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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3061 2026-08-08
Single-cell RNA Sequencing for Profiling Ganglionic and Aganglionic Colonic Segments from Patients with Hirschsprung Disease
2026-05-22, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 建立单细胞RNA测序工作流程,分析Hirschsprung病患者神经节段和无神经节段结肠组织的转录图谱,揭示免疫微环境差异 采用单细胞RNA测序技术解析HSCR患者结肠神经节段与无神经节段的细胞异质性,弥补了批量RNA测序无法分辨细胞亚群的不足 研究仅涉及少数患者样本,未进行功能验证或机制探讨 研究Hirschsprung病中神经节段与无神经节段结肠组织的细胞组成和基因表达差异,特别是免疫微环境 Hirschsprung病患者的结肠神经节段和无神经节段组织 单细胞转录组学 Hirschsprung病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3062 2026-08-08
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-05-22, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提出了一种优化的方案,用于从健康和肿瘤-bearing小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液,以供流式细胞术和单细胞RNA测序使用 该方案优化了组织灌注、酶消化、机械解离等步骤,成功从纤维化和异质性强的肿瘤肺组织中获得了超过85%的存活细胞,并通过FACS和scRNA-seq有效分离和检测tdTomato肿瘤细胞 文中未明确提及局限性 开发从肿瘤-bearing小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液的详细步骤方案,以支持单细胞RNA测序研究 健康和肿瘤-bearing小鼠肺组织,使用Kras; tdTomato报告基因小鼠模型 单细胞测序 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,FACS NA 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3063 2026-08-08
Bilirubin reductase regulates macrophage senescence and modulates implant-associated Staphylococcus aureus osteomyelitis
2026-May-14, Chinese journal of traumatology = Zhonghua chuang shang za zhi
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、批量转录组学和衰老相关基因集,识别骨髓炎诊断生物标志物并探讨其在巨噬细胞衰老中的作用。 首次将多组学数据与孟德尔随机化相结合,确定胆绿素还原酶A(BLVRA)为骨髓炎的因果中介因子,并关联到巨噬细胞衰老。 未在摘要中提及具体局限性。 识别可靠的骨髓炎诊断生物标志物,并探索其在巨噬细胞衰老中的作用,为早期诊断和免疫治疗提供基础。 骨髓炎患者样本、小鼠模型、巨噬细胞 机器学习、数字病理学 骨髓炎 单细胞RNA测序、批量转录组学、孟德尔随机化 机器学习算法(具体模型未指定) 基因表达数据、单细胞数据 未在摘要中指明样本数量 未指定 单细胞RNA测序、批量RNA测序 未指定 未指定
3064 2026-08-08
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-05, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究探讨了GITR激动剂治疗在胰腺导管腺癌中增强抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤进展的作用 首次在PDAC中系统评估GITR激动剂治疗的效果,并结合空间转录组学揭示GITR表达与肿瘤细胞的邻近关系,以及长期生存患者中GITR+淋巴细胞的高水平 主要基于小鼠模型和有限的人体样本,需要进一步临床验证 评估GITR激活在PDAC中的抗肿瘤作用及其免疫调节机制,以期为免疫治疗提供新靶点 PDAC患者肿瘤样本及Pan02小鼠模型 免疫学, 肿瘤学 胰腺导管腺癌 scRNA-seq, 空间转录组学, 免疫荧光 小鼠模型 基因表达数据, 图像数据 未明确列出具体样本数量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
3065 2026-08-08
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-05, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗PD-1相关的间接药物性肝损伤的免疫学景观,首次提供了肿瘤负荷条件下小鼠模型的肝脏微环境单细胞图谱。 首次构建了抗PD-1诱导肝损伤的肿瘤负荷小鼠模型的单细胞图谱,揭示了代谢重编程和促纤维化表型,并鉴定NETosis作为关键致病事件。 研究主要基于小鼠模型,患者样本验证有限,具体机制尚需进一步探索。 阐明抗PD-1相关间接药物性肝损伤的病理机制,特别是免疫细胞间的相互作用。 Lewis肺腺癌荷瘤小鼠的肝组织,以及用于验证的患者标本。 单细胞转录组学 药物性肝损伤 单细胞RNA测序 小鼠模型,可能涉及聚类分析等,但未明确指定具体模型(如CNN等),故输出NA 单细胞转录组数据 两只小鼠的肝组织(对照组和处理组各一只),以及有限的患者标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3066 2026-08-08
Fibrotic differentiation profile of skeletal and cardiac muscle fibroadipogenic progenitors in D2-mdx mouse
2026-Apr-24, Journal of neuromuscular diseases IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过双报告小鼠模型结合单细胞RNA测序,揭示了D2-mdx小鼠骨骼肌和心肌纤维脂肪生成祖细胞的纤维化分化特征及其在杜氏肌营养不良症纤维化中的作用 首次利用双报告小鼠模型(PRURD2)结合单细胞RNA测序,全面解析了FAPs在DMD肌肉纤维化中的动态变化和谱系分化轨迹,鉴定出纤维化相关的CD55亚群及多种纤维化相关信号通路 研究主要基于12个月龄的小鼠模型,且未涉及人类样本验证;FAPs的体内功能验证和抗纤维化治疗的干预实验尚未开展 探究FAPs在DMD肌肉纤维化中的动态变化和谱系分化机制,为理解DMD纤维化病理和开发抗纤维化疗法提供模型和依据 D2-mdx小鼠及对照小鼠的FAPs,包括心肌、膈肌和胫骨前肌组织 数字病理学 杜氏肌营养不良症 单细胞RNA测序 UMAP聚类、伪时间分析、CellChat、差异基因表达分析 单细胞转录组数据 12个月龄的PRURD2和PRURDBA小鼠,各组织样本(心脏、膈肌、胫骨前肌),具体样本量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3067 2026-08-08
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2026-04, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过整合转录组数据、临床验证和空间转录组学分析,识别出NNT作为肥胖相关结直肠癌的潜在预后生物标志物 首次将NNT确定为肥胖相关结直肠癌的预后生物标志物,并结合空间转录组学揭示其相关的肿瘤微环境特征,强调了结合临床数据与空间转录组学发现特定背景下肿瘤生物学的重要性 未提及明显的局限性 识别反映肥胖相关肿瘤特征并分层患者预后的分子标志物 肥胖相关结直肠癌肿瘤样本及对照(正常、非肥胖结直肠癌) 数字病理学 结直肠癌 转录组测序、免疫组化、空间转录组学 NA 转录组数据、组织切片图像 TCGA-COADREAD数据集及独立验证队列(具体数量未提供) NanoString 空间转录组学 GeoMx DSP GeoMx DSP用于空间转录组分析
3068 2026-08-08
YAP1-driven tumor-like cancer-associated fibroblasts modulate biomechanics of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-04, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序识别出肿瘤样癌症相关成纤维细胞亚群,并揭示YAP1通过调控该亚群重塑胰腺导管腺癌的细胞外基质力学特性。 首次识别出肿瘤样癌症相关成纤维细胞(tCAFs)亚群,并阐明YAP1调控其与肌成纤维细胞CAFs的相互转化,以及YAP1通过tCAFs促进ECM硬化和EMT的机制。 研究依赖小鼠模型和体外实验,需进一步在人类样本中验证;MRE的临床应用仍需更大规模研究。 探究YAP1与癌症相关成纤维细胞亚型在胰腺导管腺癌基质重塑中的作用,并评估靶向YAP1-tCAF轴的疗效及MRE监测基质硬度的潜力。 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织、KPC小鼠模型、癌症相关成纤维细胞亚群。 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及PDAC患者和小鼠模型(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3069 2026-08-08
CD8 TRM-like T cells expressing perforin and IFN-γ define a pediatric activated T-cell acute liver failure endotype
2026-Apr-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序,识别出儿童急性肝衰竭的两种内型,其中高穿孔素内型具有独特的CD8+ IFNγ+ Trm样细胞群和单核细胞活化特征 首次将儿童活化T细胞急性肝衰竭分为两种内型,并发现高穿孔素内型特有的循环CD8+ IFNγ+ Trm样细胞群和IFNγ介导的配体-受体相互作用 研究样本量较小,且未提供长期随访数据以验证治疗靶点的临床意义 表征儿童活化T细胞急性肝衰竭的免疫病理学,并识别潜在的治疗靶点 儿童活化T细胞急性肝衰竭患者及其外周血单核细胞、血清,以及健康儿童和疾病对照 免疫学 儿童急性肝衰竭 流式细胞术、单细胞RNA测序、Olink炎症蛋白检测 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、血清蛋白组学数据 TRIUMPH临床试验中的患者、健康儿童和疾病对照的样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics, Olink 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 10x Chromium, Olink Inflammation I 384 3' 单细胞RNA测序和Olink炎症蛋白检测
3070 2026-08-08
A Single-cell and Spatially Resolved Cell Atlas of Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2026-03-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学揭示人食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征及细胞间相互作用 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学系统解析食管鳞状细胞癌的抑制性免疫微环境,并鉴定出COL17A1+上皮细胞与POSTN+成纤维细胞组成的独特生态位及其低免疫浸润和脂质富集特征 未明确提及 阐明食管鳞状细胞癌中抑制性免疫微环境的分子特征和机制 人食管鳞状细胞癌及其匹配的非肿瘤组织 数字病理学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、代谢组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
3071 2026-08-08
Integrated single-cell transcriptomic atlas of human gastric and colorectal tissues across diverse phenotypes
2026-Mar-26, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 构建了包含574,532个细胞和479,629个细胞的人类胃和结直肠组织的综合单细胞转录组图谱,覆盖多种表型 提供了大规模、多表型的单细胞转录组图谱,包含超过一百万个细胞,并通过严格验证和标准化注释提高了数据可用性 未提及具体局限性 构建人类胃和结直肠组织的单细胞转录组图谱,以支持胃肠癌的元分析 人类胃和结直肠组织 单细胞转录组学 胃肠道癌症 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 229个人胃组织样本和220个人结直肠组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3072 2026-08-08
Multiomic characterisation of the clinical efficacy of guselkumab induction therapy in ulcerative colitis
2026-Mar-23, BMJ open gastroenterology IF:3.3Q2
研究论文 该研究详细评估了古塞库单抗治疗中重度溃疡性结肠炎患者的细胞和分子变化,并关联临床疗效终点。 首次对IL-23p19抑制剂古塞库单抗在中重度溃疡性结肠炎中的疗效进行多组学特征分析,结合转录组、单细胞和蛋白质组学。 摘要未提及局限性。 评估古塞库单抗治疗溃疡性结肠炎时相关的细胞和分子变化及其与临床疗效的关系。 中重度活动性溃疡性结肠炎患者。 多组学 溃疡性结肠炎 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 血清蛋白质组学 NA 转录组数据、单细胞数据、流式细胞数据、蛋白质组数据 313名患者入组,257例进行RNA-seq,52例进行单细胞测序,30例进行流式细胞术,302例进行血清蛋白质组学 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 蛋白质组学 NA NA
3073 2026-08-08
The PKA/MBD2 Axis Transcriptionally Represses INPP5A to Modulate PI3K/Akt Signaling and Accelerate Pituitary Tumorigenesis
2026-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究旨在探讨INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及其与PI3K/Akt信号通路和表观遗传调控因子MBD2的相互作用机制 首次揭示PKA/MBD2轴通过转录抑制INPP5A调控PI3K/Akt信号通路,加速垂体肿瘤发生的分子机制 未提及 探究INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及分子机制 垂体神经内分泌肿瘤患者样本及细胞系 分子生物学 垂体神经内分泌肿瘤 单细胞测序、免疫荧光染色 NA 单细胞测序数据、组织样本 62例垂体神经内分泌肿瘤患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3074 2026-08-08
Single-cell transcriptomics of the Drosophila ring gland identifies the SoxN-Vvl complex as a key regulator of juvenile hormone biosynthesis
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 对果蝇幼虫环腺进行单细胞转录组分析,鉴定出SoxN-Vvl复合物是保幼激素生物合成的关键转录调控因子 首次将环腺分解为细胞类型特异性分辨率进行单细胞RNA测序,克服了以往将环腺视为单一组织的局限性,并发现了CA特异性转录因子SoxN及其与Vvl形成的调控复合物 摘要未提及具体局限性 阐明保幼激素生物合成的转录调控机制,特别是细胞类型特异性的调控 果蝇幼虫环腺(包含咽侧体、前胸腺和心侧体) 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 7,919个细胞(来自幼虫环腺) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3075 2026-08-08
HSCs/MPPs as cells of origin with altered differentiation hierarchy impairing immunomicroenvironment in PML::RARA and CBFα/β fusion AML
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用优化的单细胞RNA测序技术,探究三种融合转录因子驱动的急性髓系白血病亚型中造血干细胞/多能祖细胞作为白血病干细胞起源,及其改变分化层次并影响免疫微环境的机制 首次通过优化的单细胞RNA测序技术,在24例初诊AML患者中广泛追踪融合转录因子在白血病母细胞及分化成熟的髓系和淋巴系细胞中的表达,证明HSCs/MPPs作为LSCs导致分化层次改变,并利用DNA-FISH和靶向测序验证层次性逐步白血病发生过程,开发了基于配体-受体的风险评分模型 未提供具体的局限性信息 探究融合转录因子驱动的急性髓系白血病中白血病干细胞的起源细胞,及其表达对免疫微环境的影响 24例初诊急性髓系白血病患者,包括三种融合转录因子亚型 单细胞转录组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序,DNA-FISH,靶向测序 NA 单细胞转录组数据、DNA-FISH数据、靶向测序数据 24例初诊AML患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3076 2026-08-08
MBOAT1 Promotes Glioma Progression Through Enhancing Ferroptosis Resistance and Immunosuppressive Microenvironment
2026-02, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究系统分析了MBOAT1在胶质瘤中的表达和临床意义,并验证了其通过增强铁死亡抵抗和促进免疫抑制微环境来推动胶质瘤进展的机制 首次探讨MBOAT家族成员MBOAT1在胶质瘤中的作用,并揭示其通过增强铁死亡抵抗和塑造免疫抑制微环境促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于数据库分析及体外实验,缺乏大规模临床样本验证,且具体分子机制尚需深入探讨 阐明MBOAT1在胶质瘤进展中的功能及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 胶质瘤患者样本及胶质母细胞瘤(GBM)细胞系 癌症生物学 胶质瘤 转录组测序, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 TCGA、CGGA、GEO和GTEx数据库中的胶质瘤样本及正常组织样本,具体数量未在摘要中说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3077 2026-08-08
<em>IGHG1, HLA-DOB, </em>and <em>GABBR1</em>: Genetic Insights into Rheumatoid Arthritis Using Mendelian Randomisation and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan, Journal of the College of Physicians and Surgeons--Pakistan : JCPSP
研究论文 利用孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术,识别类风湿关节炎相关关键基因并探讨其发病机制。 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合,发现GABBR1作为G蛋白偶联受体与类风湿关节炎的新关联。 摘要中未提及研究局限性。 识别类风湿关节炎的关键基因,并探索其在疾病发病机制中的作用,以提出新的治疗靶点。 类风湿关节炎患者与健康对照的基因表达数据及滑膜组织单细胞数据。 生物信息学 类风湿关节炎 差异基因表达分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3078 2026-08-08
Fumarate-associated immunometabolic network in Periodontitis revealed by integrated transcriptomic and single-cell RNA sequencing analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合批量转录组和单细胞RNA测序数据,揭示了牙周炎中与富马酸相关的免疫代谢网络,并鉴定了潜在的诊断标志物和治疗靶点。 首次将富马酸相关的转录程序与牙周炎的免疫代谢变化联系起来,通过整合多种数据源识别了新的转录标志物和药物候选。 研究主要基于计算分析,缺乏实验验证,且样本来源可能有限,结果需进一步功能实验确认。 探讨富马酸相关基因表达在牙周炎发病机制中的作用,并识别潜在诊断和治疗靶点。 人类牙周组织样本和牙周炎小鼠模型的组织样本。 转录组学、单细胞测序 牙周炎 批量RNA测序、单细胞RNA测序 计算模型(基因表达分析、药物筛选) 转录组数据、单细胞表达数据 人牙周组织样本(具体数量未提供)和小鼠模型样本。 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
3079 2026-08-08
Purine Metabolism-Related Pathogenic Genes in Trigeminal Neuralgia: A Multiomics Mendelian Randomization Study
2026, Pain research & management IF:2.5Q2
研究论文 本研究采用多组学孟德尔随机化方法,探讨嘌呤代谢相关基因与三叉神经痛(TN)之间的关联,并识别潜在的治疗靶点。 创新性地整合多组学数据(mQTL、eQTL、pQTL)与孟德尔随机化,结合共定位、药物靶点MR和单细胞RNA测序,全面分析嘌呤代谢基因与TN的因果关系,并发现多个新的候选基因及药物靶点。 研究主要基于欧洲人群的GWAS数据,可能限制结果的普适性;未进行体外或体内功能实验验证;药物靶点MR结果需进一步临床验证。 利用多组学孟德尔随机化方法,识别嘌呤代谢相关基因中与三叉神经痛相关的致病基因,并评估其作为治疗靶点的潜力。 三叉神经痛患者及对照样本,包括血液、脑组织、三叉神经节组织及转录组和单细胞数据。 机器学习 三叉神经痛 多组学孟德尔随机化、全基因组关联分析、甲基化定量性状位点、表达定量性状位点、蛋白质定量性状位点、共定位分析、药物靶点孟德尔随机化、单细胞RNA测序、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络 孟德尔随机化模型 基因组数据、表观遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 多组学数据集,包括FinnGen R10和R12、UKBB、GEO转录组和scRNA-seq数据集、GTEx脑组织eQTL数据;具体样本量未提供。 NA 单细胞RNA测序 NA 使用GEO数据库中的scRNA-seq数据集,但未提供具体平台信息。
3080 2026-08-08
Post-transcriptional regulation via alternative polyadenylation and piRNA shapes macrophage responses in psoriasis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究采用多组学整合方法,系统解析了可变多聚腺苷酸化和piRNA介导的转录后调控在银屑病发病机制中的作用 首次揭示TDRKH-piRNA轴在银屑病巨噬细胞炎症反应中的转录后调控网络,结合长读长测序和单细胞测序,并利用孟德尔随机化验证因果关联 样本量较小,功能验证仅在体外细胞模型中进行,缺乏体内实验证据 阐明可变多聚腺苷酸化和piRNA在银屑病发病中的转录后调控机制 银屑病患者外周血单核细胞、皮损组织及极化巨噬细胞(THP-1) 转录组学 银屑病 长读长测序、单细胞RNA测序、小RNA测序、全转录组关联研究、孟德尔随机化 NA 长读长测序数据、单细胞RNA测序数据、小RNA测序数据、遗传变异数据 15例健康对照和10例银屑病患者用于APA分析;4例患者皮损组织用于单细胞测序(17,734个细胞);THP-1巨噬细胞用于功能实验 NA 单细胞RNA测序、长读长测序、小RNA测序 NA NA
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