单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5215 篇文献，本页显示第 3401 - 3420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3401 | 2026-03-03 |
Single nuclei and spatial profiling of sacrococcygeal teratomas reveals cellular composition and X inactivation heterogeneity
2026-Jan-21, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01262-4
PMID:41565739
|
研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了骶尾部畸胎瘤的细胞组成、异质性以及X染色体失活状态与细胞身份之间的联系 | 首次在骶尾部畸胎瘤中结合单细胞核RNA测序与空间转录组学进行分析，揭示了肿瘤的细胞谱系异质性，并发现了女性肿瘤细胞中存在X染色体双等位基因表达现象及其与细胞身份和免疫景观的关联 | 样本量较小（仅8例肿瘤），且未能在研究中检测到假定的多能性细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层机制以及性别偏好的分子基础 | 骶尾部畸胎瘤组织样本 | 数字病理学 | 畸胎瘤 | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 8例骶尾部畸胎瘤样本（6例产后：1例男性，5例女性；2例产前：均为女性） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3402 | 2026-03-03 |
Age-dependent immune responses and resident cell dynamics in young mice following pneumonia
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114219
PMID:41488789
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序，揭示了幼鼠肺炎后年龄依赖的免疫反应和肺驻留细胞动态，强调了早期免疫发育对疾病易感性的影响 | 首次在幼鼠模型中，结合单细胞和批量RNA测序技术，全面绘制了新生儿与幼年鼠肺驻留细胞的转录组图谱，并揭示了年龄特异性免疫动态与健康结局的关联 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本，且未探讨长期免疫后果或具体治疗干预 | 探究年龄特异性免疫动态与未成熟肺健康结局差异的关联 | 新生和幼年小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及新生和幼年小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3403 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals molecular heterogeneity and subtype-specific therapeutic targets in small cell lung cancer
2026-Jan-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01243-7
PMID:41545500
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了小细胞肺癌的分子异质性，并识别了亚型特异性治疗靶点 | 引入了Edgeindex指标定量评估肿瘤空间结构，并开发了专门的人工神经网络模型进行精确肿瘤注释 | NA | 解析小细胞肺癌的异质性并探索其分子机制 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 人工神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3404 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743187
PMID:41766855
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，系统探究了乳酸代谢在PDAC肿瘤微环境中的具体角色，并构建了基于机器学习的新型预后模型 | 样本量相对有限（8个PDAC样本），且研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质或代谢组层面的验证 | 探究乳酸代谢在胰腺导管腺癌（PDAC）微环境中的作用机制及其临床意义 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者肿瘤组织中的恶性细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高通量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 集成机器学习（StepCox + Enet） | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 92名PDAC患者（ICGC队列），另有多组验证队列（GSE28735: 45例，GSE62452: 69例，GSE183795: 139例），单细胞分析涉及8个PDAC样本的50,795个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3405 | 2026-03-03 |
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1760782
PMID:41766877
|
综述 | 本文综述了乳腺癌肿瘤免疫微环境（TIME）的细胞、分子和代谢复杂性，并探讨了将免疫抑制性“冷”肿瘤转化为免疫反应性“热”肿瘤的免疫治疗策略 | 整合了代谢调节、基质重编程和精准联合疗法等新方向，以克服原发性和获得性耐药，并强调了结合空间转录组学和液体活检等新兴生物标志物策略 | NA | 探讨乳腺癌肿瘤免疫微环境的免疫抑制机制，并评估当前和新兴的免疫治疗方法，旨在改善治疗反应和克服耐药性 | 乳腺癌肿瘤免疫微环境（TIME） | NA | 乳腺癌 | 空间转录组学，液体活检 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3406 | 2026-03-03 |
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1724740
PMID:41766913
|
研究论文 | 本研究通过整合组学分析和实验验证，揭示了METTL17和SLC27A1作为慢性肾脏病（CKD）的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA测序、单细胞转录组学和临床验证，系统性地鉴定了连接线粒体调控和巨噬细胞极化的关键基因METTL17和SLC27A1，并阐明了它们在CKD进展中的细胞特异性表达和细胞间通讯机制 | 研究主要基于转录组数据，蛋白质功能和调控机制需要进一步验证；动物模型为UUO模型，可能无法完全模拟人类CKD的所有病理特征 | 阐明慢性肾脏病（CKD）的分子机制，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 慢性肾脏病（CKD）患者外周血样本、单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠模型、近端肾小管细胞（PTCs）和平滑肌细胞（SMCs） | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组织化学, Western blotting | 机器学习 | 转录组数据, 临床数据, 实验数据 | CKD患者外周血样本和UUO小鼠模型（具体样本数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3407 | 2026-03-03 |
Benign, persistent, and invasive: mechanistic and translational approaches to middle‑ear cholesteatoma
2026, Exploration of targeted anti-tumor therapy
DOI:10.37349/etat.2026.1002359
PMID:41767763
|
综述 | 本文综述了中耳胆脂瘤的发病机制，并探讨了基于微环境的精准治疗策略 | 整合了单细胞转录组学、空间蛋白质组学和表观遗传学等最新机制研究，提出胆脂瘤的侵袭性源于微环境驱动而非遗传突变，为微环境导向的精准治疗提供了新视角 | 文章为综述性论文，未报告原始实验数据或具体临床研究结果，所提治疗策略大多处于临床前或早期实验阶段 | 阐明中耳胆脂瘤的发病机制并探索其转化治疗策略 | 中耳胆脂瘤（一种组织学良性但具有局部破坏性的角化鳞状上皮病变） | 数字病理学 | 耳部疾病（具体为中耳胆脂瘤） | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学、表观遗传学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 3408 | 2026-03-03 |
Uncovering potential molecular biomarkers for cancer-associated secondary lymphedema through integrated analyses of RNA-sequencing, machine learning, and clinical data
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1760040
PMID:41768256
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA测序、机器学习和临床数据分析，揭示了癌症相关继发性淋巴水肿的潜在分子生物标志物 | 首次结合RNA测序、多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据，识别出IL2RG、HOXD10和TSPAN1作为CASL的新型潜在分子标志物，并深入探讨了其与免疫细胞浸润及临床参数的关联 | 样本量相对较小（10例正常对照和40例CASL患者），且研究主要基于脂肪组织，可能无法全面反映CASL在其他组织中的分子机制 | 探索癌症相关继发性淋巴水肿的分子机制，并寻找其诊断和治疗的潜在生物标志物 | 脂肪组织样本（来自正常对照和CASL患者） | 机器学习 | 癌症相关继发性淋巴水肿 | RNA测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 多种机器学习算法（包括SHAP解释性分析） | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 50例（10例正常对照，40例CASL患者） | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3409 | 2026-03-03 |
Uncovering mitochondrial dynamics-related genes as potential diagnostic biomarkers for acute myocardial infarction
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1755024
PMID:41768570
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定出与急性心肌梗死相关的线粒体动力学基因COX7B和SNORD54作为新型诊断生物标志物 | 首次将线粒体动力学相关基因COX7B和SNORD54识别为急性心肌梗死的潜在诊断生物标志物，并通过单细胞RNA测序分析揭示了单核细胞和自然杀伤细胞的关键作用 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步的功能实验验证这些生物标志物的具体分子机制 | 探索急性心肌梗死中线粒体动力学相关基因作为诊断生物标志物的潜力 | 急性心肌梗死患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量，但包括急性心肌梗死和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3410 | 2026-03-02 |
Decoding schizophrenia through postmortem human brain transcriptomics
2026-Apr, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102434
PMID:41637815
|
综述 | 本文通过综述尸检人脑组织的转录组学研究，揭示了精神分裂症的分子结构特征 | 整合了批量组织和单核转录组学的研究发现，揭示了精神分裂症中基因表达变化的细胞类型特异性和个体异质性，并指出前额叶皮层兴奋性神经元，特别是上层兴奋性神经元的易损性 | 尸检组织分析存在固有的方法学挑战，如组织质量、死后延迟等因素可能影响结果 | 解码精神分裂症的病理生理学分子机制 | 尸检人脑组织 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3411 | 2026-03-02 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies cellular heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment in inflammatory breast cancer
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.061
PMID:40460936
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了炎性乳腺癌的细胞异质性和免疫抑制性肿瘤微环境，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次在单细胞和空间水平上全面分析炎性乳腺癌的免疫细胞组成和信号通路，发现CXCL13表达降低与免疫抑制相关，并筛选出天然产物作为免疫调节剂 | 研究样本量有限，且主要基于转录组数据，功能验证和临床转化需要进一步研究 | 分析炎性乳腺癌的病理和分子基础，以开发精准医疗策略 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，荧光染色，空间分析，肿瘤-免疫细胞共培养，体内研究 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据，基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但涉及炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | NanoString | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间分析 |
| 3412 | 2026-03-02 |
Cytoskeletal-related genes function as checkpoints for the maintenance of VSMC contractile phenotype and prevent pathological remodeling in arterial diseases
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.065
PMID:40516911
|
研究论文 | 本研究构建了动脉疾病中血管平滑肌细胞表型转换的跨物种整合模型，识别了细胞骨架相关基因作为维持收缩表型的关键检查点，并验证其在病理重塑中的作用 | 通过单细胞RNA-seq数据分析，首次识别Fblim1、Tns1和Synpo2等细胞骨架相关基因作为VSMC表型转换的检查点，揭示了它们在防止病理重塑中的关键作用 | 研究主要基于公共数据集和动物模型，人类样本验证有限，且机制细节需进一步探索 | 构建VSMC表型转换的整合模型，识别调控基因并验证其在动脉疾病病理重塑中的功能 | 血管平滑肌细胞（VSMC）、动脉疾病（包括动脉粥样硬化和主动脉瘤） | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集、实验动物动脉瘤样本、PDGF-BB处理的VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3413 | 2026-03-02 |
ANKRD1 sustains a neurogenic BMSC niche and counters cognitive aging
2026-Mar-01, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00428-5
PMID:41764190
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了颅颌面骨髓间充质基质细胞中ANKRD1作为维持神经源性生态位的关键调节因子，并证明其靶向递送可改善老年小鼠的空间记忆缺陷 | 首次发现ANKRD1通过直接结合神经标志基因的超增强子并维持开放染色质结构来维持神经源性潜能，并证明其可作为治疗靶点改善认知老化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中得到验证；ANKRD1在衰老过程中的表达下降机制仍需进一步探究 | 探究维持骨髓间充质基质细胞神经源性潜能的分子机制及其在认知老化中的作用 | 颅颌面骨髓间充质基质细胞（BMSCs）、老年小鼠 | 单细胞转录组学 | 认知老化 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3414 | 2026-03-02 |
Spatial Single-cell Transcriptome Atlas of Mouse Thymus Reveals the T Lymphocyte Dynamics During Development
2026-Mar-01, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag020
PMID:41764407
|
研究论文 | 本研究通过空间单细胞转录组图谱揭示了小鼠胸腺在发育过程中的T淋巴细胞动态变化 | 首次构建了小鼠胸腺在四个发育阶段的空间单细胞转录组图谱，揭示了胸腺细胞组成和转录谱的动态重塑，特别是DP-T细胞亚群的空间分布和DC-DP-2相互作用的MHC-II通路富集 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；样本量相对有限（四个时间点）；空间分析分辨率可能受技术限制 | 解析胸腺微环境中淋巴细胞发育的分子动力学和空间组织 | 小鼠胸腺组织在3、9、15和33周四个发育阶段的免疫细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 空间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 四个发育阶段（3、9、15、33周）的小鼠胸腺样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3415 | 2026-03-02 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
|
研究论文 | 本研究揭示了女性与男性在晚期动脉粥样硬化纤维斑块中具有不同的临床和分子特征，特别是女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的细胞外基质重塑和TGF-β反应为特征 | 首次系统性地结合组织学、临床特征及多组学数据（蛋白质、bulk RNA、单细胞RNA、DNA甲基化），揭示了性别差异在动脉粥样硬化纤维斑块分子机制中的作用，并利用空间转录组学定位了基因表达模式，实验验证了TGF-β/SMAD3通路在女性偏向性机制中的关键作用 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术患者，可能无法完全代表其他血管床的斑块特性；研究为观察性设计，因果关系需进一步实验验证 | 探究男性和女性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异，以理解斑块侵蚀的分子机制并为动脉粥样硬化治疗提供潜在靶点 | 人类晚期动脉粥样硬化斑块（来自颈动脉内膜切除术患者） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, DNA甲基化测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | RNA-seq数据, 甲基化数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块（1309例男性，580例女性） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3416 | 2026-03-02 |
A beneficial environment promotes immune resilience through epigenetic regulation
2026-Feb-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7317
PMID:41758935
|
研究论文 | 本研究探讨了农场粉尘暴露如何通过表观遗传重编程增强免疫韧性，从而减轻过敏性肺部炎症 | 首次揭示了有益环境暴露通过PPARγ信号通路维持的组蛋白去乙酰化酶活性，对单核细胞来源的巨噬细胞进行表观遗传重编程的机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证有限；长期效应和临床转化潜力需进一步研究 | 探究有益环境暴露对免疫系统的影响机制，寻找哮喘预防新策略 | 小鼠过敏性炎症模型、骨髓来源巨噬细胞、人类细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 3417 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3418 | 2026-03-02 |
BST2 promotes esophageal squamous cell carcinoma progression by mediating the cell-cell interaction between cancer cells and cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.012
PMID:41763536
|
研究论文 | 本研究探讨了BST2在食管鳞状细胞癌中通过介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞之间的细胞间相互作用促进癌症进展的机制 | 首次建立了通过直接共培养骨髓间充质干细胞与食管鳞癌细胞生成CAF样细胞的方法，并利用此方法结合单细胞RNA测序数据揭示了BST2在癌细胞与CAFs相互作用中的关键作用 | 研究主要基于体外共培养模型和公共数据库分析，缺乏体内实验验证BST2在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究BST2在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞相互作用的机制 | 食管鳞状细胞癌细胞、骨髓来源的间充质干细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 共培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了公共单细胞RNA测序数据库和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3419 | 2026-03-02 |
Tertiary lymphoid structures correlate with reduced recurrence risk and enhanced antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma with pathologic non-complete response to neoadjuvant chemoimmunotherapy
2026-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00748-6
PMID:41736069
|
研究论文 | 本研究探讨了三级淋巴结构（TLS）在食管鳞状细胞癌（ESCC）新辅助化疗免疫治疗后非病理完全缓解（non-pCR）患者中的预后价值和免疫特征 | 首次在non-pCR ESCC患者中系统评估TLS与术后复发风险及抗肿瘤免疫的关系，并利用单细胞测序和多色免疫组化揭示TLS内免疫细胞的空间定位和相互作用模式 | 研究为回顾性分析，样本量有限，且未涉及TLS形成的机制或干预策略 | 评估TLS在non-pCR ESCC中的预后意义和免疫调控作用 | 接受新辅助化疗免疫治疗的局部晚期食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、多色免疫组化 | NA | 单细胞数据、批量RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量，但涉及临床病理特征、复发事件和生存结果分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3420 | 2026-03-02 |
Evaluation of statistical differential analysis methods for identification of senescent cells using single-cell transcriptomics
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101264
PMID:41576958
|
研究论文 | 本研究系统评估了Seurat包中10种差异基因表达分析方法在单细胞RNA测序数据中识别衰老细胞的性能 | 首次系统评估Seurat包中多种DGE方法在scRNA-seq数据中识别衰老细胞的性能，并推荐DESeq2为最佳方法 | 仅评估了Seurat包中的方法，未涵盖所有可用的DGE工具；基于模拟和真实数据集，但可能未覆盖所有生物学场景 | 评估单细胞转录组学中差异基因表达分析方法的性能，以优化衰老细胞的识别 | 单细胞RNA测序数据中的衰老细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 多种统计方法（Wilcox、DESeq2等） | 单细胞转录组数据 | 模拟和真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |