单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-02-08
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-Jan-07, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了TRPV1痛觉感受器通过调控上皮簇细胞,启动并驱动针对蠕虫感染的2型免疫和组织适应的神经-上皮环路机制 首次发现并阐明了TRPV1痛觉感受器与化学感应上皮簇细胞之间的神经-上皮环路,该环路是启动2型免疫和组织适应的关键上游决定因素,揭示了神经元、上皮细胞和免疫细胞之间复杂感觉输入的协调与整合机制 NA 探究神经元、上皮细胞和免疫细胞之间如何协调和整合多样化的感觉输入,以启动和调控针对蠕虫感染的2型免疫反应 TRPV1痛觉感受器、肠道上皮簇细胞、CGRP神经纤维、上皮祖细胞、蠕虫感染模型 NA 蠕虫感染 空间转录组学分析、单细胞RNA测序分析 NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
302 2026-02-08
Uncovering the role of integrated stress in Alzheimer's disease through single-cell and transcriptomic analysis
2026-Jan-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和转录组数据,探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制 结合LASSO回归和随机森林算法筛选出六个关键基因,并揭示了它们与炎症通路及免疫细胞浸润的关联 研究样本量有限,且主要基于公共数据集分析,需要进一步实验验证 探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制及其临床意义 阿尔茨海默病患者和正常对照的脑细胞及血液样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞测序, 转录组分析 LASSO回归, 随机森林 基因表达数据 GSE264648数据集49例,GSE48350数据集253例,另加临床验证样本 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
303 2026-01-06
A pseudouridine-related prognostic model of colorectal cancer based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2026-Jan-04, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
304 2026-02-08
A human pathophysiological 3D-bone marrow model reveals immune and stromal cell heterogeneity
2026-Jan-03, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究开发了一种标准化的三维人类骨髓模型,用于模拟骨髓微环境的关键特征并研究其生理和病理状态下的细胞动态 首次构建了能够模拟人类骨髓微环境异质性的标准化三维模型,并利用单细胞转录组学揭示了基质细胞和内皮细胞的异质性 模型仍需进一步验证其在更广泛疾病背景下的适用性,且长期培养效果有待更多数据支持 研究人类骨髓微环境中免疫细胞和基质细胞的异质性及其在病理状态下的动态变化 骨髓微环境中的基质细胞、内皮细胞、免疫细胞和造血祖细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞转录组测序 三维骨髓模型 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
305 2026-02-08
ASTRO: Automated Spatial-Transcriptome whole RNA Output
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为ASTRO的自动化流程,用于处理空间转录组学数据,特别优化了针对FFPE样本的全转录组分析 开发了首个专门针对FFPE样本空间转录组数据处理的自动化流程,能够同时检测编码和非编码RNA(如miRNA),并通过优化空间条形码识别和过滤步骤提高映射率 未明确说明该流程在其他样本类型或技术平台上的适用性限制 解决FFPE样本空间转录组数据分析的挑战,实现全转录组的空间定量分析 福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本 空间转录组学 NA 空间转录组学 自动化数据处理流程 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
306 2026-02-08
scSNViz: visualization and analysis of cell-specific expressed SNVs
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 介绍了一个名为scSNViz的R包,用于从单细胞RNA测序数据中探索、量化和可视化表达的单核苷酸变异 开发了一个专门针对单细胞水平表达SNVs的综合可视化与分析工具,填补了现有工具在单细胞变异表达模式研究方面的空白 未在摘要中明确提及具体限制,但可能依赖于现有单细胞分析框架的准确性 旨在促进对单细胞水平表达遗传变异的理解,包括转录异质性、等位基因调控和突变动力学 单细胞RNA测序数据中的表达单核苷酸变异 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
307 2026-02-08
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2026-Jan, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff,用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 Squidiff通过连续去噪和语义特征集成,学习瞬态细胞状态,并预测跨时间和条件的高分辨率转录组景观 NA 预测细胞在环境刺激下的转录组变化,并阐明潜在的疾病机制 单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞测序 扩散模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
308 2026-02-08
KRAS Withdrawal in Cholangiocarcinoma Leads to Immune Infiltration and Tumor Regression
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过构建条件性KRAS基因敲除的胆管癌小鼠模型,揭示了KRAS抑制导致肿瘤显著消退并伴随免疫细胞浸润的机制 首次利用转座子系统与CRISPR-Cas9技术构建了条件性TRE.Kras/Trp53敲除胆管癌小鼠模型,并系统揭示了KRAS抑制通过激活CD8 T细胞和诱导细胞衰老导致肿瘤消退的免疫机制 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类胆管癌中的适用性仍需进一步验证;缺乏长期疗效观察数据 探究KRAS抑制在胆管癌治疗中的作用机制及潜在治疗价值 条件性KRAS/TP53敲除胆管癌小鼠模型、TKP细胞系 肿瘤免疫学 胆管癌 CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、共聚焦免疫荧光、细胞因子阵列、慢病毒过表达 条件性基因敲除小鼠模型、同种移植模型 基因表达数据、免疫染色图像、细胞因子分泌数据 未明确说明具体样本数量,但包含小鼠模型和细胞系实验 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
309 2026-02-07
Harnessing spatial transcriptomics to understand host-parasite interactions in plants and animals
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文探讨了空间转录组学技术在动植物宿主-寄生虫相互作用研究中的应用与挑战 通过跨学科视角,将动物系统中的空间转录组学进展应用于植物寄生虫研究,为未来研究提供路线图 空间转录组学在植物-寄生虫相互作用中的应用仍有限,面临技术挑战 利用空间转录组学理解动植物宿主-寄生虫相互作用的分子机制,并寻找疾病控制新靶点 动植物中的专性寄生虫及其宿主 空间转录组学 寄生虫感染 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
310 2026-02-07
The role of pathology in immunotherapy and targeted therapy for renal cell carcinoma
2026-Mar-01, Current opinion in urology IF:2.1Q2
综述 本文综述了病理学在肾细胞癌免疫治疗和靶向治疗中的作用,提出了一个整合形态学、免疫表型和分子谱的病理驱动框架 提出了一个整合形态学、免疫表型和分子谱的病理驱动框架,以指导肾细胞癌的个性化治疗策略,并探讨了新兴工具如液体活检、空间转录组学和AI辅助病理学的应用 可靠的预测性生物标志物仍未被满足,PD-L1表达临床效用有限,肿瘤微环境特征和基因组改变预测价值不一致 概述病理学在肾细胞癌免疫治疗和靶向治疗中的作用,并探讨如何整合多参数信息以推进精准肿瘤学 肾细胞癌 数字病理学 肾细胞癌 分子谱分析、液体活检、空间转录组学、AI辅助病理学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
311 2026-02-07
Spatial transcriptomics: integrating platforms and computational approaches for clinical insights
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文全面比较了空间转录组学的技术原理与数据分析流程,并总结了其最新应用及标准化现状 整合了不同平台和计算方法,为临床见解提供了一个清晰的理解框架,并强调了技术标准化的重要性 面临技术复杂性、数据分析困难以及缺乏标准化等挑战 促进空间转录组学技术的进一步发展和临床转化 空间转录组学技术及其在生物研究和病理诊断中的应用 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
312 2026-02-07
WDR72 Is Required for Urinary Acidification and Normal H+-ATPase Activity in Intercalated Cells in Mice
2026-Mar, Acta physiologica (Oxford, England)
研究论文 本研究探讨了WDR72在肾脏酸-碱稳态中的作用,特别是在A型闰细胞中的表达和功能 首次将WDR72鉴定为A型闰细胞依赖性尿液酸化的关键调节因子,并揭示了其在H+-ATPase活性调控中的新机制,同时发现了性别特异性代谢表型 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;性别差异的具体分子机制尚未完全阐明 研究WDR72在肾脏酸-碱稳态中的表达和功能 Wdr72基因敲除小鼠的肾脏组织,特别是闰细胞 NA 远端肾小管酸中毒 单细胞转录组分析、免疫组织化学、Western印迹、微灌注分离集合管活性测定 NA 转录组数据、蛋白质表达数据、生理功能数据 Wdr72-/-雌性和雄性小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
313 2026-02-07
Unraveling sex-related cardiovascular toxicity of immune checkpoint inhibitors by pharmacovigilance and single-cell transcriptomic analysis
2026-Feb-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过药物警戒和单细胞转录组分析,揭示了免疫检查点抑制剂相关心血管毒性的临床特征和性别差异分子机制 首次结合大规模药物警戒数据库(FAERS)和单细胞RNA测序技术,系统性地探索了免疫检查点抑制剂心血管毒性的性别差异及其潜在免疫机制 研究基于自发报告系统数据,可能存在报告偏倚;单细胞分析样本量有限,需要更大规模验证 阐明免疫检查点抑制剂引发心血管毒性的临床特征、风险因素和性别特异性分子机制 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者,重点关注发生心血管不良事件的患者群体 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,药物警戒数据分析,差异报告分析 逻辑回归模型,非参数检验 临床报告数据,单细胞转录组数据 26例心血管毒性事件(来自FAERS数据库),单细胞分析具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
314 2026-02-07
Evaluation of targeted and immune combination therapies in a rat model of hormone receptor-positive breast cancer
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究在激素受体阳性乳腺癌大鼠模型中评估了靶向与免疫联合疗法,包括KMT5B/C抑制剂、IKBKE抑制剂、抗雌激素药物和TGFβ阻断抗体,并分析了其与αPD-L1的联合效果 利用大鼠乳腺肿瘤模型模拟患者免疫逃逸机制和ICI反应异质性,首次评估了KMT5B/C抑制剂A-196与αPD-L1联合治疗的效果,并通过单细胞RNA测序揭示了A-196诱导的肿瘤上皮细胞表型转变 研究基于大鼠模型,结果需在人类临床试验中进一步验证;样本量未明确说明,可能限制统计效力 开发针对ER阳性乳腺癌的联合免疫疗法,以克服免疫检查点抑制剂在该亚型中的有限疗效 硝基-N-甲基脲诱导的Sprague-Dawley大鼠乳腺肿瘤,模拟ER阳性乳腺癌 肿瘤免疫学 乳腺癌 多色流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
315 2026-02-07
Oriented cell divisions induce basal progenitors and regulate neural expansion across tissues and species
2026-Feb-06, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过在小鼠中失活GPSM2和SAPCD2基因,揭示了纺锤体定向调控在神经祖细胞分裂和神经组织扩张中的关键作用 首次证明GPSM2和SAPCD2双失活能完全重定向神经祖细胞分裂方向,诱导基底祖细胞在视网膜中异位出现,并揭示其与人类外放射状胶质细胞的相似性 研究主要基于小鼠模型,在人类组织中的验证有限,且机制细节如Hippo信号通路的具体调控方式需进一步探索 探究神经祖细胞分裂方向调控在神经组织扩张和跨物种进化中的作用 小鼠、猕猴和人类的神经祖细胞,重点关注新皮质和视网膜组织 发育神经生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
316 2026-02-07
DIS3 ribonuclease regulates Sertoli cell development to support spermatogenesis in mice
2026-Feb-06, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究揭示了外泌体相关DIS3核糖核酸酶在小鼠Sertoli细胞维持和成熟中的关键作用,及其通过p53和Wnt/β-Catenin通路调控睾丸发育和精子发生 首次明确了DIS3核糖核酸酶在Sertoli细胞RNA代谢中的功能,并发现其通过调控p53和Wnt/β-Catenin信号通路影响细胞间通讯和睾丸发育 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;机制研究主要依赖基因敲除和抑制剂处理,可能未涵盖所有相关通路 探究DIS3核糖核酸酶在Sertoli细胞发育和精子发生中的具体功能及分子机制 小鼠Sertoli细胞及睾丸组织 生殖生物学 男性不育症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因敲除技术、抑制剂处理 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
317 2026-02-07
SIRT1-NCOR2 Corepressor Modulates Trophoblast-Macrophage Interactions in Preeclampsia
2026-Feb-06, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
研究论文 本研究探讨了SIRT1通过招募NCOR2调控RARRES2表达,影响巨噬细胞极化及子痫前期发病机制 揭示了SIRT1-NCOR2共抑制复合物在调控滋养细胞RARRES2表达及巨噬细胞极化中的新机制,并提出了子痫前期早期预测和预防的新策略 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类患者样本验证相对有限,且具体临床转化路径需进一步探索 探究滋养细胞中低SIRT1水平如何通过RARRES2-CMKLR1轴影响巨噬细胞极化及子痫前期的发病机制 滋养细胞、巨噬细胞、子痫前期患者血浆样本、Sirt1条件性敲除小鼠 NA 子痫前期 单细胞测序、共培养实验、荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀、质谱分析、免疫沉淀 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据、临床血浆样本数据 子痫前期患者血浆样本(数量未明确)、Sirt1条件性敲除小鼠模型 NA 单细胞测序 NA NA
318 2026-02-07
Maternal Fine Particulate Matter Exposure Impairs Inguinal White Adipose Tissue Plasticity in Middle-Aged Male Mouse Offspring
2026-Feb-06, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了母体细颗粒物暴露对中年雄性小鼠后代代谢健康的影响,特别关注腹股沟白色脂肪组织可塑性的损害 首次在单细胞分辨率下揭示了母体PM暴露通过改变脂肪干细胞命运决定、诱导IgG产生和内皮细胞功能障碍,导致iWAT可塑性受损的细胞机制 研究仅针对中年雄性小鼠后代,未涉及雌性或其他年龄组,且机制主要在动物模型中验证,人类相关性尚需进一步研究 探究母体细颗粒物暴露对非肥胖后代长期代谢健康的影响及其细胞机制 中年雄性小鼠后代的腹股沟白色脂肪组织 单细胞组学 代谢性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
319 2026-02-07
Bufalin Inhibits the PI3K/AKT Pathway by Targeting GTF3C4 to Impede Breast Cancer Progression
2026-Feb-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了蟾毒灵通过靶向GTF3C4抑制PI3K/AKT通路,从而阻碍乳腺癌进展并重塑肿瘤微环境 首次发现蟾毒灵以GTF3C4为靶点,通过抑制PI3K/AKT通路和改变肿瘤微环境中的免疫细胞比例来抑制乳腺癌 NA 探究蟾毒灵在乳腺癌中的抗肿瘤机制 乳腺癌细胞系(MDA-MB-231和MCF-7)、小鼠模型 NA 乳腺癌 有限蛋白酶解-质谱联用、RNA测序、细胞热位移分析、药物亲和响应靶点稳定性分析、表面等离子体共振、单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
320 2026-02-07
Osteopontin attenuates microglia-mediated neuroinflammation and blood-brain barrier damage after pontine infarction
2026-Feb-05, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、多组学分析、动物模型和患者样本,揭示了骨桥蛋白在脑桥梗死后调节小胶质细胞激活和血脑屏障完整性的关键作用 首次通过单细胞RNA测序和多组学分析,系统性地识别骨桥蛋白作为脑桥梗死后神经炎症和血脑屏障损伤的关键调节因子,并验证其通过调节嘌呤代谢和增强腺苷信号发挥神经保护作用的机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类患者样本的验证相对有限,且未深入探讨骨桥蛋白在其他类型脑卒中中的普适性 探究脑桥梗死的病理机制,并寻找潜在的治疗靶点 脑桥梗死小鼠模型、BV2小胶质细胞系、脑桥梗死患者血清样本 数字病理学 脑卒中 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blotting、多组学分析 动物模型(小鼠)、细胞模型(BV2) 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 未明确指定具体样本数量,但涉及小鼠模型、细胞系和患者血清样本 NA 单细胞RNA测序, 多组学分析 NA NA
回到顶部