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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3361 | 2026-07-27 |
Multi-omics profiling identifies CDK1 as a key mediator of mitosis through the PTN pathway in bladder cancer
2026-Dec, Future science OA
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/20565623.2026.2696931
PMID:42401786
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定CDK1在膀胱癌中通过PTN通路介导有丝分裂的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示CDK1在膀胱癌上皮细胞中通过PTN通路调控有丝分裂的机制,并识别Dinaciclib为潜在靶向抑制剂 | 未说明具体局限性 | 表征CDK1在膀胱癌中的表达,阐明其在细胞间信号传导和有丝分裂中的作用,并识别靶向CDK1的小分子抑制剂 | 膀胱癌组织样本及公共数据库中的RNA测序数据 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据, 空间转录组图像, 蛋白质表达数据 | 多个数据库的RNA测序数据及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3362 | 2026-07-27 |
POU2F2 as a dual oncogenic and immunomodulatory driver in kidney renal clear cell carcinoma
2026-Dec, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2026.2700062
PMID:42421306
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研究论文 | 探讨转录因子POU2F2在肾透明细胞癌中的致癌与免疫调控作用 | 首次揭示POU2F2在肾透明细胞癌中兼具致癌驱动因子和免疫微环境调节因子的双重功能 | 未提及具体局限性 | 研究POU2F2在肾透明细胞癌的发生发展及巨噬细胞极化中的作用 | 肾透明细胞癌细胞及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序、空间转录组学、基因敲降、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、细胞实验数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3363 | 2026-07-27 |
Mitochondria-related pathogenic genes in acute and chronic kidney disease: a Mendelian randomization study
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2698274
PMID:42421394
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研究论文 | 利用孟德尔随机化方法探究线粒体相关基因在急性和慢性肾病中的潜在关联 | 首次通过汇总数据孟德尔随机化(SMR)整合DNA甲基化、基因表达和蛋白质表达定量性状位点数据,系统鉴定与急性和慢性肾病共享的线粒体相关致病基因 | 发现的共享基因NIPSNAP1在肾皮质组织中与AKI和CKD风险相关,但效应量较小(OR 0.95),且部分基因仅在CKD中特异,需进一步功能验证 | 探索线粒体相关基因与急性肾损伤和慢性肾病的分子关联 | 来自MitoCarta3.0数据库的线粒体相关基因,以及DNA甲基化、基因表达和蛋白质表达定量性状位点数据 | 机器学习 | 急性肾损伤,慢性肾病 | 汇总数据孟德尔随机化,全基因组关联研究 | NA | 基因型数据,甲基化数据,表达数据,蛋白质数据 | 发现数据集来自美国百万退伍军人项目,验证数据集来自英国生物银行 | NA | NA | NA | NA |
| 3364 | 2026-07-27 |
KIAA0101 in human cancers: From biomarker discovery to therapeutic targeting
2026-Sep, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189648
PMID:42385916
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综述 | 系统综述KIAA0101在人类癌症中的结构特征、调控网络、细胞功能、疾病特异性作用、免疫微环境关联及转化意义 | 强调KIAA0101的免疫相关效应可能通过NF-κB和Wnt/β-catenin等间接调控途径介导,而非直接转录控制免疫检查点基因 | 现有研究受限于描述性关联、小规模回顾性队列、缺乏异构体分辨的检测方法以及不完整的机制验证 | 评估KIAA0101从癌症相关分子转化为临床可操作生物标志物或治疗靶点的潜力 | KIAA0101(PCNA钳关联因子)在多种人类恶性肿瘤中的表达及功能 | 癌症生物学, 生物信息学 | 多种癌症(恶性肿瘤) | 转录组测序, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 多个回顾性队列(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium 单细胞3', 10x Visium 组织切片, Illumina NovaSeq 测序平台 |
| 3365 | 2026-07-27 |
Tubular PFKFB3 drives diabetic kidney fibrosis via lactate‑dependent H4K12 lactylation and HIPK2 transactivation
2026-Sep, International journal of molecular medicine
IF:5.7Q1
DOI:10.3892/ijmm.2026.5926
PMID:42464649
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research paper | 研究发现肾小管上皮细胞中PFKFB3通过乳酸依赖的H4K12乳酰化和HIPK2反式激活驱动糖尿病肾纤维化 | 首次揭示了糖酵解终产物乳酸通过组蛋白乳酰化修饰(H4K12la)在糖尿病肾病中的表观遗传调控机制,特别是PFKFB3通过乳酸促进HIPK2转录的新途径 | 主要基于动物模型和体外实验,临床样本验证相对有限;潜在的其他组蛋白乳酰化位点或下游靶基因未充分探讨 | 阐明肾小管上皮细胞中糖酵解驱动因子PFKFB3通过乳酸和组蛋白乳酰化促进糖尿病肾病纤维化的分子机制 | 糖尿病肾病患者肾小管上皮细胞、DKD小鼠模型及体外培养的细胞 | machine learning | 糖尿病肾病 | 空间转录组学、CUT&Tag、ChIP-qPCR、RT-qPCR、Western blot | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、乳酰化修饰数据 | DKD患者肾小管上皮细胞样本及DKD小鼠模型样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3366 | 2026-07-27 |
Donor-specific, but not sex-specific, signatures dominate cell-type classification in lung scRNA-seq data
2026-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102692
PMID:42502274
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研究论文 | 通过分析肺单细胞RNA测序数据,发现供体特异性而非性别特异性信号主导细胞类型分类 | 揭示了供体差异对单细胞RNA-seq细胞类型分类器性能的负面影响,并证明即使在高度性别偏斜的训练数据下,模型仍能同等良好地分类雄性和雌性细胞 | 研究仅基于肺scRNA-seq数据,可能不适用于其他组织;未深入探讨供体差异的具体生物学机制 | 研究供体差异和性别差异对单细胞RNA-seq细胞类型自动分类的影响 | 肺单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞类型分类器 | 基因表达数据 | 来自多个供体的肺scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3367 | 2026-07-27 |
Single-cell transcriptomics identifies a p21-activated kinase important for survival of the zoonotic parasite Fasciola hepatica
2026-Aug-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116778
PMID:42502390
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析全球流行的寄生扁虫肝片吸虫的细胞类型和细胞特异性基因表达,并发现p21激活激酶PAK4对寄生虫生存至关重要 | 首次在肝片吸虫中利用单细胞转录组学鉴定出15个细胞簇,并发现高表达蛋白激酶的ELF5-和TRPM-表达细胞簇,其中PAK4激酶可作为新药靶点 | 未明确提及局限性 | 解析多细胞病原体的细胞组成,为药物发现提供新靶点 | 肝片吸虫的19581个细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序、RNA速度分析、空间转录组学 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 19,581个肝片吸虫细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学 |
| 3368 | 2026-07-27 |
Single-cell transcriptomics reveals epithelial-stromal crosstalk underlying fibrotic remodeling in frontal fibrosing alopecia
2026-Aug-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116854
PMID:42502412
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示额叶纤维性脱发中上皮-基质相互串扰驱动纤维化重塑的机制 | 首次通过单细胞RNA测序全面解析FFA病变头皮中毛囊皮脂腺单元的上皮、基质和免疫细胞状态及谱系轨迹,提出上皮应激重编程驱动基质激活的非对称动态模型 | 未提及样本量限制、实验验证或因果机制的直接证据 | 阐明FFA中毛囊周围纤维化和不可逆脱发的细胞与分子机制 | FFA患者病变头皮组织及匹配对照的头皮组织 | 数字病理学 | 额叶纤维性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞转录组) | 38984个细胞(来自FFA患者病变头皮和匹配对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达试剂盒 |
| 3369 | 2026-07-27 |
Renal Phosphate Reabsorption in Humans Depends on at Least Three Distinct Transporters Unlike in Mice
2026-Aug, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70271
PMID:42494142
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research paper | 研究发现人类肾脏磷酸盐重吸收依赖至少三种转运蛋白,与小鼠存在显著差异 | 首次直接测量人类肾脏钠-磷酸共转运体活性,揭示物种间、年龄和性别依赖的转运蛋白功能差异 | 未明确说明局限性 | 探究肾脏磷酸盐转运对物种、年龄和性别的依赖性 | 人类和小鼠肾脏刷状缘膜囊泡(BBMV) | NA | NA | 放射性通量测量、免疫印迹、免疫荧光、scRNA-seq | NA | NA | 人类新生儿(0-11个月)和成人(51-63岁)肾脏样本,年龄匹配的小鼠肾脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3370 | 2026-07-27 |
Down-Regulation of TFEB With Defective Autophagy in the Susceptibility of Aging Kidneys to Septic Acute Kidney Injury
2026-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70644
PMID:42479943
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研究论文 | 发现老年肾脏在脓毒症急性肾损伤中的易感性与自噬缺陷和TFEB下调有关 | 首次揭示衰老肾脏中自噬激活缺陷是其对脓毒症急性肾损伤易感的关键机制,并通过单细胞测序发现TFEB在其中的作用 | 具体机制尚未完全阐明,且仅在小鼠模型中验证 | 探索老年肾脏对脓毒症急性肾损伤易感性的分子机制 | 小鼠肾脏及衰老肾近端小管细胞 | 医学研究 | 脓毒症急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老龄和年轻小鼠的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3371 | 2026-07-27 |
Single Cell and Spatially Resolved Transcriptome and Immune Repertoire of Mouse Thymus During Aging Reveal Immunological Heterogeneity and Direction of Thymic Selection Pressure
2026-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70631
PMID:42502193
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研究论文 | 通过构建小鼠胸腺的空间转录组和免疫库图谱,揭示衰老过程中胸腺的免疫异质性和选择压力方向 | 首次整合单细胞和空间分辨率技术构建胸腺衰老过程中的空间免疫库图谱,并开发TCR特异性扩增的空间TCR-seq方法,揭示TCR配对过程及其在胸腺选择压力下的动态特征 | 未明确提及研究局限,但可能包括样本量有限或技术验证不足 | 研究胸腺衰老过程中的转录组和免疫库空间异质性 | 小鼠胸腺在衰老过程中的T细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 老年病 | scRNA-seq, ST-seq, spatial-TCR-seq, scTCR-seq, TCR-seq | NA | 转录组数据, 免疫库序列数据 | 小鼠胸腺样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫库测序 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA-seq, 10x Visium空间转录组学, 结合TCR特异性扩增的空间TCR-seq |
| 3372 | 2026-07-27 |
Emerging applications of single cell and spatial transcriptomics under abiotic soil stress conditions
2026-Jul-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag375
PMID:42500918
|
综述 | 探讨单细胞和空间转录组学在非生物土壤胁迫条件下应用于作物根系研究的新兴进展与挑战 | 本文针对实际土壤环境的复杂性,强调单细胞与空间转录组学在解析根系细胞特异性转录响应方面的优势,与传统批量转录组学相比,能捕捉到空间和时间上精细变化的胁迫信号 | 大多数研究仍基于简化条件(如凝胶、水培或人工化学处理),缺乏真正原位农业土壤系统的空间图谱,且未充分整合根系生长的时间动态及水分、机械应力、气体扩散、微生物群落和营养梯度等局部测量数据 | 理解作物根系在非生物土壤胁迫下的细胞级转录调控机制,推动方法从简化环境向真实土壤条件转化 | 作物根系及其在异质土壤环境中的细胞转录响应 | 机器学习 | 非适用 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非适用 | 转录组数据 | 非适用 | 非适用 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非适用 | 非适用 |
| 3373 | 2026-07-27 |
Prdm15 deficiency perturbs hematopoietic stem and progenitor cell homeostasis
2026-Jul-25, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.07.009
PMID:42501896
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研究论文 | Prdm15缺失扰乱造血干细胞和祖细胞稳态 | 首次发现Prdm15缺陷导致造血干细胞累积,并阐明了其通过影响KMT2C和组蛋白修饰来调控造血稳态的分子机制 | 未涉及Prdm15在人类造血系统中的作用,且小鼠模型可能存在物种特异性差异 | 探究Prdm15在造血干细胞和祖细胞稳态维持中的调控作用及机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, CUT&Tag测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 小鼠造血干细胞和祖细胞样本(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 3374 | 2026-07-27 |
Single-cell analysis of the epigenome and 3D chromatin architecture in the human retina
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9162
PMID:42490430
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析研究人视网膜的表观基因组和3D染色质结构 | 首次在单细胞水平上整合了人视网膜的基因表达、染色质可及性、DNA甲基化和三维染色质结构,并利用深度学习解释非编码风险变异 | 未明确提及,可能受限于样本来源或技术验证的深度 | 解析人视网膜细胞类型的转录调控元件,并建立单细胞多组学图谱以研究眼部疾病 | 人视网膜、黄斑和视网膜色素上皮/脉络膜组织 | 机器学习 | 眼部疾病 | 单细胞多组学分析 | 深度学习模型 | 单细胞基因表达、染色质可及性、DNA甲基化、3D染色质结构数据 | 人类视网膜样本中的23种视网膜细胞类型 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3375 | 2026-07-27 |
Mechanisms and therapeutic targets in distant metastasis of lung adenocarcinoma
2026-Jul-24, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02817-y
PMID:42493498
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研究论文 | 整合数字空间分析和多重免疫荧光技术,开发肺腺癌器官特异性转移风险预测模型并探索其分子机制 | 首次基于原发肿瘤空间转录组数据,应用随机森林模型高精度预测肺腺癌向脑、肝、肾上腺和骨的特异性转移,并揭示肿瘤、免疫及基质细胞中器官趋向性相关的关键基因表达特征 | 样本量较小(仅52例肺腺癌患者),可能影响模型的泛化能力 | 阐明肺腺癌远处转移的器官趋向性分子机制并识别治疗靶点 | 52例肺腺癌患者的原发肿瘤组织及对应转移灶 | 数字病理学 | 肺癌 | 数字空间分析(DSP)、多重免疫荧光(mIF) | 随机森林 | 空间转录组数据、临床数据 | 52例肺腺癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3376 | 2026-07-27 |
ELF3 links kidney function GWAS loci to maladaptive epithelial inflammation
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec6741
PMID:42497247
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研究论文 | 该研究揭示了ELF3是肾功能GWAS位点的效应基因,通过放大损伤近端肾小管的上皮炎症重编程,推动慢性肾脏病进展 | 首次鉴定ELF3为肾功能GWAS位点的效应基因,并阐明其通过非经典NF-κB通路驱动上皮炎症重编程的机制 | 未提及具体限制,但可推断动物模型与人类疾病的差异及潜在脱靶效应 | 解析肾功能GWAS位点的效应基因及其在慢性肾脏病炎症重编程中的作用机制 | 小鼠模型和人类慢性肾脏病患者的损伤近端肾小管细胞 | 机器学习 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、免疫荧光图像 | 小鼠模型及人类慢性肾脏病组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3377 | 2026-07-27 |
Signaling mechanisms and dynamics governing the myocardial-epicardial fate switch during human cardiogenesis
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee5316
PMID:42497271
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研究论文 | 开发基于人类多能干细胞的模型,结合单细胞RNA测序揭示心肌和心外膜命运决定的信号机制和动态过程 | 首次揭示视黄酸在心脏中胚层阶段作为关键命运开关,驱动人心肌和心外膜谱系分化的双向调控机制 | 基于体外模型,可能无法完全模拟体内发育的复杂微环境 | 阐明人类心脏发育中心肌和心外膜谱系分岔的信号机制和发育动态 | 人类多能干细胞来源的心脏发育模型中的心肌和心外膜细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间序列单细胞RNA测序 |
| 3378 | 2026-07-27 |
The IRE1-XBP1s Axis Drives Inflammatory Osteolysis by Regulating a 5-HT Dependent Endogenous Anti-Autophagy Mechanism
2026-Jul-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76755
PMID:42490691
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研究论文 | IRE1-XBP1s轴通过调控5-HT依赖的内源性抗自噬机制驱动炎症性骨溶解 | 首次揭示IRE1-XBP1s轴在炎症性骨溶解中的关键作用及其通过5-HT依赖的抗自噬机制调控破骨细胞生成 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚需更多临床验证 | 探讨IRE1-XBP1s轴在炎症性破骨细胞生成和骨溶解中的作用机制 | LPS诱导的骨溶解小鼠模型、炎症性骨病患者外周血单核细胞 | 机器学习和计算生物学 | 骨疾病(炎症性骨溶解) | 单细胞RNA测序、RNA测序、双荧光素酶报告实验、ChIP-PCR、非靶向代谢组学、HPLC-MS | NA | 基因表达和代谢物数据 | 小鼠样本和炎症性骨病患者外周血单核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 3379 | 2026-07-27 |
Multi-omics and artificial intelligence nominate PCLAF as a prognostic and druggable target for hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma
2026-Jul-22, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112753
PMID:42486346
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研究论文 | 通过多组学与人工智能分析,确定PCLAF作为乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的预后和可药物靶点 | 首次系统整合多组学数据(转录组、单细胞RNA测序、空间转录组)、人工智能药物筛选与实验验证,揭示PCLAF在肝癌免疫微环境中与增殖性但功能受限的循环T细胞的关联 | 尚需进一步在大规模临床队列和体内模型中验证PCLAF的预后和治疗价值 | 系统研究PCLAF在肝细胞癌中的临床意义、生物学功能及治疗潜力 | 肝细胞癌中PCLAF的分子特征及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 计算机视觉, 机器学习 | 肝癌 | 二代测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | GEO数据库中的GSE83148和GSE121248转录组数据集、TCGA-LIHC队列、单细胞RNA测序数据GSE202642、空间转录组数据GSE245908,以及临床标本和HCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3380 | 2026-07-27 |
Quantitative calibration of a spatial QSP model identifies fibroblast impact on HCC immunotherapy
2026-Jul-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525799123
PMID:42446991
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研究论文 | 通过将定量系统药理学与基于智能体的建模结合,开发空间QSP模型,并利用近似贝叶斯计算-序贯蒙特卡洛方法校准,揭示成纤维细胞在肝细胞癌免疫治疗中的空间作用 | 首次在空间QSP模型中机械性整合成纤维细胞模块,并开发结合空间分子数据的校准流程,实现在单细胞分辨率下匹配肿瘤结构 | 模型参数化仍具挑战,且校准依赖特定数据集,泛化性有待验证 | 通过空间建模量化成纤维细胞对肝细胞癌免疫治疗反应的影响,并发现治疗前生物标志物 | 肝细胞癌肿瘤组织及成纤维细胞,采用空间转录组和免疫检查点抑制剂联合酪氨酸激酶抑制剂治疗的独立队列 | 计算机视觉, 机器学习 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序 | 基于智能体的建模,近似贝叶斯计算-序贯蒙特卡洛 | 空间分子数据,图像 | 独立队列的肿瘤组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |