本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3661 | 2025-10-06 |
A Prognostic Lysine Crotonylation Signature Shapes the Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于巴豆酰化相关基因的预后特征模型,用于肝细胞癌的风险分层和免疫微环境分析 | 首次构建了肝细胞癌中巴豆酰化相关基因的预后特征模型,揭示了其在肿瘤免疫微环境塑造中的新作用 | 需要标准化的巴豆酰化测量方法,需在不同病因的肝细胞癌中进行验证,需机制和纵向研究确认因果关系 | 探讨巴豆酰化相关基因在肝细胞癌中的预后价值和治疗相关性 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞测序,Cox回归,LASSO回归,CIBERSORT,OncoPredict | 风险评分模型,列线图 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3662 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Molecular Mechanisms of Neutrophil Dysfunction in Chronic Bone Infection
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了慢性骨感染中中性粒细胞功能障碍的分子机制 | 首次在MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中,通过单细胞RNA测序识别出7个中性粒细胞亚群,并发现NeuP2ry10亚群变化最显著,揭示了中性粒细胞向N2抗炎表型极化的分子特征 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性有待验证;单细胞测序样本量可能有限 | 探究慢性骨感染中中性粒细胞功能异常的分子机制 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序,基因本体论分析,通路富集分析,免疫荧光染色,活性氧定量 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3663 | 2026-01-09 |
Molecular Docking and Single-Cell RNA-Seq Analysis Identify PTGS2 as a Key Target of Osthole in the Oral Squamous Cell Carcinoma Microenvironment
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过分子对接和单细胞RNA-seq分析,鉴定PTGS2为蛇床子素在口腔鳞状细胞癌微环境中的关键靶点 | 首次结合分子对接和单细胞RNA-seq技术,系统性地揭示了蛇床子素通过靶向PTGS2调控OSCC微环境的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的直接功能验证 | 探究蛇床子素在口腔鳞状细胞癌中的治疗作用及其分子机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 计算生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 分子对接, 差异表达分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | 列线图(nomogram) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3664 | 2026-03-03 |
Uncovering potential molecular biomarkers for cancer-associated secondary lymphedema through integrated analyses of RNA-sequencing, machine learning, and clinical data
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1760040
PMID:41768256
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA测序、机器学习和临床数据分析,揭示了癌症相关继发性淋巴水肿的潜在分子生物标志物 | 首次结合RNA测序、多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据,识别出IL2RG、HOXD10和TSPAN1作为CASL的新型潜在分子标志物,并深入探讨了其与免疫细胞浸润及临床参数的关联 | 样本量相对较小(10例正常对照和40例CASL患者),且研究主要基于脂肪组织,可能无法全面反映CASL在其他组织中的分子机制 | 探索癌症相关继发性淋巴水肿的分子机制,并寻找其诊断和治疗的潜在生物标志物 | 脂肪组织样本(来自正常对照和CASL患者) | 机器学习 | 癌症相关继发性淋巴水肿 | RNA测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR | 多种机器学习算法(包括SHAP解释性分析) | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 50例(10例正常对照,40例CASL患者) | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3665 | 2026-07-25 |
Single-cell and spatial multi-omics reveal estrogen-mediated vaginal wall microenvironment remodeling and a perivascular reparative niche in postmenopausal pelvic organ prolapse
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1794699
PMID:42490977
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3666 | 2026-07-25 |
A mitoxyperilysis-related signature stratifies prognosis and identifies an aggressive colorectal cancer ecosystem with immune remodeling
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1851988
PMID:42491158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3667 | 2026-07-25 |
TREM1 unleashes immunosuppression in glioma: targeting macrophage polarization as a new therapeutic vulnerability
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1871988
PMID:42491234
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3668 | 2026-07-25 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal an aging-associated fibroblast subtype linked to tumor progression in human skin
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1800947
PMID:42494450
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3669 | 2026-07-25 |
Triptolide targets JUN to reverse cisplatin resistance of ovarian cancer: insights from single-cell transcriptome analysis and machine learning validation
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1850438
PMID:42494522
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3670 | 2026-07-25 |
Plasticizers and prostate cancer: unraveling the link through network toxicology and machine learning
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1768691
PMID:42494595
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3671 | 2026-07-25 |
Ubiquitination modifications as central regulators of metabolic dysfunction in type 2 diabetes mellitus
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1802982
PMID:42494871
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3672 | 2026-07-25 |
Twenty-year persistence of WT1-specific cytotoxic T lymphocytes in peritumoral brain tissue by peptide vaccine therapy: Transcriptomic evidence for resident memory T-cell induction
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdag176
PMID:42494995
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3673 | 2026-07-25 |
Immunotherapy for tuberculosis: emerging modalities, cross-disciplinary innovations, and roadmaps for drug-resistant disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1873405
PMID:42495612
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3674 | 2026-07-25 |
Heterogeneity and plasticity of tumor-associated macrophages in oral squamous cell carcinoma: implications for diagnosis and tumor microenvironment characterization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1864227
PMID:42495621
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3675 | 2026-07-25 |
Macrophages in MASLD: from inflammatory and metabolic crosstalk to exercise intervention
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1894884
PMID:42495624
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3676 | 2026-07-25 |
Uncovering the pivotal role of MYO6 in myocardial infarction: a multimodally validated diagnostic biomarker and immunotherapeutic target
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1797028
PMID:42495634
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3677 | 2026-07-25 |
Decoding early lung adenocarcinoma progression by single-cell and spatial transcriptomics reveals a CMA-related prognostic signature
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1875096
PMID:42495647
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3678 | 2026-07-25 |
Reduced CH25H expression defines a high membrane fluidity, trogocytosis active state in colon cancer stem cells
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1834358
PMID:42495718
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3679 | 2026-07-23 |
Clonal analysis for understanding fate biases in developing embryos
2026-Aug, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102475
PMID:42025228
|
综述 | 回顾了结合谱系追踪与单细胞转录组学在理解胚胎发育中命运偏差方面的前沿实验和计算方法 | 重点强调了新兴的空间和基于扰动的克隆生物学策略,这些策略有望揭示发育稳健性的机制 | 未明确提及,但作为综述,可能缺乏原创新发现 | 总结当前结合谱系追踪与单细胞转录组学在研究胚胎发育命运偏差方面的前沿方法 | 发育胚胎中的多能祖细胞及其克隆多样性 | 机器学习 | NA | 谱系追踪, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3680 | 2026-07-23 |
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026 Jul-Aug, Mycologia
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/00275514.2026.2631200
PMID:41871174
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学描述来自阿拉斯加湾的一种新海洋寄生虫罗兹菌及其分布特征 | 首次基于238个基因的系统发育分析确认一种新的罗兹菌分离株在罗兹菌门中的独特分类地位,并提出将其建立为新属 | 未明确提及局限性,但依赖于metaPR数据库的ASV分布数据可能受限于现有采样覆盖度 | 揭示海洋寄生虫罗兹菌门的多样性、分布和生态作用 | 从阿拉斯加湾分离的新罗兹菌分离株及硅藻宿主 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞转录组学, 系统发育分析 | 不适用 | 转录组数据, 宏条形码序列数据 | 1个分离株及多个环境样本(来自metaPR数据库) | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |