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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3721 | 2026-05-23 |
Hepatic radiofrequency ablation induces widespread cellular activation throughout the liver
2026-Apr-02, European radiology experimental
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s41747-026-00687-1
PMID:41926011
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研究论文 | 研究了肝脏射频消融术后远处肝组织的细胞、转录和翻译激活情况 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,全面揭示了射频消融术后肝脏远处区域在转录和翻译水平上的广泛细胞激活现象 | 研究仅使用小鼠模型,且样本量较小(两只治疗小鼠和一只对照),可能无法完全代表人类肝脏的生物学反应 | 探究射频消融对整个肝脏的细胞、转录和翻译激活程度 | 健康肝脏的小鼠模型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 射频消融, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析(SomaLogic) | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 两只8-10周龄雄性C57/Bl6小鼠进行射频消融,一只进行假手术对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3722 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophage-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00235.2025
PMID:41481288
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析臭氧暴露小鼠肺泡巨噬细胞的浓度依赖性反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示肺泡巨噬细胞对不同浓度臭氧暴露的转录组变化和功能调节 | 信息不足,未提及 | 探究肺泡巨噬细胞在臭氧暴露下的浓度依赖性反应机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3723 | 2026-05-23 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
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研究论文 | 利用空间转录组数据和生成式AI模型Tera-MIND预测并可视化脑部血管结构 | 首次利用空间转录组数据和生成式AI模型(Tera-MIND)从基因共表达模式预测脑部血管空间组织,无需额外组织处理 | NA | 预测脑部血管的空间组织,探索生成式AI在生物结构模拟中的应用潜力 | 小鼠大脑中的血管网络结构 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 扩散模型(Diffusion model) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3724 | 2026-05-23 |
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01380-7
PMID:41888349
|
研究论文 | 利用两个大型欧洲前瞻性队列数据进行孟德尔随机化分析,评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关系 | 首次系统验证原发肿瘤与继发性恶性肿瘤的因果关系,并使用单细胞测序分析揭示PLK1癌症干细胞可能是驱动因素 | 研究仅基于欧洲人群,可能限制结果的普遍性;此外,因果关系的机制尚未完全阐明 | 评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关联,为癌症幸存者的随访策略优化提供证据 | 来自UK Biobank(31种癌症类型)和FinnGen(28种癌症类型)的欧洲人群数据 | 机器学习 | 胃癌,食管癌,直肠癌 | NGS,单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,临床数据 | 两个队列包含31种和28种癌症类型,具体样本量未详细说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3725 | 2026-05-23 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
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研究论文 | 提出了一个基于异构图的框架HarveST,用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据,以识别空间域和标记基因 | 首次将异构图学习框架应用于空间转录组学,结合自监督学习和部分监督细化双重训练策略,并引入随机游走重启算法识别空间域特异性的空间可变基因 | 暂未在标题和摘要中提及具体限制 | 开发一种能够精确识别空间域和标记基因的计算方法,以解决空间转录组学中的主要挑战 | 人类皮层组织、小鼠嗅球及肿瘤微环境中的空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 异构图学习框架 | 空间转录组数据 | 涵盖人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3726 | 2026-05-23 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
|
研究论文 | 本研究通过整合八个独立队列,利用深度学习算法从CT图像中自动提取92项身体成分参数,揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结局及分子背景的关联 | 首次全面分析多维身体成分与NSCLC免疫治疗结局的关联,并揭示性别差异和不同脂肪分布区域对免疫微环境的影响 | 未明确指出具体局限性 | 探究多维身体成分与NSCLC免疫治疗预后及分子机制的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | 深度学习、RNA-seq、单细胞RNA-seq | 深度学习算法 | CT影像 | 2,132例非小细胞肺癌患者(8个独立队列) | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 3727 | 2026-05-23 |
CD8+ T cells sustain vaccination-induced immunity against dissemination of contained tuberculosis in immunosuppressed hosts
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70911-4
PMID:41876499
|
研究论文 | 在免疫抑制宿主中,CD8+ T细胞维持疫苗接种诱导的免疫反应,阻止结核分枝杆菌从局限的淋巴感染中扩散 | 首次揭示在CD4 T细胞缺失的情况下,CD8 T细胞能介导BCG疫苗接种诱导的保护作用,阻止结核分枝杆菌的扩散,并利用多参数成像、空间转录组和网络分析阐明了免疫抑制下非CD4免疫细胞的重定位机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体验证;B细胞在CD4 T细胞缺失时对遏制结核的作用虽被排除,但其他免疫细胞类型的作用仍需进一步探索 | 探究在免疫抑制条件下维持潜伏结核感染(LTBI)遏制状态的免疫学相关因素 | 小鼠模型中局限的淋巴结核分枝杆菌感染及其在免疫抑制下的扩散 | 机器学习 | 结核病 | 空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 使用小鼠模型,包括免疫细胞缺陷小鼠、细胞耗竭和过继转移实验,具体样本数量未明确 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |
| 3728 | 2026-05-23 |
IgA autoantibodies promote inflammation, Th17 polarization and fibrotic responses in hidradenitis suppurativa
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70883-5
PMID:41876535
|
研究论文 | 本文研究了IgA自身抗体在化脓性汗腺炎中促进炎症、Th17极化和纤维化反应的作用 | 首次系统揭示了IgA自身抗体通过巨噬细胞、中性粒细胞胞外陷阱和T细胞多重机制驱动HS慢性炎症和纤维化的致病网络 | 主要基于体外实验和临床样本关联分析,缺乏体内动物模型验证因果机制 | 阐明IgA自身抗体在化脓性汗腺炎发病机制中的致病作用 | 化脓性汗腺炎患者的皮肤病变组织、血清及免疫细胞 | 数字病理学 | 化脓性汗腺炎 | 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫荧光, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 图像 | HS患者皮肤病变样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3729 | 2026-05-23 |
Cellular landscape and diagnostic value of TROP2 in cerebrospinal fluid of lung adenocarcinoma leptomeningeal metastases
2026-Mar-24, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01379-0
PMID:41876785
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序描绘肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液的细胞图谱并评估TROP2的诊断价值 | 首次系统描绘肺腺癌软脑膜转移脑脊液的单细胞转录组图谱,发现促肿瘤LGMN-SELENOP巨噬细胞和增殖性循环肿瘤细胞,并揭示NECTIN2_TIGIT和CD47_SIRPA免疫抑制轴,以及TROP2作为诊断生物标志物的潜力 | 样本量有限(仅6例患者),且结果需在更大队列中验证 | 研究肺腺癌软脑膜转移脑脊液的细胞特征并寻找诊断生物标志物 | 6例肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例肺腺癌软脑膜转移患者的脑脊液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3730 | 2026-05-23 |
RelA Signaling in Scgb1a1+ Progenitors Mediates Lower Airway Epithelial Atypia in RSV-Induced Post-Viral Lung Disease
2026-Mar-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27062864
PMID:41898720
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研究论文 | 本研究探讨RSV感染后慢性肺部疾病中Scgb1a1+祖细胞的RelA信号通路如何诱导下气道上皮异型 | 首次揭示RSV后病毒性肺病中Scgb1a1+祖细胞通过RelA信号调控上皮-间质微环境,驱动非典型肺泡2型细胞(aAT2)形成及ANGPTL4信号失调 | 主要基于小鼠模型,需进一步验证在人类RSV感染相关慢性肺病中的适用性 | 解析RSV感染后慢性气道疾病中先天免疫信号在呼吸道上皮祖细胞中的作用机制 | Scgb1a1+祖细胞、非典型肺泡2型细胞(aAT2)、PDGFRβ间质细胞 | 机器学习 | 呼吸道合胞病毒感染后肺病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | RSV后病毒性肺病小鼠模型,含RelA条件敲除组和对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3731 | 2026-05-23 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
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研究论文 | 提出UniST,一个统一生成式人工智能框架,用于从稀疏连续切片计算重建致密连续的三维空间转录组景观 | 将核点卷积与交叉注意力层、光流连续切片重建和隐式神经表达图自编码器三重模块整合,实现无需改变实验技术的端到端3D空间转录组重建 | 仍依赖稀疏切片数据;框架在极端组织缺失情况下的鲁棒性及不同平台间通用性的系统验证尚存局限 | 开发一种通用计算框架,从稀疏连续切片重建致密连续的三维空间转录组,以解决组织三维重建中的数据稀疏性和异质性问题 | 小鼠胚胎数据集及两种人类癌症组织(含肿瘤-免疫边界和三级淋巴结构) | 机器学习和数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 核点卷积网络、交叉注意力机制、光流插值、隐式神经表达图自编码器 | 基因表达和空间坐标数据 | 小鼠胚胎(未明切片数)及2例人类癌症组织 | NA | 空间转录组学(多种平台) | NA | NA |
| 3732 | 2026-05-23 |
Modulating Bacteroides to boost anti-PD-1 immunotherapy in HCC
2026-Feb-17, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013755
PMID:41702649
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研究论文 | 通过调节肠道菌群中的拟杆菌属,增强抗PD-1免疫疗法在肝细胞癌中的疗效 | 发现了B.th通过KLF2/TLR9信号通路重编程树突状细胞增强抗PD-1免疫疗法疗效的新机制,并提出了基于菌群调节的免疫治疗优化策略 | 尚未完全阐明参与该过程的其他菌种和分子机制,临床转化需进一步验证 | 探究肠道微生物组对肝细胞癌抗PD-1免疫治疗应答的调控机制及潜在临床应用 | 肝细胞癌患者及小鼠模型中的肠道菌群、树突状细胞、CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序、粪便微生物移植 | NA | 测序数据 | NA | NA | 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3733 | 2026-05-23 |
Redirecting cytomegalovirus immunity against pancreas cancer for immunotherapy
2026-Feb-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012969
PMID:41638871
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研究论文 | 通过系统性递送巨细胞病毒T细胞表位,重新引导预先存在的抗病毒免疫力以对抗胰腺癌 | 提出一种利用预先存在的巨细胞病毒记忆T细胞治疗免疫难治性实体瘤(胰腺癌)的新策略,通过静脉注射T细胞肽表位实现 | NA(摘要未提及限制) | 研究利用巨细胞病毒特异性T细胞重定向攻击胰腺癌的免疫疗法效果 | 小鼠模型及胰腺癌细胞 | 免疫疗法 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA(摘要未提及具体样本量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3734 | 2026-01-18 |
Neighborhood nonnegative matrix factorization identifies patterns and spatially-variable genes in large-scale spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03846-6
PMID:41546049
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3735 | 2026-05-21 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2026-Jun, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牙髓干细胞在血管生成、成牙本质和神经分化过程中的细胞异质性和分化序列 | 首次揭示牙髓干细胞在体内先进行血管生成分化,随后再进行神经分化的时间顺序,并利用单细胞RNA测序证实了细胞异质性和特异性基因表达模式 | 未明确说明限制,但可能包括体内模型的人为性和分化时间的个体差异 | 阐明牙髓干细胞分化过程中血管生成先于神经分化的机制 | 人牙髓干细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人牙髓干细胞样本;免疫缺陷小鼠移植实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3736 | 2026-05-21 |
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04131-5
PMID:41396398
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平揭示口腔癌中炎症性肠病相关基因的表达异质性,并发现NFKBIA表达与趋化因子介导信号通路显著关联 | 研究样本量有限,未涉及功能性验证实验,缺乏健康对照组织比较 | 阐明炎症性肠病相关基因在口腔癌中的细胞和分子通路机制 | 口腔癌组织样本 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 口腔癌组织样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3737 | 2026-05-21 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals the impact of inflammatory microglia on prognosis and immunotherapy response in primary glioblastoma
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04135-1
PMID:41420790
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示炎症性小胶质细胞在原发性胶质母细胞瘤中对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次基于炎症性小胶质细胞相关基因对GBM患者进行分层,并揭示两种不同亚型在预后和免疫治疗反应上的显著差异 | NA | 阐明炎症性小胶质细胞在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的亚型特异性影响,并探索其预后和免疫治疗反应的预测价值 | 原发性胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的炎症性小胶质细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 三个独立数据集的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3738 | 2026-05-21 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular heterogeneity and prognostic subtypes in colorectal cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04153-z
PMID:41430524
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌的细胞异质性并识别预后亚型 | 整合单细胞RNA-seq与批量RNA-seq数据,在单细胞水平揭示结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成,并基于标记基因对患者进行基因分型,识别出具有预后意义的分子亚型 | 需要进一步的功能验证以充分理解这些发现的临床意义 | 探索结直肠癌的细胞组成,整合单细胞与批量转录组数据以识别预后标志物并表征肿瘤异质性 | 结直肠癌肿瘤样本的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17例结直肠癌样本用于单细胞RNA-seq,566例结直肠癌样本用于批量RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 3739 | 2026-05-21 |
CCR5 expression defines the functional heterogeneity of tumor-infiltrating CD8+ T cells and predicts enhanced antitumor immunity and favorable prognosis in non-small cell lung cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04170-y
PMID:41432877
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研究论文 | 本研究通过综合转录组、单细胞RNA测序及功能实验,揭示了CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其作为预后标志物的潜力 | 首次在非小细胞肺癌中系统验证CCR5+CD8+ T细胞的功能异质性及其独立预后价值,并采用多方法联合验证(转录组、单细胞、染色、功能实验) | 未提供明显局限性,可能包括样本量有限或机制深度不足(基于摘要推断) | 评估CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤功能和预后价值 | 非小细胞肺癌患者肿瘤浸润CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, 体外细胞共培养杀伤实验 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 组织图像 | TCGA和GEO队列(多个队列),15例NSCLC患者样本(单细胞RNA测序) | NA | NA | NA | NA |
| 3740 | 2026-05-21 |
Macrophage-Fibroblast Crosstalk Shapes Wound Repair Signaling In Vitro
2026-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601156R
PMID:42149092
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研究论文 | 利用体外2D和3D伤口愈合模型结合活细胞钙成像和单细胞RNA测序,研究巨噬细胞与成纤维细胞之间的接触依赖性和旁分泌互作机制 | 揭示了接触依赖性钙信号和连接蛋白信号与转录重塑的整合如何协调巨噬细胞-成纤维细胞行为,特别是发现连接蛋白Cx43介导的细胞-细胞接触增强巨噬细胞IL10生成并抑制TNFα分泌 | 研究仅基于体外模型,尚未在体内伤口愈合环境中验证相关信号通路 | 阐明巨噬细胞与成纤维细胞之间接触依赖性信号如何与旁分泌通路整合以调控伤口愈合过程中的相互行为 | 骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序、活细胞钙成像 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 使用骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞进行体外实验,未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |