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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3321 | 2026-07-28 |
Immunological Reprogramming in Cardiomyopathies: From Cardiomyocyte Injury to Disease of the Cardiac Immune Ecosystem
2026-Jul-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15141308
PMID:42505415
|
综述 | 提出心肌病中免疫重编程的统一框架,从心肌细胞损伤转向心脏免疫生态系统疾病的概念 | 整合心血管免疫学、单细胞和空间转录组学、免疫代谢及系统生物学,提出心肌病免疫重编程的统一框架,并引入免疫型概念以超越传统表型和遗传分类 | 未明确说明局限性 | 探讨心肌病中免疫重塑的动态作用并提出免疫生态系统分类新维度 | 心肌病中的免疫细胞、成纤维细胞、骨髓细胞等免疫生态系统组分 | 机器学习 | 心肌病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3322 | 2026-07-28 |
Human primary antibody response to vaccination follows a partially sequential class-switching program with a checkpoint at IGHG2
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102848
PMID:42242228
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研究论文 | 本研究通过分析新冠疫苗接种后志愿者的B细胞反应,揭示了抗体类别转换重组遵循部分顺序的程序并在IGHG2处存在检查点 | 首次通过高频采血和多种测序技术结合,揭示人类初级免疫应答中类别转换重组的有序性和IGHG2检查点的存在,挑战了传统单基因无菌转录的观点 | 样本量有限,仅针对新冠疫苗初免反应,且研究时间窗口限于接种后10周 | 阐明人类初级抗体应答中类别转换重组的动态机制 | 新冠疫苗初免的健康志愿者在接种后前三周内每隔一天采集的样本,包括B细胞受体库、单细胞转录组、免疫表型和IGHC无菌转录本 | 免疫学 | 传染病 | B细胞受体库测序, 单细胞转录组测序, 免疫表型分析, 无菌转录本分析 | NA | 测序数据, 转录组数据 | 新冠疫苗初免的健康志愿者,接种后前三周内高频采样 | NA | NA | NA | NA |
| 3323 | 2026-07-28 |
Differential T cell clonal dynamics underlie outcomes to frontline chemoimmunotherapy in advanced gastric cancer
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102910
PMID:42392078
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research paper | 研究晚期胃癌化疗免疫治疗中T细胞克隆动态变化与疗效的关系 | 首次通过单细胞RNA和TCR测序揭示化疗免疫治疗联合应用的T细胞克隆动态机制 | 样本量有限(33名患者),且为单中心试验 | 阐明化疗-免疫疗法协同作用的T细胞动态机制,解释晚期胃癌患者对chemoimmunotherapy的差异反应 | 来自33名晚期胃癌患者的66,813个T细胞(治疗前、化疗后和免疫治疗后) | machine learning | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 33名患者的66,813个T细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和TCR测序 |
| 3324 | 2026-07-28 |
Microglia in Alzheimer's Disease: From Homeostatic Guardians to Multifaceted Drivers of Neuropathology
2026-Jul-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15141291
PMID:42505400
|
综述 | 综述了小胶质细胞在阿尔茨海默病中从稳态守护者到多面神经病理驱动者的转变 | 整合单细胞测序和代谢组学的最新进展,提出小胶质细胞可塑性、代谢重编程和细胞间通讯的综合框架 | 缺乏原始实验数据支持,依赖现有研究的总结 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的功能转变机制及治疗策略 | 小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 | 人工智能 | 阿尔茨海默病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3325 | 2026-07-28 |
Robust and generalizable CNV detection for single-cell sequencing assays
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag636
PMID:42500822
|
研究论文 | 开发了一种名为RIDDLER的鲁棒且无监督的方法,用于从单细胞测序数据中检测拷贝数变异(CNVs),适用于多种单细胞模态 | 提出了一种基于异常值感知统计建模的鲁棒回归框架,能够跨多种单细胞模态(如sc-ATAC-seq和sc-甲基化)通用检测CNVs,并有效处理数据稀疏性 | 未明确讨论在极端数据稀疏或低测序深度下的性能,以及与其他模态(如sc-RNA-seq)的整合方法比较 | 建立一种可扩展、通用且准确的多模态单细胞CNV检测方法,以研究CNV动态与表观遗传改变之间的关系 | 单细胞ATAC-seq和单细胞甲基化数据中的拷贝数变异 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞ATAC-seq、单细胞甲基化测序 | 鲁棒回归模型 | 基因表达及表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 3326 | 2026-07-28 |
Single-cell sequencing reveals an immunotherapy-relevant IFITM1-marked epithelial interferon state in nasopharyngeal carcinoma
2026-Jul-17, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102921
PMID:42468141
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示鼻咽癌中一种与免疫治疗相关的IFITM1标记的上皮干扰素状态 | 首次通过单细胞测序鉴定出鼻咽癌中IFITM1作为上皮干扰素状态(Epi7)的前导标志物,并连接了恶性细胞异质性与肿瘤免疫通讯及免疫治疗相关的微环境重塑 | 研究主要基于已有数据库和细胞系实验,缺少大规模临床队列验证以及体内动物模型的进一步确认 | 探究鼻咽癌恶性细胞异质性与免疫治疗反应相关的分子机制 | 鼻咽癌肿瘤组织、外部公开数据集(GSE53819等)、HK1细胞系 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 包括GSE53819、GSE12452、GSE64634、GSE102349及TCGA-HNSC等多个公开队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3327 | 2026-07-28 |
Mediterranean Diet and Neurodegenerative Diseases: Recent Advances from the Gut-Immune-Brain Axis to Multi-Omics-Guided Precision Nutrition
2026-Jul-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15141287
PMID:42505396
|
综述 | 本文综合探讨了地中海饮食通过肠-免疫-脑轴对神经退行性疾病的神经保护作用,并整合多组学引导的精准营养策略 | 将疾病特异性机制框架与多组学引导的精准营养策略相结合,系统总结地中海饮食在阿尔茨海默病和帕金森病中的作用 | 当前证据多为观察性研究,需更多随机对照试验和标准化多组学数据分析框架 | 系统综述地中海饮食通过肠-免疫-脑轴对神经退行性疾病的影响,并探讨多组学技术在精准营养中的应用 | 阿尔茨海默病和帕金森病患者 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 微生物组分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3328 | 2026-07-28 |
Chemerin Promotes Obesity-Accelerated Orthodontic Tooth Movement by Activating IRE1α-Dependent ER Stress in PDL Fibroblasts
2026-Jul-16, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109708
PMID:42468352
|
研究论文 | 探讨肥胖相关趋化素上调通过激活IRE1α依赖的内质网应激促进牙周韧带成纤维细胞中正畸牙移动的作用及其机制 | 首次揭示趋化素通过IRE1α介导的内质网应激通路在肥胖加速正畸牙移动中的关键作用,并利用单细胞RNA测序鉴定牙周组织中趋化素的主要细胞来源 | 研究主要基于动物模型和体外实验,缺乏人体临床样本的直接验证,且机制探索集中于IRE1α通路,未涵盖其他可能的内质网应激分支 | 研究肥胖相关趋化素上调在正畸牙移动中的作用及其分子机制 | 肥胖小鼠和人类牙周韧带成纤维细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肥胖小鼠及体外培养的人牙周韧带成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3329 | 2026-07-28 |
IFITM3 promotes an M2-like tumor-supportive microenvironment in acute myeloid leukemia
2026-Jul-08, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03310-w
PMID:42418060
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量基因表达分析,揭示了IFITM3通过诱导M2型巨噬细胞极化,促进急性髓系白血病肿瘤支持性微环境 | 首次阐明IFITM3通过PI3K/AKT信号通路驱动M2型巨噬细胞极化,从而塑造白血病免疫微环境的机制 | 未提及 | 阐明IFITM3在急性髓系白血病中调节免疫微环境的分子机制 | IFITM3高表达的急性髓系白血病细胞及相应的巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、批量基因表达分析、巨噬细胞极化实验 | NA | 基因表达数据 | IFITM3 AML细胞系及其敲低模型、IFITM3过表达HL-60细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3330 | 2026-07-28 |
Screening of cell-type-specific meta-programs for drug repurposing in Alzheimer's disease
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag411
PMID:42506875
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq数据的综合分析,识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的元程序,并筛选候选重定位药物 | 首次整合多个单细胞/核RNA-seq数据集,识别出51个跨样本的细胞类型特异性元程序,并利用这些元程序进行药物重定位筛选 | 未明确说明 | 识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的转录组元程序,并筛选潜在的药物重定位候选药物 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 机器学习和生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 67个高病理分级样本(Braak V/VI期),1208个阿尔茨海默病样本和725个正常样本的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3331 | 2026-07-28 |
Integrated Proteogenomics and Single-Cell Transcriptomics Prioritize Putative Protective Plasma Proteins for Hidradenitis Suppurativa
2026-Jul, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70332
PMID:42499219
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研究论文 | 整合蛋白质基因组学与单细胞转录组学,优先筛选出三种可能对化脓性汗腺炎具有保护作用的血浆蛋白 | 首次将蛋白质数量性状位点孟德尔随机化与单细胞转录组定位相结合,从遗传因果关系和细胞分辨率层面优先筛选HS保护性血浆蛋白 | 血浆蛋白检测阈值可能导致某些候选蛋白(如TNFRSF6B)在皮肤中无法检出,且需要进一步功能验证 | 鉴定遗传预测水平与HS风险因果关联的血浆蛋白,并在单细胞分辨率下定位其在皮肤中的表达 | 化脓性汗腺炎患者与健康对照 | 机器学习 | 化脓性汗腺炎 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | UK Biobank Pharma Proteomics Project的2923种血浆蛋白与FinnGen R12的HS汇总统计数据 | NA | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3332 | 2026-07-28 |
CXCL8 producing macrophages shape gastric cancer outcomes
2026-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05452-9
PMID:42307886
|
研究论文 | 构建基于六种趋化因子的预后模型,揭示CXCL8阳性巨噬细胞在胃癌肿瘤微环境中的关键作用 | 首次通过整合转录组数据与单细胞RNA测序,建立趋化因子相关预后模型,并明确CXCL8阳性巨噬细胞作为肿瘤微环境通信枢纽的促肿瘤表型 | 预后模型的C-index仅为0.680,预测准确性有限;未在独立大样本队列中验证CXCL8-巨噬细胞轴的治疗靶向潜力 | 开发基于趋化因子的胃癌预后标志物并阐明其细胞机制 | 胃癌患者肿瘤组织的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 转录组数据,单细胞转录组数据 | TCGA和GEO队列的胃癌患者样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3333 | 2026-07-28 |
GATHeR: graph-based accurate tool for immunoglobulin heavy- and light-chain reconstruction
2026-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74272-w
PMID:42270654
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研究论文 | 提出GATHeR工具,从单细胞RNA测序数据中准确重建免疫球蛋白重链和轻链序列,并扩展到恒定区,提高对亚型、亚类和等位基因的分辨率 | 首次实现了从scRNA-seq数据中准确重建全长配对的BCR序列,并扩展到恒定区,包括跨膜片段和胞质尾区,从而区分表面BCR与分泌抗体,同时支持检测剪接变异 | 未明确说明局限性,但可能受限于scRNA-seq中免疫球蛋白转录本稀疏的问题,尤其在初始和记忆B细胞中 | 开发一种准确、开放获取的工具,用于从单细胞RNA测序数据中恢复全长配对的B细胞受体序列,并扩展分析能力至恒定区、亚型、亚类和等位基因水平 | B细胞受体重链和轻链序列,特别是初始和记忆B细胞中的免疫球蛋白转录本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 支持Smart-seq2/3和10x Genomics文库 |
| 3334 | 2026-07-28 |
Development and validation of a cuproptosis-immune prognostic signature for risk stratification and personalized therapy in cutaneous melanoma
2026-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05396-0
PMID:42262432
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研究论文 | 开发并验证了一种铜死亡-免疫相关预后标志,用于皮肤黑色素瘤的风险分层和个性化治疗 | 首次将铜死亡与免疫相关基因结合构建预后模型,并利用单细胞RNA测序验证关键基因XCL2的功能 | 研究基于TCGA和GTEx数据库,缺乏独立外部验证队列;功能实验仅针对XCL2基因,其他模型基因的机制尚待探索 | 构建铜死亡-免疫相关基因特征以预测皮肤黑色素瘤预后并指导治疗 | 皮肤黑色素瘤患者 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库中的SKCM样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析模型基因的细胞分布 |
| 3335 | 2026-07-28 |
Mycobacterium tuberculosis IDH-PPARγ interaction suppresses GPX4 to drive macrophage ferroptosis and sustain persistent infection
2026-Jun-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74032-w
PMID:42259813
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研究论文 | 结核分枝杆菌通过IDH-PPARγ相互作用抑制GPX4,诱导巨噬细胞铁死亡并维持持续感染 | 首次揭示结核分枝杆菌通过IDH与PPARγ相互作用来抑制GPX4表达,从而诱导巨噬细胞铁死亡的新机制 | NA | 探究结核分枝杆菌如何操纵巨噬细胞脂质代谢诱导脂质过氧化和铁死亡以维持细菌持续感染 | 结核分枝杆菌感染的巨噬细胞和小鼠模型 | NA | 结核病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3336 | 2026-07-28 |
Integrative genomic analysis of 21 orofacial diseases identifies shared genetic architecture with systemic diseases
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73925-0
PMID:42243103
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研究论文 | 通过对UK Biobank中21种口面疾病的整合基因组分析,识别了48个新位点和160个推定因果基因,揭示了口面疾病与全身性疾病之间的共享遗传结构 | 首次对多种口面疾病进行系统性的多组学整合分析(全基因组、转录组、罕见变异关联研究和孟德尔随机化),并利用CRISPR-Cas9和单细胞RNA测序验证了关键基因的功能机制 | 主要基于UK Biobank人群数据,可能限制了结果向其他人群的泛化性;部分因果关系证据尚不充分 | 解析口面疾病的遗传结构及其与全身性疾病的因果关系 | 21种口面疾病(包括牙周炎、龋齿、干燥综合征等)及多种全身性疾病(如肺癌、中风) | 机器学习 | 全身性疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、转录组关联研究(TWAS)、罕见变异关联研究、孟德尔随机化、CRISPR-Cas9编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、转录组数据 | UK Biobank数据集(具体样本量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3337 | 2026-07-28 |
Exploratory multiomics analysis identifies WDR17 as a potential biomarker of tyrosine kinase inhibitor resistance in lung adenocarcinoma
2026-May-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05286-5
PMID:42207214
|
研究论文 | 探索性多组学分析确定WDR17作为肺腺癌酪氨酸激酶抑制剂耐药性的潜在生物标志物 | 首次利用TCGA和单细胞转录组数据识别WDR17与肺腺癌TKI耐药性相关,并在体外实验中验证其增强克唑替尼敏感性的功能 | 样本量有限(仅8例TCGA LUAD患者),且缺乏大规模独立队列验证 | 鉴定与肺腺癌TKI耐药性相关的紊乱基因,揭示潜在机制 | 肺腺癌患者肿瘤样本及TKI耐药细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | RNA测序,单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 8例TCGA LUAD患者(RNA-seq数据分析),TKI耐药细胞系(体外实验) | Illumina | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3338 | 2026-07-28 |
PAX4 R192H variant impairs β cell function by disrupting β cell identity and compensatory capacity in response to metabolic stress
2026-May-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01669-z
PMID:42210309
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research paper | 研究PAX4 R192H变异通过破坏β细胞身份和代谢应激下的代偿能力导致β细胞功能障碍的机制 | 首次在PAX4 R192H敲入小鼠模型中结合代谢表型分析、批量与单细胞转录组学及14年人类队列数据,揭示该变异通过增强内质网应激和破坏β细胞成熟度来增加2型糖尿病风险 | 研究主要基于小鼠模型和东亚人群队列,可能无法直接推广至其他种族;单细胞转录组分析仅在高脂饮食条件下进行,未涵盖正常饮食长期效应 | 阐明PAX4 R192H变异如何通过影响β细胞身份和代谢应激下的代偿能力增加2型糖尿病易感性 | PAX4 R192H敲入小鼠、人类队列参与者 | machine learning | 糖尿病 | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、口服葡萄糖耐量测试 | NA | 转录组数据、代谢表型数据 | 小鼠模型及4242名人类参与者 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 3339 | 2026-07-28 |
MicroRNA-7: a versatile player and core target in brain disorders
2026-May-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08313-9
PMID:42204625
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review | 系统综述MicroRNA-7在神经系统疾病中的生物学特性、调控机制及作用,并探讨其临床转化潜力与挑战 | 首次系统阐述miR-7通过ceRNA网络与表观遗传修饰形成的多层动态调控系统,并整合其在脑疾病中多维度干预机制(蛋白聚集、神经炎症、线粒体功能障碍等)及纳米递送系统的临床转化前景 | 机制复杂性、递送系统靶向性不足、临床转化标准缺乏 | 探讨miR-7在脑疾病中的调控机制及其临床转化潜力 | MicroRNA-7(miR-7)及其在脑疾病中的调控网络 | machine learning | 帕金森病,阿尔茨海默病,缺血性脑卒中,脑出血,胶质母细胞瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 3340 | 2026-07-28 |
HucMSC-mediated stromal metabolic reprogramming in reactivating aged ovaries: a single-cell transcriptomic perspective
2026-May-26, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-026-00919-7
PMID:42192288
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人脐带间充质干细胞通过基质代谢重编程恢复衰老卵巢功能 | 首次在单细胞水平揭示HucMSC通过诱导卵母细胞和体细胞的代谢重编程,特别是基质细胞向类固醇生成和卵泡生成方向重定向而非纤维化,以及增强卵母细胞线粒体功能,从而恢复衰老卵巢功能和卵子质量 | 未明确提及,但可能限于小鼠模型及对具体分子机制仍需进一步验证 | 研究HucMSC是否以及如何恢复衰老卵巢功能和卵母细胞质量,并阐明潜在通路 | 衰老小鼠卵巢(包括卵母细胞、颗粒细胞、基质细胞) | 单细胞转录组学 | 老年性疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 衰老小鼠卵巢样本,未提供具体数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |