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当前共找到 5215 篇文献,本页显示第 3361 - 3380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3361 2026-03-04
Single-Cell Sequencing Reveals Thalidomide-Induced Teratogenicity in Zebrafish via Endoplasmic Reticulum Stress and Dysregulated Angiogenic Signaling
2026 Mar-Apr 01, The Journal of craniofacial surgery IF:1.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了沙利度胺通过内质网应激和血管生成信号失调诱导斑马鱼畸形的分子机制 首次在单细胞水平构建了沙利度胺暴露下斑马鱼胚胎的转录组图谱,并鉴定了与氧化应激和抗血管生成相关的关键基因 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本时间点有限(仅1、2、5天) 探究沙利度胺致畸性的分子机制,特别是氧化应激和抗血管生成相关基因的作用 斑马鱼胚胎 单细胞测序 先天性畸形 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR NA 单细胞转录组数据 69,115个细胞(来自沙利度胺暴露组和野生型对照组) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3362 2026-03-04
Large-scale sequencing study of de novo regulatory Tandem Repeats (TRs) identifies new ASD (Autism Spectrum Disorders) candidate genes integrating gene expression mapping, brain scRNA-seq and organoid models
2026-Feb-13, Research square
研究论文 本研究通过对新生串联重复序列进行整合分析,结合基因表达图谱、大脑单细胞RNA测序和类器官模型,识别出新的自闭症谱系障碍候选基因 整合了新生串联重复序列分析、多组学功能注释、大脑单细胞RNA测序和皮质类器官表达数据,以揭示传统外显子组或全基因组分析中通常遗漏的非编码区域复杂遗传变异 研究主要基于特定队列(西班牙队列和SSC队列),样本来源和规模可能限制结果的普适性;依赖生物信息学流程的准确性,可能存在检测偏差 揭示自闭症谱系障碍的缺失遗传性,识别新的风险基因,特别是在非编码区域 自闭症谱系障碍患者及其家庭(包括西班牙队列200个ASD三重奏和SSC的1637个ASD单纯型四重家庭),以及人类大脑组织和皮质类器官 基因组学 自闭症谱系障碍 目标测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析 NA 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据、类器官表达数据 200个ASD三重奏(西班牙队列)和1637个ASD单纯型四重家庭(SSC),以及人类大脑单细胞RNA测序数据和皮质类器官数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3363 2026-03-04
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过使用WAS蛋白敲除小鼠模型,探究了在急性LCMV感染中WAS蛋白缺乏对记忆B细胞分化的影响及其机制 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了WAS蛋白在急性病毒感染期间差异表达于记忆B细胞亚群,并调控其命运 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类WAS患者的复杂免疫反应 探究WAS蛋白缺乏如何影响记忆B细胞在急性病毒感染中的形成机制 WAS蛋白敲除小鼠在急性LCMV感染后的记忆B细胞 免疫学 Wiskott-Aldrich综合征 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3364 2026-03-04
fastdemux: Robust SNP-based demultiplexing of single-cell population genomics data
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了fastdemux,一种基于SNP的高效单细胞基因组学数据解复用框架,通过DLDA模型显著提升计算效率并保持准确的供体分配 提出基于对角线性判别分析(DLDA)的快速解复用框架,在计算速度和内存使用上相比现有方法有数量级提升,同时支持双联体和多联体检测,并适用于scATAC-seq数据 未明确提及具体样本量限制或跨平台验证的广泛性 开发一种高效且可扩展的单细胞基因组学数据解复用方法,以降低大规模研究中的成本和批次效应 单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据中的供体解复用 机器学习 NA 单细胞RNA-seq, scATAC-seq DLDA(对角线性判别分析) 基因组学数据(SNP变异信息) NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
3365 2026-03-04
SCALPEL: A pipeline for processing large-scale spatial transcriptomics data
2026-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为SCALPEL的用于处理大规模空间转录组学数据的分析流程 该流程针对大型图谱级数据集设计,集成了优化的3D分割、改进的过滤标准、基于转录组的双联体检测、增强的细胞类型标签转移、空间域检测、组织切片配准至标准脑图谱以及全基因组表达插补等多项先进功能 NA 开发一个能够高效、准确处理大规模空间转录组学数据的标准化分析流程 空间转录组学数据,特别是来自小鼠全脑的大规模数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组学数据,scRNA-seq数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
3366 2026-03-04
Club cell RhoA activation amplifies allergic airway inflammation by regulating epithelial integrity and C1qα+ interstitial macrophages
2026-Feb-01, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了Club细胞中RhoA激活在过敏性气道炎症中的作用,通过基因敲除小鼠模型和多组学技术揭示了其通过影响上皮屏障功能和巨噬细胞动态来放大炎症的机制 首次在Club细胞中特异性研究RhoA的功能,并发现其通过调节上皮完整性和C1qα+间质巨噬细胞来放大过敏性气道炎症 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 确定Club细胞中RhoA在过敏性气道炎症中的功能 Club细胞特异性RhoA敲除小鼠模型及气液界面培养的上皮细胞 免疫学与呼吸疾病研究 过敏性气道炎症 多维流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、流式细胞数据、单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型和多组学分析 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
3367 2026-03-04
Chimeric brain models to study human glial-neuronal and macroglial-microglial interactions
2026-Jan-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过将人源多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞共移植到新生小鼠大脑中,构建了包含人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的嵌合大脑模型,用于研究人类胶质细胞-神经元以及胶质细胞间的相互作用 开发了一种新型共移植嵌合大脑模型,首次在体内同时整合了人类神经元、大胶质细胞和小胶质细胞,并利用单细胞RNA测序和细胞间通讯分析揭示了人类神经细胞间特异的信号通路 模型基于小鼠宿主环境,可能无法完全模拟人类大脑的完整微环境;研究主要关注发育早期阶段,成年期相互作用的长期效应尚不明确 研究人类胶质细胞与神经元之间以及不同类型胶质细胞之间的相互作用机制 人类多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞,移植到新生小鼠大脑中形成的嵌合组织 神经科学 神经系统疾病 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建,细胞间通讯分析 嵌合大脑模型 单细胞转录组数据,成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3368 2026-03-04
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-01, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎微环境中骨重塑失调的机制作用 揭示了lncRNA ZFAS1作为炎症性骨丢失的关键驱动因子,通过促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成发挥双重调控作用 研究主要基于体外细胞模型(RAW264.7和MC3T3-E1细胞),体内验证和临床转化潜力需进一步探索 阐明牙周炎中骨吸收的分子机制,特别是lncRNA ZFAS1在病理骨丢失中的作用 牙周组织(健康与患病)、RAW264.7破骨前体细胞、MC3T3-E1成骨前体细胞 分子生物学 牙周炎 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、组织学、免疫组织化学 NA RNA测序数据、基因表达数据、组织图像 未明确具体样本数量,涉及健康与患病牙周组织样本及细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3369 2026-03-04
The Ly6ghigh Neutrophil Subset Dictates Breast Cancer Lung Metastasis via CD8+ T Cell Death
2026, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示了Ly6g高表达中性粒细胞亚群通过NETs中的cathelicidin诱导CD8+ T细胞凋亡,从而促进乳腺癌肺转移的机制 首次鉴定出Ly6g高表达中性粒细胞亚群在乳腺癌肺转移中的关键作用,并阐明其通过NETs释放cathelicidin直接结合CD8+ T细胞线粒体蛋白Ant1触发凋亡的分子机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分;机制研究集中在cathelicidin-Ant1轴,可能存在其他调控途径 解析乳腺癌肺转移微环境中中性粒细胞与CD8+ T细胞的相互作用机制及其在免疫逃逸中的作用 小鼠乳腺癌肺转移模型中的肺组织、中性粒细胞亚群、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫荧光、蛋白质结合实验 NA 单细胞转录组数据、流式数据、免疫荧光图像、蛋白质互作数据 小鼠乳腺癌肺转移模型肺组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3370 2026-03-03
Nerandomilast, a PDE4B inhibitor, alleviates silica-induced lung inflammation and fibrosis by inhibition of NLRP3 inflammasome and TGF-β/Smad signalling
2026-Apr, British journal of pharmacology IF:6.8Q1
研究论文 本研究评估了PDE4B抑制剂nerandomilast在矽肺模型中的治疗效果及其机制,发现其通过抑制NLRP3炎症小体和TGF-β/Smad信号通路减轻炎症和纤维化 首次在矽肺模型中评估nerandomilast的疗效,并利用单细胞RNA测序识别PDE4B作为关键调控靶点 研究主要基于小鼠模型和细胞系,未涉及人类临床试验,且机制探索可能未覆盖所有相关通路 探究PDE4B抑制剂nerandomilast在矽肺中的治疗潜力及其分子机制 雄性C57BL/6N小鼠、THP-1巨噬细胞和MRC-5细胞 NA 矽肺 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 NA RNA测序数据 未明确样本数量,涉及小鼠模型和细胞系 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
3371 2026-03-03
Intratumoral heterogeneity in microsatellite instability status at single-cell resolution
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据,揭示了肿瘤内微卫星不稳定性状态的异质性,挑战了MSI作为二元生物标志物的传统观点 首次在单细胞分辨率下量化肿瘤内MSI状态的异质性,发现MSI-H和MSS亚克隆共存现象 样本量有限(49例),需要更大规模研究验证异质性频率及临床意义 探究微卫星不稳定性在肿瘤内的异质性现象及其对生物标志物应用的影响 癌症患者的单细胞RNA测序数据 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 计算分析流程 单细胞RNA测序数据 49例个体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3372 2026-03-03
Differentiation of mesenchymal stem/stromal cells into CD45+ macrophage-like cells: expanding insights into MSC plasticity
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了间充质干细胞/基质细胞(MSCs)分化为CD45+巨噬细胞样细胞的潜力,揭示了MSCs的塑性及其在免疫调节和组织修复中的潜在作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了新鲜分离的MSCs中存在巨噬细胞样群体,证实了MSCs在体内外均可分化为M2型巨噬细胞,扩展了对MSCs塑性的理解 研究主要基于小鼠模型,人类MSCs的验证相对有限,且具体分化机制和体内功能影响需进一步探究 探究MSCs、纤维细胞和巨噬细胞之间的关系,特别是MSCs直接分化为巨噬细胞样细胞的可能性 小鼠PαS细胞(一种新鲜分离的MSC群体)和人类MSCs 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 多个小鼠品系和人类MSCs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3373 2026-03-03
The non-metabolic role of MTHFD2 in regulating mitochondrial fission-dependent mitophagy via stabilizing TOP2A mRNA in glioblastoma
2026-Mar-16, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了代谢酶MTHFD2在胶质母细胞瘤中通过稳定TOP2A mRNA来调控线粒体分裂依赖性线粒体自噬的非代谢功能 首次发现代谢酶MTHFD2具有RNA结合功能,通过稳定TOP2A mRNA调控线粒体动力学,揭示了其非经典功能 NA 探究MTHFD2在胶质母细胞瘤中线粒体完整性和动力学中的非代谢功能 胶质母细胞瘤细胞及小鼠原位模型 分子生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、mt-Keima线粒体自噬流检测、RNA免疫沉淀测序、荧光素酶报告基因检测 NA RNA测序数据、荧光成像数据、报告基因数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3374 2026-03-03
P16+ Cells Drive Adverse Postischemic Cardiac Remodeling Through CCL8-Mediated Recruitment of Cytotoxic Lymphocytes
2026-Mar-02, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了心肌梗死后表达P16的细胞通过分泌CCL8招募细胞毒性淋巴细胞,从而驱动不良心脏重塑的机制 首次利用p16-CreER;R26-tdT报告小鼠系统性地绘制了心肌梗死后P16+细胞的异质性图谱,并明确了P16+成纤维细胞和巨噬细胞通过CCL8依赖的方式招募细胞毒性淋巴细胞(特别是CD8+ T细胞)是驱动不良重塑的关键机制 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需验证;此外,研究聚焦于CCL8通路,可能还有其他P16+细胞分泌的因子参与该过程 阐明心肌梗死后表达衰老标志物P16的细胞在心脏不良重塑中的具体作用机制 p16-CreER;R26-tdT报告小鼠、心肌梗死后心脏组织中的P16+细胞(包括成纤维细胞、巨噬细胞、冠状动脉内皮细胞和心肌细胞) 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、定量聚合酶链反应、细胞通讯分析、遗传学消融、药物处理 NA 基因表达数据、细胞表型数据 使用p16-CreER;R26-tdT等多种遗传工程小鼠模型进行研究,具体样本数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3375 2026-03-03
GeneExt: a gene model extension tool for enhanced single-cell RNA-seq analysis
2026-Mar-02, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了GeneExt工具,该工具利用单细胞RNA-seq数据优化基因注释,以改进非模式物种中的基因表达量化 GeneExt通过扩展和统一基因注释,特别是针对非模式物种中不准确的3'端注释,提高了单细胞RNA-seq分析的准确性和跨物种比较能力 NA 开发一个工具以改进单细胞RNA-seq分析中的基因表达量化,特别是在非模式物种中 八个非模式生物的单细胞图谱 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3376 2026-03-03
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2026-Mar, Expert review of respiratory medicine IF:2.9Q2
综述 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中的应用,揭示了气道壁中上皮-免疫微环境的分子特征及其在疾病异质性和治疗反应中的作用 整合了多种空间组学技术(如Visium-HD、Xenium、CosMx SMI等)的数据,首次系统性地绘制了哮喘气道中IL-13富集的杯状细胞中心、肥大细胞-平滑肌环路等特定微环境,并强调了这些空间信息在传统解离分析中被忽略 临床广泛应用仍需降低检测成本、减少RNA扩散、统一FFPE工作流程,并需要在全球队列中进行多组学整合以提高可重复性和临床可操作性 通过空间组学技术解析哮喘气道中上皮-免疫微环境的分子构成与空间分布,以推动精准医疗发展 人类气道活检样本、离体肺切片以及小鼠哮喘模型 空间转录组学 哮喘 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 NA 空间组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组) NA 10x Genomics, NanoString, Bruker, Fluidigm, Ionpath 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 Visium-HD, Xenium, CosMx SMI, MERFISH, Imaging Mass Cytometry, MIBI, MALDI-MSI Visium-HD(空间转录组学), Xenium(原位基因表达), CosMx SMI(单分子成像), MERFISH(多重误差鲁棒荧光原位杂交), Imaging Mass Cytometry(成像质谱流式), MIBI(多重离子束成像), 高分辨率MALDI-MSI(基质辅助激光解吸电离质谱成像)
3377 2026-03-03
Single cell RNA-seq characterization of non-fibrotic stromal wound repopulation in the rabbit
2026-Mar, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在兔模型中探究了非纤维化角膜基质伤口愈合过程中的转录变化 首次通过单细胞RNA测序揭示了角膜基质细胞在非纤维化伤口愈合中的异质性及从静止态到成纤维细胞的连续转录轨迹 研究仅基于兔模型,结果可能不完全适用于人类;且仅关注了特定时间点(第7天和第28天)的转录变化 探究非纤维化角膜伤口愈合的分子机制,以预防角膜手术或损伤后的瘢痕形成 兔角膜基质细胞(包括静止态角膜细胞和伤口愈合过程中的成纤维细胞) 单细胞转录组学 角膜疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 兔角膜组织样本(包括对照组和损伤后第7天、第28天的时间点) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3378 2026-03-03
Synovial fibroblast responses to different types of injury resulting in cartilage repair or osteoarthritis
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过整合分析小鼠关节损伤模型的单细胞RNA测序数据,比较了滑膜成纤维细胞对不同类型和持续时间关节损伤的响应 揭示了滑膜成纤维细胞在关节表面损伤和创伤后骨关节炎模型中的异质性响应,包括谱系特异性转录因子的共表达特征 基于已发表的scRNA-seq数据,可能受原始实验设计和样本量的限制 比较不同关节损伤模型中滑膜成纤维细胞的响应机制,以指导关节修复和骨关节炎的未来研究 小鼠滑膜成纤维细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 多个小鼠关节损伤模型的数据集(JSI、DMM、ACLR模型,包含不同时间点) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3379 2026-03-03
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAM)来源的分泌磷蛋白1(SPP1)通过抑制CD8⁺ T细胞向Tc1细胞分化,从而促进结直肠癌进展的机制 首次在结直肠癌中鉴定出一个高表达SPP1的独特TAM亚群,并阐明了TAM来源的SPP1通过CD44介导的信号通路抑制CD8⁺ T细胞功能的具体分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其在人类结直肠癌患者中的临床相关性及转化潜力仍需进一步验证 探究肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的调控作用及其分子机制 结直肠癌(CRC)肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞(TAM)和CD8⁺ T细胞 肿瘤免疫学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学分析,体外共培养实验 小鼠结直肠癌模型(MC38细胞) 单细胞转录组数据,空间转录组数据 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3380 2026-03-03
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to dissect mast-cell heterogeneity and arginine-metabolism-associated markers in BRCA
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了乳腺癌中肥大细胞的异质性,并识别了与精氨酸代谢相关的标志物,特别是OAT基因在促进乳腺癌侵袭性中的作用 首次将精氨酸代谢与肥大细胞异质性及功能特化联系起来,并整合多组学数据识别了与预后相关的HAS和LAS亚群,以及关键基因OAT的功能验证 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏体内模型验证,且样本来源可能受批次效应影响 解析乳腺癌中肥大细胞的异质性及其与精氨酸代谢相关的功能标志物 乳腺癌组织中的肥大细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq Seurat, Monocle2, CellChat, hdWGCNA, LASSO-Cox, MiloR 基因表达数据 272,592个细胞(来自GSE161529数据集),以及TCGA和GSE42568的批量RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
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