单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 3608 篇文献，本页显示第 3281 - 3300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3281 | 2026-01-11 |
Axonal Eif5a hypusination controls local translation and mitigates defects in FUS-ALS
2026-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02101-2
PMID:41430470
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术，揭示了轴突局部蛋白合成的调控机制及其在FUS-ALS中的缺陷，并通过恢复Eif5a hypusination来缓解神经退行性病变 | 首次在成年小鼠运动神经轴突中应用空间转录组学进行亚细胞定位，发现Eif5a hypusination在轴突局部翻译中的关键作用，并证明多胺亚精胺治疗可恢复这一过程并减轻ALS相关毒性 | 研究主要基于小鼠和果蝇模型，尚未在人类患者中验证；空间转录组学技术可能受限于分辨率和灵敏度 | 探究神经元局部蛋白合成的调控机制及其在肌萎缩侧索硬化症（ALS）中的失调 | 成年小鼠运动神经轴突和细胞体，以及携带FUS和TDP-43突变的果蝇模型 | 空间转录组学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 空间转录组学，多重单分子空间转录组学，免疫荧光 | NA | 转录组数据，图像数据 | 成年小鼠运动神经样本和果蝇模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3282 | 2026-01-11 |
Multi-omics analysis identifies PUS7 as an immune modulator driving NETs-mediated macrophage polarization in pancreatic cancer
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70581
PMID:41496500
|
研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了PUS7在胰腺癌中通过诱导中性粒细胞胞外陷阱形成，驱动巨噬细胞向M2表型极化，从而促进免疫抑制和肿瘤进展的新机制 | 首次将PUS7鉴定为胰腺癌中NET介导的免疫调节关键调控因子，并阐明了PUS7-NET-M2/M1轴这一新的致病机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证有限；PUS7的具体作用靶点和下游信号通路尚未完全阐明 | 探究伪尿苷合酶家族基因在胰腺癌免疫微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）细胞、小鼠原位模型、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 多组学分析 | 胰腺癌 | 基因组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3283 | 2026-01-10 |
PLIN2 exacerbates Allergic Rhinitis by inhibiting PINK1/Parkin-mediated mitophagy
2026-Apr, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2025.107107
PMID:41192682
|
研究论文 | 本研究探讨了PLIN2通过抑制PINK1/Parkin介导的线粒体自噬，从而加剧过敏性鼻炎（AR）的促炎作用和潜在机制 | 首次在单细胞水平上鉴定出PLIN2是AR上皮细胞中显著上调的基因，并揭示了其通过抑制线粒体自噬、促进脂质积累和氧化应激来加剧AR病理的新机制，将代谢失调与炎症联系起来 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要在更广泛的人类临床样本中进行验证；PLIN2调控线粒体自噬的具体分子通路细节有待进一步阐明 | 研究PLIN2在过敏性鼻炎中的促炎作用及其调控PINK1/Parkin介导线粒体自噬的机制 | 小鼠过敏性鼻炎模型、人类鼻上皮细胞（HNEpCs）、GEO数据库中的单细胞RNA测序数据（GSE261706） | 单细胞组学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blotting、qRT-PCR、流式细胞术、ELISA、免疫荧光/组织学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质印迹数据、基因表达数据、细胞表型数据 | 涉及GEO数据库中的GSE261706数据集（包含AR患者和健康对照的鼻黏膜样本）、小鼠AR模型、体外培养的HNEpCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3284 | 2026-01-10 |
Reveal a risk and potential mechanism for keratoconus progression with isotretinoin: Toxicogenomic, transcriptomics and real-world evidence insights
2026-Feb, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110769
PMID:41285218
|
研究论文 | 本研究通过整合药物警戒与计算方法，揭示了异维A酸与圆锥角膜进展之间的风险及潜在机制 | 首次结合药物警戒数据、网络毒理学、转录组学和单细胞转录组学，系统识别异维A酸诱导圆锥角膜的关键分子靶点 | 研究基于计算分析和数据库数据，缺乏直接的临床或动物实验验证 | 探究异维A酸与圆锥角膜进展之间的关联及分子机制 | 异维A酸相关的眼表不良事件数据、候选基因靶点及角膜细胞类型 | 生物信息学 | 圆锥角膜 | 药物警戒分析、网络毒理学、转录组学、单细胞转录组学、机器学习、分子对接与动力学模拟 | 随机森林、SVM-RFE、LASSO回归 | 文本报告数据、基因表达数据、分子结构数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3285 | 2026-01-10 |
Biomechanical and inflammatory pathways underlying the genetic architecture of keratoconus: A genomic SEM study
2026-Feb, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110770
PMID:41308946
|
研究论文 | 本研究通过基因组结构方程建模解析圆锥角膜的双重遗传通路，识别出与生物力学稳定性和炎症相关的候选基因，并进行了功能验证 | 首次应用基因组结构方程建模量化解析圆锥角膜的生物力学和炎症遗传通路，结合单细胞RNA-seq虚拟敲除模拟和体外蛋白水平验证，提供了疾病发病机制的机制框架 | 研究依赖于GWAS汇总统计数据，可能受限于样本异质性；体外模型虽模拟KC生物力学环境，但可能无法完全复制体内复杂病理过程 | 解析圆锥角膜的遗传架构，明确生物力学和炎症病因成分之间的相互作用 | 圆锥角膜患者 | 生物信息学 | 圆锥角膜 | 基因组结构方程建模、GWAS、单细胞RNA-seq、转录组学、蛋白质组学 | 基因组结构方程模型 | GWAS汇总统计数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据、蛋白质数据 | 大规模GWAS汇总统计数据，两个独立患者转录组队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3286 | 2026-01-10 |
Engineering tumor spatial heterogeneity in vitro
2026-Feb, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115757
PMID:41386498
|
综述 | 本文综述了肿瘤微环境中空间异质性的特征及其在肿瘤进化、免疫调节和治疗抵抗中的作用，并探讨了利用工程化技术（如3D生物打印、类器官组装体、芯片器官系统和ECM模拟支架）在体外模拟肿瘤空间组织的最新进展 | 整合当前对癌症空间异质性的理解与工程化策略，为体外模型重建肿瘤空间组织和微区域异质性提供了创新方法 | NA | 指导肿瘤生物学和治疗创新的未来发展，通过工程化模型探索肿瘤微环境的空间异质性 | 肿瘤微环境中的空间异质性，包括细胞组成、表型状态、ECM组织及生化物理梯度 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学、多重成像、3D生物打印、类器官组装体、芯片器官系统、ECM模拟支架 | NA | 空间转录组学数据、蛋白质组学数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 3287 | 2026-01-10 |
Exploring the role of CCT7 in prognosis, cell cycle regulation, and immune microenvironment remodeling of lung adenocarcinoma based on multi-omics datasets and functional experiments
2026-Feb, Biochimica et biophysica acta. General subjects
DOI:10.1016/j.bbagen.2025.130896
PMID:41429196
|
研究论文 | 本研究基于多组学数据集和功能实验，探讨了CCT7在肺腺癌预后、细胞周期调控和免疫微环境重塑中的作用 | 首次系统性地将CCT7与肺腺癌的细胞周期调控、免疫微环境重塑及药物敏感性联系起来，揭示了其通过FOXM1-POLE2通路促进肿瘤增殖的新机制 | 研究主要基于公共数据集和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证和体内动物模型实验 | 探索CCT7作为肺腺癌新型分子标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌（LUAD）患者样本数据及A549/H1229细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，miRNA调控研究，药物敏感性分析 | NA | 多组学数据（mRNA，蛋白质），单细胞RNA测序数据 | 基于TCGA、GSE118370、CPTAC和HPA多个数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3288 | 2026-01-10 |
Characteristics of endoplasmic reticulum stress changes during the differentiation of adipose-derived stromal cells into neurons
2026-Feb, Cytotechnology
IF:2.0Q4
DOI:10.1007/s10616-025-00891-8
PMID:41510323
|
研究论文 | 本研究通过整合多种技术手段，系统分析了脂肪来源基质细胞向神经元分化过程中内质网应激的动态变化及其机制 | 首次在脂肪来源基质细胞神经元分化过程中，结合单细胞RNA测序、超微结构观察和蛋白质分析，全面描绘了内质网应激通路的时序性激活模式及其从适应性反应向凋亡性转变的关键节点 | 研究主要基于体外细胞模型，未在体内环境中验证内质网应激调控对神经元分化的实际影响；单细胞测序样本量相对有限，可能未能完全捕获细胞异质性 | 探究脂肪来源基质细胞向神经元分化过程中内质网应激的动态变化机制及其对细胞命运的影响 | 脂肪来源基质细胞及其在神经元诱导分化过程中的细胞群体 | 细胞生物学与神经科学交叉 | NA | 单细胞RNA测序、免疫细胞化学、Western印迹、透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质印迹数据、显微图像数据 | 未明确具体样本数量，涉及不同分化时间点的细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3289 | 2026-01-10 |
SPP1-CD44 signaling contributes to the mechanisms and therapeutic implications in intervertebral disc degeneration
2026-Jan-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153213
PMID:41475272
|
综述 | 本文综述了SPP1-CD44信号轴在椎间盘退变（IVDD）中的机制及治疗意义 | 整合了单细胞和空间转录组学等多组学研究，揭示了SPP1-CD44轴在IVDD中的动态、区域特异性表达及其在免疫调节和细胞外基质重塑中的核心作用，并探讨了靶向该轴的新型治疗策略 | 作为一篇综述，主要基于现有文献进行整合分析，未提供新的原始实验数据，且治疗策略的潜力仍需进一步临床验证 | 探讨SPP1-CD44信号轴在椎间盘退变发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 椎间盘退变（IVDD）的分子调控机制，特别是SPP1-CD44轴 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 免疫调节分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3290 | 2026-01-10 |
Alleviated T cell exhaustion and SLC1A3-mediated stroma-remodelling dictate chemoimmunotherapy efficacy in oesophageal squamous cell carcinoma
2026-Jan-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335642
PMID:40983502
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等方法，揭示了化疗联合抗PD-1疗法在食管鳞状细胞癌中的协同增效机制及耐药原因 | 发现了化疗通过减轻上皮应激肿瘤细胞与CD8+ T细胞间的免疫检查点相互作用（TIGIT-NECTIN2和NECTIN1-CD96）来防止T细胞耗竭，并首次鉴定出高表达SLC1A3的肿瘤细胞亚群通过诱导富含细胞外基质的肿瘤微环境阻碍CD8+ T细胞浸润，导致耐药 | 研究样本量未明确说明，且机制验证主要在临床样本和小鼠模型中进行，缺乏更大规模的临床队列验证 | 探究化疗增强免疫检查点阻断疗效的机制，并阐明无应答患者持续耐药的因素 | 接受化疗联合抗PD-1或抗PD-1单药治疗的食管鳞状细胞癌患者组织样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学、T细胞受体谱分析、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3291 | 2026-01-10 |
Single-Cell Clonal Lineage Tracing Identifies the Transcriptional Program Controlling the Cell-Fate Decisions by Neoantigen-Specific CD8+ T Cells
2026-Jan-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
|
研究论文 | 本研究通过单细胞克隆谱系追踪技术，揭示了新抗原特异性CD8+ T细胞的转录程序如何调控其细胞命运决定，并与癌症患者的临床预后相关 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析，系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹，并识别了关键的转录调控程序 | 研究主要基于小鼠前列腺癌模型，人类临床样本的验证有限，且单细胞技术可能无法完全捕获所有细胞状态 | 阐明新抗原特异性CD8+ T细胞的转录程序如何控制其细胞命运决定，并探索其与癌症免疫治疗响应的关联 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞，以及癌症患者的临床样本 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序，T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据，T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3292 | 2026-01-10 |
Mass Spectrometry Imaging Combined With Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Multidimensional Spatial Distributions and Biosynthetic Pathways of Medicinal Components in Andrographis paniculata
2026-Jan-08, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70534
PMID:41504619
|
研究论文 | 本研究首次在穿心莲中建立了质谱成像与单细胞RNA测序整合的系统，揭示了药用成分的多维空间分布和生物合成途径 | 首次在穿心莲中整合质谱成像与单细胞转录组技术，揭示了药用成分在细胞类型特异性中的精细分布和光调控的生物合成机制 | 研究主要聚焦于穿心莲的叶片和茎组织，可能未涵盖所有药用成分在其他组织中的分布情况 | 探究药用植物穿心莲中活性成分的精细空间分布和生物合成途径 | 穿心莲（Andrographis paniculata）的叶片和茎组织 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像（MSI）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、LC-QQQ-MS/MS | NA | 质谱成像数据、单细胞转录组数据 | 穿心莲的叶片和茎组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3293 | 2026-01-10 |
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Jan-08, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP093422
PMID:41504852
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和连续免疫荧光技术，揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 | 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域，揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；技术方法可能受限于空间分辨率 | 探究调控促红细胞生成素产生的机制 | 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 连续免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3294 | 2026-01-10 |
IDH-mutant gliomas arise from glial progenitor cells harboring the initial driver mutation
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adt0559
PMID:41505555
|
研究论文 | 本研究通过深度测序和空间转录组学分析，确定了IDH突变胶质瘤起源于携带初始驱动突变的胶质祖细胞 | 首次结合细胞类型特异性突变分析、克隆进化方向、患者大脑空间转录组学和癌症小鼠模型，明确了IDH突变胶质瘤的起源细胞 | 样本量相对有限（70名患者），且仅针对IDH突变胶质瘤，可能不适用于其他类型脑肿瘤 | 探究IDH突变胶质瘤的起源细胞，以理解肿瘤进化并开发新治疗方法 | IDH突变胶质瘤患者（70名）的肿瘤组织、瘤周皮质、脑室下区和血液样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 深度测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 70名患者的142个组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3295 | 2026-01-10 |
CD73 blockade enhances antitumor efficacy of oHSV in solid tumors by increasing macrophage-mediated antigen presentation
2026-Jan-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013640
PMID:41506791
|
研究论文 | 本研究探讨了CD73阻断如何通过增强巨噬细胞介导的抗原呈递来提高溶瘤疱疹病毒在实体瘤中的抗肿瘤疗效 | 揭示了免疫抑制性胞外腺苷信号是溶瘤病毒疗法的主要障碍，并证明CD73阻断可防止肿瘤免疫逃逸，支持了溶瘤病毒与CD73阻断联合策略的临床开发 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的转录组分析，尚未在大型临床试验中验证联合疗法的安全性和长期疗效 | 研究免疫抑制性胞外腺苷信号在调节溶瘤疱疹病毒抗肿瘤免疫疗效中的作用 | 实体瘤模型（包括颅内肿瘤模型）、CD73基因敲除小鼠、患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术免疫表型分析、免疫荧光成像、转录组分析 | CD73基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 | 患者肿瘤样本（治疗前与治疗后）、CD73敲除小鼠与野生型小鼠的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3296 | 2026-01-10 |
Single-cell RNA sequencing reveals the therapeutic mechanism of Calvatia lilacina in promoting wound healing of anal fistula
2026-Jan-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-025-01293-w
PMID:41495793
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的治疗机制 | 首次从单细胞水平解析了紫色秃马勃孢子通过调节巨噬细胞与成纤维细胞相互作用促进肛瘘伤口愈合的分子机制 | 样本量较小（仅20例患者），且为单中心研究，需要更大规模的多中心验证 | 探究紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的疗效和机制 | 肛瘘术后患者的肉芽组织样本及小鼠皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | 肛瘘 | 单细胞RNA测序, ELISA, 免疫组化, Western blot, 免疫荧光, 流式细胞术, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞图像数据 | 20例肛瘘手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3297 | 2026-01-10 |
Replication stress-inducing ELF3 upregulation promotes BRCA1-deficient breast tumorigenesis in luminal progenitors
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89573
PMID:41498327
|
研究论文 | 本研究揭示了复制应激在BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生中的作用，并阐明了ELF3在促进管腔祖细胞转化中的关键机制 | 首次通过单细胞测序和RNA-seq技术，揭示了复制应激作为BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生的驱动因素，并发现ELF3在这一过程中的核心调控作用 | 研究主要基于人类突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞，可能未完全涵盖所有肿瘤亚型或体内微环境的影响 | 探究BRCA1缺陷型乳腺癌在管腔祖细胞中易转化的原因 | 人类BRCA1突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3298 | 2026-01-10 |
Integrative multi-omics and radiogenomic profiling decodes NNK-related tumor remodeling and prognostic stratification in pancreatic cancer
2026-Jan-07, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004732
PMID:41504500
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和放射基因组学分析，揭示了烟草特异性致癌物NNK与胰腺癌进展的关系，并开发了一个基于CT的放射组学模型，用于无创解码NNK相关的分子改变 | 首次将NNK暴露与胰腺癌的分子改变和影像表型联系起来，开发了基于ITGA3的放射组学模型，实现了术前风险分层 | 研究依赖于回顾性数据，需要前瞻性验证；放射组学模型的泛化能力有待进一步评估 | 阐明NNK如何促进胰腺癌进展，并开发无创的放射组学模型进行预后分层 | 胰腺癌患者 | 放射组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，放射组学特征提取 | 多算法机器学习框架，Cox比例风险模型 | CT图像，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个队列的胰腺癌患者，包括TCIA和独立手术队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3299 | 2026-01-10 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2026-Jan-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
|
研究论文 | 本文开发了两种基于机器学习的框架，用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计 | 开发了数字孪生框架和单细胞代谢通量分析框架，首次实现了在人类患者体内进行代谢通量估计，克服了组织采样、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战 | 未明确说明样本量大小或具体验证方法 | 开发能够在人类患者体内进行代谢通量估计的新方法 | 脑癌患者和脑癌小鼠模型 | 机器学习 | 脑癌 | 单细胞RNA测序，C-同位素示踪 | 卷积神经网络 | bulk样本数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3300 | 2026-01-10 |
Integrating single cell- and spatial- resolved transcriptomics unravels the inter-tumor heterogeneity and immunosuppressive landscape in HBV- and Clonorchis sinensis-associated hepatocellular carcinoma
2026-Jan-05, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02381-z
PMID:41491521
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了HBV和华支睾吸虫相关肝细胞癌的肿瘤间异质性和免疫抑制微环境 | 首次同时利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，比较了HBV、华支睾吸虫及双重感染背景下肝细胞癌的肿瘤微环境异质性 | 研究样本量相对有限，且部分分析依赖于公开数据集，可能影响结果的普适性 | 探究不同感染背景（HBV和华支睾吸虫）下肝细胞癌的肿瘤间异质性及免疫微环境特征 | 肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组化, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 269例原发性肝细胞癌患者，包括肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |