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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-05-12 |
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03070-6
PMID:41872134
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研究论文 | 本研究探讨高级别浆液性卵巢癌在新辅助化疗后免疫微环境的动态变化,揭示前列腺素介导的免疫抑制微环境在化疗耐药中的关键作用 | 首次揭示前列腺素在卵巢癌化疗后免疫抑制微环境形成中的关键作用,并发现顺铂联合前列腺素特异性抑制剂可显著提高治疗效果 | 主要基于公开的scRNA-seq数据和体外体内实验验证,临床样本来源有限 | 探索卵巢癌新辅助化疗后免疫微环境变化及化疗耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自公开数据集的卵巢癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 282 | 2026-05-12 |
TRIM21-Mediated ubiquitination of FBL suppresses PI3K/AKT signaling and tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06113-4
PMID:41863623
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research paper | 本研究揭示了TRIM21介导的FBL泛素化通过调控PI3K/AKT信号通路抑制透明细胞肾细胞癌的肿瘤进展 | 首次发现TRIM21作为FBL的新型E3泛素连接酶,通过K48连接的多聚泛素化修饰FBL的K292位点,促进其蛋白酶体降解,从而抑制PI3K/AKT信号通路 | 未提及具体局限性 | 探究FBL在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制及其与TRIM21的相互作用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)细胞及其肿瘤组织样本 | machine learning | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组学、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱联用、分子对接 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 283 | 2026-05-12 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
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研究论文 | 组蛋白乳酸化驱动的正反馈环路调节嘧啶代谢促进口腔癌变 | 首次发现组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录促进嘧啶生物合成,形成糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路,揭示了表观遗传调控与乳酸驱动的代谢重编程之间的新联系 | 具体局限性未在摘要中提及 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌变中的作用及其分子机制 | 口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织及细胞 | 计算机视觉 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 涉及口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用CUT&Tag、单细胞RNA测序、ChIP-qPCR等技术 |
| 284 | 2026-05-12 |
A microfluidic-engineered vascularized endometrium micro-organoid platform for functional repair of intrauterine adhesion
2026-03-18, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ae4f26
PMID:41802406
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研究论文 | 提出一种微流控生物制造策略,构建血管化子宫内膜微类器官,用于修复宫腔粘连 | 利用微流控技术共包封子宫内膜基质细胞、上皮类器官和内皮细胞,构建具有血管结构的类器官,并通过转录组和单细胞测序揭示内皮细胞缓解缺氧炎症和促进上皮稳态的机制 | 研究中未提及具体局限性,可能包括临床转化中的规模化和长期效果评估不足 | 开发可再生的血管化子宫内膜微类器官平台,用于子宫内膜修复和疾病建模 | 人子宫内膜基质细胞、上皮类器官、内皮细胞(HUVECs) | 数字病理学 | 妇科疾病(宫腔粘连) | 微流控生物制造、转录组测序、单细胞测序 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 285 | 2026-05-12 |
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03019-9
PMID:41844578
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌中经典和非经典NF-κB信号通路转录活性的表观遗传背景依赖性 | 发现RELA和RELB在不同染色质可及性区域结合,RELB与AP1基序共定位,揭示TNFα和TWEAK分别通过RELA和RELB调控不同转录程序 | 未完全阐明上游信号激活机制及体内功能验证 | 阐明胰腺导管腺癌中RELA和RELB的差异激活和功能 | 胰腺导管腺癌细胞系和原发肿瘤组织 | 机器学习 | 胰腺癌 | RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 表观基因组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2026-05-12 |
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03025-x
PMID:41839843
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序分析与靶向血浆代谢组学,发现赖氨酸在急性肺损伤中显著减少,补充赖氨酸可通过恢复α-微管蛋白乙酰化与纤毛活性减轻肺损伤 | 首次揭示赖氨酸通过乙酰辅酶A恢复α-微管蛋白乙酰化,调节纤毛TRPC1定位进而阻断钙内流与上皮修复受损,将氨基酸代谢与纤毛信号相连接 | 具体机制有待阐明,特别是赖氨酸代谢在肺泡上皮不同细胞亚型间的精细调控及其临床转化需进一步验证 | 探究氨基酸代谢中的赖氨酸在急性肺损伤后肺泡上皮修复中的作用及其分子机制 | 急性肺损伤患者样本、小鼠及非人灵长类ALI模型 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、靶向血浆代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据及代谢物数据 | 人类ALI样本及对应小鼠与灵长类实验动物 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 287 | 2026-05-12 |
MAPK14/SLC7A11/GPX4 axis dysregulation drives podocyte ferroptosis via mediating glycerophospholipid metabolism
2026-Mar-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02990-7
PMID:41813669
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研究论文 | 通过综合多组学方法解析糖尿病肾病的细胞特异性发病机制,发现足细胞铁死亡及MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调的关键作用,并验证了黄芪甲苷IV的治疗潜力 | 首次通过单细胞RNA测序与空间代谢组学等多组学整合,揭示足细胞铁死亡在糖尿病肾病中的核心驱动作用,并锁定MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调机制 | 未提及具体研究局限性 | 探索糖尿病肾病的细胞特异性病理机制及潜在治疗靶点 | 人类糖尿病肾脏组织及足细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间代谢组数据, 临床代谢组数据 | 人类糖尿病肾脏样本(具体数量未提及) | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序,Illumina NovaSeq高通量测序 |
| 288 | 2026-05-12 |
RPS26 Expression as a Predictive Biomarker and Functional Modulator in Sublingual Immunotherapy for Japanese Cedar Pollinosis
2026-Mar-06, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000551442
PMID:41790586
|
研究论文 | 研究核糖体蛋白基因RPS26表达作为日本柳杉花粉症舌下特异性免疫治疗疗效的预测性生物标志物及功能调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序发现RPS26表达与SLIT临床应答密切相关,并揭示其通过调控IL-10表达和Treg细胞稳定性参与免疫耐受 | 样本量较小(35例患者),且RPS26并非普遍适用的预测性生物标志物,需更大规模前瞻性研究验证其临床效用 | 确定RPS26表达是否有助于SLIT疗效,并明确其在T细胞动力学、细胞因子产生和表观遗传调控通路中的作用 | 日本柳杉花粉症患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35例患者(治疗前),其中26例配对样本(治疗1年后) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序 |
| 289 | 2026-05-12 |
Transcriptional factor ZMYM3 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by upregulating CTTN and inducing invadopodia formation
2026-Mar-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08506-6
PMID:41775697
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研究论文 | 研究发现转录因子ZMYM3通过上调CTTN并诱导侵足形成促进肝细胞癌转移 | 首次揭示ZMYM3在肝细胞癌中上调并通过直接结合CTTN启动子促进侵足形成和上皮间质转化,从而增强肿瘤侵袭和转移能力 | 研究仅限于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内模型验证及ZMYM3作为治疗靶点的直接证据 | 探究ZMYM3在肝细胞癌侵袭和转移中的分子机制,以寻找有效治疗策略 | 肝细胞癌组织样本、门静脉癌栓样本以及HCC细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、染色质免疫沉淀测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、测序数据 | TCGA和GEO数据集中的肝细胞癌样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 290 | 2026-05-12 |
PlantscRNAdb 4.0: Improved marker identification and annotation under a cell-type uniformity for plants
2026-03-02, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.12.026
PMID:41449796
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研究论文 | PlantscRNAdb 4.0数据库更新,引入新的植物细胞类型本体(POCT)和HCMarker工具,覆盖33个植物物种,提供标准化和精确的细胞类型注释 | 引入植物细胞类型本体(POCT)以实现统一的细胞类型命名,开发HCMarker多指标评分系统用于高置信度标记基因鉴定,并推出PCmaster_anno深度学习工具以自动注释植物细胞类型 | 未提及具体局限性 | 改善植物单细胞RNA-seq数据的标记基因鉴定和细胞类型注释标准化 | 33种植物物种的107个单细胞RNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 深度学习 | 基因表达数据 | 33种植物物种的107个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 291 | 2026-05-12 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 提出Gloss框架,通过组套索回归结合LIPSTIC和单细胞RNA测序数据,预测细胞间物理相互作用的分子特征 | 首次将组套索回归应用于scRNA-seq数据,系统性关联基因和通路活性与物理细胞间相互作用强度,优于传统相关性分析和标准回归方法 | 未说明具体局限性 | 建立可解释的预测模型框架,分析细胞间物理相互作用的分子驱动因素 | 小鼠肿瘤中髓系-T细胞相互作用及病毒感染中T细胞亚群间相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, LIPSTIC | 组套索回归 | 基因表达数据, 细胞相互作用数据 | 多数据集及基准测试,包括小鼠肿瘤和病毒感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 292 | 2026-05-12 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学构建家蚕翅盘的时空图谱,揭示20E驱动的发育重编程机制 | 首次构建了家蚕翅盘10个时间点的单细胞时空图谱,鉴定出12种主要细胞类型及其发育转变,并提出了激素驱动的基因转变模型 | 未提及明确的局限性信息 | 阐明家蚕翅盘发育的时空逻辑,揭示20-羟基蜕皮酮(20E)驱动的激素信号对翅发育的调控机制 | 家蚕(Bombyx mori)翅盘组织 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学 | CNN | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 10个时间点的家蚕翅盘样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于snRNA-seq, 10x Visium FFPE用于空间转录组学 |
| 293 | 2026-05-12 |
Regulatory network architecture constrains inflammatory responses in tissue-resident alveolar macrophages
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706134
PMID:41757068
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和深度学习染色质可及性建模,揭示组织驻留肺泡巨噬细胞中炎症反应的调控网络架构 | 首次揭示组织驻留巨噬细胞与招募巨噬细胞在炎症应激下基因调控网络架构的差异,并发现PU.1和CEBP/β构成的稳定网络约束炎症反应 | 未在摘要中明确说明局限性 | 解析组织驻留巨噬细胞身份维持和炎症反应调控的高阶调控网络机制 | 组织驻留肺泡巨噬细胞和招募的单核细胞来源巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 深度学习染色质可及性建模 | 深度学习模型 | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 294 | 2026-05-12 |
A single-cell-resolution spatial transcriptomic atlas decodes wheat spike development and yield potential
2026-02-02, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.12.020
PMID:41437568
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研究论文 | 利用单细胞分辨率的空间转录组学技术,绘制小麦穗发育的时空转录组图谱,揭示其分子调控机制并构建基因调控网络 | 首次构建了小麦穗发育五个关键阶段的高分辨率空间转录组图谱,鉴定了9种细胞类型,发现了一种新的控制每穗粒数的基因模块,并开发了在线数据查询平台 | 信息未提 | 解析小麦穗发育的分子调控机制以提升产量潜力 | 小麦穗发育过程中的细胞类型及基因表达模式 | 新一代测序 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 小麦穗发育的五个关键阶段样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组, 10x Chromium 单核RNA测序 |
| 295 | 2026-05-12 |
Cytoplasm-nucleus shuttling of TET2: an intrinsic brake in colorectal cancer progression
2026-Jan-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08418-5
PMID:41605908
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研究论文 | 本研究揭示了TET2蛋白在结直肠癌进展中的细胞质-细胞核穿梭机制,其作为内在刹车抑制肿瘤转移 | 首次发现TET2核增加仅在转移初期肿瘤中观察到,并阐明其与EMT/WNT通路形成的负反馈环路作为肿瘤抑制机制 | 未提及具体局限性 | 阐明TET2核质穿梭在结直肠癌进展中的作用及其分子机制 | 结直肠癌细胞和组织样本 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x 铬 | 10x 铬单细胞3' |
| 296 | 2026-05-12 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2026-Jan-19, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101728
PMID:41565157
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研究论文 | 探究门静脉高压中肝动脉血流诱导的门脉束纤维化机制,聚焦VCAM-1和骨桥蛋白表达巨噬细胞的作用 | 首次揭示肝动脉血流增加通过VCAM-1和Spp1+巨噬细胞驱动门脉束纤维化的分子机制 | 仅限于大鼠模型,缺乏临床样本验证;单细胞RNA测序数据来自公共数据库,实验验证可能受限于体外条件 | 阐明门静脉高压中肝动脉缓冲反应诱导门脉束纤维化的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠(经部分门静脉结扎诱导门静脉高压)及巨噬细胞 | 机器学习 | 门静脉高压 | 微CT, 免疫细胞分型, 血流动力学测量, 转录组分析, 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 | NA | 图像, 文本 | Sprague-Dawley大鼠(部分门静脉结扎组和假手术组),具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序,数据来自GSE171904 |
| 297 | 2026-05-12 |
Benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics and application to cancer immunotherapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699379
PMID:41648323
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研究论文 | 在空间转录组学中基准测试细胞类型反卷积方法并应用于癌症免疫治疗研究 | 通过结合空间和转录复杂性的逼真模拟构建了基准测试框架,发现简单的标记基因特征评分方法在稀有细胞类型反卷积中优于复杂模型 | 可能缺乏对真实生物场景中方法泛化能力的全面验证 | 评估现有细胞类型反卷积方法在空间转录组学数据中的准确性和一致性,并探索其在癌症免疫治疗中的应用 | 小鼠癌症模型中对单次抗PD1检查点阻断免疫治疗的早期应答 | 机器学习和空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞参考数据 | 标记基因特征评分模型 | 空间转录组数据 | 小鼠癌症模型肿瘤和引流淋巴结的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 298 | 2026-05-12 |
Identification and Validation of Mitophagy-Related Biomarkers in Colorectal Cancer: An Integrated Analysis of Single-Cell Transcriptome and Mendelian Randomization
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/5579542
PMID:42108926
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析,鉴定并验证结直肠癌中线粒体自噬相关生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法,从遗传因果角度鉴定结直肠癌中线粒体自噬相关的生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据,临床样本验证规模有限,未深入探讨生物标志物的功能机制 | 鉴定结直肠癌中线粒体自噬相关的生物标志物,为诊断和治疗提供新见解 | 结直肠癌患者与对照组的临床样本及公共测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 加权基因共表达网络分析, 机器学习, 定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA(未明确说明数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2026-05-12 |
Exploring the role of adenosine deaminase in esophageal cancer and its potential for traditional Chinese medicine intervention
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1798177
PMID:42109526
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研究论文 | 通过多水平整合分析探索腺苷脱氨酶在食管癌中的遗传关联及其中医药干预潜力 | 首次从遗传学角度系统阐明腺苷脱氨酶与食管癌的关联,并结合中医药成分筛选进行分子对接 | 未提及具体局限性 | 探究腺苷脱氨酶在食管癌发生中的潜在作用机制及干预策略 | 食管癌患者和对照人群的血清样本及肿瘤组织 | 机器学习 | 食管癌 | 孟德尔随机化分析、转录组分析、单细胞RNA测序、分子对接模拟 | NA | 基因表达数据、血清样本数据 | 独立病例对照队列血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2026-05-12 |
DoTools: a cross platform framework to streamline common single cell workflows
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag098
PMID:42109579
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研究论文 | 开发了一个跨平台框架DoTools,用于简化常见的单细胞分析流程 | 提供了一个统一的R/Bioconductor和Python/PyPI框架,整合了scVI、CellTypist和CellBender等第三方工具到标准流程如Seurat、SingleCellExperiment和Scanpy中,并提供了跨语言包装器和可视化工具 | 未提及 | 简化单细胞RNA测序数据分析中集成多个工具的复杂性,减少学习时间和编程技能需求 | 单细胞RNA测序数据分析流程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |