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当前共找到 7641 篇文献，本页显示第 3681 - 3700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3681 | 2026-05-27 |
A Rare T-Cell Factor 4 Lineage-negative Epithelial Stem Cell Supports Wound Repair and APC-deletion-induced Colon Tumorigenesis
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712502
PMID:41889847
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研究论文 | 研究发现了结肠中一种稀有且表达T细胞因子4阴性（Lin-）的上皮干细胞群，该细胞在肠道屏障修复和APC缺失驱动的结肠肿瘤发生中发挥重要作用 | 首次鉴定出非隐窝基部柱状细胞的Lin-干细胞群，并证明其在APC单倍剂量不足背景下作为结肠肿瘤起源细胞的独特作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类组织中验证该干细胞群的存在与功能 | 探究肠道上皮屏障稳态维持及APC缺失诱导的结肠肿瘤发生中的新型干细胞机制 | 小鼠结肠上皮组织中的稀有干细胞群体 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序，谱系追踪，免疫组织化学 | NA | 测序数据，图像 | 小鼠结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3682 | 2026-05-27 |
Binary-SPA: A Reference-Free Method for Cell Annotation in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712369
PMID:41889971
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研究论文 | 提出一种无需外部参考数据的高分辨率空间转录组细胞注释方法Binary-SPA | 无需单细胞RNA测序参考数据集即可实现高精度细胞类型注释，通过两阶段策略结合二分类和锚点标签转移，消除了对外部参考数据的依赖 | 依赖预定义标记基因集，可能在某些组织或条件下标记基因定义不完整 | 开发一种不依赖外部参考数据的空间转录组细胞注释方法 | 高分辨率空间转录组数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 二分类器和锚点标签转移 | 空间转录组数据 | 包含骨髓活检等多种组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3683 | 2026-05-27 |
PalmaClust: A graph-fusion framework leveraging the Palma ratio for robust ultra-rare cell type detection in scRNA-seq data
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712161
PMID:41890078
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research paper | 提出PalmaClust，一个基于帕尔马比率的图融合框架，用于在单细胞RNA测序数据中稳健检测超稀有细胞类型 | 首次将社会学中用于衡量尾部不平等的帕尔马比率引入单细胞RNA测序稀有细胞类型检测，通过融合基于不同基因选择统计量（帕尔马比率、基尼指数、法诺因子）的多个K近邻图，实现了对超稀有细胞群体的灵敏识别和校准置信度 | 文本未提及明确局限性，但可能依赖公共数据集的基准测试，缺乏对真实复杂组织样本的广泛验证 | 开发一种可扩展且统计稳健的方法，用于在单细胞RNA测序数据中灵敏检测稀有细胞群，同时提供校准置信度和可解释的分子特征 | 单细胞RNA测序数据中的稀有细胞群，包括短暂祖细胞、治疗耐药肿瘤亚克隆和抗原特异性淋巴细胞 | machine learning | NA | scRNA-seq, graph-fusion clustering | KNN, graph-fusion | gene expression data | 多个公共单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3684 | 2026-05-27 |
Preferential formation of NUP98-KDM5A condensates at specific H3K4me3-rich loci drives leukemogenic gene expression
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712262
PMID:41889846
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研究论文 | 以NUP98-KDM5A为模型，研究染色体易位产生的融合蛋白如何通过染色质互作形成凝聚体并驱动致白血病基因表达 | 揭示了NUP98-KDM5A通过结合H3K4me3形成胶状凝聚体，并利用局部H3K4me3密度实现基因靶向选择性的机制，为理解染色质相关凝聚体解读表观遗传景观提供了通用框架 | 未提及 | 阐明NUP98融合蛋白的基因靶向和凝聚体行为的基本原理 | NUP98-KDM5A融合蛋白及其在白血病中的基因表达调控 | 机器学习 | 白血病 | 细胞成像、体外重建、基因组分析、单细胞测序 | NA | 图像、基因表达数据、单细胞测序数据 | 来自患者的单细胞测序数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3685 | 2026-05-27 |
Melanocyte loss dominates the vitiligo transcriptome: a rank-based meta-analysis
2026-Mar-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.07.26345817
PMID:41728299
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研究论文 | 通过对六项独立转录组研究的秩次元分析，确定了白癜风中黑素细胞丢失的一致特征 | 首次通过秩次元分析方法整合多项转录组研究，识别出白癜风皮损中黑素细胞丢失的一致特征，并发现新的候选黑素细胞标记物 | 免疫激活的异质性可能受采样方法和疾病特征影响，需要进一步研究 | 识别白癜风的共识转录组特征 | 白癜风皮损样本 | 机器学习 | 白癜风 | RNA-seq 和 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 115个样本，包括微阵列、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3686 | 2026-05-27 |
Gsx2 regulates oligodendrocyte precursor formation in the zebrafish spinal cord
2026-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2026.01.001
PMID:41491310
|
研究论文 | 利用斑马鱼模型研究Gsx2基因通过单细胞多组学数据调控脊髓少突胶质前体细胞形成的作用机制 | 首次在斑马鱼脊髓中发现Gsx2在少突胶质前体细胞前体（pre-OPCs）中特异性表达，并通过基因敲除实验证明其调控OPC形成的时间窗口 | 仅基于斑马鱼模型验证，未在哺乳动物系统中进行功能验证；结论准确性和物种间保守性有待进一步确认 | 阐明神经前体细胞向少突胶质细胞谱系特化的分子调控机制，尤其关注Gsx2基因的功能 | 斑马鱼脊髓中的神经前体细胞（NPCs）及少突胶质前体细胞（OPCs） | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | 基因组编辑数据, 单细胞转录组数据, 单核表观组数据 | 斑马鱼gsx2纯合突变体胚胎及对照胚胎（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3687 | 2026-05-27 |
Uncovering causal relationships in single-cell omic studies with causarray
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag175
PMID:41985059
|
研究论文 | 提出causarray框架，用于在单细胞组学研究中通过伪批量与单细胞水平分析揭示因果关系 | 首次在单细胞组学数据中整合未测量混杂因素的广义调整方法与半参数推断，结合灵活机器学习技术以稳健估计处理效应 | 未在更多不同类型单细胞数据集或更大规模队列中验证方法的泛化能力 | 开发能有效消除选择偏倚和未测量混杂效应，从而在单细胞观察性数据中准确推断因果关系的计算框架 | 自闭症风险基因的小鼠胚胎脑内Perturb-seq数据集，以及阿尔茨海默病的人类脑转录组病例对照数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病，自闭症 | 单细胞测序，CRISPR，Perturb-seq | 半参数模型，机器学习 | 单细胞转录组数据 | 两个单细胞基因组研究：小鼠胚胎脑Perturb-seq数据集和三个阿尔茨海默病人类脑转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3688 | 2026-05-27 |
The differentiation and function of heterogeneous thymic dendritic cell subsets require signals provided by distinct thymocyte cell types
2026-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02371-9
PMID:41507389
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和功能分析，鉴定七种胸腺常规树突状细胞亚群及其与胸腺细胞亚群的相互作用机制 | 首次全面鉴定七种胸腺常规树突状细胞亚群，并阐明CD4SP和CD8SP胸腺细胞亚群对cDC1和cDC2/pDC的差异化支持机制 | 未提及具体限制，可能包括样本量有限或未能完全模拟人类胸腺环境 | 探究胸腺树突状细胞亚群的异质性和功能分化机制 | 小鼠胸腺树突状细胞和胸腺细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胸腺样品，具体数量未提及 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 3689 | 2026-05-27 |
Immunometabolic reprogramming of macrophages: Emerging roles in skeletal muscle regeneration and therapeutic perspectives
2026-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108109
PMID:41577156
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综述 | 本文综述了巨噬细胞免疫代谢重编程在骨骼肌再生中的作用，以及在急性和慢性疾病中的治疗潜力 | 首次系统总结了单细胞和空间转录组学揭示的骨骼肌巨噬细胞异质性，并强调免疫代谢重编程作为巨噬细胞可塑性的关键驱动力 | 讨论了将免疫代谢重编程转化为肌肉萎缩疾病有效干预措施的主要挑战和未来方向 | 总结巨噬细胞免疫代谢在骨骼肌再生中的调控作用，并探讨通过重编程巨噬细胞代谢促进再生的新兴治疗策略 | 骨骼肌中的巨噬细胞及其免疫代谢过程 | 机器学习 | 肌肉萎缩疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞转录组, 空间转录组 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序, 空间转录组技术 |
| 3690 | 2026-05-27 |
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0102
PMID:42146899
|
research paper | 提出一种名为 SpaGene 的深度学习框架，用于整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据，以预测空间转录组中缺失的基因表达 | 采用两个编码器-解码器对、两个转换器和两个判别器的对抗框架，有效填补空间转录组数据中的基因表达缺失 | 在受控基因保留评估协议下测试，可能未充分反映真实场景中的噪声和批次效应 | 开发一种方法整合单细胞和空间转录组数据，提高空间基因表达预测的准确性 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | machine learning | 肺癌 | scRNA-seq， 空间转录组学 | GAN | 基因表达数据 | 多个数据集对，包括肺癌组织样本 | NA | scRNA-seq， spatial transcriptomics | NA | NA |
| 3691 | 2026-05-27 |
Trophoblast Fusion Deficiency in Placenta-Related Pregnancy Disorders
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-22637-2_6
PMID:42168741
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综述 | 本文综述了滋养层细胞融合在胎盘相关妊娠疾病中的缺陷及其分子机制 | 整合了多组学技术（如单细胞和空间转录组学）对滋养层融合的时空动态和分子复杂性进行了深入分析，并系统总结了从转录因子到代谢调控的多个层面的最新发现 | 缺乏能完全再现人类母胎界面结构和功能特征的模型，对翻译后修饰和时空调控机制的理解有限 | 阐明滋养层细胞融合缺陷在胎盘相关妊娠疾病（如子痫前期和胎儿生长受限）中的作用，并探索潜在的诊断和治疗创新 | 滋养层细胞融合过程及其相关分子机制，包括转录因子、融合蛋白、细胞骨架重塑、代谢重编程和免疫调节 | NA | 子痫前期, 胎儿生长受限 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 表观基因组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3692 | 2026-05-27 |
Autoencoder Denoising for Network-Based Spatial Transcriptomics Data with Applications for Cell Signaling Estimation
2026, Complex networks & their applications. International Conference on Complex Networks and Their Applications
DOI:10.1007/978-3-032-16719-4_16
PMID:42181748
|
研究论文 | 提出一种基于自编码器的去噪框架，用于从空间转录组学数据中估计细胞信号，并通过网络邻接矩阵去噪和细胞信号估计两个组件进行验证 | 首次将神经网络应用于空间转录组学数据中基于网络的细胞信号估计，并系统比较了自编码器与奇异值分解在不同图模型下的去噪性能 | 未提及 | 开发一种去噪框架以改善从空间转录组学数据中估计细胞信号的准确性 | 空间转录组学数据中的网络邻接矩阵和细胞信号相互作用 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学 | 自编码器 | 网络数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 3693 | 2026-05-27 |
Identification and validation of a seven-gene metastasis-associated prognostic model in breast cancer
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1770418
PMID:42186460
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研究论文 | 基于转移相关差异表达基因构建并验证了乳腺癌七基因预后模型，并发现了新的潜在治疗靶点 | 识别了两个此前未被充分研究的基因（RTN1和TLR10）作为肿瘤进展的潜在新驱动因子，并利用单细胞转录组学揭示了其细胞类型特异性表达模式 | 未在摘要中明确说明局限性 | 构建基于转移和癌症相关差异表达基因的预后特征，并识别潜在的新型治疗基因 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型, LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA-BRCA、AURORA US Network、SCAN-B和GEO数据库的多组数据集 | 未在摘要中明确提及 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未在摘要中明确提及 | 未在摘要中明确提及 |
| 3694 | 2026-05-25 |
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2650234
PMID:41913413
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研究论文 | 通过整合肿瘤和免疫细胞转录组学预测转移性黑色素瘤对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 使用单细胞RNA测序指导的免疫解卷积方法，识别出四种免疫细胞亚群作为耐药预后指标，并构建了82基因转录组特征签名 | 样本量较小（46例发现队列和54例验证队列），且液态活检仅用于8例患者的scRNA-seq分析 | 基于新型基因表达特征预测免疫检查点抑制剂原发性耐药的生物标志物 | 转移性皮肤黑色素瘤患者治疗前的肿瘤微环境转录组和外周血单核细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 46例发现队列FFPE RNA-seq样本，54例独立验证队列样本，8例scRNA-seq液态活检样本，46例流式细胞术样本 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 3695 | 2026-05-25 |
Decoding the gut microbiota metabolite-matrix metalloproteinase-3 axis in breast cancer: a multi-omics and network pharmacology study
2026-Jun, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-025-11351-y
PMID:40946247
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研究论文 | 采用多组学整合框架，结合网络药理学、机器学习、SHAP分析和单细胞RNA测序，系统研究肠道菌群代谢产物与基质金属蛋白酶-3（MMP3）在乳腺癌中的相互作用 | 首次整合网络药理学、机器学习与单细胞测序揭示肠道菌群代谢物-MMP3轴在乳腺癌中的作用，发现8种无毒菌群代谢物具有靶向MMP3的治疗潜力 | 结果基于计算分析和数据库验证，尚未进行体外和体内实验验证，缺乏临床样本的直接证据 | 探索肠道菌群代谢产物与乳腺癌相关靶点（尤其是MMP3）的相互作用机制 | 乳腺癌相关的肠道菌群代谢产物及其靶点MMP3 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 网络药理学, 分子对接, 孟德尔随机化 | 机器学习模型（SHAP分析） | 基因表达数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3696 | 2026-05-25 |
ANP32E drives lung adenocarcinoma progression via GSK3β-mediated glycolytic reprogramming
2026-Apr-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08712-2
PMID:41980942
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研究论文 | 发现ANP32E通过KDM3B/EGFR介导的GSK3β失活促进肺腺癌糖酵解重编程和进展 | 首次揭示ANP32E通过表观遗传-代谢串扰调控肺腺癌进展的机制，并筛选出靶向ANP32E的化合物PGG | 未提及临床验证PGG在人体中的疗效和安全性 | 探究ANP32E在肺腺癌进展中的表观遗传-代谢调控机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌细胞系A549/H1975和异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 多重组学分析 | NA | 基因表达数据 | TCGA和临床样本分析，具体数量未提及 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina Novaseq (推断) | NA |
| 3697 | 2026-05-25 |
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.047
PMID:41445186
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研究论文 | 开发了一种通过基因工程造血干细胞在胸腺中持续生成CAR-T细胞的平台，并利用诱导型基因表达克服胸腺负选择 | 首次利用胸腺微环境持续生成CAR-T细胞，并通过诱导型基因表达系统绕过中枢耐受，实现自体更新的CAR-T细胞疗法 | NA | 解决CAR-T细胞体内持久性有限和肿瘤复发问题，开发可持续生成CAR-T细胞的平台 | 造血干细胞和祖细胞、CAR-T细胞、胸腺微环境 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3698 | 2026-05-25 |
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2026-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02339-4
PMID:41457181
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研究论文 | 通过多模态分子与空间分析，发现NNT作为肥胖相关结直肠癌的预后生物标志物 | 首次整合转录组数据、临床验证和空间转录组学揭示NNT在肥胖相关结直肠癌中的预后价值及其肿瘤微环境特征 | 未提及明确局限性 | 识别反映肥胖相关肿瘤特征并分层患者预后的分子生物标志物 | 肥胖相关结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 免疫组化, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | TCGA-COADREAD数据集及独立队列 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析系统 |
| 3699 | 2026-05-25 |
Oxidative stress reprograms benign prostatic hyperplasia microenvironments: insights from integrative multi-omics and machine learning
2026-04-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08055-8
PMID:41923163
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研究论文 | 整合多组学和机器学习方法，揭示氧化应激在良性前列腺增生微环境中的重编程作用 | 首次通过整合多组学和机器学习构建氧化应激相关诊断模型，并结合单细胞转录组、空间转录组及体内外实验验证ACOX2等关键基因在BPH中的功能 | 样本量较小（12个BPH样本，16个对照），研究结论应视为假设生成性质，需在更大规模独立人群中验证 | 识别与氧化应激相关的良性前列腺增生生物标志物，并刻画氧化应激相关的基质细胞状态 | 良性前列腺增生患者的组织样本及前列腺基质细胞系WPMY-1 | 机器学习和数字病理学 | 前列腺增生 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 流式细胞术, RT-qPCR, western blot, 免疫组化 | WGCNA, 四种机器学习算法（逻辑回归、随机森林、支持向量机、XGBoost）, 一致性聚类 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 实验数据 | 28个组织样本（12 BPH, 16 对照）; 124,616个单细胞; 细胞系实验（WPMY-1） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组, Illumina NovaSeq批量转录组测序 |
| 3700 | 2026-05-25 |
AI-guided multi-omics analysis identifies NPC1-modulated susceptibility to SARS-CoV-2 infection under PM2.5 exposure
2026-Mar-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71196-3
PMID:41912520
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研究论文 | 研究利用AI引导的多组学分析，鉴定NPC1调节PM2.5暴露下SARS-CoV-2感染易感性的分子机制 | 首次通过微调的单细胞转录组基础模型整合PM暴露与SARS-CoV-2感染共享转录特征，并结合流行病学、GWAS和功能基因组学揭示NPC1调节的内体-溶酶体通路污染相关易感性机制 | NA | 阐明空气细颗粒物暴露增加SARS-CoV-2感染风险的分子机制 | SARS-CoV-2感染易感性、PM2.5暴露、NPC1基因调控 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、全基因组关联研究、功能基因组学 | 基础模型 | 转录组数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |