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当前共找到 9459 篇文献，本页显示第 3641 - 3660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3641 | 2026-06-10 |
ArchVelo: archetypal velocity modeling for single-cell multi-omic trajectories
2026-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74000-4
PMID:42248920
|
研究论文 | ArchVelo是一个从配对单细胞染色质可及性和转录组数据推断细胞轨迹的计算框架 | 将染色质可及性表示为共享调控程序的“原型”（archetypes），模型调控对转录的动态影响 | 未提及 | 从静态单细胞数据推断细胞动态和基因调控轨迹 | 小鼠脑、人类造血、病毒感染的CD8 T细胞 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞多组学 | 原型速度模型 | 单细胞染色质可及性（scATAC-seq）和转录组（scRNA-seq）数据 | 小鼠脑、人类造血数据集及病毒感染的CD8 T细胞样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3642 | 2026-06-06 |
Inference of spatial chromatin accessibility via integration of spatial transcriptomics and single-cell multi-omics data
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73948-7
PMID:42243114
|
研究论文 | 提出了一个统一的计算方法ISON，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，推断空间染色质可及性 | ISON能够准确预测空间位点的染色质可及性图谱，并重建空间分辨的基因调控网络，且在时间和内存上具有可扩展性；其预测的染色质可及性可捕捉顺式和反式调控信息，并能估计位点水平的转录因子活性，区分同一家族内的转录因子，这是仅依靠染色质可及性数据的方法所不具备的特点 | 当前尚无商用试剂盒可同时进行空间多组学分析，阻碍了广泛数据生成 | 开发一种统一的计算方法，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，实现空间多组学分析 | 空间转录组数据和单细胞多组学数据（基因表达和染色质可及性） | 计算生物学、机器学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞多组学、空间转录组学、计算建模 | 深度学习模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 阿尔茨海默病数据（样本数量未在摘要中明确） | 不适用 | 空间转录组学、单细胞多组学（单细胞RNA-seq与单细胞ATAC-seq联合分析） | 不适用 | 不适用 |
| 3643 | 2026-06-03 |
Application of single-cell transcriptomic technology in cell fate determination of embryonic liver
2026-May-29, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-25-100
PMID:42227418
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综述 | 综述单细胞转录组技术在胚胎肝脏细胞命运决定中的应用，整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合和类器官建模的最新进展 | 提出细胞图谱构建、细胞间通讯分析、空间验证和类器官功能建模形成迭代循环的新范式，推动从描述性编目向机制解析的转变 | 未明确说明本综述的局限 | 总结单细胞转录组学在解析胚胎肝脏发育中细胞命运决定机制的研究进展，为先天性肝病、肿瘤分层和再生医学提供概念和方法基础 | 人及小鼠胚胎肝脏中的肝母细胞、肝细胞、胆管细胞、肝胆双能祖细胞、内皮细胞和星状细胞等非实质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 先天性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、类器官建模 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 | 人类和小鼠胚胎肝脏样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3644 | 2026-05-29 |
Thyroid-stimulating hormone receptor mediates peripheral-central neuroimmune crosstalk in autoimmune thyroid diseases
2026-May-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04957-y
PMID:42204533
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示促甲状腺激素受体在自身免疫性甲状腺疾病中介导外周-中枢神经免疫串扰的分子机制 | 首次从多组学层面系统证明TSHR作为分子枢纽连接外周与中枢神经免疫串扰，并鉴定出三种潜在的再利用化合物 | 样本量有限，缺乏纵向随访和体内验证，结果需谨慎解释并进一步研究 | 阐明促甲状腺激素受体如何连接外周自身免疫与中枢神经系统特征 | Graves病、Graves眼病患者及小鼠模型 | 自然语言处理 | 甲状腺疾病 | GWAS, RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 脑影像数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3645 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk analyses reveal ATF4-associated immune suppression and WNT/β-catenin signaling in osteosarcoma
2026-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00797-1
PMID:42204636
|
研究论文 | 整合单细胞和批量分析揭示骨肉瘤中ATF4相关的免疫抑制和WNT/β-catenin信号通路 | 首次通过整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，系统揭示ATF4在骨肉瘤中连接应激相关肿瘤程序、免疫抑制和WNT/β-catenin激活的关键作用，并构建了ATF/CREB相关风险评分（ACS）用于预后分层 | 主要依赖公开数据集进行生物信息学分析，缺乏大规模前瞻性临床验证；ATF4在骨肉瘤中的具体分子机制和调控网络仍需进一步实验验证 | 探究ATF/CREB应激反应网络（特别是ATF4）在骨肉瘤免疫抑制微环境和预后的作用机制 | 骨肉瘤（OS）肿瘤样本的单细胞RNA-seq和批量转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子动力学模拟 | NA | 单细胞基因表达数据, 批量转录组数据 | 多个公共数据集，包括TARGET和GEO队列，具体样本量未详细列出 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3646 | 2026-07-25 |
Investigation of the clinical value of artificial intelligence-derived prognostic signature in cervical cancer based on machine learning algorithms
2026-May-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05182-y
PMID:42201622
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3647 | 2026-07-25 |
Decoding lactylation heterogeneity in glioblastoma: machine learning identifies G6PC3 as a prognostic target
2026-May-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16225-6
PMID:42192326
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3648 | 2026-05-27 |
Explainable machine learning-guided integrated multiomics analysis reveals macrophage-driven immune suppression in breast cancer
2026-May-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73617-9
PMID:42185288
|
研究论文 | 本研究利用可解释机器学习管道整合多组学数据分析，揭示了巨噬细胞在乳腺癌中驱动的免疫抑制机制 | 创新性地结合可解释机器学习与多组学分析（包括成像质谱流式技术和单细胞RNA测序），发现了巨噬细胞浸润与乳腺癌复发风险及化疗反应的矛盾关联，并揭示了HLA-ABC+巨噬细胞通过特定配体-受体相互作用介导免疫抑制的新机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，巨噬细胞驱动免疫抑制的因果关系需进一步实验验证 | 解析乳腺肿瘤微环境中细胞组成与疾病进展及预后的关联，为改善治疗结局提供潜在靶点 | 乳腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞、调节性T细胞和耗竭性T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 可解释机器学习、成像质谱流式技术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞间通讯分析 | 可解释机器学习模型 | 基因表达数据、细胞分数数据、成像质谱流式数据、单细胞转录组数据 | 约5000份患者样本（来自METABRIC和TCGA数据集） | NA | 成像质谱流式技术、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3649 | 2026-07-25 |
Optimized nuclei isolation and snRNA-seq reveal oligodendrocyte pathway dysregulation in MOGHE brain tissue from pediatric patients
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-54112-z
PMID:42168328
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3650 | 2026-07-25 |
Single-cell multiomics gene regulatory landscape reveals impaired spermatogonial stem cells and macrophage-driven inflammaging during testicular aging
2026-May-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.005
PMID:42167485
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3651 | 2026-05-21 |
TNFAIP3 in M2 Macrophage Attenuates Subretinal Fibrosis in Laser-Induced Murine Model
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.25
PMID:42126158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3652 | 2026-03-16 |
The pro-cancer and immunosuppressive activity of macrophage-transformed cancer-associated fibroblasts in oral squamous cell carcinoma
2026-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.027
PMID:40684939
|
研究论文 | 本研究证实了口腔鳞状细胞癌中存在巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的细胞，并揭示了其通过CXCL10途径促进肿瘤进展和免疫抑制微环境的功能机制 | 首次在口腔鳞状细胞癌中系统证实了巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞的存在，并阐明了其通过TGFβ1/smad3通路转化及通过CXCL10促进髓源性抑制细胞归巢和功能的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类患者样本中的验证仍需进一步开展，且具体的信号通路细节和临床转化潜力有待深入探索 | 探究口腔鳞状细胞癌中巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞的起源、功能特征及其形成与发挥作用的分子机制 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞、肿瘤相关成纤维细胞、髓源性抑制细胞 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、假时间分析、体外诱导、体内肿瘤模型 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据、流式细胞数据 | 未明确具体样本数量，但使用了OSCC病理切片、OSCC同种异体移植肿瘤、皮下OSCC肿瘤模型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3653 | 2026-05-25 |
Spatial Transcriptomics of Early Tooth Morphogenesis in Formalin-fixed Paraffin-embedded Mouse Embryonic Tissue
2026-03-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70340
PMID:41911219
|
研究论文 | 描述了用于小鼠胚胎甲醛固定石蜡包埋组织的空间转录组学分析方案，以研究早期牙齿形态发生 | 优化了从收集、固定到石蜡包埋的完整工作流程，确保RNA完整性和组织形态，兼容多种空间转录组学平台 | NA | 建立可重复的空间转录组学分析方法，用于研究胚胎牙齿发育的分子机制 | 小鼠胚胎颅面组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3654 | 2026-03-31 |
CD70-Targeting CAR NK Cells Overcome BCMA Downregulation and Improve Survival in High-risk Multiple Myeloma Models
2026-03-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0130
PMID:41144785
|
研究论文 | 本研究证实CD70是高危多发性骨髓瘤的潜在治疗靶点，并开发了一种靶向CD70的CAR NK细胞疗法，在临床前模型中显示出显著疗效 | 首次系统性地将CD70确立为高危多发性骨髓瘤的治疗靶点，并开发了结合CD27和IL-15的CAR NK细胞疗法，该疗法在BCMA下调或缺失的模型中仍保持有效 | 研究主要基于临床前模型，其临床疗效需通过正在进行的I/II期临床试验进一步验证 | 探索CD70作为高危多发性骨髓瘤治疗靶点的潜力，并开发相应的CAR NK细胞免疫疗法 | 多发性骨髓瘤患者样本、CD70+多发性骨髓瘤细胞系及动物模型 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | CAR NK细胞、CAR T细胞 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、图像数据 | 两个多发性骨髓瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3655 | 2026-03-31 |
Composition and Functional State of T and NK Cells in the Extramedullary Myeloma Tumor Microenvironment
2026-03-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0170
PMID:41236394
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和空间转录组学，揭示了髓外多发性骨髓瘤（EMM）肿瘤微环境（TME）中T细胞和NK细胞的组成和功能状态，并与骨髓多发性骨髓瘤（BM）进行了比较 | 首次系统性地描述了EMM TME中T和NK细胞的组成和功能状态，并发现了与BM相比的显著差异，如效应细胞与肿瘤细胞比例降低、CD4+ T细胞减少以及调节性CD16- NK细胞比例增加 | 研究样本量未明确说明，可能限制了结果的普遍性；且仅关注了T和NK细胞，未全面分析其他免疫细胞类型 | 探究EMM TME中免疫细胞的组成和功能状态，以理解其与治疗抵抗和生存期缩短的关联 | 髓外多发性骨髓瘤（EMM）肿瘤微环境中的T细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3656 | 2026-05-21 |
Longitudinal Profiling of Tumor and Immune Compartments Uncovers Patterns of Dysregulation and Associations with Response in Multiple Myeloma
2026-03-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0205
PMID:41364805
|
研究论文 | 通过对多发性骨髓瘤患者的纵向多组学分析，揭示了肿瘤与免疫微环境的动态相互作用及其与治疗反应的相关性 | 首次在纵向队列中整合单细胞RNA测序和批量测序数据，系统描绘多发性骨髓瘤免疫微环境的动态变化，并识别幼稚B细胞重建作为持久治疗反应的生物标志物 | 未详细阐述样本异质性或验证队列的局限性，可能限制结论的普适性 | 探究多发性骨髓瘤中治疗反应与疾病进展的免疫相关因素 | 102例多发性骨髓瘤患者的243份骨髓样本，包含631,226个细胞 | 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤 | RNA-seq、全基因组测序、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、基因组序列数据 | 102名患者的243份骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq、全基因组测序 | NA | NA |
| 3657 | 2026-02-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Revealed the Interplay Between Intratumoral Heterogeneity and the Tumor Microenvironment in Breast Cancer
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71600
PMID:41635010
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，揭示了乳腺癌中肿瘤内异质性与肿瘤微环境之间的相互作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，系统分析了不同乳腺癌分子亚型中细胞间通讯网络，并识别出与预后相关的关键信号通路 | 研究依赖于公共数据库数据，可能受样本来源和技术平台差异的影响，且未进行实验验证 | 研究乳腺癌分子亚型中肿瘤微环境内差异信号通路及其与临床预后的关联 | 乳腺癌样本中的上皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | SingleR, Monocle, CellChat | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3658 | 2026-02-16 |
Colorectal Cancer Organoid Model Reveals the Mechanisms of Irinotecan Resistance at Single-Cell Resolution
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71550
PMID:41678386
|
研究论文 | 本研究结合患者来源类器官模型和单细胞转录组学技术，系统揭示了结直肠癌对伊立替康耐药的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下，通过患者来源类器官模型结合单细胞RNA测序，鉴定了伊立替康耐药的关键细胞亚群及其分子特征 | 研究样本量相对较小，仅基于两名患者（CRC5和CRC11）的类器官模型，需要更大规模的队列验证 | 阐明结直肠癌对伊立替康耐药的分子机制 | 结直肠癌患者来源的类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 2名结直肠癌患者（CRC5耐药，CRC11敏感）的类器官模型，共12,360个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3659 | 2026-02-05 |
Advances and challenges in single-cell RNA sequencing data analysis: a comprehensive review
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf723
PMID:41619215
|
综述 | 本文全面回顾了单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战，包括预处理、注释工具和多模态整合等计算策略 | 综述了新兴的计算策略，如SCTransform和Harmony用于预处理与批次整合，基于transformer的注释工具scGPT和CellTypist，以及多模态整合方法，并提出了促进临床应用的路线图 | 临床转化仍受数据稀疏性、批次效应和缺乏标准化基准等挑战限制，且存在罕见患者来源克隆再识别的伦理风险 | 回顾单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战，并促进其临床转化 | 单细胞RNA测序数据及其分析计算策略 | 自然语言处理 | 胶质母细胞瘤, 严重COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | transformer, scGPT, CellTypist, scANVI | 基因表达数据, 空间转录组数据, 表观遗传数据 | 超过100,000个细胞的队列, 预训练模型使用3,300万个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 3660 | 2024-09-19 |
Foam Cells: The Origin of Formation and Target for Plant-derived Bioactive Compounds
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
综述 | 本文综述了泡沫细胞的形成来源及其作为植物来源生物活性化合物靶点的研究进展 | 本文探讨了植物来源的生物活性成分对泡沫细胞形成的抑制作用，并提出了基于细胞靶点的治疗策略 | NA | 探讨泡沫细胞的形成机制及其作为治疗动脉粥样硬化的潜在靶点 | 泡沫细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |