单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1772 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-02-07 |
TMEM158-mediated TGF-β signaling pathway modulates the sensitivity of TP53-deficient osteosarcoma to USP14 inhibitors
2026-Feb-05, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05487-0
PMID:41642468
|
研究论文 | 本研究揭示了TMEM158介导的TGF-β信号通路在调节TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性中的核心作用 | 首次发现TMEM158是TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性的关键调节因子，并阐明了其通过TGF-β信号通路发挥作用的分子机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；单细胞测序数据的分析深度和样本量有限 | 探究TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性的分子机制，寻找精准治疗靶点 | TP53缺陷型骨肉瘤细胞（原代细胞、SAOS-2、U-2OS）、临床骨肉瘤数据库、TP53缺陷型骨肉瘤小鼠模型 | 计算生物学 | 骨肉瘤 | 生物信息学分析（聚类分析、差异表达分析、功能富集分析）、qPCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个细胞系（原代TP53缺陷型骨肉瘤细胞、SAOS-2、U-2OS）、临床数据库、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2026-02-07 |
Adenosine A2B Receptor Promotes Tumor Progression and Metastases in Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-Feb-05, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3934
PMID:41642698
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现腺苷A2B受体（ADORA2B）是未分化多形性肉瘤（UPS）转移进展的关键驱动因子，并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次在UPS中系统揭示了ADORA2B通过调控缺氧、上皮-间质转化和免疫抑制通路驱动转移的分子机制，并进行了功能验证 | 样本量相对较小（13例患者），且主要基于相关性分析和临床前模型，需要更大规模临床研究进一步验证 | 探究未分化多形性肉瘤（UPS）转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 未分化多形性肉瘤（UPS）患者的配对原发和转移肿瘤样本、CRISPR-Cas9敲除的UPS细胞系、体内动物模型 | 数字病理 | 软组织肉瘤 | 空间转录组学、bulk RNA测序、反卷积分析、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 13例UPS患者的配对原发和转移肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2026-02-07 |
Targeting HSP90 as a therapeutic approach for endometriosis: insights from proteomic analysis
2026-Feb-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaaf002
PMID:41643215
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，发现热休克蛋白90（HSP90）在子宫内膜异位症中上调，并验证了其抑制剂17-AAG在体外和体内模型中的治疗效果 | 首次在子宫内膜异位症中通过单细胞RNA测序识别HSP90作为潜在治疗靶点，并利用蛋白质组学揭示了其抑制后的下游分子网络变化 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未进行人体临床试验；样本来源相对有限 | 探索子宫内膜异位症的非激素治疗新靶点 | 子宫内膜异位症患者月经流出物、原代子宫内膜基质细胞、小鼠子宫内膜异位症模型 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 数据集GSE203191（患者月经流出物），原代细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2026-02-07 |
FLASH-MM: fast and scalable single-cell differential expression analysis using linear mixed-effects models
2026-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69063-2
PMID:41644528
|
研究论文 | 本文开发了一种名为FLASH-MM的快速、可扩展的线性混合效应模型估计算法，用于解决单细胞RNA测序数据中样本相关性、个体差异和可扩展性等挑战 | 通过重新设计线性混合模型估计过程，降低计算复杂度和内存使用，实现了快速且可扩展的单细胞差异表达分析 | NA | 开发一种快速、可扩展的算法，以解决单细胞差异表达分析中的样本相关性、个体变异和可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-02-07 |
Tumour-intrinsic features shape T cell differentiation through precursor to symptomatic multiple myeloma
2026-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68718-4
PMID:41644568
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤及其前驱状态患者的骨髓和血液样本，揭示了肿瘤内在特征如何影响T细胞分化，并预测疾病进展 | 首次在多发性骨髓瘤中证明T细胞分化由抗原驱动的终末记忆分化主导，而非传统T细胞耗竭，并识别了肿瘤负荷和抗原呈递基因表达等肿瘤内在特征的关键作用 | 研究主要基于观察性数据，机制性验证有限；样本来源可能受限于特定患者群体 | 探究多发性骨髓瘤中T细胞分化的机制及其在疾病进展中的作用 | 多发性骨髓瘤患者、前驱状态患者及非癌症对照者的骨髓和血液样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大型数据集，包括多发性骨髓瘤、前驱状态和非癌症对照患者的骨髓和血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2026-02-07 |
Dextrorotatory kynurenine suppresses acute rejection through inhibiting M1 macrophage-mediated inflammation
2026-Feb-05, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00377-w
PMID:41644740
|
研究论文 | 本文发现右旋犬尿氨酸（D-Kyn）通过抑制M1巨噬细胞介导的炎症，在预防肾移植急性排斥反应中具有免疫抑制作用 | 首次揭示了右旋氨基酸（D-AAs）在免疫抑制中的作用，并鉴定出D-Kyn通过PHGDH/TLR4/Caspase-1通路抑制M1巨噬细胞炎症活性，为移植排斥治疗提供了新的候选药物 | 研究主要基于小鼠模型和患者血清分析，未来需要更多临床研究验证D-Kyn在人体中的疗效和安全性 | 探究右旋氨基酸在肾移植急性排斥反应中的作用及其免疫抑制机制 | 肾移植受者血清样本、小鼠皮肤和肾脏移植模型、M1巨噬细胞 | 免疫学 | 肾移植急性排斥反应 | 离子淌度质谱（IM-MS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | 肾移植受者血清样本（具体数量未明确）、小鼠移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE109564数据集 |
| 327 | 2026-02-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of peripheral blood mononuclear cells reveals monocyte heterogeneity in patients with Moyamoya disease
2026-Feb-05, Orphanet journal of rare diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13023-026-04241-5
PMID:41645291
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了烟雾病患者外周血单个核细胞的转录组图谱，揭示了单细胞异质性及其在疾病中的作用 | 首次在烟雾病中应用单细胞RNA测序技术，鉴定了中间单核细胞亚群的增加，并发现了两个潜在生物标志物基因RETN和TGFBR2 | 样本量较小（仅6名患者和3名对照），且仅分析了外周血免疫细胞，未涉及脑组织或血管病变部位 | 探究烟雾病患者外周免疫细胞的转录组特征，以识别潜在的生物标志物和疾病机制 | 烟雾病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名烟雾病患者和3名对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2026-02-07 |
Lactylation-related gene signature as a prognostic biomarker for neuroblastoma: insights into tumor progression and immune modulation
2026-Feb-05, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01538-7
PMID:41645330
|
研究论文 | 本研究通过构建一个基于乳酸化相关基因的七基因预后模型，揭示了乳酸化在神经母细胞瘤进展和免疫调节中的关键作用，并识别出KLHL32作为潜在的治疗靶点 | 首次在神经母细胞瘤中系统研究乳酸化修饰的预后价值，构建了首个基于乳酸化相关基因的预后模型，并发现KLHL32通过调节PI3K/AKT通路和乳酸产生影响肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验，缺乏体内动物模型验证；样本量可能有限，需要更大规模的前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 | 探究乳酸化修饰在神经母细胞瘤进展和免疫调节中的作用，并开发预后预测工具 | 神经母细胞瘤组织样本、单细胞RNA测序数据、神经母细胞瘤细胞系 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 免疫组化分析、单细胞RNA测序、Cox回归分析、LASSO分析、AUCell算法 | Cox回归模型、LASSO回归模型 | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量，但使用了多个独立数据集进行验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2026-02-07 |
transFusion: a Novel Comprehensive Platform for integration Analysis of Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Feb-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag059
PMID:41645434
|
研究论文 | 本文介绍了transFusion，一个用于整合分析单细胞RNA测序和10X Visium空间转录组数据的新型网络平台 | 开发了首个专注于全面整合scRNA-seq和10X Visium数据的网络平台，提供12项关键功能，包括细胞间依赖性分析、配体-受体共表达识别和空间多模态梯度变异模式分析 | 平台主要针对10X Visium数据，可能不适用于其他空间转录组技术；且需要用户具备一定的计算和统计知识，尽管设计上力求简化 | 解决空间转录组数据整合分析中的挑战，特别是针对10X Visium数据的低分辨率和多模态数据集复杂性 | 单细胞RNA测序数据和10X Visium空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium空间转录组技术 |
| 330 | 2026-02-07 |
Crohn's lymphoid aggregates with endothelial clusters colocalise with submucosal fibrosis in fibrostenosing Crohn's disease
2026-Feb-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70019
PMID:41645585
|
研究论文 | 本研究通过分析克罗恩病纤维狭窄病变的切除样本，结合单细胞RNA测序，揭示了克罗恩淋巴聚集物与内皮细胞簇在黏膜下层纤维化中的共定位及其潜在的细胞间信号相互作用 | 首次在克罗恩病纤维狭窄病变中系统量化了各肠层的病理变化，并利用单细胞RNA测序验证了内皮细胞、淋巴细胞、巨噬细胞和肌成纤维细胞之间通过GAS、SELL、SELPLG等多条通路进行的配体-受体相互作用，明确了克罗恩淋巴聚集物与内皮细胞簇在黏膜下层纤维化中的共定位关系 | 研究基于手术切除样本，可能无法完全反映疾病早期或活动期的动态过程；样本量未明确说明；功能验证实验有待进一步开展 | 探究克罗恩病纤维狭窄病变的局部病理特征、细胞组成及细胞间相互作用，以识别潜在的可靶向通路 | 克罗恩病纤维狭窄病变患者的回肠切除样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2026-02-07 |
ACSL1-Dependent Microglial Lipoimmunometabolic Reprogramming Underlies Cognitive Deficits in Alcohol Use Disorder
2026-Feb-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519760
PMID:41645661
|
研究论文 | 本研究揭示了酒精使用障碍（AUD）中认知缺陷的核心机制，即ACSL1介导的小胶质细胞脂质免疫代谢重编程，并提出了一种新型靶向治疗策略 | 通过单细胞RNA测序数据重分析，首次将ACSL1确定为AUD中微胶质细胞脂质代谢异常和神经炎症激活的核心调控因子，并开发了针对微胶质细胞特异性ACSL1沉默的双靶向脂质纳米颗粒系统 | 研究主要基于动物和细胞模型，在AUD患者中的直接验证有限；ACSL1抑制的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究酒精使用障碍导致认知缺陷的细胞和分子机制，特别是微胶质细胞的作用 | 酒精使用障碍患者、动物模型（小鼠）、细胞模型（微胶质细胞） | 神经科学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2026-02-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2026-Feb-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.106410
PMID:41637132
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析X射线辐射对果蝇翅盘组织的影响，揭示了细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 | 采用单细胞转录组学结合赫芬达尔-赫希曼指数量化基因表达异质性，并识别出辐射响应中区域性和细胞周期依赖的亚群 | 研究仅针对果蝇翅盘这一相对简单的上皮组织，可能无法完全代表更复杂组织或哺乳动物系统的辐射响应 | 探究X射线辐射下组织细胞响应的异质性机制 | 果蝇翅盘组织中的细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及辐射和未辐射的果蝇翅盘细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2026-02-07 |
Molecular architecture of human dermal sleeping nociceptors
2026-Feb-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.048
PMID:41643676
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、电生理学表征和空间转录组学数据，揭示了人类皮肤中休眠伤害感受器的分子标记物 | 首次结合Patch-seq方法，在猪感觉神经元中功能性地识别了CMis，并发现了OSMR和SST作为其标记基因，为神经性疼痛的靶向治疗提供了新框架 | 研究主要基于猪模型和人类志愿者注射实验，样本规模有限，且需进一步验证在人类患者中的直接应用 | 探索人类皮肤中休眠伤害感受器的分子结构，以寻找神经性疼痛的靶向治疗策略 | 人类皮肤休眠伤害感受器（CMis）、猪感觉神经元、健康人类志愿者 | 神经科学 | 神经性疼痛 | 单细胞转录组学、电生理学表征（膜片钳）、空间转录组学、跨物种转录组数据整合 | NA | 转录组数据、电生理数据 | 涉及猪感觉神经元和健康人类志愿者，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 334 | 2026-02-07 |
Heterogeneous responses of IM19 anti-CD19 CAR T-cell therapy in refractory systemic lupus erythematosus: an open-label pilot study and a mini-review
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.014
PMID:41644365
|
研究论文 | 本研究评估了IM19抗CD19 CAR T细胞疗法在难治性系统性红斑狼疮（SLE）患者中的疗效和安全性，特别关注狼疮性肾炎（LN） | 首次在难治性SLE患者中评估IM19 CAR T细胞疗法的临床效果，并结合单细胞RNA测序分析B细胞重建情况 | 研究为单臂开放标签试验，样本量较小（仅6例患者），且缺乏长期随访数据 | 评估CAR T细胞疗法在难治性SLE及LN中的疗效和安全性 | 难治性系统性红斑狼疮伴肾脏受累的患者 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 6例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2026-02-07 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
|
研究论文 | 本研究通过遗传学、单细胞RNA测序、功能实验和小鼠模型，探讨了NOTCH4基因变异在系统性硬化症血管病变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次在非裔美国人系统性硬化症患者中，通过基因关联分析发现NOTCH4变异与严重血管表型相关，并验证了NOTCH4信号通路在血管生成和内皮-间质转化中的关键作用 | 研究主要聚焦于非裔美国人群体，可能限制了结果在其他种族中的普适性；临床样本量相对有限 | 探究系统性硬化症中严重血管表型的遗传基础，特别是非裔美国人患者预后较差的原因 | 非裔美国人系统性硬化症患者，以及相关的细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序，功能实验，小鼠模型 | NA | 遗传数据，单细胞RNA测序数据，功能实验数据 | 非裔美国人系统性硬化症患者及对照群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2026-02-07 |
Tumor cell derived CCL20 exacerbates the immunosuppressive microenvironment by recruiting CCR6+ Tregs in pancreatic cancer
2026-Feb-03, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218290
PMID:41643988
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌细胞通过分泌CCL20招募CCR6+调节性T细胞，从而塑造免疫抑制微环境，并证明靶向CCL20-CCR6轴可增强抗PD1免疫检查点阻断的疗效 | 首次在胰腺癌中系统阐明了肿瘤细胞来源的CCL20通过招募CCR6+调节性T细胞塑造免疫抑制微环境的机制，并验证了靶向该轴与免疫检查点阻断联合治疗的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；未深入探讨CCL20表达调控的上游信号通路 | 探究胰腺癌免疫抑制微环境的形成机制并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌肿瘤微环境中的CCL20-CCR6轴及其对免疫细胞浸润的调控 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，基因敲除小鼠模型 | 基因敲除小鼠模型（CCL20 KO, CCR6条件性敲除） | 基因表达数据，免疫组织化学图像，单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及患者组织样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 337 | 2026-02-07 |
Hydroxypinacolone 9-cis Retinoate Mitigates UV-Induced Photoaging by Modulating ECM, Fibroblasts, Inflammation, and Melanogenesis
2026-Feb-03, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.01.020
PMID:41644086
|
研究论文 | 本研究评估了羟基频哪酮9-顺式视黄酸酯（9-cis HPR）在缓解紫外线诱导的光老化中的作用，通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了其通过调节细胞外基质、成纤维细胞、炎症和黑色素生成来改善皮肤结构和功能的机制 | 首次将9-cis HPR应用于光老化模型，并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术全面解析其通过多信号通路（如NPY-NPY1R、PTN-SDC2）调节成纤维细胞修复和抑制黑色素细胞增殖的分子机制，同时通过临床试验验证其安全性和有效性 | 研究样本量较小（31名中国女性），且为单盲试验，可能影响结果的普遍性；动物模型为SKH-1小鼠，与人类皮肤存在差异 | 评估9-cis HPR作为新型视黄酸衍生物在缓解光老化中的疗效和安全性，并探索其分子机制 | SKH-1小鼠光老化模型和31名中国女性参与者 | 数字病理学 | 皮肤光老化 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，临床评估数据 | SKH-1小鼠模型和31名中国女性 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 338 | 2026-02-07 |
LineGRN: A Line Graph Neural Network for Gene Regulatory Network Inference
2026-Feb, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3591840
PMID:40699953
|
研究论文 | 提出了一种名为LineGRN的线图神经网络框架，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 通过建模基因对之间的邻域关系，有效保留拓扑结构中的交互信号，并利用线图变换产生高节点度主导的局部网络拓扑，实现更高效的信息传播 | 未明确提及具体局限性 | 推断基因调控网络以揭示转录因子与靶基因之间的复杂相互作用 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线图神经网络 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2026-02-07 |
EnsembleRegNet: Interpretable deep learning for transcriptional network inference from single-cell RNA-seq
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种名为EnsembleRegNet的深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 通过集成编码器-解码器和多层感知机架构，结合Hodges-Lehmann估计器二值化、案例删除分析、RcisTarget基序富集和AUCell调控子活性评分，提升了网络推断的鲁棒性和生物学可解释性 | NA | 从高维单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络的结构 | 转录因子与靶基因之间的调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成编码器-解码器, 多层感知机 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 340 | 2026-02-07 |
Lactylation-Related Gene Signature and Immune Infiltration Crosstalk in Heart Failure: Insights From Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2026-Feb-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001775
PMID:41252712
|
研究论文 | 本研究通过批量与单细胞转录组学分析，探讨了乳酰化相关基因特征与免疫浸润在心力衰竭中的相互作用 | 首次系统性地将蛋白质乳酰化修饰与心力衰竭的免疫微环境联系起来，并构建了基于乳酰化相关基因的诊断模型和基因特征 | 研究结果主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证来确认乳酰化修饰在心力衰竭中的具体调控机制 | 探索乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用，并识别相关的生物标志物和潜在治疗靶点 | 心力衰竭患者样本、小鼠心力衰竭模型以及相关的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 无监督聚类, 诊断模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 200个心力衰竭样本和166个非心力衰竭样本，以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |