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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 3221 - 3240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3221 | 2026-08-01 |
From Food Contaminant to Therapeutic Target: Identification of KCNE2 and 5-Azacytidine for Gastric Cancer via Multi-Omics, Machine Learning, and In Vitro Validation
2026-Jul-09, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19071060
PMID:42515741
|
研究论文 | 本研究利用多组学、机器学习和体外验证，从食品污染物苯并[a]芘的角度，识别出KCNE2和5-氮杂胞苷作为胃癌的治疗靶点和重定位药物 | 创新性地将食品污染物苯并[a]芘作为网络毒理学查询，整合多组学、机器学习（随机森林、LASSO、SVM-RFE）和实验验证，发现KCNE2作为保护因子及5-氮杂胞苷作为潜在治疗药物 | 研究主要基于计算预测和体外实验，缺乏体内模型和临床样本验证，且单细胞转录组分析为描述性 | 利用苯并[a]芘作为查询，通过整合策略识别胃癌的治疗靶点和重定位药物 | 胃癌相关基因、苯并[a]芘相关靶点、KCNE2、SULF1、TIMP1、DNMT1、DNMT3A | 机器学习 | 胃癌 | 多组学, 机器学习, 分子对接, 动力学模拟, 单细胞转录组学 | 随机森林, LASSO, SVM-RFE, 逻辑回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质结构数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 甲基化测序 | NA | NA |
| 3222 | 2026-08-01 |
Vaccine Therapy for the Management of Penile Cancer: Evidence, Opportunities and Challenges
2026-Jul-06, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines14070597
PMID:42506634
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综述 | 本综述探讨了阴茎癌疫苗治疗的原理、现有证据、机遇与挑战，重点讨论了HPV衍生抗原、新生抗原及多种疫苗平台，并展望了未来个性化疫苗开发方向 | 强调了将治疗性疫苗与免疫检查点阻断等免疫调节方法结合的策略，并提及空间转录组学、单细胞RNA测序、人工智能辅助抗原预测和纳米技术递送系统等新技术在个性化疫苗开发中的应用潜力 | 治疗性癌症疫苗在阴茎鳞状细胞癌中作为单一疗法尚未显示一致的临床疗效，仍处于研究阶段 | 总结阴茎癌疫苗开发的原理、现有平台和未来方向，评估其作为免疫治疗策略的潜力和挑战 | 阴茎鳞状细胞癌及其疫苗治疗策略 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3223 | 2026-08-01 |
Imaging-anchored multiomics in cardiovascular disease: integrating cardiac imaging, bulk, single-cell, and spatial transcriptomics
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag365
PMID:42525854
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综述 | 本文综述了心血管疾病中成像锚定的多组学方法，整合心脏成像、批量、单细胞和空间转录组学，探讨联合表示和多模态融合策略 | 提出成像锚定的多组学视角，将超声心动图、CMR和CT定义的心脏空间表型与转录组和空间分子状态整合，并系统比较多模态融合策略，包括放射基因组学、空间对齐和基于图像的基因表达预测 | 成本、可扩展性和组织可用性是心血管翻译的主要障碍，且验证要求、限制和失败模式尚未完全解决 | 探索将心脏成像与批量、单细胞和空间转录组学整合的联合表示方法，以促进心血管疾病的综合理解 | 人类心肌和动脉粥样硬化斑块 | 多组学、医学影像 | 心血管疾病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 基础模型（多模态医学基础模型） | 成像数据（超声心动图、CMR、CT）、转录组数据（批量、单细胞、空间） | NA | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3224 | 2026-08-01 |
PromptSTG: prototype-guided prompting for few-shot spatial transcriptomics annotation
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag401
PMID:42525855
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研究论文 | 提出PromptSTG，一种基于图的原型引导少样本学习框架，用于单细胞分辨率空间转录组数据的细胞类型注释 | 结合空间信息和转录组特征建模生物学上连贯的细胞邻域，并通过原型引导提示实现从少量标记细胞到大量未标记细胞的精确标签传播 | 未提及 | 解决空间转录组数据中细胞类型注释在标签稀缺和注释成本高时的准确性问题，特别是在肿瘤微环境等复杂组织中 | 基于图的空间转录组数据，细胞类型注释，包括罕见细胞群（如未成熟少突胶质细胞和室管膜细胞） | 机器学习 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | 少样本学习框架、图模型 | 空间转录组数据 | 跨越多个空间转录组平台和组织类型的广泛基准数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3225 | 2026-08-01 |
scHashFormer: a hash-driven graph transformer for scalable scRNA-seq clustering
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag402
PMID:42525856
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研究论文 | 提出了一种基于哈希驱动的图变换器scHashFormer，用于可扩展的单细胞RNA测序聚类分析 | 引入了新颖的哈希编码器，具有可学习的哈希窗口大小，并通过自监督学习训练，使相似的细胞获得相同的哈希码，从而构建令牌序列，避免了传统基于相似性的邻居选择方法的高计算开销和对度量质量的敏感性 | 未明确讨论方法的局限性 | 开发一种高效且可扩展的单细胞RNA测序聚类方法，提高聚类效果和下游分析性能 | 多个单细胞RNA测序数据集中的细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞RNA测序表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3226 | 2026-08-01 |
Causal mitochondrial signatures in atrial fibrillation: Insights from integrated multi-omics and multi-faceted approaches
2026-Jul-02, Heart rhythm
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.hrthm.2026.06.041
PMID:42392476
|
research paper | 本研究通过整合多组学数据，系统评估了线粒体基因与心房颤动之间的因果关系，并探讨了其作为生物标志物的潜力 | 首次利用多组学数据（甲基化、基因表达、蛋白质丰度）和多种方法（MR、SMR、共定位分析）全面评估线粒体基因与心房颤动的因果关系，并结合单细胞RNA测序和机器学习模型探索其细胞机制和生物标志物潜力 | 未提供明确的局限性信息 | 系统评估线粒体基因与心房颤动之间的因果关系，并探讨其作为生物标志物的潜力 | 线粒体基因及其相关多组学数据（甲基化、基因表达、蛋白质丰度） | machine learning | atrial fibrillation | Mendelian Randomization, summary-based Mendelian Randomization, colocalization analysis, single-cell RNA sequencing, machine learning | 机器学习预测模型 | 多组学数据（甲基化、基因表达、蛋白质丰度）和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3227 | 2026-08-01 |
HKDC1-mediated polyamine rewiring drives lenvatinib resistance and immune escape in hepatocellular carcinoma
2026-Jul, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.1269
PMID:41812646
|
研究论文 | 该研究揭示了HKDC1介导的多胺重塑驱动肝细胞癌对乐伐替尼耐药和免疫逃逸的机制，并验证了精胺联合治疗策略的有效性。 | 首次阐明USF1/HKDC1/SMS轴通过多胺代谢重编程导致乐伐替尼耐药和CD8+ T细胞功能障碍，并提出精胺联合治疗的新策略。 | 研究主要基于体外和动物模型，临床验证仅限于小规模术后队列，需进一步大规模前瞻性研究确认。 | 探究肝细胞癌中乐伐替尼耐药和免疫逃逸的代谢重编程机制，并寻找新型治疗靶点和预测性生物标志物。 | 肝细胞癌细胞系、患者来源的类器官和异种移植模型、免疫活性流体动力学小鼠模型、以及接受乐伐替尼和PD-1治疗的术后患者队列。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 蛋白质组学、RNA测序、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因、RNA免疫沉淀、单细胞RNA测序、多重荧光免疫组织化学、流式细胞术 | NA | 图像、文本、生物样本数据 | 细胞系、类器官、异种移植模型、小鼠模型，以及40例患者队列 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'转录组测序，Illumina NovaSeq用于批量RNA测序和蛋白质组学相关测序 |
| 3228 | 2026-08-01 |
Beyond the Brain: Circulating Tumor Cells as a Tool for Diagnosis and Monitoring
2026-Jul, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-01199
PMID:42492027
|
研究论文 | 本研究分析了27名胶质母细胞瘤患者中的循环肿瘤细胞，评估其作为诊断和监测工具的潜力，并探讨了其基因组和表型特征。 | 首次在胶质母细胞瘤中通过全外显子测序和单细胞低深度全基因组测序全面分析CTCs，并定义了每5毫升血液4个CTCs的诊断阈值，以及发现CTCs在区分肿瘤与非肿瘤病变中的潜在作用。 | 放射坏死病例队列较小，需要更大规模队列进行进一步验证；单细胞分析中某些CTCs缺乏可检测的拷贝数改变，其来源和生物学角色尚需明确。 | 探索循环肿瘤细胞作为胶质母细胞瘤液体活检工具的可行性和诊断价值。 | 27名胶质母细胞瘤患者的循环肿瘤细胞（包括bulk和单细胞）及匹配肿瘤组织。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 全外显子测序、低深度全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据、单细胞数据 | 27名胶质母细胞瘤患者（包括原发和复发）及健康供体和对照 | Illumina | 全外显子测序、低深度全基因组测序、单细胞RNA测序 | DEPArray NxT | DEPArray NxT用于分离单细胞，随后进行低深度全基因组测序 |
| 3229 | 2026-08-01 |
Single-cell RNA sequencing reveals immunological heterogeneity of the tumor microenvironment in acute myeloid leukemia
2026-Jul, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/212574
PMID:42524819
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示急性髓系白血病肿瘤微环境的免疫异质性，重点关注NK细胞功能障碍及其与免疫抑制细胞的相互作用。 | 首次在单细胞水平上系统描绘AML免疫微环境的细胞异质性，特别是发现AML特异性NK细胞亚型NK_CD56dim_DNAJB1，其具有终末耗竭和高应激特征，并揭示TGFB1-TGFBR信号介导的NK与CD8+ T细胞间的免疫调节机制。 | 研究基于公共数据，可能受批次效应和数据质量影响；未进行功能验证实验，结论主要基于计算分析；样本量相对有限，可能影响亚型发现的普适性。 | 通过单细胞RNA测序表征急性髓系白血病肿瘤微环境的免疫异质性，尤其是NK细胞功能障碍及与免疫抑制细胞的相互作用，为免疫治疗策略提供新见解。 | 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境中的免疫细胞，尤其是NK细胞亚群及其与其他免疫细胞的相互作用。 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 无特定深度学习模型，但使用了Harmony进行批次效应校正，SingleR进行细胞注释，GSVA进行通路分析，CellChat分析细胞通讯，Monocle3推断轨迹，pySCENIC分析转录调控。 | 单细胞转录组数据 | 59个样本（40个AML和19个健康供者），共284,687个高质量细胞 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | NA |
| 3230 | 2026-08-01 |
SAP18 drives vasculogenic mimicry in esophageal squamous cell carcinoma: a machine learning and multi-omics investigation
2026-Jul-01, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01582-z
PMID:42393238
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，采用机器学习框架构建了食管鳞状细胞癌的4个血管生成拟态相关基因预后模型，并验证了SAP18在其中的核心调控作用 | 首次将多组学数据与117种算法组合的机器学习框架相结合，构建针对食管鳞状细胞癌血管生成拟态的预后模型，并揭示了SAP18通过结合PIK3CB激活AKT/mTOR信号通路促进血管生成拟态的新机制 | 基于公开数据集的分析可能存在批次效应和样本异质性，且预后模型的临床验证需要更大规模的前瞻性研究 | 探究食管鳞状细胞癌中血管生成拟态的分子机制并构建预后模型，为个体化靶向治疗提供基础 | 食管鳞状细胞癌患者样本及相关细胞系和小鼠模型 | 机器学习, 多组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | 机器学习模型（含117种算法组合） | 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据集中的食管鳞状细胞癌患者样本（具体数量未提供）及体外和体内实验样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3231 | 2026-08-01 |
Transcriptomic Insights into Micro- and Nanoplastic Toxicity in Zebrafish: A Narrative Review
2026-Jun-29, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics14070572
PMID:42515137
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综述 | 本文是关于微塑料和纳米塑料对斑马鱼毒性的叙述性综述，基于转录组学证据进行总结 | 通过按器官系统分类，重点总结高通量方法（如RNA测序和单细胞RNA测序）揭示的微塑料和纳米塑料诱导毒性的基因表达证据 | 未提及 | 总结微塑料和纳米塑料暴露对斑马鱼各器官系统影响的转录组学证据，以理解其毒性机制 | 斑马鱼 | 转录组学 | 生态毒理学 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3232 | 2026-08-01 |
Short-Chain Fatty Acids: Bridging Gut Microbiota and Systemic Aging-Mechanisms, Interventions, and Current Challenges
2026-Jun-23, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16070438
PMID:42506392
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综述 | 本文从系统角度阐述了短链脂肪酸与衰老之间的内在联系，分析了其通过关键信号通路调节衰老的机制，并总结了其在衰老相关疾病中的治疗潜力和多样化干预策略。 | 从全身性视角阐明SCFAs连接肠道微生物与系统性衰老的机制，并提出利用单细胞测序和器官模型等新技术探索衰老细胞命运调控。 | SCFAs调节衰老的详细分子机制尚不清楚，且缺乏针对不同衰老阶段和器官损伤的精确干预方案。 | 阐明短链脂肪酸与衰老的关系，分析其调节机制，并总结其在衰老相关疾病中的治疗潜力和干预策略。 | 短链脂肪酸（SCFAs）、肠道微生物、衰老及相关器官（如骨骼肌、心脏） | 微生物组学 | 老年性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3233 | 2026-08-01 |
scPASU: A computational protocol for quantifying polyadenylation site usage and alternative polyadenylation from 3' scRNA-seq data
2026-Jun-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104544
PMID:42085187
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研究论文 | 介绍了scPASU，一个用于从3'单细胞RNA测序数据量化多聚腺苷酸化位点使用和选择性多聚腺苷酸化的Snakemake工作流程 | 提出了一个可配置的、支持多聚腺苷酸化位点发现的计算协议，适用于不同生物体和样本参数 | 未在摘要中提及具体限制 | 提供一种计算协议，用于从3' scRNA-seq数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和选择性多聚腺苷酸化 | 3'单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 3'单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3234 | 2026-08-01 |
LMTK3 regulates breast cancer angiogenesis via a context-dependent mesenchymal-epithelial transition program
2026-Jun, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01001-2
PMID:41577842
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能验证，揭示LMTK3通过情境依赖的上皮-间质转化程序调控乳腺癌血管生成，在间质样三阴性乳腺癌中促进部分EMT状态和血管生成，而在腔样细胞中抑制血管生成表型 | 首次发现LMTK3作为情境依赖的血管生成驱动因子，通过MET程序调控肿瘤血管生成，并揭示了辛普森悖论现象，即LMTK3在不同乳腺癌亚型中的作用相反 | 摘要中未提及明确的局限性 | 探究LMTK3在乳腺癌肿瘤血管生成微环境中的具体作用及其分子机制 | 乳腺癌细胞，包括间质样三阴性乳腺癌细胞和腔样乳腺癌细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3235 | 2026-08-01 |
Convergent immune dysregulation in sepsis and colorectal cancer highlights plasma cells and identifies shared candidate genes
2026-May-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05215-6
PMID:42213300
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研究论文 | 整合脓毒症和结直肠癌的多队列批量及单细胞RNA测序数据，发现两者共享的免疫失调特征，尤其是浆细胞的异常激活，并鉴定出八个候选共享基因 | 首次通过跨疾病整合分析揭示脓毒症和结直肠癌在免疫失调上的趋同机制，特别是浆细胞的共同贡献，并识别出潜在的共享诊断标志物 | 研究主要基于公开数据集，缺乏实验验证；临床验证队列样本量小（每组仅3例） | 探索脓毒症和结直肠癌共有的免疫失调机制，并识别共享的候选诊断基因 | 脓毒症和结直肠癌患者的外周血及肿瘤组织样本，包括批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | 脓毒症、结直肠癌 | RNA-seq、单细胞RNA测序、MCP-counter、ssGSEA、WGCNA、CellChat | NA | 基因表达数据 | 多队列批量RNA-seq和scRNA-seq数据，以及独立临床scRNA-seq队列（CRC n=3，CRC伴脓毒症 n=3） | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3236 | 2026-08-01 |
Generation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hepatocellular Carcinoma Organoids following Drug Treatment
2026-05-26, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70511
PMID:42296231
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研究论文 | 开发了一种标准化工作流程，用于肝癌类器官的药物处理及单细胞RNA测序分析 | 提出了一个连接类器官药物处理与下游单细胞转录组分析的综合工作流程，包含类器官复苏、扩增、处理前后单细胞测序及比较分析 | 未提及明显限制 | 深入理解肝癌细胞在药物处理前后的转录组变化，以改进治疗策略 | 肝癌类器官 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3237 | 2026-08-01 |
Membrane depolarization drives tumor-suppressive cell competition via hedgehog signaling activation
2026-May-25, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.010
PMID:42190941
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研究论文 | 本研究通过果蝇遗传学、单细胞RNA测序和哺乳动物共培养模型，揭示膜去极化通过激活Hedgehog信号通路驱动肿瘤抑制性细胞竞争 | 首次阐明膜电位去极化作为细胞竞争的关键驱动因素，通过稳定Smoothened激活Hedgehog信号，连接生物电调节与肿瘤监视 | 研究主要基于果蝇和体外哺乳动物模型，缺乏体内哺乳动物验证 | 探究膜电位去极化在肿瘤抑制性细胞竞争中的机制作用及其在癌症预防中的潜在治疗价值 | 果蝇眼上皮组织、scribble缺陷细胞克隆、Scrib耗竭的MDCK细胞 | 细胞生物学、癌症生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、果蝇遗传学、共培养模型 | NA | 单细胞基因表达数据、图像数据 | 未明确说明，涉及果蝇组织和MDCK细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3238 | 2026-08-01 |
[Novel CD6-targeted CAR-T cell therapy for T-cell acute lymphoblastic leukemia: a safe and efficient strategy to prevent fratricide through gene editing]
2026-May-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
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研究论文 | 本研究针对T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）的CAR-T疗法，开发了一种新型CD6靶向且通过基因编辑防止自相残杀的策略 | 首次提出CD6作为T-ALL的CAR-T治疗新靶点，并利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除内源性CD6，构建6KO-6CAR细胞，以同时解决 fratricide 和 off-tumor 毒性问题 | 该研究主要在体外和基于公共数据集进行，未涉及体内动物模型或临床试验，需进一步验证其安全性和有效性 | 开发一种安全有效的抗T-ALL CAR-T产品，通过识别新靶点并采用兼容的基因编辑方法，解决传统CAR-T治疗中的自相残杀和靶向肿瘤外毒性问题 | T-ALL患者和健康供者的骨髓细胞，以及MOLT-4、CCRF-CEM和Jurkat等T-ALL细胞系 | 数字病理学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，CRISPR/Cas9基因编辑 | CAR-T细胞模型 | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 3239 | 2026-08-01 |
Navigating cell maps by deep learning integration of single-cell and spatially resolved transcriptomics
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag404
PMID:42531062
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研究论文 | 提出Cell2Map，一种无监督深度学习方法，整合单细胞和空间转录组数据，以高精度将细胞映射到空间位置 | 采用图注意力自编码器，设计多项目标函数联合优化表达、密度和嵌入层面的相似性与距离约束，实现细胞与空间点的无监督映射 | 摘要中未明确提及局限性 | 开发一种整合单细胞和空间转录组数据的方法，以全面解析异质性空间域和细胞基因表达 | 小鼠小脑和海马、乳腺癌和心肌梗死数据 | 机器学习 | 乳腺癌, 心肌梗死 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 数据集包括小鼠小脑、海马、乳腺癌、心肌梗死样本，具体数量未给出 | NA | NA | NA | NA |
| 3240 | 2026-08-01 |
Cell type-specific dissection of cell death programs during ovarian aging
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag399
PMID:42531060
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研究论文 | 提出DeepMCD，一种用于从批量RNA-seq数据中同时解卷积细胞类型比例和程序性细胞死亡组成的端到端多任务深度学习框架，并应用于卵巢衰老研究。 | 利用Transformer-based跨任务注意力机制，在共享的token化潜在空间中利用细胞形态学背景校准PCD预测，并通过自适应不确定性加权损失实现平衡优化，显著优于现有单任务算法。 | 未提及具体限制，但可能包括对批量RNA-seq数据的依赖以及计算方法的验证范围有限。 | 开发一种计算工具，以细胞类型特异性的方式解析卵巢衰老过程中的程序性细胞死亡程序，无需昂贵的单细胞测序。 | 小鼠卵巢衰老队列的批量RNA-seq数据。 | 机器学习 | 卵巢衰老 | RNA-seq | Transformer | 基因表达数据（批量RNA-seq） | 多个小鼠卵巢衰老队列（具体数量未提及） | NA | 批量RNA-seq | NA | NA |