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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3701 | 2026-05-25 |
Cardiomyocyte-derived GPX4 stabilizes BNIP3 to facilitate mitophagy and mitigate myocardial ischemia/reperfusion injury
2026-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71232-2
PMID:41904174
|
研究论文 | 研究发现心肌细胞来源的GPX4通过稳定BNIP3促进线粒体自噬,减轻心肌缺血再灌注损伤 | 首次揭示GPX4通过其U46活性位点增强BNIP3与USP20相互作用,减少BNIP3的K131位泛素化,从而稳定BNIP3并促进线粒体自噬的新机制,将GPX4与铁死亡相关的线粒体损伤联系起来 | 未提及 | 阐明GPX4在心肌缺血再灌注损伤中的效应及分子机制 | 心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 3702 | 2026-05-25 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization during CD4+ T cell activation reveals immune-mediated mechanisms and drug targets for neuropsychiatric disorders
2026-Mar-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09941-z
PMID:41904330
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研究论文 | 结合单细胞转录组学、表达数量性状位点鉴定、孟德尔随机化和共定位分析,识别神经精神疾病在CD4+ T细胞激活过程中的致病基因、通路和药物靶点 | 首次在动态T细胞激活状态下整合单细胞转录组学与孟德尔随机化,发现时间特异性因果模式,并优先考虑RAC1和PARP1等21个潜在药物重定位靶点 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限或因果推断的潜在混杂因素 | 阐明CD4+ T细胞激活在阿尔茨海默病和重度抑郁症免疫介导机制中的作用并识别药物靶点 | 阿尔茨海默病和重度抑郁症 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 重度抑郁症 | 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3703 | 2026-05-25 |
The CD4+ T cell population partners with Tpex CD8+ T cells to mediate antitumor immunity in the tumor microenvironment
2026-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71161-0
PMID:41904165
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和质谱流式分析,发现CD4+ T细胞亚群Th7R与Tpex CD8+ T细胞在肿瘤微环境中协同作用,维持抗肿瘤免疫 | 首次鉴定出IL-7R CCR6+ Th1样CD4+ T细胞亚群(Th7R)作为Tpex的伴侣细胞,阐明其在三级淋巴结构中与Tpex共定位并支持抗肿瘤免疫的新机制 | 部分数据来自肾细胞癌样本,且主要基于肺癌患者,可能限制结论的普适性;小鼠模型为过继转移实验,人类研究为关联性分析,因果验证不足 | 探究肿瘤微环境中CD4+ T细胞如何与Tpex CD8+ T细胞协作以维持抗肿瘤免疫 | 肺癌患者(主要)和肾细胞癌患者的外周血、肿瘤和淋巴结样本 | 机器学习 | 肺癌, 肾细胞癌 | NA | NA | NA | 肺癌和肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 3704 | 2026-05-25 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
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研究论文 | 通过单细菌细胞视角揭示头孢曲松耐药在奈瑟氏球菌亚种中的机制 | 首次结合实验进化和单细胞转录组学来解析奈瑟氏球菌亚种在抗生素压力下从共生菌向病原菌转变的多因素策略 | 尚未在更多临床菌株或体内模型中验证该适应性过程 | 研究抗生素压力如何驱动奈瑟氏球菌亚种适应并增强致病性 | 奈瑟氏球菌亚种(Neisseria subflava) | 机器学习和数字病理学 | 慢性呼吸系统疾病 | 全基因组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | 实验进化过程中多个时间点的细菌培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3705 | 2026-05-25 |
Germ line LCP1 mutations cause immunodeficiency with neutropenia, monocytopenia, lymphopenia, and defective cytokinesis
2026-Feb-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016507
PMID:41056520
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研究论文 | 本研究报告了LCP1基因种系突变导致的一种新型免疫缺陷疾病,其特征包括中性粒细胞减少、单核细胞减少、淋巴细胞减少及细胞分裂缺陷 | 首次发现LCP1基因的激活型突变是导致常染色体显性遗传性造血系统疾病的病因,并通过患者来源的诱导多能干细胞验证了遗传起源 | 主要基于四个独立家系的数据,样本量有限,且对突变导致的功能获得效应的分子机制阐述尚不完全 | 阐明LCP1基因突变在先天性中性粒细胞减少症及免疫缺陷中的致病作用 | 来自四个独立家系的LCP1基因突变患者及其骨髓来源的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 先天性中性粒细胞减少症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个家系中多名患者,具体数量未说明;其中A247_E254del突变患者的骨髓来源造血干细胞和祖细胞进行了单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3706 | 2026-05-25 |
Claudin 18.2 as a Biomarker for Imaging and Radiopharmaceutical Therapy in Gastric and Pancreatic Tumors
2026-01-02, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.125.270568
PMID:41266253
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研究论文 | 探究Claudin 18.2作为胃癌和胰腺癌中分子成像与靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 首次在胃癌和胰腺癌模型中系统评估CLDN18.2用于PET成像和放射性核素治疗的可行性,展示了[Zr]Zr-DFO-zolbetuximab的高肿瘤摄取和[Lu]Lu-DOTA-zolbetuximab的抗肿瘤效果 | 研究基于小鼠异种移植模型,尚未在人体中进行验证;样本量较小(31例PDAC患者) | 评估CLDN18.2作为胃癌和胰腺癌分子成像和靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 胃癌(GSU细胞系)和胰腺导管腺癌(HUPT-4和PATU8988S细胞系)的小鼠皮下异种移植模型 | 数字病理学 | 胃癌, 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, PET成像, 放射性药物治疗 | NA | 测序数据, 影像数据 | 31名胰腺癌患者, 裸鼠异种移植模型(GSU、HUPT-4、PATU8988S细胞系) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3707 | 2026-05-25 |
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4807-0_7
PMID:41273642
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综述 | 讨论了在慢病毒载体中构建和运用组成型及脑细胞类型特异性启动子和增强子以实现精准高效基因递送的方法 | 利用单细胞转录组学和ATAC测序新技术发现新型增强子区域,为开发更精准的靶向慢病毒载体铺平道路 | 未明确说明 | 开发用于慢病毒载体的脑细胞类型特异性启动子和增强子,提高转基因在脑细胞中的表达特异性和效率 | 脑细胞类型包括兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学, ATAC测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 3708 | 2026-05-23 |
SIRT1-NCOR2 Corepressor Modulates Trophoblast-Macrophage Interactions in Preeclampsia
2026-Jun, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 研究SIRT1-NCOR2共抑制复合物在子痫前期中调节滋养层-巨噬细胞相互作用的机制 | 首次揭示SIRT1通过招募NCOR2调控RARRES2表达,影响滋养层与巨噬细胞相互作用,并验证孕酮补充可逆转子痫前期样症状 | 未标注具体局限性,但可能涉及小鼠模型的物种差异及临床样本量限制 | 探究子痫前期中低SIRT1水平如何上调RARRES2表达,影响巨噬细胞极化和疾病发病机制 | 系统性Sirt1杂合敲除小鼠、滋养层特异性Sirt1敲除(cKO)小鼠、子痫前期患者血浆 | 数字病理学 | 妊娠期高血压疾病(子痫前期) | 单细胞测序、共培养实验、荧光素酶报告基因、染色质免疫沉淀、质谱分析、免疫沉淀 | NA | 测序数据、细胞实验数据、动物模型数据、临床样本数据 | 包含小鼠模型(具体数量未提及)及子痫前期患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3709 | 2026-05-23 |
Endothelial prolyl hydroxylase 3 mitigates maladaptive inflammation to promote post-ischemic kidney repair
2026-Jun, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.017
PMID:41692346
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研究论文 | 研究内皮细胞脯氨酰羟化酶3在急性肾损伤后修复中的作用机制 | 首次揭示内皮PHD3作为关键氧感受器,通过抑制干扰素-γ驱动的内皮激活来保护肾脏免受适应不良性炎症,促进组织修复并限制AKI向CKD的转变 | 主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞分析,具体机制在人体内的验证尚需进一步研究 | 探究内皮氧感受(特别是PHD3)在急性肾损伤后肾脏修复中的作用 | 小鼠(条件性基因敲除品系)和人类肾脏样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、体外实验数据 | 两种独立人类数据集及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3710 | 2026-05-23 |
Autocrine SFRP2 (secreted frizzled related protein 2) enhances lung myofibroblast fibrogenic activity by suppressing PINK1-mediated mitophagy initiation
2026-Jun, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2642341
PMID:41789512
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SFRP2在IPF肺肌成纤维细胞中高表达,并揭示其通过抑制PINK1介导的线粒体自噬启动来增强肺肌成纤维细胞的纤维化活性 | 首次定义了一个新型的自分泌SFRP2-线粒体自噬调控轴,该轴持续激活肌成纤维细胞,并作为肺纤维化的潜在治疗靶点 | 目前文章未明确提及局限性,但可能包括模型仅限于小鼠、未在人体样本中验证治疗干预等 | 探究特发性肺纤维化中肌成纤维细胞持续激活的调控机制 | IPF患者肺组织、小鼠肺纤维化模型、原代小鼠肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体、中和抗体、自噬诱导剂 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及IPF患者肺组织样本和小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'(推测) |
| 3711 | 2026-05-23 |
Epigenetic and Transcriptional Regulatory Networks Underlying Psoriasis Pathogenesis
2026-Jun, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.003
PMID:41856313
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综述 | 本文综述了表观遗传调控在银屑病发病机制中的作用,包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA,并探讨了环境因素、诊断工具和治疗策略 | 整合了表观遗传学与遗传风险、环境触发因素及精准治疗策略的联系,并强调了单细胞表观基因组学和空间转录组学等新型诊断工具的应用潜力 | 临床前模型的预测价值有限,且表观遗传谱存在个体差异,限制了研究结果的转化 | 阐明表观遗传调控在银屑病病理生理中的核心作用,并探索其作为精准医学框架的桥梁价值 | 银屑病相关的表观遗传机制(DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA)及环境因素(紫外线、空气污染) | 自然语言处理 | 银屑病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞表观基因组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 3712 | 2026-05-23 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Identifies Prognostic Biomarkers in Breast Cancer Metastasis
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11228-7
PMID:40828203
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据,识别乳腺癌转移相关的预后生物标志物 | 首次结合批量微阵列与单细胞RNA测序数据,发现PRC1和POLR3H作为乳腺癌转移的新型预后标志物 | 未提供具体局限信息 | 识别乳腺癌转移的预后相关基因标志物 | 乳腺癌转移相关的差异表达基因及其在恶性上皮和EMT细胞中的表达 | 机器学习 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个公共微阵列数据集(GSE14776、GSE103357、GSE32489)及一个单细胞RNA测序数据集(GSE180286) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3713 | 2026-05-23 |
Chemotherapy-induced reactive myelopoiesis promotes expansion of immunosuppressive neutrophil-like monocytes in mice and humans
2026-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198360
PMID:41945895
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研究论文 | 化疗诱导的反应性骨髓生成促进免疫抑制性中性粒细胞样单核细胞在小鼠和人类中扩增 | 通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,揭示化疗药物环磷酰胺诱导骨髓生成产生中性粒细胞样单核细胞(NeuMo)的分子特征,并确认其在人类中的保守免疫调节反馈机制 | 对CTX诱导的骨髓生成的分子机制理解仍有限,且NeuMo细胞在肿瘤对化学免疫治疗反应中的临床意义尚待进一步研究 | 研究化疗诱导的反应性骨髓生成及其对免疫抑制性单核细胞扩增的影响 | 化疗(环磷酰胺)处理的小鼠和接受含环磷酰胺化疗的淋巴瘤患者 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠骨髓单核细胞(具体数量未说明),公共数据库中化疗治疗的癌症患者数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 3714 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomics reveals that air-liquid interface culture promotes goblet cell differentiation and inhibits glycolysis in organoid cell monolayers
2026-05-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00251.2025
PMID:41830459
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示气液界面培养促进肠道类器官单层中杯状细胞分化并抑制糖酵解 | 首次利用单细胞RNA测序系统比较了浸没培养和气液界面培养条件下兔盲肠类器官的细胞异质性,发现ALI培养能显著增强分泌谱系分化并更接近体内转录组特征 | BEST4细胞在类器官中未能检测到,表明ALI条件仍无法完全重现体内所有上皮细胞类型 | 阐明气液界面培养对肠道类器官上皮细胞类型特异性基因表达的影响及代谢机制 | 兔盲肠来源的类器官单层细胞(浸没培养和气液界面培养)及体内兔盲肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 兔盲肠类器官样本(浸没和气液界面两种条件)及体内兔盲肠上皮样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 3715 | 2026-05-21 |
Corrigendum to: Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf159
PMID:40719554
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3716 | 2026-05-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals HMGA2 involvement in neoplastic aggressiveness and endothelial cell senescence in chondrosarcoma
2026-Apr-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10188-x
PMID:41964890
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HMGA2在软骨肉瘤肿瘤侵袭性和内皮细胞衰老中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织的细胞异质性,发现HMGA2调控恶性表型并与不良预后相关,同时揭示SPP1和HBEGF在肿瘤细胞与内皮细胞通讯中的新机制 | 研究基于有限临床样本,公共数据集验证可能受批次效应影响,功能实验仅在体外和动物模型中进行 | 解析软骨肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性,寻找潜在治疗靶点 | 高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织的临床样本 | 单细胞转录组学 | 软骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织临床标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3717 | 2026-05-23 |
DUSP5 suppresses esophageal squamous cell carcinoma by counteracting macrophage-derived AREG-ERK1/2 signaling and disrupting an oncogenic ERK1/2-ELK1-DUSP5 feedback circuitry
2026-Apr-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08641-0
PMID:41956999
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合体内外模型,揭示了DUSP5通过抑制肿瘤浸润巨噬细胞来源的AREG-ERK1/2信号通路及破坏致癌性ERK1/2-ELK1-DUSP5正反馈回路来抑制食管鳞癌进展的分子机制 | 首次阐明DUSP5在食管鳞癌中充当肿瘤抑制因子,并发现其受ERK1/2下游转录因子ELK1负调控,形成致癌性反馈回路;同时揭示了APOC⁺巨噬细胞通过AREG-EGFR轴促进肿瘤生长的免疫微环境机制 | 未明确提及具体研究限制 | 探究DUSP5在食管鳞癌中的功能及肿瘤免疫微环境中的调控机制 | 食管鳞癌细胞系、小鼠异种移植模型及致癌物诱导的DUSP5敲除小鼠 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、细胞增殖/凋亡/迁移检测、小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组分析、基因表达谱 | 单细胞转录组数据、临床组织样本数据 | 未明确提及样本量,涉及多个细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3718 | 2026-05-23 |
Functional analysis of the human miRNome in non-small cell lung cancer unveils a novel miR-92b-3p/NOTCH3 axis that drives tumor progression
2026-Apr-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08709-x
PMID:41951596
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研究论文 | 通过功能性miRNA筛选发现miR-92b-3p/NOTCH3轴驱动非小细胞肺癌进展 | 首次对肺腺癌中人类miRNome进行系统性功能筛选,并发现驱动肿瘤进展的新miR-92b-3p/NOTCH3轴 | NA | 系统鉴定与肺腺癌进展相关的功能性miRNA及其机制 | 肺腺癌细胞系及患者样本 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 慢病毒miRNA筛选, RNA-seq, 空间转录组学 | 风险评分模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 | TCGA-LUAD队列及内部空间转录组样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3719 | 2026-05-23 |
SIRT1 mediates KU70 to maintain genomic stability in spermatogonial stem cells via the NHEJ repair pathway
2026-Apr-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08710-4
PMID:41946691
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研究论文 | 该论文揭示了SIRT1通过KU70介导的非同源末端连接修复途径维持精原干细胞基因组稳定性的机制 | 首次在精原干细胞中阐明SIRT1通过去乙酰化KU70调控NHEJ修复通路,并发现SIRT1-KU70轴是保护雄性生育力的潜在靶点 | 主要基于体外实验和小鼠模型,人体样本验证有限,且未深入探讨SIRT1其他下游靶点 | 探究SIRT1在精原干细胞DNA损伤应答中的作用机制及其对雄性生育力的影响 | 非阻塞性无精子症患者的精原干细胞及小鼠精原干细胞模型 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类睾丸单细胞RNA测序数据集(非阻塞性无精子症患者与对照),以及梗阻性无精子症患者睾丸切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'RNA-seq |
| 3720 | 2026-05-23 |
Integrated spatial transcriptomics and pan-cancer XGBoost modeling uncover spatial drivers of immune exclusion and predict immunotherapy response
2026-Apr-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04374-3
PMID:41925746
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研究论文 | 本研究建立了一个综合计算框架,整合27种癌症类型的多组学数据,利用空间转录组学解码免疫相关非编码RNA调控网络,发现SNHG6-BIRC5轴是肺腺癌“免疫冷”表型的关键驱动因子,并开发了泛癌XGBoost模型用于预测免疫治疗反应 | 首次将空间转录组学与多组学分析结合,系统鉴定免疫排斥的空间驱动因素,并开发了优于PD-L1的泛癌XGBoost预测模型 | 文中未明确提及研究局限性 | 利用空间转录组学和机器学习方法,揭示免疫排斥的空间驱动因素,并开发预测免疫治疗反应的泛癌模型 | 27种癌症类型的肿瘤样本,重点为肺腺癌样本 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, 空间转录组学, CRISPR-Cas9筛选 | XGBoost | 图像 | 27种癌症类型的数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |