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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 3341 - 3360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3341 | 2026-07-28 |
Lysosome-related biomarkers in peripheral blood immune cells discriminate sepsis from SIRS
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-53608-y
PMID:42168299
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研究论文 | 筛选外周血免疫细胞中溶酶体相关基因以区分脓毒症与全身炎症反应综合征 | 首次从溶酶体相关基因角度筛选区分脓毒症与SIRS的生物标志物，并结合单细胞RNA测序明确核心基因表达的主要免疫细胞类型 | 样本量较小，核心基因的诊断效能需进一步在大规模临床队列中验证 | 寻找区分脓毒症与全身炎症反应综合征的溶酶体相关生物标志物 | 外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例SIRS患者和20例脓毒症患者 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3342 | 2026-05-16 |
Systemic Immune Correlates of Long-term Survival after Delta-24-RGD Based on the Therapeutic Adenovirus for Recurrent Glioblastoma Effect Trial (TARGET)
2026-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3566
PMID:41609523
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研究论文 | 评估瘤内注射Delta-24-RGD联合皮下注射干扰素γ治疗复发性高级别胶质瘤患者的免疫相关性及长期生存关联 | 首次在Ib期临床试验中结合Delta-24-RGD与IFNγ治疗复发性高级别胶质瘤，并利用噬菌体免疫沉淀测序（VirScan）和单细胞RNA测序分析全身免疫相关指标，发现抗腺病毒特异性IgG和CD8+ NKT样细胞可作为长期生存的早期替代标志物 | IFNγ联合Delta-24-RGD未显著增加长期生存者比例，且样本量较小（37例），可能限制统计效力 | 评估瘤内Delta-24-RGD联合皮下注射干扰素γ治疗复发性高级别胶质瘤的疗效，并探索长期生存的全身免疫相关因素 | 复发性高级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 噬菌体免疫沉淀测序（VirScan），单细胞RNA测序 | 无 | 血浆和外周血单核细胞数据 | 37例复发性高级别胶质瘤患者（27例随机分组，10例扩展队列） | NA | NA | NA | NA |
| 3343 | 2026-07-28 |
Deciphering microenvironmental heterogeneity by scalable Niche Guided Module Discovery
2026-May-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10240-w
PMID:42129459
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研究论文 | 提出可扩展的微环境引导模块发现方法（SIGMOD），用于解码空间转录组中的微环境异质性 | 首次将预先构建的微环境信息与基因表达分解相结合，以发现受微环境影响的功能性基因模块 | NA | 开发一种可扩展的方法，用于从空间转录组数据中识别细胞类型特异性和细胞状态特异性的基因模块，并揭示模块间相互作用 | 10X ST、Visium、Xenium和CosMX空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium, CosMX | 10X ST、Visium、Xenium、CosMX平台 |
| 3344 | 2026-07-28 |
A Conserved Fibroblast-Myeloid Gene Signature in Digestive Cancers: Multi-Omics Integration Identifies DCN, COL10A1, CTHRC1, and TREM2 as Candidate Microenvironmental Markers
2026-Apr-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27073208
PMID:41977392
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研究论文 | 通过多组学整合分析，在七种消化系统癌症中鉴定出一个保守的成纤维细胞-髓系基因特征，包括 DCN、COL10A1、CTHRC1 和 TREM2，并揭示其作为肿瘤微环境标志物的潜力 | 首次跨七种消化系统癌症类型鉴定出保守的成纤维细胞-髓系基因特征，并通过单细胞RNA测序和细胞间通讯分析揭示基质-免疫相互作用的共享机制 | 未明确说明，可能包括需进一步验证该基因特征在诊断和治疗中的实用性 | 探究消化系统癌症肿瘤微环境中是否存在保守的基质-免疫相互作用 | 七种消化系统癌症样本 | 机器学习和数字病理学的交叉领域 | 消化系统癌症 | 多组学整合分析、单细胞RNA测序、细胞间通讯分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 七种消化系统癌症类型，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3345 | 2026-07-28 |
EREG-secreting THBS1+ tissue monocytes are recruited by C5a to promote rapid liver regeneration in patients and mice during the ALPPS procedure
2026-Apr-01, Hepatobiliary surgery and nutrition
IF:6.1Q1
DOI:10.21037/hbsn-24-391
PMID:41983196
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research paper | 本研究揭示了ALPPS手术促进肝脏快速再生的关键免疫细胞——EREG分泌型THBS1+组织单核细胞及其通过C5a/C5aR1轴被招募的机制 | 首次通过单细胞和质谱流式技术系统鉴定出THBS1+组织单核细胞在ALPPS诱导的肝再生中通过EREG-EGFR通路促进肝细胞增殖，并发现补体C5a作为招募信号的关键作用 | 样本量较小（5例患者用于单细胞分析，22例用于验证），且机制验证主要在体外和动物模型中进行 | 探究ALPPS手术诱导快速肝再生的关键免疫细胞及分子机制 | 接受ALPPS手术的肝细胞癌（HCC）患者的肝脏组织及外周血样本 | 计算机视觉 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，质谱流式技术，批量RNA测序 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 5例用于单细胞分析，22例用于组织芯片验证 | 10x Genomics，Fluidigm | 单细胞RNA测序，质谱流式技术，批量RNA测序 | 10x Chromium，CyTOF，Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序，CyTOF用于质谱流式分析，Illumina NovaSeq用于批量RNA测序 |
| 3346 | 2026-07-28 |
Ochratoxin A and Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Exploring Potential Molecular Links Through Network Toxicology and Machine Learning
2026-Mar-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27072971
PMID:41977161
|
研究论文 | 利用网络毒理学与机器学习探索赭曲霉毒素A与透明细胞肾细胞癌之间的潜在分子关联 | 首次整合网络毒理学、机器学习与分子对接技术，系统揭示OTA与ccRCC的分子联系 | 研究基于公共数据集的生物信息学分析，缺乏体外或体内实验验证 | 探究赭曲霉毒素A暴露与透明细胞肾细胞癌之间的潜在分子机制 | OTA相关ccRCC的潜在分子靶点与核心驱动基因 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 网络毒理学、机器学习、分子对接 | glmBoost + RF（特征选择与分类器的组合模型） | 转录组数据 | 两个GEO数据集中的转录组样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3347 | 2026-07-28 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Salivary Epithelial Cells Reveals Large-Scale Dysregulation in Bitter Taste Dysfunction
2026-Mar-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27072953
PMID:41977143
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析唾液上皮细胞，揭示苦味功能障碍中大规模基因失调 | 首次通过单细胞转录组分析揭示COVID-19长期后遗症中苦味功能障碍的细胞和分子机制，发现细胞骨架动态、味觉细胞-神经突触组装以及苦味受体基因下调 | 研究样本量可能有限，且仅针对苦味功能障碍，未涵盖其他味觉异常 | 阐明COVID-19长期后遗症中苦味功能障碍的分子变化机制 | 唾液上皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具有苦味功能障碍的COVID-19长期后遗症患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 3348 | 2026-07-28 |
Leveraging single cell multiomic analyses to identify gene regulatory networks that drive human articular cartilage cell fate
2026-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.12.025
PMID:41520766
|
研究论文 | 利用多组学数据识别驱动人关节软骨细胞命运的基因调控网络 | 首次联合单细胞多组学和空间转录组数据预测并验证了调控软骨细胞命运的关键转录因子CREB5和NFATC2，发现其重编程生长板软骨的潜力 | 研究主要基于胎儿样本和体外平台，未在体内或疾病模型中充分验证 | 识别驱动人关节软骨细胞命运的基因调控网络，为治疗退行性关节疾病奠定基础 | 人远端股骨软骨细胞、人多能干细胞分化的软骨细胞 | 机器学习和计算生物学 | 骨关节炎、退行性关节疾病 | 单细胞多组学、空间转录组测序、体外干细胞平台 | 基因调控网络预测模型 | 转录组和开放染色质数据、空间转录组数据 | 2个胎儿时间点的软骨样本及额外时间点的空间转录组样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 单细胞核转录组和开放染色质联合分析、高清晰度空间转录组 |
| 3349 | 2026-07-28 |
BCRInsight: an antibody language model to decode biological signals from BCR sequences
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag154
PMID:41978383
|
研究论文 | 提出一种基于Transformer架构和表型感知对比学习的抗体特异性预训练语言模型BCRInsight，从BCR序列中解码免疫信号 | 首次将表型感知对比学习与Transformer预训练结合用于BCR序列分析，并在80M人类BCR序列上预训练，实现无监督下的结构可解释性 | 单细胞测序的可扩展性和成本限制，群体层面组数据未充分利用，且现有方法难以建模高阶非线性依赖 | 解码BCR序列中嵌入的免疫动态信号，推动抗体发现和计算免疫学 | 人类B细胞受体(BCR)序列，涵盖健康、肿瘤、病毒感染等多种免疫队列 | 自然语言处理， 计算生物学 | 肿瘤， 病毒感染 | 预训练语言模型， 对比学习， 单细胞测序， BCR序列分析 | Transformer | 序列数据(BCR氨基酸序列) | 80M人类BCR序列用于预训练，多组单细胞免疫队列用于评估 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3350 | 2026-07-28 |
A conserved eIF1A+ luminal cell-centered hypoxic and "cold" tumor microenvironment promotes pan-subtype prostate cancer progression
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102619
PMID:41707646
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研究论文 | 通过成像质谱流式技术分析前列腺癌四种组织学亚型，发现保守的eIF1A+腔细胞驱动的缺氧和“冷”肿瘤微环境促进跨亚型前列腺癌进展 | 首次揭示eIF1A在前列腺癌高亚型中过度表达并驱动缺氧微环境，鉴定其作为跨亚型保守进展驱动因子的作用 | 未提及具体局限性信息 | 识别前列腺癌组织学亚型中保守的肿瘤进展驱动因子，以改善临床预后 | 前列腺癌患者的癌旁组织和四种组织学亚型（低分级腺泡腺癌、高分级腺泡腺癌、导管内癌和导管腺癌） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 成像质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 | 38种蛋白质分析覆盖癌旁组织和四种组织学亚型；新辅助治疗临床试验（NCT06834321） | NA | 成像质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3351 | 2026-07-28 |
[Recent Advances in the Interorgan Regulatory Roles of Adipose Tissue]
2026-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20260160201
PMID:41834951
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综述 | 综述了脂肪组织作为关键信号中枢与肝、肠、脑、骨等器官的间质调节作用及其与肿瘤进展的关联 | 系统回顾了以脂肪组织为中心的调节网络，突破了单一器官研究的局限性，并重点介绍了单细胞测序和人工智能等前沿技术在脂肪组织研究中的应用 | 未提及具体研究限制，可能受限于现有文献的覆盖范围和技术的应用成熟度 | 探讨脂肪组织在器官间通讯中的调控作用及其在疾病治疗和健康管理中的潜力 | 脂肪组织及其与肝、肠、脑、骨的互动关系，以及与肿瘤进展的相关性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3352 | 2026-07-28 |
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
DOI:10.1142/9789819824755_0061
PMID:41758189
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workshop介绍 | 介绍AI方法在单细胞空间组学中的最新进展 | 聚焦人工智能和机器学习在空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学中的应用，涵盖数据整合、细胞间相互作用建模及疾病和精准医学的转化应用 | NA | 展示AI在单细胞空间组学中的新方法和应用 | 空间组学数据、细胞间相互作用、疾病和精准医学 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3353 | 2026-07-28 |
Multiomics Profiling Identifies Tlr4 as a Therapeutic Target of Necroptosis in Spinal Cord Injury
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/7306884
PMID:42499235
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研究论文 | 通过多组学分析识别Tlr4为脊髓损伤中坏死性凋亡的治疗靶点 备注：由于“坏死性凋亡”是标准译名，而“necroptosis”在中文中也常用“坏死性凋亡”（非“坏死性凋亡”），保持准确性，用“坏死性凋亡”。但原文有误，应为Necroptosis=坏死性凋亡（程序性坏死），中文常用“坏死性凋亡”或“程序性坏死”，这里按标准“坏死性凋亡”。 输出：通过多组学分析识别Tlr4为脊髓损伤中坏死性凋亡的治疗靶点 | 首次建立Tlr4作为脊髓损伤中pRIPK1/pRIPK3/pMLKL坏死性凋亡轴的上游直接调控因子，区别于其作为一般炎症介质的作用 | 研究仅限于大鼠脊髓损伤模型，在人类样本中的验证尚不明确 | 识别并验证脊髓损伤中与坏死性凋亡相关的关键基因，探索Tlr4作为治疗靶点的潜力 | 脊髓损伤大鼠模型的组织样本和细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-qPCR、蛋白质印迹 | 加权基因共表达网络分析、最小绝对值收敛和选择算子回归 | RNA测序数据和空间转录组数据 | 包含多个大鼠脊髓损伤样本，具体数量未在摘要中说明 | Illumina | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | Illumina Novaseq | 未提供具体配置细节 |
| 3354 | 2026-07-28 |
Reframing thymic epithelial tumors through single-cell transcriptomics: a narrative review
2026, Mediastinum (Hong Kong, China)
DOI:10.21037/med-2025-1-45
PMID:41982618
|
综述文章 | 通过单细胞转录组学重新审视胸腺上皮肿瘤的叙事性综述 | 整合了近期单细胞研究，揭示了胸腺上皮肿瘤中上皮亚群、瘤内免疫景观和重症肌无力相关表型 | 基于三项关键研究，可能存在选择偏倚 | 综合单细胞转录组学在胸腺上皮肿瘤中的应用，解析细胞异质性 | 胸腺上皮肿瘤及其相关细胞亚群和免疫微环境 | 数字病理学 | 胸腺上皮肿瘤 | scRNA-seq | NA | 文本 | 三项主要研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3355 | 2026-07-28 |
Single-Cell Analysis Delineates Glutathione Metabolism-Related Gene Signatures in the Glioblastoma Microenvironment and Identifies GSTA4 as a Regulator of Malignant Behaviors
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/7575181
PMID:41982811
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤微环境中谷胱甘肽代谢相关基因特征，并鉴定GSTA4为恶性行为调控因子 | 首次在单细胞水平揭示胶质母细胞瘤微环境中的谷胱甘肽代谢重编程特征，并首次证明GSTA4通过Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤发生和侵袭表型 | 未明确说明局限性 | 阐明胶质母细胞瘤微环境的细胞景观和谷胱甘肽代谢特征，并明确GSTA4在胶质母细胞瘤进展中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞（U87 MG、LN229、U251）和正常人类星形胶质细胞（SVG p12） | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 104,789个胶质母细胞瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3356 | 2026-07-28 |
Plantaricin BM-1 enhances anti-colorectal cancer effects by inhibiting CD8+ cytotoxic T cell apoptosis via the ERK/AP1/Bim signaling pathway
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1792962
PMID:41983138
|
研究论文 | 揭示plantaricin BM-1通过抑制CD8+细胞毒性T细胞凋亡增强抗结直肠癌效果的分子机制 | 首次揭示plantaricin BM-1在体内通过ERK/AP1/Bim信号通路抑制CD8+ T细胞凋亡从而增强抗结直肠癌效果，并利用单细胞RNA测序阐明机制 | 未提及具体局限，但可能包括样本量有限或机制验证主要基于小鼠模型 | 探究plantaricin BM-1对结直肠癌的体内抗肿瘤效果及其分子机制 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型以及CD8+细胞毒性T细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组化, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因表达数据, 图像 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3357 | 2026-07-28 |
Enterococcus-driven metabolite-host gene networks in IBD-associated colorectal carcinogenesis: integrative multi-omics and experimental validation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1793350
PMID:41983192
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研究论文 | 通过多组学整合与实验验证，阐明肠球菌在炎症性肠病相关结直肠癌发生中的代谢物-宿主基因网络调控作用 | 首次系统揭示肠球菌通过代谢物胍基丁胺和左旋多巴调控MAPK3等宿主基因的双重致癌机制，并鉴定雌二醇和亚砷酸钠为潜在辅助治疗药物 | 未详细说明体外实验验证的具体细胞系类型及动物模型验证缺失，仅依赖数据库挖掘和有限样本分析 | 探究肠球菌在炎症性肠病向结直肠癌进展中的作用机制 | 肠球菌驱动的代谢物-宿主基因网络 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3358 | 2026-07-28 |
A deep learning representation and spatial Bayesian cell-type deconvolution for spatial transcriptomics
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21548
PMID:42504247
|
研究论文 | 提出了名为SDDGP的计算框架，通过深度高斯过程与贝叶斯推断实现空间转录组数据的细胞类型反卷积，并在两个数据集上验证了其准确性 | 将深度高斯过程与贝叶斯推断结合，为空间转录组数据提供空间感知的反卷积及不确定性量化 | 论文摘要未明确提及局限性 | 提出一种能同时进行空间反卷积和不确定性量化的计算方法，以改进对空间转录组数据的分析 | 胰腺导管腺癌（PDAC）数据集和人类胸腺数据集 | 机器学习 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 深度高斯过程 | 基因表达数据 | 两个数据集：PDAC数据集（匹配单细胞RNA测序和空间转录组数据）和人类胸腺数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3359 | 2026-07-27 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomic approaches to decipher the tumor microenvironment and therapeutic resistance in pancreatic cancer
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2026.2699508
PMID:42411636
|
综述 | 综合单细胞和空间转录组学方法解析胰腺癌肿瘤微环境及治疗耐药性 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在剖析胰腺导管腺癌肿瘤微环境异质性、基质-免疫相互作用及治疗耐药机制中的整合应用，强调了它们对生物标志物发现和新型治疗策略开发的指导作用 | 未明确提及具体局限性，但综述性文章可能缺乏新的实验数据支持 | 阐述单细胞和空间转录组学整合方法在揭示胰腺癌肿瘤微环境特征及治疗耐药机制中的应用潜力 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析，10x Visium空间基因表达分析 |
| 3360 | 2026-07-27 |
Single-cell sequencing profiling of intratumoral heterogeneity and immunosuppressive microenvironment in primary thyroid cancer and lymph node metastases
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2701504
PMID:42430190
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研究论文 | 通过单细胞测序分析原发性甲状腺癌和淋巴结转移灶内的异质性和免疫抑制微环境 | 首次高分辨率描绘甲状腺癌生态系统，揭示恶性上皮细胞异质性和发育轨迹，发现LAG3-LGALS3轴为优势免疫逃逸通路，挑战传统PD-1阻断疗法的有效性 | 样本量有限 | 探究甲状腺癌恶性进化与免疫微环境之间的相互作用 | 原发性甲状腺癌和淋巴结转移灶 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 55,005个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |