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当前共找到 7641 篇文献，本页显示第 3641 - 3660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3641 | 2026-05-28 |
Integrating single-cell transcriptomics and epigenetics in a multi-omics MR framework identifies PARK7 as a causal gene in streptococcal septicemia
2026-Apr-05, Epigenetics & chromatin
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s13072-026-00673-2
PMID:41937214
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3642 | 2026-04-06 |
Integration of machine learning-based screening approaches and single-cell sequencing technique to identify cancer stemness genes associated with radiotherapy resistance in lung adenocarcinoma
2026-Apr-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04873-w
PMID:41934581
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3643 | 2026-05-28 |
Helicobacter pylori-linked gene CFAP73 rewires epithelial programs and shapes the gastric cancer microenvironment
2026-Apr-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04891-8
PMID:41934579
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研究论文 | 该研究揭示了HP感染相关基因CFAP73通过重编程上皮程序并塑造胃癌微环境，促进肿瘤抑制和免疫激活的作用 | 首次发现CFAP73作为HP感染过程中进行性下调的肿瘤保护基因，并明确其通过抑制增殖、EMT和激活p53/凋亡通路来维持上皮抑癌状态，同时通过配体-受体分析和空间转录组学揭示其重塑纤维细胞和T细胞状态以维持抗肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要基于公共数据库和体外/体内实验，尚需更大规模的前瞻性队列验证CFAP73作为生物标志物的临床价值，且CFAP73在HP感染早期下调的具体分子机制有待进一步阐明 | 探究胃上皮细胞在HP感染过程中逐渐紊乱的分子程序，并寻找与恶性转化相关的关键基因 | HP感染相关的胃黏膜上皮细胞和胃癌微环境中的免疫细胞、成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | 随机森林 | 文本 | 多个公共数据集（GSE60662、GSE60427、TCGA-STAD）及单细胞RNA-seq数据集GSE249874 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3644 | 2026-05-28 |
Cell neighborhood topology directs rare cell population identification
2026-Mar-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71180-x
PMID:41912521
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研究论文 | 介绍了一种名为RareQ的快速可扩展框架，通过评估单细胞组学数据中每个细胞的k近邻团度来检测罕见细胞群 | 提出基于细胞邻域拓扑结构的团度评估方法，能同时识别模态特异性和共享罕见细胞，并在模拟和真实数据集上展现卓越的准确性、灵敏度和效率 | NA（摘要未提及局限性） | 开发高效方法识别复杂生物系统中关键但低丰度的罕见细胞群 | 模拟和真实单细胞组学数据，包括空间转录组学数据 | 单细胞组学 | NA（摘要未指定具体疾病） | 单细胞组学技术（包括空间转录组学） | 图论中的团度分析 | 单细胞组学数据（包括空间转录组数据） | NA（摘要未提及具体样本量） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3645 | 2026-05-28 |
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2026-Mar-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117144
PMID:41875135
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示1型糖尿病胰腺和局部引流淋巴结组织中的淋巴毒素β特征 | 首次通过多细胞分辨率空间转录组学在人类1型糖尿病中识别出淋巴结滤泡和胰岛炎病变中的LTB上调及下游趋化因子特征 | 未提及，样本量可能有限 | 探索1型糖尿病自然病程中胰腺和胰腺淋巴结的炎症反应 | 无糖尿病个体、自身抗体阳性风险个体及1型糖尿病供体的胰腺和胰腺淋巴结组织 | 空间转录组学 | 1型糖尿病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多例供体组织样本（无糖尿病、自身抗体阳性及1型糖尿病供体） | NA | 空间转录组学 | NA | 多细胞分辨率空间转录组平台及正交亚细胞分辨率空间转录组平台 |
| 3646 | 2026-05-28 |
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2026-Mar-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117103
PMID:41865369
|
研究论文 | 利用单核多组学测序技术，研究人类记忆CD4+ T细胞快速回忆的基因调控网络决定因素 | 通过单核多组学测序同时分析基因表达和染色质可及性，首次重建了CD4 T细胞动态激活过程中的基因调控网络，并识别出五个与记忆相关的转录因子（MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3和KLF6）可能调控快速回忆过程 | 转录因子与靶基因的结合预测需要进一步通过ChIP-seq验证，且记忆相关转录因子活性在独立单细胞RNA测序研究中的复制仍需更多验证 | 阐明记忆CD4+ T细胞快速回忆的基因调控机制，以及这些机制在免疫介导疾病遗传风险中的作用 | 人类CD4+ T细胞的记忆和初始亚群及其快速回忆反应 | 机器学习 | 免疫介导疾病 | 单核多组学测序（基因表达和染色质可及性）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、全基因组关联研究（GWAS） | 基因调控网络 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | NA | 10x Genomics | 单核多组学 | 10x Chromium | 单核多组学测序同时分析基因表达和染色质可及性 |
| 3647 | 2026-05-28 |
Molecular subtypes in pancreatic cancer: from academic promise to clinical reality
2026-Mar-09, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02614-9
PMID:41796340
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综述 | 总结胰腺导管腺癌分子亚型的研究进展，并探讨其从学术概念向临床应用转化的关键障碍与可行路径 | 整合多组学、单细胞RNA测序和空间转录组学的最新发现，提出以GATA6免疫组化检测为核心的简化临床实施路线图，强调治疗诱导分子可塑性的影响 | 部分亚型分类标准仍存在争议，治疗过程中分子亚型的动态变化增加了生物标志物的不可靠性，临床验证样本有限 | 综述胰腺癌分子亚型的研究现状，分析转化障碍，并提出走向临床的实用策略 | 胰腺导管腺癌及其分子亚型（经典/祖细胞型、基底样/鳞状型） | 自然语言处理 | 胰腺癌 | 转录组学分析，免疫组化，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 3648 | 2026-05-28 |
Engineering Tregs-mediated immune tolerance via foxp3a overexpression to evade allograft transplantation barriers in zebrafish
2026-Mar-02, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.024
PMID:41780749
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研究论文 | 通过过表达foxp3a工程化Treg介导的免疫耐受，实现斑马鱼异体移植屏障的规避 | 首次在斑马鱼中通过全身过表达Foxp3a构建Tg(CMV:foxp3a)品系，利用单细胞RNA测序揭示免疫景观重塑，并成功加速性腺移植和生殖系干细胞移植，提供了一种基于Treg的免疫缺陷宿主替代方案 | 研究主要集中于斑马鱼模型，其免疫系统与哺乳动物存在差异，可能限制向哺乳动物移植应用的直接转化；另外，foxp3a过表达的长期安全性及潜在副作用未充分探讨 | 开发一种基于Treg的实用策略，通过foxp3a过表达诱导免疫耐受，以替代免疫缺陷宿主，用于斑马鱼的基因组操作和移植 | 斑马鱼（Danio rerio）的Tg(CMV:foxp3a)品系及其体内免疫细胞效应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼样品（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3649 | 2026-05-28 |
Hypoxia-activated scleraxis a mediates epicardial progenitor differentiation into a unique cardiac perivascular cell type
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.26.708296
PMID:42124670
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研究论文 | 通过单细胞转录组学、遗传谱系追踪和心脏损伤模型，发现缺氧激活的Scleraxis a介导心外膜祖细胞分化为一种独特的心脏血管周围细胞类型，并揭示了Scxa-Col18a1a轴在冠状动脉血管发育和再生中的作用 | 首次鉴定Scleraxis a作为心外膜祖细胞分化的关键调控因子，发现其响应缺氧/Hif1a信号并驱动心外膜细胞向血管支持性命运分化，定义了一类新的心外膜源性血管周围间充质细胞（Epi-PMCs） | 研究主要基于斑马鱼模型，其发现向哺乳动物或人类心脏的转化仍需进一步验证 | 阐明心外膜祖细胞命运决定的分子机制，特别是缺氧信号在冠状动脉血管发育和心脏再生中的作用 | 斑马鱼心脏发育和再生过程中的心外膜祖细胞及其分化产物 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、遗传谱系追踪、心脏损伤模型 | NA | 基因表达数据、图像 | 斑马鱼胚胎和成体心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3650 | 2026-05-28 |
Predictable clonal hierarchies from restricted progenitors provide a framework for cell type-specific therapies in glioblastoma
2026-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.21.707071
PMID:42124710
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研究论文 | 通过整合高通量组合DNA条形码与单细胞转录组学，研究胶质母细胞瘤中克隆层级组织及其对细胞类型特异性治疗的影响 | 首次在人类肿瘤微环境中实现谱系分辨的前体细胞组织映射，揭示多前体细胞群体而非单一主导群体驱动肿瘤生长，并基于此提出层级指导的联合治疗策略 | NA | 解析胶质母细胞瘤中细胞谱系随时间组织的动态机制，为细胞类型特异性联合治疗提供框架 | 来自9名IDH1野生型胶质母细胞瘤患者的235,155个恶性细胞 | 机器学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学、组合DNA条形码 | NA | 单细胞转录组数据 | 9个肿瘤样本，共235,155个恶性细胞 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序，Illumina NovaSeq测序平台 |
| 3651 | 2026-05-28 |
Local Tumor Microenvironment Niches Correlate With Survival And Immunotherapy Response In Human Glioblastoma
2026-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.23.707276
PMID:42124719
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研究论文 | 整合空间转录组学、单细胞RNA测序和组织学数据，对25个胶质母细胞瘤肿瘤的微环境进行空间解析，发现六种独特的TME生态位，其组成与患者生存和免疫治疗反应显著相关 | 首次通过空间转录组学与单细胞RNA-seq结合，系统描绘胶质母细胞瘤肿瘤微环境的六种空间生态位，并揭示其与患者生存和PD-1抑制剂治疗反应的临床关联 | 样本量有限（25个肿瘤），需更大队列验证；生态位分类基于空间转录组学斑点分辨率，可能遗漏亚细胞层面细节；免疫治疗反应数据来自外部公开数据集，缺乏前瞻性验证 | 解析胶质母细胞瘤肿瘤微环境的空间异质性，并评估其与患者生存和免疫治疗反应的关系 | 25个胶质母细胞瘤肿瘤组织的空间转录组学、单细胞RNA-seq和组织学数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学， 单细胞RNA测序， 组织学分析 | NA | 空间转录组学数据， 单细胞RNA-seq数据， 组织学图像， 批量RNA-seq数据 | 25个胶质母细胞瘤肿瘤，超过46,000个55微米宽的斑点 | NA | 空间转录组学， 单细胞RNA测序， 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3652 | 2026-05-28 |
Single-cell characterization of trophoblast-epithelial interactions at the human maternal-fetal interface during early implantation†
2026-02-18, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf246
PMID:41189328
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研究论文 | 利用输卵管异位妊娠患者的单细胞RNA测序数据构建胚胎着床模型，研究早期妊娠过程中母胎界面的滋养层-上皮细胞互作 | 首次利用输卵管异位妊娠模型作为替代工具，结合公共数据库中正常宫内妊娠数据，系统解析了早期着床过程中滋养层细胞与上皮细胞的双向配体-受体通讯网络 | 基于异位妊娠模型推断正常着床机制可能存在局限性，且缺乏体内直接验证；研究依赖公共数据库数据，样本量和异质性可能影响结论的普适性 | 阐明人早期胚胎着床过程中母胎界面的细胞互作分子机制 | 输卵管异位妊娠和正常宫内妊娠的着床部位组织样本 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3653 | 2026-05-28 |
Recent advances in reproductive biology: European innovations in embryo development and research†
2026-02-18, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf245
PMID:41206649
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综述 | 欧洲在生殖生物学和胚胎学领域的创新进展综述 | 总结了欧洲在辅助生殖技术、高通量单细胞RNA测序和合成胚胎模型方面的前沿贡献，揭示了胚胎发育中保守和物种特异性分子途径 | 实现可重复性和更稳健的植入模型方面仍存在挑战 | 综述欧洲在生殖生物学和胚胎学领域的研究进展及未来方向 | 人类和动物的胚胎发育、辅助生殖技术及合成胚胎模型 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3654 | 2026-05-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf295
PMID:41182312
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示芳烃受体激活通过多种途径减轻急性呼吸窘迫综合征的机制 | 首次利用单细胞RNA测序全面揭示芳烃受体激活在急性呼吸窘迫综合征中对多种肺免疫和上皮细胞类型的影响及其分子机制 | 仅在小鼠模型中验证，且使用强效配体TCDD，其临床转化性及潜在毒性需进一步评估 | 探究芳烃受体激活对脂多糖诱导的急性呼吸窘迫综合征小鼠模型的保护作用及细胞机制 | 脂多糖诱导的急性呼吸窘迫综合征小鼠模型中的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3655 | 2026-05-28 |
SCALE: unsupervised multiscale domain identification in spatial omics data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1456
PMID:41495880
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研究论文 | 提出一种无监督多尺度空间域识别算法SCALE，用于空间组学数据中功能域的分层检测 | 首次将深度学习图表示学习与熵基搜索算法结合，实现无需预先指定尺度的空间域层次化识别 | 未明确提及局限性，但算法性能可能受数据稀疏性和组织类型差异影响 | 开发能够自动识别空间转录组数据中多尺度功能域的计算方法 | 模拟数据及小鼠脑组织（Xenium和MERFISH平台）与患者肾组织样本 | 计算生物学, 深度学习 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络（GNN） | 空间基因表达数据 | 模拟数据、小鼠脑组织及患者肾组织样本（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | Xenium, MERFISH | Xenium平台和MERFISH平台用于小鼠脑组织空间转录组数据采集 |
| 3656 | 2026-05-27 |
Granulocyte heterogeneity in immune-mediated and inflammatory diseases: Insights from single-cell transcriptomic analyses
2026-May-26, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxag026
PMID:42186818
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综述 | 通过单细胞转录组分析揭示免疫介导和炎症性疾病中粒细胞异质性的最新进展与当前局限 | 利用单细胞RNA测序技术突破传统分类，定义基于转录组的粒细胞亚群，揭示多种疾病中粒细胞的异质性，并探讨临床相关生物标志物和靶向治疗策略的开发 | 疾病相关粒细胞群体在疾病病理生理学中的因果作用尚不明确，缺乏实验验证功能和临床适用的替代标志物 | 总结免疫介导和炎症性疾病中粒细胞异质性的研究进展与局限，讨论整合性单细胞方法如何支持临床生物标志物和靶向治疗策略的开发 | 粒细胞（中性粒细胞和嗜酸性粒细胞）及其在各种疾病中的异质性 | 单细胞转录组学 | 免疫介导和炎症性疾病（如微观多血管炎、COVID-19、败血症、心血管疾病、过敏性疾病） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3657 | 2026-05-27 |
Toward simultaneous pseudo-space reconstruction and cell-type deconvolution of single-cell spatial transcriptome using SpaDicer
2026-May-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101465
PMID:42184831
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科研论文 | 介绍SpaDicer，一个统一伪空间重建和细胞类型反卷积的单细胞空间转录组端到端深度学习框架 | 通过跨域特征解耦提取细胞身份和空间定位的域不变特征，并采用自适应损失加权策略协调多个目标任务 | 未明确提及局限性 | 桥接单细胞RNA测序和空间转录组之间的差距，同时实现单细胞伪空间重建和空间点位细胞类型反卷积 | 模拟数据集和五个真实人类组织样本 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 两个模拟数据集和五个真实人类组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 3658 | 2026-05-27 |
CNet-Cox for interpretable network biomarker discovery and survival risk scoring in precise breast cancer prognosis
2026-May-25, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-026-02756-6
PMID:42185445
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研究论文 | 提出CNet-Cox框架，一种结合先验网络连接性的正则化Cox比例风险模型，用于在乳腺癌预后中识别具有生物学可解释性的网络生物标志物并进行生存风险评分 | 将基因共定位关系整合到稀疏特征选择中，发现连接性预后模块，提高了生物标志物的可解释性和临床转化潜力 | 仅在乳腺癌数据集上验证，虽声称可扩展至其他疾病，但缺乏多疾病泛化性评估 | 开发一种疾病无关的网络感知生存模型，用于系统性发现连接生物标志物并实现可解释的风险预测 | 乳腺癌患者的基因表达数据，包括发现数据集（TCGA，n=1080）、内部测试数据集、7个独立批量转录组数据集（GEO，n=1602）和空间转录组数据集（Visium，4992个点） | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 批量RNA-seq、空间转录组学 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | 发现数据集1080个样本，内部测试数据集若干（未具体说明），7个独立数据集共1602个样本，空间转录组数据集4992个点 | Illumina | 批量RNA-seq、空间转录组学 | Illumina NovaSeq、10x Visium | TCGA样本的批量RNA-seq（平台未具体说明）、空间转录组学使用10x Visium平台 |
| 3659 | 2026-05-27 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomic analyses to explore key lactylation-related genes in benign prostatic hyperplasia
2026-May-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-54516-x
PMID:42185567
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研究论文 | 整合单细胞和批量转录组分析，探究良性前列腺增生中关键乳酸化相关基因 | 首次在单细胞分辨率下描绘良性前列腺增生中乳酸化相关基因的活性图谱，并识别出ANXA2和IFI27作为关键候选基因，揭示了ANXA2与代谢和炎症之间的潜在联系 | 基于公开数据集和体外细胞实验，缺乏体内验证和更大样本量的确认 | 探究蛋白质乳酸化在良性前列腺增生发病机制中的作用及相关分子特征 | 良性前列腺增生组织与正常前列腺组织的单细胞和批量转录组数据，以及BPH-1细胞系 | 生物信息学 | 良性前列腺增生 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开数据集，具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3660 | 2026-05-27 |
Identifying potential ligand-receptor interactions by integrating LSTM network and the attention mechanism for cell-cell communication prediction
2026-May-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08033-0
PMID:42185831
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研究论文 | 提出CellAL框架，利用LSTM网络和注意力机制从蛋白质序列数据预测配体-受体相互作用，并结合单细胞RNA测序数据推断细胞间通讯 | 通过整合LSTM网络与注意力机制，直接基于蛋白质序列预测配体-受体相互作用，克服了对静态数据库的依赖，并能够捕获氨基酸的序列依赖性，从而发现新的信号对 | 未明确说明 | 开发一个稳健的计算框架，直接从蛋白质序列数据识别潜在配体-受体相互作用，克服对静态数据库的依赖，并发现新的信号对 | 配体-受体相互作用对、细胞间通讯网络 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | LSTM | 序列数据 | 四个标准配体-受体相互作用数据集和人类黑色素瘤单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |