将单细胞转录组学与蛋白质组学结合,系统解析MSC-Exos对NK细胞代谢与免疫功能的多维度调控,并提出基于FcγR/CD16信号的外泌体作用假说 | 因果关系验证尚不充分,需进一步机制研究确认 | 评估MSC-Exos对人NK细胞体外扩增过程中功能状态的影响及其分子机制 | 人自然杀伤细胞(NK细胞)及间充质干细胞来源的外泌体 | 单细胞组学 | 肿瘤免疫、衰老免疫监视 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 体外扩增的人NK细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3867 | 2026-07-13 |
Inhibiting Nampt signaling promotes M2 macrophage polarization to enhance bone regeneration in periodontitis
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1768560
PMID:41969528
|
研究论文 | 研究通过抑制Nampt信号促进M2型巨噬细胞极化,增强牙周炎骨再生 | 首次揭示NAMPT信号在牙周炎巨噬细胞极化中的作用,并证实局部注射FK866通过诱导M2极化促进骨再生 | NA | 阐明NAMPT信号在巨噬细胞极化中的功能及其对牙周骨再生的影响 | 牙周炎组织中的巨噬细胞、小鼠RAW264.7巨噬细胞、MC3T3-E1成骨细胞、结扎诱导的大鼠牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、共培养、显微CT、组织学染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 牙周炎组织样本、小鼠细胞系、大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3868 | 2026-07-13 |
Malignant triton tumor with thoracic region as the initial presentation: a case report
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1764543
PMID:41971419
|
病例报告 | 报道一例以胸痛为首发表现的罕见恶性Triton肿瘤,并综述其临床特征和治疗策略 | 首次将单细胞RNA测序应用于恶性Triton肿瘤,结合CopyKAT算法区分恶性与非恶性细胞,揭示肿瘤微环境的异质性 | 病例报告的代表性有限,单细胞测序的应用仍处于初步探索阶段,结论需要更大规模研究验证 | 总结恶性Triton肿瘤的临床表现和治疗策略,并探索单细胞RNA测序在揭示肿瘤分子特征中的作用 | 一名23岁女性恶性Triton肿瘤患者,伴有神经纤维瘤病1型病史 | 机器学 | 神经纤维瘤病1型相关恶性Triton肿瘤 | 单细胞RNA测序 | CopyKAT算法 | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3869 | 2026-07-13 |
Ovarian tissue quality assessment and fertility preservation strategies enabled by multi-omics and artificial intelligence: current applications and clinical perspectives
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1789252
PMID:41971663
|
综述 | 本文综述多组学和人工智能在卵巢组织质量评估和生育力保存策略中的应用及其临床前景 | 首次系统整合多组学(如转录组学、单细胞测序、蛋白质组学和空间转录组学)与人工智能技术,提出基于分子图谱和智能预测的个性化卵巢组织评估与移植决策框架 | 当前多组学和AI技术仍处于研究阶段,缺乏大规模临床验证,且整合多模态数据的标准化流程尚未建立 | 探讨多组学和人工智能在卵巢组织质量评估和生育力保存中的应用潜力 | 卵巢组织冷冻保存相关的组织质量评估、生育力保存策略及临床决策 | 数字病理学, 机器学习 | 卵巢早衰, 癌症 | 转录组学、单细胞测序、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 图像、文本、多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3870 | 2026-07-13 |
Immune Cell-Mediated Retinoblastoma Development: Genetic and Molecular Mechanisms
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6303747
PMID:41971766
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序探究免疫细胞介导的视网膜母细胞瘤发生机制 | 首次利用双样本孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序数据,系统揭示了28种免疫细胞与RB1基因的关联,并发现EZH2、UBLCP1和HKDC1基因在免疫细胞参与RB过程中的潜在分子机制 | 基于GWAS汇总统计数据的分析可能受限于数据来源和样本大小,单细胞RNA测序数据的细胞类型覆盖及因果关系推断需进一步验证 | 阐明免疫细胞通过RB1基因影响视网膜母细胞瘤发生的遗传和分子机制 | 视网膜母细胞瘤组织中的免疫细胞及RB1基因相关变异 | 机器学习 | 视网膜母细胞瘤 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基于已发表的GWAS汇总统计数据,具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3871 | 2026-07-13 |
Integrative multi-omics dissection identifies ACO2, KLF5, and IMP4 as central regulators of the mitochondrial-immune axis in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1746810
PMID:41972123
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研究论文 | 通过整合多组学分析,识别ACO2、KLF5和IMP4为溃疡性结肠炎中线粒体-免疫轴的核心调控因子 | 首次系统鉴定ACO2、KLF5和IMP4作为连接线粒体代谢与免疫调控的关键基因,并从遗传、转录组和单细胞水平进行多重验证 | 未对AGPS在不同UC数据集中的转录差异进行功能验证,且部分发现仅基于公共数据库和动物模型,需进一步在临床样本中验证 | 探索溃疡性结肠炎中代谢-免疫调控的关键基因及其作用机制 | 溃疡性结肠炎患者及DSS诱导的小鼠结肠炎模型 | 机器学习和生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | GWAS、eQTL、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | UC病例对照共计394,626人(GWAS),215例病例和134例对照(转录组),18例病例和12例对照(单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3872 | 2026-07-13 |
The construction of CD8+ T cell-associated molecular subtypes in esophageal squamous cell carcinoma reveals tumor heterogeneity, tumor microenvironment, and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1775837
PMID:41972154
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研究论文 | 基于CD8+ T细胞分化基因表达谱构建食管鳞状细胞癌分子亚型,揭示肿瘤异质性、肿瘤微环境及免疫治疗反应 | 首次通过单细胞测序分析CD8+ T细胞分化动态,结合非负矩阵分解构建三种新型分子亚型,并利用孟德尔随机化分析发现RHOB基因作为食管鳞癌新生物标志物 | 未提及具体局限性 | 构建CD8+ T细胞相关分子亚型以预测食管鳞癌患者预后和治疗效果 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤样本及CD8+ T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | GSE53625队列及多个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | Seurat包进行细胞聚类可视化,Harmony包去除批次效应,Monocle2包进行伪时间分析 |
| 3873 | 2026-07-13 |
Correction: Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1827500
PMID:41972190
|
更正 | 对一篇关于肥大细胞标记基因特征在肺腺癌预后和免疫治疗反应预测中作用的研究进行更正 | NA | NA | 更正已发表文章的错误 | NA | NA | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 3874 | 2026-07-13 |
IL21 is predominantly produced by a CXCL13 associated CD4+ T cell subset and shapes the immune microenvironment in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1865519
PMID:42433376
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研究论文 | 本研究揭示IL21在结直肠癌中主要由CXCL13相关CD4+ T细胞亚群产生,并塑造免疫微环境 | 首次明确结直肠癌中IL21的主要细胞来源为CXCL13+CD4+ T细胞,并鉴定候选关键转录因子(STAT1、IRF9等),揭示外源IL21诱导的转录重塑特征 | 直接机制验证仍有待开展 | 阐明IL21在结直肠癌中的细胞来源、调控程序及功能意义 | 结直肠癌肿瘤浸润T细胞、结直肠癌组织微阵列、AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, SCENIC分析, 批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 全转录组测序数据, 免疫荧光图像 | 公开单细胞RNA测序数据集(具体数量未说明)、抗PD-1新辅助治疗单细胞队列(具体数量未说明)、结直肠癌组织微阵列(具体数量未说明)、AOM/DSS诱导小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3875 | 2026-07-12 |
Construction of ammonia death-related lncRNA prognostic signature model and immunomodulatory effect in glioblastoma multiforme
2026-Jul-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150266
PMID:41861940
|
研究论文 | 构建与氨死亡相关的长链非编码RNA预后特征模型并探讨其在胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | 首次探索氨诱导细胞死亡这一区别于凋亡和铁死亡的新机制相关的lncRNA在GBM中的预后价值,并揭示其与代谢-免疫微环境的关联 | NA | 识别与氨死亡相关的lncRNA生物标志物并阐明GBM的代谢-免疫景观 | 胶质母细胞瘤细胞系(U-251、U-87 MG)和正常人星形胶质细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA和CGGA数据库中的多队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3876 | 2026-07-12 |
Sphingomonas paucimobilis-Driven Epithelial-Endothelial Transition in Adenomyosis Pathogenesis
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516652
PMID:41861114
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现鞘氨醇单胞菌驱动腺肌症中的上皮-内皮转化机制 | 首次揭示微生物(鞘氨醇单胞菌)通过TNFα→NF-κB→MMP信号级联诱导上皮-内皮转化,为腺肌症发病机制提供新视角 | 未提及的局限性,如样本量、机制验证的广度或临床转化挑战 | 探索腺肌症的发病机制,特别是微生物驱动的细胞转化 | 腺肌症组织、小鼠模型、细胞培养中的上皮-内皮转化细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序、CSI-Microbes流程、2bRAD-M验证、蛋白质印迹、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、微生物组数据 | 人体组织样本(数量未指定)、小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3877 | 2026-07-12 |
Spatiotemporal profiling of Fat family genes highlights Fat2 as a novel marker of outer enamel epithelium and stratum intermedium
2026-Apr, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100766
PMID:41862271
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研究论文 | 本研究揭示了Fat基因家族在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式,并发现Fat2可作为外釉上皮和中间层的新的标志物 | 首次系统描绘Fat1-Fat4在小鼠牙齿发育中的时空表达谱,并鉴定Fat2为外釉上皮和中间层的特异性标志物,通过功能实验证实其在牙上皮干细胞分化和细胞身份维持中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚需在人类牙齿发育中验证;Fat2调控下游基因的具体分子机制未完全阐明 | 探究Fat基因家族(Fat1-Fat4)在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式及其功能 | C57BL/6J小鼠胚胎及新生小鼠的牙齿组织;M3H1牙上皮干细胞系 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 定量聚合酶链反应, 原位杂交, 小干扰RNA敲低, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 从胚胎第12.5天到出生的小鼠牙齿样本;M3H1细胞系样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用了公共单细胞RNA-seq数据集 |
| 3878 | 2026-07-12 |
Quantifying the fidelity of in vitro human cell culture systems using a biomedical foundation model
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520482123
PMID:41860964
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研究论文 | 利用生物医学基础模型量化体外人肠上皮细胞培养系统的保真度 | 首次提出利用基于单细胞RNA测序数据训练的生物医学基础模型(BMFM-RNA)定量评估体外培养细胞与体内细胞的一致度,为体外细胞培养系统提供标准化基准方法 | 未提及 | 开发一种定量基准测试方法,用于评估体外人类细胞培养系统的保真度 | 人肠上皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生物医学基础模型(BMFM-RNA) | 单细胞RNA测序数据 | 来自患者活检样本及体外培养的人肠上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3879 | 2026-07-12 |
Ultra-precision deconvolution of spatial transcriptomics decodes immune heterogeneity and fate-defining programs in tissues
2026-Mar-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70645-3
PMID:41862467
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研究论文 | 提出超精度空间转录组解卷积算法UCASpatial,揭示组织中的免疫异质性与命运决定程序 | 利用基于熵的权重实现超精度空间转录组解卷积,精准识别低丰度细胞亚群并区分转录异质性群体,发现20q染色体扩增、HERV-H沉默及IL11信号在免疫排斥和纤维化中的新机制 | 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 | 开发高精度空间转录组解卷积算法以解析复杂组织中免疫细胞的空间组织和功能特化 | 人类结直肠癌样本和小鼠伤口愈合模型(C57BL/6) | 空间转录组学、机器学习 | 结直肠癌、伤口愈合相关疾病 | 空间转录组学(空间转录组数据解卷积) | 基于熵加权的解卷积算法(UCASpatial) | 空间转录组数据 | 人类结直肠癌样本和C57BL/6小鼠伤口愈合模型样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3880 | 2026-07-12 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
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research paper | 本研究揭示了组蛋白乳酸化通过正反馈环路调节嘧啶代谢促进口腔癌发生的机制 | 首次发现组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录并形成糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路促进口腔癌发生,揭示了表观遗传调控与乳酸驱动的代谢重编程之间的新联系 | 组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的具体作用机制仍需进一步阐明,且研究主要基于体外和动物模型,临床转化尚需验证 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的作用及其分子机制 | 口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织、细胞系及4NQO诱导的舌癌模型 | digital pathology | lung cancer, prostate cancer, cardiovascular disease, geriatric disease | 免疫组化、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR、糖酵解抑制剂、基因沉默 | NA | image, text | 研究涉及口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织样本,具体数量未在标题和摘要中说明 | 10x Genomics | scRNA-seq | 10x Chromium | NA |