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当前共找到 3608 篇文献，本页显示第 3441 - 3460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3441 | 2026-01-03 |
Tumor-Derived CXCL10 and CCL20 Polarize the Immune Microenvironment in Nasopharyngeal Carcinoma via Competitive Recruitment of Effector T Cells and Tregs
2026, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.116010
PMID:41399390
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和临床样本验证，揭示了鼻咽癌中肿瘤来源的CXCL10和CCL20通过竞争性招募效应T细胞和调节性T细胞来极化肿瘤免疫微环境的机制 | 首次在鼻咽癌中系统阐明了肿瘤来源的CXCL10和CCL20对免疫微环境的竞争性极化作用，并揭示了其通过不同恶性上皮亚群分泌产生拮抗功能的机制 | 研究主要基于观察性数据和体外/体内模型验证，尚未在临床治疗中进行直接干预验证 | 探究鼻咽癌肿瘤免疫微环境的形成机制及其对预后的影响 | 鼻咽癌组织样本和患者临床数据 | 单细胞组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析，体外趋化实验，体内异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据，免疫组化数据 | 109例原发性患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3442 | 2026-01-03 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal P4HA2-mediated radiotherapy resistance mechanisms in breast cancer
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.121257
PMID:41424847
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了P4HA2介导的乳腺癌放疗抵抗机制 | 整合了单细胞转录组、空间转录组、机器学习（SuperPC和StepCox）和孟德尔随机化分析，构建了名为SSRR的预后模型，并首次系统性地将P4HA2鉴定为乳腺癌放疗抵抗的关键分子和潜在治疗靶点 | 研究主要基于公共队列数据（TCGA-BRCA和GSE120798），需要进一步的前瞻性临床队列验证 | 阐明乳腺癌放疗抵抗的关键分子决定因素和细胞群体，并开发预后预测模型 | 乳腺癌肿瘤组织及细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | SuperPC, StepCox, 机器学习模型 | 转录组数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 来自TCGA-BRCA和GSE120798队列的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3443 | 2026-01-03 |
Macrophages in Colorectal Cancer: from Normal Mucosa to Distant Metastasis: Beyond the M1/M2 Paradigm
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.126772
PMID:41438574
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综述 | 本文综述了结直肠癌中巨噬细胞从正常黏膜到远处转移的演变过程，超越了传统的M1/M2二分法 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了巨噬细胞表型是一个连续谱系，挑战了经典的M1/M2二分法，并探讨了其在结直肠癌不同发展阶段及分子亚型中的复杂作用 | NA | 研究巨噬细胞在结直肠癌发展、转移及肿瘤微环境中的作用 | 结直肠癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3444 | 2026-01-03 |
Comprehensive characterization of AP-1 adaptor complex genes in lung cancer reveals AP1AR as a novel prognostic and therapeutic biomarker
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.125763
PMID:41438582
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研究论文 | 本研究通过多组学数据系统分析了AP-1衔接复合体基因在肺癌中的作用，揭示了AP1AR作为新的预后和治疗生物标志物 | 首次在家族层面系统定义了AP-1衔接复合体在肺癌中的作用，并发现AP1AR在肺腺癌中持续上调且与不良预后独立相关 | AP-1衔接复合体在肺癌中的作用尚未完全明确，研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探究AP-1衔接复合体基因在肺癌中的生物学功能、预后价值和治疗潜力 | 肺癌（特别是肺腺癌）中的AP-1衔接复合体基因（AP1AR, AP1S1, AP1S2, AP1S3, AP1M1, AP1M2, AP1B1, AP1G1） | 生物信息学 | 肺癌 | 多组学数据分析、单细胞RNA测序、细胞间通讯建模、通路富集分析、生存分析、药物基因组学分析 | CellChat模型、伪时间分析 | 多组学数据集、生存资源数据、药物基因组学面板数据、人类蛋白质图谱数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3445 | 2026-01-03 |
Multi-Omics and Single-Cell Dissection of Exostosin Glycosyltransferases (EXT1/EXT2) Reveals Divergent Oncogenic Roles and Therapeutic Vulnerabilities in Gliomas
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.123965
PMID:41438585
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研究论文 | 本文通过多组学和单细胞分析揭示了EXT1和EXT2在胶质瘤中的不同致癌作用及治疗脆弱性 | 首次整合多组学和单细胞RNA测序数据，系统解析EXT1和EXT2在胶质瘤中的转录、表观遗传和微环境景观，并识别其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和体外验证，缺乏体内功能实验验证，且样本来源可能受限于特定人群 | 探究EXT1和EXT2在胶质瘤中的生物学功能、预后影响及治疗靶点潜力 | 胶质瘤患者样本，包括来自TCGA和CGGA的转录组数据，以及胶质瘤组织微阵列 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组化，基因集富集分析，免疫去卷积分析 | NA | 转录组数据，表观遗传数据，单细胞RNA测序数据，免疫组化图像 | 来自TCGA和CGGA的胶质瘤患者转录组数据，以及胶质瘤组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3446 | 2026-01-03 |
Identification of key ferroptosis-related targets in colorectal cancer: A transcriptomics-driven study via machine learning and AUcell analysis of single-cell RNA-sequencing
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.114522
PMID:41438584
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研究论文 | 本研究通过机器学习和AUcell分析，识别了结直肠癌中铁死亡相关的关键基因，并探讨了其分子机制和治疗潜力 | 结合机器学习（LASSO和SVM-RFE）与单细胞RNA测序的AUcell分析，系统识别结直肠癌中铁死亡的核心生物标志物，并构建了竞争性内源RNA网络和药物候选库 | qRT-PCR验证中AQP8和NR5A2的表达未显示预期差异，且研究依赖于公共数据库数据，需进一步实验验证 | 阐明结直肠癌中铁死亡相关的关键基因和分子机制，以指导治疗策略和预后评估 | 结直肠癌患者样本及相关基因数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组织化学 | LASSO，SVM-RFE | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3447 | 2026-01-03 |
Genetic Association Between Polymyositis/Dermatomyositis and Epilepsy: Insights From Mendelian Randomization and Bioinformatic Analyses
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71148
PMID:41466027
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和生物信息学分析，探讨了多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的遗传关联及免疫介导机制 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学，揭示多发性肌炎与癫痫之间的因果关联及免疫细胞浸润模式 | 研究未发现皮肌炎与癫痫的显著关联，且样本主要基于公开数据库，需进一步实验验证 | 探索多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的潜在因果联系及免疫机制 | 多发性肌炎、皮肌炎和癫痫患者及小鼠模型的遗传与转录组数据 | 生物信息学 | 多发性肌炎、皮肌炎、癫痫 | GWAS、孟德尔随机化、转录组分析、单细胞转录组学、PCR | NA | 遗传数据、转录组数据 | 基于公开GWAS数据库（如finn-b-M13_POLYMYO、finn-b-DERMATOPOLY_FG、ebi-a-GCST90018840）及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3448 | 2026-01-03 |
Spatial Transcriptomics Unveils Landscape of Resistance to Concurrent Chemo-Radiotherapy in Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma: The Role of SPP1+ Macrophages
2026-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71493
PMID:41466485
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了下咽鳞状细胞癌患者对同步放化疗产生耐药性的肿瘤微环境特征，并明确了SPP1+巨噬细胞在其中的关键作用 | 首次利用空间转录组学技术，在空间维度上解析了下咽鳞状细胞癌对同步放化疗耐药的肿瘤微环境，并识别出SPP1+巨噬细胞通过CD44和ITGB1介导的配体-受体相互作用促进耐药的新机制 | 研究样本量有限，且为观察性研究，需要更大规模的前瞻性队列和功能实验验证SPP1+巨噬细胞在耐药中的因果作用 | 探究下咽鳞状细胞癌对同步放化疗产生耐药的肿瘤微环境机制，以寻找预测性生物标志物和开发靶向治疗策略 | 晚期下咽鳞状细胞癌患者的组织样本，包括对同步放化疗耐药的患者和未接受同步放化疗的患者 | 空间转录组学 | 下咽鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及对同步放化疗耐药和未接受同步放化疗的晚期下咽鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3449 | 2026-01-03 |
Identification and Validation of the Prognostic Value of PTTG1-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma by Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptome Analysis
2026-Jan, Iranian journal of biotechnology
IF:1.6Q4
DOI:10.30498/ijb.2025.543634.4221
PMID:41472935
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、转录组分析和单细胞测序方法，评估了PTTG1相关基因在肝细胞癌中的预后价值 | 首次结合孟德尔随机化、转录组分析和单细胞测序方法，系统评估PTTG1相关基因在肝细胞癌中的预后价值，并识别出CDC45和CENPE作为新的潜在治疗靶点 | 孟德尔随机化分析显示CDC45和CENPE与HCC的因果关联虽显著但效应较弱，表明这些基因在HCC发病机制中可能起微妙调控作用而非强直接因果作用 | 评估PTTG1相关基因在肝细胞癌中的预后价值 | 肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化，转录组分析，单细胞测序 | 单变量Cox回归，机器学习方法 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3450 | 2026-01-03 |
Single-Cell 3' mRNA Sequencing with 10× Chromium Gel Beads-in-Emulsion (GEM) Kits
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4901-5_35
PMID:41478996
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研究论文 | 本文介绍了使用10× Genomics的Chromium Next GEM Single Cell 3'试剂盒进行单细胞3' mRNA测序的详细协议 | 基于微流控分区和条形码技术，通过GEMs封装单细胞实现高通量单细胞转录组分析 | 依赖于特定试剂盒和平台，需参考官方指南以确保实验准确性，可能受技术更新影响 | 提供单细胞RNA测序的实验方法，用于研究细胞异质性、基因表达动态和稀有细胞群 | 单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 数千个单个细胞 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Illumina sequencing platforms | 10x Chromium Single Cell 3' Reagent Kits (v3.1-Dual Index) |
| 3451 | 2026-01-03 |
Exploring Chronic Rejection in Organ Transplantation Through Computational Modeling
2026, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-032-07686-1_3
PMID:41479021
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综述 | 本章探讨了计算模型在理解实体器官移植慢性排斥反应机制、提高诊断精度和识别新治疗靶点方面的应用 | 综述了多种计算建模方法（包括人工智能、机器学习、微分方程、基于代理的模型和基因网络分析）在肾、肝、心、肺移植慢性排斥研究中的整合应用，并展望了单细胞转录组学和空间基因组学等新兴技术的潜力 | 面临数据质量、标准化和临床验证方面的挑战，需要更全面的纵向研究和结合多种计算技术的混合模型来弥合差距 | 通过计算建模理解慢性排斥机制，提高诊断精度，识别新治疗靶点，以改善移植器官长期存活率 | 实体器官移植（肾、肝、心、肺）中的慢性排斥反应 | 机器学习 | 器官移植排斥 | 单细胞转录组学，空间基因组学，多组学数据整合 | 人工智能，机器学习，常微分方程，偏微分方程，基于代理的模型，基因网络分析 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学，空间基因组学 | NA | NA |
| 3452 | 2026-01-02 |
Single-Cell RNA Sequencing of Murine Limbal Epithelia Reveals Gas1 as a Novel Stem/Progenitor Cell Marker for the Corneal Epithelium
2026-Feb-01, Cornea
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/ICO.0000000000003938
PMID:40704715
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠角膜缘上皮中Gas1作为角膜上皮干细胞/祖细胞的新标记物 | 首次将Gas1鉴定为角膜缘上皮干细胞/祖细胞的统一表面标记物，并验证其在年轻和年老小鼠中的表达及损伤后的上调 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证Gas1的标记功能 | 识别角膜缘上皮干细胞/祖细胞的特定标记物，以促进角膜疾病的细胞治疗 | 小鼠角膜缘上皮细胞 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, PCR | NA | 转录组数据, 图像数据 | 5至60周龄的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | SmartSeq-2 | SmartSeq-2单细胞转录组学技术 |
| 3453 | 2026-01-01 |
Exploring the key functions of T cells and the regulation of the immune microenvironment in prostate cancer using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2026-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2596700
PMID:41474172
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，系统探究了前列腺癌中T细胞亚群的功能及其对肿瘤免疫微环境的调控作用，并构建了一个基于T细胞标记基因的预后风险模型 | 首次在前列腺癌中结合单细胞和bulk RNA测序数据，从多角度（细胞互作、拟时序、富集分析等）系统解析T细胞功能，并构建和验证了一个新的基于T细胞标记基因（BCAS2, EIF2S2, RIOK3, ATP6V1E1）的预后模型 | 研究基于公共数据集或有限样本，缺乏大规模独立队列的外部验证；单细胞数据样本量相对较小（16,999个细胞），可能无法完全代表所有患者亚型；功能机制研究主要基于生物信息学预测，缺乏实验验证 | 系统研究前列腺癌肿瘤微环境中T细胞亚群的分布模式及其与临床病理参数的相关性，并探索T细胞在免疫治疗中的作用 | 前列腺癌患者的肿瘤微环境，特别是其中的T细胞 | 生物信息学，肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 预后风险模型（基于基因标记），ssGSEA，ESTIMATE算法 | 基因表达数据（单细胞和bulk RNA-seq） | 单细胞数据包含16,999个细胞（经过质控后），具体患者样本数未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3454 | 2025-12-31 |
Breaking barriers: epithelial-mesenchymal transition role in melanoma invasion and resistance
2026-Feb-01, Melanoma research
IF:1.5Q4
DOI:10.1097/CMR.0000000000001068
PMID:41222312
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综述 | 本综述探讨了上皮-间质转化（EMT）在黑色素瘤侵袭和耐药中的核心作用 | 详细阐述了EMT在黑色素瘤中的分子机制，包括转录因子、信号通路、表观遗传和非编码RNA调控，并强调了EMT与肿瘤微环境的相互作用及作为预后生物标志物的潜力 | 存在EMT异质性和临床前模型不足的局限性 | 阐明EMT在黑色素瘤进展、转移和耐药中的角色，以推动治疗策略发展 | 黑色素瘤细胞及其EMT过程 | NA | 黑色素瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞分析, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3455 | 2025-12-31 |
Revealing Inhibition of Gastric Cancer Occurrence and Metastasis by GPX3 Through Single-Cell Transcriptomics and Organoid Multimodal Technologies
2026-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70057
PMID:41118587
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合类器官多模态技术，揭示了GPX3在抑制胃癌发生和转移中的作用 | 首次结合单细胞转录组分析和类器官模型，系统性地揭示了GPX3作为胃癌转移的潜在抑制因子及其在体内外实验中的功能验证 | 样本量相对较小（3个原发肿瘤、1个癌旁组织、6个转移样本），且主要基于公共数据集GSE163558进行分析 | 阐明驱动胃癌转移的关键因子，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 胃癌细胞、患者来源的胃癌类器官、裸鼠肝转移模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个样本（3个原发GC、1个癌旁、6个GC转移样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3456 | 2025-12-31 |
Prognostic Significance of LGALS3BP in Triple-Negative Breast Cancer: Implications for Immune Infiltration and Therapeutic Response
2026-Jan, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70536
PMID:41467329
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析，鉴定出LGALS3BP作为三阴性乳腺癌中关键的脂质相关巨噬细胞标志物，并探讨其与免疫浸润、治疗反应及预后的关联 | 首次将LGALS3BP识别为三阴性乳腺癌中脂质相关巨噬细胞的关键预后标志物，并揭示了其与免疫浸润和免疫治疗反应的直接联系 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能有限，需进一步临床队列验证 | 识别三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的新型预后标志物，并探索其免疫调节功能 | 三阴性乳腺癌患者样本，特别是肿瘤微环境中的脂质相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3457 | 2025-12-30 |
Integrating Single-Cell Sequencing, Machine Learning, and Molecular Docking to Elucidate the Molecular Network Linking Myocardial Infarction and DEHP Exposure
2026-Jan, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70663
PMID:41459671
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序、机器学习和分子对接技术，揭示了环境塑化剂DEHP通过结合SLC2A3和MMP9等核心基因，在特定免疫细胞中加剧心肌梗死的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序、机器学习算法集成和分子对接模拟，系统解析了DEHP在心肌梗死中细胞类型特异性的促炎免疫失调网络，并识别出六个核心诊断生物标志物 | 研究主要基于公共转录组数据集和计算预测，缺乏体内或体外实验的直接功能验证 | 阐明DEHP暴露与心肌梗死发病机制之间的细胞类型特异性分子联系 | DEHP（邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯）暴露下的免疫细胞与心肌梗死相关分子靶点 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 分子对接模拟 | 集成机器学习算法（11种算法） | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集（GSE66360, GSE60993, GSE61144, GSE48060, GSE141512, GSE269269），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3458 | 2025-12-29 |
LncRNA ZFAS1 in hepatocellular carcinoma: A systematic review of molecular mechanisms and clinical translation
2026-Apr, Non-coding RNA research
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.ncrna.2025.11.003
PMID:41450817
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综述 | 本文系统综述了长链非编码RNA ZFAS1在肝细胞癌中的分子机制及其临床转化前景 | 系统性地整合了ZFAS1作为竞争性内源RNA、编码微肽调控铁死亡、通过外泌体重塑肿瘤微环境等多维机制，并提出了结合多组学与AI建模的未来研究方向 | 当前转化挑战包括ZFAS1亚型异质性、液体活检灵敏度不足以及肿瘤微环境动态相互作用的复杂性 | 阐明长链非编码RNA ZFAS1在肝细胞癌发生发展中的分子机制，并探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的临床转化潜力 | 肝细胞癌患者组织、血浆样本及相关分子机制 | 自然语言处理 | 肝细胞癌 | 多组学整合（空间转录组学/单细胞测序）、AI驱动的网络建模 | NA | 文本（文献数据） | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 3459 | 2025-12-28 |
Lubricin maintains temporomandibular joint homeostasis by regulating synovial inflammation
2026-Mar, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.101051
PMID:41445976
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研究论文 | 本研究探讨了蛋白聚糖4（Prg4，即润滑素）在维持颞下颌关节稳态中的作用及其在颞下颌关节骨关节炎中的病理意义 | 首次利用高分辨率Visium HD空间转录组学揭示了Prg4在颞下颌关节中的区域特异性表达模式，并阐明了其在炎症过程中的时间依赖性调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，其结论向人类临床转化的有效性仍需进一步验证 | 探索Prg4在维持颞下颌关节稳态及治疗颞下颌关节骨关节炎中的潜在再生治疗应用 | 野生型和Prg4敲除小鼠的颞下颌关节、体外培养的滑膜细胞 | 空间转录组学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 空间转录组学、谱系追踪、体外炎症刺激 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、基因表达数据 | 野生型和Prg4敲除小鼠模型，具体数量未明确说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 高分辨率Visium HD空间转录组学平台 |
| 3460 | 2025-12-28 |
SpatialFusion: A Unified Model for Integrating Spatial Transcriptomics to Unveil Cell-type Distribution, Interaction, and Functional Heterogeneity in Tissue Microenvironments
2026-Jan-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169535
PMID:41237948
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialFusion的深度学习模型，旨在通过整合基因表达和空间坐标来改进空间转录组学中的空间域识别和细胞类型反卷积 | SpatialFusion模型创新性地结合了图神经网络和注意力机制，通过空间数据的多维嵌入捕获复杂空间关系，并采用双编码策略（空间图和特征图的协同学习）及自监督对比学习，显著提高了准确性和鲁棒性 | NA | 解决空间转录组学中空间域识别和细胞类型反卷积在准确性、鲁棒性和计算效率方面的挑战 | 人类DLPFC数据集和乳腺癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络, 注意力机制 | 基因表达数据, 空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |