单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 3608 篇文献，本页显示第 3061 - 3080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3061 | 2026-01-20 |
17β-estradiol mediates sex-biased progesterone receptor expression via estrogen receptor α in chicken pituitary
2026-Jan, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106210
PMID:41380332
|
研究论文 | 本研究揭示了17β-雌二醇通过雌激素受体α介导鸡垂体中孕酮受体表达的性别偏倚机制 | 首次在鸡垂体中阐明了雌激素依赖的孕酮受体性别偏倚表达调控机制，涉及膜锚定ERα触发的快速非基因组通路和ERα相关的长效基因组作用 | 研究主要基于鸡模型，机制在其它鸟类或动物中的普适性有待验证 | 探究鸡垂体中孕酮受体性别偏倚表达的关键性腺类固醇及其调控机制 | 鸡垂体组织 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA-seq，体外实验，皮下注射 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3062 | 2026-01-20 |
Multi-omics atlas of ovarian cellular and molecular responses to diabetes
2026-Jan, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102307
PMID:41397560
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和代谢组学，全面表征了糖尿病雌性小鼠卵巢的细胞景观、表观遗传改变和代谢重编程 | 首次在糖尿病背景下，利用多组学方法系统揭示了卵巢功能障碍的细胞和分子机制，特别是发现了颗粒细胞中关键基因表达下降与DNA甲基化增加的相关性 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且糖尿病模型的特定类型和病程可能影响结果的普适性 | 阐明糖尿病对卵巢功能的细胞和分子影响机制 | 糖尿病雌性小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 代谢数据 | 未明确指定样本数量，但基于糖尿病雌性小鼠卵巢 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 3063 | 2026-01-20 |
TOGAR: Token-gated generative refinement for high-fidelity spatial transcriptomics and robust spatial domain clustering
2026-Jan, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111179
PMID:41422986
|
研究论文 | 本文介绍了TOGAR模型，一种用于空间转录组学的令牌门控生成式精炼模型，旨在通过去噪、空间增强和聚类统一处理，提高数据保真度和空间域聚类鲁棒性 | TOGAR模型首次结合了图卷积网络损失和零膨胀负二项分布损失来减少噪声，并采用基于UGate的扩散骨干网络，集成令牌门控、门控线性注意力和旋转位置嵌入进行生成式空间精炼，同时通过相似性引导平均沿扩散轨迹提供稳定的点级估计 | NA | 提高空间转录组学数据的保真度，实现鲁棒的空间域聚类 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络, 扩散模型 | 基因表达数据 | 12个切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3064 | 2026-01-20 |
Differentiation-induced reduction in functional diversity restricts the ability of cytomegalovirus-specific CD8 T cells to eliminate virus-infected cells
2026-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106107
PMID:41494240
|
研究论文 | 本研究通过多模态分析揭示了巨细胞病毒特异性CD8 T细胞分化程度与其功能多样性及清除病毒能力之间的关系 | 首次系统比较了高频率和低频率NLV-T细胞在分化表型、细胞因子分泌和清除病毒感染细胞能力方面的差异，并发现分化程度较低的细胞在HLA下调情况下仍能有效清除病毒 | 研究样本仅来自健康HCMV阳性供体，未涵盖免疫功能受损个体；实验主要在体外进行，体内验证有限 | 探究巨细胞病毒特异性CD8 T细胞分化状态如何影响其免疫控制能力 | 来自116名健康HCMV阳性供体的NLV-T细胞 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | 多色光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、TCR谱分析 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据 | 116名健康HCMV阳性供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3065 | 2026-01-20 |
Integrating multiple key molecules in uveal melanoma to uncover metastatic and immune microenvironment-related gene signatures
2026, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2026.01.02
PMID:41523997
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，在葡萄膜黑色素瘤中鉴定出与转移和预后相关的七个关键基因，并构建了一个用于生存预测的风险评分模型 | 整合了TCGA和GEO的转录组数据、单细胞RNA-seq数据以及体外细胞实验验证，构建了一个与转移和免疫微环境相关的七基因特征，并首次在单细胞水平揭示了这些基因在具有高转移潜能的肿瘤细胞亚群中的特异性表达 | 样本量相对较小（TCGA队列80例，GEO验证集13例，单细胞数据11个肿瘤），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性队列进行验证 | 鉴定葡萄膜黑色素瘤中与转移相关的预后基因，并构建一个稳健的分子特征用于患者生存预测 | 葡萄膜黑色素瘤患者（来自TCGA-UVM队列和GEO数据集）、葡萄膜黑色素瘤细胞系（92.1, OMM1, MEL270）以及成人视网膜色素上皮细胞（ARPE-19） | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序、微阵列、单细胞RNA-seq、qRT-PCR、Western blotting | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、体细胞突变数据、拷贝数变异数据 | TCGA队列80例患者，GEO数据集GSE73652中13例（8例非转移 vs 5例转移），单细胞数据集GSE139829中11个肿瘤 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3066 | 2026-01-20 |
Sex in Immune Cells and Parasitic Diseases - A Complex Relationship
2026-Jan, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70097
PMID:41546136
|
综述 | 本文综述了性别在免疫细胞与寄生虫病关系中的作用，重点探讨了生物学性别差异如何通过免疫系统影响寄生虫感染的易感性和控制 | 结合经典免疫学与单细胞转录组学，揭示了激素和染色体因素驱动的先天与适应性免疫细胞的性别特异性差异 | 许多寄生虫病研究仍缺乏充分的性别分层数据，且未应用最先进的免疫学分析来全面表征生物学性别效应 | 总结当前关于先天和适应性免疫关键细胞成分中性别差异的知识，并讨论其对全球重要寄生虫病的相关性 | 利什曼病、恰加斯病、阿米巴病、血吸虫病和疟疾等寄生虫病 | 自然语言处理 | 寄生虫病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3067 | 2026-01-20 |
GSTO1 as a Potential Risk Factor for Diabetic Nephropathy: Evidence From Mendelian Randomisation and Multi-Omics Analyses
2026-Jan, Nephrology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/nep.70165
PMID:41549440
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和多组学分析，探讨了GSTO1作为糖尿病肾病潜在风险因素的因果关联 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序技术，系统评估GSTO1在糖尿病肾病中的因果作用 | 研究主要基于观察性数据和体外细胞实验，需要进一步的功能验证和临床研究 | 探究GSTO1与糖尿病肾病风险的潜在因果关系 | 糖尿病肾病患者样本、HK-2细胞系 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3068 | 2026-01-19 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing to identify disulfidptosis-related gene signature, immune landscape, and immunotherapy targets in cutaneous melanoma
2026-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.116046
PMID:41500176
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序，识别了皮肤黑色素瘤中与二硫键死亡相关的基因特征、免疫景观及免疫治疗靶点 | 首次在皮肤黑色素瘤中系统探索二硫键死亡的分子机制及其临床价值，并识别出关键基因B2M、HLA-A和HLA-B作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限，单细胞数据仅来自四名患者，且体外实验仅使用A-375细胞系，需进一步验证 | 阐明二硫键死亡在皮肤黑色素瘤中的分子机制及其对免疫治疗和预后的潜在影响 | 皮肤黑色素瘤细胞（A-375细胞系）及患者样本（单细胞数据来自4名患者，bulk数据来自472名患者） | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 4名患者的单细胞数据，472名患者的bulk RNA数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3069 | 2026-01-19 |
Pre-B-cell leukemia transcription factor 1 contributes to liver fibrosis by enabling IL-7 signaling in HSC
2026-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001302
PMID:40080840
|
研究论文 | 本研究探讨了Pre-B细胞白血病转录因子1（PBX1）在肝纤维化中的作用，发现其通过激活IL-7信号通路促进肝星状细胞活化 | 首次揭示了PBX1在肝星状细胞活化中的关键作用，并发现其通过调控IL-7受体（IL7R）激活促纤维化信号级联 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证有限，且未深入探讨PBX1在其他肝细胞类型中的潜在作用 | 探究PBX1在肝纤维化过程中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肝星状细胞（HSCs）、小鼠模型、肝硬化患者样本 | 数字病理学 | 肝纤维化、肝硬化、肝细胞癌 | 单细胞RNA-seq、转录组分析、报告基因检测、染色质免疫沉淀 | NA | RNA-seq数据、转录组数据 | 小鼠模型及肝硬化患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3070 | 2026-01-19 |
Targeting cell-state plasticity driven by FOXM1/CEBPB axis disrupts developmental heterogeneity and therapeutic resistance in hepatocellular carcinoma
2026-Feb, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.09.022
PMID:41043722
|
研究论文 | 本研究揭示了FOXM1/CEBPB轴驱动肝细胞癌（HCC）细胞状态可塑性、发育异质性和治疗耐药性的关键作用，并设计了一种靶向肝FOXM1的RNAi疗法，在临床前模型中显示出疗效 | 首次发现FOXM1/CEBPB轴作为主控开关，通过相互抑制和竞争下游网络控制HCC发育异质性动态，并设计了靶向该轴的GalNAc偶联siRNA化合物进行干预 | 研究主要基于公共数据集和临床前模型，其结论在人体中的有效性和安全性仍需进一步临床测试验证 | 探究肝细胞癌（HCC）中发育异质性和治疗耐药性的调控机制，并开发靶向干预策略 | 肝细胞癌（HCC）患者样本、体外和体内HCC模型 | 计算生物学，单细胞组学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq），自调节网络分析 | NA | RNA测序数据（bulk和单细胞） | 来自HCC患者的公共bulk RNA-seq和scRNA-seq数据集，以及研究者自有的肝细胞分化模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3071 | 2026-01-19 |
Activation of Angiotensin-Converting Enzyme 2 Mitigates Gastrointestinal Acute Radiation Syndrome
2026-Feb-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.09.021
PMID:40967372
|
研究论文 | 本研究评估了激活血管紧张素转换酶2（ACE2）在啮齿动物模型中减轻胃肠道急性放射综合征（GI-ARS）及保护幸存者免受延迟性急性辐射暴露效应（DEARE）的作用 | 首次在体内模型中证明，通过药物DIZE或工程化ACE2蛋白变体激活ACE2，可以加速肠道祖细胞恢复并改善GI-ARS和DEARE的生存率，揭示了替代肾素-血管紧张素系统（RAS）轴作为辐射损伤医学对策的新靶点 | 研究主要在啮齿动物模型中进行，结果向人类临床转化的有效性尚需进一步验证 | 开发针对胃肠道急性放射综合征（GI-ARS）和延迟性急性辐射暴露效应（DEARE）的医学对策 | 啮齿动物（大鼠和小鼠）的胃肠道组织 | NA | 急性放射综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个啮齿动物部分身体照射（PBI）模型队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3072 | 2026-01-19 |
Whole Genome and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Clonal Evolution and Heterogeneity of Secondary Plasma Cell Leukemia: A Case Report
2026-Feb, EJHaem
DOI:10.1002/jha2.70215
PMID:41542018
|
病例报告 | 本文通过全基因组测序和单细胞RNA测序，报告了一例继发性浆细胞白血病患者的克隆演化与肿瘤异质性 | 结合全基因组测序与单细胞RNA测序技术，揭示了继发性浆细胞白血病发展过程中的克隆演化和基因组不稳定性 | 仅基于单个病例报告，样本量有限，结果可能不具有普遍代表性 | 探究继发性浆细胞白血病的克隆演化和肿瘤异质性 | 一名75岁日本男性患者，患有IgG-λ型多发性骨髓瘤并迅速进展为继发性浆细胞白血病 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3073 | 2026-01-19 |
Unraveling the Effects and Characteristics of Proliferating Tumor and Cytotoxic T Cells in Colorectal Cancer
2026-Jan-16, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2026
PMID:41201451
|
研究论文 | 本研究通过多色免疫组化和单细胞RNA测序，探讨了结直肠癌中增殖性肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特征及其预后意义 | 首次系统性地结合空间定位分析和单细胞转录组数据，揭示了肿瘤细胞增殖与良好预后的关联，并比较了增殖与非增殖细胞毒性T细胞的预后价值差异 | 研究基于回顾性队列，可能存在选择偏倚；空间分析仅考虑了肿瘤细胞与T细胞的共定位，未涉及其他免疫细胞类型 | 探究结直肠癌中增殖性肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特性及其对患者预后的影响 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多色免疫组化，单细胞RNA测序，数字图像分析 | NA | 图像，单细胞转录组数据 | 两个独立队列共1839名患者，以及62例结肠癌的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3074 | 2026-01-19 |
Glial betaPix is essential for blood vessel development in the zebrafish brain
2026-Jan-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.106665
PMID:41543887
|
研究论文 | 本研究通过建立高效的条件性敲除方法，揭示了胶质细胞中的betaPix在斑马鱼大脑血管发育和血脑屏障形成中的关键作用 | 开发了一种基于同源定向修复的高效条件性敲除方法，并首次明确了betaPix在胶质细胞中的特异性功能，而非神经元、内皮细胞或周细胞 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型，对人类细胞的适用性仅作推测，需进一步验证 | 探究betaPix在斑马鱼大脑血管发育和血脑屏障形成中的细胞特异性功能及分子机制 | 斑马鱼胚胎中的胶质细胞、神经元、内皮细胞和周细胞 | 发育生物学 | 脑血管疾病 | 同源定向修复介导的敲入和敲除技术、单细胞转录组分析 | 条件性敲除模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3075 | 2026-01-19 |
Hidden oral-joint-lung axis: Porphyromonas gingivalis Infection promotes the EMyT of RA-ILD by inhibiting the JUN-regulated palmitoylation balance
2026-Jan-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116210
PMID:41547254
|
研究论文 | 本研究揭示了牙龈卟啉单胞菌感染通过破坏JUN调控的棕榈酰化平衡，促进类风湿关节炎相关间质性肺病中的上皮-肌成纤维细胞转化和纤维化，从而发现了一个新的口腔-关节-肺轴 | 首次提出并验证了口腔-关节-肺轴的存在，揭示了牙龈卟啉单胞菌通过调控JUN介导的棕榈酰化失衡来驱动RA-ILD的病理机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系，临床样本验证有限，且棕榈酰化调控网络可能涉及更多未探索的因子 | 探究牙龈卟啉单胞菌感染如何通过棕榈酰化介导的上皮-肌成纤维细胞转化驱动RA-ILD，阐明口腔-关节-肺连接的机制基础 | RA-ILD患者的支气管肺泡灌洗液和粪便样本、胶原诱导关节炎小鼠模型、人肺上皮细胞系（A549和BEAS-2B） | 病理机制研究 | 类风湿关节炎相关间质性肺病 | 宏基因组下一代测序、16S rRNA测序、免疫病理学、qPCR、Western blotting、单细胞测序、分子对接 | NA | 测序数据、分子表达数据、病理图像 | RA-ILD患者的临床样本（具体数量未明确）、胶原诱导关节炎小鼠模型、人肺上皮细胞系 | NA | 宏基因组下一代测序、16S rRNA测序、单细胞测序 | NA | NA |
| 3076 | 2026-01-19 |
Advances in Spatial Transcriptomics in Bone
2026-Jan-15, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-025-00949-8
PMID:41535622
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在骨骼研究中的应用进展，包括其在骨骼发育、维持、相关疾病和骨折愈合中的潜力 | 强调了空间转录组学作为揭示骨骼空间和分子复杂性的关键技术，并探讨了其与多组学和多模态成像方法整合的潜力 | 缺乏标准化的数据分析流程，且当前数据集样本量较小，影响了数据的可解释性 | 推动骨骼基础研究和转化研究，特别是在骨科和肌肉骨骼研究领域 | 骨骼组织，包括骨骼发育、维持、相关疾病和骨折愈合过程 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 样本量较小 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3077 | 2026-01-19 |
Lineage tracing reveals the origins and dynamics of macrophages in lung injury and repair
2026-Jan-14, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00859-0
PMID:41535251
|
研究论文 | 本研究利用遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了组织驻留和浸润性巨噬细胞在肺损伤和修复过程中的动态贡献和功能 | 通过遗传谱系追踪结合scRNA-seq，首次系统阐明了不同来源巨噬细胞在肺纤维化中的细胞命运、动态响应和功能，并发现Notch信号与Wnt/β-catenin信号在单核细胞招募和肺纤维化调控中的负相关关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类肺损伤和修复中的巨噬细胞动态可能有所不同；未详细探讨其他免疫细胞类型的相互作用 | 探究肺损伤和修复过程中不同来源巨噬细胞的细胞命运、动态响应和功能 | 组织驻留巨噬细胞和浸润性巨噬细胞（包括单核细胞来源的巨噬细胞） | 数字病理学 | 肺纤维化 | 遗传谱系追踪，scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3078 | 2026-01-19 |
PSMD1 inhibition suppresses tumor progression and enhances antitumor immunity by modulating the RTKN/β-catenin/PD-L1 axis in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08241-4
PMID:41535254
|
研究论文 | 本研究探讨了PSMD1通过调控RTKN/β-catenin/PD-L1轴在肝细胞癌中的作用，揭示了其抑制肿瘤进展和增强抗肿瘤免疫的机制 | 首次揭示了PSMD1通过RTKN/β-catenin轴调控PD-L1表达，并证明靶向该轴可增强抗PD-1疗法的疗效 | 研究主要基于体外和体内模型，临床转化潜力需进一步验证 | 探究PSMD1在肝细胞癌免疫治疗反应中的调控作用及分子机制 | 肝细胞癌细胞系、动物模型及公共单细胞RNA测序数据集 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、质谱分析、组织微阵列 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3079 | 2026-01-19 |
Longitudinal analysis of retinal cell state transitions in RB1-deficient retinal organoids reveals the nascent cone precursors are the earliest cell-origin of human retinoblastoma
2026-Jan-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08191-x
PMID:41535675
|
研究论文 | 本研究通过构建RB1缺陷的人视网膜类器官模型，结合单细胞RNA测序分析，揭示了RB1缺失如何诱导ATOH7神经源性视网膜祖细胞过度增殖，并最终导致ATOH7/RXRγ新生锥体前体细胞驱动视网膜母细胞瘤发生 | 首次证明nRPCs是RB1缺失最敏感的细胞，能诱导新生视网膜细胞异常增殖，而ATOH7新生锥体前体细胞是人类视网膜母细胞瘤最早的细胞起源 | 研究基于类器官模型和异种移植，可能无法完全模拟人体内肿瘤微环境 | 探究RB1失活对不同视网膜细胞类型的影响，并确定视网膜母细胞瘤的细胞起源 | RB1缺陷的人视网膜类器官、人诱导多能干细胞、肿瘤细胞 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、多组学分析、基因敲低实验、小分子抑制剂验证 | 类器官模型、异种移植模型 | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | 未明确具体样本数量，但涉及RB1或RB1人诱导多能干细胞生成的类器官和肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3080 | 2026-01-19 |
scCT-DB, an omnibus for cancer patient-derived paired pre- and post-treatment single-cell transcriptomes to reveal drug perturbation and drug resistance mechanisms
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1065
PMID:41160885
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scCT-DB的综合性数据库，该数据库专门收集癌症患者治疗前后配对的单细胞转录组数据，旨在揭示药物扰动和耐药机制 | 开发了首个全面整合癌症患者治疗前后配对单细胞转录组数据的数据库，并提供了统一的数据处理流程、结构化元数据以及多种在线分析工具 | NA | 为癌症药物耐药性研究提供一个易于访问、整合和重用的高质量单细胞转录组数据资源与分析平台 | 癌症患者的配对治疗前后单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 619万个细胞，来自1142个原始患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |