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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 3281 - 3300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3281 2026-07-31
A latent factor framework to organize regulatory and metabolic programs inferred from scRNA-seq
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 提出一个潜在因子框架,用于组织从单细胞RNA测序中推断出的调控和代谢程序 首次联合建模基因表达、转录因子调控活性、代谢物水平特征和预测代谢通量四种转录组功能投影,通过潜在因子组织策略实现协调变异轴的功能解释 未说明该框架在不同组织或疾病类型中的泛化能力,且依赖单细胞RNA测序数据的推断准确性 开发一种潜在因子组织策略,从单细胞RNA测序数据中整合并解析调控和代谢功能程序 乳腺癌细胞系数据集中的细胞状态 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 潜在因子模型 单细胞RNA测序数据 乳腺癌细胞系数据集(具体样本量未明确) 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
3282 2026-07-31
GLA is associated with ESCC progression and chemotherapy response via DNA damage repair-related pathways
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 揭示GLA通过DNA损伤修复相关通路促进食管鳞癌进展并影响化疗应答 首次在食管鳞癌中鉴定GLA的上调表达及其通过DNA损伤修复通路影响化疗敏感性的机制,发现Migalastat联合化疗具有协同增敏作用 机制研究和体内验证尚待进一步开展 探究GLA在食管鳞癌进展和化疗应答中的作用及分子机制 食管鳞状细胞癌 机器学习 食管癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化, qRT-PCR, Western blot, siRNA敲低 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 两个独立ESCC数据集(GSE161533, GSE38129)及一个独立验证集(GSE20347),整合单细胞RNA-seq图谱,两个ESCC细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3283 2026-07-31
Bioinformatics-driven single-cell sequencing analysis of angiogenesis-related genes in rheumatoid arthritis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于生物信息学驱动单细胞测序分析类风湿性关节炎中血管生成相关基因 通过单细胞测序和生物信息学分析,首次系统鉴定类风湿性关节炎中HIF1、VEGFA、E2F7、E2F8和IL10等关键血管生成基因,并揭示其与疾病活动度的相关性 样本量有限,且仅基于公共数据库和少数临床样本验证 探索类风湿性关节炎中血管生成相关基因和免疫细胞谱,评估其临床相关性 类风湿性关节炎患者滑膜组织和外周血单核细胞 数字病理学 类风湿性关节炎 单细胞测序、定量实时PCR NA 基因表达数据、单细胞测序数据 来自公共数据库和临床样本的类风湿性关节炎患者与健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3284 2026-07-31
Analysis of senescence in pituitary tumors from different lineages and the potential role of senolytic drugs as targeted therapies
2026, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 通过空间转录组学和单核RNA测序分析不同谱系垂体瘤的衰老特征,并探索抗衰老药物靶向治疗的潜力 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术全面解析垂体瘤的衰老、增殖和干性景观,并验证达沙替尼对垂体瘤原代细胞的抗衰老效应 样本量有限且仅包含药物治疗抵抗的垂体瘤亚型,未涵盖所有垂体瘤谱系 探究不同谱系垂体瘤中细胞衰老、上皮-间质转化和干性特征,以及抗衰老药物的潜在治疗价值 多巴胺激动剂抵抗的泌乳素分泌型垂体瘤、生长激素分泌型和非功能性促性腺分化型垂体瘤 数字病理学 垂体瘤 空间转录组学, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, 单核转录组数据 多巴胺激动剂抵抗的泌乳素分泌型垂体瘤、生长激素分泌型和非功能性促性腺分化型垂体瘤样本 NA 空间转录组学, 单核RNA测序 NA NA
3285 2026-07-31
Metabolic-immunoregulatory subtypes reveal prognostic and therapeutic insights in multiple primary lung cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析多原发肺癌的代谢免疫调控亚型,揭示其预后和治疗意义 首次系统描绘多原发肺癌中代谢重编程和免疫调控特征,鉴定出代谢异常的恶性上皮亚群,并构建基于代谢的八基因预后模型 样本量有限(4例多原发肺癌患者),功能验证主要依赖体外实验,缺乏体内模型验证 探索多原发肺癌的肿瘤内在代谢特征和免疫调控相互作用,建立代谢相关的预后分层和治疗策略 多原发肺癌患者的肿瘤样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 Lasso-Cox回归 基因表达数据 11个单原发肺癌肿瘤和4例多原发肺癌患者的8个样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3286 2026-07-31
Gut microbiota induces immune-related alterations in gene expression, RNA methylation, and metabolism in glioblastoma revealed by single-cell and spatial multi-omics
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞和空间多组学揭示肠道微生物通过免疫相关改变影响胶质母细胞瘤的基因表达、RNA甲基化和代谢 首次综合运用单细胞转录组、空间转录组、宏基因组、代谢组和m6A-seq等多种组学手段,系统探究抗生素扰动肠道微生物对胶质瘤进程的影响机制 主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;具体机制如肠道微生物如何精确调控EPHA信号通路仍需进一步阐明 阐明肠道微生物通过肠-脑轴影响胶质母细胞瘤进程的分子机制 抗生素处理的小鼠胶质母细胞瘤模型 机器学 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 宏基因组测序, 代谢组学, m6A-seq NA 转录组数据, 空间转录组数据, 宏基因组数据, 代谢组数据, 表观转录组数据 小鼠胶质瘤样本(实验组和对照组各若干只,具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 宏基因组学, 代谢组学, m6A-seq NA NA
3287 2026-07-31
Spatiotemporal orchestration of the salivary gland immune microenvironment in Sjögren's disease: a multidimensional framework of epithelial licensing, lymphoid neogenesis, and stromal remodeling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 提出一种以组织为中心的诠释框架,用于解释干燥综合征中唾液腺免疫微环境的时空演变 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和纵向组织学研究证据,提出包含上皮激活、淋巴新生和基质重塑三个重叠维度的组织中心框架,挑战传统将干燥综合征视为均一炎症性疾病的观点 该框架仅作为诠释性构建,尚未经过验证的临床分期分类,相关生物标志物的应用仍需前瞻性验证 弥合干燥综合征生物学靶点参与和临床获益之间的差距,提出基于组织状态和疾病分期的精准医学策略 干燥综合征患者唾液腺免疫微环境 数字病理学 干燥综合征 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 组织数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3288 2026-07-31
Single-cell transcriptomic profiling of bronchial lymph nodes reveals mechanisms of PRRSV escape from host adaptive immunity
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过支气管淋巴结单细胞转录组分析揭示PRRSV逃逸宿主适应性免疫的机制 首次发现PRRSV感染相关的RAG1+ CD4+CD8+双阳性T细胞亚群,并揭示该病毒通过破坏Tfh细胞与生发中心B细胞间的相互作用等途径抑制抗体产生 本研究仅使用猪模型,结果是否适用于其他物种需进一步验证;且主要关注支气管淋巴结,其他组织中的免疫逃逸机制未探讨 解析高致病性PRRSV感染如何通过调控支气管淋巴结免疫细胞组成和互作来逃逸宿主适应性免疫 感染高致病性PRRSV(HV株)及其减毒衍生株(N29株)的仔猪支气管淋巴结细胞 数字病理学 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量(来自感染HP-PRRSV HV株或N29株的仔猪支气管淋巴结) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3289 2026-07-31
Single-cell profiling uncovers extracellular vesicle-associated malignant plasma cell subpopulations driving multiple myeloma progression
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者的骨髓样本,揭示了与细胞外囊泡相关的恶性浆细胞亚群及其在疾病进展中的作用 首次在单细胞水平上鉴定出ASS1+浆细胞亚群具有高细胞外囊泡特征和干性,并与复发/难治性MM密切相关,揭示了其通过转录因子调控网络、代谢重编程及与骨髓微环境串扰驱动疾病进展的新机制 样本量较小(12例患者),且未提及功能验证实验存在离体模型限制,需进一步在更大队列和体内模型中验证 解析多发性骨髓瘤的异质性、进展机制及恶性浆细胞亚群的特征 12例多发性骨髓瘤患者(包括SMM、NDMM和RRMM亚型)的骨髓样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 CytoTRACE, Monocle, Slingshot, CellChat, SCENIC 单细胞基因表达数据 12例多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3290 2026-07-30
Deciphering transcriptional plasticity in pancreatic ductal adenocarcinoma reveals alterations in sensory neuron innervation
2026-07, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析胰腺导管腺癌中感觉神经元的转录可塑性,发现肿瘤相关神经支配中神经元亚群变化及肿瘤来源RNA转移的新机制 首次对胰腺和胰腺导管腺癌感觉神经元进行详细的转录组学分析,识别出神经丝蛋白阳性神经元为优势亚型,并发现肿瘤来源RNA通过细胞外囊泡转移至感觉神经元的新机制 研究主要基于小鼠模型,结论向人类胰腺癌转化需进一步验证 揭示胰腺导管腺癌中感觉神经元的转录组特征及其在肿瘤进展中的作用 小鼠胰腺感觉神经元(背根神经节中Fast Blue阳性的感觉神经元) 转录组学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、类器官培养、qPCR NA 单细胞转录组数据 野生型和KPC小鼠模型,具体数量未明确 未明确 单细胞RNA-seq 未明确 NA
3291 2026-07-30
Identifying clinically relevant cell state interactions in the tumor microenvironment of IDH-mutant gliomas using CSI-TME
2026-Jun, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 提出了CSI-TME计算框架,用于从批量转录组数据推断IDH突变胶质瘤肿瘤微环境中的细胞状态相互作用 将基因相互作用概念(如合成致死)扩展到细胞状态,直接利用大规模批量转录组数据集推断预后相关的细胞状态互作 缺乏具有临床信息的单细胞RNA测序队列,且批量RNA测序队列缺少细胞背景 系统表征IDH突变胶质瘤肿瘤微环境中的功能细胞状态相互作用 IDH突变胶质瘤患者肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞状态 机器学习 胶质瘤 RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA 批量转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 多个批量转录组数据集队列 NA bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、spatial transcriptomics NA NA
3292 2026-07-30
Decoding B-cell Signatures of Complete Pathologic Response to Perioperative Chemoimmunotherapy in Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Apr-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 通过多组学分析B细胞和三级淋巴结构特征,揭示非小细胞肺癌围手术期化疗免疫治疗完全病理应答的免疫景观 首次整合B细胞受体库、多重免疫荧光、批量及空间转录组学等多组学数据,系统解析完全病理应答肿瘤中B细胞克隆性、类别转换及三级淋巴结构成熟度的动态变化 NA 阐明B细胞和三级淋巴结构在围手术期化疗免疫治疗完全病理应答中的免疫机制,并探索B细胞受体指标作为预测性生物标志物的潜力 非小细胞肺癌患者(来自NADIM/NADIM II临床试验)的肿瘤组织和血液样本 数字病理学 非小细胞肺癌 B细胞受体库测序、多重免疫荧光、批量RNA-seq、空间转录组学、单细胞转录组学 NA 基因表达数据、组织图像、免疫组化数据 123例患者(87份组织样本、25份血液样本用于B细胞受体库;67份组织用于多重免疫荧光;15份用于批量转录组;12份用于空间转录组;15份用于单细胞转录组) NA NA NA NA
3293 2026-07-30
The topographical distribution of spermatogonial subpopulations during the cycle of seminiferous epithelium in Macaca Fascicularis
2026-04-13, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 探究食蟹猴生精上皮周期中精原细胞亚群的拓扑分布 首次描述灵长类中不同精原细胞亚群在生精小管基底室的阶段性空间分布模式,并发现其与生精上皮周期的动态协调 未说明具体局限性 阐明灵长类精原细胞亚群的空间分布及其与微环境的关系 食蟹猴(Macaca fascicularis)的生精上皮组织 NA NA 免疫组化染色 NA 图像 Bouin固定食蟹猴样本 NA NA NA NA
3294 2026-07-30
LINC01116, a hypoxia-lncRNA marker of pathological lymphangiogenesis and poor prognosis in lung adenocarcinoma
2026-04, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本文研究LINC01116作为低氧相关长链非编码RNA在肺腺癌病理性淋巴管生成和不良预后中的作用 首次发现LINC01116在淋巴内皮细胞中高表达,并作为肿瘤淋巴管生成的特异性生物标志物 LUAD癌细胞系中未发现LINC01116的明显调控作用 探究LINC01116在肺腺癌淋巴管生成中的作用及预后价值 肺腺癌患者队列、LUAD癌细胞系、淋巴内皮细胞 生物信息学 肺腺癌 转录组分析、CRISPRi、RNA干扰、单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 肺腺癌患者队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3295 2026-07-30
Neural signaling contributes to heart formation and growth in the invertebrate chordate, Ciona robusta
2026-Apr, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 研究表明神经肽速激肽和经典Wnt信号共同调控无脊椎动物尾索动物强壮海鞘的心肌祖细胞增殖 首次发现神经肽速激肽对心肌祖细胞增殖的调控作用,结合单细胞RNA测序揭示了心脏神经样细胞的分布及其与远端祖细胞的神经支配关系 研究仅限于无脊椎动物模型,可能无法直接推广到脊椎动物心脏发育 探索神经元信号在心脏形成和生长中的作用机制 无脊椎动物尾索动物强壮海鞘的成年心脏 机器学习 NA 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因敲除、药理抑制剂 NA 单细胞基因表达数据 成年强壮海鞘心脏样本(具体数量未提及) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒用于单细胞文库构建,Illumina NovaSeq用于测序
3296 2026-07-30
Construction of a SEMA3 family-based model to predict prognosis and molecular subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Mar-06, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 基于SEMA3家族基因构建预测胰腺导管腺癌预后和分子亚型的模型 首次整合多组学数据系统分析SEMA3家族在胰腺导管腺癌中的表达异质性,结合单细胞和空间转录组学揭示SEMA3C在肿瘤微环境中调控免疫逃逸的细胞间通讯作用 主要基于公开数据集,缺乏独立外部验证队列;SEMA3C作为治疗靶点需进一步实验验证 探究SEMA3基因家族在胰腺导管腺癌中的预后和免疫学意义并开发风险模型 胰腺导管腺癌患者 机器学习 胰腺导管癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 LASSO回归, Cox比例风险模型 基因表达数据, 突变数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 多中心公共数据集(TCGA和GEO) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3297 2026-07-30
RNA Quality Control Enables Antibiotic Tolerance
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过实验进化揭示细菌在抗生素和免疫压力下通过RNA质量控制实现抗生素耐受性的机制 发现RNA降解体组分RNase Y的突变通过转录水平上的赌博策略(少数维持基线转录,多数选择性降解RNA)赋予细菌广谱抗生素耐受性,并加速恢复 未在临床菌株或体内模型中验证这些耐受机制的普适性 探究细菌在复杂宿主环境中适应抗生素压力的分子机制 细菌群体在不同抗生素和免疫状态下的适应性进化及耐药性机制 机器学习 感染性疾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 不同抗生素和免疫条件下实验进化的细菌群体样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3298 2026-07-29
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2026-Aug, Neurological research IF:1.7Q4
研究论文 通过整合单细胞和空间转录组学分析,揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫学作用 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子,通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 NA 探究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值及其驱动恶性进展的分子机制,以识别新的治疗靶点 低级别胶质瘤患者样本中的恶性单细胞亚群及空间转录组数据 数字病理学 低级别胶质瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 低级别胶质瘤患者样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
3299 2026-07-28
A salivary protein panel for detecting malignant transformation of oral leukoplakia
2026-Sep, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 通过唾液蛋白质组学分析,识别出一个五蛋白组合用于检测口腔白斑的恶性转化 首次利用唾液蛋白质组学结合机器学习方法,开发出非侵入性的五蛋白生物标志物组合用于检测口腔白斑向口腔鳞状细胞癌的恶性转化 样本量相对较小(131例),且未在独立大样本队列中验证 探索基于唾液蛋白质组学的非侵入性方法以检测口腔白斑的恶性转化 口腔白斑患者和口腔白斑相关口腔鳞状细胞癌患者 机器学习 口腔癌 质谱蛋白质组学 XGBoost, LASSO回归 蛋白质表达数据 131例(48例口腔白斑和83例口腔白斑相关口腔鳞状细胞癌患者) NA NA NA NA
3300 2026-07-28
A self-perpetuating cycle of Type H vessel proliferation and T-2 induced inflammation drives KBD pathogenesis
2026-08, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 揭示H型血管增殖与T-2毒素诱导的炎症在Kashin-Beck病发病机制中的恶性循环 首次发现H型血管在Kashin-Beck病中作为关键介导因子,连接T-2毒素运输、炎症和软骨损伤,并揭示其增殖与炎症信号的恶性循环 未提及 研究H型血管在Kashin-Beck病发病机制中的潜在作用 Kashin-Beck病大鼠模型 数字病理学 大骨节病 单细胞RNA测序,qPCR NA 基因表达数据 大鼠模型,分为安慰剂组、T-2组、T-2+Roxadustat组和T-2+Halofuginone组 NA 单细胞RNA测序 NA 未指定具体平台
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