单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 2981 - 3000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2981 | 2026-08-09 |
Compact and informative representation learning for scRNA-seq data clustering with masked information bottleneck
2026-03-31, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02590-y
PMID:41917934
|
研究论文 | 提出scMIB，一种基于掩码信息瓶颈的框架，用于scRNA-seq数据的鲁棒表示学习，以提高聚类准确性。 | 结合掩码扰动与信息瓶颈目标，并引入掩码一致性学习机制，有效抑制噪声和冗余，提升聚类性能。 | 未明确提及局限性。 | 开发一种有效的表示学习方法，从噪声和稀疏的scRNA-seq数据中提取信息性特征，提高细胞聚类准确性。 | 多个公开的scRNA-seq数据集。 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 信息瓶颈 | 基因表达数据 | 多个公开数据集，具体数量未提及。 | NA | NA | NA | NA |
| 2982 | 2026-08-09 |
HFB301001, an OX40-based immunotherapy, drives Treg clearance and CTL activation through optimized OX40 receptor clustering
2026-Mar-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014185
PMID:41912269
|
研究论文 | 该研究生成了一种低亲和力OX40激动剂抗体HFB301001，通过优化受体聚类增强T细胞激活和调节性T细胞清除，在多种小鼠肿瘤模型中展现出优于高亲和力突变体的抗肿瘤疗效，且在非人灵长类中安全性良好 | 首次系统揭示OX40抗体亲和力与激动活性之间的复杂关系，证明低亲和力策略可通过优化受体聚类实现更强的T细胞激活和Treg清除效果，为OX40靶向免疫治疗提供了新的设计思路 | 研究主要基于临床前模型，尚需进一步验证HFB301001在人类患者中的疗效，且低亲和力策略的普适性尚未确定 | 明确OX40抗体亲和力对其免疫治疗功效的影响及潜在机制，并评估低亲和力策略的临床开发潜力 | 不同亲和力的OX40激动剂抗体（包括HFB301001及高亲和力突变体），涉及小鼠肿瘤模型、食蟹猴及临床肿瘤样本 | 免疫治疗 | 实体瘤 | 噬菌体展示、人工智能预测、氢氘交换、单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISpot、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、ELISpot数据、免疫荧光图像 | 多种小鼠肿瘤模型、食蟹猴、临床肿瘤样本（具体样本量未在标题和摘要中提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2983 | 2026-08-09 |
Single-cell analysis of a salmonid immune system (river brown trout Salmo trutta fario) reveals evolutionary divergence and hatchery-induced transcriptional reprogramming
2026-03-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02554-2
PMID:41845393
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了河鳟（褐鳟）免疫细胞的异质性，揭示了进化分歧和孵化场引起的转录重编程 | 首次对具有全基因组复制事件的鲑科鱼类（河鳟）进行单细胞免疫细胞图谱分析，发现免疫基因调控中的亚功能化和新功能化现象，并揭示孵化场饲养历史对免疫细胞转录身份的影响 | 研究仅限于肾脏来源的免疫细胞，未涵盖其他免疫组织；样本量有限，可能无法完全代表野生和孵化场群体的差异 | 建立健康褐鳟细胞免疫系统的基线数据，探索脊椎动物免疫系统的进化，并理解孵化场养殖鱼免疫力降低的分子机制 | 河鳟（Salmo trutta fario）的肾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞基因表达数据 | 83,000多个肾脏免疫细胞，来自野生和不同孵化场世代的鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2984 | 2026-08-09 |
The vaccine platform used for COVID-19 primary immunization shapes the quality of the human B cell response to a vaccine boost
2026-Feb-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aeb9837
PMID:41739906
|
研究论文 | 本研究利用流式细胞术和单细胞转录组学比较了不同COVID-19疫苗平台组合对B细胞反应质量的影响，发现腺病毒载体初免加mRNA疫苗加强能诱导更强的短期B细胞扩增和特定活化非典型B细胞亚群，而mRNA初免加同源加强则诱导不同的活化B细胞亚群和长寿命静息记忆亚群 | 首次系统比较了不同同源和异源疫苗平台组合在人类B细胞反应中的免疫学差异，特别是发现了腺病毒载体初免加mRNA加强策略能诱导独特的活化非典型B细胞亚群，并与抗体结合滴度相关 | 摘要中未提及研究局限 | 探究不同COVID-19疫苗平台组合如何影响人类B细胞反应的质量，以优化疫苗策略实现持久保护 | 接受不同同源和异源COVID-19疫苗方案的人类受试者的B细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2985 | 2026-08-09 |
Recent insights in the development and functions of insect hemocytes
2026-Feb, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101434
PMID:40962030
|
综述 | 本文综述了昆虫血细胞发育和功能的最新研究进展，重点关注黑腹果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫中的转录因子、信号通路以及单细胞RNA测序在血细胞分类和免疫反应中的应用 | 利用单细胞RNA测序鉴定不同血细胞群体的过渡状态和免疫应答中的基因变化，并扩展了对固着血细胞功能的理解 | 未提及具体局限性 | 总结昆虫血细胞个体发育和功能的最新研究进展 | 昆虫血细胞，特别是黑腹果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的血细胞 | 单细胞生物学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2986 | 2026-08-09 |
Screening of Anti-Atherosclerosis Targets of Ce-Bai-Si-Wei Decoction Based on Multidimensional Data and Study on Cellular Distribution
2026, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/9699723
PMID:42557835
|
研究论文 | 基于多维数据筛选策百思维汤抗动脉粥样硬化的靶点并研究其细胞分布 | 整合网络药理学、微阵列数据和单细胞转录组学等多维数据，识别出HMOX1、SELE、CD4和FLT1四个核心基因，并通过分子对接、分子动力学模拟及体外实验验证了CSD通过NRF2/HMOX1通路发挥抗AS作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证，且分子机制探索可能不够全面 | 探究策百思维汤治疗动脉粥样硬化的分子机制及核心作用靶点 | 巨噬细胞泡沫细胞和受损内皮细胞 | 生物信息学、网络药理学 | 动脉粥样硬化、心血管疾病 | RNA-seq、单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、RT-qPCR、Western blot | NA | 基因表达数据、文本数据 | NA（未提及具体样本量，涉及体外细胞模型和多维数据整合） | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2987 | 2026-08-09 |
Artesunate Alleviates Inflammatory Injury in Neonatal Acute Respiratory Distress Syndrome Through CCL5-Mediated Pyroptosis of M2 Macrophage Subsets
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7437447
PMID:42557887
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序探究新生儿急性呼吸窘迫综合征微环境中细胞焦亡的分子机制，并发现青蒿素通过抑制CCL5介导的M2巨噬细胞焦亡减轻炎症损伤并促进组织修复 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CCL5在M2巨噬细胞中作为焦亡调控因子，并利用网络药理学识别青蒿素作为潜在的CCL5抑制剂，突显其双重抗炎和促修复作用 | 主要基于体外和生物信息学分析，缺乏体内动物模型的验证，且临床样本量有限 | 探究NARDS微环境中焦亡的分子机制，并评估青蒿素作为治疗药物的潜力 | 新生儿急性呼吸窘迫综合征患者及相关的巨噬细胞亚群 | 单细胞测序，网络药理学 | 新生儿急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，网络药理学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2988 | 2026-08-09 |
NTMT1 (METTL11A) promotes MYC-dependent proliferation and downstream HLA-A suppression in cervical cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1853434
PMID:42568485
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了NTMT1在宫颈癌中促进MYC依赖性增殖并抑制HLA-A表达，从而影响CD8+ T细胞功能。 | 首次将NTMT1与宫颈癌中MYC激活和HLA-A抑制联系起来，并利用空间转录组学揭示了其在不同肿瘤微环境中的上下文特异性作用。 | 精确的分子机制尚未阐明，且实验结果仅限于体外共培养条件，需要进一步的体内研究验证。 | 识别连接肿瘤增殖与免疫相关改变的上游分子调控因子，并评估NTMT1在宫颈癌中的作用。 | 宫颈癌组织中的上皮细胞和免疫细胞，重点关注NTMT1表达及其功能。 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, RT-qPCR, Western blotting, 多重免疫荧光, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像 | 包括GSE208653和GSE208654数据集，具体样本数量未在摘要中提供 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2989 | 2026-08-09 |
The airway epithelial-immune axis: mechanisms and therapeutic implications
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1891760
PMID:42568577
|
综述 | 本文全面综述了气道上皮-免疫轴的结构和功能基础及其在慢性呼吸道疾病中的关键作用，并探讨了靶向该轴的治疗策略。 | 强调气道上皮作为黏膜免疫的主动调节者，聚焦警报素（TSLP、IL-33、IL-25）介导的上皮-免疫回路，并整合新兴技术（如单细胞RNA测序、空间转录组学、类器官模型）以推动精准医学。 | 未提及具体局限性。 | 总结气道上皮-免疫轴的机制，并探讨其在哮喘、慢性阻塞性肺病和上气道炎症性疾病中的治疗意义。 | 气道上皮细胞、固有免疫细胞（ILC2s）、适应性免疫细胞（Th2细胞）及相关的细胞因子和信号通路。 | 免疫学、呼吸医学 | 哮喘、慢性阻塞性肺病、上气道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合（据摘要推断，原文未明确指定具体技术） | NA | 生物医学数据（如基因表达、空间转录组数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2990 | 2026-08-09 |
Spatial immune programs associated with nodal status differ between lymphoid follicular regions and peritumoral tonsillar tissue in HPV-positive oropharyngeal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1905992
PMID:42568560
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和批量转录组学分析了HPV阳性口咽癌中淋巴滤泡区域和肿瘤周围扁桃体组织的免疫程序，并探讨其与淋巴结状态的关系 | 首次区分淋巴滤泡区域和肿瘤周围扁桃体组织，揭示相同免疫通路在不同空间位置具有不同的生物学关联 | 空间转录组学分析的患者数量有限，研究结果属于探索性发现，需在更大规模的独立队列中验证 | 探究HPV阳性口咽癌中与淋巴结状态相关的空间免疫程序差异 | HPV阳性口咽癌患者的扁桃体组织，包括淋巴滤泡区域和肿瘤周围扁桃体组织 | 空间转录组学 | HPV阳性口咽癌 | 空间转录组学, 批量转录组学, 基因集富集分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 批量微阵列数据 | 有限数量的患者（具体数量未提供） | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间转录组分析 |
| 2991 | 2026-08-09 |
Spatial transcriptomic mapping of early immune responses to an adjuvanted recombinant hemagglutinin vaccine
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1831403
PMID:42568657
|
研究论文 | 利用空间转录组学绘制了含佐剂重组血凝素疫苗早期免疫反应的空间图谱，揭示了注射部位和引流淋巴结中的时空转录程序 | 首次提供了佐剂疫苗早期反应中局部炎症与淋巴结组织在空间和时间上关联的高分辨率视图 | 未提及 | 绘制含佐剂重组血凝素疫苗早期免疫反应的空间转录组图谱，以理解注射部位信号与引流淋巴结转录程序的耦合 | 小鼠肌肉注射部位和引流淋巴结 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，GeoMx数字空间 profiling，CosMx空间分子成像 | NA | 空间转录组数据，单细胞成像数据 | 小鼠，具体数量未提及 | NanoString | 空间转录组学，单细胞成像 | GeoMx Digital Spatial Profiling, CosMx Spatial Molecular Imaging | GeoMx DSP和CosMx SMI用于单细胞成像，注射部位使用20x20 µm空间网格 |
| 2992 | 2026-08-09 |
Decoding benign prostatic hyperplasia at single-cell resolution: heterogeneity, inflammation, and beyond androgen-driven pathogenesis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1881717
PMID:42568833
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在良性前列腺增生（BPH）研究中的应用，强调从均质、激素中心视角向复杂、异质性细胞-免疫相互作用驱动的过程转变 | 通过scRNA-seq识别出增生移行带中新的基底上皮亚型和活化成纤维细胞群，并揭示慢性炎症、SASP在维持增殖微环境中的作用，提出超越雄激素轴的新型治疗靶点如CXCL13/CD4T细胞轴和颗粒酶K通路 | 未明确提及具体局限性，但作为综述，可能受限于现有研究的样本量和异质性 | 总结scRNA-seq在BPH研究中的最新进展，探讨其如何揭示BPH的异质性、炎症机制及非雄激素驱动的发病机制，并为精准治疗提供方向 | 良性前列腺增生（BPH）组织中的细胞类型，包括基底上皮亚型、活化成纤维细胞、免疫细胞等 | 数字病理学 | 良性前列腺增生 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2993 | 2026-08-09 |
Integrated peripheral immune profiling reveals B-cell dysregulation and CD8 effector signatures in chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1888882
PMID:42568867
|
研究论文 | 通过整合外周免疫分析，揭示了慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病中B细胞失调和CD8效应T细胞特征 | 首次采用多模式整合方法（单细胞RNA测序、细胞因子谱分析和流式细胞术验证）定义CIDP的外周免疫结构，并与多发性硬化症进行跨疾病对比，发现CIDP特有的I型干扰素和炎症小体相关程序及B细胞激活与细胞数量解离的现象 | 样本量较小（20例患者和20例对照），单细胞分析仅在发现子集中进行，需在更大、治疗分层队列中验证 | 定义CIDP的外周免疫架构，识别其独特的免疫特征，并与MS进行对比，以理解其免疫机制差异 | 慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病（CIDP）患者和多发性硬化症（MS）患者的外周血免疫细胞 | 免疫学 | 慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病 | 单细胞RNA测序、细胞因子谱分析、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子数据、流式细胞术数据 | 20例CIDP患者和20例年龄性别匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 2994 | 2026-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies potential roles of CCL2-mediated macrophage-endothelial cell interactions in endothelial apoptosis of varicose veins
2026-Nov-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150279
PMID:42349529
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了静脉曲张组织中细胞异质性及CCL2介导的巨噬细胞-内皮细胞相互作用在内皮细胞凋亡和疾病进展中的作用 | 首次利用单细胞转录组测序技术系统解析静脉曲张组织的细胞异质性、细胞间相互作用和分化轨迹，并发现CCL2介导的巨噬细胞-内皮细胞相互作用是触发内皮细胞凋亡和血管炎症的关键机制 | 研究样本量较小，且功能验证实验不足，需进一步通过体内外实验验证CCL2信号通路在静脉曲张中的具体作用机制 | 阐明静脉曲张的细胞和分子机制，为开发新的治疗靶点提供理论依据 | 静脉曲张大隐静脉组织和正常大隐静脉组织 | 单细胞转录组学 | 静脉曲张 | 单细胞转录组测序 | 无 | 单细胞转录组数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2995 | 2026-08-08 |
Comprehensive analysis of the association between perfluorooctanoic acid exposure and osteosarcoma progression
2026-Oct, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116274
PMID:42462996
|
研究论文 | 本文综合网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟和体外实验，探讨全氟辛酸暴露与骨肉瘤进展之间的关联机制 | 首次整合多种生物信息学方法和实验验证，揭示PFOA通过代谢重编程和免疫失调促进骨肉瘤进展的新机制，并识别出代谢相关基因轴 | 研究主要基于计算预测和体外实验，缺乏体内实验验证；样本量和临床数据有限 | 阐明长期PFOA暴露对骨肉瘤进展的影响及其分子机制 | PFOA暴露相关的骨肉瘤细胞及共享靶基因 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq（单细胞） | 机器学习模型（未明确指定） | 基因表达数据、分子结构数据 | 细胞实验样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2996 | 2026-08-08 |
Integrative single-cell transcriptomics and Mendelian randomization prioritize FN1 and DCN in intervertebral disc degeneration
2026-Oct, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116275
PMID:42476215
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，优先考虑椎间盘退变中的FN1和DCN，并通过功能实验初步验证 | 结合单细胞RNA测序和基于蛋白质数量性状位点的孟德尔随机化分析，识别细胞外基质相关候选基因，并通过功能实验初步验证其在椎间盘退变中的作用 | FN1的孟德尔随机化估计在重新计算后不显著，DCN的关联仅名义上显著且不同估计方法间一致性不足；功能实验仅初步验证，未建立因果机制 | 理解椎间盘退变的细胞异质性，并评估循环细胞外基质蛋白与疾病易感性的关联 | 人类椎间盘组织（健康与退变）和原代髓核细胞 | 单细胞转录组学、孟德尔随机化 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、siRNA敲降 | NA | 单细胞转录组数据、遗传变异数据、基因表达数据 | 公开单细胞RNA测序数据集（健康与退变椎间盘）及原代髓核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2997 | 2026-08-08 |
Machine learning-based study on Xin-Pi simultaneous treatment formula via drug nanodelivery systems regulating macrophage polarization and TEAD2/PKM2 synergistic repair strategy in myocarditis
2026-Sep, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100433
PMID:42150704
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法结合药物纳米递送系统，探讨心脾同治方调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2通路协同修复心肌炎的分子机制 | 首次系统阐明心脾同治方通过纳米递送系统调控巨噬细胞M1/M2极化平衡和TEAD2/PKM2代谢重编程网络修复心肌炎损伤的分子机制，并采用多组学整合策略（网络药理学、机器学习、单细胞转录组、空间转录组、代谢组、蛋白质组）进行多维度分析 | 研究仅基于小鼠模型，缺乏人类队列和临床试验验证，临床转化需进一步研究 | 系统分析心脾同治方经纳米载体制剂调控心肌炎中巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2信号通路的分子机制 | 心肌炎小鼠模型及其心肌组织中的巨噬细胞亚群和相关信号分子 | 机器学习 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、Western blot、免疫荧光、qRT-PCR、代谢组学、蛋白质组学 | 随机森林、支持向量机、XGBoost | 图像、文本、序列数据 | 心肌炎小鼠模型（具体样本量未提供） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2998 | 2026-08-08 |
Spatial transcriptomics reveals clonal relationships between intraductal carcinoma and adjacent invasive prostate cancer
2026-Sep, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.70188
PMID:42236150
|
研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术，揭示了前列腺导管内癌与相邻浸润性前列腺癌之间的克隆关系 | 首次使用空间转录组学技术，在组织原位分析HGPIN、IDC和浸润性前列腺癌的克隆关系，提出并检验了'重复侵袭、前体进展'（RIPP）假说，与传统的逆行扩散观点相反 | 样本数量有限（六个标本），可能限制统计功效和普遍性 | 阐明高级别前列腺上皮内瘤变、前列腺导管内癌与相邻浸润性前列腺癌之间的相互克隆关系 | 六例Gleason评分3+4=7根治性前列腺切除术标本中的HGPIN、IDC和相邻浸润性前列腺癌区域 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 6例根治性前列腺切除术标本，包含HGPIN、IDC和浸润性前列腺癌区域 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium工作流程，用于空间转录组分析和文库制备 |
| 2999 | 2026-08-08 |
Spatial transcriptome and single-cell reveal the role of sorbitol metabolism in hepatocellular carcinoma progression and tumor microenvironment
2026-Sep, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100451
PMID:42413619
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组数据，揭示山梨醇代谢在肝细胞癌进展及肿瘤微环境中的作用 | 首次建立山梨醇代谢评分系统，结合空间转录组和单细胞数据揭示ALDH3A1+恶性细胞的空间分布及免疫逃逸机制，并预测靶向药物Irofulven | 研究主要基于转录组数据和体外实验，缺乏体内功能验证及更大规模的临床队列验证 | 探讨山梨醇代谢在肝细胞癌进展和肿瘤微环境中的生物学功能及其临床意义 | 67例肝细胞癌患者的单细胞转录组数据、空间转录组数据及肝癌细胞系 | 机器学习和数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组、伪时间轨迹分析、CIBERSORT免疫浸润分析、药物敏感性预测 | 机器学习预测模型（具体类型未指定） | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、体外实验数据 | 67例肝细胞癌患者的单细胞转录组数据及相应空间转录组样本，以及体外细胞系 | 未指定 | 单细胞RNA测序、空间转录组 | 未指定 | NA |
| 3000 | 2026-08-02 |
Corrigendum to "Technology-enabled integration of single-cell transcriptomics and microbiome data identifies RNA-targetable host-microbiota networks in colorectal adenoma" [SLAS Technology (2025) 100365]
2026-Sep, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100453
PMID:42538186
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |