单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 3081 - 3100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3081 2026-08-08
A single-cell sequencing-based prognostic model reveals HLA-DRA, NPC2, and PRPF38B as immune-regulatory tumor suppressors in non-small cell lung cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 基于单细胞测序数据构建非小细胞肺癌预后模型,并验证HLA-DRA、NPC2和PRPF38B作为免疫调节性肿瘤抑制因子的作用 首次利用单细胞RNA测序数据构建基于肿瘤浸润淋巴细胞的9基因风险评分模型,并鉴定HLA-DRA、NPC2和PRPF38B为具有肿瘤抑制功能的免疫调节靶点 未提及具体局限性 构建非小细胞肺癌的预后风险模型并探索免疫调节性肿瘤抑制因子 非小细胞肺癌患者肿瘤组织及肿瘤浸润淋巴细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、共培养实验 LASSO回归 基因表达数据、临床数据 来自GEO和TCGA数据库的非小细胞肺癌样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3082 2026-08-08
Tumor organoid-immune cell co-culture systems for precision oncology
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文批判性评估了肿瘤类器官与免疫细胞共培养系统,包括还原论、整体论和类器官芯片方法,并讨论了其在精准肿瘤学中的应用与挑战 对共培养方法进行了定量基准测试,并分析了新兴的“类器官+”技术,如空间转录组学、AI辅助成像和机器学习 现有系统存在批次变异性、天然异质性丧失、血管化不足和缺乏系统性免疫建模等主要限制,阻碍临床转化 评估肿瘤类器官-免疫细胞共培养系统的现有方法,并探讨其在精准肿瘤学和个性化免疫治疗中的应用前景 肿瘤类器官(特别是患者来源的类器官)和免疫细胞共培养系统 数字病理学 肿瘤 共培养技术 类器官模型 图像 不适用 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
3083 2026-08-08
Shared glycosylation-related molecular mechanism and immune infiltration patterns of fetal growth restriction and preeclampsia
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了胎儿生长受限和子痫前期共享的糖基化相关分子机制及免疫浸润模式,并构建了诊断模型 首次系统分析FGR和PE中糖基化相关基因的表达模式,并结合多种机器学习算法构建诊断模型,单细胞测序验证关键基因在不同滋养层亚群的表达,及细胞间通讯网络分析 未在更大规模或不同人群中验证诊断模型,蛋白水平验证仅针对两个基因,机制验证略显不足 探讨FGR和PE中糖基化相关基因的表达模式及其在母胎界面免疫失衡中的作用,并构建诊断模型 胎盘和蜕膜组织样本,包括对照、PE、FGR和PE+FGR患者,以及单细胞RNA测序数据中的滋养层细胞亚群 生物信息学,机器学习 胎儿生长受限,子痫前期 基因表达谱分析,WGCNA,机器学习(LASSO、随机森林、支持向量机),CIBERSORT,单细胞RNA测序 LASSO,随机森林,支持向量机 基因表达数据,单细胞转录组数据,临床样本表达验证数据 104个样本,包括对照(n=26),PE(n=28),FGR(n=23),PE+FGR(n=27),另有独立临床样本用于验证 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序(微阵列) NA NA
3084 2026-08-08
DUSP5 contributes to platinum resistance in ovarian cancer: single-cell discovery and functional validation
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,发现DUSP5在卵巢癌铂类药物耐药中发挥关键作用,并验证其作为潜在生物标志物和治疗靶点的价值 首次在单细胞水平整合治疗前后卵巢癌数据,揭示化疗相关的上皮细胞状态,并创新性地将DUSP5与应激适应程序及肿瘤微环境特征联系起来,通过功能实验验证其促进铂耐药的机制 尚未在临床样本中验证DUSP5作为生物标志物的可靠性,且DUSP5相关的下游信号通路和临床转化机制仍需进一步探究 阐明卵巢癌铂类药物敏感性和耐药性的细胞药理学机制,并鉴定DUSP5作为潜在的治疗靶点和生物标志物 卵巢癌肿瘤组织(包括治疗前和新辅助化疗后)以及OVCAR8和SKOV3卵巢癌细胞系 数字病理学,单细胞生物学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据,功能实验数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
3085 2026-08-08
Multiomics Integration Reveals Coexpression Regulatory Networks in Osteoporosis and Osteosarcoma
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究整合多组学数据,比较骨质疏松症和骨肉瘤的转录组景观,识别共表达调控网络并构建诊断分类器 首次系统比较骨质疏松症和骨肉瘤的转录组,结合批量转录组、共表达网络、免疫去卷积、单细胞RNA测序及诊断分类器构建的多组学整合方法,并通过体外实验验证关键枢纽基因 模块与性状相关性弱、部分交叉验证折中分类器性能低于随机基线、使用循环血单核细胞研究骨特异性基因表达需谨慎解读 比较骨质疏松症和骨肉瘤的转录组景观,识别与骨密度相关的共表达模块和关键基因,并建立可复用的生物标志物发现分析框架 骨质疏松症和骨肉瘤患者样本(循环血单核细胞、骨肉瘤肿瘤样本)及小鼠MC3T3-E1成骨前体细胞和RAW264.7破骨前体细胞 多组学整合,转录组学 骨质疏松症,骨肉瘤 批量转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR,DNA甲基化分析,拷贝数分析 逻辑回归分类器 转录组数据,单细胞转录组数据,DNA甲基化数据,拷贝数数据 80例循环血单核细胞样本(40低骨密度/40高骨密度),88例骨肉瘤肿瘤样本,86例DNA甲基化样本,81例拷贝数样本,3658个单细胞(骨肉瘤标本) NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
3086 2026-08-08
FAP as a Clinical Biomarker: FAP+ CAFs Orchestrate an Immunosuppressive Stem Cell Niche via the COL1A1/2-CD44 Axis in Colon Cancer
2026, Stem cells international IF:3.8Q2
研究论文 该研究整合多组学数据,揭示FAP+癌症相关成纤维细胞通过COL1A1/2-CD44轴在结肠癌中形成免疫抑制干细胞微环境,并建立预后模型和潜在治疗药物 首次阐明FAP+ CAFs通过COL1A1/2-CD44轴协调免疫逃逸和肿瘤干性的双重功能,并构建14基因预后风险模型及筛选潜在治疗药物 研究主要基于公共数据库和多组学分析,缺乏体内外实验验证,且预后模型的临床应用价值需要进一步前瞻性研究确认 阐明FAP在结肠癌肿瘤微环境中的作用机制,特别是其调控免疫抑制和肿瘤干性的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 结肠癌患者的肿瘤组织样本及公共数据库中的结肠癌多组学数据 数字病理学 结肠癌 RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、组织芯片图像 未明确说明,涉及TCGA和GEO数据库中的结肠癌样本及组织芯片样本 NA NA NA NA
3087 2026-08-08
Performance of deep learning methods for spatial gene expression prediction from histology images: a comprehensive assessment
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 对深度学习从组织学图像预测空间基因表达的方法进行了全面评估 首次对七种算法在六个数据集、四种癌症类型及一种非癌症疾病上进行系统比较,并分析了与疾病功能相关基因的可预测性 未提及具体局限性 评估现有深度学习方法在从组织学图像预测空间基因表达中的性能与局限性 七种深度学习算法,用于预测空间基因表达 计算机视觉 癌症、非癌症疾病 空间转录组学 深度学习模型 组织学图像、基因表达数据 六个数据集 NA 空间转录组学 NA NA
3088 2026-08-08
CMA-associated cellular state remodeling defines prognostic heterogeneity and identifies ARRDC3 as a protective functional gene in small cell lung cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,揭示了小细胞肺癌中伴侣介导自噬相关的细胞异质性,并构建了预后风险评分,验证了ARRDC3的保护性功能 首次在单细胞水平上系统表征小细胞肺癌中伴侣介导自噬的细胞异质性,并基于机器学习构建了新的预后风险评分模型,同时实验验证了ARRDC3作为保护性功能基因的作用 文章未明确提及研究局限性 探究小细胞肺癌中伴侣介导自噬相关的细胞异质性及其预后意义,并建立可靠的分子分层工具以反映肿瘤异质性和生存风险 小细胞肺癌患者样本、细胞系(H446细胞)及相关转录组和临床数据 机器学习、生物信息学 小细胞肺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、机器学习 机器学习模型(具体类型未明确) 基因表达数据、临床数据、图像数据(如细胞实验图像) 未明确具体样本数量,但涉及多个队列(综合队列、GSE60052队列、cBioPortal队列) 未明确 单细胞RNA测序、批量RNA测序 未明确 未明确
3089 2026-08-08
[Ethical and clinical aspects of genetic analysis in neurodegenerative diseases]
2026, Zhurnal nevrologii i psikhiatrii imeni S.S. Korsakova
综述 对传统遗传学方法与单细胞和单核RNA测序等高分辨率技术在神经退行性疾病中的应用进行综合分析,探讨LRRK2和GBA1基因不完全外显率的机制及其对特定细胞类型的影响 整合全基因组关联研究与单细胞表达图谱,揭示LRRK2和GBA1突变在胶质细胞中的细胞特异性作用,并系统分析不完全外显率的异质性 未提供原始实验数据,基于文献综述,可能受限于已有研究的覆盖范围 比较传统遗传学方法与单细胞测序技术的局限性,阐明神经退行性疾病中关键风险基因的细胞特异性机制及其不完全外显率的临床意义 LRRK2和GBA1基因突变相关的神经退行性疾病,涉及小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞和特定脆弱神经元 自然语言处理 神经退行性疾病 单细胞RNA测序、单核RNA测序、全基因组关联研究 NA 转录组数据、基因组数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA测序、单核RNA测序 NA NA
3090 2026-08-06
Generation of Porcine Blastoids from Embryonic Stem Cells
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 该论文描述了一种从胚胎干细胞生成猪胚泡样结构(blastoids)的三维两步分化方案,并验证其形态、细胞谱系组成和单细胞转录组特征与猪囊胚相似。 首次开发了从猪胚胎干细胞生成胚泡样结构的三维两步分化策略,该胚泡样结构能在体外存活并扩展超过两周。 未提及具体局限性,但可能包括体外培养条件与体内环境的差异以及长期发育能力的验证不足。 开发一种从猪胚胎干细胞生成胚泡样结构的方法,以用于研究胚胎发生和早期发育事件,并可能为大型动物育种提供工具。 猪胚胎干细胞及其生成的胚泡样结构(blastoids),并与猪囊胚进行比较。 干细胞生物学 NA 单细胞转录组测序,三维细胞培养 NA 单细胞转录组数据,图像(形态学) 未明确说明样本数量,但涉及猪胚胎干细胞系及生成的胚泡样结构。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3091 2026-08-04
Cerebrospinal fluid-driven ependymal motile cilia defects are implicated in multiple sclerosis
2026-Aug-03, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究首次探讨了多发性硬化中脑脊液驱动的室管膜运动纤毛缺陷及其对病理和行为的潜在影响 首次在MS背景下研究室管膜运动纤毛,通过单细胞RNA测序、CSF暴露实验和转基因动物模型揭示其功能障碍 未在标题和摘要中明确提及局限性 探究MS中室管膜运动纤毛是否受损及其对病理和行为的影响 多发性硬化患者和非MS对照的脑室周围组织、患者CSF、小鼠室管膜细胞及EAE模型小鼠 神经科学 多发性硬化 单细胞RNA测序、免疫染色、转基因动物模型 NA 基因表达数据、图像、行为学数据 人类患者和对照的脑组织及CSF样本,小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3092 2026-08-04
BMAL1 insufficiency increases the risk of thoracic aortic aneurysm and dissection
2026-02-24, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨BMAL1不足通过下调REV-ERBα诱导血管平滑肌细胞凋亡,增加胸主动脉瘤和夹层风险 首次揭示BMAL1通过转录调控REV-ERBα影响VSMC凋亡在TAAD发生中的作用,并验证BMAL1激活剂和REV-ERBα激动剂的治疗潜力 未提及具体局限性 阐明BMAL1不足在胸主动脉瘤和夹层发展中的作用及机制 TAAD患者和BAPN诱导的TAAD小鼠模型 机器学习 心血管疾病 转录组学、空间转录组学、分子实验 小鼠模型 转录组数据、空间转录组数据、图像 未明确提及 NA 空间转录组学 NA NA
3093 2026-08-04
Ets1-regulated endothelial-secreted factors promote compact myocardial growth and contribute to the pathogenesis of ventricular non-compaction
2026-02-24, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Ets1调控的内皮分泌因子在致密心肌生长中的关键作用,并探讨其在心室致密化不全发病机制中的贡献 首次揭示Ets1调控的内皮分泌因子(包括ECM成分和Notch信号效应因子)对致密心肌发育的必需性,并提出潜在的治疗靶点 未明确说明 探讨Ets1调控的内皮分泌因子在致密心肌生长中的作用及其在心室致密化不全发病机制中的贡献 小鼠模型中的心肌细胞和内皮细胞 分子生物学 心室致密化不全 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
3094 2026-08-03
Pure isolation, culture, and postinjury lineage tracing of mouse visceral pleural mesothelial cells
2026-Aug-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 提出了一种从野生型小鼠肺中纯化分离和培养内脏胸膜间皮细胞的方法,并利用谱系追踪观察其在损伤后的行为 首次实现了野生型啮齿动物肺中内脏胸膜间皮细胞的直接纯分离,利用Msln基因标记结合流式细胞分选,并验证了其在体内损伤模型中的应用 该方法仅适用于未损伤肺;肺损伤后部分间皮细胞可发生间皮-间充质转化并降低Msln表达,从而影响分离效率 开发一个可靠的内脏胸膜间皮细胞分离和培养方法,以支持胸膜相关肺部疾病的机制研究 小鼠内脏胸膜间皮细胞 分子生物学 胸膜疾病 单细胞RNA测序数据分析,流式细胞分选,细胞培养,免疫细胞化学,谱系追踪,博来霉素损伤模型 NA 单细胞RNA测序数据,细胞图像,组织病理图像 小鼠内脏胸膜细胞样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA NA
3095 2026-08-03
Engineering Tregs-mediated immune tolerance via foxp3a overexpression to evade allograft transplantation barriers in zebrafish
2026-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过系统性过表达foxp3a构建转基因斑马鱼品系,以介导Treg细胞免疫耐受,从而克服异体移植屏障,加速种系干细胞移植和建立稳定转基因系。 首次通过foxp3a过表达在斑马鱼中工程化Treg介导的免疫耐受,提供一种替代免疫缺陷宿主的实用方法,用于鱼类基因组操作和移植。 研究依赖斑马鱼模型,可能无法完全模拟哺乳动物移植的复杂性,且长期安全性和潜在的免疫副作用尚未充分评估。 利用foxp3a过表达工程化Tregs介导免疫耐受,以克服斑马鱼异体移植屏障,提高种系干细胞移植效率和转基因系建立。 斑马鱼(Tg(CMV:foxp3a)品系)及其生殖腺原基和种系干细胞。 免疫学、遗传工程 不适用 转基因技术、转录组分析、原位杂交、单细胞RNA测序 转基因斑马鱼模型 转录组测序数据、单细胞RNA测序数据、基因表达图像 涉及斑马鱼品系和移植实验,具体数量未在标题和摘要中提供。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
3096 2026-08-03
The single cell transcriptomic landscape of recurrent giant cell tumor of bone following neoadjuvant denosumab therapy
2026-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了未经治疗的原发性、新辅助地诺单抗治疗后的原发性及复发性骨巨细胞瘤的转录组景观,揭示了地诺单抗治疗相关的复发机制。 首次在单细胞水平上描绘了新辅助地诺单抗治疗前后及复发骨巨细胞瘤的转录组变化,揭示了地诺单抗诱导的肿瘤细胞转化和免疫微环境改变,以及CSF1R抑制剂治疗的潜在价值。 样本量可能有限,未提及具体样本数,且研究基于单细胞RNA测序,未进行功能验证或长期临床随访。 探究新辅助地诺单抗治疗增加骨巨细胞瘤刮除术后局部复发风险的潜在机制,并为复发后的治疗提供新策略。 人骨巨细胞瘤样本,包括未经治疗的、地诺单抗治疗后的原发及复发肿瘤组织。 单细胞转录组学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 33,440个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3097 2026-08-03
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Aug, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过实验上调Lancl1蛋白,验证其促进视神经损伤后轴突再生的作用 首次证明Lancl1作为新型轴突再生促进因子,在体内促进视神经损伤后的神经保护和轴突再生 未发现Lancl1转基因激活mTOR通路pS6标记,需进一步研究其下游机制 探究Lancl1上调能否直接修复受损轴突,并评估其治疗中枢神经系统损伤的潜力 视网膜神经节细胞(RGCs)及视神经损伤模型 神经科学 视神经损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3098 2026-08-03
Single-cell sequencing unveils a profibrotic macrophage and infiltrating monocyte niche in the bronchoalveolar lavage of patients with chronic obstructive pulmonary disease
2026-Aug-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 通过单细胞测序技术揭示慢性阻塞性肺疾病患者支气管肺泡灌洗液中促纤维化巨噬细胞和浸润性单核细胞的生态位 首次在单细胞分辨率下全面表征COPD患者肺泡空间免疫细胞组成差异,并关联气流受限严重程度 样本量较小(17名参与者),可能限制统计功效和普遍性 在单细胞分辨率下表征COPD患者与健康对照肺泡空间免疫细胞组成差异及其与气流受限严重程度的关系 COPD患者和健康对照者的支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 单细胞测序 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 17名参与者(COPD组10人,对照组7人),共97,254个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3099 2026-08-03
A cholinergic checkpoint controls autoantibody selection via somatic hypermutation in lupus germinal centers
2026-Aug, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 本研究揭示了在狼疮生发中心中,Tfh细胞来源的乙酰胆碱通过体细胞超突变调控自身抗体选择,促进系统性红斑狼疮发病的胆碱能检查点机制。 首次发现Tfh细胞中的胆碱乙酰转移酶(ChAT)通过乙酰胆碱信号调控生发中心B细胞的体细胞超突变和自身反应性抗体选择,为SLE发病机制提供了新的胆碱能检查点概念。 尚未明确ChAT调控体细胞超突变的具体分子机制,且研究基于小鼠模型,需在人类SLE中进一步验证。 阐明狼疮生发中心中调控自身抗体生成的精确机制,特别是胆碱能信号在体细胞超突变中的作用。 狼疮易感NZM2328小鼠模型中的生发中心B细胞、滤泡辅助性T细胞(Tfh)、浆细胞及其相互作用。 免疫学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序、流式细胞术、基因敲除小鼠、免疫荧光 NA 基因表达数据、免疫表型数据 小鼠模型,具体样本量未在标题和摘要中提供 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序分析,具体配置未详细说明
3100 2026-08-03
Sympathetic immunomodulation suppresses liver metastasis by maintaining the balance between norepinephrine concentration and the α2a/β2-AR ratio
2026-Aug, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 本研究探讨了交感神经系统在肝转移中的作用,发现去甲肾上腺素浓度对结直肠癌肝转移具有剂量依赖性效应,并揭示了α2a/β2-肾上腺素能受体比例在其中的调控机制。 首次揭示了交感神经系统通过去甲肾上腺素浓度和α2a/β2-AR受体比例调节肝转移的U型效应,提出适度交感神经激活可作为抑制肝转移的治疗策略。 本研究主要基于动物模型和体外实验,临床验证尚需进一步开展,且具体分子机制需更深入探索。 阐明交感神经系统在肝转移中的作用及其潜在机制,探索抑制肝转移的新治疗策略。 结直肠癌肝转移小鼠模型,以及单细胞RNA测序分析的免疫细胞。 数字病理学 结直肠癌肝转移 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型,未提及具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
回到顶部