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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3721 | 2026-02-22 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过外泌体递送RAB10蛋白,抑制巨噬细胞M1极化并促进其M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现外泌体RAB10通过与干扰素受体IFNAR1结合,抑制JAK1/STAT1通路磷酸化,从而调控巨噬细胞极化,并证明联合靶向RAB10和PD-L1具有协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于乳腺癌模型,其他肿瘤类型中的普适性有待验证;临床样本验证相对有限 | 探究外泌体RAB10在调控巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 乳腺癌细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境、CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、体外实验、动物模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3722 | 2026-02-22 |
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68512-2
PMID:41559043
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研究论文 | 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 | 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 | 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 | Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) | 小鼠肿瘤模型 | 多组学数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |
| 3723 | 2026-02-22 |
Robust and interpretable prediction of gene markers and cell types from spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68487-0
PMID:41545411
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研究论文 | 本文介绍了一个名为STimage的综合模型套件,用于直接从标准H&E图像预测空间基因表达和分类细胞类型 | 通过估计基因表达分布并使用集成方法量化数据驱动和模型不确定性,增强了模型的鲁棒性;通过单细胞分辨率的归因分析结合组织病理学注释、功能基因和潜在表示,提高了可解释性 | NA | 提高空间转录组学数据中基因标记和细胞类型预测的鲁棒性和可解释性 | 空间转录组学数据中的基因表达和细胞类型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习模型,集成方法 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3724 | 2026-02-22 |
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001671
PMID:41525512
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型,用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层,并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 | 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征,构建了可解释的深度学习模型,并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 | 研究涉及多个队列,但外部验证队列样本量相对较小(n=88),且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 | 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层,并为治疗决策提供信息 | 肝内胆管癌患者 | 计算机视觉 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | Swin UNETR,SwinU-CliRad框架 | 磁共振成像,临床放射学特征 | 发现队列682例,内部测试队列204例,外部多中心队列88例,新辅助治疗队列145例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3725 | 2026-01-14 |
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07677-2
PMID:41526921
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3726 | 2026-02-22 |
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag070
PMID:41712686
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研究论文 | 提出了一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN,用于处理不同分辨率和通量的ST数据 | 首次将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成,通过混合编码器结合多头注意力和残差连接,同时捕获局部表达模式和全局信息 | 未明确说明方法对特定组织类型或实验条件的适用性限制 | 开发鲁棒的空间转录组数据分析框架 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 对抗自编码器, 图卷积网络 | 基因表达空间数据 | 多个ST数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3727 | 2026-02-21 |
The shared mechanisms and potential diagnostic markers for IgA nephropathy and celiac disease
2026-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2026.2635179
PMID:41714845
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研究论文 | 本研究通过整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,识别了共享的生物标志物和致病机制 | 首次系统整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据,利用多组学分析和机器学习方法识别出ITGB2、CD74和KLK1等共享诊断标志物,并构建了转录因子-miRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认这些标志物的功能和临床适用性 | 揭示IgA肾病和乳糜泻的共病分子机制,并寻找潜在的诊断标志物和治疗策略 | IgA肾病和乳糜泻患者 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 加权基因共表达网络分析,机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个独立队列的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3728 | 2026-02-21 |
Aberrant epithelial differentiation may contribute to endometrial polyp formation: insights from single-cell analysis
2026-Dec, Systems biology in reproductive medicine
IF:2.1Q3
DOI:10.1080/19396368.2026.2628916
PMID:41712676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析子宫内膜息肉与邻近子宫内膜的转录组差异,探讨息肉形成的分子机制 | 首次在单细胞水平揭示子宫内膜息肉中上皮细胞分化异常和血管重塑缺陷,通过伪时间分析发现上皮细胞成熟受阻 | 单细胞RNA测序仅局限于增殖期样本,可能限制结果的普适性 | 探究子宫内膜息肉形成和复发的分子机制 | 子宫内膜息肉及邻近子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 伪时间分析 | RNA测序数据 | 12名女性的配对子宫内膜息肉和邻近子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3729 | 2026-02-21 |
Exosome-related lactylation gene signature defines diagnostic biomarkers of periodontitis through integrative bulk and single-cell transcriptomics
2026-Apr, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组学数据,构建了首个基于外泌体相关乳酸化基因的诊断模型,用于牙周炎诊断,并揭示了细胞类型特异性的乳酸化重塑机制 | 首次建立了基于外泌体相关乳酸化基因的诊断模型,并整合批量与单细胞转录组学数据解析了牙周炎中乳酸化修饰的细胞异质性 | 未明确提及样本量限制或模型在更广泛人群中的验证情况 | 探索外泌体相关乳酸化基因作为牙周炎潜在诊断生物标志物 | 牙周炎患者与健康组织的基因表达数据 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及训练队列和两个独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3730 | 2026-02-21 |
ROS-responsive, brain- and M1 microglia-targeting modified ginkgetin-loaded smart liposomes ameliorate cerebral ischemia by HIF-1α-mediated negative regulation of microglia pyroptosis
2026-Apr, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.102870
PMID:41716338
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研究论文 | 本研究设计了一种ROS响应、靶向大脑和M1小胶质细胞的银杏双黄酮智能脂质体,通过抑制HIF-1α通路减轻小胶质细胞焦亡,从而改善脑缺血损伤 | 开发了具有ROS响应性和双重靶向功能(RVG29靶向大脑,MG1靶向小胶质细胞)的智能脂质体递送系统,用于精准递送银杏双黄酮至缺血病灶,并揭示了其通过HIF-1α/c-Myc/NLRP3轴抑制小胶质细胞焦亡的新机制 | 研究主要在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验;长期安全性和免疫原性有待进一步评估;具体靶向效率和脱靶效应在复杂人体环境中的表现仍需验证 | 开发一种能够克服血脑屏障、精准靶向缺血病灶的纳米治疗策略,以改善脑缺血后的神经功能恢复 | 大脑、小胶质细胞、神经元、脑缺血损伤区域 | 神经科学、纳米医学、药物递送 | 脑缺血、缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、共培养实验、动物模型(大脑中动脉闭塞/再灌注模型) | NA | 基因表达数据、组织病理学数据、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3731 | 2026-02-21 |
An atlas of cGAS-STING signaling in pathophysiological angiogenesis and retinal vascular homeostasis across species
2026-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.102847
PMID:41717290
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研究论文 | 本研究通过分析跨物种的单细胞RNA测序数据,揭示了cGAS-STING信号通路在视网膜血管生成和稳态中的保守作用,并发现其通过调控VEGFA-VEGFR2信号通路影响血管生成 | 首次在跨物种(小鼠、人类、狨猴)水平上系统描绘了cGAS-STING信号通路在视网膜血管生成中的时空表达模式,并证实了该通路通过调控VEGFA-VEGFR2信号影响血管生成的分子机制 | 研究主要基于单细胞测序数据和细胞实验,缺乏在大型动物模型或临床样本中的进一步验证 | 探究cGAS-STING信号通路在视网膜血管生成和稳态调控中的作用机制 | 小鼠视网膜、人类视网膜血管内皮细胞、狨猴视网膜、视网膜前纤维血管膜 | 单细胞组学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 多个物种的视网膜样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3732 | 2026-02-21 |
Single-cell transcriptomics of multi-site cell therapy in osteoarthritis: Tissue-specific treatment correlations
2026-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.102839
PMID:41717289
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了骨关节炎自体细胞疗法临床试验中骨髓抽吸浓缩物和基质血管组分样本的转录组特征 | 首次在骨关节炎细胞疗法临床试验中应用单细胞转录组学,揭示了治疗部位特异性的变异模式,并识别了与临床反应相关的关键分子通路 | 患者异质性可能掩盖了差异表达基因的显著性发现,且基因组分析目前尚不能直接用于指导个体化治疗 | 评估骨关节炎自体细胞疗法的分子机制和临床反应相关性 | 接受骨髓抽吸浓缩物和基质血管组分自体细胞治疗的膝骨关节炎患者 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 方差分解、张量分解、差异表达基因分析、细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 临床试验中的BMAC和SVF样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3733 | 2026-02-21 |
Applications of single-cell transcriptomics: updated insights in endometrial cancer
2026-Mar, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04032-7
PMID:40903692
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在子宫内膜癌研究中的应用,重点分析了肿瘤微环境的细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术全面解析子宫内膜癌肿瘤微环境的细胞组成和相互作用,为个性化治疗和预后预测提供新见解 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行总结 | 总结单细胞转录组学在子宫内膜癌研究中的最新应用进展 | 子宫内膜癌及其肿瘤微环境中的细胞(上皮细胞、基质细胞、内皮细胞和免疫细胞) | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3734 | 2026-02-21 |
IGSF9 promotes immunotherapy resistance in colon cancer by orchestrating an immunosuppressive tumor microenvironment and enables combinatorial targeting strategies
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102478
PMID:41717080
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析、单细胞测序和临床前模型,探讨了IGSF9在结肠癌中的作用及其与免疫治疗耐药性的关联 | 首次将IGSF9确立为结肠癌免疫治疗耐药的预后和预测生物标志物,并提出了靶向IGSF9相关KRAS/MAPK通路与抗PD-1疗法联合的新策略 | 研究主要基于临床前模型和临床数据集分析,需要进一步的临床试验验证 | 探索IGSF9在结肠癌免疫治疗耐药中的作用机制,并寻找克服耐药性的联合治疗策略 | 结肠癌肿瘤组织、恶性上皮细胞、小鼠模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多组学分析、单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 临床数据集和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 3735 | 2026-02-21 |
CAMK1D and PI3 in low-density neutrophils are associated with the anti-hypertensive effects of valsartan
2026-Feb-28, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.178613
PMID:41628662
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探讨了缬沙坦对高血压患者低密度中性粒细胞的影响及其分子机制 | 首次在高血压治疗背景下,利用单细胞RNA测序识别了低密度中性粒细胞的四个亚型(CAMK1D、PI3、ISG15、S100A12),并发现CAMK1D和PI3基因表达变化与缬沙坦疗效相关 | 样本量较小,研究仅观察了一个月的治疗效果,且未进行功能验证实验 | 探究缬沙坦对高血压患者低密度中性粒细胞的影响及其分子机制 | 新诊断的高血压患者 | 单细胞组学 | 高血压 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 新诊断高血压患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3736 | 2026-02-21 |
A muscle-centered hierarchical breakdown underlies flight loss during silkworm domestication
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114846
PMID:41716997
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了家蚕在驯化过程中飞行能力丧失的分子机制,发现其核心在于飞行肌细胞的协调性崩溃 | 首次通过整合单细胞与空间转录组学解析昆虫飞行能力退化的多层次遗传模块,并发现该肌肉中心模块在迁徙性害虫中具有保守性 | 研究主要聚焦于家蚕与飞蛾两种物种,其他昆虫飞行能力退化的普适性机制仍需进一步验证 | 探究昆虫在驯化过程中复杂性状(飞行能力)退化的进化回归机制 | 家蚕及其飞行能力祖先飞蛾的发育期飞行器官,以及迁徙性害虫飞蛾 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及家蚕、飞蛾及迁徙性害虫飞蛾的飞行器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3737 | 2026-02-21 |
Mathematical analysis of G1/S sub-networks in hematopoietic proliferation: Sequential and lineage-specific activation
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114291
PMID:41717016
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研究论文 | 本文通过计算分析和数学建模,研究了造血细胞中G1/S亚网络的激活模式,揭示了不同细胞类型在相同微环境中具有独特增殖特性的机制 | 首次将68种造血细胞类型映射到特定模型参数,并识别它们通过G1/S的个体化路径,为造血增殖提供了新的机制见解 | 研究基于已发表的单细胞转录组数据,可能受数据质量和样本异质性限制,且为理论工作需实验验证 | 探究造血细胞中G1/S网络与发育阶段的协调机制,以理解增殖与分化的平衡 | 人类骨髓中的造血干细胞和谱系祖细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 数学模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3738 | 2026-02-21 |
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal tumor immunometabolism in lymph node metastasis of lung cancer
2026-Feb-19, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了肺癌淋巴结转移中肿瘤免疫代谢的调控机制 | 首次在肺癌淋巴结转移中鉴定出MOCCI驱动的氧化磷酸化重编程的PLMC亚群,并揭示了其通过GDF15-TGFBR2轴信号驱动Tfh耗竭和抑制B细胞活化的空间相互作用机制 | 样本量相对较小(10名患者),且主要基于转录组数据,功能验证仍需进一步扩展 | 探究肺癌淋巴结转移中肿瘤细胞代谢适应与免疫微环境相互作用的机制 | 肺癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结、未受累淋巴结和外周血样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,T细胞受体/B细胞受体测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 37个匹配样本(来自10名肺癌患者),共捕获671,467个细胞;另有一个独立队列(n=875)用于预后验证 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3739 | 2026-02-21 |
Exploring the causal relationship between plasma proteins and obstructive sleep apnea: a study using genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2026-Feb-19, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05087-1
PMID:41711838
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研究论文 | 本研究通过整合基因组范围孟德尔随机化、单细胞RNA测序分析和网络药理学方法,系统评估了血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的因果关系,并识别了潜在的治疗靶点 | 首次将双向孟德尔随机化分析、网络药理学策略和单细胞测序技术相结合,系统性地探索了血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的因果关系,并识别了新的候选治疗靶点和潜在药物 | 研究数据主要来源于欧洲人群(芬兰生物银行),可能限制了结果在其他人群中的普适性;研究为观察性设计,确定的因果关系需要进一步的实验验证 | 阐明血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的因果关系,探索其分子病理机制,并识别潜在的治疗靶点和药物 | 血浆蛋白(4,907种)与阻塞性睡眠呼吸暂停 | 生物信息学 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | 基因组范围孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,网络药理学,蛋白质-蛋白质相互作用网络构建,药物靶点预测,分子对接模拟 | NA | 基因组关联研究数据,血浆蛋白数据,单细胞转录组数据 | 血浆蛋白数据样本量 n=35,559;OSA相关GWAS数据来源于芬兰生物银行的欧洲人群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3740 | 2026-02-21 |
Ketogenic Diet as an Epigenetic Therapy in SETD1B-Related Epilepsy
2026-Feb-19, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70345
PMID:41714828
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研究论文 | 本研究报道了一名患有SETD1B相关失神性癫痫的4岁男孩,在传统药物治疗无效后,通过改良阿特金斯生酮饮食实现了超过90%的癫痫发作减少,并通过单细胞RNA测序揭示了生酮饮食对染色质、核糖体、免疫和线粒体通路基因调控的逆转作用 | 首次将生酮饮食作为表观遗传疗法应用于SETD1B相关癫痫,并通过单细胞RNA测序在单细胞分辨率上展示了生酮饮食对染色质介导的基因调控通路的广泛逆转效应 | 研究仅基于单个病例,样本量有限,且缺乏长期随访数据 | 探索生酮饮食作为表观遗传疗法在SETD1B相关癫痫中的治疗效果及分子机制 | 一名4岁SETD1B相关失神性癫痫男性患者 | 单细胞组学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3个样本(基线、治疗3个月、年龄匹配对照),共25,159个外周单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |