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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3301 | 2026-07-28 |
Metabolic Checkpoints in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma: ACSL1 and PPARD Orchestrate Lipid-Ferroptosis Crosstalk via Keratinocyte Remodeling
2026-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05734-6
PMID:42154143
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研究论文 | 本研究整合生物信息学和单细胞RNA测序分析,鉴定皮肤鳞状细胞癌中与铁死亡和脂质代谢相关的生物标志物ACSL1和PPARD,并揭示其通过角质形成细胞重塑协调脂质-铁死亡串扰的潜在机制 | 首次在皮肤鳞状细胞癌中通过单细胞转录组测序揭示ACSL1和PPARD在角质形成细胞分化过程中的动态表达模式,并提出其调控脂质-铁死亡串扰的新机制 | 研究仅揭示ACSL1/PPARD与脂质-铁死亡串扰的关联性,未建立因果关系,且缺乏蛋白水平和功能性验证 | 阐明皮肤鳞状细胞癌中铁死亡与脂质代谢紊乱的具体分子机制,识别关键生物标志物 | 皮肤鳞状细胞癌患者组织和细胞样本 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 临床皮肤鳞状细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3302 | 2026-07-28 |
Decoding anemoside B4: Core mechanistic axes and an omics-to-atom paradigm
2026-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108270
PMID:42217593
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研究论文 | 解析白头翁皂苷B4(AB4)的核心作用机制轴,并提出一种从组学到原子的新范式以突破传统分析方法的分辨率限制 | 识别出AB4的四种核心机制轴,并揭示其在不同疾病背景下对PI3K/Akt通路的矛盾双向调控现象,提出整合单细胞/空间转录组学、细胞类型特异性化学蛋白质组学、冷冻电镜和CRISPR功能基因组学的"组学到原子"范式以解析细胞异质性和动态药物-蛋白质相互作用 | 传统组织分析方法固有的分辨率上限掩盖了细胞类型特异性的相互作用组,无法解释AB4的矛盾双向调控 | 阐明AB4的精确分子机制,建立从组学到原子的研究范式以推动天然产物药理学向精准医学转型 | 白头翁皂苷B4(AB4)及其在不同疾病(炎症、肿瘤、病毒和代谢疾病)中的作用机制 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 化学蛋白质组学, 冷冻电镜, CRISPR功能基因组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3303 | 2026-07-28 |
Targeting tumor‑associated macrophages in osteosarcoma: From molecular reprogramming to immuno-regenerative scaffolds
2026-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108294
PMID:42285386
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综述 | 评估骨肉瘤中靶向肿瘤相关巨噬细胞的干预策略,重点关注从单型吞噬检查点阻断向多模式协同方案的转变,并探讨免疫再生支架等新型生物材料的发展 | 系统阐述骨肉瘤治疗中从传统免疫检查点阻断向多模式协同方案(如纳米医学、代谢应激诱导、药理学重编程)的范式转变,并首次聚焦免疫再生支架这一双功能生物材料在术后肿瘤清除与骨再生同步中的创新应用 | 未明确提及具体局限性,但作为综述可能受限于现有研究数据的时效性和临床转化验证的缺乏 | 评估骨肉瘤中肿瘤相关巨噬细胞靶向干预的研究进展,突破传统治疗瓶颈 | 骨肉瘤中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其M2样免疫抑制表型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学, 仿生平台, 铁磁氧醇MRI, 高分辨率生物标志物(PSME2) | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组学用于绘制物理免疫排斥屏障和新型治疗亚群 |
| 3304 | 2026-07-28 |
A spatial and temporal atlas of tubulin isotype gene expression during vertebrate embryonic development
2026-Aug, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E26-03-0116
PMID:42275208
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研究论文 | 建立了脊椎动物胚胎发育过程中微管蛋白同型基因表达的时空图谱 | 首次在脊椎动物胚胎中系统解析了α-和β-微管蛋白同型基因在神经嵴上皮间充质转化和分化过程中的空间表达模式 | 需要进一步研究验证这些转录模式与微管蛋白组成的关联性 | 阐明微管蛋白同型基因在脊椎动物胚胎发育过程中细胞状态转变时的表达调控 | 鸡胚神经嵴细胞及其相关细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交链式反应 | NA | 基因表达数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集及鸡胚发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3305 | 2026-07-28 |
Crosstalk between ion homeostasis and lipid peroxidation: Mechanisms and translational opportunities in regulated cell death
2026-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108308
PMID:42315070
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综述 | 系统性综述了离子稳态与脂质过氧化在调节性细胞死亡中的交叉对话机制及其转化医学潜力 | 提出脂质过氧化作为金属催化氧化应激与离子通道介导的细胞器功能障碍的核心生化交汇点,并揭示肿瘤免疫微环境中离子驱动RCD的双重作用 | 未涉及体内实时离子动态监测技术的具体验证数据 | 解析离子稳态与脂质过氧化的交互机制,为肿瘤、心血管及神经疾病的治疗提供新靶点 | 调节性细胞死亡(铁死亡、铜死亡、焦亡、凋亡)中的离子信号网络 | 机器学习 | 心血管疾病, 肿瘤 | NA | NA | 综述文献 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3306 | 2026-07-28 |
Engineered exosomes improve myocardial cell membrane integrity and heart function in dystrophic cardiomyopathy
2026-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70751
PMID:42505044
|
research paper | 开发工程化外泌体改善杜氏肌营养不良相关心肌病的心肌细胞膜完整性和心脏功能 | 首次使用工程化外泌体(Exo-CHP)靶向治疗杜氏肌营养不良相关心肌病,并揭示其通过调节基因表达、抑制钙内流和calpain蛋白酶活性等机制发挥作用 | 未提及具体局限性 | 开发工程化外泌体治疗杜氏肌营养不良相关心肌病并探索其机制 | DmdΔ4小鼠(杜氏肌营养不良心肌病模型)及原代心肌细胞 | machine learning | cardiovascular disease | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | DmdΔ4小鼠及相关原代心肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3307 | 2026-07-28 |
Functionally Guided Graph Learning for Robust Cross-Patient Cell-Type Annotation in Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jul-27, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c01857
PMID:42455075
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研究论文 | 提出PathoGraph框架,利用功能引导的图学习实现跨患者单细胞RNA测序中稳健的细胞类型注释 | 整合KEGG-7通路生物语义图结构与跨患者表征自适应机制,通过功能语义信息优化细胞图,减少纯表达相似性引入的噪声 | 未明确提及跨数据集的泛化能力及计算开销 | 解决跨患者单细胞RNA测序中细胞类型注释的异质性和分布偏移问题 | 32个跨患者参考到查询的细胞注释迁移任务,覆盖白血病、乳腺浸润癌和结直肠癌数据集 | 机器学习 | 白血病, 乳腺癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 32个跨患者转移任务,具体样本量未明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3308 | 2026-07-28 |
SpaVCCA Identifies Spatial Transcriptomics Domains Across Slices by Coupling Variational Autoencoder with Canonical Correlation Analysis
2026-Jul-27, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c01401
PMID:42462182
|
研究论文 | 提出SpaVCCA框架,通过结合变分自编码器和典型相关分析,实现跨切片空间转录组学域鉴定 | 首次将图卷积变分自编码器与基于CCA的对齐损失及图对比目标结合,统一批量校正与空间结构保持 | 文中未明确讨论局限性 | 解决空间转录组学数据整合中批量校正与空间结构保持的权衡问题 | 来自不同平台(Visium、Stereoseq、MERFISH)的多片空间转录组学数据及3D空间数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积变分自编码器、典型相关分析、对比学习 | 基因表达数据 | 多个切片,涵盖不同平台技术 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, BGI Stereoseq | Visium、Stereoseq、MERFISH平台,含多张切片及跨技术整合 |
| 3309 | 2026-07-28 |
Preclinical and limited clinical evidence for metformin in ulcerative colitis: a systematic review and meta-analysis
2026-Jul-27, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05749-0
PMID:42503524
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系统综述与Meta分析 | 系统评估二甲双胍作为溃疡性结肠炎潜在重定位疗法的临床前疗效和有限临床证据,并利用多组学和计算机模拟分析探索候选机制 | 首次将多组学分析、3D响应面建模、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、单细胞RNA测序和空间转录组学整合到系统综述中,优先排序潜在剂量-时间模式和候选机制通路 | 动物研究样本量小、方法学异质性高、存在小样本效应;人类RCT数量有限且临床终点异质性大;探索性结果如XDH相关上皮炎症程序需进一步验证 | 评价二甲双胍治疗溃疡性结肠炎的疗效和机制 | 溃疡性结肠炎动物模型和人类患者 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟 | 3D响应面模型 | 基因表达数据、蛋白质结构数据、临床数据 | 8项临床前动物研究和3项人类RCT,共232名患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3310 | 2026-07-28 |
Targeting IFN-I driven tertiary lymphoid structures halts B cell-mediated bone loss in periodontitis
2026-Jul-27, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00450-7
PMID:42503518
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研究论文 | 本研究揭示IFN-I驱动的三级淋巴结构在牙周炎中介导B细胞相关骨丢失的机制 | 首次阐明三级淋巴结构在牙周炎中作为B细胞激活枢纽促进破骨细胞生成和骨吸收,并验证IFN-I信号通路可作为治疗靶点 | 未提及 | 探究三级淋巴结构在牙周炎B细胞介导骨丢失中的作用及IFN-I信号通路的治疗潜力 | 牙龈组织、成纤维细胞、B细胞、小鼠牙周炎模型 | 机器学习 | 牙周炎 | 多重免疫组化染色、单细胞RNA测序、体外实验、小鼠模型 | 未提及 | 基因表达数据、组织图像 | 未明确样本数量,涉及人牙龈组织和小鼠模型 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 3311 | 2026-07-28 |
Plant Immunity in High Resolution: Advances in Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Plant-Pathogen Interactions
2026-Jul-27, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag374
PMID:42504126
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综述 | 综述了单细胞和空间转录组学在植物-病原体互作研究中的进展,揭示细胞类型特异性免疫反应和空间组织 | 系统总结了单细胞RNA测序和空间转录组学如何解析植物免疫反应中的细胞异质性和空间信息,突破了传统整体组织分析的局限 | 当前技术限制包括实验成本、数据解析难度以及空间分辨率的进一步提升需求 | 总结单细胞和空间转录组学在植物-病原体互作研究中的应用,推动高分辨率植物免疫研究 | 植物与病原体互作系统中的细胞类型及组织区域 | 自然语言处理 | 植物病害 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 3312 | 2026-07-28 |
Antipsychotics-Induced Hyposalivation Mediated by Impaired Salivary Ca2+ Signaling
2026-Jul-27, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70410
PMID:42504524
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研究论文 | 研究抗精神病药物通过损害唾液钙信号导致唾液分泌减少的分子机制 | 首次发现抗精神病药物通过直接抑制唾液腺中毒蕈碱受体而非多巴胺或血清素受体导致唾液分泌减少 | 未提及研究局限性 | 阐明奥氮平、氟哌啶醇和利培酮诱导唾液分泌减少的分子机制 | 人唾液腺NS-SV-AC细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3313 | 2026-07-28 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Tumor Heterogeneity and the Microenvironment in Pseudomyxoma Peritonei
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523760
PMID:42504943
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序、全外显子测序、批量RNA测序和组织病理学验证,构建了原发性与配对转移性假性腹膜黏液瘤的高分辨率图谱,揭示了肿瘤异质性和微环境特征 | 首次构建了假性腹膜黏液瘤原发性与配对转移性肿瘤的高分辨率单细胞转录组图谱,鉴定了上皮细胞的不同功能状态(如TFF3黏液分泌相关状态和MACC1恶性相关状态),并发现了转移病变中微环境的重编程,包括POSTN纤维化相关成纤维细胞、CXCL5巨噬细胞及胶原免疫排斥屏障 | 回顾性观察仅来自三例复发性假性腹膜黏液瘤病例,样本量有限,且抗血管生成治疗的潜力需进一步前瞻性验证 | 利用单细胞转录组学阐明假性腹膜黏液瘤的肿瘤异质性和微环境生态系统,为开发新型治疗策略提供资源 | 假性腹膜黏液瘤的原发性及配对转移性肿瘤样本 | 计算病理学 | 假性腹膜黏液瘤 | 单细胞RNA测序、全外显子测序、批量RNA测序、组织病理学验证 | NA | 基因表达数据(单细胞和批量)、外显子测序数据、组织图像 | 多例假性腹膜黏液瘤肿瘤样本(含3例复发性病例的回顾性观察) | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 3314 | 2026-07-28 |
Targeting the KCNC3-Dependent Anterior Insular-Lateral Orbitofrontal Cortex Glutamatergic Circuit Attenuates Post-Traumatic Anxiety
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76779
PMID:42505083
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研究论文 | 本研究揭示了创伤性脑损伤后焦虑的关键神经环路与分子机制,发现前岛叶-外侧眶额叶皮层谷氨酸能环路的过度活跃及KCNC3下调是核心病理基础 | 首次阐明KCNC3依赖的前岛叶-外侧眶额叶皮层谷氨酸能环路在创伤后焦虑中的双向调控作用,并整合fMRI、单细胞测序及光遗传学技术验证机制 | 主要基于小鼠模型,人类验证仅通过影像学关联,缺乏直接因果验证;KCNC3下游分子通路尚未完全解析 | 探索创伤性脑损伤后焦虑的神经环路及分子机制 | 人类创伤性脑损伤患者(额叶损伤伴焦虑)及小鼠额叶创伤模型 | 神经科学 | 创伤后焦虑症 | BOLD-fMRI、单细胞RNA测序、光遗传学、化学遗传学、c-Fos表达分析 | NA | 影像数据、基因表达数据、行为学数据 | 人类患者数据(具体数量未提及);小鼠模型(分焦虑与不焦虑组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3315 | 2026-07-28 |
High-Fat Diet Reprograms the Periapical Immune Landscape in a Mouse Model of Apical Periodontitis: A Spatial Transcriptomics Study
2026-Jul-27, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70237
PMID:42506892
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示高脂饮食如何重塑小鼠根尖周炎模型中的免疫微环境 | 首次结合空间转录组学与高脂饮食诱导的代谢紊乱模型,系统解析根尖周病中先天免疫细胞(中性粒细胞和巨噬细胞)的空间重编程及其对骨破坏的影响 | 仅使用雄性C57BL/6小鼠,未纳入雌性个体,且高脂饮食暴露时间为18周,可能无法完全代表长期慢性代谢疾病状态 | 探究慢性高脂饮食如何通过空间转录组学改变根尖周髓系细胞状态及病变特征 | 雄性C57BL/6小鼠(n=20,6-8周龄) | 数字病理学, 空间转录组学 | 根尖周炎 | 空间转录组学(10x Genomics Xenium原位分析), 微型CT | NA | 空间基因表达数据, 组织切片, 微型CT图像 | 20只C57BL/6小鼠,分为正常饮食组(n=10)和高脂饮食组(n=10),每只小鼠第一磨牙诱导根尖周炎 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Genomics Xenium原位空间转录组学分析,重点检测中性粒细胞和巨噬细胞相关基因 |
| 3316 | 2026-07-28 |
DSSMST: A Deterministic State Space Model for Self-Supervised Spatial Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Jul-27, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11441-y
PMID:42507063
|
研究论文 | 提出了DSSMST,一个结合确定性状态空间模型、图神经网络和对比学习的自监督学习框架,用于空间转录组学中的空间域识别 | 引入确定性状态空间模型(DSSM)捕捉空间梯度变化和连续依赖关系,克服了静态图方法的局限性;结合自监督对比学习机制增强潜在嵌入空间,提升识别精度 | 未提及 | 准确识别空间转录组学数据中的功能区域 | 空间转录组学数据集中的空间域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 确定性状态空间模型(DSSM)、图神经网络(GNN)、对比学习 | 基因表达数据 | 多个代表性空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3317 | 2026-07-28 |
Tumor-derived ITGB3 shapes a primed but functionally constrained NK cell state in breast cancer through HLA-E-NKG2A signaling
2026-Jul-27, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12497-0
PMID:42507293
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研究论文 | 本研究揭示乳腺癌中肿瘤来源的ITGB3通过HLA-E-NKG2A信号塑造一种启动但功能受限的NK细胞状态 | 首次发现恶性细胞中ITGB3表达通过HLA-E-NKG2A信号轴影响NK细胞状态,并揭示NKG2A抑制性分支的功能贡献 | 未明确排除NKG2C激活信号的协同作用,且结论基于体外共培养实验,需体内验证 | 探究乳腺癌中恶性细胞ITGB3表达对NK细胞状态的调控机制及其在免疫逃逸中的作用 | 乳腺癌肿瘤微环境中的NK细胞和ITGB3阳性/阴性恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | TCGA-BRCA队列(具体样本数未提及),MDA-MB-231和BT-474细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3318 | 2026-07-28 |
The immunological landscape of the area postrema in neuromyelitis optica spectrum disorders
2026-Jul-26, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.70127
PMID:42503643
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研究论文 | 通过空间转录组学和免疫组化分析,揭示了视神经脊髓炎谱系疾病中后区与延髓的免疫景观差异,并探讨了视黄酸的保护作用 | 首次结合空间转录组学与功能注释聚类,系统比较了后区与延髓在水通道蛋白4抗体作用下的免疫反应差异,并发现醛脱氢酶1家族成员A2(Aldh1a2)在后区的高表达及其通过视黄酸发挥保护作用的潜在机制 | 文中未明确提及研究局限性 | 探究视神经脊髓炎谱系疾病中后区对水通道蛋白4抗体具有抵抗性的免疫学原因 | 视神经脊髓炎谱系疾病患者的后区和延髓组织 | 数字病理学 | 视神经脊髓炎谱系疾病 | 免疫组化分析,空间转录组学 | NA | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3319 | 2026-07-28 |
Intracerebral Hemorrhage Induces Monocyte TNF Signaling in Patients That Is Suppressed by BAF312
2026-Jul-25, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70485
PMID:42501052
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研究论文 | 对脑出血患者外周血免疫细胞进行单细胞RNA测序,发现BAF312抑制单核细胞TNF信号且与临床结局相关 | 首次在脑出血患者中纵向追踪BAF312(Siponimod)对单核细胞TNF信号通路的抑制作用,并揭示单核细胞TNF信号与良好临床结局的正相关关系 | 样本量较小(仅7例患者),需更大规模研究验证结果的普适性 | 研究脑出血后一周内免疫应答的动态变化及免疫调节药物BAF312的影响 | 脑出血患者外周血单核细胞及淋巴细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7例患者(5例BAF312治疗,2例安慰剂) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3320 | 2026-07-28 |
FOSL2-driven SASP in endometrial stroma promotes the inflammation of endometriosis
2026-Jul-24, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-026-00447-w
PMID:42498708
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研究论文 | 本研究探讨FOSL2驱动的子宫内膜基质细胞衰老相关分泌表型(SASP)在子宫内膜异位症炎症中的作用 | 首次发现转录因子FOSL2异常过表达诱导子宫内膜基质细胞衰老和SASP,并通过NF-κB信号通路促进M2巨噬细胞极化和招募,揭示了FOSL2作为子宫内膜异位症慢性盆腔炎症的新机制 | 未明确说明 | 探究子宫内膜异位症中促炎性SASP的机制及其潜在影响 | 子宫内膜基质细胞(ESCs)及子宫内膜异位症患者的在位内膜和异位病灶 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 未明确说明 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |