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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3121 | 2026-06-06 |
Integrating network toxicology, machine learning, and single-cell sequencing to reveal the FASN-mediated role of phenolic endocrine disruptors in water in promoting prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0350638
PMID:42228706
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研究论文 | 整合网络毒理学、机器学习和单细胞测序揭示水中酚类内分泌干扰物通过FASN促进前列腺癌的作用 | 首次利用网络毒理学、机器学习和单细胞测序多维框架,系统揭示酚类内分泌干扰物(NP/OP)通过FASN基因促进前列腺癌的潜在分子机制 | 研究基于计算分析和已有数据集,缺乏实验验证;FASN作为分子枢纽的因果关系仍需进一步实验确认 | 探究水中酚类内分泌干扰物(NP/OP)促进前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌相关基因和酚类内分泌干扰物靶点 | 机器学习, 生物信息学, 网络毒理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | ANN, LASSO, SVM-RFE, GSVA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE46602数据集(36个肿瘤样本 vs 14个良性样本),GSE137829数据集(6个前列腺癌样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3122 | 2026-06-06 |
The Research Progress of Tumor-Associated Macrophages in Prostate Cancer
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/6287638
PMID:42244152
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综述 | 文章综述了肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的研究进展,包括其促进肿瘤进展和免疫治疗耐药的机制,以及靶向TAMs的精准治疗策略 | 基于单细胞RNA测序细化了TAMs的经典M1/M2分型,提出增殖性TAM和免疫调节性TAM等新亚型,并探讨了巨噬细胞胞外陷阱在转移中的作用 | 靶向治疗面临肿瘤微环境复杂性、TAM异质性、药物生产和递送障碍以及毒性管理等挑战 | 基于患者肿瘤内TAM亚群的组成、功能状态和信号依赖性开发个性化靶向策略,实现从“一刀切”方法向精准医学的转变 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习教育 | 前列腺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3123 | 2026-06-06 |
Multisystem regulation of reward and addiction: beyond the dopaminergic system
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1840096
PMID:42244883
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综述 | 综述了奖赏与成瘾的多系统调控机制,超越了多巴胺能系统的单一视角 | 提出奖赏和厌恶应在一个统一的价处理框架下理解,并鉴定出下丘脑被盖核(SVTg)作为新的脑干节点,整合多系统信号 | 未提供具体实验数据,主要基于现有文献的综合分析 | 阐述奖赏和成瘾的多系统、网络基础模型,强调超越多巴胺能系统的调控机制 | 奖赏与成瘾相关神经环路及分子机制 | 机器学习 | 成瘾 | 单细胞转录组学、实时神经影像学、计算精神病学、药物基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3124 | 2026-06-06 |
Epigenetic subtypes of high-grade T1 bladder cancer reveal intra-tumor heterogeneity and distinct interactions with tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.129729
PMID:42244999
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研究论文 | 该研究通过整合染色质图谱、单核RNA-seq、免疫组化和空间转录组学,定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,揭示了肿瘤内异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次通过整合多种技术定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,并揭示了其与微环境的特异性相互作用及空间分布特征 | 研究中未提及明显的局限性信息 | 定义高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,表征异质性,并探索肿瘤-微环境相互作用 | 高级别T1期膀胱癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 批量染色质分析、单核RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 未明确说明具体样本数量,但涉及高级别T1期膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3125 | 2026-06-06 |
Scalable differentiation of human cardiac organoids from iPSCs generates cardiac tissues for cardiac cell therapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.127654
PMID:42245001
|
研究论文 | 本研究提出了一种可扩展的方法,从iPSC分化出心脏类器官,用于心脏细胞治疗,并在猪心肌梗死模型中验证了其移植效果 | 首次在20天内从iPSC分化出含有心肌细胞、心脏成纤维细胞和内皮细胞的成熟心脏类器官,并验证了生物反应器辅助放大策略和猪体内移植可行性 | 仅使用了少量类器官(3500个),且随访时间较短(8-30天),长期效果和安全性需进一步评估 | 开发可扩展的心脏类器官分化技术,用于改善心肌梗死细胞治疗的细胞植入效果 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的心脏类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | 图像 | 3500个心脏类器官,移植到猪心肌梗死模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3126 | 2026-06-06 |
Toll-Like Receptors in Diabetes: Immunometabolic Mechanisms and Emerging Precision Therapeutic Strategies
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S606875
PMID:42245151
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综述 | 综述Toll样受体在糖尿病中的免疫代谢机制及新兴精准治疗策略 | 提出“特洛伊木马”途径——肠道来源外泌体将炎症配体隐蔽运输至β细胞内体,绕过传统表面受体监控,并利用单细胞转录组学和孟德尔随机化揭示β细胞免疫反应细胞异质性和因果遗传联系 | 未提及具体限制 | 综合梳理Toll样受体在糖尿病中的免疫代谢整合角色,并为精准医学提出框架 | Toll样受体及其在糖尿病中的作用机制 | 机器学习 | 糖尿病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3127 | 2026-06-06 |
Integrated clinical and multi-omics analysis links composite inflammatory indices to macrophage-associated molecular programs in aortic dissection
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1840880
PMID:42245402
|
研究论文 | 通过临床数据与多组学分析,探索复合炎症指数与主动脉夹层中巨噬细胞相关分子程序之间的联系 | 首次将常规血液检测衍生的复合炎症指数与单细胞RNA测序、批量转录组数据整合分析,揭示炎症指数与巨噬细胞转录重编程的关联 | 样本量相对有限,炎症指数与分子机制的因果关系尚未完全验证 | 评估复合炎症指数在主动脉夹层疾病评估中的作用,并揭示其与分子机制的整合关系 | 主动脉夹层患者和对照组参与者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归, LASSO, 随机森林, SVM-RFE, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 288名参与者(144名主动脉夹层患者和144名对照组) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3128 | 2026-06-06 |
Graph Topology Reframes the Coherence of Cell-State Manifold Inference under Heterogeneous Single-Cell Observations
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0087
PMID:42245398
|
研究论文 | 该论文讨论了在异质性单细胞观测数据下,图拓扑结构如何重构细胞状态流形推断的一致性 | 提出拓扑稳定性描述符用于评估低维流形骨架的可靠性,识别异质性观测带来的系统性扭曲 | 主要基于模拟数据验证,未在多种真实数据集上充分验证拓扑描述符的普适性 | 研究单细胞观测异质性对基于流形的推断(如图抽象)的影响,并提出解决系统性扭曲的方法 | 异质性单细胞RNA测序数据中的浅层观测细胞与深层观测细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个经验性单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3129 | 2026-06-06 |
NAMPT orchestrates fibroblast cuproptosis and immune crosstalk during IPF progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1726692
PMID:42245670
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示NAMPT在特发性肺纤维化(IPF)中调控成纤维细胞铜死亡和免疫互作的关键作用 | 首次将铜死亡机制与IPF病程进展关联,并发现NAMPT作为枢纽基因在调控成纤维细胞铜死亡和免疫微环境重塑中的双重功能 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏体内实验或功能验证机制的直接证据 | 探索NAMPT在IPF中调控成纤维细胞铜死亡及免疫互作的分子机制和潜在治疗靶点 | IPF患者和健康对照的肺组织样本 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | IPF患者和健康对照样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3130 | 2026-06-06 |
The translational paradox of AI in hepatocellular carcinoma: from algorithmic over-engineering to real-world clinical utility
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1848190
PMID:42245726
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综述 | 批判性评述人工智能在肝细胞癌中从算法过度工程化到临床实际应用的转化悖论 | 揭示自监督视觉基础模型、无监督域适应与AI协同空间转录组学等先进算法在真实世界多扫描仪队列中未经验证的转化困境,并挑战多模态叙事范式,证明算法复杂度不等同于临床效用 | 该综述基于近期文献批判性分析,但未提供原始实验数据或具体队列验证结果 | 评估肝细胞癌中人工智能方法从静态模式识别到机制驱动诊断的演变及其临床转化障碍 | 肝细胞癌的人工智能诊断方法(包括视觉基础模型、虚拟分子分析、空间转录组学、大语言模型与概念瓶颈模型) | 机器学习 | 肝细胞癌 | NA | 自监督视觉基础模型、大语言模型、概念瓶颈模型 | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3131 | 2026-06-06 |
Comprehensive analysis of m6A RNA methylation regulators and the immune microenvironment in spinal cord injury
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1759661
PMID:42246043
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研究论文 | 综合分析脊髓损伤中m6A RNA甲基化调控因子与免疫微环境的关系 | 首次系统性地结合多种机器学习算法、单细胞RNA测序和体内实验,识别并验证了FTO和YTHDC1作为脊髓损伤关键调控因子的作用,并探讨其与免疫微环境的关系 | 研究依赖于公共数据集,样本量有限,且未进行功能验证实验以确认FTO和YTHDC1在脊髓损伤中的直接作用机制 | 探索m6A RNA甲基化调控因子在脊髓损伤发病机制中的作用,并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 脊髓损伤组织和细胞(包括人源转录组数据和大鼠模型) | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, 免疫荧光染色 | 机器学习算法, ssGSEA, NetworkAnalyst | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个脊髓损伤转录组数据集,以及大鼠脊髓损伤模型组织样本 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3132 | 2026-06-05 |
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
DOI:10.1080/10641963.2026.2627352
PMID:41655191
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研究论文 | 通过多组学整合和机器学习方法,鉴定与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST | 首次利用单细胞转录组数据构建动脉粥样硬化图谱,结合高维WGCNA和机器学习筛选出四个内皮细胞特异性诊断基因,并通过分子对接预测其与沙利度胺和白藜芦醇的结合能力 | NA | 识别与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物 | 内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、高维WGCNA、LASSO回归、SVM-RFE、ssGSEA、CIBERSORT、分子对接 | NA | 基因表达数据 | 来自单细胞RNA测序数据集的动脉粥样硬化单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3133 | 2026-06-05 |
Immune-related biomarkers for major depressive disorder identified via integrated bioinformatics and machine learning
2026-Dec, European journal of psychotraumatology
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/20008066.2026.2619389
PMID:41665627
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别出与重度抑郁症相关的免疫相关生物标志物 | 首次整合多个基因表达数据集并结合两种机器学习算法(LASSO和SVM-RFE)筛选MDD诊断标志物,并通过单细胞RNA测序和动物模型进行验证 | 未说明具体限制 | 识别重度抑郁症的免疫相关生物标志物以改善早期和客观诊断 | 重度抑郁症患者和慢性不可预测轻度应激大鼠模型 | 机器学习 | 重度抑郁症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集及CUMS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3134 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptome revealed the aberrant keratinocytes activation in antigen presentation in atopic dermatitis
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2627742
PMID:41666125
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示特应性皮炎中角质形成细胞在抗原呈递中的异常激活 | 首次发现角质形成细胞中抗原加工和呈递通路的持续激活是特应性皮炎慢性炎症的关键驱动因素,并质疑卵清蛋白诱导小鼠模型在模拟人类慢性特应性皮炎中的有效性 | 研究主要基于公共单细胞转录组数据的整合分析,缺乏直接实验验证;小鼠模型与人类疾病在角质形成细胞基因激活模式上存在差异 | 探究特应性皮炎中角质形成细胞的基因表达、细胞动态及其与免疫细胞的相互作用 | 健康对照、慢性活动性特应性皮炎患者、自愈性特应性皮炎患者和卵清蛋白诱导的特应性皮炎小鼠模型的皮肤组织 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个皮肤组织样本,包括健康对照、慢性活动性特应性皮炎患者、自愈性特应性皮炎患者和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3135 | 2026-06-05 |
Bone targeted microenvironment actuated engineered exosomes for precision therapy of IBD associated bone loss
2026-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.04.034
PMID:42238026
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研究论文 | 开发了一种骨靶向微环境响应型工程化外泌体系统ExoBIP,用于精准治疗炎症性肠病相关的骨丢失 | 首次发现IL-18连接肠道炎症与骨丢失,并设计骨靶向微环境激活工程化外泌体,实现位点特异性IL-18中和,同时保留其在肠道的生理功能 | 需进一步验证在人类中的安全性及有效性,且慢性炎症性疾病的长期治疗效果尚未明确 | 阐明IBD相关骨丢失的机制并开发靶向治疗策略 | 炎症性肠病相关骨丢失小鼠模型及骨髓间充质干细胞来源的外泌体 | 数字病理学 | 炎症性肠病相关骨丢失 | 单细胞RNA测序 | 工程化外泌体系统 | 单细胞转录组数据 | 慢性IBD相关骨丢失小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 3136 | 2026-06-05 |
Genome-resolved metagenomics of the tumour microbiome: From strain diversity to functional cancer ecology
2026-Sep, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156543
PMID:42166940
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综述 | 本文从基因组解析宏基因组学角度综述肿瘤微生物组的菌株多样性及功能生态在癌症中的作用 | 提出一个整合基因组解析、空间和功能视角的“肿瘤宏基因组框架”,将肿瘤微生物生态与癌症演化、免疫调节及转化干预联系起来 | 未提及具体局限性 | 综述肿瘤微生物组在菌株水平多样性、功能性生态及其在癌症进展和治疗中的影响 | 肿瘤相关微生物及其基因组、功能基因和代谢模块 | 机器学习和多组学分析 | 多癌种 | 宏基因组学、空间转录组学、单细胞测序、宏转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、空间数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞测序 | NA | NA |
| 3137 | 2026-06-05 |
Spatial multi-omics defines cancer-associated fibroblasts subtype gradients driving metabolic support and immune remodeling in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218585
PMID:42144098
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研究论文 | 整合空间转录组学和空间代谢组学数据,通过SpatialGlue多模态聚类和最优传输模型,定义胰腺导管腺癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型,揭示其代谢支持和免疫重塑功能 | 首次将空间多组学整合与最优传输建模结合,系统刻画CAF亚型的代谢异质性及其与肿瘤细胞的代谢通讯机制,并揭示亚型特异性临床预后关联 | 未明确提及研究局限性,但潜在局限包括空间分辨率限制、独立验证队列规模较小 | 阐明胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的代谢与空间异质性,及其在肿瘤微环境中的功能角色 | 胰腺导管腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞亚型及其与肿瘤细胞的代谢互作 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学, 多重免疫荧光, TCGA-PAAD反卷积 | SpatialGlue多模态聚类模型, 最优传输模型 | 空间基因表达数据, 空间代谢物数据, 多重免疫荧光图像, TCGA转录组数据 | 独立空间代谢组学队列和多重重免疫荧光染色队列的样本 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 3138 | 2026-06-05 |
Sensory Nerves Regulate Odontoblast Differentiation via the SPP1/ITGA4 Axis During Tooth Root Development
2026-Jul, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70129
PMID:41796694
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研究论文 | 本研究以牙根发育为模型,探讨感觉神经如何通过SPP1/ITGA4轴调节成牙本质细胞分化 | 首次揭示感觉神经通过SPP1/ITGA4轴调控祖细胞命运,从而协调牙根发育的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;未涉及其他神经类型或信号通路的潜在作用 | 探究感觉神经在牙根发育过程中调节成牙本质细胞分化的作用及分子机制 | 小鼠牙乳头细胞、三叉神经节、牙根发育组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, Co-IP, PLA, siRNA敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第3.5天和第30天的小鼠三叉神经节和磨牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3139 | 2026-06-05 |
Perspectives on human adipose tissue: from cellular mechanisms to clinical complications
2026-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06735-0
PMID:42029708
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综述 | 基于2025年Camillo Golgi奖讲座,回顾白色脂肪组织在代谢、内分泌和免疫功能中的可塑性,以及从代谢健康向肥胖相关疾病转变的细胞机制和临床意义 | 通过C年代测定和临床研究揭示脂肪细胞持续更新及脂质周转受损导致体重增加和胰岛素抵抗的机制,利用空间转录组学发现人类白色脂肪组织中至少三种主要脂肪细胞状态,并鉴定免疫调节性脂肪细胞在网膜脂肪组织中的富集 | 未明确提及具体限制 | 探讨人类脂肪组织从细胞机制到临床并发症的转化研究进展 | 人类白色脂肪组织,包括脂肪细胞更新、大小调控和细胞异质性 | 机器学习 | 心血管疾病, 代谢性疾病 | 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | 未明确提及具体样本量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学用于人类白色脂肪组织分析 |
| 3140 | 2026-06-05 |
Circulating Tumor Cells in Multiple Myeloma: From Peripheral Clues to Central Insights
2026-Jul, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70326
PMID:41974595
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综述 | 本文综述了循环肿瘤细胞(CTCs)在多发性骨髓瘤中的生物学意义、检测技术进展及其作为液体活检和预后生物标志物的临床应用价值 | 系统总结了CTCs从外周血检测到揭示骨髓微环境逃逸机制的研究进展,强调了其与骨髓微小残留病(BM-MRD)评估的互补作用,并介绍了单细胞测序技术(如MinimuMM-seq和SWIFT-seq)在追踪克隆异质性和进化动态中的创新应用 | CTCs检测面临标准化不足、灵敏度有限及临床整合困难的方法学挑战 | 探讨CTCs在多发性骨髓瘤中从生物学标志物向临床可操作工具转化的潜力,推动精准医学发展 | 多发性骨髓瘤患者及疾病谱各阶段(MGUS、冒烟型骨髓瘤、孤立性浆细胞瘤、症状性MM、浆细胞白血病)的循环肿瘤细胞 | 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤 | 高灵敏度流式细胞术、下一代单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | MinimuMM-seq, SWIFT-seq | 单细胞测序技术用于CTCs基因组和转录组分析,包括MinimuMM-seq和SWIFT-seq等新型方法 |