单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 3608 篇文献,本页显示第 321 - 340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2026-03-24
The transcription factor Tcf21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2026-Apr-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究探讨了转录因子Tcf21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的关键作用 首次将Tcf21鉴定为肾脏基质细胞身份的关键决定因子,并揭示其缺失导致新型Emcn高表达基质细胞群的扩增,从而连接发育命运与成年期纤维化疾病 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏中的适用性尚需验证;且未深入探讨Tcf21下游的具体分子通路 阐明肾脏发育中基质祖细胞命运决定的分子机制 小鼠胚胎肾脏中的Foxd1+基质祖细胞及其衍生细胞类型 发育生物学 肾脏疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫染色, 组织学分析 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 组织图像 胚胎期E14.5和E18.5的小鼠肾脏样本,包括Tcf21条件敲除和对照 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
322 2026-03-24
Single-Cell Analysis of Chemotherapy-induced Remodeling Reveals CD276-driven Basal-like Chemoresistance in Pancreatic Cancer
2026-Apr, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺导管腺癌患者化疗前后的肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境重塑,揭示了CD276/B7-H3在驱动基底样化疗耐药中的关键作用 首次在单细胞分辨率下表征了化疗诱导的胰腺癌恶性状态和免疫微环境的动态重塑,并识别出由SNCG+基底样肿瘤细胞、SPP1+肿瘤相关巨噬细胞和耗竭T细胞组成的化疗耐药生态位,同时发现CD276/B7-H3作为双重功能免疫检查点促进化疗耐药 样本量相对较小(28例患者),且研究主要基于观察性数据,需要进一步的功能验证和临床试验来确认CD276/B7-H3作为治疗靶点的有效性 探究化疗如何重塑胰腺导管腺癌的肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境,以影响临床结局 胰腺导管腺癌患者(28例)的配对治疗前后肿瘤活检样本和外周血单核细胞,以及KPC小鼠模型和裸鼠异种移植肿瘤 单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,空间转录组学,CRISPR-Cas9敲除,肿瘤杀伤实验 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据,免疫荧光图像 28例胰腺导管腺癌患者的配对治疗前后肿瘤活检样本和外周血单核细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10X Visium HD 10X Visium HD空间转录组学平台,分辨率达2微米
323 2026-03-24
Overcoming CXCR4-Mediated T-Cell Exclusion Potentiates Antitumor Cytotoxicity in Fibrolamellar Carcinoma
2026-Apr, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究探讨了纤维板层型肝癌中CXCR4介导的T细胞排斥如何限制抗肿瘤免疫反应,并通过联合CXCR4和PD-1阻断在人类肿瘤切片培养模型中增强抗肿瘤细胞毒性 首次在纤维板层型肝癌中利用单核RNA测序和空间蛋白质组学揭示CXCL12+肌成纤维细胞与CXCR4+淋巴细胞间的相互作用介导T细胞排斥,并证明联合CXCR4和PD-1阻断可协同克服免疫抵抗 研究基于人类肿瘤切片培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性,且样本量有限,作为罕见癌症,需要进一步临床验证 探究纤维板层型肝癌免疫治疗反应受限的机制,并开发联合免疫治疗策略 纤维板层型肝癌患者的肿瘤组织及肿瘤免疫微环境 数字病理学 肝癌 单核RNA测序, 多重免疫组化, 活体成像, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 人类肿瘤切片培养系统 RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质组数据 未明确指定样本数量,但涉及纤维板层型肝癌患者组织 NA 单核RNA测序, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 NA NA
324 2026-03-24
Krüppel-like factor 2 regulates renin expression in mature juxtaglomerular cells
2026-Apr-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究探讨了Krüppel-like factor 2 (Klf2)在成熟肾小球旁细胞中调节肾素表达的机制 首次通过多组学分析揭示Klf2与肾素细胞身份相关,并利用条件性敲除小鼠模型证实Klf2在连接血流动力学信号与肾素转录中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类肾素细胞中的Klf2功能尚需进一步验证 阐明Klf2在肾素表达调控中的作用及其对血压调节的影响 小鼠肾素谱系细胞,特别是成熟肾小球旁细胞 分子生物学与生理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,条件性基因敲除,免疫组织化学,血压测量 条件性敲除小鼠模型 基因表达数据,组织形态数据,血压数据 未明确指定样本数量,但涉及多个年龄组和实验条件的小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
325 2026-03-24
DNAJA1 as a modulator of CD8+ T-cell function and prognosis in lung cancer: implications for immune regulation and therapeutic targeting
2026-Apr, Journal of drug targeting IF:4.3Q1
研究论文 本研究揭示了DNAJA1在肺腺癌中通过表观遗传激活驱动CD8+ T细胞耗竭和促肿瘤巨噬细胞极化,并可作为免疫失调肿瘤微环境中患者的潜在生物标志物 首次将DNAJA1确立为通过表观遗传机制协调CD8+ T细胞耗竭和巨噬细胞极化的关键免疫调节因子,并揭示了其与PD-L1表达的相关性 研究主要基于体外实验和异种移植模型,在人体内的直接功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 探究DNAJA1在肺腺癌免疫调节和肿瘤进展中的作用机制 肺腺癌组织、CD8+ T细胞、巨噬细胞、肿瘤细胞系 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、甲基化分析、共培养实验、染色质分析、功能实验、异种移植模型 NA 测序数据、表观遗传数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
326 2026-03-24
Splicing variants in MYRF cause partial loss of function in the retinal pigment epithelium leading to nanophthalmos
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过体外和动物模型实验,揭示了MYRF基因剪接变体导致其功能部分丧失,从而引发视网膜色素上皮功能缺陷,最终导致小眼症的分子机制 首次将MYRF C-末端变体(dG-MYRF)鉴定为一种低效等位基因,并发现两种导致无功能亚型的MYRF剪接变体与孤立性小眼症相关,支持了组织特异性阈值效应的假说 动物模型中纯合dG-MYRF变体导致胚胎致死,限制了其在出生后表型的研究;研究主要聚焦于特定变体,其他MYRF变体的功能影响尚未全面探索 探究MYRF基因变异导致孤立性小眼症而非综合征性疾病的分子机制差异 MYRF基因剪接变体、视网膜色素上皮细胞、人源化MYRF C-末端小鼠模型 遗传学与分子生物学 眼科疾病 单细胞RNA测序、体外功能实验、动物模型构建 小鼠基因工程模型 基因表达数据、单细胞转录组数据 人类RPE细胞、原代RPE细胞、E17.5和E15.5及P0时间点的小鼠胚胎组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
327 2026-03-24
Combined single-cell transcriptome and immune repertoire analysis reveals hepatic and renal immune injury by heat stroke
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学、T细胞受体测序和流式细胞术分析,揭示了热射病(特别是劳力性热射病)中肝脏和肾脏免疫损伤的机制 首次结合单细胞转录组和免疫组库分析,识别出热射病中富集的颗粒酶阳性T细胞、CD56dim NK细胞和IL-1B+NLRP3+单核细胞,并发现阻断NLRP3炎症小体通路可减轻器官损伤 样本量较小(仅27名参与者),且研究主要关注外周血单个核细胞,可能未全面反映组织特异性免疫反应 探索热射病(特别是劳力性热射病)的免疫病理学机制 9名健康对照者、9名热衰竭患者和9名劳力性热射病患者的PBMCs 单细胞组学 热射病 单细胞转录组学、T细胞受体测序、流式细胞术 NA 单细胞RNA-seq数据、TCR序列数据、流式细胞数据 27名参与者(9名健康对照、9名热衰竭患者、9名劳力性热射病患者) NA 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序 NA NA
328 2026-03-24
Hypothyroidism impairs skeletal muscle regeneration after injury by altering myogenic and nonmyogenic pathways
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和FUCCI报告小鼠模型,揭示了甲状腺功能减退通过改变成肌和非成肌通路损害骨骼肌损伤后再生过程 首次结合scRNA-seq和FUCCI报告系统,系统揭示了甲状腺功能减退对骨骼肌再生中成肌谱系多样性、细胞周期进程及非成肌细胞动态的双重调控机制 研究基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;损伤模型为化学诱导,可能与临床创伤修复存在差异 阐明甲状腺激素信号在骨骼肌再生中的具体作用通路 小鼠胫骨前肌在心脏毒素诱导损伤后的再生过程 单细胞组学 肌肉疾病 单细胞RNA测序 FUCCI报告小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确样本数量的小鼠骨骼肌组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
329 2026-03-24
Extracellular vesicle miR-93-5p cargo regulates glomerular endothelial cell damage in Alport syndrome
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了miR-93-5p在Alport综合征中减轻肾小球损伤的作用,以及人羊水干细胞来源的细胞外囊泡(hAFSC-EVs)通过其miR-93-5p货物介导疾病修饰活性的机制 首次揭示了miR-93-5p在肾小球内皮细胞中的下调与Alport综合征进展相关,并证明hAFSC-EVs通过传递miR-93-5p调节VEGFR1和VEGFR2信号通路,从而恢复肾小球内皮细胞功能 研究主要基于体外和动物模型,人类患者数据验证有限,且未详细探讨miR-93-5p在其他肾细胞类型中的作用 探究miR-93-5p在Alport综合征肾小球损伤中的保护作用及hAFSC-EVs的治疗机制 肾小球内皮细胞、人羊水干细胞来源的细胞外囊泡(hAFSC-EVs)、Alport综合征动物模型及患者活检组织 分子生物学与病理学 Alport综合征 空间转录组学、空间分子成像、转录组学、蛋白质组学 NA 转录组数据、蛋白质组数据、空间成像数据 动物模型及患者活检组织,具体样本数量未明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
330 2026-03-24
Macrophages expressing macrophage receptor with collagen structure attenuate liver fibrosis through a tissue restoration phenotype
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现并验证了表达胶原结构巨噬细胞受体(MARCO)的巨噬细胞亚群在肝纤维化中具有组织修复表型,并能通过与肝星状细胞相互作用减轻纤维化 首次在肝纤维化模型中通过单细胞RNA-seq鉴定出MARCO高表达巨噬细胞亚群,并证明其具有独特的组织修复表型,能通过调节肝星状细胞功能减轻纤维化 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类肝纤维化样本中得到验证;MARCO+巨噬细胞的具体作用机制仍需进一步阐明 探究巨噬细胞在肝纤维化中的作用,特别是MARCO+巨噬细胞亚群的功能 小鼠肝纤维化模型中的巨噬细胞和肝星状细胞 单细胞组学 肝纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠肝纤维化模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
331 2026-03-24
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-Cell Data Analysis
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文通过综合实验评估了基础模型在单细胞测序数据分析中的性能,并提出了scEval评估框架 首次对十种单细胞基础模型在八个下游任务中进行系统性评估,揭示了基础模型与任务特定方法的性能差异,并提出了训练优化指南 研究发现单细胞基础模型并非在所有任务中都优于任务特定方法,这挑战了开发单细胞基础模型的必要性 评估基础模型在单细胞数据分析中的效用和性能 单细胞测序数据 机器学习 NA 单细胞测序 基础模型(包括scGPT、Geneformer、CellFM等) 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
332 2026-03-24
scResponse: A Rank-Based Method for Identifying Cell States That Contribute to Immunotherapy Response by Single-Cell Data
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一种名为scResponse的基于排序的方法,通过单细胞数据识别影响免疫治疗反应的细胞状态 scResponse算法首次量化单细胞对免疫治疗的反应,能捕捉多种细胞亚型和状态(如血管细胞正常化、巨噬细胞极化、CD8 T细胞终末耗竭及成纤维细胞亚型)对疗效的细微影响,并跨癌症整合分析识别关键代谢通路 方法作为概念验证,主要依赖计算分析,实验验证仅限于肿瘤-CD8 T细胞共培养和小鼠模型,尚未在广泛临床样本中验证 开发一种评估免疫治疗疗效的单细胞分辨率方法,以促进新免疫治疗增敏策略的机制理解和靶点发现 单细胞数据中的细胞状态,包括血管细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞和成纤维细胞亚型 单细胞分析 癌症 单细胞测序 基于排序的算法 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
333 2026-03-24
Integrative machine learning analysis suggests novel molecular targets for liver cancer diagnosis and therapy
2026-Mar-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合机器学习与基因组数据分析,识别了肝细胞癌的关键分子靶点并开发了一个8基因诊断模型 结合WGCNA、单细胞测序和多种机器学习算法,发现了一个新的8基因诊断签名,在训练队列中AUC达到1.000,并在外部数据集中得到验证 研究依赖于公共微阵列数据集,可能受样本异质性和平台差异影响,且需要进一步实验验证 通过识别关键分子靶点和通路,提高肝细胞癌的及时有效诊断和治疗 肝细胞癌患者与对照组的基因表达数据 机器学习 肝癌 微阵列分析,单细胞测序,WGCNA,ssGSEA 多种机器学习算法 基因表达数据 来自NCBI GEO的微阵列数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
334 2026-03-24
Mathematical dissection of tumor phenotypic heterogeneity in a spatial data-informed nonlocal reaction-diffusion model
2026-Mar-22, Journal of mathematical biology IF:2.2Q2
研究论文 本研究提出了一个结合空间基因表达数据的非局部反应-扩散模型,用于严格分析血管化肿瘤内的表型异质性和进化 首次将非局部反应-扩散模型与真实空间转录组学数据相结合,以量化肿瘤细胞空间密度、表型状态和血管分布,并识别表型异质性的关键决定因素 模型在具有高空间和表型维度的情况下进行严格数学分析仍然具有挑战性,且先前研究很少通过整合模型与真实空间数据来探索表型异质性的关键决定因素 剖析血管化肿瘤内的表型异质性和进化 肿瘤细胞 机器学习 肿瘤 空间转录组学 非局部反应-扩散模型 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
335 2026-03-24
Integrated single-cell and bulk transcriptomics reveals STAB1 as a novel therapeutic target for ovarian cancer
2026-Mar-21, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组学,结合机器学习算法,揭示了STAB1作为卵巢癌新型治疗靶点的重要性 首次通过整合单细胞和批量转录组学,结合机器学习算法,将STAB1识别为连接免疫抑制基质和恶性上皮的关键“双检查点”分子 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内模型验证 解析卵巢癌的免疫抑制肿瘤微环境和异质性,以识别新的治疗靶点 卵巢癌(OC)的肿瘤微环境、STAB1基因、卵巢癌细胞系(A2780和SK-OV-3) 数字病理学 卵巢癌 单细胞转录组学、批量转录组学、机器学习算法(LASSO和SVM-RFE) 集成机器学习算法 转录组数据 多队列批量转录组数据及单细胞分析样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
336 2026-03-24
IL-4 treatment induces apoptosis of blood monocytes and proliferation of recruited injury-associated macrophages to resolve liver injury
2026-Mar-20, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究探讨了IL-4在急性肝损伤模型中的作用机制,发现其通过诱导血液单核细胞凋亡和促进损伤相关巨噬细胞增殖来促进肝损伤修复 揭示了IL-4治疗通过改变损伤相关髓系细胞的组成、数量和功能来促进肝损伤修复的新途径 研究主要基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;未详细探讨IL-4在其他器官损伤中的普适性 阐明IL-4在肝损伤修复中的治疗机制 小鼠急性肝损伤模型中的髓系细胞(单核细胞和巨噬细胞) NA 肝损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
337 2026-03-24
Methods of muscle atrophy analysis at the single-nucleus level
2026-Mar-20, Mechanisms of ageing and development IF:5.3Q1
研究论文 本文介绍了一种针对骨骼肌的组织解离和细胞核分离的详细协议,并概述了适用于单细胞核RNA测序数据的生物信息学分析流程 优化了骨骼肌的单细胞核RNA测序样本制备方法,并提供了针对肌肉萎缩状态的转录组比较分析流程 NA 研究肌肉萎缩的分子机制,特别是在衰老和神经肌肉病理条件下的肌肉功能衰退 骨骼肌组织,特别是肌肉纤维的细胞核 数字病理学 老年疾病 单细胞核RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
338 2026-03-24
PRAMEL12 orchestrates spermiogenesis to ensure male fertility in mice
2026-Mar-20, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过基因敲除小鼠模型,揭示了PRAMEL12在精子发生中的关键作用,其缺失导致精子染色质凝聚缺陷和雄性不育 首次明确了PRAMEL12作为精子发生必需调控因子的功能,并揭示了其通过调控组蛋白-鱼精蛋白转换过程影响精子染色质凝聚的新机制 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的功能验证尚需进一步研究 探究PRAMEL12在精子发生过程中的具体功能及其导致雄性不育的分子机制 Pramel12基因敲除小鼠及其精子发生过程 生殖生物学 雄性不育症 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、组织化学分析 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、蛋白质组数据、组织学图像 未明确具体数量的小鼠样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
339 2026-03-24
Single-cell sequencing reveals metabolic reprogramming and immune regulation underlie the maintenance of teleost granulomas
2026-Mar-20, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组织转录组学、单细胞RNA测序、超微结构成像和荧光原位杂交技术,揭示了硬骨鱼肉芽肿维持的代谢重编程和免疫调控机制 首次在脊椎动物中解析了肉芽肿的代谢和功能景观,发现了上皮样巨噬细胞(E-Macs)的代谢适应和表型转换,并证明这些特征在斑马鱼中是进化保守的 研究主要基于硬骨鱼感染模型,在哺乳动物中的普适性仍需验证;单细胞测序数据主要来自感染后期,动态变化过程有待进一步研究 探究脊椎动物肉芽肿维持的生物能量学和调控机制 大口黑鲈(Micropterus salmoides)-诺卡氏菌(Nocardia seriolae)感染模型,以及斑马鱼 单细胞生物学 慢性肉芽肿性疾病 多组织转录组学, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 超微结构成像, 荧光原位杂交(FISH) NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 涉及多个组织(头肾、脾脏、肝脏、肾脏)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
340 2026-03-24
Targeting BATF: A new strategy for cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 本文综述了BATF作为癌症免疫治疗新靶点的研究进展,重点关注其在CD8 T细胞发育和耗竭中的作用 强调了BATF作为新型免疫治疗靶点的潜力,并探讨了其与PD-1表达之间的正反馈机制 NA 为抗肿瘤免疫治疗提供新的见解和方法 BATF转录因子及其在T细胞中的作用 NA 癌症 单细胞测序技术 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部