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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-03-25 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-Skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2026-Mar-19, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70277
PMID:41853894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素信号驱动造血干细胞向髓系分化的转录重编程机制 | 首次发现镰状细胞贫血中I型干扰素信号异常激活导致造血干细胞转录重编程,并揭示其对G-CSF的意外响应性 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明镰状细胞贫血中病理性髓系生成和慢性炎症的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | 单细胞组学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2026-03-25 |
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf317
PMID:41384851
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研究论文 | 本研究通过多模态单细胞测序和体外刺激实验,定义了人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性特征 | 首次全面描绘了人类巨噬细胞在多个组织(如肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结)中的转录组和蛋白质组特征,并揭示了这些特征在激活过程中如何保持组织特异性 | 研究样本来自器官捐献者,可能受个体差异影响;体外刺激实验可能无法完全模拟体内环境 | 探索人类巨噬细胞在不同组织中的身份特征及其在稳态和激活状态下的变化 | 人类巨噬细胞和单核细胞,从肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结中分离 | 单细胞组学 | NA | 多模态单细胞测序,单核转座酶可及染色质测序(snATAC-seq),体外刺激实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,染色质可及性数据 | 来自个体器官捐献者的多个组织样本(肺、小肠、脾脏、骨髓、淋巴结) | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 284 | 2026-03-25 |
Integrated single-cell and spatial analysis reveals context-dependent myeloid-T cell interactions in response to immune checkpoint blockade in head and neck cancer
2026-Mar-16, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2300
PMID:41837744
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间组学数据,系统评估了头颈癌患者在接受免疫检查点阻断治疗后的肿瘤浸润免疫细胞间相互作用 | 结合Visium空间转录组学和CosMx SMI单细胞空间组学技术,首次揭示了头颈癌中髓系细胞与T细胞相互作用的上下文依赖性,并识别了新的ICB响应标记物 | 样本量相对有限(23例单细胞数据,8例空间数据),且主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 评估头颈癌患者免疫检查点阻断治疗后的细胞间相互作用,以识别响应标记物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA和蛋白质数据, 空间RNA-seq数据 | 23例患者的522,399个单细胞,以及8例接受ICB治疗患者的空间RNA-seq数据 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 单细胞空间组学 | 10x Visium, CosMx SMI | Visium spot-based空间转录组学, CosMx SMI单细胞空间组学(包含64-plex蛋白质面板和1000基因RNA面板) |
| 285 | 2026-03-25 |
Size-Modulated Mesoderm-Endoderm Divergence and Myocardial Cavitation in Micropatterned Cardioids
2026-Mar-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515661
PMID:41837870
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研究论文 | 本研究利用微图案化心脏类器官、CRISPR工程报告hiPSCs、深层组织成像和单细胞RNA测序,探索了中胚层-内胚层协同发育,揭示了尺寸调控对细胞组成、类器官腔化及信号互作的影响 | 整合微图案化心脏类器官与scRNA-seq技术,首次系统解析中胚层-内胚层互作在心脏发育中的协同作用,并发现微图案尺寸可调控类器官腔化模拟早期心腔形成 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂微环境;scRNA-seq数据仅提供静态转录组快照 | 探究中胚层与内胚层在早期心脏发育中的协同发育机制及信号互作 | 人类诱导多能干细胞(hiPSCs)衍生的微图案化心脏类器官 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR基因编辑、深层组织成像 | 微图案化心脏类器官模型 | 单细胞转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2026-03-25 |
Selective Impact on Regulatory T cell with Sustained Functional Phenotype by the IL-2 Mutein VIS171 in a Nonhuman Primate Model
2026-Mar-16, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.03.007
PMID:41850490
|
研究论文 | 本研究评估了IL-2突变体VIS171在非人灵长类动物模型中,与雷帕霉素联用,选择性扩增调节性T细胞(Tregs)并维持其功能表型的能力 | VIS171被设计为延长半衰期并增强对高表达三聚体IL-2受体的Tregs的选择性结合和扩增,结合雷帕霉素使用,在非人灵长类模型中实现了对Tregs的稳健、选择性和持久性扩增,同时不影响细胞毒性T淋巴细胞(CTLs) | 研究仅基于非人灵长类动物模型,未涉及人类临床试验,且样本量有限,长期效应和安全性需进一步验证 | 评估VIS171在非人灵长类动物中扩增Tregs并增强移植耐受性的策略 | 非人灵长类动物(恒河猴)的免疫细胞群体,特别是调节性T细胞(Tregs) | 免疫学 | 移植耐受 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 287 | 2026-03-25 |
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-Mar-16, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3273-6
PMID:41870780
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA-seq数据,发现未注释的非编码转录本作为恶性细胞状态中肿瘤内异质性的来源 | 首次鉴定出数千个代表未注释转录本3'末端的poly(A)位点峰,并揭示其表达与恶性细胞状态的广泛关联,提出表观遗传激活这些转录本是肿瘤内异质性的新机制 | 研究主要基于3'标签单细胞RNA-seq数据,可能未全面覆盖所有转录本类型;功能实验仅针对两个非编码UPTs进行验证,需进一步扩展 | 探究肿瘤内异质性的分子机制,特别是未注释非编码转录本在恶性细胞状态多样性中的作用 | 12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq数据,包括肺癌细胞系和肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 多组学数据整合 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 多组学数据 | 覆盖12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'标签单细胞RNA-seq |
| 288 | 2026-03-25 |
A single cell transcriptional profile of benign prostatic hyperplasia
2026-Mar-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02417-w
PMID:41832222
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对15名良性前列腺增生患者的组织进行分析,揭示了与炎症相关的细胞亚群及其相互作用 | 首次在BPH中识别出一个罕见的管腔前体亚群,并通过伪时间分析和干细胞特征评分,揭示了其作为管腔细胞前体的潜力,同时利用CellPhoneDB探索了细胞间通过MIF的配体-受体相互作用 | 样本量较小(仅15名患者),且仅基于单细胞RNA测序数据,缺乏功能验证实验 | 深入理解良性前列腺增生的病理生理学和细胞组成,以促进新疗法的开发 | 良性前列腺增生患者的组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 15名患者,共16,234个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 289 | 2026-03-25 |
IDH2 Clonal Hematopoiesis and IKAROS Loss Cooperate in a B-ALL Subtype after Lenalidomide Therapy for Multiple Myeloma
2026-03-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031047
PMID:41824395
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研究论文 | 本研究对来那度胺治疗多发性骨髓瘤后相关的B细胞前体急性淋巴细胞白血病(LenB-ALL)进行了全面的分子特征分析,揭示了其独特的分子亚型 | 首次系统性地定义了IDH2突变型LenB-ALL这一独特的分子亚型,并揭示了来那度胺通过促进IDH2突变克隆性造血和下调IKAROS表达,协同导致B细胞前体阶段成熟停滞的发病机制 | 样本量相对有限(57例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 阐明来那度胺治疗多发性骨髓瘤后诱发继发性B-ALL的分子机制和特征 | 57例来那度胺相关B-ALL(LenB-ALL)患者 | 血液肿瘤学 | B细胞急性淋巴细胞白血病,多发性骨髓瘤 | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序,转录组分析,DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观遗传数据,单细胞数据 | 57例LenB-ALL患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 290 | 2026-03-25 |
Spatial transcriptomics reveals altered communities and drivers of aberrant epithelia and pro-fibrotic fibroblasts in interstitial lung diseases
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101066
PMID:41576947
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研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了纤维化过程中的关键分子驱动因素 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,首次全面描绘了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了异常上皮细胞和促纤维化成纤维细胞共定位的致病生态位 | NA | 探究间质性肺疾病中肺纤维化的细胞和分子机制 | 间质性肺疾病患者的远端肺组织 | 空间转录组学 | 间质性肺疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 291 | 2026-03-25 |
Integrated Genome-wide Association and Single-cell Transcriptomic Analysis Identifies OAT as Therapeutic Targets for Periodontitis
2026-Mar-11, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02392-4
PMID:41811548
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组关联分析和单细胞转录组分析,鉴定出鸟氨酸氨基转移酶(OAT)是牙周炎的一个潜在治疗靶点 | 首次整合全基因组关联分析和单细胞转录组学来揭示OAT在牙周炎中的致病机制,并识别出其在成纤维细胞亚群中的特异性表达和功能 | 研究主要基于关联分析和转录组数据,缺乏直接的体内功能验证实验来证实OAT的致病作用和作为治疗靶点的有效性 | 探索牙周炎的宿主代谢调控机制,并识别新的治疗靶点 | 牙周炎患者的组织样本(涉及成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞) | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),全基因组关联分析(GWAS),伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据,遗传关联数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2026-03-25 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 本研究揭示了IFN-γ通过IRF1上调AGPAT3表达,驱动脂质重塑并增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性,从而提升免疫检查点抑制剂疗效 | 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑调控铁死亡敏感性,并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习模型预测免疫治疗反应 | 未明确AGPAT3在不同肿瘤类型中的普适性,且临床样本验证需进一步扩大 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的作用机制 | 肿瘤细胞、单细胞RNA测序数据集、临床患者样本 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、脂质组学、转录组学、ChIP-seq、CUT&Tag分析 | 机器学习预测模型 | 基因表达数据、脂质组数据、转录组数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集及临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 293 | 2026-03-25 |
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2026-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01220-1
PMID:40665101
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研究论文 | 本文提供了一个针对单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的scGPT模型微调完整指南 | 提出了一套端到端的scGPT微调协议,实现了自动化数据处理、模型微调和评估,并在视网膜数据集上达到99.5%的F1分数 | 需要用户具备基本的生物信息学知识,对Python和Linux有最低要求 | 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战,特别是针对大规模数据集和罕见细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的视网膜细胞类型 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer (scGPT) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 294 | 2026-03-25 |
An integrative multi-omics study reveals glutamine metabolism dysregulation connecting Alzheimer's disease and age-related macular degeneration
2026-Mar, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877261418263
PMID:41603341
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研究论文 | 本研究采用整合多组学策略,揭示了谷氨酰胺代谢失调是连接阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性的共同机制 | 首次通过整合孟德尔随机化、转录组学和靶向代谢组学,系统性地揭示了AD与AMD之间共享的谷氨酰胺代谢通路异常 | 研究主要基于动物模型(APP/PS1小鼠)和遗传推断数据,需要在人类临床样本中进行进一步验证 | 探索阿尔茨海默病与年龄相关性黄斑变性之间的共享代谢特征和通路 | 阿尔茨海默病(AD)和年龄相关性黄斑变性(AMD)两种神经退行性疾病 | 多组学整合分析 | 阿尔茨海默病, 年龄相关性黄斑变性 | 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | 孟德尔随机化模型, 差异表达分析 | 遗传数据, 转录组数据, 代谢组数据 | APP/PS1小鼠模型(5月龄) | NA | 单细胞RNA-seq, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 295 | 2026-03-25 |
Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Ischemic Injury Promoting Polyomavirus Replication by DNA Damage Response
2026-Mar, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70854
PMID:41744079
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了缺血性损伤通过激活DNA损伤应答通路促进多瘤病毒复制的分子机制,并鉴定出CDK1为关键枢纽基因 | 首次结合单细胞与批量转录组数据,系统解析缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子通路,并跨物种验证CDK1的关键作用 | 研究主要基于测序数据的生物信息学分析,实验验证部分仅限于细胞水平的siRNA敲降,缺乏动物模型或临床样本的进一步验证 | 阐明缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子机制,寻找关键调控通路和基因 | BK多瘤病毒(BKPyV)及其在肾移植患者中的再激活机制 | 生物信息学 | 肾移植相关病毒感染 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,siRNA敲降实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 296 | 2026-03-25 |
singIST: An integrative method for comparative single-cell transcriptomics between disease models and humans
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014002
PMID:41838773
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为singIST的计算方法,用于在疾病模型与人类条件之间进行单细胞转录组学的比较分析 | singIST在单细胞分辨率下提供可解释的定量测量,整合基因同源性、细胞类型存在、重要性以及基因水平变化,控制单细胞数据的内在复杂性 | 方法在模拟研究中与基于重叠差异表达基因的基线进行了比较,但可能未全面评估所有现有方法 | 开发一种计算方法来评估疾病模型与人类疾病在分子层面的相似性,以支持药物发现和早期开发 | 疾病模型(如小鼠模型)和人类条件(如特应性皮炎和化脓性汗腺炎) | 自然语言处理 | 特应性皮炎, 化脓性汗腺炎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 297 | 2026-03-25 |
Systems Biology of Metabolic Dysregulation in Ankylosing Spondylitis Using scRNA-Seq Data
2026-Mar, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261424002
PMID:41841316
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,通过构建基因组尺度代谢模型,分析了强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的代谢失调,并识别了关键的蛋白质相互作用网络重连 | 整合单细胞RNA测序与基因组尺度代谢模型,首次在强直性脊柱炎中系统量化免疫细胞类型的代谢通路活性和反应通量差异,并识别了跨细胞类型的重连蛋白质枢纽 | 研究基于外周血单个核细胞,可能无法完全反映疾病在关节等靶组织中的局部代谢变化,且样本量未明确说明 | 揭示强直性脊柱炎的免疫细胞代谢重编程机制,以发现转化治疗靶点和生物标志物 | 强直性脊柱炎患者和健康对照的外周血单个核细胞,包括CD14单核细胞、CD4记忆T细胞、CD4初始T细胞和CD8 T细胞等免疫细胞亚型 | 系统生物学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | 基因组尺度代谢模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 298 | 2026-03-25 |
Old Blood, Young Bones: Identification of Middle-Aged Myeloid Cells That Limit Cortical Bone Loss
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71094
PMID:41873045
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研究论文 | 本研究通过骨髓移植实验和单细胞RNA测序分析,揭示了中年小鼠骨髓中CD11BCD36髓系细胞通过分泌Wnt配体(特别是Wnt6)增强皮质骨形成的机制 | 首次识别出中年骨髓中CD11BCD36髓系细胞作为促进皮质骨合成的关键细胞群,并发现其通过Wnt6信号通路发挥作用,这一发现在人类骨髓中同样适用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;未详细探讨中年髓系细胞在其他骨骼部位或疾病状态下的作用 | 探究中年阶段骨髓细胞对皮质骨流失的调控机制 | 8周和40周龄小鼠的骨髓细胞,以及人类骨髓样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),流式细胞术,显微CT分析,谱系追踪实验 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据,流式细胞数据 | 使用8周和40周龄小鼠进行骨髓移植实验,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 299 | 2026-02-15 |
Single-cell RNA sequencing combined with single-cell genome-wide association study identifies SF3B4 as a hub gene in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04501-7
PMID:41689695
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2026-03-25 |
Compartmentalized VEGF receptor expression in hypothalamic tanycytes reveals a novel non-endothelial axis of VEGF signaling : Tanycytes as a novel non-endothelial target of VEGF signaling
2026-Feb-14, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00774-w
PMID:41691203
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研究论文 | 本研究首次揭示了血管内皮生长因子(VEGF)信号在下丘脑伸长细胞中存在一种非内皮、空间区室化、发育程序化且年龄依赖性的信号系统 | 首次在下丘脑伸长细胞中发现并描绘了非内皮VEGF信号系统的空间区室化表达模式,揭示了该信号在发育和衰老过程中的动态变化,并证实了该信号系统在小鼠和人类之间存在部分进化保守性 | 研究主要基于表达图谱的描述,VEGF信号在伸长细胞中的具体功能机制及其对神经血管和神经内分泌功能的影响尚需进一步的功能性实验验证 | 阐明VEGF及其受体在下丘脑伸长细胞中的空间分布、细胞类型特异性功能及其在发育和衰老过程中的动态变化 | 小鼠(雄性和雌性)和人类下丘脑组织中的伸长细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)重分析、RNAscope原位杂交、免疫组织化学、FACS分离qPCR、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,但涉及不同性别、发育阶段(从新生P0到衰老)的小鼠以及人类组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |