单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-02-08
Diabetes exacerbates destructive inflammation by activating the CD137L-CD137 axis in dendritic and IL-17+ T cells
2026-Feb-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示了糖尿病通过激活树突状细胞和IL-17+ T细胞中的CD137L-CD137轴,加剧牙周病等细菌感染引起的破坏性炎症反应的关键机制 首次通过单细胞RNA-Seq技术,在牙周病模型中鉴定出高血糖驱动的CD137L-CD137轴是糖尿病加剧炎症性组织破坏的关键分子通路,并证实了树突状细胞作为CD137L产生者的核心作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的直接验证相对有限;CD137L-CD137轴在其他糖尿病相关并发症中的普适性仍需进一步探索 探究糖尿病如何加剧细菌感染(特别是牙周病)引起的炎症反应,并寻找潜在的治疗靶点 牙周病模型中的树突状细胞、IL-17+ T细胞、γδ T细胞等免疫细胞 免疫学 糖尿病 单细胞RNA-Seq、谱系特异性基因敲除、体外共培养系统、抗体介导的抑制实验 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
282 2026-02-08
Identification of DIO2 as a Molecular Therapeutic Target for Depression in Chronic Rhinosinusitis: A Comprehensive Bioinformatics and Experimental Study
2026-Feb, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过生物信息学和实验方法,识别了慢性鼻窦炎(CRS)与抑郁症共病的分子机制,并确定DIO2作为潜在的治疗靶点 首次结合生物信息学分析、机器学习算法和单细胞RNA测序技术,系统性地识别了CRS与抑郁症共病的共享枢纽基因,并通过动物实验验证了DIO2在改善抑郁样行为中的作用 研究主要基于公共数据库的基因表达数据,动物实验模型可能无法完全模拟人类疾病的复杂性,且临床验证尚未进行 识别慢性鼻窦炎与抑郁症之间的潜在分子联系,并探索其共病的病理生理机制 慢性鼻窦炎和抑郁症患者的基因表达数据,以及CRS小鼠模型 生物信息学 慢性鼻窦炎和抑郁症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、GO、KEGG和GSEA富集分析 随机森林、LASSO回归 基因表达数据 从GEO数据库检索的CRS和抑郁症基因表达数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
283 2026-02-08
Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序技术,筛选并验证了金银花在脓毒症治疗中的核心靶点基因 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和荟萃分析,系统识别金银花在脓毒症中的潜在治疗靶点,并定位到细胞水平 研究结果需要进一步的实验验证,样本量相对较小 阐明金银花在脓毒症中的分子作用机制,识别核心治疗靶点 脓毒症患者和健康对照者的血液样本 自然语言处理 脓毒症 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 22名脓毒症患者和10名健康对照者 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
284 2026-02-08
The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment
2026-Feb, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境、预后和治疗中的作用 首次从单细胞层面揭示了凝血通路在GBM内皮细胞中的激活及SPP1-整合素介导的细胞间通讯机制,并构建了一个基于五个凝血相关基因的预后风险特征模型,该模型能有效预测免疫治疗反应并识别潜在敏感药物PLX4720 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,部分发现(如药物PLX4720的疗效)仍需进一步的体内实验和临床验证 阐明凝血相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤生物学中的作用,并开发预后预测模型和探索新的治疗策略 胶质母细胞瘤患者、肿瘤组织样本、胶质瘤细胞系 生物信息学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、体细胞突变分析、LASSO回归、随机生存森林分析、免疫组化、CCK8实验、伤口愈合实验、克隆形成实验 风险特征模型 基因组数据(SNP, CNV)、转录组数据(单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq)、临床数据 TCGA队列461例GBM患者,CGGA693队列GBM患者,IMvigor210免疫治疗队列,以及体外细胞实验 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
285 2026-02-08
Targeting mesenchymal monocyte-derived macrophages to enhance the sensitivity of glioblastoma to temozolomide by inhibiting TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1 axis
2026-Feb, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,鉴定出一种新的单核细胞来源巨噬细胞亚型MES-MDM,并揭示了其通过TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1轴促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的新机制 首次鉴定出在缺氧坏死区高表达TREM1的MES-MDM亚型,并阐明其通过组蛋白去乙酰化酶1的乳酸化修饰促进肿瘤细胞亚型转换和TMZ耐药的分子机制 研究主要基于临床前模型(患者来源类器官和颅内原位模型),需要进一步临床验证 阐明胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的机制并寻找潜在治疗靶点 胶质母细胞瘤(GBM)、单核细胞来源巨噬细胞(MDM)、肿瘤微环境 肿瘤免疫学、单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
286 2026-02-08
Dynamic heterogeneity towards drug resistance in AML cells is primarily driven by epigenomic mechanism unveiled by multi-omics analysis
2026-Feb, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了急性髓系白血病(AML)细胞耐药性的动态异质性主要由表观基因组机制驱动 开发了一种新型多重单细胞RNA测序策略NAMUL-seq,并整合了scRNA-seq、scATAC-seq、DNA甲基化分析和全外显子组测序,首次系统揭示了AML细胞快速获得阿糖胞苷耐药性主要源于表观基因组变化,而非外显子突变 研究主要基于AML细胞系(KG-1a、Kasumi-1和HL-60),未在患者原代细胞或体内模型中充分验证 阐明AML细胞耐药性的细胞和分子机制 急性髓系白血病(AML)细胞 多组学分析 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质可及性分析(scATAC-seq)、DNA甲基化分析、全外显子组测序(WES) NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、基因组数据 三种AML细胞系(KG-1a、Kasumi-1和HL-60) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 全外显子组测序 NA NA
287 2026-02-08
Cluster-Guided Contrastive Learning With Masked Autoencoder for Spatial Domain Identification Based on Spatial Transcriptomics
2026-Feb, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为STMCCL的自监督学习框架,结合掩码自编码器和聚类引导对比学习,用于空间转录组学数据中的空间域识别 提出了一种新颖的自监督学习框架STMCCL,联合训练掩码自编码器和聚类引导对比学习,并引入多聚类视角模块,考虑聚类间的几何和结构关系,以产生更可靠的聚类分配 NA 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 掩码自编码器, 对比学习 基因表达谱, 空间信息 7个公共数据集 NA 空间转录组学 NA NA
288 2026-02-08
Nuclear receptor co-factor TBL1X/TBL1XR1 T cell activity protects against atherosclerosis
2026-Feb, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序发现核受体共因子TBL1X/TBL1XR1在人类颈动脉斑块CD4 T细胞中表达显著,其缺失会促进动脉粥样硬化斑块形成 首次揭示TBL1X/TBL1XR1在CD4 T细胞中的表达与动脉粥样硬化发展的关联,并证明其缺失会加剧斑块形成 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本,尚未在更大规模人群中验证,且具体分子机制有待进一步阐明 探究TBL1X/TBL1XR1在动脉粥样硬化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 人类颈动脉斑块组织、小鼠CD4 T细胞、LDLR敲除小鼠模型 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 人类颈动脉斑块样本(稳定与不稳定斑块及健康对照)、小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
289 2026-02-08
Metabolic adaptations rewire CD4+ T cells in a subset-specific manner in human critical illness with and without sepsis
2026-Feb, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究探讨了危重病患者CD4+ T细胞的代谢特性及其与免疫抑制的机制联系 揭示了CD4+ T细胞在危重病中的亚群特异性代谢可塑性,特别是调节性T细胞优先获得糖酵解能力,并发现ROS和犬尿氨酸代谢是T细胞重塑的驱动因素 研究样本可能有限,且机制联系仍需进一步验证 阐明危重病中CD4+ T细胞代谢与免疫抑制的机制联系 危重病患者(包括脓毒症和非脓毒症)及健康成年人的CD4+ T细胞 免疫学 危重病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 危重病患者和健康成年人的CD4+ T细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
290 2026-02-08
Innate immune cell subsets are enriched in synovial fluid of ACPA-negative rheumatoid arthritis and characterized by distinct type I IFN gene signatures
2026-Feb, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了ACPA阴性类风湿关节炎患者滑膜液中独特的先天免疫细胞组成和I型干扰素基因特征 首次在ACPA阴性RA患者的滑膜液中鉴定出特定的先天免疫细胞亚群富集和I型干扰素基因特征,且这些特征在外周血中未观察到 样本量较小(发现队列每组4人,验证队列每组8人),且滑膜组织数据仅来自两个患者,可能限制结果的普遍性 探究ACPA阴性类风湿关节炎的先天免疫机制,特别是滑膜液中的细胞组成和干扰素反应 类风湿关节炎患者(包括ACPA阴性和ACPA阳性)的外周血单核细胞和滑膜液单核细胞,以及银屑病关节炎患者的滑膜液单核细胞作为对照 单细胞组学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 发现队列每组4人,验证队列每组8人(总计24名RA患者),外加银屑病关节炎患者对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
291 2026-02-08
Entheseal tissue signature in response to IL-17A inhibition in psoriatic arthritis: results from the EBIO entheseal biopsy study
2026-Feb, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过影像质谱流式细胞术和空间转录组学分析,探讨了IL-17A抑制对银屑病关节炎患者附着点组织的细胞和分子响应 首次结合影像质谱流式细胞术和空间转录组学技术,在活体患者附着点组织中系统评估IL-17A抑制的免疫调节作用,并发现CD200+DKK3+成纤维细胞与2型先天淋巴细胞的抗炎生态位形成 样本量较小(仅10例患者),且仅针对外侧上髁附着点炎,可能限制结果的普遍适用性 研究IL-17A抑制对银屑病关节炎患者附着点组织微环境的免疫调节机制 患有活动性银屑病关节炎且伴有外侧上髁附着点炎的患者 数字病理学 银屑病关节炎 影像质谱流式细胞术, 空间转录组学 NA 组织图像, 转录组数据 10例患者 NA 空间转录组学 NA NA
292 2026-02-08
Construction of a prognostic model and multidimensional analysis of hepatocellular carcinoma based on palmitoylation-related genes
2026-Jan-30, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于棕榈酰化相关基因构建了肝细胞癌的预后模型,并通过多维分析探索其分子机制 首次结合单细胞和批量转录组数据,分析肝细胞癌上皮细胞中棕榈酰化的调控网络 NA 构建肝细胞癌的预后模型并探索其分子机制 肝细胞癌上皮细胞 生物信息学 肝细胞癌 单细胞转录组测序,批量转录组测序 LASSO回归,Cox回归,scAB反卷积算法,hdWGCNA 转录组数据 TCGA-LIHC和GEO数据集(包括GSE189903和GSE14520验证集) NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
293 2026-02-08
Improving atlas-scale single-cell annotation models with hierarchical cross-entropy loss
2026-Jan-30, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文提出了一种分层交叉熵损失函数,用于改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 引入分层交叉熵损失,将模型目标与生物层次结构对齐,无需额外计算成本即可提升分布外性能12-15% 未提及具体局限性 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 线性模型、transformer RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
294 2026-02-08
Hist2Cell: Deciphering fine-grained cellular architectures from histology images
2026-Jan-26, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究提出了一种名为Hist2Cell的视觉图-Transformer框架,用于直接从组织学图像中精确解析细粒度细胞类型 Hist2Cell通过结合视觉和图Transformer技术,提高了单个基因表达预测的准确性,并能预测细粒度转录细胞类型,这是现有方法所缺乏的 NA 旨在从组织学图像中预测细胞表型,以支持大规模空间生物学研究和精确癌症预后 人类肺癌和乳腺癌数据集,以及大规模癌症基因组图谱(TCGA)队列 数字病理学 肺癌, 乳腺癌 空间转录组学 视觉图-Transformer 组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
295 2026-02-08
RBM15/IGF2BP3 promotes immune escape in bladder cancer by enhancing m6A modification of PFKFB4
2026-Jan-22, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究揭示了m6A修饰蛋白RBM15通过IGF2BP3依赖的机制稳定PFKFB4表达,从而促进膀胱癌糖酵解并抑制CD8 T细胞功能,靶向RBM15可增强抗PD1疗法疗效 首次阐明RBM15通过m6A-IGF2BP3轴调控PFKFB4的分子机制,并证明其通过调控糖酵解影响肿瘤免疫微环境,为膀胱癌免疫治疗提供新靶点 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证相对有限;RBM15在其他癌症类型中的普适性未充分探讨 探究m6A修饰在膀胱癌肿瘤微环境塑造中的作用机制 膀胱癌细胞、小鼠模型 肿瘤免疫学 膀胱癌 单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq、乳酸化蛋白质组学、RIP-qPCR、MeRIP-qPCR、荧光素酶报告实验 NA 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、基因表达数据 未明确说明具体样本数量,涉及细胞系和动物模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
296 2026-02-08
Deciphering the Cellular and Metabolic Landscape of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer Using Single-Cell and Spatial Multi-Omics
2026-Jan-22, The American journal of pathology
研究论文 本研究通过单细胞和空间多组学技术,解析了乳腺癌淋巴结转移的细胞和代谢景观 构建了乳腺癌淋巴结转移的单细胞图谱,识别了早期播散癌细胞亚群,揭示了代谢重编程和免疫调节在转移中的作用,并通过计算药物重定位识别了潜在治疗靶点 样本量相对有限(78个原发肿瘤及配对淋巴结转移样本),空间转录组学验证仅基于四个淋巴结组织切片,可能影响结果的普适性 阐明乳腺癌淋巴结转移的微环境细胞组成、信号网络和分子机制,以指导靶向治疗策略 乳腺癌原发肿瘤及其配对的淋巴结转移样本中的细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 78个原发乳腺癌肿瘤及其配对淋巴结转移样本,以及四个淋巴结转移组织切片 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
297 2026-02-08
Diversity and immune dynamics of choroid plexus macrophages are shaped by distinct developmental origins
2026-Jan-21, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学结合谱系和空间追踪方法,揭示了脉络丛巨噬细胞的发育起源、生态位特化和免疫动态 首次通过单细胞转录组学识别了三种生物学上不同的脉络丛巨噬细胞亚群,并阐明了它们由不同造血波产生、依赖不同生存因子以及TGFβ信号在维持其身份中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析相对有限,可能未完全捕捉到物种间的所有差异 探究脉络丛巨噬细胞的多样性、发育起源和免疫功能 小鼠和人类的脉络丛巨噬细胞 单细胞生物学 NA 单细胞转录组学、谱系追踪、空间追踪方法 NA 转录组数据、空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
298 2026-02-08
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Jan-19, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究利用新辅助治疗前后的胰腺导管腺癌患者来源类器官,揭示了化疗耐药机制并发现了潜在的治疗靶点 建立了匹配的新辅助治疗前后患者来源类器官平台,用于追踪治疗驱动的肿瘤演变,并首次在类器官模型中证实AG化疗会激活KRAS/MAPK信号通路诱导耐药 样本量相对有限,类器官模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 揭示胰腺导管腺癌化疗耐药的分子机制并寻找潜在治疗靶点 胰腺导管腺癌患者来源类器官及患者组织样本 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析 患者来源类器官,异种移植模型 基因表达数据,测序数据 患者样本:AG治疗组30例,非治疗组60例;验证队列:29个类器官 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
299 2026-02-08
Engrailed 1 promotes immune evasion and chemoresistance in glioma through single cell and CeRNA network analyses
2026-Jan-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析、ceRNA网络构建及实验验证,揭示了转录因子EN1在胶质瘤免疫逃逸和化疗耐药中的关键作用 首次系统性地将EN1与胶质瘤免疫微环境特征、化疗反应预测联系起来,并构建了一个新的NEAT1/miR-9-5p/miR-128-3p/EN1 ceRNA调控轴来解释其失调机制 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 全面研究EN1在胶质瘤中的功能,特别关注其在免疫逃逸和化疗耐药中的作用 胶质瘤细胞、公共转录组数据集(TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109) 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ceRNA网络分析, Western blot, CCK-8, Transwell实验 NA 转录组数据, 图像, 文本 多个公共数据集(TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109),具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
300 2026-02-08
Airway immune profiles and therapeutic implications of IGF1 in eosinophilic granulomatosis with polyangiitis
2026-Jan-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了嗜酸性肉芽肿性多血管炎(EGPA)与重度嗜酸性哮喘(SEA)的气道免疫特征,揭示了EGPA中独特的干扰素驱动炎症机制,并发现IGF1巨噬细胞与疾病复发相关,提示IGF1作为潜在治疗靶点 首次在EGPA中识别出干扰素驱动的炎症通路,与SEA的TNF主导通路形成对比;发现IL1BMX1中性粒细胞促进三级淋巴结构形成;通过纵向分析揭示IGF1巨噬细胞与疾病复发的关联;在动物模型中验证IGF1阻断可减轻T2炎症 研究样本量未明确说明;动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证;EGPA与SEA的病理生理差异机制仍需深入探究 探究EGPA与SEA的免疫特征差异,识别EGPA特有的炎症机制及潜在治疗靶点 嗜酸性肉芽肿性多血管炎(EGPA)和重度嗜酸性哮喘(SEA)患者的气道免疫细胞 单细胞组学 嗜酸性肉芽肿性多血管炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部