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当前共找到 7641 篇文献，本页显示第 3801 - 3820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3801 | 2026-05-21 |
Bone Marrow-Derived Macrophage NLRP3 Mediates Renal Fibrosis by triggering TGF-β/Smad3-mediated Macrophage-Myofibroblast Transition
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.131452
PMID:42157945
|
研究论文 | 发现骨髓来源巨噬细胞中的NLRP3通过触发TGF-β/Smad3介导的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化促进肾纤维化 | 首次揭示NLRP3在肾纤维化中的促纤维化新角色，并阐明其通过直接结合TGF-β受体激活信号通路的新机制 | 局限可能包括仅在小鼠模型中验证，缺乏人类样本的直接证据，以及未深入探讨NLRP3在其他细胞类型中的潜在作用 | 研究NLRP3在肾纤维化发病机制中的新功能及其作用机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞以及UUO和IRI诱导的肾纤维化小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 大规模单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及不同基因型小鼠（如NLRP3敲除和巨噬细胞特异性NLRP3敲除小鼠）及UUO和IRI模型，样本数量未具体说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 3802 | 2026-05-21 |
Decoding the Sphingolipid Landscape of Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Single-Cell-Guided Prognostic Model Built With 101 Machine Learning
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/3249360
PMID:42158467
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合101种机器学习方法，构建了一个基于鞘脂代谢的透明细胞肾细胞癌预后模型 | 首次利用单细胞测序数据解析鞘脂代谢在ccRCC微环境中的细胞类型特异性特征，并通过101种机器学习组合筛选出最优预后模型 | 未提及具体局限性 | 探索鞘脂代谢在透明细胞肾细胞癌微环境中的异质性作用，并构建预后模型以指导风险分层和治疗优先级 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞亚群 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 非负矩阵分解, 机器学习 | Lasso+SuperPC | 基因表达数据 | 多队列整合数据，包括GEO单细胞RNA-seq数据及Xena、ArrayExpress、ICGC的批量转录组和临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3803 | 2026-05-21 |
Delineating novel diagnostic biomarkers and therapeutic targets for oral submucosal fibrosis: an integrative multi-omics and machine learning approach
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1803111
PMID:42158597
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研究论文 | 通过整合多组学和机器学习方法，鉴定口腔黏膜下纤维化的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 结合转录组、表观基因组和单细胞RNA-seq数据，并应用机器学习模型来识别潜在生物标志物 | 未明确说明局限性，但样本量较小且主要依赖公共数据库数据 | 发现口腔黏膜下纤维化的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 口腔黏膜下纤维化患者 | 机器学习 | 口腔黏膜下纤维化 | RNA-seq, 微阵列, 表观基因组测序, 单细胞RNA-seq | 随机森林模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多个公共数据集，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 3804 | 2026-05-21 |
Characteristics of peripheral blood neutrophil subsets in patients with primary Sjogren's syndrome based on single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1820004
PMID:42158857
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序构建原发性干燥综合征患者外周血中性粒细胞亚群图谱，并探索其作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘原发性干燥综合征患者外周血中性粒细胞的亚群谱系及细胞间相互作用，发现中性粒细胞2亚群具有独特特征，并鉴定LY6E和CLEC12A为潜在生物标志物和治疗靶点 | 未明确说明研究的局限性 | 探究中性粒细胞亚群在原发性干燥综合征发生发展中的角色与机制 | 原发性干燥综合征患者的外周血中性粒细胞 | 机器学学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 纳入2022年12月至2025年1月间新诊断的原发性干燥综合征患者及健康对照者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3805 | 2026-05-21 |
Identification of characteristic hub genes in the immune-active phase of chronic hepatitis B
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769749
PMID:42158856
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研究论文 | 通过整合生物信息学和机器学习方法，鉴定慢性乙型肝炎免疫活跃期外周经典单核细胞中的特征性枢纽基因SLC24A4，并探索其作为免疫调节潜在药物靶点的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据验证SLC24A4在慢性乙型肝炎免疫活跃期外周经典单核细胞中高表达，并通过计算机敲除分析揭示其可能作为单核细胞活化的负调控因子，提出其高表达是限制过度炎症的补偿机制 | 研究主要基于公共数据库和计算机模拟分析，SLC24A4的功能验证局限于计算机敲除和临床样本蛋白表达，缺乏体内功能实验证据 | 识别慢性乙型肝炎免疫活跃期的关键分子靶点，为调控宿主免疫反应提供新策略 | 慢性乙型肝炎患者外周经典单核细胞 | 生物信息学, 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹法 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法, 计算机敲除分析 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | GSE230397数据集（样本量未明确）、GSE182159和GSE283471单细胞数据集（样本量未明确）、临床样本蛋白质印迹验证（样本量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3806 | 2026-05-21 |
Integrative transcriptomic analysis revealed the roles and prognostic value of ion channels in hypertrophic cardiomyopathy
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1810143
PMID:42158954
|
研究论文 | 通过整合转录组分析揭示离子通道在肥厚型心肌病中的作用及预后价值 | 首次结合多个转录组数据集、单细胞RNA测序和空间转录组分析，系统识别出四个关键离子通道（KCNC4、KCNN3、ANO1、CACNA2D3）与HCM发展相关，并发现它们与心肌肥厚、纤维化和巨噬细胞比例变化等病理特征的联系 | 未提及具体局限性，但基于公开数据集的分析可能受样本异质性和数据质量影响 | 阐明离子通道在肥厚型心肌病发展中的角色及其诊断和预后价值 | 肥厚型心肌病患者与对照人群的心脏组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 基于三个转录组数据集，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3807 | 2026-05-20 |
Identifying mitochondria-related signatures for tuberculosis diagnosis through machine learning on single-cell transcriptomics data and experimental verification
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108489
PMID:41967724
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据和机器学习识别线粒体相关基因特征用于结核病诊断，并经过实验验证 | 首次将单细胞RNA测序数据与机器学习算法相结合，识别出三个线粒体相关基因（STAT2、CASP1和COX7B）作为结核病诊断标志物，构建了基于血液的诊断模型 | 模型在独立临床队列中进行了初步验证，但样本量有限，需更大规模研究进一步确认 | 探索线粒体相关基因特征作为结核病诊断的生物标志物 | 活动性结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序、微阵列、定量PCR、LASSO、SVM-RFE | 支持向量机（SVM） | 基因表达数据 | 训练集125例，验证集30例，两个测试集分别15例和26例，独立临床队列52例 | Illumina | 单细胞RNA测序、微阵列 | Illumina NovaSeq, Illumina HumanHT-12 | GSE19491微阵列数据，SRP247583单细胞RNA测序数据，GSE54992和GSE34608微阵列数据 |
| 3808 | 2026-05-20 |
Atopic dermatitis: Multi-omics insights into microbiota-driven modulation of the gut-skin axis
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108504
PMID:42019770
|
综述 | 本文综述了多组学技术揭示的微生物群驱动肠-皮肤轴调控特应性皮炎的作用机制 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞转录组学等多组学数据，识别出以拟杆菌和普雷沃菌为主的特应性皮炎内型特征，为精准分层和靶向治疗提供了新框架 | 该综述主要基于现有文献总结，缺乏原始实验数据验证，且未详细讨论不同研究间方法学差异对结论一致性的影响 | 总结宿主遗传学、微生物群网络和多组学生物标志物在特应性皮炎内型中的作用，为精准诊断和靶向干预提供依据 | 特应性皮炎患者及其肠道微生物群、代谢产物和免疫反应特征 | 机器学习 | 特应性皮炎 | 宏基因组学, 代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3809 | 2026-05-20 |
Extracellular vimentin promotes neutrophil-dominant granulomatous inflammation in progressive pulmonary sarcoidosis
2026-Jun-10, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20250651
PMID:42084847
|
研究论文 | 本研究通过计算机分析和动物实验，发现细胞外波形蛋白在进展性肺结节病中促进中性粒细胞主导的肉芽肿性炎症 | 首次揭示细胞外波形蛋白可作为触发因子，驱动中性粒细胞介导的炎症通路，导致肺结节病进展和纤维化 | 未明确提及具体局限性 | 探索进展性肺结节病中中性粒细胞及其效应分子的作用机制 | 进展性肺结节病患者肺组织样本和波形蛋白诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 进展性纤维化结节病患者与自愈性疾病患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3810 | 2026-05-20 |
Cuproptosis-Related Gene FDX1 Induces Malignant Progression and Immune Suppression in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11242-9
PMID:40911146
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研究论文 | 本文研究了铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌中诱导恶性进展及免疫抑制的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示铜死亡关键基因FDX1在三阴性乳腺癌上皮细胞中高表达，并通过体外实验和共培养模型证明其促进肿瘤细胞增殖、迁移并抑制CD8 T细胞免疫应答 | 研究仅基于公共单细胞RNA测序数据集和体外实验，缺乏临床样本验证及体内免疫微环境动态调控机制的深入探讨 | 探究铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌恶性进展及免疫抑制中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞及小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、qPCR、细胞功能实验、共培养体系、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及体外细胞系（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公共scRNA-seq数据集（具体平台未说明） |
| 3811 | 2026-05-20 |
Integrating multiomic layers to decode psychiatric disease mechanisms
2026-Jun, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102451
PMID:41831411
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综述 | 整合多组学数据以解析精神疾病的分子机制 | 通过单细胞转录组学、表观组学、蛋白质组学和空间组学等多组学技术，系统连接遗传变异与基因调控、细胞类型脆弱性和环路功能障碍，推动从变异到机制和环路的转化 | 未提及具体局限性 | 利用新兴多组学技术整合分析精神疾病的遗传机制，为生物标志物发现、患者分层和精准治疗策略奠定基础 | 精神疾病，包括精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症 | 计算生物学 | 精神疾病 | NA | NA | 多组学数据（转录组、表观组、蛋白质组、空间组） | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 单细胞 ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3812 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-06, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3813 | 2026-05-20 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2026-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziag070
PMID:42124856
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研究论文 | 针对小鼠肌肉骨骼组织，开发了利用Xenium Prime 5K平台进行空间转录组分析的高质量样本处理流程，包括灌注、固定、脱钙、石蜡包埋和共嵌入策略，实现了多组织同时切片和高转录本检测 | 首次系统建立了适用于小鼠完整肌肉骨骼组织（包括矿化组织）的空间转录组样本处理流程，通过优化固定、脱钙和共嵌入步骤，在保持组织解剖结构的同时实现了高比例优质转录本检测 | 不同组织类型间检测到的转录本数量差异显著，矿化组织转录本数较低；且流程涉及多步骤处理，可能仍存在RNA降解风险 | 建立高质量空间转录组分析的标准流程，以解决小鼠肌肉骨骼组织因脱钙等处理导致的RNA完整性难题 | 成年小鼠的完整膝关节、胫骨和腰椎样本 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 基于成像的空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 成年小鼠膝关节、胫骨和腰椎样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | Xenium Prime 5K平台 |
| 3814 | 2026-05-20 |
Myeloid Mas drives pyruvate kinase M2-mediated Spi1 lactylation to fuel inflammatory senescence in MASLD
2026-May-19, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02704-6
PMID:42151117
|
研究论文 | 揭示了髓系Mas通过驱动丙酮酸激酶M2介导的Spi1乳酰化促进MASLD炎症性衰老的机制 | 首次发现G蛋白偶联受体Mas作为MASLD的代谢检查点，并通过Mas-PKM2-Spi1乳酰化轴调控糖酵解重编程和单核前体细胞分化 | 未提及具体局限性 | 阐明免疫代谢与MASLD疾病进展之间的精确机制 | MASLD患者及饮食诱导小鼠模型的肝髓系细胞 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肝组织样本及饮食诱导小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3815 | 2026-05-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal an arachidonic acid-related cellular atlas in lung adenocarcinoma
2026-May-19, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02251-4
PMID:42151495
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示肺腺癌中花生四烯酸相关的细胞图谱 | 整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，首次在肺腺癌中系统探索花生四烯酸代谢相关的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的作用 | 未明确说明局限性 | 探究肺腺癌中花生四烯酸代谢的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的调控机制 | 肺腺癌组织中的肿瘤细胞、T细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3816 | 2026-05-20 |
Basal cell subsets, as biomarker to predict the therapeutic effect of neoadjuvant therapy for esophageal carcinoma
2026-May-19, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-026-06503-y
PMID:42151650
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析食管癌新辅助治疗中基底细胞亚群作为疗效预测的生物标志物 | 首次发现基底细胞亚群Basal3、Basal8与病理完全缓解相关，Basal7与不完全病理反应相关，并识别了ATF3和JUN基因对生存的影响 | 样本量较小（仅22例患者），且包含多数食管鳞癌和1例腺鳞癌，统计结果代表性有限 | 探索食管癌新辅助治疗疗效预测的生物标志物 | 来自22例II-IV期接受新辅助化免疫治疗的食管癌患者的肿瘤及配对邻近组织 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22例食管癌患者（21例食管鳞癌，1例食管腺鳞癌） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3817 | 2026-05-20 |
Mastication-Induced Electrical Stimulation Activates Prg4+ Chondroprogenitors for Osteoarthritis Therapy
2026-May-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75725
PMID:42153977
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研究论文 | 开发了一种咀嚼驱动的镁掺杂压电纳米纤维，通过将关节载荷转化为局部电刺激并释放镁离子来中和酸性微环境，用于骨关节炎治疗 | 首次利用咀嚼产生的机械载荷激活内源性电敏感软骨祖细胞，提出变废为宝的骨关节炎治疗策略 | 仅在动物模型验证，缺乏人体临床试验数据；遗传消融Prg4细胞显示疗效减弱但未完全消除，可能存在其他补偿机制 | 开发利用关节生物力学信号治疗骨关节炎的新疗法 | 大鼠颞下颌关节骨关节炎模型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠颞下颌关节组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 3818 | 2026-05-20 |
Decoding circulating neutrophil phenotypes in triple-negative breast cancer via optimized single-cell RNA sequencing
2026-May-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04345-8
PMID:42154046
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研究论文 | 通过优化的单细胞RNA测序解码三阴性乳腺癌中循环中性粒细胞的表型 | 开发了基于两个中性粒细胞标记基因面板和排除非中性粒细胞标记基因的稳健分析框架，实现了对单细胞数据中中性粒细胞的精准鉴定与功能表征 | 研究样本量较小（仅6名TNBC患者和6名对照），且中性粒细胞分离数量有限（TNBC组84个，对照组128个），可能限制结果的普适性 | 表征三阴性乳腺癌患者循环中性粒细胞的转录组差异，探究肿瘤对免疫细胞的影响机制 | 三阴性乳腺癌患者和非恶性供体的循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例样本（6例TNBC患者和6例非恶性供体），共分离212个中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3819 | 2026-05-20 |
Multiscale domain identification for spatial transcriptomics via persistent homology
2026-May-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101376
PMID:41916308
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研究论文 | 利用持续同调方法对空间转录组数据进行多尺度域识别 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组的多尺度域识别，解决了传统聚类方法仅能识别单一形态尺度域、忽略多尺度交互的问题 | 未对计算效率进行详细评估，且方法在异构区域与同质域之间的边界识别能力有待进一步验证 | 开发一种基于持续同调的多尺度空间域识别方法，以捕捉跨形态尺度的组织结构 | 空间转录组数据中的空间域 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 持续同调 | 基因表达数据 | 多组织类型与空间转录组技术的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3820 | 2026-05-20 |
Decoding spatial transcriptomics across multicellular and subcellular resolutions
2026-May-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72872-0
PMID:42151140
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研究论文 | 提出STARS方法，利用Vision Transformer和对比学习，从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中重建单细胞水平基因表达 | 首次实现跨多细胞和亚细胞分辨率空间转录组平台的单细胞水平基因表达重建，结合组织学图像和转录组数据 | 未明确指出局限性 | 开发能准确从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中分解或聚合信号至单细胞水平的方法 | 小鼠肺组织、结直肠癌组织中的细胞类型，包括免疫细胞和成纤维细胞等 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌, 流感感染, 细菌继发感染 | 空间转录组学 | Vision Transformer, 对比学习 | 图像, 转录组数据 | 小鼠肺组织（3个平台：Visium、Visium HD、Stereo-seq）及额外公共数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Visium HD, BGI Stereo-seq | 10x Visium多细胞分辨率平台, 10x Visium HD亚细胞分辨率平台, BGI Stereo-seq亚细胞分辨率平台 |